המחבר מודה ברברה Berli למתן נתונים לדוגמה ואת מימון נדיב של הפדרציה הקנדית חיות הבר.

1. לכידת הסתגלות <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש נטו knotless, לאסוף דגים בודדים מטנק מחזיק שלהם. מזעור ללכוד זמן, למנוע איסוף דגים רבים לא מחזיקים דגים במשך יותר מכמה שניות ברשת גורמים אלה יכולים להגדיל את הלחץ. מתח יכול להשפיע על ביצועי שחייה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מקום דגים באקווריום או העברה עם הרדמה או ישירות respirometer השחייה מנהרה (&quot;מנהרה לשחות&quot;). אם הדגים יש מרדים, או tricaine methanesulfonate (MS222) או שמן ציפורן ניתן להשתמש. ריכוזים מקובלים יהיה תלוי בגורמים רבים, כולל רגישות מינים וטמפרטורה, אבל בדרך כלל בטווח 1-10 מ&quot;ג / ליטר עבור 1,2 או הרדמה. ריכוז חומר ההרדמה צריך להשרות 3 הרדמה הבמה (כלומר לא מגיב לגירויים חיצוניים) ואת היתר ההתאוששות המהירה (כלומר שניות). בעת שימוש MS222 במים מתוקים, סודיום ביקרבונט יש להשתמש ב חלקים שווים (לפי מסה) חיץ. ללא חיץ, MS222 יהיה לצמצם במידה ניכרת pH, ו pH נמוך עלול לפגוע ברקמות הזימים. חציצה אין צורך במי ים מכיוון שהיא מכילה קיבולת חציצה מספקת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגים הרדים ניתן מינית, נמדד מסה ואורך, ולאור בדיקה חיצונית שטחית של מצבם. אורך יכול להיחשב האורך הכולל (TL), אורך מזלג (פלורידה) או אורך הגוף (BL). מדדים אלה שונים חלים בדרך כלל על פי הנוהג המקובל, מורפולוגיה מינים (למשל אין סנפיר מפוצל) או מצב דגים (סנפיר הזנב נשחקו למשל). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגים גם בהרדמה ולא מרדים צריך להיות הציג במנהרה לשחות במהירות האפשרית לתוך מים זורמים כמו זו תאפשר התאוששות. קצב זרימת מוגדרת, בדרך כלל כאלה הדגים יוכלו לנוח על הקרקעית בעוד בקושי שחייה. שיעור דוגמה סלמון sockeye הבוגרת 0.3 BL / s. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הדג צריך להיות שמאל במנהרה לשחות להסתגל. תקופת ההסתגלות ניתן להגדיר תקופות מסורתי (למשל 12 שעות), או לאלה המשמשים במחקרים העדכניים ביותר אשר יכול להיות קצר כמו 30 דקות. כדי לקבוע תקופת הסתגלות אידיאלי עבור דגים נתון, הפעם נלקח להגיע יציב, הנמוכים באופן אידיאלי, קצב חילוף החומרים יכול לשמש (מפורט בסעיף הבא). </li></ol> 2. מדידת קצב חילוף החומרים <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שינויים חמצן בתוך המנהרה לשחות יש לרשום את משך הבדיקה לשחות (ים). בדיקות חמצן יכול להיות אטום ישירות לתוך המנהרה לשחות, אולם תחילה יש לקבוע האם זרימת מים על החללית משפיעה על התפקוד של החללית. אם בדיקה מושפע מהירויות מים שעלולות להתרחש במהלך הבדיקה, החללית יהיה צורך להציב בתא משלו מחוץ למנהרה וסיפקה מים מנהרה על ידי משאבה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי לחדש את מלאי החמצן להקטין הצטברות פסולת, המנהרה לשחות סביר להניח שאתה צריך להיות סמוקות מעת לעת. רווית חמצן לא יורשו לרדת נמוך מ -70% עבור רוב מינים כמו ביצועים שחייה עשוי להיות מופחת או ייתכן שיש לעבור מטבוליזם אנאירובי. פלאשינג מים מנהרה עשוי גם לסייע להפחית עליות טמפרטורת המים, אך טמפרטורת המים צריכה להיות קבועה שנערך על ידי צימוד המנהרה לשחות ילר. שינויי הטמפרטורה ישפיעו על קצב חילוף החומרים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קצב חילוף החומרים שגרתיות ומקסימום, מקוצר &quot;RMR &#39;ו&#39; המשולש &#39;, נקבעים בדרך כלל (איור 1A). אלה שיעורי ניתן לבטא נפח (V o 2) או מסה (M o 2) של חמצן לכל יחידת מסה, ליחידת זמן, למשל O 2 מ&quot;ג / ק&quot;ג / שעה. ההבדל בין שני שיעורי שניתן לנקוט כדי להשיג את &quot;מרחב הפעילות&quot;. התרגיל הבא &quot;חוב חמצן&quot;, המכונה &quot;צריכת שלאחר האימון עודף חמצן&quot; (EPOC), יכול גם להיות נחוש שווה החמצן הנדרש במהלך לחזור שלאחר האימון כדי RMR. </li></ol><ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הערה: בדיקות חמצן רבים התפוקה שלהם באופן אוטומטי לספק טמפרטורה לתקן שינויים החמצן המומס. אלו שלא יהיה צורך לתקן. בנוסף, ערכים מסוימים יהיה צורך לתקן אם המדידות נערכו בתנאים מלוחים. </li></ol> מדידת ביצועים שחיה מגוון של יכולות וביצועים שחייה ניתן להעריך במנהרה לשחות. הדרך הנפוצה ביותר כדי לאפיין את ביצועי השחייה היא משך הזמן שעבורו זה יכול להישמר 3. את המהירות איטית, ככל שהוא יכול להישמר ולהיפך. מהירויות מכונים בדרך כלל בשם &quot;פרץ&quot;, &quot;ממושכת&quot; או &quot;מתמשכת&quot;, אשר מתאימות המשכים של שניות, דקות עד שעות (מקסימום = 200 דק &#39;), ואת שעות ומעבר (&gt; 200 דקות), בהתאמה. כדי לקבוע אלו מהירויות, דגים חשופים &quot;צעדים&quot; המוגדרים על ידי המשתמש, המורכב &quot;גובה&quot; מוגדר, כלומר זרם המים להגביר מהירות, &quot;אורך&quot;, כלומר משך הצעד. מקסום גובה ואורך צעד צעד מזעור יהיה ללכוד את המהירות פרץ הגדול, בעוד עושה את ההפך יהיה ללכוד את המהירות ממושך ביותר. בשלבבדיקות, הדרך המסורתית לדווח את המהירות המרבית מושגת שווה למהירות של השלב האחרון הושלמה במלואה בתוספת החלק הזמני של הצעד, סופי גמור (איור 1A). שחייה פרץ הערכת ביצועים <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי ללכוד שחייה פרץ או היכולת ספרינט, לאחר הסתגלות, להביא את מהירות הזרימה המקסימלית מוערך (למשל פעמיים מכה קריטית U, ראה להלן), ולהניע את הדגים לשחות. הדג צריך להיות מונח בחלקו האחורי של החדר כמו מהירות הזרימה הוא גדל במהירות. דגים ייתכן שיהיה צורך מוטיבציה לשחות. מוטיבציה יכול להיות מכני (מגע למשל) או חשמלי (למשל מטען קטן להחיל רשת הלם בחלק האחורי של המנהרה לשחות). אמנם לא במפורש מבחן היכולת פרץ, דגים ניתן גם לתת &quot;בדיקה האצה מתמדת&quot; (CAT או U ΔV) בהיקף של מספר שלבים של זמן קצר (למשל, 1 דקות) 4,5. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הקלט את משך השחייה. מספר פרץ הפרט המרחק שלהם יכול גם להיות מוקלט 6. מהירות יכול להינתן מקסימלית שהושגה או מחושב לפי המשוואה באיור 1 א. ממושכת ומתמשכת שחייה הערכת ביצועים הצעד השכיח ביותר המשמש להערכת יכולת שחייה ממושכת או מתמשך המכונה &quot;ביצועי שחייה קריטי&quot; (מכה קריטית U). אורך שלב מכה קריטית עבור U באופן מסורתי נקבע על 20 דקות, למרות זמנים קצרים יותר כמו 10 דקות יש גם בשימוש. הכלל הוא כי לפחות עשרה צעדים יש לנקוט לפני עייפות, אשר עלולה לגרום בדיקות ארוכות, למשל&gt; 3 שעות / דגים. כדי לקצר את מבחן קריטית U, הראשונית שבעה צעדים יכול להיות מקוצר ל 5 דקות (מבחן שנקרא אז &quot;הרמפה-U מכה קריטית&quot;). </li></ol><ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר הסתגלות ו / או לשחות בפועל, להגביר את מהירות הזרימה על פי גודל הצעד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי להגדיר את גובה צעד מתאים מכה קריטית U, סביר להניח שיהיה צורך להעריך מכה קריטית U למדגם של הדג להיבדק. ניתן להשיג זאת באמצעות ערכים בספרות. לחילופין, ניתן לתת דגים &quot;לשחות בפועל&quot; אחרי מבוא המנהרה. לשם כך, לתת קצר דגים, המוגדרים על ידי המשתמש שלבים, עד עייפות. השתמש המהירות הסופית הגיעה כאומדן מוקדם של מכה קריטית U. התאם את גודל הצעד (גובה ואורך) עבור כל הדגים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי לבחון את יכולת ההתאוששות או לקבוע וריאציה בודדים בביצועים, דגים ניתן לתת מבחן השחייה השני שלאחר תקופת התאוששות 7-9. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגים יכולים גם להיבחן בבתי הספר, למרות הדגים נוטים עייפות בזמנים שונים במהלך הבדיקות אשר עלולה להיות בעייתית עבור להסיר אותם מן המנהרה ולחסל את היכולת לאמוד את ספיגת החמצן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עייפות פעם, הדג צריך להיות מותר לשחזר או להסירו מיד הדגימה רקמות. מדדי ביצועים אחדים הקשורים שחייה ניתן לאסוף במהלך הבדיקות או אחרי ניתוח באמצעות וידאו (איור 1 C, D). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי למדוד את קצב תחלופת האוויר והיכו תדירות הזנב, קצב השאיבה מספר opercular של פעימות הזנב צריך להיות שנדגמו על פני תקופות של כמה שניות (איור 1B) 10,11. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי למדוד לנצח משרעת הזנב, הסטייה המרבית של סנפיר הזנב ניתן למדוד (איור 1B) 12. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעקבות בדיקה, דגים יכולים להיות מורדמים, בהתחשב בדיקה שלאחר המוות ורקמות שנאספו כדי לקבוע המטוקריט (ארז נפח תא אדום), הורמון ריכוזי מתח, אנרגיה חנויות שריר (לדוגמה, גליקוגן phosphocreatine), פעילות האנזים (למשל לקטט דהידרוגנז, esterase אצטילכולין ), או פרמטרים פיזיולוגיים אחרים. </li></ol> 3. נציג תוצאות <img src="/files/ftp_upload/2572/2572fig1.jpg" alt="איור 1" /> איור 1.) דוגמה הרמפה-U מבחן קריטית שניתן salmonid נעורים, מדגרה מורם פורל הקשת (Oncorhynchus mykiss), 6.3 ס&quot;מ אורך הגוף (BL) ו 3.5 גרם במסה. הבדיקה בוצעה L 12 שונה ברט מסוג respirometer (Loligo מערכות, דנמרק; <a href="http://www.loligosystems.com/">www.loligosystems.com</a> ). קצב חילוף החומרים שגרתיות ומקסימום חושבו מדרון (מ&quot;ג / שעה) × נפח (L) / דגים מסה (ק&quot;ג), והיו 198 ו - 961 מ&quot;ג O 2 / ק&quot;ג / שעה, בהתאמה (היקף פעילות = 4.84). שיעורים אלה עולים בקנה אחד עם אלו המדווחים על ידי ברט עבור נוער sockeye סלמון (א &#39;nerka) 13. הערה: לצורך חישובי ספיגת החמצן, נפח המים שווה נפח respirometer פחות נפח דגים. הצלב מציין את הנקודה שבה הדג סירב לשחות נוסף שבו מכה קריטית U היה מחושב. ב) להכות זנב ערכי תדר נרשמו מעל 10 זה שש פעמים: משרעת זנב ערכים לנצח נרשמו שלוש פעמים; הערכים המוצגיםהם ממוצע ± SEM. ג) להציג צד מוגדלים ד) להציג העליון של הדגים שוחים בתוך החדר לשחות. ד) מציג את הדג מסומנים על ידי EthoVision תוכנה (Noldus, הולנד; <a href="http://www.noldus.com/">www.noldus.com</a> ). קיצורים: מכה קריטית U = מהירות השחייה קריטי; U f = המהירות של השלב האחרון הושלמה במלואה, U s = מהירות צעד, t f = הזמן המושקע על השלב האחרון, זה לא זמן = צעד.

<ol>
	<li>Anderson, W. G., McKinley, R. S., Colavecchia, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+use+of+clove+oil+as+an+anesthetic+for+rainbow+trout+and+its+effects+on+swimming+performance.">The use of clove oil as an anesthetic for rainbow trout and its effects on swimming performance.</a> North Am. J. Fish Manage. 17, 301-307 (1997).</li><li>Cho, G. K., Heath, D. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+tricaine+methanesulphonate+(MS222)+and+clove+oil+anaesthesia+effects+on+the+physiology+of+juvenile+chinook+salmon+Oncorhynchus+tshawytscha+(Walbaum).">Comparison of tricaine methanesulphonate (MS222) and clove oil anaesthesia effects on the physiology of juvenile chinook salmon Oncorhynchus tshawytscha (Walbaum).</a> Aquacult. Res. 31, 537-546 (2000).</li><li>Beamish, F. W. H., Hoar, W. S., Randall, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Swimming capacity in Fish Physiology. , 101-187 (1978).</li><li>Farrell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparisons+of+swimming+performance+in+rainbow+trout+using+constant+acceleration+and+critical+swimming+speed+tests.">Comparisons of swimming performance in rainbow trout using constant acceleration and critical swimming speed tests.</a> J. Fish Biol. 72, 693-710 (2008).</li><li>Tierney, K. B., Casselman, M., Takeda, S., Farrell, A. P., Kennedy, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relationship+between+cholinesterase+inhibition+and+two+types+of+swimming+performance+in+chlorpyrifos-exposed+coho+salmon+(Oncorhynchus+kisutch).">The relationship between cholinesterase inhibition and two types of swimming performance in chlorpyrifos-exposed coho salmon (Oncorhynchus kisutch).</a> Environ. Toxicol. Chem. 26, 998-1004 (2007).</li><li>Martinez, M., Bedard, M., Dutil, J. -. D., Guderley, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Does+condition+of+Atlantic+cod+(Gadus+morhua)+have+a+greater+impact+upon+swimming+performance+at+Ucrit+or+sprint+speeds.">Does condition of Atlantic cod (Gadus morhua) have a greater impact upon swimming performance at Ucrit or sprint speeds.</a> J. Exp. Biol. 207, 2979-2990 (2004).</li><li>Marras, S., Claireaux, G., McKenzie, D. J., Nelson, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Individual+variation+and+repeatability+in+aerobic+and+anaerobic+swimming+performance+of+European+sea+bass,+Dicentrarchus+labrax.">Individual variation and repeatability in aerobic and anaerobic swimming performance of European sea bass, Dicentrarchus labrax.</a> J. Exp. Biol. 213, 26-32 (2010).</li><li>Kolok, A. S., Plaisance, E. P., Abdelghani, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Individual+variation+in+the+swimming+performance+of+fishes:+an+overlooked+source+of+variation+in+toxicity+studies.">Individual variation in the swimming performance of fishes: an overlooked source of variation in toxicity studies.</a> Environ. Toxicol. Chem. 17, 282-285 (1998).</li><li>Tierney, K. B., Farrell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+relationships+between+fish+health,+metabolic+rate,+swimming+performance+and+recovery+in+return-run+sockeye+salmon,+Oncorhynchus+nerka+(Walbaum).">The relationships between fish health, metabolic rate, swimming performance and recovery in return-run sockeye salmon, Oncorhynchus nerka (Walbaum).</a> J. Fish Dis. 27, 663-671 (2004).</li><li>Webber, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Upstream+swimming+performance+of+adult+white+sturgeon:+Effects+of+partial+baffles+and+a+ramp.">Upstream swimming performance of adult white sturgeon: Effects of partial baffles and a ramp.</a> Trans. Am. Fish. Soc. 136, 402-408 (2007).</li><li>Farrell, A. P., Gamperl, A. K., Birtwell, I. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prolonged+swimming,+recovery+and+repeat+swimming+performance+of+mature+sockeye+salmon+Oncorhynchus+nerka+exposed+to+moderate+hypoxia+and+pentachlorophenol.">Prolonged swimming, recovery and repeat swimming performance of mature sockeye salmon Oncorhynchus nerka exposed to moderate hypoxia and pentachlorophenol.</a> J. Exp. Biol. 201, 2183-2193 (1998).</li><li>Flammang, B. E., Lauder, G. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Speed-dependent+intrinsic+caudal+fin+muscle+recruitment+during+steady+swimming+in+bluegill+sunfish,+Lepomis+macrochirus.">Speed-dependent intrinsic caudal fin muscle recruitment during steady swimming in bluegill sunfish, Lepomis macrochirus.</a> J. Exp. Biol. 211, 587-598 (2008).</li><li>Brett, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+respiratory+metabolism+and+swimming+performance+of+young+sockeye.">The respiratory metabolism and swimming performance of young sockeye.</a> J. Fish. Res. Board Can. 21, 1183-1226 (1964).</li><li>Bla&#382;ka, P., Volf, M., &#268;epela, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+type+of+respirometer+for+the+determination+of+the+metabolism+of+fish+in+an+active+state.">A new type of respirometer for the determination of the metabolism of fish in an active state.</a> Physiol. Bohemoslov. 9, 553-558 (1960).</li><li>Peake, S. J., Farrell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fatigue+is+a+behavioural+response+in+respirometer+confined+smallmouth+bass.">Fatigue is a behavioural response in respirometer confined smallmouth bass.</a> J. Fish Biol. 68, 1742-1755 (2006).</li></ol>

אין ניגודי אינטרסים הכריז.

בסביבה טבעית, התנהגויות כגון בריחה טורף והגירה תלויה היכולת לשחות בעוצמות ספציפיות בזמנים שונים. בסביבה מעבדה, לשחות respirometers מנהרה ומגבירה התערב מהירות ניתן להשתמש כדי להעריך את היכולת של הדגים לבצע התנהגויות רבות. מדדים של קצב חילוף החומרים ברקמות אחרות ברמת הערכות (כגון ייצור חומצת החלב) ניתן לכלול בדיקות לשחות כדי לקבוע מנגנונים פיזיולוגיים הבסיסית מצבי שחייה שונים. מנהרה עיצוב לשחות יכול מאוד להשפיע על ביצועי שחייה. ישנם מספר סוגים של מנהרות לשחות כדי לקבוע את ביצועי שחייה, רוב מאופיינים גם ברט 13 - או 14-Blazka סוגים. עבור עיצוב או כך, השיקולים המרכזיים כוללים את &quot;שויון&quot; של זרימת המים (כמה מרובע זה), מהירות הזרימה המקסימלית ואת אורך החדר לשחות. שויון חשוב כי דגים באופן אינסטינקטיבי למצוא לשחות באזורים תזרים נמוך כדי למזער את המאמץ. תזרים גבוה שיעור הפוטנציאל עשוי להיות נחוץ כדי לבחון את היכולת לשחות פרץ או מינים שחייה מהירה (דגי טונה, לדוגמה). לשחות אורך תא יכול להיות מאוד משמעותי כפי בתאי באורך קטן, אורך דג כלומר&gt; 10% אורך קאמרית, דגים ייתכן שלא תוכל לנצל את כל המצבים שחייה. באופן ספציפי, צינורות קטנים עלולים להגביל את היכולת של הדגים המעבר יציב אל יציב בשער שחייה, כלומר שחייה פרץ ואת החוף. לכן, דגים עלול להפסיק לשחות במהירות של כ זהה ללא קשר אורך צעד מכה קריטית U יכול להיות מקביל &quot;מהירות המעבר בשער&quot; 15. כל המנהרות לשחות צריך להיות מכויל באמצעות מכשירים כגון בדיקות הדמיה תזרים או חלקיק velocimetry (PIV) ציוד. באופן אידיאלי לשחות המנהרות תהיה זרימה מרובע, אבל אם דגים נמצאים לטובת שטח, מהירות השחייה שלהם יכול להיות מותאם על בסיס הבדלים מקומיים הזרימה.

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>tricaine methanesulfonate (MS222)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td><a href="http://www.argent-labs.com">www.argent-labs.com</a></td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Clove oil</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Pharmacy or <a href="http://www.sigmaaldrich.com">www.sigmaaldrich.com</a></td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Swim tunnel respirometer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Custom made or <a href="http://www.loligosystems.com">www.loligosystems.com</a></td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Required</td>
</tr>
<tr>
<td>High speed cameras</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Numerous sources</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Video capture card</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Numerous sources</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>optional</td>
</tr>
<tr>
<td>Behaviour analysis software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td><a href="http://www.noldus.com">www.noldus.com</a> <a href="http://www.cleversysinc.com">www.cleversysinc.com</a> <a href="http://www.loligosystems.com">www.loligosystems.com</a> <a hre</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>optional</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

swimming performance assessment in fishes

בדיקות ביצועים שחיה של דגים כבר חלק בלתי נפרד מחקרים אנרגטיקה של שרירים, מכניקה שחייה, גז החליפין, לב ופיזיולוגיה, מחלות, זיהום, חוסר חמצן וטמפרטורה. מאמר זה מתאר פרוטוקול גמישה להעריך דגים שוחים הביצועים תוך שימוש בציוד שבו המהירות מים יכול להיות נשלט. פרוטוקול כרוך אחד מגדיל צעד כמה מהירות זרימת כי נועדו לגרום לעייפות דגים. מהירויות שלב ומשך שלהם ניתן להגדיר ללכוד יכולות השחייה של שייכות פיזיולוגיים ואקולוגיים שונים. רוב לעיתים קרובות גודל הצעד נקבע כדי לקבוע מהירות השחייה קריטי (U מכה קריטית), אשר נועד ללכוד שחייה המרבי יכולת מתמשכת. באופן מסורתי מבחן זה מורכב בערך עשרה צעדים כל אחד משך 20 דקות. עם זאת, צעדים של משך קצר יותר (למשל 1 דק &#39;) יותר ויותר מנוצל כדי ללכוד את יכולת האצה או שחייה ביצועים פרץ. ללא קשר לגודל צעד, בדיקות שחייה ניתן לחזור לאורך זמן כדי לאמוד וריאציה אישית ויכולת התאוששות. נקודות קצה הקשורים שחייה כגון מדדים של קצב חילוף החומרים, לשימוש סנפיר, קצב אוורור של התנהגות, כגון המרחק בין הדגים לימוד, כלולים לעתים קרובות לפני, במהלך ואחרי בדיקות שחייה. לאור המגוון של מיני דגים, מספר שאלות המחקר נחקרו, ואת החשיבות של מינים רבים באקולוגיה העולמית לבריאות כלכלית, מחקרים של ביצועים דגים שוחים יישאר פופולרי יקר בעתיד הנראה לעין.

Watch this Scientific Journal Video about Swimming Performance Assessment in Fishes at JoVE.com

Swimming Performance Assessment in Fishes

חייהם של רוב הדגים מבוססת על שחייה. פרוטוקול זה מתאר שיטות לכידת מגוון של מצבי שחייה זמין דגים בודדים לימוד, והוא כולל מדדים הקשורים לפיזיולוגיה שחייה התנהגות.

הערכת ביצועים שחייה דגים

Swimming performance tests of fish have been integral to studies of muscle energetics, swimming mechanics, gas exchange, cardiac physiology, disease, ...

swimming-performance-assessment-in-fishes

Research

JoVE Journal

Biology

25.4K Views.  University of Alberta. חייהם של רוב הדגים מבוססת על שחייה. פרוטוקול זה מתאר שיטות לכידת מגוון של מצבי שחייה זמין דגים בודדים לימוד, והוא כולל מדדים הקשורים לפיזיולוגיה שחייה התנהגות.

Video: Swimming Performance Assessment in Fishes

Respirometric Oxidative Phosphorylation Assessment in Saponin-permeabilized Cardiac Fibers

Investigation of mitochondrial function represents an important parameter of cardiac physiology as mitochondria are involved in energy metabolism, oxidative stress, apoptosis, aging, mitochondrial encephalomyopathies and drug toxicity. Given this, technologies to measure cardiac mitochondrial function are in demand. One technique that employs an integrative approach to measure mitochondrial function is respirometric oxidative phosphorylation (OXPHOS) analysis.
The principle of respirometric OXPHOS assessment is centered around measuring oxygen concentration utilizing a Clark electrode. As the permeabilized fiber bundle consumes oxygen, oxygen concentration in the closed chamber declines. Using selected substrate-inhibitor-uncoupler titration protocols, electrons are provided to specific sites of the electron transport chain, allowing evaluation of mitochondrial function. Prior to respirometric analysis of mitochondrial function, mechanical and chemical preparatory techniques are utilized to permeabilize the sarcolemma of muscle fibers. Chemical permeabilization employs saponin to selectively perforate the cell membrane while maintaining cellular architecture.
This paper thoroughly describes the steps involved in preparing saponin-skinned cardiac fibers for oxygen consumption measurements to evaluate mitochondrial OXPHOS. Additionally, troubleshooting advice as well as specific substrates, inhibitors and uncouplers that may be used to determine mitochondria function at specific sites of the electron transport chain are provided. Importantly, the described protocol may be easily applied to cardiac and skeletal tissue of various animal models and human samples.

Saponin-permeabilized fiber preparation in conjunction with respirometric oxidative phosphorylation analysis provides integrative assessment of mitochondrial function. Mitochondrial respiration in physiological and pathological states can reflect various regulatory influences including mitochondrial interactions, morphology and biochemistry.

הערכה Respirometric זרחון חמצוני ב-Saponin permeabilized סיבים לב

Investigation of mitochondrial function represents an important parameter of cardiac physiology as mitochondria are involved in energy metabolism, ...

Endurance Training Protocol and Longitudinal Performance Assays for Drosophila melanogaster

One of the most pressing problems facing modern medical researchers is the surging levels of obesity, with the consequent increase in associated disorders such as diabetes and cardiovascular disease 1-3. An important topic of research into these associated health problems involves the role of endurance exercise as a beneficial intervention.
Exercise training is an inexpensive, non-invasive intervention with several beneficial results, including reduction in excess body fat 4, increased insulin sensitivity in skeletal muscle 5, increased anti-inflammatory and antioxidative responses 6, and improved contractile capacity in cardiomyocytes 7. Low intensity exercise is known to increase mitochondrial activity and biogenesis in humans 8 and mice, with the transcriptional coactivator PGC1-&alpha; as an important intermediate 9,10. 
Despite the importance of exercise as a tool for combating several important age-related diseases, extensive longitudinal genetic studies have been impeded by the lack of an endurance training protocol for a short-lived genetic model species. The variety of genetic tools available for use with Drosophila, together with its short lifespan and inexpensive maintenance, make it an appealing model for further study of these genetic mechanisms. With this in mind we have developed a novel apparatus, known as the Power Tower, for large scale exercise-training in Drosophila melanogaster 11. The Power Tower utilizes the flies' instinctive negative geotaxis behavior to repetitively induce rapid climbing. Each time the machine lifts, then drops, the platform of flies, the flies are induced to climb. Flies continue to respond as long as the machine is in operation or until they become too fatigued to respond. Thus, the researcher can use this machine to provide simultaneous training to large numbers of age-matched and genetically identical flies. Additionally, we describe associated assays useful to track longitudinal progress of fly cohorts during training.

Endurance Training Protocol and Longitudinal Performance Assays for Drosophila melanogaster

We describe the first endurance training protocol for an important genetic model species, Drosophila melanogaster, and outline several assays to chart improvements in mobility following training.

אימון סיבולת פרוטוקול מבחני ביצועים ארוכי טווח עבור תסיסנית melanogaster

One of the most pressing problems facing modern medical researchers is the surging levels of obesity, with the consequent increase in associated disorders ...

An Improved Method for Accurate and Rapid Measurement of Flight Performance in Drosophila

Drosophila has proven to be a useful model system for analysis of behavior, including flight. The initial flight tester involved dropping flies into an oil-coated graduated cylinder; landing height provided a measure of flight performance by assessing how far flies will fall before producing enough thrust to make contact with the wall of the cylinder. Here we describe an updated version of the flight tester with four major improvements. First, we added a &#34;drop tube&#34; to ensure that all flies enter the flight cylinder at a similar velocity between trials, eliminating variability between users. Second, we replaced the oil coating with removable plastic sheets coated in Tangle-Trap, an adhesive designed to capture live insects. Third, we use a longer cylinder to enable more accurate discrimination of flight ability. Fourth we use a digital camera and imaging software to automate the scoring of flight performance. These improvements allow for the rapid, quantitative assessment of flight behavior, useful for large datasets and large-scale genetic screens.

An Improved Method for Accurate and Rapid Measurement of Flight Performance in Drosophila

Here we describe a method for rapid and accurate measurement of flight performance in Drosophila, enabling high-throughput screening.

שיטה משופרת למדידה מדויקת והמהירה של טיסה בביצועים<em&gt; דרוזופילה</em

Drosophila has proven to be a useful model system for analysis of behavior, including flight. The initial flight tester involved dropping flies into an ...

A Method for Selecting Structure-switching Aptamers Applied to a Colorimetric Gold Nanoparticle Assay

Small molecules provide rich targets for biosensing applications due to their physiological implications as biomarkers of various aspects of human health and performance. Nucleic acid aptamers have been increasingly applied as recognition elements on biosensor platforms, but selecting aptamers toward small molecule targets requires special design considerations. This work describes modification and critical steps of a method designed to select structure-switching aptamers to small molecule targets. Binding sequences from a DNA library hybridized to complementary DNA capture probes on magnetic beads are separated from nonbinders via a target-induced change in conformation. This method is advantageous because sequences binding the support matrix (beads) will not be further amplified, and it does not require immobilization of the target molecule. However, the melting temperature of the capture probe and library is kept at or slightly above RT, such that sequences that dehybridize based on thermodynamics will also be present in the supernatant solution. This effectively limits the partitioning efficiency (ability to separate target binding sequences from nonbinders), and therefore many selection rounds will be required to remove background sequences. The reported method differs from previous structure-switching aptamer selections due to implementation of negative selection steps, simplified enrichment monitoring, and extension of the length of the capture probe following selection enrichment to provide enhanced stringency. The selected structure-switching aptamers are advantageous in a gold nanoparticle assay platform that reports the presence of a target molecule by the conformational change of the aptamer. The gold nanoparticle assay was applied because it provides a simple, rapid colorimetric readout that is beneficial in a clinical or deployed environment. Design and optimization considerations are presented for the assay as proof-of-principle work in buffer to provide a foundation for further extension of the work toward small molecule biosensing in physiological fluids.

A protocol is provided to select structure-switching aptamers for small molecule targets based on a tunable stringency magnetic bead selection method. Aptamers selected with structure-switching properties are beneficial for assays that require a conformational change to signal the presence of a target, such as the described gold nanoparticle assay.

שיטה לבחירת Aptamers מיתוג מבנה יישומית לColorimetric זהב Nanoparticle Assay

Small molecules provide rich targets for biosensing applications due to their physiological implications as biomarkers of various aspects of human health ...

Design and Development of Aptamer&#8211;Gold Nanoparticle Based Colorimetric Assays for In-the-field Applications

The design and development of an aptamer&#8211;gold nanoparticle (AuNP) colorimetric assay for the detection of small molecules for in-the-field applications was examined. Target selective AuNP based color assays have been developed in controlled proof-of-concept laboratory settings. However, these schemes have not been exerted to a point of failure to determine their practical use beyond laboratory settings. This work describes a generic approach to design, develop, and troubleshoot an aptamer-AuNP colorimetric assay for small molecule analytes and using the assay for in-the-field settings. The assay is advantageous because adsorbed aptamers passivate the nanoparticle surfaces and provide a means to reduce and eliminate false positive responses to non-target analytes. Transitioning this system to practical uses required defining not only the shelf-life of the aptamer-AuNP assay, but establishing methods and procedures for extending the long-term storage capabilities. Also, one of the recognized concerns with colorimetric readout is the burden placed on analysts to accurately identify often subtle changes in color. To lessen the responsibility on analysts in the field, a color analysis protocol was designed to perform the color identification duties without the need for performing this task on laboratory grade equipment. The method for creating and testing the data analysis protocol is described. However to understand and influence the design of adsorbed aptamer assays, the interactions associated with the aptamer, target, and AuNPs require further study. The knowledge gained could lead to tailoring aptamers for improved functionality.

The design and development of an aptamer&#8211;gold nanoparticle colorimetric assay for the detection of small molecules for in-the-field applications was examined. Additionally, a smart-device colorimetric application (app) was validated and long-term storage of the assay was established for use in the field.

עיצוב ופיתוח של מבוסס Nanoparticle Aptamer-זהב מדד-צבע מבחנים עבור יישומי in-the-השדה

The design and development of an aptamer&#8211;gold nanoparticle (AuNP) colorimetric assay for the detection of small molecules for in-the-field ...

A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research

Recent studies that compared transcriptomic datasets of human diseases with datasets from mouse models using traditional gene-to-gene comparison techniques resulted in contradictory conclusions regarding the relevance of animal models for translational research. A major reason for the discrepancies between different gene expression analyses is the arbitrary filtering of differentially expressed genes. Furthermore, the comparison of single genes between different species and platforms often is limited by technical variance, leading to misinterpretation of the con/discordance between data from human and animal models. Thus, standardized approaches for systematic data analysis are needed. To overcome subjective gene filtering and ineffective gene-to-gene comparisons, we recently demonstrated that gene set enrichment analysis (GSEA) has the potential to avoid these problems. Therefore, we developed a standardized protocol for the use of GSEA to distinguish between appropriate and inappropriate animal models for translational research. This protocol is not suitable to predict how to design new model systems a-priori, as it requires existing experimental omics data. However, the protocol describes how to interpret existing data in a standardized manner in order to select the most suitable animal model, thus avoiding unnecessary animal experiments and misleading translational studies.

We provide a standardized protocol for the use of gene set enrichment analysis of transcriptomic data to identify an ideal mouse model for translational research. 
This protocol can be used with DNA microarray and RNA sequencing data and can further be extended to other omics data if data are available.

פרוטוקול להצפנה באמצעות גנים להגדיר העשרה ניתוח כדי לזהות את המודל החייתי המתאים עבור המחקר Translational

Recent studies that compared transcriptomic datasets of human diseases with datasets from mouse models using traditional gene-to-gene comparison ...

Simple and Effective Administration and Visualization of Microparticles in the Circulatory System of Small Fishes Using Kidney Injection

The systemic administration of micro-size particles into a living organism can be applied for vasculature visualization, drug and vaccine delivery, implantation of transgenic cells and tiny optical sensors. However, intravenous microinjections into small animals, which are mostly used in biological and veterinary laboratories, are very difficult and require trained personnel. Herein, we demonstrate a robust and efficient method for the introduction of microparticles into the circulatory system of adult zebrafish (Danio rerio) by injection into the fish kidney. To visualize the introduced microparticles in the vasculature, we propose a simple intravital imaging technique in fish gills. In vivo monitoring of the zebrafish blood pH was accomplished using an injected microencapsulated fluorescent probe, SNARF-1, to demonstrate one of the possible applications of the described technique. This article provides a detailed description of the encapsulation of pH-sensitive dye and demonstrates the principles of the quick injection and visualization of the obtained microcapsules for in vivo recording of the fluorescent signal. The proposed method of injection is characterized by a low mortality rate (0-20%) and high efficiency (70-90% success), and it is easy to institute using commonly available equipment. All described procedures can be performed on other small fish species, such as guppies and medaka.

This article demonstrates the principles of a quick, minimally invasive injection of fluorescent microparticles into the circulatory system of small fishes and the in vivo visualization of the microparticles in fish blood.

ניהול פשוטה ויעילה והדמיה של Microparticles במערכת הדם של דגים קטנים באמצעות הזרקת כליות

The systemic administration of micro-size particles into a living organism can be applied for vasculature visualization, drug and vaccine delivery, ...

Medium-throughput Screening Assays for Assessment of Effects on Ca2+-Signaling and Acrosome Reaction in Human Sperm

Ca2+-signaling is essential to normal sperm cell function and male fertility. Similarly, the acrosome reaction is vital for the ability of a human sperm cell to penetrate the zona pellucida and fertilize the egg. It is therefore of great interest to test compounds (e.g., environmental chemicals or drug candidates) for their effect on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm either to examine the potential adverse effects on human sperm cell function or to investigate a possible role as a contraceptive. Here, two medium-throughput assays are described: 1) a fluorescence-based assay for assessment of effects on Ca2+-signaling in human sperm, and 2) an image cytometric assay for assessment of acrosome reaction in human sperm. These assays can be used to screen a large number of compounds for effects on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm. Furthermore, the assays can be used to generate highly specific dose-response curves of individual compounds, determine potential additivity/synergism for two or more compounds, and to study the pharmacological mode of action through competitive inhibition experiments with CatSper inhibitors.

Medium-throughput Screening Assays for Assessment of Effects on Ca2+-Signaling and Acrosome Reaction in Human Sperm

Here, two medium-throughput assays for assessment of effects on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm are described. These assays can be used to quickly and easily screen large amounts of compounds for effects on Ca2+-signaling and acrosome reaction in human sperm.

הקרנת מבחני עבור הערכה של השפעות על Ca2 +תפוקה בינונית-איתות ותגובה Acrosome זרע אנושי

Ca2+-signaling is essential to normal sperm cell function and male fertility. Similarly, the acrosome reaction is vital for the ability of a human sperm ...

Silencing the Spark: CRISPR/Cas9 Genome Editing in Weakly Electric Fish

Electroreception and electrogenesis have changed in the evolutionary history of vertebrates. There is a striking degree of convergence in these independently derived phenotypes, which share a common genetic architecture. This is perhaps best exemplified by the numerous convergent features of gymnotiforms and mormyrids, two species-rich teleost clades that produce and detect weak electric fields and are called weakly electric fish. In the 50 years since the discovery that weakly electric fish use electricity to sense their surroundings and communicate, a growing community of scientists has gained tremendous insights into evolution of development, systems and circuits neuroscience, cellular physiology, ecology, evolutionary biology, and behavior. More recently, there has been a proliferation of genomic resources for electric fish. Use of these resources has already facilitated important insights with regards to the connection between genotype and phenotype in these species. A major obstacle to integrating genomics data with phenotypic data of weakly electric fish is a present lack of functional genomics tools. We report here a full protocol for performing CRISPR/Cas9 mutagenesis that utilizes endogenous DNA repair mechanisms in weakly electric fish. We demonstrate that this protocol is equally effective in both the mormyrid species Brienomyrus brachyistius and the gymnotiform Brachyhypopomus gauderio by using CRISPR/Cas9 to target indels and point mutations in the first exon of the sodium channel gene scn4aa. Using this protocol, embryos from both species were obtained and genotyped to confirm that the predicted mutations in the first exon of the sodium channel scn4aa were present. The knock-out success phenotype was confirmed with recordings showing reduced electric organ discharge amplitudes when compared to uninjected size-matched controls.

Here, a protocol is presented to produce and rear CRISPR/Cas9 genome knockout electric fish. Outlined in detail are the required molecular biology, breeding, and husbandry requirements for both a gymnotiform and a mormyrid, and injection techniques to produce Cas9-induced indel F0 larvae.

השתקה הניצוץ: CRISPR/Cas9 הגנום עריכה בדגים חשמליים חלש

Electroreception and electrogenesis have changed in the evolutionary history of vertebrates. There is a striking degree of convergence in these ...

An Air-liquid Interface Bronchial Epithelial Model for Realistic, Repeated Inhalation Exposure to Airborne Particles for Toxicity Testing

For toxicity testing of airborne particles, air-liquid interface (ALI) exposure systems have been developed for in vitro tests in order to mimic realistic exposure conditions. This puts specific demands on the cell culture models. Many cell types are negatively affected by exposure to air (e.g., drying out) and only remain viable for a few days. This limits the exposure conditions that can be used in these models: usually relatively high concentrations are applied as a cloud (i.e., droplets containing particles, which settle down rapidly) within a short period of time. Such experimental conditions do not reflect realistic long-term exposure to low concentrations of particles. To overcome these limitations the use of a human bronchial epithelial cell line, Calu-3 was investigated. These cells can be cultured at ALI conditions for several weeks while retaining a healthy morphology and a stable monolayer with tight junctions. In addition, this bronchial model is suitable for testing the effects of repeated exposures to low, realistic concentrations of airborne particles using an ALI exposure system. This system uses a continuous airflow in contrast to other ALI exposure systems that use a single nebulization producing a cloud. Therefore, the continuous flow system is suitable for repeated and prolonged exposure to airborne particles while continuously monitoring the particle characteristics, exposure concentration, and delivered dose. Taken together, this bronchial model, in combination with the continuous flow exposure system, is able to mimic realistic, repeated inhalation exposure conditions that can be used for toxicity testing.

Described is the cell culture and exposure method of an in vitro bronchial model for realistic, repeated inhalation exposure to particles for toxicity testing.

מודל אפיתל ממשק נוזלי אוויר לחשיפה מציאותית וחוזרת ונשנית לחלקיקים מוטסים לבדיקות רעילות

For toxicity testing of airborne particles, air-liquid interface (ALI) exposure systems have been developed for in vitro tests in order to mimic realistic ...