Method Article
Burada, bilgisayarlı tomografiye dayalı olarak sıfırdan bir kalp modeli oluşturmak için bir protokol açıklıyoruz ve bunu anatomiyi öğrenmek için üç boyutlu (3D) baskı ve karma gerçeklik teknolojisini kullanarak tıp öğrencilerine sunuyoruz.
Karma gerçeklik teknolojisi ve üç boyutlu (3D) baskı, tıp alanında giderek daha yaygın hale geliyor. COVID-19 salgını sırasında ve kısıtlamalar hafifletildikten hemen sonra, geleceğin doktorlarının eğitiminde birçok yenilik uygulandı. Anatomi öğretiminde sürükleyici tekniklere ve 3D baskı teknolojisine de ilgi vardı. Ancak, bunlar yaygın uygulamalar değildir. 2023 yılında kalbin yapısına odaklanan dersler için karma gerçeklik teknolojisinde 3D baskılar ve hologramlar hazırlandı. Mühendislerin desteğiyle, kalbin ayrıntılı yapısı hakkında bilgi edinebilen ve insan kadavralarında geleneksel öğrenme modelini destekleyen yeni teknolojilere aşina olabilen öğrencilere öğretmek için kullanıldılar. Öğrenciler bu olasılığı çok değerli buluyorlar. Makale, sınıflar için materyal hazırlama sürecini ve daha fazla uygulama olanaklarını sunmaktadır. Yazarlar, sunulan teknolojilerin öğrencilerin çeşitli eğitim seviyelerinde öğretilmesinde geliştirilmesi ve giderek yaygınlaşan uygulamanın gerekçesi için bir fırsat görmektedir.
Üç boyutlu (3D) baskı teknolojisi ve karma gerçeklik, tıpta giderek daha yaygın olarak kullanılan teknolojik başarılardır. Sadece çeşitli alanlardan birçok uzmanın günlük klinik pratiğinde değil, aynı zamanda asistanların ve geleceğin doktorlarının, yani tıp öğrencilerinineğitiminde de daha fazla uygulama bulunmaktadır 1,2,3,4,5,6.
3D baskı teknolojisi genellikle ticari kuruluşlar tarafından sunulan anatomik modelleri basmak için kullanılır, ancak öğrencilerin bu tür öğrenme hazırlıklarına artan ilgisi, tıp üniversitelerinin anatomi bölümlerinde yeniliklerin tanıtılması için bir itici güçtür7. Hazırlıklar, anatomik atlaslardan, çizimlerden ve gravürlerden elde edilen verilere dayalı olarak oluşturulabilir, aynı zamanda bilgisayarlı tomografi veya manyetik rezonans görüntüleme gibi görüntüleme çalışmalarına da dayalı olarak oluşturulabilir 1,8,9. Anatomik preparatları bir 3D yazıcıda çeşitli ölçeklerde basmak mümkündür ve öğretim materyalinin erişilebilirliğini artırmak için renkler, işaretleyiciler ve diğer varyasyonları kullanmak mümkündür10,11. Materyallerin artan mevcudiyetine rağmen, Polonya'daki tıp öğrencileri, henüz tam olarak uygulanmamış yeni teknolojilerin eklenmesiyle insan kadavra hazırlıklarına dayanan mevcut, klasik öğretim modelini destekleme konusunda beyan edilen istekliliklerinden bağımsız olarak, bu tür hazırlıklara geniş erişime sahip değildir.
Karma gerçeklik teknolojisi, sanal dünyanın gerçek dünya ile bütünleşmesidir. Daha önceden hazırlanmış hologramların görselleştirilmesini sağlayan gözlükler sayesinde, gerçek dünyadaki çevredeki nesnelerin üzerine "üst bindirilebilir"12. Hologramlar uzayda manipüle edilebilir, örneğin büyütülebilir, küçültülebilir veya döndürülebilir, bu da görüntülenen görüntüyü daha iyi görselleştirilir, erişilebilir ve daha kullanışlı hale getirir. Karma gerçeklik, kalp cerrahisi 3,13 ortopedi14,15,16,17, onkoloji18 gibi cerrahi disiplinlerdeki operatörler tarafından giderek daha fazla kullanılmaktadır. Giderek artan bir şekilde, özellikle COVID-19 pandemisinden sonraki dönemde, temel tıp bilimleri alanındaki didaktikçiler, geleceğin doktorlarının eğitimine uygulamak için karma gerçeklik de dahil olmak üzere yeni teknolojilere ilgi duymaktadır 19,20,21. Normal anatomi öğreten akademik öğretmenler de kendi alanlarında karma gerçekliği tanıtmak için yer buluyorlar 22,23,24,25,26. Hologramlar oluşturmak, mühendisler tarafından özel bir yazılım kullanılarak holografik bir versiyona dönüştürülen ve işlenen bir görüntüleme çalışması, çoğunlukla bilgisayarlı tomografi gerektirir - gözlüklerle kullanılması mümkündür.
Tıp eğitiminin ilk yılında anatomi derslerinin bir parçası olarak öğrencilerin insan kalbinin anatomisini öğrenmeleri için faydalı materyaller oluşturmaya karar verdik. Bu amaçla, verilerin önceden tamamen anonimleştirilmesinden sonra Kardiyoloji Bölümü'nden temin edilebilen bir Anjiyo-BT taraması kullanıldı. İki takıma ayrıldık, hologramlar ve 3D baskılar oluşturduk ve bunlar daha sonra pilot dersin bir parçası olarak öğrencilere sunuldu. Öğrenciler materyallerin erişilebilirliğini ve doğruluğunu çok iyi değerlendirdiler, ancak bu konuyla ilgili ayrıntılı bir çalışma daha sonra sunulacak - sonuçlar şu anda değerlendiriliyor.
Burada, bilgisayarlı tomografiden model oluşturma sürecini, öğretim uygulamasında uygulanan hazır modelleri sunmaya kadar gösteriyoruz.
Protokol, Silezya Tıp Üniversitesi İnsan Araştırmaları Etik Komitesi'nin yönergelerini takip eder. Hastanın görüntüleme verileri tam anonimleştirildikten sonra kullanıldı.
1. 3D Yazdırma - 3D kalp modelinin segmentasyonu ve yeniden yapılandırılması
2. Karma gerçeklik
NOT: Kalp CT DICOM dosyalarını CarnaLife Holo (karma gerçeklik yazılımı olarak adlandırılır) kullanarak holografik bir gösterime işleyin.
Segmentasyon ve 3D rekonstrüksiyon protokolü, anatomi eğitimi için iki temel çıktı verdi: 3D baskılı bir kalp modeli ve kalbin 3D MR görselleştirmesi. Hastaya özel BT verilerini kullanan bu sonuçlar, öğrencilerin uygulamalı ve sürükleyici öğrenme deneyimlerine katılmaları için tamamlayıcı araçlar sağlar.
3D baskılı kalp modeli, öğrencilerin kardiyak anatominin somut bir temsili ile fiziksel olarak etkileşime girmelerini sağlar. Bu model, miyokard gibi farklı dış özelliklerin yanı sıra odalar ve valfler dahil olmak üzere iç yapılar sunar. Başarılı deneylerde, anatomik doğruluk, iyi tanımlanmış özellikler ve işlem sonrası minimum artefaktlar ile yüksekti. Şekil 9 , miyokard ve iç odacıklar arasında net bir ayrım ile tamamen işlenmiş bir 3D baskılı modeli göstermektedir. BT görüntülerindeki kontrastın yetersiz olduğu durumlarda, segmentasyon hataları, düzensiz oda boyutları veya eksik valf yapıları gibi modelde yanlışlıklara yol açmıştır. Bu sorunlar, Şekil 10'da vurgulandığı gibi, ek yumuşatma ve artefakt kaldırma dahil olmak üzere genellikle manuel müdahale ile düzeltilebilirdi.
