Yazar Barbara Berli örnek verileri ve Kanada Yaban Hayatı Federasyonu nazik finansman sağlamak için teşekkür ederim.

1. Yakalama ve aklimasyonundan <ol><li> Düğümsüz ağ kullanımı, onların pis su tankı tek tek balık toplamak. Zaman yakalama en aza indirmek, birden fazla balık toplama önlemek ve bu faktörler, stres artışı gibi net bir kaç saniye daha fazla balık tutmayın. Stres yüzme performansını etkileyebilir. </li><li> Anestezi veya doğrudan yüzme tüneli respirometredeki (&#39;yüzmeye tünel&#39;) ile bir transfer tankı ya Yeri balık. Balık, tricaine methanesulfonate (MS222) veya karanfil yağı kullanılabilir ya narkoz iseniz. Kabul edilebilir konsantrasyonları tür hassasiyet ve sıcaklık gibi birçok faktöre bağlıdır, ancak genellikle aralığı 10-100 mg / L ya da anestezi 1,2. Anestezik konsantrasyonu evre 3 anestezi (yani dış uyaranlara tepkisiz) ve hızlı kurtarma (yani saniye) neden izin vermelidir. Tatlı suda MS222 kullanırken, sodyum bikarbonat, bir tampon olarak eşit parçaya (kütle) kullanılması gerekir. Tampon olmadan, MS222 büyük ölçüde pH değerini düşürür, ve düşük pH solungaç dokusu zarar verebilir. Yeterli tamponlama kapasitesi içeren Tamponlama deniz suyu gerekli değildir. </li><li> Anestezi altında balık cinsiyetli, kütle ve uzunluk için ölçülen ve durumlarının üstünkörü bir dış sınavı olabilir. Uzunluğu toplam uzunluğu (TL), çatal boy (FL) veya vücut uzunluğu (BL) olarak alınabilir. Bu farklı ölçümler genellikle standart uygulamalara göre uygulanır, türlerin morfolojisi (herhangi bir çatallı yüzgeç gibi) ya da balık durumu (örneğin, kuyruk yüzgeci aşınmış). </li><li> Her iki anestezi ve anestezi olmayan balık ve bu kurtarma kolaylaştıracaktır akan suyun içine mümkün olduğunca hızla yüzerek tünel getirilmelidir. Akış hızı, genellikle, balık, ancak yüzme sırasında alt dinlenmek için mümkün olacaktır. Yetişkin Sockeye somon için bir örnek oranı 0.3 BL / s </li><li> Balık sol gelmesini yüzme tünel içinde olması gerekir. Aklimasyonundan dönemde geleneksel bir süre (örneğin 12 saat), ya da 30 dakika kadar kısa olabilir, en güncel çalışmalarda kullanılan ayarlanabilir. Için ideal bir aklimasyonundan süre belirli bir balık, istikrarlı, ideal düşük metabolizma hızı (ayrıntılı bir sonraki bölümde) kullanılabilir ulaşmak için alınan süreyi belirlemek için. </li></ol> 2. Ölçüm Metabolik Oranları <ol><li> Yüzme tünel içinde oksijen değişiklikler yüzme testi (ler) in süresi boyunca kayıt altına alınmalıdır. Oksijen sondaları doğrudan yüzme tünel içine kapatılmış; ancak ilk probu üzerinde su akış prob işlevi etkileyip etkilemediğini tespit edilmelidir. Prob testi sırasında meydana gelebilecek su hızları etkilenmesi durumunda, tünel dışında kendi odasında prob yerleştirilir ve bir pompa ile tünel su ile temin edilecek gerekir. </li><li> Oksijen doldurmak ve atık birikimi azaltmak için, yüzme tüneli muhtemelen periyodik kızarmış gerekecektir. Yüzme performansı düşebilir veya anaerobik metabolizmayı bir kayma olabilir, oksijen doygunluğu, çoğu türler için% 70&#39;den düşük düşmesine izin verilmemelidir. Flushing tünel su da su sıcaklığı herhangi bir artış azaltmaya yardımcı olabilir, ancak, bir soğutucu yüzme tünel kaplin su sıcaklığı sabit tutulur olmalıdır. Sıcaklık değişiklikleri, metabolik hızı etkileyecektir. </li><li> Rutin ve maksimum metabolik oranları, kısaltılmış &#39;RMR&#39; ve &#39;KKK&#39;, tipik olarak belirlenmiştir (Şekil 1A). Bu oranlar hacmi (V o 2) ya da birim kütle başına oksijen kütle (M o 2) ifade edilebilir, birim zamanda, örneğin mg O 2 / kg / saat. Iki oranları arasındaki fark faaliyet kapsamı &#39;almak için alınabilir. &#39;Oksijen borç&#39;, &#39;aşırı egzersiz sonrası oksijen tüketimi (EPOC) olarak adlandırılır aşağıdaki egzersiz, aynı zamanda kararlı ve RMR için egzersiz sonrası dönüş sırasında gerekli oksijen eşittir. </li></ol><ol><li> Not: çok oksijen sondaları ve çıkış otomatik olarak çözünmüş oksijen, sıcaklık düzeltilmiş değişiklikler sağlayacaktır. Olmayanları düzeltilmesi gerekir. Ayrıca, bazı değerleri ölçümleri tuzlu koşullar yapılmıştır düzeltilmesi gerekir. </li></ol> Yüzme performans ölçümü Yüzme performans yeteneklerini çeşitli yüzme tünelinde değerlendirilebilir. Yüzme performansını karakterize etmek için en yaygın yolu, 3 muhafaza edilebileceği süresi ile . Hızı yavaş, o kadar uzun korunur ve tam tersi olabilir. Hızları genellikle sırasıyla saniye süreleri, saat (max = 200 dk) dakika ve saat ve ötesinde (&gt; 200 dk) karşılık, &#39;uzun süreli&#39; veya &#39;sürekli&#39;, &#39;patlama&#39; olarak adlandırılır. Bu hızlarını belirlemek için, balık kullanıcı tanımlı &#39;set&#39; yüksekliği &#39;, yani su akış hızı artışı ve&#39; uzunluk &#39;, yani adım süresi oluşan adımları&#39;, tabi tutulmaktadır. Basamak yüksekliği en üst düzeye çıkarma ve ters yaparken adım uzunluğu en aza indirmek, büyük patlama hızı yakalamak