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Este protocolo utiliza farelo de trigo em um sistema rotativo de fermentação em estado sólido para aumentar a produção de enzimas. O substrato, complementado com indutores como a quitina, suporta o crescimento de fungos sob condições controladas. Os resultados demonstram rendimentos enzimáticos 4-6 vezes maiores em comparação com a fermentação submersa, mostrando a adaptabilidade e eficácia do método para diversas aplicações biotecnológicas.
A fermentação em estado sólido (SSF) é um processo de bioconversão que utiliza um substrato sólido que não se dissolve em meio aquoso. Os microrganismos crescem na superfície do substrato e penetram em sua matriz sólida para extrair nutrientes essenciais para o seu desenvolvimento. A FES é caracterizada por um mínimo de água livre, com um teor de umidade do substrato mantido acima de 70%, e envolve três fases interconectadas - gasosa, líquida e sólida. Este protocolo descreve o uso do farelo de trigo, um subproduto agroindustrial, como substrato base para a produção de enzimas em um sistema rotativo. O substrato é suplementado com um indutor, como quitina, quitosana, amido ou celulose, para promover a síntese de proteínas hidrolíticas. O sistema é altamente adaptável, permitindo o uso de diferentes formas de fungos, incluindo micélio, esporos ou pellets. Na metodologia descrita, o indutor e o substrato são misturados na proporção de 1:100 (m/m), esterilizados em autoclavagem e ajustados ao nível de umidade desejado com água estéril. O inóculo fúngico é então adicionado e o sistema rotativo opera a 10 rpm para garantir mistura e oxigenação adequadas. O sistema é incubado por 6-8 dias em condições ideais de crescimento para fungos mesófilos ou termofílicos/termotolerantes, aumentando sua versatilidade. Após a incubação, a enzima é facilmente extraída usando um tampão frio apropriado (por exemplo, acetato, citrato ou fosfato), dependendo do tipo de enzima. O extrato é clarificado por centrifugação e filtração para obter um sobrenadante livre de células. A enzima pode então ser ainda mais concentrada ou purificada conforme necessário. Os resultados demonstraram um aumento de 4 a 6 vezes na atividade enzimática em comparação com a fermentação submersa (SmF), destacando a eficácia do sistema. Sua adaptabilidade a diferentes substratos, indutores e espécies de fungos o torna uma ferramenta valiosa para várias aplicações biotecnológicas.
A fermentação em estado sólido (SSF) surgiu como uma tecnologia de bioconversão promissora e sustentável para a produção de enzimas de alto valor, compostos bioativos e metabólitos secundários. Essa técnica envolve o crescimento de microrganismos em substratos sólidos com o mínimo de água livre, simulando seu ambiente natural e permitindo uma atividade metabólica eficiente1. O principal objetivo deste protocolo é otimizar a produção de enzimas por meio de um sistema SSF rotativo que garante maior utilização do substrato, difusão de oxigênio e escalabilidade do processo. O emprego do farelo de trigo, um subproduto agroindustrial abundante, como substrato base, contribui para a valorização dos resíduos agrícolas e promove práticas de bioeconomia circular2.
O SSF tem vantagens significativas sobre a fermentação submersa (SmF), incluindo menor consumo de energia e água, maior concentração de produto e compatibilidade com uma ampla gama de resíduos agrícolas baratos, como farelo de trigo, casca de arroz e bagaço de cana-de-açúcar3. Ao contrário do SmF, que requer grandes volumes de água e meios nutritivos caros, os sistemas SSF utilizam matrizes sólidas que não apenas servem como superfícies de crescimento microbiano, mas também fornecem nutrientes essenciais para a atividade microbiana. Além disso, a água livre limitada em SSF minimiza os riscos de contaminação, tornando-a uma opção mais robusta para a produção de enzimas em ambientes industriais4. Além de suas vantagens operacionais, a FES apresenta benefícios ambientais e econômicos significativos em comparação com a fermentação submersa (SmF). Estudos relataram que o SSF reduz o consumo de água em 50% -70% e reduz os custos de energia em mais de 30% devido à ausência de grandes volumes de água que requerem agitação e aeração constantes. Além disso, o uso de resíduos agroindustriais como substratos minimiza os custos das matérias-primas e promove práticas de economia circular ao reaproveitar subprodutos agrícolas 2,4.
O SSF foi amplamente validado por sua eficiência e escalabilidade. Por exemplo, estudos relataram um aumento de 4 a 6 vezes na atividade enzimática usando SSF em comparação com SmF, destacando as vantagens econômicas e ambientais dessa técnica 2,5. Além disso, o processo a jusante é simplificado, pois a extração de enzimas normalmente requer menos água e menos etapas de purificação. Isso torna a pesca de pequeno e pequeno nível particularmente atraente para as indústrias que visam reduzir os custos operacionais e o impacto ambiental6.
O sistema SSF rotativo descrito neste protocolo oferece várias melhorias em relação aos métodos tradicionais de SSF estático. Embora os sistemas estáticos frequentemente enfrentem desafios como colonização irregular do substrato e limitação de oxigênio, a configuração rotativa garante mistura e aeração completas, promovendo o crescimento microbiano uniforme 7,8,9. Por exemplo, este sistema tem sido empregado com sucesso para produzir enzimas hidrolíticas, como quitinases, amilases e proteases, usando espécies de fungos como Aspergillus e Trichoderma2.
Uma característica fundamental deste sistema SSF é sua adaptabilidade. O uso do farelo de trigo como substrato base demonstra o potencial dos resíduos agroindustriais para bioconversão econômica3. Além disso, a suplementação do substrato com indutores como quitina, quitosana e amido aumenta ainda mais a síntese enzimática, estimulando vias metabólicas específicas 2,10. O sistema também é compatível com diferentes formas de fungos, incluindo esporos, micélio e pellets, permitindo que os usuários adaptem o processo às suas necessidades específicas2.
A pesca de pequena escala oferece um amplo potencial de aplicação em vários domínios, como a biotecnologia alimentar, a produção de biocombustíveis e a remediação ambiental11. Sua integração de substratos econômicos, rendimentos excepcionais de enzimas e alta flexibilidade de processo estabelecem o SSF como uma abordagem essencial para inovações biotecnológicas em escala industrial.
Os reagentes e os equipamentos utilizados neste estudo estão listados na Tabela de Materiais.
1. Preparação do substrato
NOTA: Use uma marca comercial de farelo de trigo para minimizar variações significativas nas características do substrato. Cada lote de farelo de trigo varia devido a vários fatores, tornando-o um material heterogêneo e difícil de padronizar, levando a flutuações em seu conteúdo constituinte. Se for necessário um material padronizado, escolha uma matriz alternativa ou faça uma análise química centesimal de cada lote de farelo de trigo para ajustá-lo de acordo com as necessidades.
2. Preparação do inóculo
NOTA: Este protocolo descreve três métodos para preparação de inóculo: suspensão de esporos, inoculação direta com discos de micélio e suspensão celular. Estabeleça a concentração inicial de inóculo e quantifique os níveis de proteína para cálculos precisos de rendimento.
3. Preparação do sistema de pesca de pequena escala
NOTA: Os indutores podem ser naturais ou comerciais. Os indutores comerciais purificados são preferidos para minimizar as impurezas que podem alterar a eficiência da fermentação. Ajuste as adições de água para manter uma umidade relativa de pelo menos 90%.
4. Procedimento de fermentação no estado sólido (SSF)
NOTA: Para estudos cinéticos ou avaliações de parâmetros em momentos diferentes, prepare tubos separados para cada ponto de tempo para garantir a representatividade.
5. Extração de enzimas
NOTA: Os fundamentos da extração são baseados na solubilidade e na atividade de pH máximo da enzima extracelular. Como a FES evita o meio aquoso, a enzima extracelular está envolvida na água ao redor da matriz sólida, o que significa que a concentração é maior do que na SmF. Nesse contexto, a seleção do melhor tampão de extração depende do conhecimento da atividade desejada. A otimização das extrações depende da concentração final da enzima e do tipo de tampão de extração utilizado.
6. Processo de otimização
NOTA: Otimize este protocolo avaliando e ajustando a qualidade e a concentração dos indutores, bem como o tipo e a concentração do inóculo.
A Figura 1A apresenta a representação esquemática do misturador rotativo utilizado neste sistema, que tem capacidade para seis tubos cônicos de 50 mL. A Figura 2B ilustra as mudanças que ocorrem no farelo de trigo durante o condicionamento antes de entrar no processo de fermentação em estado sólido. Como visto, não foram observadas alterações estruturais significativas.
A Figura 2 mostra a saturação do farelo de trigo após 6 dias de fermentação em estado sólido para produção de quitinase pelo fungo Trichoderma harzianum neste sistema, utilizando quitina comercial como indutor. A Figura 2A mostra o material original antes do processo de fermentação. As micrografias confirmam a utilização do substrato pelo fungo, o que também se reflete nas modificações que sofre, perdendo sua estrutura fractal devido à interação com o fungo.
Os resultados da Figura 3 mostram um aumento significativo na atividade da quitinase (Figura 3A) e da atividade da amilase (Figura 3B) obtidas de T. harzianum e Aspergillus lentulus, respectivamente, quando comparados os sistemas de fermentação em estado sólido (SSF) e fermentação submersa (SmF). Os dados foram validados por ANOVA one-way e teste de Tukey com p < 0,05 usando o software SigmaPlot. Nesse contexto, observa-se que esse sistema é aplicável a diferentes atividades enzimáticas e fungos. A. lentulus foi caracterizado como um fungo termotolerante, incubado a 40 °C, apresentando um aumento significativo em sua atividade amilase. Os resultados da atividade da quitinase de T. harzianum em fermentação líquida e sólida foram previamente relatados separadamente por nosso grupo de pesquisa 2,5, com este trabalho confirmando e comparando um aumento significativo na FES em comparação com a SmF, semelhante à atividade da amilase. Nosso grupo trabalhou com mais de 50 cepas de fungos para a produção de proteases e amilases em condições mesófilas e termofílicas, e os resultados são consistentes.
Os resultados confirmam o sucesso do protocolo, demonstrando aumentos significativos na atividade enzimática, com a fermentação em estado sólido produzindo maiores resultados em comparação com a fermentação submersa. Isso indica a eficácia do SSF no aumento da produção de quitinase e amilase. As figuras publicadas anteriormente foram reutilizadas com a devida permissão de reimpressão.
Figura 1: Visão geral do sistema rotativo de fermentação em estado sólido (SSF) e do processo de pré-tratamento do farelo de trigo. (A) Representação esquemática do sistema rotativo SSF. (B) Modificações no processo de pré-tratamento do farelo de trigo: (I) Matéria-prima inicial, (II) Farelo de trigo úmido após a etapa de lavagem, (III) Farelo de trigo seco. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 2: Saturação do substrato por Trichoderma harzianum. (A) Substrato antes do SSF. (B, C) Substrato saturado com micélio fúngico em diferentes ampliações. Barras de escala: (A), 50 μm; (B), 200 μm; (C), 100 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 3: Atividade enzimática em SSF e fermentação submersa (SmF) por T. harzianum e A. lentulus. Comparação de (A) formação de glucosamina através da hidrólise de quitosana por enzimas produzidas por Trichoderma harzianum em SSF e SmF, e (B) atividade de amilase de Aspergillus lentulus obtida em SSF e SmF. As barras de erro representam o desvio padrão de três repetições. Asteriscos (*) indicam uma diferença estatisticamente significativa entre os dados. Observe que a variação estatística é específica para cada tipo de enzima e não se aplica a comparações entre (A) e (B). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Este estudo descreve um protocolo relevante para otimizar a produção de enzimas por meio de sistemas de fermentação em estado sólido (SSF), projetados especificamente para fungos filamentosos. Abaixo, são discutidos aspectos críticos da metodologia, juntamente com seu significado, limitações e possíveis aplicações.
O sucesso do protocolo é altamente dependente de etapas importantes, como a preparação do substrato e do inóculo. A lavagem e secagem adequadas do farelo de trigo são essenciais para eliminar impurezas que podem interferir no crescimento de fungos ou na produção de enzimas. Além disso, o ajuste cuidadoso da umidade do substrato para manter a umidade relativa acima de 90% garante a colonização e a atividade fúngica ideais13. A operação do sistema rotativo a 10 rpm é outro parâmetro crucial, pois promove mistura e oxigenação uniformes, evitando a aglomeração do substrato e garantindo o crescimento uniforme dos fungos14.
A adaptabilidade deste protocolo reside em sua compatibilidade com diversas espécies de fungos e indutores. Por exemplo, enquanto quitina e amido comerciais foram usados como indutores neste estudo, outros substratos, como lignina, celulose ou quitosana, podem ser substituídos dependendo da enzima alvo. A solução de problemas comuns, como a colonização irregular do substrato, envolve o refinamento dos parâmetros de mistura ou o ajuste da concentração de inóculo2. Além disso, garantir a esterilidade durante a preparação e inoculação do substrato é fundamental para evitar a contaminação, especialmente em aplicações em escala industrial15.
Embora o SSF ofereça várias vantagens sobre a fermentação submersa (SmF), ele não é isento de limitações16. Um grande desafio é aumentar a escala do sistema rotativo de SSF sem comprometer a mistura de substratos, a difusão de oxigênio ou a determinação precisa da biomassa, outro problema comum no SSF17,18. Além disso, a dependência do protocolo de resíduos agroindustriais, como farelo de trigo, pode introduzir variabilidade nos resultados devido a diferenças na composição do substrato entre os lotes. Essas limitações destacam a necessidade de maior otimização na transição para a produção em larga escala 19,20.
O sistema SSF rotativo descrito demonstra vantagens significativas sobre os métodos tradicionais de SSF estático e SmF. Em comparação com o SSF estático, o sistema rotativo garante um crescimento microbiano mais uniforme, reduzindo os problemas relacionados às limitações de oxigênio. Além disso, a adaptabilidade do sistema permite sua aplicação a várias formas fúngicas e tipos de enzimas, tornando-o altamente versátil18. Os sistemas SSF podem ter várias configurações para aumentar a produtividade dos metabólitos. Cada tipo de sistema tem vantagens e desvantagens que devem ser analisadas em profundidade para determinar a melhor configuração. O sistema rotativo SSF oferece várias vantagens sobre o SSF e o SmF estáticos tradicionais; no entanto, enfrenta desafios quando comparado a outros sistemas SSF, como biorreatores de bandeja e leito compactado. Os biorreatores de bandeja, comumente usados para SSF em larga escala, oferecem simplicidade e baixo consumo de energia, mas enfrentam desafios relacionados à transferência limitada de oxigênio e distribuição de umidade, levando a um crescimento microbiano desigual e redução do rendimento enzimático. Os biorreatores de leito compactado, por outro lado, melhoram a aeração por meio do fluxo de ar forçado, mas podem encontrar problemas com quedas de pressão e distribuição desigual de temperatura, principalmente em colunas altas. Em contraste, o sistema SSF rotativo promove mistura contínua e condições homogêneas, reduzindo as zonas anaeróbicas e aumentando a produtividade enzimática. No entanto, o consumo de energia e o desgaste mecânico devido à rotação contínua podem aumentar os custos operacionais21.
Os sistemas estáticos de fermentação em estado sólido, como biorreatores de bandeja, são limitados pela transferência limitada de calor e massa, muitas vezes levando a gradientes de temperatura interna de mais de 30 °C, resultando em desempenho microbiano abaixo do ideal. Esses sistemas geralmente operam em pequenos volumes (0,15-0,25 m³) e sofrem de colonização microbiana heterogênea, com estudos indicando que apenas cerca de 34% dos poros do substrato são efetivamente utilizados. Em contraste, os biorreatores rotativos oferecem agitação mecânica que melhora a distribuição de oxigênio e a homogeneidade do substrato, ao mesmo tempo em que suportam volumes operacionais maiores de até 13 m³ e cargas de substrato que chegam a 40% (p/v). Um exemplo notável envolve a produção de celulase por Thermoascus aurantiacus, onde um reator SSF rotativo mantido a 49 ° C e ventilado a 5 L / min · kg produziu 14.098 UI / g de atividade enzimática - mais de três vezes maior do que as 4.212 UI / g obtidas em condições estáticas22.
A ampliação da fermentação em estado sólido requer um equilíbrio delicado entre manter a cinética microbiana e garantir a transferência eficaz de massa e calor em sistemas progressivamente maiores. A abordagem tradicional em etapas inclui estágios laboratoriais (5-20 kg), piloto (50-5.000 kg) e industriais (25-1.000 toneladas). Um dos principais desafios durante o escalonamento é a dissipação do calor metabólico, que pode chegar a até 3.200 kcal/kg de material seco, o que é particularmente problemático em sistemas estáticos ou mal ventilados. Para resolver isso, as estratégias de aumento de escala geralmente dependem do controle de parâmetros de projeto adimensionais e da aplicação de abordagens de modelagem matemática, incluindo equações de balanço de massa e energia, para preservar variáveis-chave, como disponibilidade de oxigênio e retenção de umidade do substrato em diferentes escalas. Os sistemas em escala piloto (por exemplo, 150 L e 6 m³) incorporaram com sucesso recursos de engenharia, como camisas de água, lâminas de agitação curvas e umidade controlada para melhorar a reprodutibilidade do processo e garantir rendimentos consistentes do produto 18,21,22.
O protocolo apresentado demonstrou eficácia para a produção de enzimas em pequena escala laboratorial. No entanto, a ampliação do processo para aplicações industriais apresenta desafios significativos, principalmente relacionados à manutenção de mistura e aeração eficientes em volumes maiores. Uma abordagem promissora para lidar com essas limitações é o uso de um reator de parafuso contínuo, que imita a função de um misturador vertical, promovendo mistura contínua e oxigenação aprimorada em todo o substrato sólido. Este projeto reduz a formação de zonas anaeróbicas e aumenta a transferência de massa, que são fatores críticos para o sucesso da fermentação em estado sólido em escala industrial 2,15. No entanto, os desafios potenciais incluem manter a integridade estrutural da matriz sólida e evitar a formação de gradientes de temperatura ao longo do reator. Estudos futuros devem se concentrar na otimização dos parâmetros operacionais e na validação dos rendimentos enzimáticos em condições de aumento de escala para garantir a viabilidade e eficiência do processo.
As aplicações potenciais deste protocolo se estendem a vários setores, incluindo biotecnologia de alimentos, bioenergia e remediação ambiental. Por exemplo, a produção aprimorada de enzimas hidrolíticas como quitinases e amilases pode apoiar processos de bioconversão na agricultura e na indústria. Além disso, o uso de subprodutos agroindustriais, como o farelo de trigo, se alinha a práticas sustentáveis, promovendo a valorização de resíduos e contribuindo para uma bioeconomia circular20.
Os autores declaram não ter conflitos de interesse.
Este trabalho foi apoiado pela Secretaría de Investigación y Posgrado do Instituto Politécnico Nacional (SIP-IPN) através dos números de subvenção/projeto 20220487, 20230676, 20240793 e 20251269 concedidos ao GGS, e 20220492, 20230427, 20240335 e 20251139 concedidos ao DROH. Os autores gostariam de expressar sua gratidão ao ENCB-IPN, à Secretaria de Ciência, Humanidades, Tecnologia e Inovação do México (Secihti), anteriormente conhecida como Consejo Nacional de Ciencia, Humanidades y Tecnología (CONAHCyT), e ao programa BEIFI, bem como ao Centro de Nanociências y Micro y Nanotecnologías do Instituto Politécnico Nacional por seu inestimável apoio. López-García agradece a Secihti (anteriormente CONAHCyT) pela bolsa de mestrado, bem como ao IPN pela bolsa SIP-BEIFI. Legorreta-Castañeda é bolsista de pós-doutorado do programa "Estancias Posdoctorales por México" da Secihti, anteriormente conhecido como CONAHCyT.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
125 mL Erlenmeyer flask | Sigma-Aldrich | CLS431684 | For culturing mycelium in liquid medium. |
50 mL conical tube | Sigma-Aldrich | CLS430921 | For storing and preparing substrates and inoculum. |
Acetate buffer, pH 5.6 | Sigma-Aldrich | 320866 | For chitinase extraction. |
Centricon filters | Millipore | UFC905024 | For further purification of enzymes. |
Counting cells chamber | Sigma-Aldrich | Z359629 | Used to count spores under a microscope. |
Filter paper | Whatman | 1001-110 | For filtering the enzyme extract. |
Hygrometer | Todomicro | - | To measure relative humidity of the substrate. |
Inducer (e.g., commercial chitin) | Sigma-Aldrich | C9752 | Used to enhance enzyme production during fermentation. |
Phosphate buffer, pH 6.9 | Sigma-Aldrich | P5379 | For amylase extraction. |
Potato-dextrose agar | Sigma-Aldrich | P2182 | Culture medium for growing fungal mycelium. |
Potato-dextrose broth | Sigma-Aldrich | P6685 | Liquid culture medium for growing fungal mycelium. |
Rotary mixer | Thermo-Fisher Scientific | 88-861-051 | To keep substrate moving during fermentation. |
Salt solution components (e.g., KH2PO4, Na2SO4, KCl, etc.) | Sigma-Aldrich | Multiple | For preparing sterile salt solution, see detailed recipe in the protocol. |
Wheat bran | Comercial market | - | Substrate for solid-state fermentation. |
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