1. Extração de DNA de amostras de alimentos
- Adicione 500 μL de matriz de mistura PCR comprada a cada um dos 2 tubos de tampa de parafuso usando uma tubulação de transferência ou 200-1.000 μL de micropipette de volume ajustável. Pipeta para cima e para baixo com a tubulação entre cada alíquota para misturar uniformemente a matriz PCR.
- Rotule um tubo de tampa de parafuso "não-OGM" e o outro "teste".
- Pese 0,5 g de alimentos não transgênicos certificados e coloque-o na argamassa.
- Adicione 2,5 mL de água destilada e moa com pilão por 2 minutos para formar um chorume.
- Adicione mais 2,5 mL de água destilada e continue moendo com pilão até que o chorume fique liso o suficiente para pipetar.
- Pipet 50 μL de chorume moído para o tubo de tampa de parafuso contendo 500 μL de pré-mistura PCR rotulado como "não-OGM" usando a marca de 50-μL em uma tubulação graduada. Tubo de recapitulação.
- Repita as etapas 1.3-1.6 para preparar a amostra de alimentos de teste.
- Pipet 50 μL de chorume de alimento de ensaio moído para o tubo de tampa de parafuso rotulado "teste". Tubo de recapitulação.
- Vórtice os alimentos não transgênicos e tubos pcr de teste por 1 min e coloque tubos em banho de água de 95 °C por 5 min. Se não houver vórtice disponível, aperte o tubo várias vezes para misturar antes de colocar no banho de água.
- Coloque tubos em uma centrífuga por 5 minutos. Uma pelota sólida deve se formar na parte inferior do tubo. Se a pelota não for formada após 5 min, centrífuga novamente por intervalos de 2 minutos até que a pelota se forme.
- Os tubos podem ser usados imediatamente para PCR ou armazenados em uma geladeira por até 1 semana.
2. Configuração de reações do PCR
- Tubos PCR número 1-6 e inicial. Os números devem corresponder aos seguintes conteúdos do tubo listados na Tabela 1.
- Coloque cada tubo PCR rotulado em um suporte de microtubo com tampas abertas.
- Usando uma dica fresca para cada adição, adicione 20 μL do primer indicado na Tabela 1 a cada tubo PCR. Tubos de tampa.
- Utilizando uma ponta fresca para cada tubo, adicione 20 μL da amostra de DNA indicada na Tabela 1 a cada tubo PCR, certificando-se de pipeta apenas do supernatante e evitando a pelota sólida na parte inferior dos tubos.
- Depois que cada amostra de DNA for pipetada no tubo PCR correspondente, use pipeta para misturar DNA e primer, pipetando suavemente para cima e para baixo; tubos de recapitulação.
- Coloque tubos PCR no cicloviário térmico e programe o ciclo dor para:
Denaturação inicial: 1 ciclo a 94 °C por 2 min.
Amplificação: 40 ciclos a 94 °C para 1 min (desnaturação), 59 °C para 1 min (ressarição) e 72 °C para 2 min (extensão).
Extensão Final: 1 ciclo a 72 °C por 10 min.
Por dentro de: 4 °C por tempo indeterminado.
3. 3% Preparação de Gel Agarose
- Usando fita de laboratório ou mascaramento, fitar com segurança as extremidades abertas da bandeja de gel. Certifique-se de que a fita está selada nas bordas da bandeja para evitar que agarose derretida vaze.
- Pesar 3 g de agarose em um frasco erlenmeyer de 250 mL ou maior.
- Adicione 100 mL de tampão TAE 1x (comprado ou preparado a partir do concentrado).
- Usando uma placa magnética quente com uma barra de mexida, aqueça o béquer até que a agarose esteja completamente dissolvida no tampão e a solução esteja fervendo e fique clara. Alternativamente, um forno micro-ondas pode ser usado colocando béquer no forno e aquecendo por intervalos de 30 s, usando uma haste de mesclagem para misturar a cada 10 s, repetindo até que a mistura esteja fervendo e se deixe claro.
- Inverta um frasco de Erlenmeyer de 50 mL na abertura do frasco de 250 mL para atuar como um refluxo, impedindo que a solução agarose evapore.
- Deixe a solução agarose esfriar a 60 °C e despeje 30-50 mL em cada bandeja de gel colada.
- Coloque um pente de gel no primeiro par de entalhes para criar poços de gel.
- Deixe o gel esfriar completamente antes de remover a fita e pentear. O gel se solidificará e passará de claro para nublado quando pronto, aproximadamente 10-20 min.
4. Eletroforese de Produtos PCR
- Coloque um gel de 3% de agarose pré-feito em uma bandeja de gel ou use uma bandeja de gel que tenha sido usada para lançar um gel de 3% de agarose derramado.
- Deslize a bandeja de gel para a câmara de eletroforese com os poços mais próximos da extremidade do cátodo (preto).
- Despeje 1x tampão TAE na câmara, o suficiente para ter 2 mm de tampão acima da parte superior da bandeja de gel.
- Obtenha tubos PCR do cicloviário térmico e coloque no suporte de microtubo.
- Usando uma dica de pipeta fresca cada vez, adicione 10 μL de corante de carregamento Laranja G (LD) comprado em cada amostra e misture bem.
- Carregar 20 μl da régua de peso molecular e 20 μL de cada amostra no gel na ordem indicada(Tabela 2).
- Executar eletroforese de gel por 30 min a 100 V.
- Remova a bandeja de gel da câmara e o gel de slides para remover da bandeja. Coloque gel em uma bandeja de coloração.
- Mergulhe gel na mancha de gel de DNA comprada por 5 min, cuidadosamente tremendo bandeja para ajudar a distribuir a mancha por todo o gel.
- Transfira o gel para um recipiente de lavagem e enxágue com água da torneira (40-55 °C) por aproximadamente 10 s.
- Destain lavando 3x em água morna da torneira por 6 min cada com agitação suave para melhores resultados. Se necessário, continue se deseminhando em água morna até que o contraste desejado seja alcançado.
Número do tubo |
Cartilha |
Amostra de DNA |
1 |
Primer de planta de 20 μL (verde) |
DNA de controle alimentar não transgênico de 20 μL |
2 |
Primer 20 μL GMO (vermelho) |
DNA de controle alimentar não transgênico de 20 μL |
3 |
Primer de planta de 20 μL (verde) |
20 μL Teste dna alimentar |
4 |
Primer 20 μL GMO (vermelho) |
20 μL Teste dna alimentar |
5 |
Primer de planta de 20 μL (verde) |
DNA de controle positivo 20 μL GMO |
6 |
Primer 20 μL GMO (vermelho) |
DNA de controle positivo 20 μL GMO |
Mesa 1. Lista dos números de tubos apropriados, primers e amostras de DNA.
Bem 1 |
Amostra 1 Controle alimentar não Transgênico com primers de plantas 20 μL. |
Bem 2 |
Amostra 2 Controle alimentar não transgênico com primers OGM 20 μL. |
Bem 3 |
Amostra 3 Testar alimentos com primers de plantas 20 μL. |
Bem 4 |
Amostra 4 Alimentos de teste com primers OGM 20 μL. |
Bem 5 |
Amostra 5 DNA positivo OGM com primers de plantas 20 μL. |
Bem 6 |
Amostra 6 DNA positivo de OGM com primers OGM 20 μL. |
Bem 7 |
Régua de peso molecular PCR 20 μL. |
Bem 8 |
Deixe vazio. |
Mesa 2. A ordem apropriada para carregar 20 μL da régua de peso molecular e 20 μL de cada amostra no gel.