sürekli büyük hız yakalayacaktır. Adımdatestleri, geleneksel yolla elde edilen maksimum hız rapor, en son tam olarak tamamlanmış bir adım artı son, bitmemiş bir adım (Şekil 1A) temporal kısmı hızına eşit. Burst yüzme performans değerlendirmesi <ol><li> (Aşağıya bakın örneğin iki kez U crit) ve balık yüzmek için motive aklimasyonundan aşağıdaki patlama yüzme veya sürat yeteneği yakalamak için, tahmini maksimum akış hızı getirmek. Akış hızı hızla arttıkça Balık odasının arka kısmında istirahat edilmelidir. Balık yüzmek için motive olması gerekir. Motivasyon mekanik (örn. dokunma) veya elektrik (örneğin yüzme tünelin arka kısmında bir şok ızgara uygulanan küçük bir ücret) olabilir. Özellikle patlama yeteneği test rağmen, balık 4,5 kısa süreli birkaç adım (örneğin 1 dakika) oluşan bir &#39;sabit ivmeli test&#39; (CAT veya U ΔV) olabilir. </li><li> Yüzme süresi kaydedin. Bireysel patlama ve aralarındaki mesafeyi sayısı da 6 olarak kaydedilebilir. Hız maksimum Şekil 1A denkleme göre elde veya hesaplanan olarak verilebilir. Uzun süreli ve sürekli yüzme performans değerlendirmesi Uzun süreli veya devamlı yüzme yeteneği tahmin etmek için en sık kullanılan ölçü &#39;kritik yüzme performansı&#39; (U crit) olarak adlandırılır. U crit Adım uzunluğu 10 dakika gibi kısa sürelerde de kullanılmış olmasına rağmen, geleneksel olarak 20 dakika oldu. Genel bir kural uzun testler, örneğin&gt; 3 saat / balık neden olabilir yorgunluk, en az on adım önce alınması gerektiği. U crit testi kısaltmak için, ilk yedi adım 5 dakika (test sonra &#39;rampa U crit&#39; denir) olarak kısaltılır. </li></ol><ol><li> Aklimasyonundan ve / veya bir uygulama yüzmeye sonra boyutu adıma göre akış hızı artar. </li><li> U crit için uygun adım yüksekliğini ayarlamak için, büyük olasılıkla bir örnek için test edilecek balık U crit tahmin etmek için gerekli olacaktır . Bu literatür değerleri kullanılarak yapılabilir. Alternatif olarak, tünel giriş sonra balık &#39;uygulama yüzmeye&#39; olabilir. Bunun için, yorgunluk kadar balık kısa, kullanıcı tanımlı adımları verir. U crit erken bir tahmin olarak ulaştığı son hız kullanın. Her balık için adım boyutu (yükseklik ve uzunluk) ayarlayın. </li><li> Kurtarma yeteneği test veya bireysel performans değişimi belirlemek için, balık, bir iyileşme dönemi 7-9 izleyen ikinci bir yüzme testi verilebilir . </li><li> Balık aynı zamanda balık tünel çıkardıktan için sorunlu ve oksijen alımını ölçme yeteneği ortadan kaldırabilir testler sırasında farklı zamanlarda yorgunluk eğiliminde olmasına rağmen, okullarda test edilebilir. </li><li> Bir kez yorgun, balık kurtarmak için izin veya doku örneklemesi için derhal çıkarılmalıdır. Yüzme ile ilgili çeşitli performans ölçütleri (Şekil 1 C, D) testleri sırasında veya video analiz kullandıktan sonra toplanabilir. </li><li> Havalandırma oranı ve kuyruk yendi frekans, kuyruk vuruş opercular pompalama oranı ve sayı ölçmek için birkaç saniye dönemleri (Şekil 1B) 10,11 üzerinden numune olmalıdır. </li><li> Kuyruk yendi genlik ölçmek için, kuyruk yüzgeci maksimum sapma (Şekil 1B) 12 ölçülen olabilir. </li><li> Aşağıdaki test, balık, bir post-mortem sınav ve hematokrit (paketlenmiş kırmızı hücre hacmi), stres hormon düzeyleri, kas enerji depolayan (örn. phosphocreatine, glikojen), enzim aktiviteleri (örneğin laktat dehidrogenaz, asetilkolin esteraz belirlemek için toplanan dokulara verilen ötenazi olabilir ) veya diğer fizyolojik parametreler. </li></ol> 3. Temsilcisi Sonuçlar <img src="/files/ftp_upload/2572/2572fig1.jpg" alt="Şekil 1" /> Şekil 1 bir çocuk salmonid için verilen A) Bir örnek rampa U crit testi, kuluçkahane, gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss), kitle 6.3 cm, vücut uzunluğu (BL) ve 3.5 g kaldırdı. Test modifiye Brett-tipi respirometredeki (Loligo Sistemleri, Danimarka, 12 L gerçekleştirildi <a href="http://www.loligosystems.com/">www.loligosystems.com</a> ). Rutin ve maksimum metabolik oranları eğimi (mg / saat) × hacmi (L) / balık kütlesi (kg) olarak hesaplanır ve sırasıyla 198 ve 961 mg O 2 / kg / saat, (faaliyet kapsamı = 4.84) ​​idi. Bu oranlar, juvenil Sockeye somon (O. nerka) 13 Brett tarafından bildirilen bu tutarak . Not: oksijen alımını hesaplamalar için, su hacmi respirometredeki hacmi daha az balık hacmi eşit. Çapraz balıklar yüzmek için reddetti ve U crit hesaplandı noktasını belirtir. B) altı kez 10 sn içinde Kuyruk yendi frekans değerleri kaydedildi; kuyruk yendi genlik değerleri üç kez kaydedildi değerleri gösterilirortalama ± SEM. C) genişlemiş bir yan görünüm ve D) yüzme odasının içinde yüzen balıklar üstten görünüm. D) EthoVision yazılımı (Noldus, Hollanda tarafından izlenen balık gösterir <a href="http://www.noldus.com/">www.noldus.com</a> ). Kısaltmalar: U crit = kritik yüzme hızı; U f = tam doldurulmuş son adım hız, U = adım hız, t f = zaman son adım harcanan, t s = adım zamanı.

<ol>
	<li>Anderson, W. G., McKinley, R. S., Colavecchia, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+use+of+clove+oil+as+an+anesthetic+for+rainbow+trout+and+its+effects+on+swimming+performance.">The use of clove oil as an anesthetic for rainbow trout and its effects on swimming performance.</a> North Am. J. Fish Manage. 17, 301-307 (1997).</li><li>Cho, G. K., Heath, D. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+tricaine+methanesulphonate+(MS222)+and+clove+oil+anaesthesia+effects+on+the+physiology+of+juvenile+chinook+salmon+Oncorhynchus+tshawytscha+(Walbaum).">Comparison of tricaine methanesulphonate (MS222) and clove oil anaesthesia effects on the physiology of juvenile chinook salmon Oncorhynchus tshawytscha (Walbaum).</a> Aquacult. Res. 31, 537-546 (2000).</li><li>Beamish, F. W. H., Hoar, W. S., Randall, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Swimming capacity in Fish Physiology. , 101-187 (1978).</li><li>Farrell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparisons+of+swimming+performance+in+rainbow+trout+using+constant+acceleration+and+critical+swimming+speed+tests.">Comparisons of swimming performance in rainbow trout using constant acceleration and critical swimming speed tests.</a> J. Fish Biol. 72, 693-710 (2008).</li><li>Tierney, K. B., Casselman, M., Takeda, S., Farrell, A. P., Kennedy, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relationship+between+cholinesterase+inhibition+and+two+types+of+swimming+performance+in+chlorpyrifos-exposed+coho+salmon+(Oncorhynchus+kisutch).">The relationship between cholinesterase inhibition and two types of swimming performance in chlorpyrifos-exposed coho salmon (Oncorhynchus kisutch).</a> Environ. Toxicol. Chem. 26, 998-1004 (2007).</li><li>Martinez, M., Bedard, M., Dutil, J. -. D., Guderley, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Does+condition+of+Atlantic+cod+(Gadus+morhua)+have+a+greater+impact+upon+swimming+performance+at+Ucrit+or+sprint+speeds.">Does condition of Atlantic cod (Gadus morhua) have a greater impact upon swimming performance at Ucrit or sprint speeds.</a> J. Exp. Biol. 207, 2979-2990 (2004).</li><li>Marras, S., Claireaux, G., McKenzie, D. J., Nelson, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Individual+variation+and+repeatability+in+aerobic+and+anaerobic+swimming+performance+of+European+sea+bass,+Dicentrarchus+labrax.">Individual variation and repeatability in aerobic and anaerobic swimming performance of European sea bass, Dicentrarchus labrax.</a> J. Exp. Biol. 213, 26-32 (2010).</li><li>Kolok, A. S., Plaisance, E. P., Abdelghani, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Individual+variation+in+the+swimming+performance+of+fishes:+an+overlooked+source+of+variation+in+toxicity+studies.">Individual variation in the swimming performance of fishes: an overlooked source of variation in toxicity studies.</a> Environ. Toxicol. Chem. 17, 282-285 (1998).</li><li>Tierney, K. B., Farrell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relationships+between+fish+health,+metabolic+rate,+swimming+performance+and+recovery+in+return-run+sockeye+salmon,+Oncorhynchus+nerka+(Walbaum).">The relationships between fish health, metabolic rate, swimming performance and recovery in return-run sockeye salmon, Oncorhynchus nerka (Walbaum).</a> J. Fish Dis. 27, 663-671 (2004).</li><li>Webber, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Upstream+swimming+performance+of+adult+white+sturgeon:+Effects+of+partial+baffles+and+a+ramp.">Upstream swimming performance of adult white sturgeon: Effects of partial baffles and a ramp.</a> Trans. Am. Fish. Soc. 136, 402-408 (2007).</li><li>Farrell, A. P., Gamperl, A. K., Birtwell, I. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prolonged+swimming,+recovery+and+repeat+swimming+performance+of+mature+sockeye+salmon+Oncorhynchus+nerka+exposed+to+moderate+hypoxia+and+pentachlorophenol.">Prolonged swimming, recovery and repeat swimming performance of mature sockeye salmon Oncorhynchus nerka exposed to moderate hypoxia and pentachlorophenol.</a> J. Exp. Biol. 201, 2183-2193 (1998).</li><li>Flammang, B. E., Lauder, G. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Speed-dependent+intrinsic+caudal+fin+muscle+recruitment+during+steady+swimming+in+bluegill+sunfish,+Lepomis+macrochirus.">Speed-dependent intrinsic caudal fin muscle recruitment during steady swimming in bluegill sunfish, Lepomis macrochirus.</a> J. Exp. Biol. 211, 587-598 (2008).</li><li>Brett, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+respiratory+metabolism+and+swimming+performance+of+young+sockeye.">The respiratory metabolism and swimming performance of young sockeye.</a> J. Fish. Res. Board Can. 21, 1183-1226 (1964).</li><li>Bla&#382;ka, P., Volf, M., &#268;epela, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+type+of+respirometer+for+the+determination+of+the+metabolism+of+fish+in+an+active+state.">A new type of respirometer for the determination of the metabolism of fish in an active state.</a> Physiol. Bohemoslov. 9, 553-558 (1960).</li><li>Peake, S. J., Farrell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fatigue+is+a+behavioural+response+in+respirometer+confined+smallmouth+bass.">Fatigue is a behavioural response in respirometer confined smallmouth bass.</a> J. Fish Biol. 68, 1742-1755 (2006).</li></ol>

