JoVE Logo

Войдите в систему

Для просмотра этого контента требуется подписка на Jove Войдите в систему или начните бесплатную пробную версию.

В этой статье

  • Резюме
  • Аннотация
  • Введение
  • протокол
  • Результаты
  • Обсуждение
  • Раскрытие информации
  • Благодарности
  • Материалы
  • Ссылки
  • Перепечатки и разрешения

Резюме

Здесь мы представляем протокол использования трехмерного быстрого силового картирования - метода атомно-силовой микроскопии - для визуализации структуры раствора на границах твердого тела и жидкости с субнанометровым разрешением путем картирования взаимодействий зонда и образца в межфазной области.

Аннотация

Среди задач для различных областей исследований — визуализация границ раздела твердого и жидкого тела и понимание того, как на них влияют условия раствора, такие как концентрация ионов, pH, лиганды и следовые добавки, а также лежащие в их основе кристаллография и химический состав. В этом контексте трехмерное быстрое отображение сил (3D FFM) стало перспективным инструментом для исследования структуры решения на границах раздела. Эта возможность основана на атомно-силовой микроскопии (АСМ) и позволяет напрямую визуализировать межфазные области в трех пространственных измерениях с субнанометровым разрешением. Здесь мы приводим подробное описание экспериментального протокола для получения данных 3D FFM. Обсуждаются основные соображения по оптимизации рабочих параметров в зависимости от образца и области применения. Кроме того, обсуждаются основные методы обработки и анализа данных, включая преобразование наблюдаемых объектов измеренного прибора в карты сил зонд-образец, которые могут быть связаны со структурой локального решения. Наконец, мы проливаем свет на некоторые нерешенные вопросы, связанные с интерпретацией данных 3D FFM и с тем, как этот метод может стать центральным инструментом в репертуаре науки о поверхности.

Введение

Многие интересные явления происходят в пределах нескольких нанометров от границы между твердым телом и жидкостью, где классические теории коллоидных взаимодействий не выдерживают критики1. Молекулы и ионы растворителя организуются в неожиданные паттерны2 и различные процессы, такие как катализ3, адсорбция ионов 4,5, перенос электронов 6,7, биомолекулярная сборка8, агрегация частиц9, присоединение10,11 и сборка12,13, может произойти. Тем не менее, немногие методы могут охарактеризовать структуру решения на границе раздела, особенно с субнанометровым 3D-разрешением. В этом контексте трехмерное быстрое силовое картирование (3D FFM) – метод, основанный на атомной силовой микроскопии (АСМ) – оказалось полезным инструментом для определения структуры межфазного решения14,15 и понимания его влияния на такие явления.

В целом, методы АСМ используют кантилевер с наноразмерным наконечником для определения характеристик поверхностей с использованием двух основных классов измерений: топографическая визуализация, которая измеряет высоту подложки на каждом пикселе xy, или измерения силы, которые количественно оценивают механические свойства, коллоидные взаимодействия16,17 или адгезионные силы между функционализированным наконечником и подложкой. Сегодня возможности этого универсального инструмента выходят далеко за рамки этих традиционных применений; Опытные пользователи, работающие с современными приборами, могут измерять электрические, магнитные и химические свойства поверхности с помощью силовой микроскопии с помощью спектроскопии идругих методов. Возможно, самым впечатляющим достижением стала возможность отображать материалы и процессы в их нативных решениях с наноразмерным пространственным разрешением в реальном времени 19,20,21. Эта последняя возможность способствовала разработке 3D FFM, которая расширяет измерения АСМ в третьем пространственном измерении, комбинируя одномерные силовые кривые с топографической визуализацией14. В частности, наконечник получает последовательные кривые силы в каждой координате xy для создания 3D-карты сил, обнаруженных наконечником на границе раздела твердое тело и жидкость. Новизна здесь заключается в том, что достаточно быстрый и чувствительный зонд может обнаруживать незначительные градиенты силы, соответствующие локальному распределению молекул, чтобы отобразить структуру межфазного раствора.

На сегодняшний день 3D FFM разрабатывается всего несколькими исследовательскими группами, что, на наш взгляд, связано не с техническими ограничениями, а с необходимостью кастомизации приборов для выполнения этих измерений собственными силами. Тем не менее, 3D FFM недавно была коммерциализирована и теперь доступна исследователям всех соответствующих дисциплин. С научной точки зрения этот метод имеет широкую и междисциплинарную привлекательность. Например, первые 3D-эксперименты FFM были проведены на системах минерал-раствор 15,22,23,24, где важными вопросами были понимание механизмов роста и растворения кристаллов, адсорбции ионов и молекул, а также роль гидратационных слоев в агрегации и присоединении частиц. В ходе успешных экспериментов были идентифицированы атомы кальция и магния в кристаллической решетке25 доломита, визуализирована структура раствора вокруг дефектов кальцитовой точки26 и визуализирована адсорбция ионов на поверхностях слюды27,28 и флюорита24,29.

Помимо визуализации интерфейсов минерал-раствор, 3D FFM может дать представление о фундаментальных вопросах поверхностной и коллоидной физики, таких как масштабирование коллоидных взаимодействий на коротком расстоянии, структура двойных электрических слоев на молекулярном уровне, а также природа и происхождение сольвационных сил. Эти измерения имеют важное значение для электрохимии и исследований аккумуляторов, поскольку 3D FFM может отображать границы раздела электрод-электролит и исследовать их реакцию наэлектрические поля. Другие приложения в материаловедении включают понимание явлений, происходящих на поверхности разделительных мембран, гетерогенных катализаторов и полимерных покрытий. Мы ожидаем, что по мере дальнейшего развития этой способности она также будет играть важную роль в визуализации биомолекул и определении роли взаимодействий, ионов и молекул растворителей в их самосборке.

Одним из ключевых аспектов для продвижения интерпретации данных в 3D FFM является сравнительный анализ с другими экспериментальными и имитационными инструментами, которые ранее использовались для изучения границ раздела твердого и жидкостного тела. Например, методы, основанные на рентгеновской отражательной способности или дифракции, измеряют профили электронной плотности, которые могут быть отображены на распределение ионов и молекул растворителя в зависимости от высоты от границы раздела 30,31,32,33. Этот подход оказался успешным для ряда систем минеральных растворов, но по-прежнему ограничен большими атомарно гладкими поверхностями и часто не способен производить данные с боковым разрешением. Другие методы, такие как спектроскопия генерации суммарных частот, позволяют получить данные о конкретных аспектах структурирования растворителя на минеральных поверхностях, таких как ориентация молекул растворителя на поверхности, но не о прямой визуализации структуры34,35. Кроме того, моделирование молекулярной динамики значительно продвинулось вперед и теперь позволяет регулярно исследовать профили распределения растворителей на поверхностях кристаллов 4,36,37,38,39. Хотя каждый из этих методов имеет свои проблемы и ограничения, они образуют дополнительный набор инструментов для исследования структуры межфазного решения; 3D FFM готова внести значительный вклад в этом направлении и расширить спектр твердо-жидких систем, которые могут быть изучены, а также исследовательские вопросы, на которые можно ответить.

Обязательным условием для реализации 3D FFM на конкретном образце, является возможность получения топографических изображений с желаемым пространственным разрешением. Для получения подробного экспериментального протокола по визуализации АСМ высокого разрешения читатель может обратиться к недавней рукописи Miller et al.20. Для оптимальной работы 3D FFM настоятельно рекомендуется сначала освоить описанную в нем технику визуализации с высоким разрешением. Большинство рекомендаций в этом протоколе применимы и необходимы для 3D FFM. В следующем протоколе мы кратко выделим основные шаги для получения изображений с высоким разрешением, но сосредоточимся на конкретных аспектах 3D FFM.

протокол

1. Загрузка и калибровка наконечника АСМ

  1. Очистите наконечник кантилевера, погрузив его последовательно в воду и растворители изопропанола на несколько минут, чтобы удалить загрязнения и органические адсорбаты. К другим распространенным методам очистки относятся аргоно-плазменная или ультрафиолетово-озоновая обработка поверхности.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Будьте последовательны в подготовке образца и кантилевера при сравнении различных наборов данных. Изменения в процессе очистки могут повлиять на свойства наконечника, такие как химический состав поверхности, гидрофильность или даже форма, и, следовательно, повлиять на измеряемые силы40.
  2. Также промойте держатель кантилевера водой и растворителями изопропанола.
  3. Загрузите консоль в держатель с помощью зажима или винта держателя, как обычно для используемого инструмента АСМ. Подсоедините держатель консоли к АСМ.
  4. Выровняйте лазерное пятно на наконечнике, чтобы максимизировать ответный сигнал с помощью программного обеспечения АСМ, а затем обнулите сигнал отклонения.
  5. Измерьте постоянную консолнечную пружину в воздухе. Этот шаг автоматизирован на большинстве современных микроскопов путем регистрации тепловых флуктуаций кантилевера и подгонки первого резонансного пика к простой модели гармонического генератора, выполненной в соответствии с протоколом производителя.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Измерение постоянной пружины часто упускается из виду в некоторых приложениях АСМ, но имеет решающее значение для правильной интерпретации данных 3D FFM, особенно для преобразования данных из наблюдаемых приборов в измеренные силы, как описано в следующем разделе.

2. Загрузка субстрата и раствора

  1. Отсоедините и снимите держатель кантилевера с столика АСМ и добавьте ~60 мкл раствора для визуализации на наконечник консоли. Убедитесь, что наконечник полностью погружен в раствор. Следите за тем, чтобы во время этого процесса не образовывались пузырьки воздуха.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Решение для визуализации может быть любым, связанным с научным исследованием. В качестве тестового раствора используйте [KCl] = 10 мМ или даже чистую воду.
  2. Расщепляйте образец (например, слюду) непосредственно перед измерениями, чтобы получить гладкую и чистую поверхность. Промойте образец раствором для визуализации, а затем добавьте ~100 μL того же раствора для визуализации на поверхность образца.
    1. Поместите очищенную подложку на предметный столик для образца. Размер субстрата варьируется в зависимости от эксперимента; Она может быть размером с пластину размером 1 x 1 см2 или размером с наночастицы, осажденные на поверхности.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Как и при любом другом измерении АСМ, наличие чистой поверхности очень важно для получения надежных 3D-данных, поскольку интерфейс особенно чувствителен к загрязнению органикой и другими остатками.
  3. Верните и закрепите консольный держатель на его месте на сцене. Осторожно опустите консольное положение до тех пор, пока капли раствора не попадут на наконечник, и образец не соприкоснется. Столик образца управляется либо программным обеспечением прибора, либо физической ручкой на корпусе прибора.
  4. Дайте поверхности образца химически уравновеситься и обменяться ионами с раствором для визуализации в течение примерно 10 минут.
    1. В качестве дополнительного шага снимите кончик кантилевера, замените раствор для визуализации свежим аликвотом, верните держатель кантилевера и приближайтесь к образцу до тех пор, пока наконечник снова не будет погружен в раствор.

3. Настройка параметров прибора для измерений амплитудно-модулированной АСМ

  1. Получите еще один тепловой график, пока наконечник погружен в раствор. На этом этапе убедитесь, что постоянная пружины зафиксирована на уровне, рассчитанном на шаге 1.5, в то время как параметр прибора (например, параметр AmpInVOLS) используется для подгонки теплового пика. Опять же, этот шаг автоматизирован на большинстве современных микроскопов с помощью нескольких щелчков мыши в разделе теплового графика в программном обеспечении прибора.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Этот параметр калибрует преобразование электронного сигнала, обнаруженного прибором, в расстояние между зондом и образцом в нанометрах, чтобы экспериментатор мог получить надежные данные о положении и отклонении зонда.
  2. Настройте наконечник кантилевера, установив частоту привода (νexc) на резонансной частоте (νe), а затем центрируя фазовый сдвиг на 90°, близком к резонансной частоте. Это параметры прибора, которыми пользователи могут управлять с помощью протокола производителя при работе прибора в амплитудно-модулированном режиме.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Некоторые приборы АСМ используют фототермическое возбуждение, для которого резонансная частота равна значению, полученному на шаге 3.1. Этот метод возбуждения зонда очень выгоден для 3D-отображения сил, поскольку он обеспечивает стабильные условия визуализации даже при очень низких амплитудах привода.
  3. Определите приблизительную высоту поверхности образца и осторожно приближайтесь к наконечнику, пока он не войдет в зацепление с поверхностью. Для этого измените амплитуду заданного значения примерно на ~70% от свободной амплитуды с помощью параметра Set Point в программном обеспечении прибора. По мере приближения зонда к поверхности амплитуда снижается до тех пор, пока не достигнет заданного значения, и, таким образом, будет определено, что зонд находится в зацеплении у поверхности.
  4. Получите одну силовую кривую, начинающуюся на расстоянии ~200 нм от поверхности. Как правило, это делается на панели «Сила » программного обеспечения прибора. Прежде чем вытащить наконечник, повторно настройте и центрируйте фазовый сдвиг на 90°, как показано в шаге 3.2. Резонансная частота будет немного уменьшаться из-за взаимодействия зонда с поверхностью.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Этот шаг гарантирует, что во время последующих измерений 3D FFM сдвиг фазы составит примерно 90 градусов в положении втянутого наконечника.
  5. Измените установленную амплитуду на ~70% от свободной амплитуды. Не используйте очень низкие уставки (большие, приложенное усилие), так как это может привести к преждевременному повреждению наконечника.
  6. Получите топографический снимок. Для гладких поверхностей, таких как слюда, начните с изображения ~20 x 20 нм2 . Для более шероховатых поверхностей начните с визуализации больших областей, прежде чем быстро найти атомарно гладкую область 20 x 20нм2 для изображения. Внимательно изучите полученные снимки. На этом этапе разрешение 2D-изображения должно быть, по крайней мере, эквивалентно желаемому разрешению 3D-отображения сил.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Следует позаботиться о том, чтобы свести к минимуму ущерб, наносимый наконечником. Например, не делайте больше изображений, чем это необходимо, и используйте мягкие заданные значения, большие коэффициенты усиления изображения и низкую скорость сканирования при визуализации больших и шероховатых областей.
  7. С помощью программного обеспечения прибора уменьшите амплитуду привода примерно до 0,25 нм, а по возможности даже уменьшите. Соответственно уменьшите заданное значение , чтобы оно всегда было меньше амплитуды привода, и получите тестовые изображения. При правильном выборе наконечника и условий визуализации амплитуда привода может быть уменьшена до ~0,1 нм. Тем не менее, будьте очень осторожны при съемке с такой малой амплитудой на шероховатой поверхности, которая может повредить наконечник.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Для лучшего разрешения по вертикали амплитуда привода должна быть меньше, чем функции решения, которые вы пытаетесь разрешить. Наименьшая свободная амплитуда, которая может быть реально достигнута, ограничена тепловым шумом, связанным с консолью и инструментальной установкой. Качественно оценить отношение сигнал/шум при настройке кантилевера можно, анализируя пиковую амплитуду по сравнению с базовым шумом.
  8. Получение одиночных силовых кривых, начиная с расстояния между зондом и образцом 200 нм. Затем уменьшите расстояние между зондом и образцом для силовых кривых до 50 нм, 10 нм и, наконец, до 5 нм.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Оптимизируйте условия измерения таким образом, чтобы амплитуда в положении втянутого наконечника была как можно ниже (< 0,25 нм); сдвиг фазы в положении втянутого наконечника составляет ~90°; частота возбуждения (νexc) равна резонансной частоте (νe) или очень близка к ней, что упрощает преобразование наблюдаемых прибором сил в измеряемые на последующих этапах; При этом заданное значение достаточно низкое, чтобы фазовый сдвиг (и амплитуда) значительно падал (на ~40-50%) в течение последних нескольких нанометров измерения силы. Приложенное усилие может быть дополнительно увеличено (заданное значение уменьшено). Компромисс заключается в том, что в этом процессе наконечник повреждается быстрее.
  9. Обязательно вынимайте наконечник после того, как захват кривой силы был остановлен. Если наконечник остается зацепленным и близко к поверхности, он может дрейфовать к поверхности и врезаться в нее.
    ПРИМЕЧАНИЕ: На рисунке 1 построены кривые 1D силы для системы мусковит-вода, полученной в растворе [NaCl] = 10 мМ, в частности, фазовая (φ), амплитудная (A) и отклоняющая (δ) реакции. На данном этапе эти профили должны демонстрировать признаки особенностей, на которые нацелены 3D-карты и которые проявляются в виде колебательных особенностей, которые в основном очевидны на фазовой кривой. Обратите внимание, что координата высоты для этих исходных данных произвольна. Более подробная информация об обработке и анализе данных представлена в следующем разделе.

4. Получение 3D-карт сил

ПРИМЕЧАНИЕ: Поиск оптимальных параметров для измерений 3D FFM будет зависеть от поверхности образца, консольного наконечника и решения для визуализации. В качестве отправной точки приведены общие рекомендации, но для определения соответствующих параметров для каждой выборки потребуется получение и анализ наборов данных с различными условиями измерения. Следующие шаги показывают, как получить 3D-карты силы для системы минеральной воды. Все параметры, описанные в шагах 4.2 - задаются с помощью программного обеспечения прибора.

  1. Выполните все действия, как описано в разделах 2 и 3.
  2. Установите расстояние между зондом и образцом (z) на 2-5 нм. Это расстояние достаточно для устранения особенностей межфазного раствора, поскольку наконечник находится близко к поверхности, а также позволяет наконечнику уравновешиваться с объемным раствором, когда он втягивается в самое дальнее положение.4.3.
  3. Установите область сканирования как 3 x 3 нм2 или 10 x 10 нм2, с разрешением 64 x 64 пикселей2 -128 x 128 пикселей2.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Другие приложения, такие как визуализация биомолекул, могут потребовать больших размеров сканирования во всех трех пространственных измерениях.
  4. Установите скорость захвата кривой силы на 200-800 Гц, что соответствует 15-120 с на 3D-набор данных. В идеале максимально уменьшить это число, чтобы свести к минимуму искажение изображения и тепловой дрейф наконечника, сохранив при этом приличное разрешение в направлении z . Для этих скоростей сканирования и размеров после обработки данных в направлении z получают 50-100 пикселей/нм, что обычно достаточно для разрешения межфазной структуры решения.
  5. В качестве отправной точки выберите значение для Заданной точки таким образом, чтобы фазовый сдвиг регулярно падал до ~50-60° на каждой силовой кривой. Заданное значение может быть определено как 50% от свободной амплитуды. Однако это особенно зависит от типа измеряемого образца и потребует проб и ошибок. Например, использование низкой заданной точки (высокого давления) может повредить наконечник или деформировать поверхность в случае мягких молекул. С другой стороны, высокая заданная точка (низкое давление) может быть недостаточной для проникновения и зондирования гидратационных слоев.
  6. Убедитесь, что программное обеспечение записывает четыре ключевых наблюдаемых объекта, необходимых для анализа данных АСМ с амплитудной модуляцией: высота зонда, амплитуда, фаза и отклонение. Обратите внимание, что в зависимости от прибора и программного обеспечения может существовать несколько каналов передачи данных для отслеживания высоты зонда. Поскольку 3D FFM требует очень высокого разрешения, важно использовать максимально гладкие профили высоты зонда с наименьшим перекрытием электронного шума от прибора. В дополнение к записи этих ключевых переменных необходимы другие рабочие параметры и метаданные для анализа и реконструкции сил, действующих на зонд (обычно сохраняемых в файле данных по умолчанию), как описано в следующем разделе.
    ПРИМЕЧАНИЕ: 3D FFM была продемонстрирована как в режиме амплитудно-модулированной, так и в частотно-модулированной АСМ. С точки зрения качества и анализа данных эти два метода эквивалентны. Соответственно, предпочтительный режим работы оставляется на усмотрение и опыт экспериментатора. Одним из возможных преимуществ амплитудно-модулированного режима является стабильность зонда на больших расстояниях z , что позволяет пользователю получать 3D-данные, простирающиеся на >10 нм в раствор. Для сравнения, одним из недостатков этого режима является визуализация мягких молекул с масштабами релаксации, более медленными, чем движение кантилевера. Последнее приложение дает возможность FFM исследовать межфазную релаксацию в мягких материалах и вязких жидкостях. В этих случаях измеренные профили амплитуды могут показывать гистерезис в циклах приближения и втягивания, что создает неопределенность в отношении фактической высоты зонда.

5. Обработка данных 3D карты сил

ПРИМЕЧАНИЕ: Следующие шаги могут быть выполнены в предпочтительном программном обеспечении для анализа данных с использованием собственных кодов или с использованием файлов обработки данных, предоставленных в Вспомогательной информации.

  1. Загрузите необработанные данные в предпочитаемое программное обеспечение для анализа для расчетов и визуализации.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Необходимыми наблюдаемыми факторами для анализа являются амплитуда (A), фазовый сдвиг (φ) и прогиб зонда (δ) в зависимости от смещения по высоте (z), а также свойства зонда, такие как резонансная частота (νe), постоянная пружины (k) и добротность (Q). К другим рабочим параметрам относятся размеры сканирования, скорость сканирования, частота возбуждения зонда (νexc) и амплитуда привода (A0). Последнее значение обычно записывается в единицах напряжения, но может быть легко преобразовано в нанометры на основе калибровочного значения, полученного на шаге 3.1.
  2. Извлеките эквивалентное топографическое изображение из набора 3D-данных, записав наибольшее смещение вершины по высоте в каждой координате xy . Используя эти данные, рассчитайте наклон образца, подогнав прямые линии к профилям средней высоты в обоих направлениях сканирования x и y . Даже если поверхность атомарно гладкая, такая как слюда, ожидается наклон образца в несколько градусов, и соответствующий наклон высоты должен быть учтен до начала анализа данных.
    ПРИМЕЧАНИЕ: На большинстве современных приборов этот шаг автоматизирован для обычной топографической визуализации, но для данных 3D FFM его следует выполнять вручную. Очевидно, что этот метод следует немного подкорректировать, если пользователь измеряет более сложные поверхности, такие как кристаллы с многоступенчатыми краями.
  3. Линеаризуйте профили смещения по высоте. Напомним, что зонд в 3D FFM следует по схожим синусоидальным траекториям в каждом цикле захода на посадку и втягивания. Тем не менее, самая дальняя протяженность зонда варьируется в зависимости от того, на какой кристаллографический участок она приземляется, и зарегистрированные высоты вершины, очевидно, не идентичны последней значащей цифре. Соответственно, значения высоты, измеренные во всех траекториях зонда, дискретизируются для получения единого линейного z-профиля для всех силовых кривых.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Размер ячейки зависит от параметров измерения и шкалы длины интересующих объектов. Для большинства приложений разрешение по высоте 0,2 Å является достаточным. Эта величина более чем в десять раз меньше размера молекулы воды; Использование бункеров меньшего размера не дает преимуществ и фактически находится в пределах механического и электронного шума прибора.
  4. Рассчитайте средние наблюдаемые значения, соответствующие ячейкам высот для каждой отдельной кривой силы. Этот метод позволяет получить 3D-объем данных о фазе/амплитуде, который можно легко разрезать и визуализировать в любом направлении.
    ПРИМЕЧАНИЕ: В принципе, профили сил от подхода и отвода наконечника должны быть одинаковыми. Можно проверить, что более целесообразно — использовать данные одного или обоих в зависимости от конкретной выборки. В частности, биомолекулы и более мягкие более крупные молекулы могут проявлять эффекты гистерезиса в циклах приближения/втягивания. В этом случае пользователю рекомендуется изменить условия визуализации, как описано выше.
  5. Отрегулируйте профили высоты, учитывая прогиб наконечника. Этот шаг является необязательным и оставлен на усмотрение пользователя. Например, при использовании консолей с большими пружинными постоянными (>200 Н/м) отклонение наконечника в растворе разбавленной соли обычно составляет менее <0,08 Å, что не оказывает существенного влияния на данные.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Основываясь на конкретном образце, пользователь может либо 1) пренебречь отклонением наконечника для очень жестких консолей, предварительно проверив, что их влияние незначительно, 2) скорректировать высоту наконечника, используя профиль отклонения, усредненный из всего набора данных, 3) скорректировать высоту наконечника для каждой отдельной кривой силы, используя соответствующие данные об отклонении наконечника из этой кривой силы. Последний вариант интуитивно является наиболее «правильным» и должен быть реализован по возможности, но такой подход часто вносит больше шума в данные, который перевешивает достоинства этой коррекции.
  6. Сгладьте набор данных с помощью 3D-медианного фильтра. В большинстве случаев этот дополнительный шаг снижает уровень шума без ущерба для разрешения. Полезно также сохранять версию неотфильтрованных данных для проверки согласованности на последующих этапах анализа. Кроме того, пользователь может изучить более продвинутые методы фильтрации, такие как методы на основе анализа главных компонент, которые легко доступны в большинстве программ обработки данных.
  7. Сохраните обработанные результаты, а также полезные метаданные (параметры измерения, важные для преобразования наблюдаемых АСМ в силу зонд-образец) в файл данных, который можно использовать для последующего анализа.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Три файла обработки данных, представленные в Вспомогательной информации , могут быть использованы для выполнения функций, перечисленных в этом разделе. Первый файл загружает необработанные 3D данные FFM и создает файл hdf5, который включает в себя соответствующие данные и метаданные; Это просто перенос данных в более удобный для пользователя файл, к которому можно получить более легкий доступ для обработки. Второй файл обрабатывает исходные данные в соответствии с описанными выше шагами, извлекая изображение эквивалентной высоты, линеаризовав профили смещения высоты, сортируя значения данных по соответствующим ячейкам высоты, сглаживая набор данных с помощью фильтра, и сохраняет обработанные результаты в выходной файл данных. Пользователь также может активировать некоторые функции для построения примера силовых кривых (необработанных и обработанных), срезов xz/xy и коррекции наклона подложки, а также выполнить другие проверки согласованности постобработки. Эти скрипты обработки данных удобны для пользователя и аннотированы, демонстрируя точные шаги для пользователей по настройке параметров и извлечению данных из необработанных файлов приборов.

Результаты

На рисунке 2А представлена схема 3D-отображения сил. Подобно другим методам АСМ, работающим в амплитудно-модулированном режиме, осциллирующий кантилевер сканируется по поверхности. В дополнение к высоте зонда в каждой координате, данные прибора, такие ...

Обсуждение

Выбор наконечника АСМ
Как и в любом приложении АСМ, ключевыми характеристиками наконечника щупа являются резонансная частота, размер кантилевера, радиус наконечника, материал наконечника и постоянная пружины. Почти во всей литературе по 3D FFM на сегодняшни?...

Раскрытие информации

Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих финансовых интересов или других конфликтов интересов.

Благодарности

Мы благодарим д-ра Марту Кокун (Asylum Research), д-ра Такеши Фукуму (Канадзава), д-ра Рикардо Гарсию (CSIC Madrid), д-ра Ангелику Кюнле (Билефельд), д-ра Ральфа Бехштейна (Билефельд), Себастьяна Зайберта (Билефельд) и д-ра Хироши Ониси (Кобе) за полезные беседы.

Разработка экспериментального протокола 3D FFM была поддержана в рамках IDREAM (Interfacial Dynamics in Radioactive Environments and Materials), исследовательского центра энергетических рубежей, финансируемого Министерством энергетики США (DOE), Управлением науки (SC), Управлением фундаментальных энергетических наук (BES). Разработка кода анализа данных 3D FFM была поддержана Программой лабораторных исследований и разработок (LDRD) в Тихоокеанской северо-западной национальной лаборатории (PNNL) в рамках программы стипендий Лайнуса Полинга для выдающихся постдокторантов, которой Э.Н. выражает благодарность за поддержку. Разработка возможности измерения 3D FFM проводилась в PNNL при поддержке Отдела материаловедения и инженерии, программы «Синтез и обработка наук» BES. PNNL является многопрофильной национальной лабораторией, управляемой для Министерства энергетики Мемориальным институтом Баттеля по контракту No. DEAC05-76RL0-1830.

Материалы

NameCompanyCatalog NumberComments
AC55TS AFM tipOlympus
Cypher VRS Atomic Force MicroscopeAsylum Research
PPP-NCH AFM tipNanosensors
Tap300-G AFM tipBudget Sensors
USC-F5-k30-10 AFM tipNanoworld
(Note only one of the AFM tip options is required)

Ссылки

  1. Israelachvili, J. N. . Intermolecular and Surface Forces. Third edition. , (2011).
  2. Israelachvili, J. N., Pashley, R. M. Molecular layering of water at surfaces and origin of repulsive hydration forces. Nature. 306, (1983).
  3. Bentley, C. L., Kang, M., Unwin, P. R. Nanoscale surface structure-activity in electrochemistry and electrocatalysis. Journal of American Chemical Society. 141, 2179-2193 (2019).
  4. Bourg, I. C., Lee, S. S., Fenter, P., Tournassat, C. Stern layer structure and energetics at mica-water interfaces. Journal of Physical Chemistry C. 121, 9402-9412 (2017).
  5. Lee, S. S., Fenter, P., Nagy, K. L., Sturchio, N. C. Real-time observation of cation exchange kinetics and dynamics at the muscovite-water interface. Nature Communications. 8, 15826 (2017).
  6. Suo, L., et al. "Water-in-salt" electrolyte makes aqueous sodium-ion battery safe, green, and long-lasting. Advanced Energy Materials. 7, 1701189 (2017).
  7. Magnussen, O. M., Gross, A. Toward an atomic-scale understanding of electrochemical interface structure and dynamics. Journal of American Chemical Society. 141, 4777-4790 (2019).
  8. Chen, J., et al. Building two-dimensional materials one row at a time: Avoiding the nucleation barrier. Science. 362, 1135-1139 (2018).
  9. Nakouzi, E., et al. Impact of solution chemistry and particle anisotropy on the collective dynamics of oriented aggregation. ACS Nano. 12, 10114-10122 (2018).
  10. De Yoreo, J. J., et al. Crystallization by particle attachment in synthetic, biogenic, and geologic environments. Science. 349, (2015).
  11. Liu, L., et al. Connecting energetics to dynamics in particle growth by oriented attachment using real-time observations. Nature Communications. 11, 1045 (2020).
  12. Lee, J., et al. Mechanistic understanding of the growth kinetics and dynamics of nanoparticle superlattices by coupling interparticle forces from real-time measurements. ACS Nano. 12, 12778-12787 (2018).
  13. Lee, J., et al. Interplay between short- and long-ranged forces leading to the formation of Ag nanoparticle superlattice. Small. 15, 1901966 (2019).
  14. Fukuma, T., Garcia, R. Atomic- and molecular-resolution mapping of solid-liquid interfaces by 3D atomic force microscopy. ACS Nano. 12, 11785-11797 (2018).
  15. Herruzo, E. T., Asakawa, H., Fukuma, T., Garcia, R. Three-dimensional quantitative force maps in liquid with 10 piconewton, angstrom and sub-minute resolutions. Nanoscale. 5, 2678-2685 (2013).
  16. Zhang, X., et al. Direction-specific interaction forces underlying zinc oxide crystal growth by oriented attachment. Nature Communications. 8, 835 (2017).
  17. Li, D., et al. Trends in mica-mica adhesion reflect the influence of molecular details on long-range dispersion forces underlying aggregation and coalignment. Proceedings of the National Academy of Science U. S. A. 114, 7537-7542 (2017).
  18. Eaton, P., West, P. . Atomic Force Microscopy. , (2018).
  19. Fukuma, T., Kobayashi, K., Matsushige, K., Yamada, H. True atomic resolution in liquid by frequency-modulation atomic force microscopy. Applied Physics Letters. 87, 034101 (2005).
  20. Miller, E. J., et al. Sub-nanometer resolution imaging with amplitude-modulation atomic force microscopy in liquid. Journal of Visualized Experiments. (118), e54924 (2016).
  21. Legg, B. A., et al. Visualization of aluminum ions at the mica water interface links hydrolysis state-to-surface potential and particle adhesion. Journal of the American Chemical Society. 142, 6093-6102 (2020).
  22. Fukuma, T., Ueda, Y., Yoshioka, S., Asakawa, H. Atomic-scale distribution of water molecules at the mica-water interface visualized by three-dimensional scanning force microscopy. Physical Review Letters. 104, 016101 (2010).
  23. Fukuma, T., et al. Mechanism of atomic force microscopy imaging of three-dimensional hydration structures at a solid-liquid interface. Physical Review B. 92, 155412 (2015).
  24. Miyazawa, K., et al. A relationship between three-dimensional surface hydration structures and force distribution measured by atomic force microscopy. Nanoscale. 8, 7334-7342 (2016).
  25. Songen, H., et al. Chemical identification at the solid-liquid interface. Langmuir. 33, 125-129 (2017).
  26. Songen, H., et al. Resolving point defects in the hydration structure of calcite (10.4) with three-dimensional atomic force microscopy. Physical Review Letters. 120, 116101 (2018).
  27. Martin-Jimenez, D., Chacon, E., Tarazona, P., Garcia, R. Atomically resolved three-dimensional structures of electrolyte aqueous solutions near a solid surface. Nature Communications. 7, 12164 (2016).
  28. Martin-Jimenez, D., Garcia, R. Identification of single adsorbed cations on mica-liquid interfaces by 3D force microscopy. Journal of Physical Chemistry Letters. 8, 5707-5711 (2017).
  29. Miyazawa, K., Watkins, M., Shluger, A. L., Fukuma, T. Influence of ions on two-dimensional and three-dimensional atomic force microscopy at fluorite-water interfaces. Nanotechnology. 28, 245701 (2017).
  30. Fenter, P., Kerisit, S., Raiteri, P., Gale, J. D. Is the calcite-water interface understood? Direct comparisons of molecular dynamics simulations with specular X-ray reflectivity data. Journal of Physical Chemistry C. 117, 5028-5042 (2013).
  31. Pintea, S., de Poel, W., de Jong, A. E. F., Felici, R., Vlieg, E. Solid-liquid interface structure of muscovite mica in SrCl2 and BaCl2 solutions. Langmuir. 34, 4241-4248 (2018).
  32. Garcia, N., Raiteri, P., Vlieg, E., Gale, J. Water structure, dynamics and ion adsorption at the aqueous {010} brushite surface. Minerals. 8, 334 (2018).
  33. Bracco, J. N., et al. Hydration structure of the barite (001)-water Interface: Comparison of X-ray reflectivity with molecular dynamics simulations. Journal of Physical Chemistry C. 121, 12236-12248 (2017).
  34. Tuladhar, A., Piontek, S. M., Borguet, E. Insights on interfacial structure, dynamics, and proton transfer from ultrafast vibrational sum frequency generation spectroscopy of the alumina(0001)/water interface. Journal of Physical Chemistry C. 121, 5168-5177 (2017).
  35. Dewan, S., Yeganeh, M. S., Borguet, E. Experimental correlation between interfacial water structure and mineral reactivity. Journal of Physical Chemistry Letters. 4, 1977-1982 (2013).
  36. Spijker, P., et al. Understanding the interface of liquids with an organic crystal surface from atomistic simulations and AFM experiments. Journal of Physical Chemistry C. 118, 2058-2066 (2014).
  37. Kerisit, S., Okumura, M., Rosso, K., Machida, M. Molecular simulation of cesium adsorption at the basal surface of phyllosilicate minerals. Clays and Clay Minerals. 64, 389-400 (2016).
  38. Kerisit, S. N., De Yoreo, J. J. Effect of hydrophilicity and interfacial water structure on particle attachment. Journal of Physical Chemistry C. 124, 5480-5488 (2020).
  39. Willemsen, J. A. R., Myneni, S. C. B., Bourg, I. C. Molecular dynamics simulations of the adsorption of phthalate esters on smectite clay surfaces. Journal of Physical Chemistry C. 123, 13624-13636 (2019).
  40. Voïtchovsky, K. High-resolution AFM in liquid: What about the tip. Nanotechnology. 26, 100501 (2015).
  41. Fukuma, T., Onishi, K., Kobayashi, N., Matsuki, A., Asakawa, H. Atomic-resolution imaging in liquid by frequency modulation atomic force microscopy using small cantilevers with megahertz-order resonance frequencies. Nanotechnology. 23, 135706 (2012).
  42. Seibert, S., Klassen, S., Latus, A., Bechstein, R., Kuhnle, A. Origin of ubiquitous stripes at the graphite-water interface. Langmuir. 36, 7789-7794 (2020).
  43. Songen, H., Bechstein, R., Kuhnle, A. Quantitative atomic force microscopy. Journal of Physics: Condensed Matter. 29, 274001 (2017).
  44. Payam, A. F., Martin-Jimenez, D., Garcia, R. Force reconstruction from tapping mode force microscopy experiments. Nanotechnology. 26, 185706 (2015).
  45. Araki, Y., Sekine, T., Chang, R., Hayashi, T., Onishi, H. Molecular-scale structures of the surface and hydration shell of bioinert mixed-charged self-assembled monolayers investigated by frequency modulation atomic force microscopy. RSC Advances. 8, 24660-24664 (2018).
  46. Asakawa, H., Yoshioka, S., Nishimura, K. -. i., Fukuma, T. Spatial distribution of lipid headgroups and water molecules at membrane water interfaces visualized by three-dimensional scanning force microscopy. ACS Nano. 10, 9013-9020 (2012).
  47. Nakouzi, E., et al. Moving beyond the solvent-tip approximation to determine site-specific variations of interfacial water structure through 3D force microscopy. Journal of Physical Chemistry C. 125, 1282-1291 (2020).
  48. Watkins, M., Reischl, B. A simple approximation for forces exerted on an AFM tip in liquid. Journal of Chemical Physics. 138, 154703 (2013).
  49. Kaggwa, G. B., Nalam, C. P., Kilpatrick, J. I., Spencer, N. D., Jarvis, S. P. Impact of hydrophilic/hydrophobic surface chemistry on hydration forces in the absence of confinement. Langmuir. 28, 6589-6594 (2012).
  50. Miyazawa, K., et al. Tip dependence of three-dimensional scanning force microscopy images of calcite-water interfaces investigated by simulation and experiments. Nanoscale. 12, 12856-12868 (2020).
  51. Umeda, K., et al. Atomic-resolution three-dimensional hydration structures on a heterogeneously charged surface. Nature Communications. 8, 2111 (2017).

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи

Запросить разрешение

Смотреть дополнительные статьи

3D FFM

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Исследования

Образование

О JoVE

Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены