Высокопроизводительный скрининг для получения кристаллических попаданий для кристаллографии белка

Получение кристалла для проведения дифракционных экспериментов остается проблемой, потому что трудно предсказать, какие параметры будут влиять на кристаллизацию. Мы отдаем предпочтение экспериментатору, просеивая 1536 условий кристаллизации в одной пластине, и используем передовые технологии визуализации для выявления даже самых маленьких попаданий кристаллов. Методы структурной биологии быстро развиваются, и эта область была революционизирована предсказанием вычислительной структуры.

Это привело к тому, что область стала более интегративной, и несколько экспериментальных или вычислительных подходов чаще всего объединялись для создания более подробного и точного представления биологических механизмов. Генерация кристаллических попаданий является ключевым шагом для проведения экспериментов по дифракции монокристаллов в рентгеновских лучах и разработки таких методов, как микроэректильная дисфункция и серийная кристаллография. Используя передовые методы визуализации, UVTBF и SHG вместе с мощью алгоритма Марко помогают нам идентифицировать полезные кристаллы во всех масштабах размера.

Наши высокопроизводительные методы кристаллизации позволили получить большой объем данных для исследования вопросов эффективности компонентов кристаллизационного коктейля. Специализированная визуализация, которую мы делаем, показывает, как нелинейно-оптические методы могут быть использованы для обнаружения исчезающе малых кристаллов. Поиск условий кристаллизации имеет решающее значение для структурных методов на основе кристаллов, на которые приходится 90% всех структурных моделей в банке данных белка.

В 2021 году из PDB загружалось около 2 миллионов файлов в день, что подчеркивает влияние структур на прокладывание пути для дальнейших научных исследований.