Doğal bir ortamda, bu tür yırtıcı kaçış ve göç gibi davranışları farklı zamanlarda belirli yoğunluklarda yüzebilme bağlıdır. Bir laboratuar ayarı, tünel respirometers yüzmek ve hızı adım artar, çok sayıda davranışları gerçekleştirmek için balık yeteneğini tahmin etmek için kullanılabilir. Farklı yüzme modları altında yatan fizyolojik mekanizmaların belirlenmesi yardımcı yüzmeye testleri ile metabolik hızı ve diğer doku düzeyinde değerlendirmeler (laktat üretimi gibi) tedbirler dahil edilebilir. Swim tünel tasarımı yüzme performansı büyük ölçüde etkileyebilir. Veya Blazka 14-türleri yüzmeye tüneller yüzme performansını belirlemek için kullanılan çeşitli türleri vardır, en Brett 13 ya olarak karakterize edilirler. Ya da tasarım için, su akışı &#39;düzgünlüğü&#39; (nasıl dörtgen), maksimum akım hızı ve yüzme odasının uzunluğu önemli hususlar şunlardır. Balık içgüdüsel bulmak ve en aza indirmek için çaba düşük akım alanlarında yüzme çünkü düzlük önemlidir. Yüksek potansiyel akış hızı patlama yüzme yeteneği veya hızlı yüzme türleri (örneğin orkinos) test etmek için gerekli olabilir. Odasının uzunluğu odaları küçük bir uzunluk, yani balık uzunluğu&gt; odasının uzunluğu% 10 gibi çok anlamlı olabilir yüzün, balık tüm yüzme modları kullanmak mümkün olabilir. Özellikle, küçük tüpler patlama ve sahil yüzme yani sürekli bir geçiş için yüzme kapısı dengesiz balık yeteneğini sınırlayabilir. Bu nedenle, balık ne olursa olsun, adım uzunluğu ve U crit &#39;kapı geçiş hızı 15 benzer olabilir, yaklaşık olarak aynı hızda yüzme durabilir. Tüm yüzmeye tüneller akış sondaları veya parçacık görüntüleme velosimetri (PIV) ekipman gibi cihazlar kullanılarak kalibre edilmesi gerekir. İdeal tüneller doğrusal akışı olacak yüzmek, ancak bir bölgede balık lehine tespit edilmesi halinde, kendi yüzmeye hızı akış yerel farklılıklar dayalı olarak ayarlanabilir.

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>tricaine methanesulfonate (MS222)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td><a href="http://www.argent-labs.com">www.argent-labs.com</a></td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Clove oil</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Pharmacy or <a href="http://www.sigmaaldrich.com">www.sigmaaldrich.com</a></td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Swim tunnel respirometer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Custom made or <a href="http://www.loligosystems.com">www.loligosystems.com</a></td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Required</td>
</tr>
<tr>
<td>High speed cameras</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Numerous sources</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Video capture card</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Numerous sources</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Behaviour analysis software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td><a href="http://www.noldus.com">www.noldus.com</a> <a href="http://www.cleversysinc.com">www.cleversysinc.com</a> <a href="http://www.loligosystems.com">www.loligosystems.com</a> <a hre</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>optional</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

swimming performance assessment in fishes

Balık Yüzme performans testleri, yüzme mekaniği, gaz değişimi, kardiyak fizyoloji, hastalık, kirlilik, hipoksi ve sıcaklık kas enerji çalışmalarının ayrılmaz bir parçası olmuştur. Bu kağıt, su hızı kontrol edilebilir olan ekipman kullanarak balık yüzme performansını değerlendirmek için esnek bir protokol tanımlamaktadır. Protokol balık yorgunluğa neden amaçlanan akış hızı birkaç basamaklı artışlar tek içerir. Adım hızları ve süreleri farklı fizyolojik ve ekolojik önemi yüzme yeteneklerini yakalamak için ayarlanabilir. En sık adım büyüklüğü maksimum sürekli yüzme yeteneği yakalamak için tasarlanmıştır kritik yüzme hızı (U crit) belirlemek için ayarlanır. Geleneksel olarak bu test yaklaşık 20 dakika süresi her on adım oluşmuştur. Ancak, kısa bir süre (örneğin 1 dakika) adımlarla giderek ivme yeteneği ya da patlama yüzme performansı yakalamak için kullanılmaktadır. Adım boyutu ne olursa olsun, yüzme testleri, bireysel farklılıklar ve kurtarma yeteneği ölçmek için zaman içinde tekrar edilebilir. Metabolizma hızı, fin kullanımı, havalandırma oranı ve okul arasındaki mesafe balık gibi davranışları, önlemleri gibi yüzme ile ilgili uç nokta, yüzme testleri sırasında ve sonrasında sık sık, daha önce yer almaktadır. Balık türlerinin çeşitliliği göz önüne alındığında, keşfedilmemiş araştırma soruları ve küresel ekoloji ve ekonomik sağlığı için pek çok türün önemini sayısı, balık yüzme performans çalışmaları yakın gelecekte popüler ve değerli olmaya devam edecektir.

Watch this Scientific Journal Video about Swimming Performance Assessment in Fishes at JoVE.com

Swimming Performance Assessment in Fishes

Balık çoğunluğunun yaşamlarını yüzme esas alınır. Bu protokol bir dizi bireysel ve okullaşma balık için kullanılabilir modları yüzme yakalama teknikleri açıklar ve yüzme fizyolojisi ve davranışları ile ilgili ölçümler şunlardır.

Balıklar yüzme Performans Değerlendirme

Swimming performance tests of fish have been integral to studies of muscle energetics, swimming mechanics, gas exchange, cardiac physiology, disease, ...

swimming-performance-assessment-in-fishes

Research

JoVE Journal

Biology

25.4K Görüntüleme.  University of Alberta. Balık çoğunluğunun yaşamlarını yüzme esas alınır. Bu protokol bir dizi bireysel ve okullaşma balık için kullanılabilir modları yüzme yakalama teknikleri açıklar ve yüzme fizyolojisi ve davranışları ile ilgili ölçümler şunlardır.

Video: Swimming Performance Assessment in Fishes

Respirometric Oxidative Phosphorylation Assessment in Saponin-permeabilized Cardiac Fibers

Investigation of mitochondrial function represents an important parameter of cardiac physiology as mitochondria are involved in energy metabolism, oxidative stress, apoptosis, aging, mitochondrial encephalomyopathies and drug toxicity. Given this, technologies to measure cardiac mitochondrial function are in demand. One technique that employs an integrative approach to measure mitochondrial function is respirometric oxidative phosphorylation (OXPHOS) analysis.
The principle of respirometric OXPHOS assessment is centered around measuring oxygen concentration utilizing a Clark electrode. As the permeabilized fiber bundle consumes oxygen, oxygen concentration in the closed chamber declines. Using selected substrate-inhibitor-uncoupler titration protocols, electrons are provided to specific sites of the electron transport chain, allowing evaluation of mitochondrial function. Prior to respirometric analysis of mitochondrial function, mechanical and chemical preparatory techniques are utilized to permeabilize the sarcolemma of muscle fibers. Chemical permeabilization employs saponin to selectively perforate the cell membrane while maintaining cellular architecture.
This paper thoroughly describes the steps involved in preparing saponin-skinned cardiac fibers for oxygen consumption measurements to evaluate mitochondrial OXPHOS. Additionally, troubleshooting advice as well as specific substrates, inhibitors and uncouplers that may be used to determine mitochondria function at specific sites of the electron transport chain are provided. Importantly, the described protocol may be easily applied to cardiac and skeletal tissue of various animal models and human samples.

Saponin-permeabilized fiber preparation in conjunction with respirometric oxidative phosphorylation analysis provides integrative assessment of mitochondrial function. Mitochondrial respiration in physiological and pathological states can reflect various regulatory influences including mitochondrial interactions, morphology and biochemistry.

Söz konusu modelde Saponin permeabilize Kardiyak Elyaf Oksidatif Fosforilasyon Değerlendirmesi

Investigation of mitochondrial function represents an important parameter of cardiac physiology as mitochondria are involved in energy metabolism, ...

Biyoloji

Endurance Training Protocol and Longitudinal Performance Assays for Drosophila melanogaster

One of the most pressing problems facing modern medical researchers is the surging levels of obesity, with the consequent increase in associated disorders such as diabetes and cardiovascular disease 1-3. An important topic of research into these associated health problems involves the role of endurance exercise as a beneficial intervention.
Exercise training is an inexpensive, non-invasive intervention with several beneficial results, including reduction in excess body fat 4, increased insulin sensitivity in skeletal muscle 5, increased anti-inflammatory and antioxidative responses 6, and improved contractile capacity in cardiomyocytes 7. Low intensity exercise is known to increase mitochondrial activity and biogenesis in humans 8 and mice, with the transcriptional coactivator PGC1-&alpha; as an important intermediate 9,10. 
Despite the importance of exercise as a tool for combating several important age-related diseases, extensive longitudinal genetic studies have been impeded by the lack of an endurance training protocol for a short-lived genetic model species. The variety of genetic tools available for use with Drosophila, together with its short lifespan and inexpensive maintenance, make it an appealing model for further study of these genetic mechanisms. With this in mind we have developed a novel apparatus, known as the Power Tower, for large scale exercise-training in Drosophila melanogaster 11. The Power Tower utilizes the flies' instinctive negative geotaxis behavior to repetitively induce rapid climbing. Each time the machine lifts, then drops, the platform of flies, the flies are induced to climb. Flies continue to respond as long as the machine is in operation or until they become too fatigued to respond. Thus, the researcher can use this machine to provide simultaneous training to large numbers of age-matched and genetically identical flies. Additionally, we describe associated assays useful to track longitudinal progress of fly cohorts during training.

Endurance Training Protocol and Longitudinal Performance Assays for Drosophila melanogaster

We describe the first endurance training protocol for an important genetic model species, Drosophila melanogaster, and outline several assays to chart improvements in mobility following training.

Drosophila melanogaster Kondisyon Eğitim Protokolü ve Boyuna Performans Tahliller

One of the most pressing problems facing modern medical researchers is the surging levels of obesity, with the consequent increase in associated disorders ...

An Improved Method for Accurate and Rapid Measurement of Flight Performance in Drosophila

Drosophila has proven to be a useful model system for analysis of behavior, including flight. The initial flight tester involved dropping flies into an oil-coated graduated cylinder; landing height provided a measure of flight performance by assessing how far flies will fall before producing enough thrust to make contact with the wall of the cylinder. Here we describe an updated version of the flight tester with four major improvements. First, we added a &#34;drop tube&#34; to ensure that all flies enter the flight cylinder at a similar velocity between trials, eliminating variability between users. Second, we replaced the oil coating with removable plastic sheets coated in Tangle-Trap, an adhesive designed to capture live insects. Third, we use a longer cylinder to enable more accurate discrimination of flight ability. Fourth we use a digital camera and imaging software to automate the scoring of flight performance. These improvements allow for the rapid, quantitative assessment of flight behavior, useful for large datasets and large-scale genetic screens.

An Improved Method for Accurate and Rapid Measurement of Flight Performance in Drosophila

Here we describe a method for rapid and accurate measurement of flight performance in Drosophila, enabling high-throughput screening.

Uçuş Performans Doğru ve hızlı ölçüm için geliştirilmiş Yöntemi<em&gt; Drosophila</em

Drosophila has proven to be a useful model system for analysis of behavior, including flight. The initial flight tester involved dropping flies into an ...

A Method for Selecting Structure-switching Aptamers Applied to a Colorimetric Gold Nanoparticle Assay

Small molecules provide rich targets for biosensing applications due to their physiological implications as biomarkers of various aspects of human health and performance. Nucleic acid aptamers have been increasingly applied as recognition elements on biosensor platforms, but selecting aptamers toward small molecule targets requires special design considerations. This work describes modification and critical steps of a method designed to select structure-switching aptamers to small molecule targets. Binding sequences from a DNA library hybridized to complementary DNA capture probes on magnetic beads are separated from nonbinders via a target-induced change in conformation. This method is advantageous because sequences binding the support matrix (beads) will not be further amplified, and it does not require immobilization of the target molecule. However, the melting temperature of the capture probe and library is kept at or slightly above RT, such that sequences that dehybridize based on thermodynamics will also be present in the supernatant solution. This effectively limits the partitioning efficiency (ability to separate target binding sequences from nonbinders), and therefore many selection rounds will be required to remove background sequences. The reported method differs from previous structure-switching aptamer selections due to implementation of negative selection steps, simplified enrichment monitoring, and extension of the length of the capture probe following selection enrichment to provide enhanced stringency. The selected structure-switching aptamers are advantageous in a gold nanoparticle assay platform that reports the presence of a target molecule by the conformational change of the aptamer. The gold nanoparticle assay was applied because it provides a simple, rapid colorimetric readout that is beneficial in a clinical or deployed environment. Design and optimization considerations are presented for the assay as proof-of-principle work in buffer to provide a foundation for further extension of the work toward small molecule biosensing in physiological fluids.

A protocol is provided to select structure-switching aptamers for small molecule targets based on a tunable stringency magnetic bead selection method. Aptamers selected with structure-switching properties are beneficial for assays that require a conformational change to signal the presence of a target, such as the described gold nanoparticle assay.

Bir Kolorimetrik Altın Nanopartikül Testi Uygulanan Yapı-anahtarlama aptamers seçilmesi için bir yöntem

Small molecules provide rich targets for biosensing applications due to their physiological implications as biomarkers of various aspects of human health ...

Design and Development of Aptamer&#8211;Gold Nanoparticle Based Colorimetric Assays for In-the-field Applications

The design and development of an aptamer&#8211;gold nanoparticle (AuNP) colorimetric assay for the detection of small molecules for in-the-field applications was examined. Target selective AuNP based color assays have been developed in controlled proof-of-concept laboratory settings. However, these schemes have not been exerted to a point of failure to determine their practical use beyond laboratory settings. This work describes a generic approach to design, develop, and troubleshoot an aptamer-AuNP colorimetric assay for small molecule analytes and using the assay for in-the-field settings. The assay is advantageous because adsorbed aptamers passivate the nanoparticle surfaces and provide a means to reduce and eliminate false positive responses to non-target analytes. Transitioning this system to practical uses required defining not only the shelf-life of the aptamer-AuNP assay, but establishing methods and procedures for extending the long-term storage capabilities. Also, one of the recognized concerns with colorimetric readout is the burden placed on analysts to accurately identify often subtle changes in color. To lessen the responsibility on analysts in the field, a color analysis protocol was designed to perform the color identification duties without the need for performing this task on laboratory grade equipment. The method for creating and testing the data analysis protocol is described. However to understand and influence the design of adsorbed aptamer assays, the interactions associated with the aptamer, target, and AuNPs require further study. The knowledge gained could lead to tailoring aptamers for improved functionality.

The design and development of an aptamer&#8211;gold nanoparticle colorimetric assay for the detection of small molecules for in-the-field applications was examined. Additionally, a smart-device colorimetric application (app) was validated and long-term storage of the assay was established for use in the field.

In-alan uygulamaları için tasarım ve Aptamer-Altın Nanopartikül Tabanlı Kolorimetrik Tahliller Gelişimi

The design and development of an aptamer&#8211;gold nanoparticle (AuNP) colorimetric assay for the detection of small molecules for in-the-field ...

A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research

Recent studies that compared transcriptomic datasets of human diseases with datasets from mouse models using traditional gene-to-gene comparison techniques resulted in contradictory conclusions regarding the relevance of animal models for translational research. A major reason for the discrepancies between different gene expression analyses is the arbitrary filtering of differentially expressed genes. Furthermore, the comparison of single genes between different species and platforms often is limited by technical variance, leading to misinterpretation of the con/discordance between data from human and animal models. Thus, standardized approaches for systematic data analysis are needed. To overcome subjective gene filtering and ineffective gene-to-gene comparisons, we recently demonstrated that gene set enrichment analysis (GSEA) has the potential to avoid these problems. Therefore, we developed a standardized protocol for the use of GSEA to distinguish between appropriate and inappropriate animal models for translational research. This protocol is not suitable to predict how to design new model systems a-priori, as it requires existing experimental omics data. However, the protocol describes how to interpret existing data in a standardized manner in order to select the most suitable animal model, thus avoiding unnecessary animal experiments and misleading translational studies.

We provide a standardized protocol for the use of gene set enrichment analysis of transcriptomic data to identify an ideal mouse model for translational research. 
This protocol can be used with DNA microarray and RNA sequencing data and can further be extended to other omics data if data are available.

Gen kullanmak için bir protokol translasyonel araştırma için uygun hayvan modeli belirlemek için zenginleştirme çözümlemesi ayarla

Recent studies that compared transcriptomic datasets of human diseases with datasets from mouse models using traditional gene-to-gene comparison ...

Simple and Effective Administration and Visualization of Microparticles in the Circulatory System of Small Fishes Using Kidney Injection

The systemic administration of micro-size particles into a living organism can be applied for vasculature visualization, drug and vaccine delivery, implantation of transgenic cells and tiny optical sensors. However, intravenous microinjections into small animals, which are mostly used in biological and veterinary laboratories, are very difficult and require trained personnel. Herein, we demonstrate a robust and efficient method for the introduction of microparticles into the circulatory system of adult zebrafish (Danio rerio) by injection into the fish kidney. To visualize the introduced microparticles in the vasculature, we propose a simple intravital imaging technique in fish gills. In vivo monitoring of the zebrafish blood pH was accomplished using an injected microencapsulated fluorescent probe, SNARF-1, to demonstrate one of the possible applications of the described technique. This article provides a detailed description of the encapsulation of pH-sensitive dye and demonstrates the principles of the quick injection and visualization of the obtained microcapsules for in vivo recording of the fluorescent signal. The proposed method of injection is characterized by a low mortality rate (0-20%) and high efficiency (70-90% success), and it is easy to institute using commonly available equipment. All described procedures can be performed on other small fish species, such as guppies and medaka.

This article demonstrates the principles of a quick, minimally invasive injection of fluorescent microparticles into the circulatory system of small fishes and the in vivo visualization of the microparticles in fish blood.

Basit ve etkili yönetim ve küçük balıklar böbrek enjeksiyon kullanarak dolaşım sistemi içinde Microparticles görselleştirme

The systemic administration of micro-size particles into a living organism can be applied for vasculature visualization, drug and vaccine delivery, ...

Medium-throughput Screening Assays for Assessment of Effects on Ca2+-Signaling and Acrosome Reaction in Human Sperm

Ca2+-signaling is essential to normal sperm cell function and male fertility. Similarly, the acrosome reaction is vital for the ability of a human sperm cell to penetrate the zona pellucida and fertilize the egg. It is therefore of great interest to test compounds (e.g., environmental chemicals or drug candidates) for their effect on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm either to examine the potential adverse effects on human sperm cell function or to investigate a possible role as a contraceptive. Here, two medium-throughput assays are described: 1) a fluorescence-based assay for assessment of effects on Ca2+-signaling in human sperm, and 2) an image cytometric assay for assessment of acrosome reaction in human sperm. These assays can be used to screen a large number of compounds for effects on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm. Furthermore, the assays can be used to generate highly specific dose-response curves of individual compounds, determine potential additivity/synergism for two or more compounds, and to study the pharmacological mode of action through competitive inhibition experiments with CatSper inhibitors.

Medium-throughput Screening Assays for Assessment of Effects on Ca2+-Signaling and Acrosome Reaction in Human Sperm

Here, two medium-throughput assays for assessment of effects on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm are described. These assays can be used to quickly and easily screen large amounts of compounds for effects on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm.

Orta-den geçerek deneyleri Ca2 +etkileri değerlendirilmesi için eleme-sinyal ve insan Sperm Acrosome reaksiyon

Ca2+-signaling is essential to normal sperm cell function and male fertility. Similarly, the acrosome reaction is vital for the ability of a human sperm ...

Silencing the Spark: CRISPR/Cas9 Genome Editing in Weakly Electric Fish

Electroreception and electrogenesis have changed in the evolutionary history of vertebrates. There is a striking degree of convergence in these independently derived phenotypes, which share a common genetic architecture. This is perhaps best exemplified by the numerous convergent features of gymnotiforms and mormyrids, two species-rich teleost clades that produce and detect weak electric fields and are called weakly electric fish. In the 50 years since the discovery that weakly electric fish use electricity to sense their surroundings and communicate, a growing community of scientists has gained tremendous insights into evolution of development, systems and circuits neuroscience, cellular physiology, ecology, evolutionary biology, and behavior. More recently, there has been a proliferation of genomic resources for electric fish. Use of these resources has already facilitated important insights with regards to the connection between genotype and phenotype in these species. A major obstacle to integrating genomics data with phenotypic data of weakly electric fish is a present lack of functional genomics tools. We report here a full protocol for performing CRISPR/Cas9 mutagenesis that utilizes endogenous DNA repair mechanisms in weakly electric fish. We demonstrate that this protocol is equally effective in both the mormyrid species Brienomyrus brachyistius and the gymnotiform Brachyhypopomus gauderio by using CRISPR/Cas9 to target indels and point mutations in the first exon of the sodium channel gene scn4aa. Using this protocol, embryos from both species were obtained and genotyped to confirm that the predicted mutations in the first exon of the sodium channel scn4aa were present. The knock-out success phenotype was confirmed with recordings showing reduced electric organ discharge amplitudes when compared to uninjected size-matched controls.

Here, a protocol is presented to produce and rear CRISPR/Cas9 genome knockout electric fish. Outlined in detail are the required molecular biology, breeding, and husbandry requirements for both a gymnotiform and a mormyrid, and injection techniques to produce Cas9-induced indel F0 larvae.

Kıvılcım Susturma: CRISPR/Cas9 Zayıf Elektrikli Balıklarda Genom Düzenleme

Electroreception and electrogenesis have changed in the evolutionary history of vertebrates. There is a striking degree of convergence in these ...

An Air-liquid Interface Bronchial Epithelial Model for Realistic, Repeated Inhalation Exposure to Airborne Particles for Toxicity Testing

For toxicity testing of airborne particles, air-liquid interface (ALI) exposure systems have been developed for in vitro tests in order to mimic realistic exposure conditions. This puts specific demands on the cell culture models. Many cell types are negatively affected by exposure to air (e.g., drying out) and only remain viable for a few days. This limits the exposure conditions that can be used in these models: usually relatively high concentrations are applied as a cloud (i.e., droplets containing particles, which settle down rapidly) within a short period of time. Such experimental conditions do not reflect realistic long-term exposure to low concentrations of particles. To overcome these limitations the use of a human bronchial epithelial cell line, Calu-3 was investigated. These cells can be cultured at ALI conditions for several weeks while retaining a healthy morphology and a stable monolayer with tight junctions. In addition, this bronchial model is suitable for testing the effects of repeated exposures to low, realistic concentrations of airborne particles using an ALI exposure system. This system uses a continuous airflow in contrast to other ALI exposure systems that use a single nebulization producing a cloud. Therefore, the continuous flow system is suitable for repeated and prolonged exposure to airborne particles while continuously monitoring the particle characteristics, exposure concentration, and delivered dose. Taken together, this bronchial model, in combination with the continuous flow exposure system, is able to mimic realistic, repeated inhalation exposure conditions that can be used for toxicity testing.

Described is the cell culture and exposure method of an in vitro bronchial model for realistic, repeated inhalation exposure to particles for toxicity testing.

Toksisite Testi için Havadaki Parçacıklara Gerçekçi, Tekrarlanan Soluma Maruziyeti için Hava Sıvısı Arayüzü Bronşiyal Epitel Modeli

For toxicity testing of airborne particles, air-liquid interface (ALI) exposure systems have been developed for in vitro tests in order to mimic realistic ...