We would like to thank the Texas Pierce&#8217;s Disease Research and Education Program and USDA-APHIS for their funding support for this project. We would also like to thank Hema Kothari at the University of Texas Health Science Center at Tyler for her assistance with confocal microscopy.

1. Hücre Kültürü Not: USDA Agricultural Research Service (ft. Pierce, FL ABD) Dr Wayne Hunter laboratuvar tarafından Homalodisca vitripennis hücre çizgileri, ilk ve fibroblast hücre mono tabakaları içeren karışık aşamadan oluşan bir laboratuar stok başlatmak için kullanılmıştır. <ol><li> 25 cm2, kültür şişelerinden ile 20-24 ° C&#39;lik bir sıcaklık aralığında muhafaza steril bir laboratuar ortamında, aşağıdaki işlemleri gerçekleştirmek. </li><li> Yetiştirmek ve H2G + yaprak piresi ortamı, bir tadil edilmiş WH2 bal ortam 10 (Tablo 1) ile 25 cm2 doku kültürü şişeleri içinde kültürleri korumak. </li><li> 53 nem oranı% ~ 24 ° C &#39;de kültür şişeleri inkübe edin. </li><li> , Herhangi bir anormal hücre büyümesi kontrol, örneğin kültür büyümesini izlemek, herhangi bir potansiyel kirletici için monitör ve kültürleriyle arasında büyüme ilerlemeyi kontrol etmek için toplam büyütme 100X (TM) bir ters mikroskop kullanınTure yüzey. </li><li> Kültür yüzeyini bozmadan 10 gün - her 7 tam orta değişikliği (şişesi ortalama ~ 4 ml kültür ortamı) gerçekleştirin. </li><li> Kültür yüzey hücreleri ayırmak etilendiamintetraasetik asit (EDTA) ihtiva eden,% 0.25 tripsin kullanılarak hücre büyümesi (konfluent) kapsamındaki yaklaşık% 80 olduğu zaman kültür geçirin. Her kültür şişesine tripsin 3 ml ve kısa bir süre için enzime kültür (ler) maruz - ~ 2 Ekle - tam hücre ayrışmasını sağlamak için (5 10 dk). </li><li> Enzim aktivitesini durdurmak için santrifüj ve konik tüp bütün çözüm aktarmak için - kültür şişesine (lar) (3 mi ~ 2) taze ortamın eşit miktarda ekleyin. </li><li> 350 x g hızında 6 dakika boyunca 4 ° C&#39;de santrifüj ile pelet hücreleri. </li><li> Hücre topaklarını bozmadan Süpernatantı ve her bir tüpe ~ taze ortam 8 ml ekleyin. Yavaşça bir pipet kullanarak hücreleri homojenize. </li><li> 1 Split kültürler: 2 oranı için 25 cm 2 şişeler (~ hücre soluti 4 mlkap başına üzerinde) ve ayrılmak taze kültür geçirilen süspansiyon halindeki hücreler şişenin yüzeyine sağlam bir şekilde tutunmasını sağlayacak, 48 saat boyunca rahatsız. Not: 1 cm2 &#39;lik bir büyüme yüzeyi ile 48-çukurlu steril doku kültürü plakaları içindeki hücrelerin yetiştirilmesi mümkündür ve ~ 250 ul kültür ortamı hacimde bir azalma ile birlikte kültür şişelerinde aynı şekilde elde edilebilir. </li></ol> 2. Tüm virüs Ekstraksiyon <ol><li> Virüs pozitif H. tüm organları homojenize ~ 10 saniye aralıklarla girdap% 0.02 sodyum dietilditiyokarbamat trihidrat (DETCA) ile fosfat tamponu içinde vitripennis, pH-7.2, mevcut bir dokusunun daha büyük topaklar kalmayana kadar. 4 ° C de 4 saat ya da 4 ° C &#39;de 16 saat süre ile 22.000 x g boyunca 124.500 x g&#39;de santrifüj ile SuperSpeed ​​virüs ekstrakte edin. Üstünde bir çökelti ortaya çıkarsa, steril pamuklu çubuk 11 ile çıkarın. </li><li> Süpernatant atın. </li><li> Pelet toplayın ve% 0.4 Na-deoksikolik asit ve% 4 polietilen glikol heksadesil eter (Brij 52) ihtiva eden, 5 mi 10 mM fosfat tampon maddesi (yok DETCA), pH değeri, 7.2 ile çözülür. <ol><li> De pelet karıştırmak için, tüpün yanından pelet kaldırmak ve gerekirse çözelti içinde kadar ezmek. </li><li> Topak gerekirse çözelti haline ve 2 tüpler 11 birleştirmek yardımcı olmak için ~ 5 mi artışlarla daha 10 mM fosfat tamponu ilave edin. </li></ol></li><li> 15 dakika için 11 300 x g&#39;de çözümü santrifüj. </li><li> Süpernatantı ve bir 0.45 um filtre içinden çözeltisinin, ve büyük bir toplama tüpü 11 Süzüntüyü toplamak. </li><li> Bir moleküler ağırlığa sahip bir diyaliz zarı transfer süzülen madde 10 mM&#39;lik 11 gerekirse herhangi bir DETCA ihtiva eden fosfat tamponu (pH 7), küçük miktarları kullanılarak, 3.5 kD (MWCO) kesilir. </li><li> 4 ° C&#39;de GKD 2 O dolu olan büyük bir beher içinde diyaliz membranı yerleştirin. GKD 2 O her saat f değiştirinveya 5-6 saat sonra, zar 11, beyaz bir çökelti oluşana kadar. </li><li> Zarı içinde saflaştırılmış virüsü toplamak ve GKD 2 O 90 ul solüsyon 10 ul ekleyerek 10-kat seyreltme serisi için% 100 virüs çözeltinin çok 100.000: Daha sonra 1 bir seyreltme ulaşana kadar GKD 2 O başka bir 90 ul seyreltme 10 ul ekleyin. </li><li> -80 ° C&#39;de saklayın virüs çözümü. </li></ol> 3. Viral kopyalama <ol><li> Hücre büyümesi (hücreler ortalama bir oranda artmaktadır, yaklaşık olarak 72 saat post-geçiş)% 80 birleşmeye kadar 48 oyuklu kültür plakaları içinde tohum hücreleri ve tüm satırları büyür. </li><li> Hücre büyümesi konfluansa ulaştığında, seri halinde seyreltilmiş virüs, hücrelerin her satır inoküle, yani, 1:10 seyreltme, bir satır, bir 1 bir sıra: en üst sırasının dışında 100 seyreltme, vb. Bir kontrol olarak üst satırı kullanın ve ses kontrolü olarak her kuyuya GKD 2 O 10 ul ekleyin. <ol><li> Önce virüs kültürlerde herhangi bir kuyu İlk aşıdan her satırın ilk kuyu, deneysel hücre sayımları ile karşılaştırma için bir başlangıç ​​bazal hücre konsantrasyonunu kurmak ayırmak ve saymak için. </li></ol></li><li> Kültür plakaları, pH değişikliği gösteren bir ortam içinde herhangi bir renk değişikliği ve hücre morfolojisinde herhangi bir değişiklik için virüs aşılanmasından sonra her 24 saat izleyin. </li><li> 100X TM bir ters mikroskop kullanılarak her bir zaman noktasında test plakası, görüntü bir sütun. </li><li> Her bir 24 saatlik zaman noktasında görüntülenmiştir kolondan tüm Ortamı çıkarın ve -80 ° C de, viral RNA çıkartması ve miktar tayini ya da uzun bir dönem için -20 ° C &#39;de kısa süreli saklayın. </li><li> Hücre Pelle yeniden suspande edilmesi için enzim aktivitesi ve taze ortam ~ 250 ul durdurma% 0.25 tripsin EDTA ve taze ortam arasında sadece yaklaşık 250 ul kullanılarak 1.9 - 1.6 aşamalarında daha önce tarif edildiği gibi orta çıkardıktan sonra kuyulardan hücreleri ayırmakt. </li><li> Bir hafta boyunca her 24 saatlik bir süre boyunca hücre ayrılma sonra hücre sayıları gerçekleştirmek için hücreleri ihtiva eden her tüpe% 0.4 tripan mavi boyası, 10 ul ekle. Leke hücre sayımları yapmadan önce 10 dakika dinlendirin. <ol><li> Leke hem de cansız hücreler alımı başlar leke maruz bırakılarak ya da yaşayan hücrelerin, 1 saat içinde hücre sayar. </li></ol></li><li> Yavaş yavaş bir mikropipet kullanılarak standart bir hemasitometre her iki tarafına da lekeli hücre çözeltisinin 10 ul ekle. Veren çözelti, hava kabarcıklarını önlemek için kılcal hareketi ile yukarı alınır. </li><li> Hemasitometre her iki tarafına uygulanabilir (non-lekeli) hücrelerin sayısını (hemositometrede 16 kareler 4 sayımları eşdeğer) sayılır. Çıkarıldı kolonun her bir oyuk için hücre sayar. </li><li> Her kolondan hücre sayıları ortalama ve toplam hücre sayısı numarasını edinmek için aşağıdaki formülü kullanın: x seyreltme faktörü (hücre / 4 ortalama sayısı) = hücrelerin x 10 sayısını <sup&gt; 4 mi. Bu, kültürdeki hücre yoğunluğu ya da yaşayan hücrelerin sayısıdır. </li></ol> Hücre Kültürü 4. Virüs Ekstraksiyon <ol><li> Tedavi H. Kaldır Enzim aktivitesini durdurmak için% 0.25 tripsin EDTA ve taze ortam arasında sadece yaklaşık 250 ul kullanılarak 1.8 - Kültür şişelerinden alınan hücreler, vitripennis aşamalarında daha önce tarif edildiği gibi 1.6. </li><li> Süpernatant atın. </li><li> 2.8 - 2.3 &#39;te, daha önce adımda tanımlanan protokol ile kültür hücrelerinden ekstrakte virüs. </li></ol> 5. RNA Ekstraksiyon <ol><li> Üreticinin protokolüne göre, sıvı örnekleri için tasarlanmış bir guanidinyum tiyosiyanat-fenol-kloroform ekstraksiyonu kullanılarak, her bir haftalık deneme sırasında toplanan virüs ortamı örnekleri RNA çıkarmak. </li><li> -80 ° C&#39;de saklayın numuneleri ekstre edilmiştir. </li></ol> 6. RT-PCR <ol><li> Kullanarak geleneksel PCR çalıştırarak RT-PCR için viral standartlar oluşturulmasıprimer çifti HoCV RT-PCR primeri 1 (ileri 5&#39;-GCTCCCCGGCTTTGCTGGTT-3 &#39;-ACGACGGATCTGCGTGCCAA 5&#39;-3, ters&#39;) virüsü ile tüm vücut H. izole vitripennis. </li><li> Konu PCR ürünü,% 0.1 etidyum bromid içeren bir% 2 agaroz jeli içinde, 120 V, 60 dakika boyunca jel elektroforezi için. </li><li> Jelden bantları pulu ve imalatçının protokolüne göre, bir jel ekstre etme kiti kullanılarak saflaştırılması. </li><li> Havuz tüm kesilmiş ve jel ile saflaştırılmıştır ve ürün ayrıca temel etanol presipitasyonu ile saflaştırılması. Genel örnek konsantrasyonunu arttırmak Tris EDTA (TE) içinde yaklaşık 30 ul çökeltme ürünü elute edin. </li><li> Nükleik asit saptama için 260/230 dalga boyu ayarlarını kullanarak spektrofotometre ile toplanmış örneklerin cDNA seviyesini ölçmek. </li><li> 57 ng arasında değişen saflaştırılmış örnekteki bir on-kat daha seri seyreltme serileri sonuçları / 57 ug / ul (10 -18) ul. Benzer seri seyreltme i Me tarif edilen gerçekleştirmen konsantrasyon gereksinimleri farkı için yapılan ayarlamalar 2.8. </li><li> Düşük yoğunluklu transkriptlerin güvenilir bir ölçümü QRT-PCR kiti kullanılarak QRT-PCR gerçekleştirilerek seyreltme serisinin tespiti sınırlarını belirler. NOT: 5 x 10 -3 kopya daha Viral konsantrasyonları daha düşük tespit değildir. </li><li> Adım 5.1 &#39;de daha önce tarif edildiği gibi deneysel numunelerin RNA ekstrakte ve spektrofotometrisi kullanılarak miktarı belirlenir. </li><li> Nükleaz ücretsiz su kullanarak ul / 5 ng tüm ayıklanır örnekleri normalleştirmek. </li><li> Aşağıdaki gibi 25 ul reaksiyonu, düşük kopya sayısını algılamak için yeteneğine sahip tek aşamalı bir QRT-PCR kiti kullanılarak olarak, iki kopya halinde, tüm numunelerde QRT-PCR uygulaması: 50 ° C&#39;de 10 dakika boyunca tutun; 5 dakika boyunca 95 ° C&#39;de tutma; 10 saniye, 30 saniye için 60 ° C 95 ° C 30 döngü; Her adımda 5 saniye 99 ° C - 50 eritebilir. <ol><li> Her bir reaksiyon karışımı, 1 x ustalar 12.5 ul içerir, böylece ana karışımı yapmakR karışımı, ileri primerin 1.0 ul (0.3 uM), ters primer, 1.0 ul (0.3 uM), ters transkriptaz ve standardizasyon değerlerine göre şablon değişken miktarlarda 0.25 ul. </li><li> RNazsız su ile 25 ul toplam reaksiyon hacmi. </li><li> Her bir PCR&#39;nin beş standart konsantrasyonlar, aşağıdaki kopya numaralarıyla birlikte çalışmasını da kapsaması: 5 x 10 -10, 5 cm x 10 -8, 5 x 5 x 10 -4 -6 10, ve 5 x 10 -2 kopyalar. Her çalışma başında erken alımı sırasında gürültüyü azaltmak için, sadece 10x -2.5 bir floresan altına her çalıştırmak için eşik ayarlayın. </li></ol></li></ol> 7. Konfokal Mikroskopi <ol><li> Her iyi çapı 18 mm boyutlarındaki on iki iyi plaka içeren cam lamelleri içinde Homalodisca vitripennis hücreleri büyümek. </li><li> Bir tek-tabakalı elde edildiği zaman, dört günlük bir süre boyunca levha üzerinde her 24 saatte bir sütun inoküle. Her c emin olunolumn iyi bir denetimi içeren, düşük viral seyreltme (1:10) iyi ve yüksek viral seyreltme (1: 100,000) iyi. Adım 2.8 elde virüs çözümleri kullanın. </li><li> Beşinci gününde tüm ortamları çıkarın ve iki kez 1x PBS (pH 7.4) ile hücreleri yıkayın. </li><li> 30 dakika boyunca 4 ° C&#39;de soğuk% 4 paraformaldehit ile hücreleri saptamak. </li><li> 1x Fosfat 500 ul hücrelere serum fizyolojik (PBS) ilave edilmeden önce ilave edin ve düşük hızda bir sallama düzeneği üzerinde oda sıcaklığında 10 dakika boyunca yıkayın. Hücreleri üç kez yıkayın. </li><li> Bunları permeabilize hücrelerin% 0.1 Triton X-100 500 ul ilave edin. Oda sıcaklığında 10 dakika bekletin. </li><li> Hücreler tekrar yıkama, daha önce tarif edildiği aşama 7.5. </li><li> Oda sıcaklığında hücrelere engellemek için,% 5 sığır serumu albümini (BSA) çözeltisi 500 ul ilave edin. 2 saat boyunca oturup sonra çıkaralım. </li><li> 1x PBS% 5 BSA içeren 250 ve F-aktin leke iyi her seyreltme 250 ul ekleyin: stok Rodamin kırmızı-konjuge Phalloidin (BİP) 1 seyreltin. </li><li> Alüminyum f Kapak plakasıYağ ağartmadan boya önlenmesi ve 4 ° de CO / N inkübe hücreleri. </li><li> 12 saat inkübasyondan sonra, RCP çıkarın ve hücrelerin çekirdekleri leke,% 5 BSA içeren PBS içinde 1x seyreltilmiş 6-diamidino-2-fenilindol 4 250 ul &#39;(DAPI) (250 ug / ml) ile değiştirin . </li><li> 1 saat boyunca oda sıcaklığında DAPI içeren hücreleri inkübe edin. </li><li> Aşamasında önceden tarif edildiği gibi 7,5 1x PBS hücreleri üç kez yıkayın. </li><li> Yavaşça kuyulardan lamelleri çıkarın ve bir anti-solmaya reaktif ile bir montaj medyayı kullanarak slaytlar mikroskop monte. </li><li> Konfokal mikroskop altında inceledi kadar slaytlar kutulara lightproof kurumasını bekleyin. Boyalar hızla solmaya gibi gör kısa sürede hazırlanan slaytlar. </li><li> 63X (yağ) Plan-apochromate lens içeren bir mikroskop ile donatılmış bir konfokal sistemi kullanılarak görüntü lekeli hücreler. <ol><li> 543 ± 10 nm uyarma ve Rhoadmine kırmızı-conjucated Phalloidin için 575 ± 10 nm emisyona lazer dalga boylarını ayarlamaDAPI&#39;nin için, ve 369 ± 10 nm uyarma ve 450 ± 30 nm emisyon. </li><li> Tüm görüntüler elde etmek için dedektör için aynı kazanç ve off-set ayarlarını kullanın. </li><li> Görüntü işleme için uygun bir yazılım kullanarak bir görüntü yönetme yazılımı içine sıralama ve ithalat istenen görüntüleri Süreci görüntüler. </li></ol></li></ol>

<ol>
	<li>Takiya, D. M., McKamey, S. H., Cavichioli, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Validity+of+Homalodisca+and+of+H.+vitripennis+as+the+Name+for+Glassy-winged+Sharpshooter+(Hemiptera:+Cicadellidae:+Cicadellinae).">Validity of Homalodisca and of H. vitripennis as the Name for Glassy-winged Sharpshooter (Hemiptera: Cicadellidae: Cicadellinae).</a> Ann. Entomol. Soc. Am. 99 (4), 648-655 (2006).</li><li>Hunter, W. B., Katsar, C. S., Chaparro, J. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+analysis+of+capsid+protein+of+Homalodisca+coagulata+Virus-1,+a+new+leafhopper-infecting+virus+from+the+glassy-winged+sharpshooter,+Homalodisca+coagulata.">Molecular analysis of capsid protein of Homalodisca coagulata Virus-1, a new leafhopper-infecting virus from the glassy-winged sharpshooter, Homalodisca coagulata.</a> J. Insect Sci. 6 (28), 1-10 (2006).</li><li>Hunnicutt, L. E., Hunter, W. B., Cave, R. D., Powell, C. A., Mozoruk, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genome+sequence+and+molecular+characterization+of+Homalodisca+coagulata+virus-1,+a+novel+virus+discovered+in+the+glassy-winged+sharpshooter+(Hemiptera:+Cicadellidae).">Genome sequence and molecular characterization of Homalodisca coagulata virus-1, a novel virus discovered in the glassy-winged sharpshooter (Hemiptera: Cicadellidae).</a> Virology. 350 (1), 67-78 (2006).</li><li>Hunnicutt, L. E., Mozoruk, J., Hunter, W. B., Crosslin, J. M., Cave, R. D., Powell, C. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prevalence+and+natural+host+range+of+Homalodisca+coagulata+virus-1+(HoCV-1).">Prevalence and natural host range of Homalodisca coagulata virus-1 (HoCV-1).</a> Virology. 153, 61-67 (2008).</li><li>Jones, W. A., Setamou, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biology+and+Biometry+of+Sharpshooter+Homalodisca+coagulata+(Homoptera)+Cicadellidae)+Reared+on+Cowpea.">Biology and Biometry of Sharpshooter Homalodisca coagulata (Homoptera) Cicadellidae) Reared on Cowpea.</a> Ann. Entomol. Soc. Am. 98 (3), 322-328 (2005).</li><li>Turner, W. F., Pollard, H. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Life+histories+and+behavior+of+five+insect+vectors+of+phony+peach+disease.">Life histories and behavior of five insect vectors of phony peach disease.</a> US Dep. Agric. Tech. Bull. 1188, 1-32 (1959).</li><li>Brodbeck, B. V., Andersen, P. C., Mizell, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Utilization+of+primary+nutrients+by+the+polyphagous+xylophage,+Homalodisca+coagulata,+reared+on+single+host+species.">Utilization of primary nutrients by the polyphagous xylophage, Homalodisca coagulata, reared on single host species.</a> Arch. Insect Biochem. Physiol. 32, 65-83 (1996).</li><li>Brodbeck, B. V., Andersen, P. C., Mizell, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+total+dietary+nitrogen+and+nitrogen+form+on+the+development+of+xylophagous+leafhoppers.">Effects of total dietary nitrogen and nitrogen form on the development of xylophagous leafhoppers.</a> Arch. Insect Biochem. Physiol. 42, 37-50 (1999).</li><li>Kamita, S. G., Do, Z. N., Samra, A. I., Halger, J. R., Hammock, B. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+Cell+Lines+Developed+from+the+Glassy-winged+Sharpshooter,+Homalodisca+coagulata+(Hemiptera:+Cicadellidae).">Characterization of Cell Lines Developed from the Glassy-winged Sharpshooter, Homalodisca coagulata (Hemiptera: Cicadellidae).</a> In vitro Cell Dev.-An. 41, 149-153 (2005).</li><li>Hunter, W. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Medium+for+development+of+bee+cell+cultures+(Apis+mellifera:+Hymenoptera:+Apidae).">Medium for development of bee cell cultures (Apis mellifera: Hymenoptera: Apidae).</a> In vitro Cell Dev.-An. 46 (2), 83-86 (2010).</li><li>Bextine, B., Hunter, W., Marshall, P., Hail, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+and+whole+extraction+of+Homalodisca+coagulata-virus01.+(HoCV-01)+from+Texas+glassy-winged+sharpshooter+populations.">Identification and whole extraction of Homalodisca coagulata-virus01. (HoCV-01) from Texas glassy-winged sharpshooter populations.</a> , 9-12 (2009).</li><li>Rhoades, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Economics+of+baculovirus+&#8211;+insect+cell+production.">Economics of baculovirus &#8211; insect cell production.</a> Cytotechnology. 20, 291-297 (1996).</li><li>Briske-Anderson, M. J., Finley, J. W., Newman, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+influence+of+culture+time+and+passage+number+on+the+morphological+and+physiological+development+of+Caco-2+cells.">The influence of culture time and passage number on the morphological and physiological development of Caco-2 cells.</a> P. Soc. Exp. Biol. Med. 214 (3), 248-257 (1997).</li><li>Chin, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deficiency+Rescues+the+Adverse+Effects+of+Telomere+Loss+and+Cooperates+with+Telomere+Dysfunction+to+Accelerate+Carcinogenesis.">Deficiency Rescues the Adverse Effects of Telomere Loss and Cooperates with Telomere Dysfunction to Accelerate Carcinogenesis.</a> Cell. 97 (4), 527-538 (1999).</li><li>Counter, C. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Telomere+shortening+associated+with+chromosome+instability+is+arrested+in+immortal+cells+which+express+telomerase+activity.">Telomere shortening associated with chromosome instability is arrested in immortal cells which express telomerase activity.</a> Embo. J. 11, 1921-1929 (1992).</li><li>Hayflick, L., Moorhead, P. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+serial+cultivation+of+human+diploid+cell+strains.">The serial cultivation of human diploid cell strains.</a> Exp. Cell. Res. 25, 585-621 (1961).</li><li>Goetz, I. E., Moklebust, R., Warren, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+some+antibiotics+on+the+growth+of+human+diploid+skin+fibroblasts+in+cell+culture.">Effects of some antibiotics on the growth of human diploid skin fibroblasts in cell culture.</a> In Vitro. 15 (2), 114-119 (1979).</li><li>Coriell, L. L., Fogh, J. .. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+of+prevention+of+bacterial,+fungal,+and+other+contaminations.">Methods of prevention of bacterial, fungal, and other contaminations.</a> Contamination in Tissue Culture. , 29-49 (1973).</li><li>Hambor, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bioreactor+Design+and+Bioprocess+Controls+for+Industrialized+Cell+Processing.">Bioreactor Design and Bioprocess Controls for Industrialized Cell Processing.</a> Bioprocess Tech. Bull. 10 (6), 22-33 (2012).</li><li>Abbot, A., Cyranoski, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biology&#8217;s+new+dimension.">Biology&#8217;s new dimension.</a> Nature. 424, 870-872 (2003).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

Istilacı tarımsal türlerin akını ilişkin artan endişeler gelişmekte olan zararlılara ve patojenlere karşı savunmak için yeni metodolojiler için artan bir talep yol var. Hastalık önleme ve yönetim odağı patojen vektörler yönetimini içerir ve bu çalışmanın birincil hedefi oldu. Ekonomi pratik uygulama büyük alanlar üzerinde ancak düşük bir maliyetle 12 de büyük miktarlarda olması gerekiyor, çünkü tarımda karantinası yönetmek için biyolojik zararlı öldürücünün bu t?...

Camsı kanatlı keskin nişancı (Homalodisca vitripennis Germar 1821), Kuzey Amerika&#39;da 1, Xylella fastidiosa (X fastidiosa) baskın bir vektör olarak asma (PD) Pierce hastalığının nedensel ajanı tespit edilmiştir. Böcek nüfus yönetim hızla Kaliforniya ve güney Amerika Birleşik Devletleri genelinde bağcılık sektöründe bu yıkıcı sorunla mücadele için araştırma odağı haline gelmiştir. Familyasına ait olan bir pozitif sens, tek iplikçikli bir RNA virüsü Dicistroviridae, Homalodisca coagulata virüs 01 (HoCV-01), vahşi H. saptanmıştır vitripennis popülasyonları ve böcek için böceğin direncini düşürürken, bu toplumlarda 2-4 ölümleri arttırdığı gösterilmiştir. Yöntemlerin geliştirilmesi etkili arka H. enfekte etmek Bir laboratuar ortamında yetişkinliğe vitripennis çünkü zor olmuştur <em&gt; H. vitripennis ana bitkilerin 5-8 çeşitli gerektiren farklı sahne özgü beslenme ihtiyaçları var. Belirli tesisleri arka canlı H. gerekmektedir Amerika Birleşik Devletleri vitripennis; Bu nedenle hücre kültürü daha ekonomik ve etkili bir alternatif, hem de HoCV-01 tespiti ve çoğaltılması 2,9 giderek önem taşımaktadır. H. hücre kültürlerinin kurulması için temel yöntem ise vitripennis, virüsler 2 gibi, bu yöntemler, yine biyolojik kontrol maddelerinin ticari üretimi için normal olarak kullanılmamış olan, tarif edilmektedir. Aşağıdaki prosedürler genel amacı, biyolojik kontrol maddesi olarak kullanım için müsait HoCV-01 gibi yüksek bir konsantrasyonunun üretmektir. Viral replikasyon neden başarılı H. yetiştirilmesi ve optimize bir canlı hücre gerektirir vitripennis kültürler virüs karlı seviyelerini üretme ilerleme için hayati önem taşımaktadır.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="595">
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:93px;">Company</td>
			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:167px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Corning&#160;cell culture flasks</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>CLS430168</td>
			<td>Surface area 25&#160;cm2, canted neck, cap (plug seal)</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Olympus DP30BW, IX2-SP, IX71</td>
			<td style="width:93px;">Olympus</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>Inverted microscope and camera</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Trypsin-EDTA solution</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>T4049</td>
			<td>0.25%, sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture, 2.5 g porcine trypsin and 0.2&#160;g EDTA &#8226; 4Na per liter of Hanks&#8242; Balanced Salt Solution with phenol red</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Greiner CELLSTAR&#160;multiwell culture plates</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>M8937</td>
			<td>48 wells (TC treated with lid)</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">DETCA&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>228680</td>
			<td style="width:167px;">Sodium diethyldithiocarbamate trihydrate</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Corning&#160;bottle-top vacuum filter system</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>CLS431206</td>
			<td>Cellulose acetate membrane, pore size 0.45&#160;&#956;m, membrane area 54.5&#160;cm2, filter capacity 500&#160;mL</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Brij 52</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>388831</td>
			<td>Polyethylene glycol hexadecyl ether</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Phosphate buffer solution</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>P5244</td>
			<td>Recieved as 100mM diluted to 10mM with sterile water</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">TRIzol LS&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Life Technologies</td>
			<td>10296-028</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Agarose</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>A5304</td>
			<td>For electrophoresis</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Ethidium bromide</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>E7637</td>
			<td>BioReagent, for molecular biology, powder</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">QIAquick</td>
			<td style="width:93px;">Qiagen</td>
			<td>28704</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">QuantiTect qRT-PCR kit&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Qiagen</td>
			<td>204243</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">4% paraformaldehyde&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>P6148&#160;</td>
			<td>Reagent grade, crystalline</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">PBS&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>P5368</td>
			<td style="width:167px;">Phosphate buffered saline</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Triton X-100&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>X100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Bovine serum albumin (BSA)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>A2153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">Rhodamine red-conjugated phalloidin&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Life Technologies</td>
			<td>R415</td>
			<td>Rhodamine phalloidin is a high-affinity F-actin probe conjugated to the red-orange fluorescent dye, tetramethylrhodamine</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">DAPI&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>D9542</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">ProLong Gold Antifade Reagent</td>
			<td style="width:93px;">Life Technologies</td>
			<td>P36934</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">LSM510 Meta Confocal System&#160;</td>
			<td style="width:93px;">Carl Zeiss</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">LSM Zen 2007 Software</td>
			<td style="width:93px;">Carl Zeiss</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Grace&#8217;s Insect medium (supplemented, 1X)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>G8142</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">L-histidine monohydrate</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>H8125</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Medium 199 (10X)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>M4530</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Medium 1066 (1X)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">C0422</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Hank&#8217;s Balanced Salts (1X)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>51322C</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">L-Glutamine (100X)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>G3126</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">MEM, amino acid mix (50X)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>56419C</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">1 M MgCl solution</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>M8266</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Pen-Strep (w/ Glutamine)</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>G6784</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Nystatin</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>N6261</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Gentamycin</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>46305</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Dextrose</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>D9434</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Fetal Bovine Serum</td>
			<td style="width:93px;">Sigma Aldrich</td>
			<td>F2442</td>
			<td>H2G+ leafhopper medium component</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

propagation of homalodisca coagulata virus-01 via homalodisca vitripennis cell culture

Camsı kanatlı keskin nişancı (Homalodisca vitripennis) güneybatı Amerika Birleşik Devletleri boyunca bulunan bir çok vagile ve polifag böcek türüdür. Bu böcekler Xylella fastidiosa (X. fastidiosa) baskın vektörleri, asmanın Pierce hastalığı (PH) nedensel ajan bir ksilem sınırlı bakteri vardır. Pierce&#39;ın hastalığı ekonomik zarar olduğunu; Bu şekilde, H vitripennis patojen yönetimi stratejileri için bir hedef haline gelmiştir. Homalodisca coagulata virüs-01 (HoCV-01) olarak tanımlanan bir dicistrovirus H. mortalite artışı ile ilişkili olduğu vitripennis popülasyonları. Bir konakçı hücre HoCV-01 replikasyonu için gerekli olduğundan, hücre kültürü lojistik ve biyolojik böcek öldürücü soyu üretimi için ekonomik açıdan önemli olan çoğaltma hedef için tek tip bir ortam sağlar. Bu çalışmada, H. büyük ölçekli üretimi için bir sistemde Doku kültürü ile vitripennis hücreleri geliştirildi, sViral replikasyon mekanizması roviding. HoCV-01 tüm vücut böceklerden çıkarılabilir ve kültür H&#39;yi inoküle etmek için kullanıldı çeşitli seviyelerde vitripennis hücreleri. Kültür ortamı 168 saat, RNA ekstre edilmiş ve QRT-PCR ile analiz için her 24 saatte uzaklaştırılmıştır. Hücreler, tripan mavisi ile boyandı ve ışık mikroskopisi kullanılarak hücre hayatta kalma ölçmek için sayıldı. Tüm virüs parçacıkların toplam hücre kültürü çöküşü oluşmadan önce olduğu tespit edilen bir zaman noktasında olduğu enfeksiyondan sonra 96 ​​saat, kadar ekstre edilmiştir. Hücreler aynı zamanda floresan boyama tabi ve F-aktin bağlanma ve çekirdekler bütünlüğü viral aktivitesini araştırmak için konfokal mikroskopi kullanılarak incelendi. Bu çalışmanın sonuç olduğunu H. vitripennis hücreleri kültive edilip, bir biyolojik zararlı öldürücünün üretimine olanak sağlamak üzere müsait bir seviyede HoCV-01 kitle üretimi için kullanılan olma yeteneğine sahiptirler.

Hücre bağlanma ve büyüme primer kültürlerinde ve sürekli geçişlerinden, hem küçük hem de büyük bir kültür şişelerinde geçidinin 48 saat içinde görülmüştür. Fibroblast büyüme ve gelişme de bu süre içinde gözlenmiştir. Yeni seribaşı şişeler 48 saat önce rahatsız edildiğinde, orada, hücre eki görülür bir düşüş oldu, bazen yavaş büyüyen kültürlerde ve tüm hiçbir ek veya büyüme lider. Hücreler geçen bir hafta içinde, yaklaşık% 80 birleşmeye ve 10-14 gün (...

Watch this Scientific Journal Video about Propagation of Homalodisca coagulata virus-01 via Homalodisca vitripennis Cell Culture at JoVE.com

Propagation of Homalodisca coagulata virus-01 via Homalodisca vitripennis Cell Culture

Burada in vitro Homalodisca vitripennis hücreleri ve HoCV-1 yaymak için bir protokol mevcut. Orta HoCV-1 pozitif kültürlerden çıkarıldı ve RNA 168 saat süre ile, her 24 saat ekstre edilmiştir. Hücre yaşayabilirliği tripan mavi ile nicelendirildi. Tüm virüs parçacıkları sonrası enfeksiyon ekstre edildi. Çıkarılan RNA QRT-PCR ile belirlenmiştir.

Yayılması<em&gt; Homalodisca coagulata virüs 01</em&gt; Yoluyla<em&gt; Homalodisca vitripennis</em&gt; Hücre Kültürü

The glassy-winged sharpshooter (Homalodisca vitripennis) is a highly vagile and polyphagous insect found throughout the southwestern United States. These ...

propagation-homalodisca-coagulata-virus-01-via-homalodisca

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Propagation of Homalodisca coagulata virus-01 via Homalodisca vitripennis Cell Culture

11.6K Görüntüleme.  University of Texas at Tyler.  Burada in vitro Homalodisca vitripennis hücreleri ve HoCV-1 yaymak için bir protokol mevcut. Orta HoCV-1 pozitif kültürlerden çıkarıldı ve RNA 168 saat süre ile, her 24 saat ekstre edilmiştir. Hücre yaşayabilirliği tripan mavi ile nicelendirildi. Tüm virüs parçacıkları sonrası enfeksiyon ekstre edildi. Çıkarılan RNA QRT-PCR ile belirlenmiştir. 

Video: Propagation of Homalodisca coagulata virus-01 via Homalodisca vitripennis Cell Culture

Influenza Virus Propagation in Embryonated Chicken Eggs

Influenza infection is associated with about 36,000 deaths and more than 200,000 hospitalizations every year in the United States. The continuous emergence of new influenza virus strains due to mutation and re-assortment complicates the control of the virus and necessitates the permanent development of novel drugs and vaccines. The laboratory-based study of influenza requires a reliable and cost-effective method for the propagation of the virus. Here, a comprehensive protocol is provided for influenza A virus propagation in fertile chicken eggs, which consistently yields high titer viral stocks. In brief, serum pathogen-free (SPF) fertilized chicken eggs are incubated at 37 &#176;C and 55-60% humidity for 10 &#8211; 11 days. Over this period, embryo development can be easily monitored using an egg candler. Virus inoculation is carried out by injection of virus stock into the allantoic cavity using a needle. After 2 days of incubation at 37 &#176;C, the eggs are chilled for at least 4 hr at 4 &#176;C. The eggshell above the air sac and the chorioallantoic membrane are then carefully opened, and the allantoic fluid containing the virus is harvested. The fluid is cleared from debris by centrifugation, aliquoted and transferred to -80 &#176;C for long-term storage. The large amount (5-10 ml of virus-containing fluid per egg) and high virus titer which is usually achieved with this protocol has made the usage of eggs for virus preparation our favorable method, in particular for in vitro studies which require large quantities of virus in which high dosages of the same virus stock are needed.

Fertile chicken eggs are widely used to produce large amounts of human influenza A virus as they provide a convenient and cost-effective system to prove high yields of virus.

Embriyone Tavuk Yumurta Grip Virüsü Yayılım

Influenza infection is associated with about 36,000 deaths and more than 200,000 hospitalizations every year in the United States. The continuous ...

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Organoids as Model for Infectious Diseases: Culture of Human and Murine Stomach Organoids and Microinjection of Helicobacter Pylori

Recently infection biologists have employed stem cell derived cultures to answer the need for new and better models to study host-pathogen interactions. Three cellular sources have been used: Embryonic stem cells (ESC), induced pluripotent stem cells (iPSC) or adult stem cells. Here, culture of mouse and human gastric organoids derived from adult stem cells is described and used for infection with the gastric pathogen Helicobacter pylori. Human gastric glands are isolated from resection material, seeded in a basement matrix and embedded in medium containing growth factors epidermal growth factor (EGF), R-spondin, Noggin, Wnt, fibroblast growth factor (FGF) 10, gastrin and transforming growth factor (TGF) beta inhibitor. In these conditions, gastric glands grow into 3-dimensional organoids containing 4 lineages of the stomach. The organoids expand indefinitely and can be frozen and thawed similarly as cell lines. For infection studies, bacteria are microinjected into the lumen of the organoids. Infected organoids are processed for imaging. The described methods can be adapted to other organoids and infections with other bacteria, viruses or parasites. This allows the study of infection-induced changes in primary cells.

Stem cell derived cultures harbor tremendous potential to model infectious diseases. Here, the culture of mouse and human gastric organoids derived from adult stem cells is described. The organoids are microinjected with the gastric pathogen Helicobacter pylori.

Enfeksiyon Hastalıkları Modeli Olarak Organoids: Helicobacter Pylori ve İnsan Kültür ve kemirgen Mide Organoids ve Mikroenjeksiyon

Recently infection biologists have employed stem cell derived cultures to answer the need for new and better models to study host-pathogen interactions. ...

An In Vitro Caseum Binding Assay that Predicts Drug Penetration in Tuberculosis Lesions

The eradication of tuberculosis disease requires drug regimens that can penetrate the multiple layers of complex pulmonary lesions. Drug distribution in the caseous cores of cavities and lesions is especially crucial because they harbor subpopulations of drug-tolerant bacteria also commonly referred to as persisters. Existing methods for the measurement of drug penetration in tuberculosis lesions involve costly and time-consuming in vivo pharmacokinetic studies coupled to bioanalytical or imaging techniques. The in vitro measurement of drug binding to caseum macromolecules was proposed as an alternative to such techniques since this binding hinders the passive diffusion of drug molecules through caseum. Rapid equilibrium dialysis is a fast and reliable system for performing plasma protein and tissue binding studies. In this protocol, we used a rapid equilibrium dialysis (RED) device to measure drug binding to homogenates of caseum that is excised from the lesions and cavities of tuberculosis-infected rabbits. The protocol also describes how to generate a surrogate matrix from lipid loaded THP-1 macrophages to use in place of caseum. This caseum/surrogate binding assay is an important tool in tuberculosis drug discovery and can be adapted to help study drug distribution in lesions or abscesses caused by other diseases.

An In Vitro Caseum Binding Assay that Predicts Drug Penetration in Tuberculosis Lesions

Here we describe a rapid equilibrium dialysis (RED) method to measure drug binding to caseum from pulmonary tuberculosis lesions and cavities. The protocol is also used with a foamy macrophage-derived matrix that is an effective surrogate to caseum.

bir<em&gt; In vitro</emTüberküloz Lezyonlarında İlaç Penetrasyonunu Öngören Caseum Bağlanma Testi

The eradication of tuberculosis disease requires drug regimens that can penetrate the multiple layers of complex pulmonary lesions. Drug distribution in ...

Identification of Mediators of T-cell Receptor Signaling via the Screening of Chemical Inhibitor Libraries

The T-cell receptor (TCR) signaling pathway comprises a multitude of mediators that transmit signals upon the activation of the TCR. Different strategies have been proposed and implemented for the identification of new mediators of TCR signaling, which would improve the understanding of T-cell processes, including activation and thymic selection. We describe a screening assay that enables the identification of molecules that influence TCR signaling based on the activation of developing thymocytes. Strong TCR signals cause developing thymocytes to activate apoptotic machinery in a process known as negative selection. Through the application of kinase inhibitors, those with targets that affect TCR signaling are able to override the process of negative selection. The method detailed in this paper can be used to identify inhibitors of canonical kinases with established roles in the TCR signaling pathways and also inhibitors of new kinases yet to be established in the TCR signaling pathways. The screening strategy here can be applied to screens of higher throughput for the identification of novel druggable targets in TCR signaling.

Identification of Mediators of T-cell Receptor Signaling via the Screening of Chemical Inhibitor Libraries

This paper uses a flow-cytometry-based assay to screen libraries of chemical inhibitors for the identification of inhibitors and their targets that influence T-cell receptor signaling. The methods described here can also be expanded for high-throughput screenings.

T-hücre reseptör üzerinden tarama kimyasal inhibitörü kütüphanelerin sinyal arabulucu tanımlaması

The T-cell receptor (TCR) signaling pathway comprises a multitude of mediators that transmit signals upon the activation of the TCR. Different strategies ...

Bacterial Cell Culture at the Single-cell Level Inside Giant Vesicles

We developed a method for culturing bacterial cells at the single-cell level inside giant vesicles (GVs). Bacterial cell culture is important for understanding the function of bacterial cells in the natural environment. Because of technological advances, various bacterial cell functions can be revealed at the single-cell level inside a confined space. GVs are spherical micro-sized compartments composed of amphiphilic lipid molecules and can hold various materials, including cells. In this study, a single bacterial cell was encapsulated into 10&#8211;30 &#956;m GVs by the droplet transfer method and the GVs containing bacterial cells were immobilized on a supported membrane on a glass substrate. Our method is useful for observing the real-time growth of single bacteria inside GVs. We cultured Escherichia coli (E. coli) cells as a model inside GVs, but this method can be adapted to other cell types. Our method can be used in the science and industrial fields of microbiology, biology, biotechnology, and synthetic biology.

We demonstrate single-cell culture of bacteria inside giant vesicles (GVs). GVs containing bacterial cells were prepared by the droplet transfer method and were immobilized on a supported membrane on a glass substrate for direct observation of bacterial growth. This approach may also be adaptable to other cells.

Dev veziküller Içinde tek hücreli seviyede bakteriyel hücre kültürü

We developed a method for culturing bacterial cells at the single-cell level inside giant vesicles (GVs). Bacterial cell culture is important for ...

Purification of High Yield Extracellular Vesicle Preparations Away from Virus

One of the major hurdles in the field of extracellular vesicle (EV) research today is the ability to achieve purified EV preparations in a viral infection setting. The presented method is meant to isolate EVs away from virions (i.e., HIV-1), allowing for a higher efficiency and yield compared to conventional ultracentrifugation methods. Our protocol contains three steps: EV precipitation, density gradient separation, and particle capture. Downstream assays (i.e., Western blot, and PCR) can be run directly following particle capture. This method is advantageous over other isolation methods (i.e., ultracentrifugation) as it allows for the use of minimal starting volumes. Furthermore, it is more user friendly than alternative EV isolation methods requiring multiple ultracentrifugation steps. However, the presented method is limited in its scope of functional EV assays as it is difficult to elute intact EVs from our particles. Furthermore, this method is tailored towards a strictly research-based setting and would not be commercially viable.

This protocol isolates extracellular vesicles (EVs) away from virions with high efficiency and yield by incorporating EV precipitation, density gradient ultracentrifugation, and particle capture to allow for a streamlined workflow and a reduction of starting volume requirements, resulting in reproducible preparations for use in all EV research.

Yüksek Verim Ekstrasellüler Vezikül Preparatlarının Virüsten Uzaklaştırılması

One of the major hurdles in the field of extracellular vesicle (EV) research today is the ability to achieve purified EV preparations in a viral infection ...

Measurement of Pulse Propagation Velocity, Distensibility and Strain in an Abdominal Aortic Aneurysm Mouse Model

An abdominal aortic aneurysm (AAA) is defined as a localized dilation of the abdominal aorta that exceeds the maximal intraluminal diameter (MILD) by 1.5 times of its original size. Clinical and experimental studies have shown that small aneurysms may rupture, while a subpopulation of large aneurysms may remain stable. Thus, in addition to the measurement of intraluminal diameter of the aorta, knowledge of structural traits of the vessel wall may provide important information to assess the stability of the AAA. Aortic stiffening has recently emerged as a reliable tool to determine early changes in the vascular wall. Pulse propagation velocity (PPV) along with the distensibility and radial strain are highly useful ultrasound-based methods relevant for assessing aortic stiffness. The primary purpose of this protocol is to provide a comprehensive technique for the use of ultrasound imaging system to acquire images and analyze the structural and functional properties of the aorta as determined by MILD, PPV, distensibility and radial strain.

This manuscript describes a detailed protocol for using high frequency ultrasound imaging to measure luminal diameter, pulse propagation velocity, distensibility and radial strain on a mouse model of abdominal aortic aneurysm.

Abdominal Aort Anevrizması Fare Modelinde Nabız Yayılma Hızı, Şişkinlik ve GerinimÖlçümü

An abdominal aortic aneurysm (AAA) is defined as a localized dilation of the abdominal aorta that exceeds the maximal intraluminal diameter (MILD) by 1.5 ...

Visualization of Macrophage Lytic Cell Death During Mycobacterial Infection in Zebrafish Embryos via Intravital Microscopy

Zebrafish is an excellent model organism for studying innate immune cell behavior due to its transparent nature and reliance solely on its innate immune system during early development. The Zebrafish Mycobacterium marinum (M. marinum) infection model has been well-established in studying host immune response against mycobacterial infection. It has been suggested that different macrophage cell death types will lead to the diverse outcomes of mycobacterial infection. Here we describe a protocol using intravital microscopy to observe macrophage cell death in zebrafish embryos following M. marinum infection. Zebrafish transgenic lines that specifically label macrophages and neutrophils are infected via intramuscular microinjection of fluorescently labeled M. marinum in either the midbrain or the trunk. Infected zebrafish embryos are subsequently mounted on low melting agarose and observed by confocal microscopy in X-Y-Z-T dimensions. Because long-term live imaging requires using low laser power to avoid photobleaching and phototoxicity, a strongly expressing transgenic is highly recommended. This protocol facilitates the visualization of the dynamic processes in vivo, including immune cell migration, host pathogen interaction, and cell death.

This protocol describes a technique for visualizing macrophage behavior and death in embryonic zebrafish during Mycobacterium marinum infection. Steps for the preparation of bacteria, infection of the embryos, and intravital microscopy are included. This technique may be applied to the observation of cellular behavior and death in similar scenarios involving infection or sterile inflammation.

İntravital Mikroskopi ile Zebrabalığı Embriyolarında Mikobakteriyel Enfeksiyon Sırasında Makrofaj Litik Hücre Ölümünün Görüntülenmesi

Zebrafish is an excellent model organism for studying innate immune cell behavior due to its transparent nature and reliance solely on its innate immune ...

Propagation of the Microsporidian Parasite Edhazardia aedis in Aedes aegypti Mosquitoes

Edhazardia aedis is a microsporidian parasite of Aedes aegypti mosquitoes, a disease vector that transmits multiple arboviruses which cause millions of disease cases each year. E. aedis causes mortality and reduced reproductive fitness in the mosquito vector and has been explored for its potential as a biocontrol agent. The protocol we present for culturing E. aedis is based on its natural infection cycle, which involves both horizontal and vertical transmission at different life stages of the mosquito host. Ae. aegypti mosquitoes are exposed to spores in the larval stage. These infected larvae then mature into adults and transmit the parasite vertically to their offspring. Infected offspring are then used as a source of spores for future horizontal transmission. Culturing E. aedis can be challenging to the uninitiated given the complexities of the parasite&#8217;s life cycle, and this protocol provides detailed guidance and visual aids for clarification.

Propagation of the Microsporidian Parasite Edhazardia aedis in Aedes aegypti Mosquitoes

A protocol to culture the microsporidian parasite Edhazardia aedis. The parasite is passaged from one generation of Aedes aegypti mosquitoes to the next via horizontal transfer at the larval stage followed by vertical transmission at the adult stage. Live sporoplasms survive long-term in infected eggs.

Aedes aegypti Sivrisinekmikrosporidian Parazit Edhazardia aedis yayılması

Edhazardia aedis is a microsporidian parasite of Aedes aegypti mosquitoes, a disease vector that transmits multiple arboviruses which cause millions of ...

Investigating Aortic Valve Calcification via Isolation and Culture of T Lymphocytes using Feeder Cells from Irradiated Buffy Coat

Calcific aortic valve disease (CAVD), an active disease process ranging from mild thickening of the valve to severe calcification, is associated with high mortality, despite new therapeutic options such as transcatheter aortic valve replacement (TAVR). 
The complete pathways that start with valve calcification and lead to severe aortic stenosis remain only partly understood. By providing a close representation of the aortic valve cells in vivo, the assaying of T lymphocytes from stenotic valve tissue could be an efficient way to clarify their role in the development of calcification. After surgical excision, the fresh aortic valve sample is dissected in small pieces and the T lymphocytes are cultured, cloned then analyzed using fluorescence activated cell sorting (FACS).
The staining procedure is simple and the stained tubes can also be fixed using 0.5% of paraformaldehyde and analyzed up to 15 days later. The results generated from the staining panel can be used to track changes in T cell concentrations over time in relation to intervention and could easily be further developed to assess activation states of specific T cell subtypes of interest. In this study, we show the isolation of T cells, performed on fresh calcified aortic valve samples and the steps of analyzing T cell clones using flow cytometry to further understand the role of adaptive immunity in CAVD pathophysiology.

In this study, we describe the process of T lymphocyte isolation from fresh samples of calcified aortic valves and the analytical steps of T cell-cloning for the characterization of the adaptive leukocyte subsets by using flow cytometry analysis.

Işınlanmış Buffy Coat'dan Besleyici Hücreler Kullanılarak T Lenfositlerin İzolasyonu ve Kültürü Yoluyla Aort Kapak Kireçlenmesinin Araştırılması

Calcific aortic valve disease (CAVD), an active disease process ranging from mild thickening of the valve to severe calcification, is associated with high ...