Başlamak için, ekstrakte edilen yoğuşma çözeltisinin en az beş dakika çökmesine izin vererek RNA Şablonlayıcı C-yıldız yoğuşmalarını yıkayın. Ardından, yoğuşma giderimini en aza indirmek için sıvı seviyesinin en üstünden pipetleme yaparken, süpernatantın hacminin yaklaşık yarısını çıkarın. Çıkarılan süpernatantın yerini almak için tris-EDTA'ya aynı hacimde 0.3 molar sodyum klorür ekleyin ve pipetleme ile karıştırın.
Süpernatan çıkarma ve tampon değiştirme döngüsünü toplam üç döngü boyunca tekrarlayın. T7 transkripsiyon karışımı için, dimetil sülfoksit içinde 10 milimolar DFHBI'lik bir stok çözeltisi hazırlayın. Daha sonra bir alikotu RNAse ve DNAse içermeyen su kullanarak 600 mikromolar nihai konsantrasyona seyreltin.
Transkripsiyon kiti bileşenlerinin buzunu buz üzerinde çözün. Ardından, steril pipet uçlarını kullanarak, görüntülenen bileşenleri oda sıcaklığında otoklavlanmış bir mikrosantrifüj tüpüne pipetleyin. Çözeltiyi pipetleme ile nazikçe karıştırın ve hemen RNA transkript sentezi için kullanın.
Bunu yapmak için, RNA-Templating C-Stars'tan hazırlanan yıkanmış kondensatlardan 3,3 mikrolitreyi mikroskopi görüntülemeye uygun bir odaya pipetleyin. Ve taze hazırlanmış transkripsiyon karışımının toplam hacmini ekleyin. Transkripsiyon karışımını kondensatlara ekledikten hemen sonra başlayarak 18 saatlik bir süre boyunca mikroskopi görüntüleri elde edin.
RNA Aptamerlerinin transkripsiyonu için, mikroskopi ile zaman içinde florigenin floresansındaki artışla başarılı bir sonuç doğrulandı.
