Depois de realizar a ressonância magnética de alta resolução, converta os arquivos de varredura DICOM ponderados em T1, T2 e eco de tempo zero do formato DICOM para NIfTI usando a ferramenta dcm2niix. Usando a ferramenta SimNIBS Charm, execute o co-registro e a extração da máscara de tecido. Em seguida, abra o Brainsight.
Clique em Novo projeto vazio e carregue a imagem T1 ponderada do NIfTI do participante. Clique na guia Reconstruções e, em seguida, no menu suspenso Nova Reconstrução. Clique em Skin, seguido de Compute Skin na nova janela.
Depois de concluído, clique no botão Fechar no canto superior esquerdo da janela. Na guia Reconstruções, clique no menu suspenso Nova Reconstrução, seguido por Full Brain Curvilinear. Agora ajuste a posição da caixa verde nos planos sagital, coronal e transversal arrastando suas bordas para envolver firmemente o cérebro.
Percorra todas as fatias para garantir que nenhuma borda de tecido se sobreponha. Clique em Calcular curvilíneo e ajuste a profundidade da casca para quatro milímetros. Em seguida, clique na guia Pontos de referência no Brainsight, seguido de Configurar pontos de referência.
Coloque a mira na ponta do nariz e, no campo de nome, rotule o ponto de referência como Nariz. Em seguida, coloque a mira entre os olhos acima da ponte do nariz e rotule o marco Nasion. Em seguida, coloque a mira na orelha esquerda e rotule o marco L Ear.
Em seguida, coloque a mira na orelha direita e rotule o marco R Ear. Depois, clique na guia Destinos, seguido de Configurar destinos. Coloque a mira no local do alvo desejado e use os botões de ângulo no lado direito da tela para definir o ângulo da trajetória.
Depois que o alvo e a trajetória desejados forem selecionados, clique no novo menu suspenso e escolha Trajetória. Para nomear o destino, digite na caixa de texto ao lado do nome. Clique em Exportar para exportar o destino e salve-o na pasta de assunto apropriada.
Abra o BabelBrain e selecione os arquivos necessários para simulações acústicas e térmicas. Para selecionar o arquivo de texto exportado anteriormente do Brainsite, clique em Selecionar trajetória e escolha o arquivo de participante apropriado. Clique em selecionar SimNIBS, para escolher o arquivo SimNIBS criado anteriormente.
Clique em Selecionar T1W e escolha a imagem ponderada T1 produzida e usada anteriormente para mapeamento de alvo e trajetória. Agora escolha Real CT para tomografias computadorizadas, CTE para varreduras CTE ou não para usar uma máscara simplificada gerada pela ferramenta Charm. Ao usar uma imagem de TC ou CTE, clique no menu suspenso Coreg, seguido de CT para RM. Clique em Selecionar e escolha a imagem correspondente no arquivo de participante apropriado.
Clique em Selecionar perfil térmico e escolha o arquivo de perfil térmico que descreve os parâmetros de sonicação do experimento em termos de duração ativada, duração desativada e ciclo de trabalho. Em seguida, clique no menu suspenso ao lado de Transdutor e selecione o transdutor usado para experimentação. Clique no menu suspenso ao lado de back-end de computação e escolha o back-end de computação do computador que executa as simulações.
Depois que todas as informações forem inseridas, clique em Continuar para concluir o restante das simulações. Agora selecione a frequência de ultrassom do transdutor e os pontos apropriados por comprimento de onda. Clique em Calcular Máscara de Planejamento.
Inspecione a imagem para garantir que os limites da pele, crânio e cérebro foram reconhecidos com precisão. Para simulação acústica, clique na guia Etapa 2 AC Sim para abrir. Ajuste a distância do cone ao ponto focal digitando a distância apropriada.
Para executar a simulação, clique no botão Calcular Campos. Ajuste o valor de ZSteering para que a mira fique no centro do ponto focal. Pressione as setas para cima ou para baixo ou insira manualmente o valor necessário.
Em seguida, clique em Calcular campos. Para simulação térmica, clique na guia Etapa 3 Thermal Sim e, em seguida, clique em Calcular campos térmicos.