Buna karşılık, 3B Karma Gerçeklik görselleştirmesi, öğrencilerin sanal alanda kalbi keşfedebilecekleri dinamik ve etkileşimli bir deneyim sunar. MR ortamı, rotasyon, yakınlaştırma ve farklı anatomik düzlemlerde kesit alma dahil olmak üzere gerçek zamanlı etkileşim sağlayarak koroner arterler veya septal duvarlar gibi karmaşık yapıların daha ayrıntılı bir şekilde anlaşılmasına olanak tanır. MR görselleştirmenin başarılı uygulamaları, hem dış hem de iç anatominin son derece doğru temsillerini sundu. Bununla birlikte, optimal olmayan görselleştirmeler (örneğin, segmentasyonun kusurlu olduğu durumlarda), MR modelinin gerçekçiliğini ve öğretim etkinliğini etkileyen iç yapıların çarpık görünümlerine yol açmıştır (Şekil 11). Kompleks olan anatomik yapılar için segmentasyon yaklaşımı yeterli olmayabilir. Hacimsel işleme imkanı sayesinde, anatomiyi anlamak için önemli olan farklı yoğunlukları (Hounsfield Birimleri ile temsil edilir) görselleştirmek mümkündür (Şekil12).
Teknikler, doğru ve manipüle edilebilir modeller sağlayarak öğrenme deneyimini geliştiren sağlam, tamamlayıcı araçlar sunar, ancak başarıları protokolün ilk adımlarında segmentasyon ve yeniden yapılandırmanın kalitesine bağlıdır. Genel olarak, bu sonuçlar protokolün hastaya özgü BT verilerinden kesin kalp modelleri oluşturmadaki etkinliğini göstermektedir. Bu sonuçlar, protokolün hastaya özgü BT verilerinden kesin kalp modelleri oluşturmadaki etkinliğini göstermektedir.
Anatomi eğitiminde, özellikle de kalbin yapısını öğrenmede öğrencilerin karma gerçeklik teknolojisine ilişkin algılarını değerlendirmek için bir ön çalışma yapılmıştır. Çalışma, mühendislerin gözetiminde hologramları öğrenme amacıyla kullanabilen 106 öğrenciyi içeriyordu. Oturumun sonunda şu soru soruldu: "Karma gerçeklik teknolojisi, konuyu, kalbin yapısını daha iyi anlamanıza yardımcı oldu mu?" Ankete katılanların tümü (%100) "evet" yanıtını verdi. Öğrencilerin bilgileri, oturumdan hemen sonra, kalbin morfolojisi ile ilgili üç anatomik yapıyı tanımlamalarını gerektiren kısa bir yazılı test ile değerlendirildi. Ortalama puan 2.037 iken toplam puan 3 idi (Tablo 1).
Şekil 1: Kalbin BT segmentasyonu. 3D Slicer yazılımında CT segmentasyonunun eksenel (sol üst), koronal (sol alt), sagital (sağ alt) ve 3D (sağ üst) görünümleri. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 2: İşlem sonrası. Prototip tasarım yazılımı üzerinde segmentasyon 3D modellerinin görünümleri. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 3: İşlem sonrası sonra. Prototip tasarım yazılımı üzerinde segmentasyon 3D modellerinin görünümleri. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 4: Karma Gerçeklik yazılımının görünümü. Uygulama başlangıç ekranı. Açık ve erişilebilir giriş paneli. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 5: Karma gerçeklik yazılımında doğru seriyi seçme. Holografik görselleştirme için mevcut bilgisayarlı tomografi görüntülerinin seçimi. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 6: Karma gerçeklik yazılımında görselleştirme parçalarını kesmek için makas seçeneği. Hologramı gerçek zamanlı olarak kullanıcının ihtiyaçlarına göre ayarlamaya izin veren bir araç. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 7: Karma gerçeklik yazılımında holografik görselleştirmenin renklerini ayarlama. Görselleştirmeye renk eklemek, hologramların erişilebilirliğini ve netliğini artırır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 8: Karma gerçeklik yazılımıyla oluşturulan holografik uzaydaki görselleştirmeler. Uzayda oryantasyona yardımcı olmak için vurgulanmış renklere ve bilgisayarlı tomografi işaretleyicilerine sahip üç boyutlu bir hologram. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 9: İşlem sonrası ve boole işleminden sonra "x-ışını" önizlemesi. Prototip tasarım yazılımında 3D modellerin görünümü. Miyokard ve iç odalar arasında net bir ayrım ile tamamen işlenmiş 3D baskılı model. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 10: Modeli dört odacıklı bir projeksiyonda kestikten sonra, son 3D baskılı parça önizlemesi. Prototip tasarım yazılımında 3D modellerin görünümü. Ek yumuşatma ve artefakt kaldırma. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 11: Karma gerçeklik yazılımında CT verilerinin görselleştirilmesi. Yüzey işleme, aşırı segmentasyonun sonucunu temsil eder. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 12: Karma gerçeklik yazılımında CT verilerinin örnek görselleştirmesi. Farklı yoğunlukları görselleştiren hacim oluşturma. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Toplam öğrenci sayısı (n) | 106 | ||
Hologramları öğrenme amacıyla kullanan öğrenci sayısı (n) | 106 | ||
"Karma gerçeklik teknolojisi konuyu, yani kalbin yapısını daha iyi anlamanıza yardımcı oldu mu?" sorusuna "EVET" yanıtını veren öğrenci sayısı. (n) | 106 | ||
"Karma gerçeklik teknolojisi konuyu, yani kalbin yapısını daha iyi anlamanıza yardımcı oldu mu?" sorusuna "HAYIR" yanıtını veren öğrenci sayısı. (n) | 0 | ||
Minimum puan | 0 | ||
Maksimum puan | 3 | ||
Kalbin morfolojisi ile ilgili üç anatomik yapıyı tanımlamak için kısa bir yazılı sınava giren öğrencilerin ortalama puanı | 2.037 | ||
Toplam puan | 3 |
Tablo 1: Çalışmanın ön verileri.
Modern anatomi, öncelikle yüzlerce yıldır bilinen klasik, kanıtlanmış yöntemlere dayanmaktadır. İnsan kadavraları, geleceğin doktorlarını öğretmenin temelidir ve anatomistler, yalnızca insan vücudunun yapılarını anlamada değil, aynı zamanda etik tutumları şekillendirmede de rollerini vurgulamaktadır28,29. Gelişen teknoloji sadece günlük klinik prosedürlerde değil, aynı zamanda öğretimde de geniştir, bu nedenle 3D baskı 7,30,31,32 ve anatomi öğretiminde karma gerçeklik 33,34,35,36 uygulama girişimi vardır. Şu anda, doktorların çalışmaları büyük ölçüde modern çözümlere, ekipmanlara ve geniş çapta anlaşılan dijitalleşmeye dayanmaktadır ve otomasyon, robotizasyon ve yenilikçi çözümlerin uygulanmasının artan payı, yıllardır devam eden eğilim dikkate alınarak ilerleyecektir.
Klasik eğitim biçimlerini 3D baskı ile desteklemek, karma gerçeklik veya ultrason kullanan sınıflar, gelecekteki doktorların mesleğe hazırlanması üzerinde çok olumlu bir etkiye sahip olabilir, sadece daha fazla bilgi edinme ve çeşitli görüntüleme tekniklerinde görselleştirmeleri karşılaştırma fırsatı nedeniyle değil, aynı zamanda yeni teknolojilerle temas nedeniyle, kullanımlarına aşina olmak ve özellikle ilgi alanındaki yeni uygulamalar hakkında düşünme dürtüsü vermek37.
3B baskı teknolojisinde modellerin yanı sıra karma gerçeklik teknolojisinde hologramlar hazırlamak, standart bağlılıktan daha fazlasını, oluşturulmalarını planlamayı ve bunları kullanarak ders verme özgürlüğü kazanmayı gerektirir. Bunların pahalı çözümler olduğu, özellikle de hologramları (gözlükleri) görüntüleyebilen cihazlar, mühendislik tesisleri - bir uygulama ve çalışması da dahil olmak üzere karma gerçeklik olduğu da eklenmelidir. 3D baskı, daha fazla popülaritesi ve daha düşük maliyetleri38 nedeniyle uygulanması daha kolaydır, ancak anatomi departmanı sıfırdan kendi modellerini ve DICOM görüntüleme çalışmalarından baskıya hazır görüntüler oluşturmak için yazılım oluşturmak isterse bir yazıcı ve filament satın almanın planlanmasını gerektirir.
CarnaLife Holo, kullanıcıların hem CT verilerini hem de segmentasyon sonuçlarını yüklemelerine olanak tanıyarak MR alanında nadiren uygulanan benzersiz bir yaklaşım sunar. Mevcut son teknoloji teknikler tipik olarak STL veya OBJ dosyalarına dayalı yüzey oluşturma kullanarak 3B modelleri görselleştirir39,40. Sonuç olarak, kullanıcılar yalnızca orijinal verileri doğrudan görüntüleme konusunda sınırlı bir yetenekle segmentasyon sonuçlarına erişebilir. Bu, segmentasyon hassasiyetinin kritik olduğu kalsifikasyonlar gibi küçük yapıları veya patolojileri analiz ederken zorluklar doğurabilir.
Ham veri görselleştirme (hacim oluşturma) sayesinde, kullanıcılar yapıları yalnızca geometriye göre değil, aynı zamanda yapı içindeki Hounsfield birimlerinin (yoğunluk) dağılımını analiz ederek de değerlendirebilir. Manuel segmentasyonun sıkıcı görevini kolaylaştıran yaygın bir teknik olan otomatik kalp segmentasyonunun sınırlamaları vardır41. Özellikle patolojilerin varlığında segmentlere ayırabileceği yapı sayısı ile sınırlıdır ve verimli işleme için yüksek performanslı donanım gerektirir.
Bu zorlukların üstesinden gelmek için, hacim oluşturma ve yüzey oluşturma olmak üzere iki görselleştirme yönteminin bir kombinasyonu önerilmiştir. Bu hibrit yaklaşım, segmentlere ayrılmış yapıların ve analiz edilen veriler içindeki değerlerin dağılımının aynı anda görselleştirilmesine olanak tanıyarak kullanıcılara veri yorumlama için daha kapsamlı bir araç sunar.
Kalp anatomisi söz konusu olduğunda, bir 3D model oluşturmak karmaşıktır, çünkü programdaki standart otomatik araçlar, boyut, şekil, anatomik yapıların konumu, artefaktların varlığı ve bitişik dokular arasındaki bulanık sınırlar (düşük kontrast) nedeniyle kalp dokusunu tam bir görüntüden çıkarmak için yetersizdir. Bu nedenle, eşik segmentasyona ek olarak, "dilim dilim" mekanizmasında bir hekim tarafından denetlenen segmentasyon yapılmalıdır. Bir sonraki aşama, modelin, görüntü elde etme sırasındaki gürültüden kaynaklanan bozulmaların daha da giderilmesini içeren 3D baskıya uyarlanmasıdır. Baskıdan sonra, daha pürüzsüz bir yüzey elde etmek için modeller aseton içinde nazikçe çözülür. Hazır modellerin öğrenciler tarafından kullanımı basittir - insan kadavra hazırlıklarını görüntülemeye ve tartışmaya benzer. Karma gerçeklik söz konusu olduğunda, her seferinde, teknolojinin kullanımında eğitim gereklidir - gözlüklerin kafaya doğru şekilde takılması, ayrıca ses ve hareket kontrolü. Mevcut ekipmanların sınırlı olması nedeniyle, aynı anda daha fazla sayıda öğrencinin katılması mümkün değildir. Görüntülenen materyalin erişilebilirliğini arttırmak için, preparatların - hologramların daha hızlı tartışılmasını kolaylaştırmak için belirli anatomik yapıların belirteçleri kullanıldı.
3D Slicer'da segmentasyon ve 3D yeniden yapılandırma sürecine hakim olmak, birden fazla işlevsellik ve iş akışını öğrenmeyi içerdiğinden yeni başlayanlar için zor olabilir. Yeterlilik geliştirmek tipik olarak önemli uygulama ve deneyim gerektirir. Gözlemlerimize göre, yazılımla güven elde etmek, en az 5-7 farklı kalp modelinin bölümlere ayrılmasını içeren yaklaşık 20-30 saatlik özel bir çalışma gerektiriyordu. 3D Slicer, sağlam bir çevrimiçi topluluktan yararlanan açık kaynaklı bir platformdur. Kapsamlı sorun giderme kaynakları, sorun çözme forumları ve çok sayıda öğretici ve kullanım örneği sunar. Bu kaynaklar, erişilebilir rehberlik sağlayarak öğrenme sürecini kolaylaştırır. Ek olarak, ChatGPT veya Gemini dahil olmak üzere büyük dil modelleri (LLM'ler) gibi araçların kullanılması, yazılımın ve özelliklerinin anlaşılmasını daha da geliştirebilir. Öğrenme aşamasında, tıbbi görüntüleme ve anatomi konusunda deneyimli bir akıl hocasına veya süpervizöre erişim oldukça avantajlıdır. Segmentasyon stratejileri ve doğruluğu hakkında anında geri bildirim, beceri gelişimini hızlandırır ve anatomik hassasiyetin korunmasını sağlar. Yeni başlayanlar, ilk denemelerin zaman alıcı olabileceğini ve hatalara açık olabileceğini tahmin etmelidir. Bununla birlikte, tutarlı uygulama, segmentasyon ve iyileştirme süreçlerini önemli ölçüde daha sezgisel ve verimli hale getirir. Bu öğrenme eğrisine sabırla yaklaşmak çok önemlidir, çünkü araçla sürekli etkileşim hızı ve doğruluğu önemli ölçüde artırır.
Sunulan protokolün kritik adımları, 3D baskı ve karma gerçeklik teknolojileri için yararlı olan üç boyutlu bir model oluşturmak için görüntüleme çalışmasından kalp dokusunun uygun segmentasyonu ve çıkarılmasıydı.
3D baskı ve karma gerçeklik teknolojisini kullanan kalp anatomisi dersi öğrenciler tarafından çok iyi karşılandı ve büyük çoğunluk teknolojik desteği yararlı buldu - tartışılan konunun daha iyi anlaşılmasını sağladı. Yazarlara göre, yeni teknolojiler mevcut, klasik didaktik çözümleri desteklemeli ve giderek daha yaygın olarak kullanılmalıdır.
Maciej Stanuch, Marcel Pikuła, Oskar Trybus ve Andrzej Skalski, MedApp S.A. çalışanlarıdır. MedApp S.A., CarnaLifeHolo çözümünü üreten şirkettir.
Çalışma, ticari olmayan işbirliği kapsamında gerçekleştirilmiştir.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
3D Slicer | The Slicer Community | https://www.slicer.org | Version 5.6.0 |
CarnaLifeHolo | MedApp S.A. | https://carnalifeholo.com | 3D visualization software |
Meshmixer | Autodesk Inc. | https://www.research.autodesk.com/projects/meshmixer/ | prototype design software |
Ender 3 | Creality | https://www.creality.com/products/ender-3-3d-printer | 3D printer |
Cura | UltiMaker | https://ultimaker.com/software/ultimaker-cura/ | 3D printing software |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır