JoVE Logo

Войдите в систему

Для просмотра этого контента требуется подписка на Jove Войдите в систему или начните бесплатную пробную версию.

В этой статье

  • Резюме
  • Аннотация
  • Введение
  • протокол
  • Результаты
  • Обсуждение
  • Раскрытие информации
  • Благодарности
  • Материалы
  • Ссылки
  • Перепечатки и разрешения

Резюме

Человеческий грибковый патоген Cryptococcus neoformans продуцирует различные факторы вирулентности (например, пептидазы), способствующие его выживанию в организме хозяина. Экологические ниши представляют собой многообещающий источник новых природных ингибиторов пептидазы. В этом протоколе описывается приготовление экстрактов из моллюсков и оценка их влияния на выработку фактора вирулентности грибов.

Аннотация

Cryptococcus neoformans - это инкапсулированный грибковый патоген человека с глобальным распространением, который в основном заражает людей с ослабленным иммунитетом. Широкое использование противогрибковых препаратов в клинических условиях, их использование в сельском хозяйстве и гибридизация штаммов привели к увеличению эволюции резистентности. Этот растущий уровень резистентности к противогрибковым препаратам вызывает растущую озабоченность среди клиницистов и ученых во всем мире, и существует повышенная необходимость в разработке новых противогрибковых методов лечения. Например, C. neoformans продуцирует несколько факторов вирулентности, включая внутри- и внеклеточные ферменты (например, пептидазы), играющие роль в деградации тканей, клеточной регуляции и усвоении питательных веществ. Нарушение такой пептидазной активности ингибиторами нарушает рост и пролиферацию грибов, предполагая, что это может быть важной стратегией борьбы с патогеном. Важно отметить, что беспозвоночные, такие как моллюски, продуцируют ингибиторы пептидазы с биомедицинским применением и антимикробной активностью, но они недостаточно изучены с точки зрения их использования против грибковых патогенов. В этом протоколе была проведена глобальная экстракция из моллюсков для выделения потенциальных ингибиторов пептидазы в сырых и осветленных экстрактах, и было оценено их влияние на классические факторы вирулентности криптококка. Этот метод поддерживает приоритет моллюсков с противогрибковыми свойствами и предоставляет возможности для открытия противовирулентных агентов за счет использования природных ингибиторов, обнаруженных в моллюсках.

Введение

Cryptococcus neoformans — это грибковый патоген человека, который вызывает тяжелое заболевание у хозяев с ослабленным иммунитетом, таких как люди, живущие с ВИЧ/СПИДом1, и приводит примерно к 19% смертей, связанных соСПИДом2. Гриб чувствителен к нескольким классам противогрибковых препаратов, включая азолы, полиены и флуцитозин, которые проявляют фунгицидную и фунгистатическую активность с использованием различных механизмов 3,4. Однако широкое использование противогрибковых препаратов в клинических и сельскохозяйственных условиях в сочетании с гибридизацией штаммов усилило эволюцию резистентности у нескольких видов грибов, включая C. neoformans5.

Для преодоления проблем устойчивости к противогрибковым препаратам и снижения распространенности грибковых инфекций в глобальном масштабе перспективным подходом является использование факторов вирулентности Cryptococcus spp. (например, температурной адаптивности, полисахаридной капсулы, меланина и внеклеточных ферментов)в качестве потенциальных терапевтических мишеней 4,6 . Этот подход имеет ряд преимуществ, поскольку эти факторы вирулентности хорошо охарактеризованы в литературе, и нацеливание на эти факторы может потенциально снизить показатели устойчивости к противогрибковым препаратам, оказывая более слабое селективное давление за счет ухудшения вирулентности, а не нацеливания на рост клеток6. В этом контексте многочисленные исследования оценили возможность воздействия на внеклеточные ферменты (например, протеазы, пептидазы) для снижения или ингибирования вирулентности Cryptococcus spp.7,8,9.

Такие организмы, как беспозвоночные и растения, не обладают адаптивной иммунной системой, чтобы защитить себя от патогенов. Тем не менее, они полагаются на сильную врожденную иммунную систему с огромным количеством химических соединений для борьбы с микроорганизмами и хищниками10. Эти молекулы включают ингибиторы пептидаз, которые играют важную роль во многих биологических системах, включая клеточные процессы иммунитета беспозвоночных, такие как коагуляция гемолимфы, синтез цитокинов и антимикробных пептидов, а также защита хозяев путем прямой инактивации протеаз патогенов11. Таким образом, ингибиторы пептидазы беспозвоночных, таких как моллюски, обладают потенциальными биомедицинскими применениями, но многие из них остаются неохарактеризованными10,12,13. В этом контексте насчитывается около 34 видов наземных моллюсков в Онтарио и 180 пресноводных моллюсков в Канаде14. Однако их углубленное профилирование и характеристика по-прежнему ограничены15. Эти организмы предоставляют возможность для идентификации новых соединений с потенциальной противогрибковой активностью10.

В этом протоколе описаны методы выделения и осветления экстрактов беспозвоночных (например, моллюсков) (рис. 1) с последующим измерением предполагаемой ингибирующей активности пептидазы. Затем противогрибковые свойства этих экстрактов оценивают путем измерения их влияния на продукцию фактора вирулентности C. neoformans с использованием фенотипических анализов (рис. 2). Важно отметить, что различия в противогрибковых свойствах между сырыми и осветленными экстрактами могут указывать на микробные факторы (например, вторичные метаболиты или токсины, продуцируемые микробиомом хозяина) моллюска, которые могут влиять на экспериментальные наблюдения. Такие результаты подтверждают необходимость того, чтобы этот протокол независимо оценивал как сырые, так и осветленные экстракты, чтобы разгадать способы действия. Кроме того, процесс экстракции является объективным и может позволить обнаружить антимикробные свойства против множества грибковых и бактериальных патогенов. Таким образом, этот протокол обеспечивает отправную точку для определения приоритета видов моллюсков с противогрибковыми свойствами против C. neoformans и возможность оценить связи между ферментативной активностью и продукцией фактора вирулентности с помощью предполагаемых ингибирующих механизмов.

протокол

1. Извлечение белка из моллюсков

  1. Собирайте моллюсков в специально отведенной и утвержденной природной зоне (например, Спид-Ривер, Гвельф, Онтарио). Для этого исследования были выбраны как местные, так и инвазивные виды для оценки широкого спектра потенциальных противогрибковых эффектов.
  2. Аккуратно разбейте панцирь моллюсков (например, Cepaea nemoralis, Planorbella pilsbryi и Cipangopaludina chinensis) с помощью пестика и ступки и удалите твердые кусочки пинцетом. Как правило, 10 моллюсков объединяются для использования по всему протоколу.
  3. Соберите и взвесьте органы. Оптимальным является примерно 15-20 г образца. С помощью ножниц разрежьте органы на мелкие кусочки размером примерно 0,5-1 см.
  4. Мгновенно замораживайте рассеченные и разрезанные образцы органов жидким азотом. Затем измельчите образцы органов в мелкий порошок с помощью пестика и ступки.
  5. Добавьте порошок образца органа (приблизительно 15 г) в 30 мл холодной дистиллированной воды (4 ° C) для достижения соотношения 1: 2 (мас. / об.).
  6. Налейте 2 мл образца в ударопрочные пробирки объемом 2 мл. Добавьте мерную ложку 3 мм шариков из нержавеющей стали (примерно 500 мкг) в каждую пробирку и гомогенизируйте с помощью блендера (см. Таблицу материалов) в течение 3 мин при 1 200 об/мин и 4 °C.
  7. Центрифуга при 12 000 × г в течение 20 мин при 4 °C. Соберите все надосадочные жидкости пипеткой в свежую пробирку объемом 50 мл, выбросив гранулы.
  8. Фильтруйте надосадочную жидкость с помощью мембраны 0,22 мкм. Храните пробы на льду и, если применимо, приступайте к протоколу уточнения (раздел 2).
    ПРИМЕЧАНИЕ: Образцы могут быть заморожены в жидком азоте и храниться при температуре -20 °C для использования в качестве сырых экстрактов.

2. Осветление экстракта моллюска

  1. Поместите образец надосадочной жидкости из шага 1.8 в термальную ванну при температуре 60 °C на 30 минут. Затем быстро охладите образцы, переложив их в ведро со льдом на 20 минут.
  2. Центрифугируют образцы при 15 000 × г в течение 45 мин при 4 °C. Соберите надосадочную жидкость в свежую пробирку объемом 50 мл и выбросьте гранулы. Фильтруйте-стерилизуйте образцы с помощью мембранного фильтра 0,22 мкм, а затем храните их на льду.
  3. Определяют концентрацию белка в образцах из стадий 1.8 (т.е. сырой экстракт) и стадии 2.2 (т.е. осветленного экстракта) с использованием количественного анализа (например, анализа17 бицинхониновой кислоты). Оптимальный диапазон концентрации белка составляет 4-8 мг/мл.
  4. Храните образцы на льду до 1 часа или замораживайте их в жидком азоте и храните при температуре -20 °C до тех пор, пока они не понадобятся.

3. Анализ ингибирующей активности

  1. Измеряют ингибирующую активность сырых и осветленных экстрактов с помощью ферментативных анализов в техническом трипликате.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Каждый ферментативный анализ состоит из фермента (например, субтилизина А, который участвует в вирулентности грибов 16,17,18; обычно около 1 x 10-9 моль/л для хромогенных анализов), буфера и субстрата. Реакция начинается, когда субстрат сталкивается с ферментом. Ферментативная активность пропорциональна скорости превращения субстрата в продукт.
  2. Оценивают влияние концентрации фермента (ЭК) на ферментативную активность (ЭА) до тех пор, пока не будет получена линейная зависимость между обоими параметрами. Для следующих шагов используйте концентрацию фермента в пределах измеренного линейного диапазона.
    ПРИМЕЧАНИЕ: Ферментативный анализ пептидазы субтилизина А подробно описан в следующих шагах.
  3. Инкубируют сырые (стадия 1.11) или осветленные (стадия 2.5) экстракты белков моллюсков (например, 10 мкл, содержащий 4 мг/мл белка) с 10 мкл субтилизина А (концентрация определяется на этапе 3.2) и 220 мкл 100 мМ Tris-HCl при рН 8,6 (для контроля добавьте 230 мкл трис-буфера без добавления экстракта) в течение 10 мин при 25 °C в 96-луночной пластине с плоским дном.
  4. Добавьте 10 мкл N-сукцинил-ала-ала-Pro-Phe-p-нитроанилида, субстрата для субтилизина А, в конечной концентрации1 Км (постоянная Михаэлиса-Ментена; 0,2 мМ для этого субстрата с субтилизином А) для конечного объема реакции 250 мкл.
  5. Измеряйте ферментативную активность, отслеживая внешний вид продукта с течением времени, считывая оптическую плотность (OD) при 405 нм каждые 15 с в течение 3 минут.
  6. Определите остаточную ферментативную активность, вычислив отношение ферментативной активности в присутствии экстракта моллюска к таковой при отсутствии экстракта.
  7. Если наблюдается ингибирующая активность (т.е. остаточная активность ниже 1), измерьте значение ингибирующей концентрации 50 (IC50), используя диапазон концентраций экстрактов (например, двукратный ряд разведения от 200 мкг/мл до 1 мкг/мл) в соответствии со стандартными методами19.

4. Влияние экстрактов моллюсков на рост C. neoformans

  1. С помощью наконечника пипетки объемом 10 мкл ввести одну колонию C. neoformans var. grubii H99 дикого типа (WT) в 5 мл среды дрожжевого экстракта-пептид-декстрозы (YPD) (10 г/л дрожжевого экстракта, 20 г/л пептона и 20 г/л декстрозы, pH 6,5) и инкубировать в течение 16-18 ч при 30 °C и 200 об/мин. Проведите эксперимент в биологическом трипликации и техническом дубликате.
  2. Соберите 500 мкл культуры в кювету и измерьте рост, считывая OD на длине волны 600 нм. Разбавьте культуру дрожжевой азотно-щелочной средой (YNB) до конечного OD600 0,02.
  3. Совместное культивирование клеток C. neoformans с различными концентрациями (например, трехкратная серия разведения от 440 мкг/мл до 15 мкг/мл белка) экстрактов (т.е. сырых и осветленных). Для этого смешайте 10 мкл экстрактов со 190 мкл разбавленной культуры C. neoformans (этап 4.2) в 96-луночном планшете.
  4. Измерьте рост, считывая OD 600 с помощью планшетного считывателя каждые 15 минут до 1 ч в течение 72 ч при200 об/мин и 37 °C.

5. Влияние экстрактов моллюсков на выработку меланина C. neoformans

  1. Подготовьте пластины с L-3,4-дигидроксифенилаланином (L-ДОФА).
    1. Автоклав 230 мл 14 г/л агара и дайте ему остыть, пока он не достигнет 50-60 °C.
    2. Добавьте в жидкий агар 3,25 мл 1 М глицина, 7,35 мл 1 М KH 2 PO 4, 2,5 мл 1 М MgSO4,7H 2 O, 0,6 мл 40% глюкозы, 70 мкл 10 мМ тиамина и 2,5мл 100 мМ L-ДОФА (стерилизованного фильтром).
    3. Налейте 15 мл смеси в чашки Петри, дайте им высохнуть в течение примерно 1 часа в темноте и храните при температуре 2-4 ° C до 1 недели. Убедитесь, что крышки частично приподняты, чтобы агар правильно высох.
  2. Инокулируют 5 мл среды YNB 50 мкл культуры C. neoformans из шага 4.1. Инкубировать 16-18 ч при 30 °C и 200 об/мин.
  3. Отжимают клетки при 1000 × г в течение 5 мин при 4 ° C. Промойте клетки 2 раза стерильным фосфатно-буферным физиологическим раствором (PBS) при pH 7,4.
  4. Подсчитайте клетки с помощью гемоцитометра. Ресуспендируют клетки в 1 мл PBS до достижения конечной концентрации 106 клеток / мл.
  5. Приготовьте серию разбавления (например, двукратное) сырых и осветленных экстрактов моллюсков. Аналогичным образом готовят 10-кратную серию разведения клеток C. neoformans (этап 5.4) от 1 x 106 клеток/мл до 1 x 101 клеток/мл с использованием стерильного PBS в 96-луночных планшетах.
  6. Нанесите 200 мкл экстракта на пластины Петри, содержащие L-ДОФА-агар, с помощью тампона и дайте им высохнуть в течение 15 минут.
  7. Поместите по 5 мкл культуры из каждой лунки на пластину L-ДОФА, оставляя 1 см между каплями. Дайте высохнуть в темноте в течение 15 минут.
  8. Инкубируйте планшеты при 30 °C и 37 °C в статическом инкубаторе в течение 3-5 дней, делая снимки каждые 24 часа с помощью камеры или планшетного тепловизора (например, сканера).
    ПРИМЕЧАНИЕ: Здесь используются два температурных условия для изучения влияния температуры на ингибирующие рост эффекты экстрактов моллюсков: 30 ° C представляет окружающую среду и 37 ° C представляет физиологическую температуру человека.

6. Влияние экстрактов моллюсков на продукцию полисахаридной капсулы C. neoformans

  1. Подготовьте среду с низким содержанием железа (LIM), как описано ниже.
    1. Растворите 5 г хелатирующей смолы (см. Таблицу материалов) в 60 мл сверхчистой воды и упакуйте в стеклянную колонку (диаметр 2 см х длина 25 см). Промойте колонку 100 мл воды и слейте собранную воду.
    2. Приготовьте воду с низким содержанием железа (LI-воду), пропустив 2 л стерильной сверхчистой воды через хелатирующую колонну. Храните литий-ионную воду при температуре 4 °C до 3 месяцев.
    3. Растворите 5 г глюкозы в 100 мл LI-воды. Растворите 5 г L-аспарагина в 200 мл LI-воды в отдельном стакане.
    4. Добавьте в 500 мл литий-ионной воды по порядку: 4,78 г HEPES, 0,4 г K 2 HPO 4, 0,08 г MgSO 4,7H 2 O, 1,85 г NaHCO 3 и 0,25 г CaCl 2,2H 2O.
    5. Объедините решения из шагов 6.1.3 и 6.1.4. Добавьте 1 мл 100 мМ натриевой соли батофенантролиндисульфоновой кислоты (BPS) до конечной концентрации 100 мкМ.
    6. Отрегулируйте рН до 7,2 с помощью 1 м литий-швабры. Добавьте литий-ионную воду до конечного объема 1 л и отфильтруйте и стерилизуйте среду, пропустив ее через мембрану 0,22 мкм. Добавьте в среду 100 мкл стерильного тиамина (4 мг/мл).
  2. Инокулируют 5 мл среды YNB 50 мкл культуры C. neoformans из шага 4.1. Инкубировать 16-18 ч при 30 °C и 200 об/мин. Используйте эту культуру для инокуляции 5 мл LIM до конечной концентрации 105 клеток / мл.
  3. Добавьте соответствующие объемы экстрактов моллюсков (например, двукратное разведение или объем, определенный из предыдущих анализов вирулентности) для достижения желаемых концентраций. Инкубировать в течение 72 ч при 37 °C и 200 об/мин с разрыхленными колпачками. После инкубации соберите 1 мл клеток и промыть 2 раза стерильным PBS, pH 7,4, при 1,500 × г в течение 2 мин при 4 °C.
  4. Осторожно ресуспендируйте клетки в 1 мл PBS. Смешайте клетки с India Ink в соотношении 1:1 (например, 4 мкл India Ink с 4 мкл клеточной суспензии) на предметном стекле микроскопа. Поместите покровное стекло поверх предметного стекла.
  5. Визуализируйте образцы с помощью дифференциально-интерференционно-контрастного микроскопа (DIC) с 63-кратным масляным объективом (см. Таблицу материалов). Установите автоматическую контрастность и сфокусируйтесь вручную с помощью диска микроскопа. Выберите все изображения и экспортируйте их в формате TIFF. Никаких фильтров применять не нужно.
  6. С помощью инструмента «Линейка» в ImageJ20 определите отношение общего размера клетки (включая капсулу) к размеру тела клетки.

7. Влияние экстрактов моллюсков на продукцию биопленки C. neoformans

  1. Инокулируют 5 мл среды YNB 50 мкл культуры C. neoformans из шага 4.1. Инкубировать 16-18 ч при 30 °C и 200 об/мин.
  2. Собирают клетки из культуры объемом 5 мл. Промыть клетки стерильным PBS, pH 7,4, при 1,500 × г в течение 2 мин при 4 ° C.
  3. Подсчитайте клетки с помощью гемоцитометра. Ресуспендировать клетки в 3 мл модифицированной среды Dulbecco Eagle Medium (DMEM) до конечной концентрации 107 клеток / мл.
  4. Перенесите 300 мкл клеточной суспензии в отдельные лунки стерильной полистирольной плоскодонной 24-луночной пластины. Используйте скважины со средой только в качестве контроля.
  5. Добавьте соответствующие объемы экстрактов моллюсков (например, двукратное разведение или объем, определенный из предыдущих анализов вирулентности), чтобы достичь конечной концентрации белка 10-20 мкг/мл. Убедитесь, что объем экстракта не превышает 10% от общего объема.
  6. Оберните пластины алюминиевой фольгой (чтобы избежать испарения среды) и инкубируйте в течение 48 часов в статическом инкубаторе при 30 ° C и 37 ° C.
  7. Используя бутылку или дозатор, промойте лунки 2 раза стерильной водой и дайте им высохнуть на воздухе в течение 10-15 минут при комнатной температуре. Затем добавляют 100 мкл 0,3% раствора кристаллического фиолетового цвета в каждую лунку (включая контрольные лунки только для среды) и выдерживают при комнатной температуре в течение 10 минут.
  8. Тщательно промойте лунки 3 раза стерильной водой (биопленки не будут разрушены во время промывки). Добавьте 200 мкл 100% этанола и инкубируйте в течение 10 мин при RT.
  9. Перенесите 75 мкл на новую пластину с плоским дном с 96 лунками и считайте OD550. Количественно определите образование биопленки как (OD 550 нм образца - OD550 нм заготовки).

Результаты

Рабочий процесс, описанный в настоящем описании, позволяет выделять белки и пептиды из моллюсков с потенциальными антивирулентными свойствами в отношении C. neoformans. Аналогичным образом, оценка различных форм экстрактов (т.е. сырых и осветленных) позволяет проводить полуочистку пот?...

Обсуждение

Описанный здесь протокол экстракции описывает выделение соединений из моллюсков, собранных в Онтарио, Канада, и демонстрирует новое исследование использования экстрактов моллюсков против грибкового патогена человека C. neoformans. Этот протокол дополняет растущий объем исследований...

Раскрытие информации

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Благодарности

Авторы благодарят членов лаборатории Геддеса-Макалистера за их ценную поддержку на протяжении всего исследования и отзывы о рукописях. Авторы выражают признательность за финансовую поддержку со стороны Ontario Graduate Scholarship and International Graduate Research Award - University of Guelph to D.G.-G, а также от Канадского фонда инноваций (JELF 38798) и Министерства колледжей и университетов Онтарио - Early Research Award для J.G.-M.

Материалы

NameCompanyCatalog NumberComments
0.2 μm FiltersVWR28145-477 (North America)
1.5 mL Tubes (Safe-Lock)Eppendorf0030120086
2 mL Tubes (Safe-Lock)Eppendorf0030120094
3,4-Dihydroxy-L-phenylalanine (L-DOPA)Sigma-AldrichD9628-5GCAS #: 59-92-7
96-well platesCostar (Corning)3370
Bullet Blender Storm 24NEXT ADVANCEBBY24M
Centrifuge 5430REppendorf5428000010
Chelex 100 ResinBioRad142-1253
CO2 Incubator (Static)SANYONot available
Cryptococcus neoformans H99ATCC208821
DIC MicroscopeOlympus
DIC Microscope softwareZeiss
DMEMCorning10-013-CV
Glucose (D-Glucose, Anhydrous, Reagent Grade)BioShopGLU501CAS #: 50-99-7
GlycineFisher ChemicalG46-1CAS #: 56-40-6
GraphPad Prism 9Dotmatics
HemocytometerVWR15170-208
HEPESSigma AldrichH3375
Magnesium sulfate heptahydrate (MgSO4.7 H2O)HoneywellM1880-500GCAS #: 10034-99-8 
PeptoneBioShopPEP403
Phosohate buffer salt pH 7.4BioShopPBS408SKU: PBS408.500
Plate reader (Synergy-H1)BioTek (Agilent)Not available
Potassium phosphate monobasic (KH2PO4)Fisher ChemicalP285-500CAS #: 7778-77-0
Subtilisin ASigma-AldrichP4860CAS #: 9014-01-01
Succinyl-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilideSigma-Aldrich573462CAS #: 70967-97-4
Thermal bathVWR76308-834
Thiamine HydrochlorideFisher-BioreagentsBP892-100CAS #: 67-03-8
Yeast extractBioShopYEX401CAS #: 8013-01-2
Yeast nitrogen base (with Amino Acids)Sigma-AldrichY1250-250GYNB 

Ссылки

  1. Derek, J., Sloan, V. P. Cryptococcal meningitis: Epidemiology and therapeutic options. Clinical Epidemiology. 6, 169-182 (2014).
  2. Rajasingham, R., et al. The global burden of HIV-associated cryptococcal infection in adults in 2020: a modelling analysis. The Lancet Infectious Diseases. , (2022).
  3. Mourad, A., Perfect, J. R. Present and future therapy of Cryptococcus infections. Journal of Fungi. 4 (3), 79 (2018).
  4. Bermas, A., Geddes-McAlister, J. Combatting the evolution of antifungal resistance in Cryptococcus neoformans. Molecular Microbiology. 114 (5), 721-734 (2020).
  5. Geddes-McAlister, J., Shapiro, R. S. New pathogens, new tricks: Emerging, drug-resistant fungal pathogens and future prospects for antifungal therapeutics. Annals of the New York Academy of Sciences. 1435 (1), 57-78 (2019).
  6. Kronstad, J. W., Hu, G., Choi, J. The cAMP/protein kinase A pathway and virulence in Cryptococcus neoformans. Mycobiology. 39 (3), 143-150 (2018).
  7. Olszewski, M. A., et al. Urease expression by Cryptococcus neoformans promotes microvascular sequestration, thereby enhancing central nervous system invasion. The American Journal of Pathology. 164 (5), 1761-1771 (2004).
  8. Shi, M., et al. Real-time imaging of trapping and urease-dependent transmigration of Cryptococcus neoformans in mouse brain. The Journal of Clinical Investigation. 120 (5), 1683-1693 (2010).
  9. Vu, K., et al. Invasion of the central nervous system by Cryptococcus neoformans requires a secreted fungal metalloprotease. mBio. 5 (3), 01101-01114 (2014).
  10. Gutierrez-Gongora, D., Geddes-McAlister, J. From naturally-sourced protease inhibitors to new treatments for fungal infections. Journal of Fungi. 7 (12), 1016 (2021).
  11. Nakao, Y., Fusetani, N. Enzyme inhibitors from marine invertebrates. Journal of Natural Products. 70 (4), 689-710 (2007).
  12. Reytor, M. L., et al. Screening of protease inhibitory activity in extracts of five Ascidian species from Cuban coasts. Biotecnologia Aplicada. 28 (2), 77-82 (2011).
  13. González, L., et al. Screening of protease inhibitory activity in aqueous extracts of marine invertebrates from Cuban coast. American Journal of Analytical Chemistry. 7 (4), 319-331 (2016).
  14. Brown, D. S., Werger, M. J. A. Freshwater molluscs. Biogeography and Ecology of Southern Africa. , 1153-1180 (1978).
  15. Forsyth, R. G., Oldham, M. J. Terrestrial molluscs from the Ontario Far North. Check List. 12 (3), 1-51 (2016).
  16. Eigenheer, R. A., Lee, Y. J., Blumwald, E., Phinney, B. S., Gelli, A. Extracellular glycosylphosphatidylinositol-anchored mannoproteins and proteases of Cryptococcus neoformans. FEMS Yeast Research. 7 (4), 499-510 (2007).
  17. Homer, C. M., et al. Intracellular action of a secreted peptide required for fungal virulence. Cell Host & Microbe. 19 (6), 849-864 (2016).
  18. Clarke, S. C., et al. Integrated activity and genetic profiling of secreted peptidases in Cryptococcus neoformans reveals an aspartyl peptidase required for low pH survival and virulence. PLoS Pathogens. 12 (12), 1006051 (2016).
  19. Copeland, R. A. . Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists. , (2013).
  20. Collins, T. J. ImageJ for microscopy. Biotechniques. 43, 25-30 (2007).
  21. Rawlings, N. D., et al. The MEROPS database of proteolytic enzymes, their substrates and inhibitors in 2017 and a comparison with peptidases in the PANTHER database. Nucleic Acids Research. 46, 624-632 (2018).
  22. Gutierrez-Gongora, D., Geddes-McAlister, J. Peptidases: Promising antifungal targets of the human fungal pathogen, Cryptococcus neoformans. Facets. 7 (1), 319-342 (2022).
  23. Martinez, L. R., Casadevall, A. Susceptibility of Cryptococcus neoformans biofilms to antifungal agents in vitro. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 50 (3), 1021-1033 (2006).
  24. Culp, E., Wright, G. D. Bacterial proteases, untapped antimicrobial drug targets. Journal of Antibiotics. 70 (4), 366-377 (2017).
  25. Ruocco, N., Costantini, S., Palumbo, F., Costantini, M. Marine sponges and bacteria as challenging sources of enzyme inhibitors for pharmacological applications. Mar Drugs. 15 (6), 173 (2017).
  26. Costa, H. P. S., et al. JcTI-I: A novel trypsin inhibitor from Jatropha curcas seed cake with potential for bacterial infection treatment. Frontiers in Microbiology. 5, 5 (2014).

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи

Запросить разрешение

Смотреть дополнительные статьи

190

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Исследования

Образование

О JoVE

Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены