Для просмотра этого контента требуется подписка на Jove Войдите в систему или начните бесплатную пробную версию.
Method Article
В этом протоколе квантовые точки, конъюгированные с рекомбинантным всплеском SARS-CoV-2, позволяют клеточным анализам контролировать связывание шипов с hACE2 на плазматической мембране и последующий эндоцитоз связанных белков в цитоплазму.
Разработка новых технологий клеточной флуоресцентной микроскопии облегчила высокопроизводительные методы скрининга для открытия лекарств. Квантовые точки представляют собой флуоресцентные наночастицы с отличными фотофизическими свойствами, проникнутыми яркой и стабильной фотолюминесценцией, а также узкими эмиссионными полосами. Квантовые точки имеют сферическую форму и при правильной модификации химического состава поверхности могут использоваться для сопряжения биомолекул для клеточных применений. Эти оптические свойства в сочетании со способностью функционализировать их с биомолекулами делают их отличным инструментом для исследования рецептор-лигандных взаимодействий и клеточного трафика. Здесь мы представляем метод, который использует квантовые точки для отслеживания связывания и эндоцитоза спайкового белка SARS-CoV-2. Этот протокол может быть использован в качестве руководства для экспериментаторов, желающих использовать квантовые точки для изучения белково-белковых взаимодействий и торговли в контексте клеточной физиологии.
Флуоресцентная микроскопия позволяет исследователям заглянуть во внутреннюю работу клетки, используя специализированные красители1, генетически закодированные флуоресцентные белки2 и флуоресцентные наночастицы в виде квантовых точек (QD)3. Для глобальной пандемии коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома 2019 года (SARS-CoV-2) исследователи использовали флуоресцентную микроскопию, чтобы понять, как вирус взаимодействует с клеткой как на плазматической мембране, так и в цитоплазме. Например, исследователи смогли получить представление о связывании белка SARS-CoV-2 Spike на поверхности вириона с человеческим ангиотензинпревращающим ферментом 2 (hACE2) на поверхности клеток человека, последующей интернализацией через слияние на плазматической мембране и эндоцитозом белкового комплекса Spike: hACE24,5. Также было получено большое понимание выхода SARS-CoV-2 из клеток через лизосому с использованием клеточной флуоресцентной визуализации, уникальной особенности коронавирусов, которые, как ранее считалось, происходят через традиционное пузырьковое почкование из Гольджи, как и со многими другими вирусами6. Являясь основой почти всех аспектов биологических исследований, метод клеточной флуоресцентной микроскопии обязательно продвинулся в своей широте и области применения от визуализации со сверхвысоким разрешением целых животных до автоматизированной многопараметрической визуализации с высоким содержанием для скрининга лекарств. Здесь автоматизированная конфокальная микроскопия с высоким содержанием применяется для исследования проникновения в клетки SARS-CoV-2 с использованием флуоресцентных QD, конъюгированных с вирусным спайковым белком.
Анализ изображений с высоким содержанием, генерируемых платформами биологической визуализации, позволяет получить большую ценную биологическую информацию, чем отдельные параметры, такие как интенсивность всей скважины, которые можно было бы получить с помощью мультимодального считывателя пластин7. Разделяя объекты в поле зрения с помощью автоматизированных алгоритмов сегментации, каждый объект или совокупность объектов могут быть проанализированы по таким параметрам, как интенсивность, площадь и текстура в каждом доступном флуоресцентном канале8. Объединение многих измерений в многомерные наборы данных является полезным подходом для фенотипического профилирования. Когда желаемый фенотип известен, например, интернализация QD в форме пункты, можно использовать измерения, связанные с пунктой, такие как размер, количество и интенсивность, для оценки эффективности лечения.
Облачное программное обеспечение для анализа изображений с высоким содержанием может вместить большое разнообразие выходных данных приборов, включая платформу обработки изображений с высоким содержанием. Используя облачный сервер для хранения изображений и онлайн-анализа, пользователь может загружать свои данные либо с инструмента обработки изображений, либо с сетевого диска, на котором хранятся данные. Аналитическая часть протокола проводится в облачной программной среде, и данные могут быть экспортированы в различные форматы файлов для последующей визуализации данных.
Вирус SARS-CoV-2 состоит из неструктурных и структурных белков, которые помогают в его сборке и репликации. Спайк SARS-CoV-2 имеет два домена, называемых S1 и S2, причем S1 содержит рецептор-связывающий домен, ответственный за взаимодействия hACE2 в плазматической мембране9. Также было обнаружено, что Спайк взаимодействует с другими молекулами плазматической мембраны, которые могут действовать как корецепторы в дополнение к hACE210,11. По всей последовательности спайкового белка и особенно на границе раздела S1/S2 существуют участки расщепления протеазы, которые позволяют сращиваться на мембране после трансмембранной сериновой протеазы 2 (TMPRSS2)12. Различные рекомбинантные белки SARS-CoV-2 Spike были получены из отдельных рецепторсвязывающих доменов до S1, S2, S1 с S2 и целых тримеров шипов от нескольких коммерческих поставщиков для использования в исследовательской деятельности13.
В этой работе поверхность QD была функционализирована рекомбинантными шиповыми тримерами, которые содержат гистидиновую метку (QD-Spike). QD, производимые Отделом оптических наноматериалов Военно-морской исследовательской лаборатории, содержат ядро селенида кадмия и оболочку сульфида цинка14,15. Цинк на поверхности QD координирует остатки гистидина в рекомбинантном белке, образуя функционализированный QD, который по форме и функции напоминает вирусную частицу SARS-CoV-2. Генерация наночастиц и конъюгация белка были ранее описаны с использованием QD-конъюгированного рецепторсвязывающего домена15. Этот метод описывает препараты клеточной культуры, лечение QD, сбор изображений и протокол анализа данных, которые могут направлять исследователя в изучении активности SARS-CoV-2 Spike в физиологическом контексте клетки человека.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Клеточная линия HEK293T, используемая в этом исследовании, является увековеченной клеточной линией. В этом исследовании не использовались ни люди, ни животные.
1. Культивирование и посев клеток
2. Лечение клеток QD-Spike
3. Фиксация и окрашивание ядер
4. Настройка сбора и визуализация
5. Анализ данных
6. Экспорт данных
7. Анализ данных в электронной таблице
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
После лечения QD будут интернализованы, поскольку наночастица будет связываться с ACE2 на плазматической мембране и индуцировать эндоцитоз. Используя ACE2-GFP экспрессирующую клеточную линию, транслокация как QD, так и ACE2 может быть визуализирована с помощью флуоресцентной микроскопии. Посл...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Метод, описанный в этой статье, обеспечивает необходимые шаги для визуализации функционализированных QD в клетках человека с использованием высокопроизводительной конфокальной микроскопии. Этот метод лучше всего подходит для клеток, где эндоцитоз является основным путем проникновен...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
У авторов нет конфликта интересов для раскрытия.
Это исследование было частично поддержано Программой внутренних исследований Национального центра продвижения трансляционных наук, NIH. Военно-морская исследовательская лаборатория предоставила финансирование через свой внутренний Институт нанонауки. Препарат реагентов поддерживался через базовый фонд NRL COVID-19.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
32% Paraformaldehyde | Electron Microscopy Sciences | 15714 | Used for fixing cells after quantum dot treatment, final concentration 3.2% Used for stabilizing QDs in Optimem I and preventing non-specific interactions, final concentration 0.1% |
7.5% Bovine Serum Albumin | Gibco | 15260-037 | Used as a cell viability dye for fluorescence cell counting |
Acridine Orange / Propidium Iodide Stain | Logos Biosystems | F23001 | Microwell plates used for seeding cells and assaying QD-Spike |
Black clear bottom 96 well coated plate coated with poly-D-lysine | Greiner | 655946 | Used to support cell culture, DMEM supplement |
Characterized Fetal Bovine Serum | Cytiva/HyClone | SH30071.03 | Cloud-based high-content image analysis software; V2.9.1 |
Columbus Analyzer | Perkin Elmer | NA | Used for labeling cell nuclei and cell bodies after fixation, deep red nuclear dye |
DRAQ5 (5 mM) | ThermoFisher Scientific | 62252 | Basal media for HEK293T cell culture |
Dulbecco's Minimal Essential Media, D-glucose (4.5g/L), L-glutamine, sodium pyruvate (110 mg/L), phenol red | Gibco | 11995-065 | Used for arranging data after export from Columbus; V2110 Microsoft 365 |
Excel | Microsoft | NA | Used to continue selection of hACE2-GFP positive cells, DMEM supplement |
G418 | InvivoGen | ant-gn-5 | Human embryonic kidney cell line stably expression human angiotensin converting enzyme 2 tagged with GFP |
HEK293T hACE2-GFP | Codex Biosolutions | CB-97100-203 | Automated cell counter |
Luna Automated Cell Counter | Logos Biosystems | NA | Used for fluorescence cell counting |
Luna Cell Counting Slides | Logos Biosystems | L12001 | High-content imaging platform |
Opera Phenix | Perkin Elmer | NA | Imaging media, used for incubating cells with quantum dots |
Opti-MEM I Reduced Serum Medium | Gibco | 11058-021 | Phosphate-buffered saline without calcium or magnesium used for washing cells during passaging and assaying |
PBS -/- | Gibco | 10010-023 | Used to prevent bacterial contamination of cell culture, DMEM supplement |
Penicillin Streptomycin | Gibco | 15140-122 | Used for graphing, data visualization, and statistical analysis;V9.1.0 |
Prism | GraphPad | NA | Used for assaying SARS-Cov-2 Spike binding to hACE2 and monitoring Spike endocytosis |
Quantum Dot 608 nm-Spike (QD608-Spike) | custom made by Naval Research Laboratory | Used for inhibition of SARS-Cov-2 Spike binding to hACE2 | |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike Neutralizing Antibody, Mouse Mab | Sino Biological | 40592-MM57 | Used to dissociate cells from flask during passaging |
TrypLE Express | Gibco | 12605-010 |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены