Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir. Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
Method Article
Bu protokol, insan kan örneklerinden monosit türevi makrofajlar (MDM) elde etmek için iş akışını, enflamatuar kaspaz Bimoleküler Floresan Kompleman (BiFC) muhabirlerini hücre canlılığı ve davranışından ödün vermeden insan MDM'sine verimli bir şekilde tanıtmak için basit bir yöntemi ve canlı hücrelerde enflamatuar kaspaz aktivasyonunu ölçmek için görüntüleme tabanlı bir yaklaşımı açıklamaktadır.
İnflamatuar kaspazlar kaspaz-1, -4, -5, -11 ve -12'yi içerir ve başlatıcı kaspazların alt grubuna aittir. Kaspaz-1, enflamatuar sinyalizasyonun doğru düzenlenmesini sağlamak için gereklidir ve enflamatuarlara işe alımı takiben yakınlık kaynaklı dimerizasyon ile aktive edilir. Kaspaz-1, monositik hücre soyunda bol miktarda bulunur ve pro-inflamatuar sitokinlerin interlökin (IL)-1β ve IL-18'in aktif salgılanan moleküllere olgunlaşmasını indükler. Diğer inflamatuar kaspazlar, kaspaz-4 ve -5 (ve bunların murin homolog kaspaz-11), pirotozu indükleyerek IL-1β salınımını teşvik eder. Kaspaz Bimoleküler Floresan Komplesyonu (BiFC), kaspaz aktivasyonunun bir okuması olarak inflamatuar kaspaz kaynaklı yakınlığı ölçmek için kullanılan bir araçtır. Enflamatuara bağlanan bölgeyi içeren kaspaz-1, -4 veya -5 prodomain, kaspazlar indüklenen yakınlığa maruz kaldığında floresan Venüs kompleksini reforme etmekle ilişkili sarı floresan protein Venüs'ün (Venüs-N [VN] veya Venüs-C [VC]) floresan olmayan parçalarına kaynaştırılır. Bu protokol, bu muhabirlerin nükleofeksiyon kullanarak birincil insan monosit kaynaklı makrofajlara (MDM) nasıl tanıtılacağını, inflamatuar kaspaz aktivasyonunu indüklemek için hücrelerin nasıl tedavi edileceğini ve floresan ve konfokal mikroskopi kullanarak kaspaz aktivasyonunun nasıl ölçüleceğini açıklamaktadır. Bu yaklaşımın avantajı, canlı hücrelerdeki inflamatuar kaspaz aktivasyon kompleksinin bileşenlerini, gereksinimlerini ve lokalizasyonunu tanımlamak için kullanılabilmesidir. Bununla birlikte, hücre canlılığından ve davranışından ödün vermemek için dikkatli kontrollerin göz önünde bulundurulması gerekir. Bu teknik, enflamatuar düzeyde dinamik kaspaz etkileşimlerinin analizi ve canlı MDM ve insan kan örneklerinden türetilen monositlerdeki inflamatuar sinyal kaskadlarının sorgulanması için güçlü bir araçtır.
Kaspazlar, başlatıcı kaspazlar ve cellat kaspazlar olarak gruplandırılabilen bir sistein aspartat proteazlar ailesidir. Cellater kaspazlar kaspaz-3, -6 ve -7'den oluşur. Doğal olarak hücrelerde dimerler olarak bulunurlar ve apoptoz1'i yürütmek için başlatıcı kaspazlar tarafından bölünürler. Başlatıcı kaspazlar insan kaspazı-1, -2, -4, -5, -8, -9, -10 ve -12'yi içerir. Yakınlığa bağlı dimerizasyon ile aktive olan ve otoproteolitik bölünme 2,3 ile stabilize edilen inaktif zimojenler (pro-kaspazlar) olarak bulunurlar. İnflamatuar kaspazlar, başlatıcı kaspaz2'nin bir alt kümesidir ve insanlarda kaspaz-1, -4, -5 ve -12'yi ve fare 4,5'te kaspaz-1, -11 ve -12'yi kapsar. Apoptotik bir rolden ziyade, inflamasyonda merkezi bir rol oynarlar. Patojenik istilacılara yanıt olarak salınan ilk sitokinler olan pro-interlökin (IL)-1β ve pro-IL-18 6,7'nin proteolitik işlenmesine ve salgılanmasına aracılık ederler 8,9. Caspase-1, aktivasyon platformuna işe alındıktan sonra etkinleştirilir; inflamatuar olarak adlandırılan büyük bir moleküler ağırlıklı protein kompleksi (Şekil 1A)10. Kaspaz-4, -5 ve -11'in dimerizasyonu, kanonik olmayan bir enflamatuar yol11,12 aracılığıyla bu platformlardan bağımsız olarak gerçekleşir.
Kanonik enflamatuarlar, bir enflamatuar sensör proteini, adaptör protein ASC (CARD içeren apoptozla ilişkili leke benzeri protein) ve efektör protein kaspaz-110'dan oluşan sitozolik multimerik protein kompleksleridir. En iyi çalışılmış kanonik enflamatuarlar, bir pirin alanı (NLRP), NLRP1 ve NLRP3 içeren NOD benzeri reseptör ailesi, bir CARD (NLRC), NLRC4 içeren NLR ailesi ve melanom 2'de (AIM2) bulunmayanlardır. Her biri bir pirin etki alanı, bir CARD veya her iki etki alanı içerir. CARD etki alanı, CARD içeren kaspazlar ve bunların yukarı akış aktivatörleri arasındaki etkileşime aracılık eder. Bu nedenle, bir N-terminal pirin alanı (PYD) ve bir C-terminal CARD motifi 13,14'ten oluşan iskele molekülü ASC, NLRP1 10, NLRP315 ve AIM216 enflamatuarlarına kaspaz-1'in alınması için gereklidir.
Her enflamatuar, farklı pro-inflamatuar uyaranları tanıyan benzersiz sensör proteininden sonra adlandırılır (Şekil 1B). Bu yolun aktivatörlerine kanonik uyaranlar denir. Enflamatuarlar, mikrobiyal bileşenler ve doku stresi için sensörler görevi görür ve enflamatuar kaspazların aktivasyonu yoluyla sağlam bir enflamatuar yanıtı tetiklemek için bir araya gelir17. Enflamatuar düzenek, ana substratları pro-IL-1β ve pro-IL-18'in olgunlaşmasına ve salgılanmasına aracılık etmek için kaspaz-1 aktivasyonunu başlatır. Bu işlem iki adımlı bir mekanizma ile gerçekleşir. İlk olarak, bir astarlama uyaranı, NF-κB yolunun aktivasyonu yoluyla bazı enflamatuar proteinlerin ve pro-IL-1β'nin ekspresyonunu düzenler. İkincisi, hücre içi (kanonik) bir uyaran, enflamatuar montaja ve prokaspaz-1 6,7'nin işe alınmasına neden olur.
Kaspaz-4 ve kaspaz-5, murin kaspaz-11 11'in insan ortologlarıdır. Gram-negatif bakterilerin dış zarında bulunan bir molekül olan hücre içi lipopolisakkarit (LPS) 18,19,20 ve kırmızı kan hücresi hemolizi 21'in bir ürünü olan hücre dışı heme ile enflamatuardan bağımsız bir şekilde aktive edilirler. LPS'nin doğrudan bu proteinlerin CARD motifine bağlandığı ve oligomerizasyonlarını indüklediği öne sürülmüştür20. Kaspaz-4 veya kaspaz-5'in aktivasyonu, gözenek oluşturan protein gasdermin D'nin (GSDMD) bölünmesi yoluyla piroptoz adı verilen enflamatuar bir hücre ölümü formunu indükleyerek IL-1β salınımını teşvik eder18,19. Ek olarak, kaspaz-4 ve GSDMD aracılı piroptotik ölümden kaynaklanan potasyum iyonlarının efflüksü, NLRP3 enflamatuarının aktivasyonunu ve ardından kaspaz-122,23'ün aktivasyonunu indükler. Bu nedenle, kaspaz-4, -5 ve -11, spesifik uyaranlar 11,24'e yanıt olarak piroptoz ve kaspaz-1 aktivasyonunu indükleyebilen LPS için hücre içi sensörler olarak kabul edilir.
Şekil 1: İnflamatuar kaspazlar ve kaspaz-bimoleküler floresan kompleman (BiFC) testi. (A) Venüs'ün floresan olmayan her bir parçasına (Venüs-C veya Venüs-N) bağlı iki kaspaz-1 prodomaininin (C1-pro) NLRP3 aktivasyon platformuna alındığı ve Venüs'ü refere ve floresan yapmaya zorlayan kaspaz-BiFC sistemini gösteren diyagram. Bu kompleks mikroskop altında yeşil bir nokta olarak görünür ve başlatıcı kaspaz aktivasyonunda ilk adım olan inflamatuar kaspaz kaynaklı yakınlık için bir okuma görevi görür. (B) Enflamatuar bileşenlerin ve inflamatuar kaspazların etki alanı organizasyonunu gösteren şematik. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Spesifik başlatıcı kaspaz aktivasyonunu ölçmek zordur ve görüntüleme yaklaşımlarıyla bunu yapmak için çok fazla yöntem yoktur. Kaspaz Bimoleküler Floresan Komplemanı (BiFC), doğrudan canlı hücrelerde inflamatuar kaspaz aktivasyonunu görselleştirmek için kullanılabilir (Şekil 1A)25. Bu teknik yakın zamanda insan monosit türevi makrofajlarda (MDM) kullanılmak üzere uyarlanmıştır (MDM)21. Kaspaz BiFC, dimerizasyonu kolaylaştırmak için inflamatuar kaspaz aktivasyonundaki ilk adımı, indüklenmiş yakınlığı ölçer. Fotolanabilir sarı floresan protein Venüs'ün (Venüs-C [VC]) ve Venüs-N [VN]) floresan olmayan fragmanlarına kaynaşmış CARD içeren kaspaz prodomainini kodlayan plazmidlerin ekspresyonu kullanılır. İki kaspaz prodomaini aktivasyon platformlarına alındığında veya indüklenmiş yakınlığa maruz kaldığında, Venüs'ün iki yarısı yakına getirilir ve refold ve floresan yapmaya zorlanır (bkz. Şekil 1A, B). Bu, spesifik inflamatuar kaspaz aktivasyonunun gerçek zamanlı bir okumasını sağlar.
İnsan MDM'si, tehlike sinyallerini ve patojen ürünlerini tanımlayan enflamatuar genleri ve patern tanıma reseptörlerini bolca eksprese eder. Bu, inflamatuar kaspaz yolaklarının sorgulanması için ideal bir hücre tipi sağlar. Ek olarak, periferik kandan ve hatta belirli bir hastalık durumunda inflamatuar kaspaz aktivasyonunu değerlendirmek için hasta örneklerinden türetilebilirler. Bu protokol, elektroporasyon tabanlı bir transfeksiyon yöntemi olan nükleofeksiyon kullanılarak BiFC kaspaz muhabirlerinin MDM'ye nasıl tanıtılacağını, inflamatuar kaspaz aktivasyonunu indüklemek için hücrelerin nasıl tedavi edileceğini ve mikroskopi yaklaşımlarını kullanarak aktif kaspaz komplekslerinin nasıl görselleştirileceğini açıklamaktadır. Ek olarak, bu metodoloji, bu komplekslerin moleküler bileşimini, hücre altı lokalizasyonunu, kinetik ve bu yüksek sıralı yapıların büyüklüğünü belirlemek için uyarlanabilir25,26,27.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Bu protokol, Baylor College of Medicine'in insan örneklerinin manipülasyonu için insan araştırma etik komitesinin yönergelerini takip etmektedir. Kan örnekleri, insan örnekleri için kurumsal güvenlik kurallarına uyularak ele alınır. Kan örnekleri, sitrat fosfat dekstroz (CPD) çözeltisi ile toplandıkları bölgesel bir kan bankasında elde edilir. Bununla birlikte, sodyum heparin, lityum heparin veya EDTA gibi diğer antikoagülanlarla toplanan kan da bu protokoliçin kullanılabilir 28,29.
1. İnsan monositlerinin izolasyonu ve makrofajlara farklılaşması
Şekil 2: Deneysel iş akışına şematik genel bakış. Bu şeklin daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
2. Elektroporasyon bileşenlerinin hazırlanması
NOT: Bu protokol 10 μL-Neon uç (Malzeme Tablosu) için tasarlanmıştır. Her transfeksiyon için 1-2 x 105 hücre kullanın. Transfekte hücrelerin 48 delikli bir tabakta veya 8 kuyucuklu bir tabakta (kuyu başına 10 μL-transfekte edilmiş hücreler) tohumlanması önerilir. PBS yerine 1x steril DPBS (Ca2 + ve Mg2+ olmadan) kullanılabilir.
3. Elektroporasyon için hücrelerin hazırlanması
NOT: 7 günlük farklılaşma periyodunun sonunda 10 cm'lik bir çanaktan MDM verimi yaklaşık 1,5 x 106 hücredir. PBS yerine 1x steril DPBS (Ca2 + ve Mg2+ olmadan) kullanılabilir. Bu protokol, çoğu makrofajın hücre canlılığı ve bütünlüğünün korunmasıyla plakadan ayrılması için optimize edilmiştir. MDM'nin hücre kültürü plakalarından ayrılması zordur. Bu nedenle, hücreleri ayırmak için 3.2 ve 3.3 adımlarını iki kez gerçekleştirmek gerekebilir. Tripsin-EDTA (% 0.25) ile her kuluçka süresinin 5 dakikayı geçmediğinden emin olun.
4. Kaspaz BiFC bileşenlerinin insan monosit türevi makrofajlara nükleofeksiyonu
NOT: Protokolün bu bölümü Neon Transfeksiyon Sistemi (Malzeme Tablosu) kullanılarak gerçekleştirilir. Bu protokol, 10 μL Neon uç (Malzeme Tablosu) kullanarak 1-2 x 105 hücreyi transfekte etme adımlarını özetlemektedir. 100 μL Neon uç kullanıyorsanız, ölçeği buna göre artırın. Hücreleri 15 dakikadan fazla bir süre boyunca resüspansiyon tamponu R'ye maruz bırakmaktan kaçının, çünkü bu hücre canlılığını ve transfeksiyon verimliliğini azaltabilir.
5. Transfekte MDM ve kaspaz BiFC veri toplama tedavisi
NOT: Bir epifloresan veya konfokal mikroskop kullanarak hücreleri görüntülemeyi planlıyorsanız, kaspaza bağımlı hücre ölümünü (ağırlıklı olarak apoptoz) önlemek için seçilen uyaranla 1 saat önceden tedavi için qVD-OPh (20 μM) ile tedavi önerilir. Bu, hücrelerin apoptoz nedeniyle kalkmasını önlemek için görüntülemede kullanılır ve odak düzleminden çıktıklarında görüntülenmesini çok zorlaştırır. Aktivasyon platformuna ve ilişkili kaspaz BiFC'ye kaspaz alımının kaspazın kaspazın katalitik aktivitesine bağlı olmadığını ve sonuç olarak kaspaz inhibisyonunun bu adımı etkilemeyeceğini unutmayın.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Şekil 2'de gösterilen şema, insan MDM'sinin nasıl elde edileceğine, transfekte edileceğine ve görüntüleneceğine dair genel bir bakış sunmaktadır. seçilen CD14 + monositlerinin GM-CSF ile 7 gün boyunca inkübasyonundan sonra, hücre morfolojisi farklılaşma periyodu boyunca değişir (Şekil 3A), küresel süspansiyon hücrelerinden ve tamamen bağlı (gün 3 ve 4), ve son olarak, tamamen farklılaştığında daha fazla yayılmış hücrelere (7...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Bu protokol, insan kan örneklerinden izole edilen monositlerden makrofajlar elde etmek için iş akışını ve enflamatuar kaspaz BiFC muhabirlerini hücre canlılığından ve davranışından ödün vermeden insan MDM'sine verimli bir şekilde tanıtmak için bir yöntemi açıklar.
Bu protokol, bölünmüş floresan protein Venüs'ün floresan olmayan fragmanları ile kaspaz işe alım alanındaki (CARD) inflamatuar kaspazları etiketlemek için BiFC tekniği35'ten...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Yazarlar, rekabet eden finansal çıkarları olmadığını beyan ederler.
Bu tekniğin geliştirilmesine katkıda bulunan LBH'nin geçmiş ve şimdiki laboratuvar üyelerine teşekkür ederiz. Bu laboratuvar NIH/NIDDK T32DK060445 (BEB), NIH/NIDDK F32DK121479 (BEB), NIH/NIGMS R01GM121389 (LBH) tarafından desteklenmektedir. Şekil 2, Biorender yazılımı kullanılarak çizilmiştir.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
48 well tissue culture2:34 plates | Genesee Scientific | 25-108 | |
10 cm Tissue Culture Dishes | VWR | 25382-166 | |
2 Mercaptoethanol 1000x | Thermo Fisher Scientific | 21985023 | |
8 well chambered coverglass with 1.5 HP coverglass | Cellvis | c8-1.5H-N | |
AutoMACS columns | Miltenyi (Biotec) | 130-021-101 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Pro Separator | Miltenyi (Biotec) | 130-092-545 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Pro Washing Solution | Miltenyi (Biotec) | 130-092-987 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Rinsing Solution | Miltenyi (Biotec) | 130-091-222 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMacs running buffer | Miltenyi (Biotec) | 130-091-221 | For manual or automated separation using QuadroMACS or AutoMACS pro Separator |
Axio Observer Z1 motorized inverted microscope equipped with a CSU-X1A 5000 spinning disk unit | Zeiss | Any confocal microscope equipped with a laser module fitted with laser lines of 568 nm (RFP) and 488 or 512 nm (GFP or YFP) wavelengths can be used | |
AxioObserver A1, Research Grade Inverted Microscope | Zeiss | Any epifluorescence microscope with fluorescence filters capable of exciting 568 nm (RFP) and 488 or 512 nm (GFP or YFP) wavelengths can be used | |
CD14+ MICROBEADS | Miltenyi (Biotec) | 130-050-201 | For manual or automated separation using QuadroMACS or AutoMACS pro Separator |
DPBS without calcium chloride and magnesium chloride | Sigma | D8537-6x500ML | |
DsRed mito plasmid | Clontech | 632421 | Similar plasmids that can be used as fluorescent reporters can be found on Addgene |
Fetal Bovine Serum | Thermo Fisher Scientific | 10437028 | |
Ficoll-Paque PLUS 6 x 100 mL | Sigma | GE17-1440-02 | |
GlutaMAX Supplement (100x) | Thermo Fisher Scientific | 35050079 | |
GM-CSF | Thermo Fisher Scientific | PHC2011 | |
Hemin BioXtra, from Porcine, ≥96.0% (HPLC) | Sigma | 51280-1G | |
HEPES | Thermo Fisher Scientific | 15630106 | |
Inflammatory caspase BiFC plasmids | Available by request from LBH lab | ||
LPS-EB Ultrapure | Invivogen | TLRL-3PELPS | |
LS Columns | Miltenyi (Biotec) | 130-042-401 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
MACS 15 mL Tube Rack | Miltenyi (Biotec) | 130-091-052 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
MACS MultiStand | Miltenyi (Biotec) | 130-042-303 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
mCherry plasmid | Yungpeng Wang Lab | Similar plasmids that can be used as fluorescent reporters can be found on Addgene | |
Neon Transfection System | Thermo Fisher Scientific | MPK5000 | Includes Neon electroporation device, pipette and pipette station |
Neon Transfection System 10 µL Kit | Thermo Fisher Scientific | MPK1096 | Includes resuspension buffer R, resuspension buffer T, electrolytic buffer E, 96 x 10 µL Neon tips and Neon electroporation tubes |
Nigericin sodium salt, ready made solution | Sigma | SML1779-1ML | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
Poly-D-Lysine Hydrobromide | Sigma | P7280-5mg | |
QuadroMACS Separator | Miltenyi (Biotec) | 130-090-976 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
qVD-OPh | Fisher (ApexBio) | 50-101-3172 | |
RPMI 1640 Medium | Thermo Fisher Scientific | 11875119 | |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25200072 | |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Zeiss Zen 2.6 (blue edition) software | Zeiss | Any software used to operate the confocal microscope of choice |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır