Name: techniques for the analysis of extracellular vesicles using flow cytometry
Uploaded: 2015-03-17T15:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 39 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry at JoVE.com

Yazarlar enstrüman ayarları sitometrede akışı ile yaptığı yardım için kan Sistemler Araştırma Enstitüsü&#39;nden Dale Hirschkorn teşekkür etmek istiyorum. NIH tarafından desteklenen bu çalışma HL095470 ve U01 HL072268 ve DoD sözleşmeleri W81XWH-10-1-0023 ve W81XWH-2-0028 verir.

Not: Aşağıdaki protokoller, insan refahı için tüm kurumsal, ulusal ve uluslararası kurallara uygun olarak yapılmıştır. Bütün insan konu örnekleri kurumsal inceleme kurulu (KİK) -onaylı protokol kapsamında ve konuların bilgilendirilmiş rızası ile test edildi. 1. YÖNTEM A: Bireysel Algılama Yöntemi AGH Kan Örneği / İzolasyon 1.1) İşleme <ol><li> Aşağıdaki 2 adımlı diferansiyel santrifüj protokolü kullanılarak ACD-Solüsyon A ya da diğer halinde, uygun bir antikoagülan ve proses (30 dakika içinde max), 1.5 ml ihtiva eden iki adet 10 ml&#39;lik cam tüplere verici / hastadan alınan kan alımı. NOT: Bu protokol, çekilen kan Birleştirilen ~ 17 ml den yaklaşık 10 ml trombosit bakımından yoksul plazma (PPP), bir yol açacaktır. Daha fazla veya daha az, PPP gerekirse, toplanan kan tüplerin sayısı uygun şekilde ayarlanabilir. </li><li> Oda sıcaklığında 10 dakika boyunca 1500 x g&#39;de santrifüj örnekleribuffy coat ve kırmızı hücrelerin plazma ayırmak için. Buffy coat ve kırmızı hücreleri içeren alt katmanları rahatsız etmemek için dikkatli olmak, 1.5 ml santrifüj tüplerine plazma süpernatant 1.2 ml hacimde aktarın. </li><li> Trombosit ve büyük hücre parçalarını almak için oda sıcaklığında 10 dakika boyunca 13,000 x g&#39;de dönerler. Dikkatle pelet bozulmasını önleyen ve yeni bir tüpe PPP eklemek için 200 ul geride bırakarak PPP aktarın. </li><li> Bu noktada, daha sonra analiz için iki yıla kadar (bir genel bakış için 1A bakınız Şekil) -80 ° C de analiz veya yeni bir 1.5 ml&#39;lik santrifüj tüplerine 1.0 mi alikotlar içinde transfer ve mağaza hemen PPP kullanın. </li><li> Saflaştınldı AGH bir ultra santrifüj tüpüne fonksiyonel deneylerde, transferi PPP 6 mi için gerekli ve 0.2 um filtreden fosfat tamponlu tuzlu su içinde 28 ml (PBS) ekleyin ise. Bir sallanan kepçeli rotor ile donatılmış bir ultrasantrifüj kullanarak, oda sıcaklığında 100,000 x g&#39;de 60 dakika süre ile spin. Aspire süpernatant ve tekrar süspansiyon EV pel1.5 ml medyada bildirin. NOT: En yüksek tekrarlanabilirlik için, kan örnekleri vericiden itibaren sürekli sürede işleme alınmalıdır. EV izolasyon yönteminin herhangi bir varyasyon ölçüde tespit AGH sayısını ve türünü etkileyebilir. </li></ol> 1.2) Analiz için Örnekleri Hazırlama NOT: Bu noktadan itibaren, adım 3 panellerde 14 belirteçleri için 12 numune analiz için yüksek verimlilik protokolü açıklar. Ancak, antikorların ve diğer kombinasyonları burada kullanılabilir; Protokol ilgilenilenlerdir için önerilen belirteçler ile ikame diğer EV popülasyonları çalışma için adapte edilebilir. <ol><li> 37 ° C&#39;de ve çözülme (-80 ° C &#39;de depolandığı takdirde) dondurucu 12 örnek çıkarın. </li><li> Pipet içeriği yukarı ve aşağı birkaç kez karıştırın. Her bir örnekten 320 ul çıkarın ve 96 gözlü bir levhanın üst üste ekleyin. NOT: Bir genişlik ayarlanabilir çok iyi pipetlemeyin bu ve eşek boyunca birçok diğer adımlar için son derece yararlı olanay, bir kerede birden fazla örnekleri analiz özellikle. </li></ol> 1.3) Boyama EV Örnekleri <ol><li> Boyamadan önce, olumlu sinyaller neden olabilir, agrega kaldırmak için tüm antikorları (Abs) filtre. <ol><li> Ab karışımın tümü filtreden geçtikten Kombine antikorlar 2 dakika boyunca oda sıcaklığında sabit bir açı tek hızlı santrifüj (~ 750 xg) ile ayrı bir 0.22 um santrifüj filtre tüpleri ve santrifüj içine 3 panellerin her kullanılacak kadar veya ve herhangi bir antikorun sıvı filtre yüzeyi üzerinde kalır. Mağaza Ab iki hafta buzdolabında kokteyller ama tekrar filtre kullanmadan önce her zaman. </li></ol></li><li> Iyi aralıksız 2&#39;de her süzüldü antikor karışımının uygun miktarda (ör Her Ab 2 ul ile boyanır masasında örnekler, bu yüzden, süzüldü antikor kokteyli 12 ul&#39;lik toplam 2 satır için her bir oyuğa ilave edilir). Önerilen plaka haritanın bir anahat için 1B Bakınız Şekil. Bu ek tekrarlayınDaha fazla paneller çalıştırmak eğer altındaki satırlara s (burada, iyi 4 satır için Panel III kokteyli 3 ve 11 ul / satır 8 ul / kuyu Panel II kokteyl ekleyin; özel paneli bilgileri için malzemeler Listesi&#39;ne bakınız). </li><li> Çok kanallı pipet kullanarak, yukarı ve aşağı satır 1 PPP örnekleri karıştırın ve 2. karıştırın yukarı ve aşağı satır kuyulara satır 1 kuyulardan 100 ul aktarın. 30 dakika boyunca 4 ° C &#39;de satır 3 ve 4 inkübasyona sıra 1 den 100 ul transfer değiştirme uçları ve tekrar. </li></ol> 1.4) Yıkama OG Örnekleri <ol><li> Biyolojik güvenlik kabini 96-kuyu 4 ° C plaka ve transferi çıkarın. / Oyuk satır 6-8 PBS 220 ul, bir çok kanallı pipet kullanarak (/ durulama lekeli PPP içeren kuyu yıkanması için kullanılmak üzere). </li><li> Antikorların 3 panel, 12 x 3 = 36 filtre tüpleri ile, 12 numuneler için genişlik ayarlı çok kanallı pipet (kullanarak ön-etiketli santrifüj filtre tüpleri iyi her içeriğini aktarmak olacak) gerekli. Aynı ipuçları kullanarak, yıkama satırlardan PBS 200 ul kaldırmak ve PPP sadece çıkarıldığı gelen kuyulara ekleyin. </li><li> Kuyu durulayın ve PPP önce ilave edildiği için aynı filtreler durulama çözüm aktarmak için aşağı yukarı karıştırın ve. Santrifüj filtre yakın üstleri. Değişim ipuçları. </li><li> Tüm lekeli PPP örnekleri santrifüj filtre kendi durulama çözümleri ile birlikte devredilmiştir kadar kalan lekeli örnekleri ile bu işlemi tekrarlayın. </li><li> Oda sıcaklığında 3 dakika boyunca 850 xg&#39;de sabit rotor santrifüj ve spin santrifüj filtre aktarın. NOT: Hiçbir sıvı filtre üstleri kalır emin olun. Santrifüj işleminden sonra, filtre, görünür sıvı tabaka üstünde kalan &quot;kuru&quot; olarak görünmelidir. Olası iken, bazı PPP örnekleri etkin bir filtre aracılığıyla taşımak için daha uzun bir santrifüj süresi gerekebilir. </li><li> Santrifüj filtre tüpleri çıkarın ve biyolojik güvenlik kabini dönmek.Çok kanallı bir pipet kullanılarak, PBS, 300 ul filtre tepelerini yeniden süspanse edin. Yeniden süspanse içerikler derhal FCM analizi için tüpler etiketli önceden transfer. NOT: Bu örnek-örnek varyasyon önlemek için numuneler arasında tutarlı pipet piston çöküntü kuvvet ve sayısını tutmak çok önemlidir. Bu ideal yukarı ve belirli bir hacme aşağı pipetlemeyin için programlanmış bir elektronik pipet kullanılarak yapılmalıdır (örn, 280 ul), her numune için zaman (örneğin, 8 kez) bir tam sayısı. </li></ol> 1.5) Sitometresi Kur <ol><li> FCM yazılımını açın. Kurulumu deneme (üreticinin talimatlarına) enstrüman kurulum boncuklar kullanarak günlük alet kalibrasyon ve kurulumu gerçekleştirmek için önce. </li><li> EV örnekleri birden fazla antikor ile boyandı ve olan varsa birden fluorochromes aşağıdaki gibi tazminat değerlerini hesaplamak, bir kerede ölçülecek gibidir: <ol><li> Ön tazminat boncuk 2 damla ekleyin-etiketli borular (her bir florokrom-eşlenik antikor için 1 tüp) ve antikorun önerilen miktarını ekleyin. Lekesiz kompanzasyon kontrolü olarak kullanmak için başka bir tüp negatif tazminat boncuk 2 damla ekleyin. </li><li> 30 dakika boyunca 4 ° C&#39;de inkübe edin PBS içinde 400 ul PBS ve tekrar süspansiyon ile yıkayın. </li><li> Cihaz ile birlikte yazılım sitometrede akışını kullanarak, her tazminat tüpü çalıştırmak ve 5-on günlük bir ölçekte yaklaşık 10 4 her zirveye yerleştirmek için floresan gerilimler ayarlayın. Floresan tepe diğer tüm kanallara kıyasla kendi floresan kanalda yüksek (parlak) olduğundan emin olun ve gerekirse tekrar floresan parametrelerin gerilimleri ayarlayın. Her biri ayrı ayrı boyanmış abone ol tüp çalıştırın ve tüp başına en az 5.000 olayları yakalamak. </li><li> Sonra seçin &quot;Deney&quot; sekmesini seçin &quot;Telafisi,&quot; daha sonra tüm örnekler için tazminat değerlerini uygulamak için &quot;Hesapla Telafisi&quot; seçeneğini seçin. </li></ol></li><li&gt; Ölçek log ve her biri için sitometresindeki (FSC = 200 ve SSC = 200) tarafından izin verilen en düşük eşik seçmek için ileri dağılım (FSC) ve yan dağılım (SSC) gerilim parametrelerini ayarlayın. </li><li> 0.22 mikron filtreli PBS bir tüp çalışırken, (yani, sadece olay hızı 5 olayları / sn aşan hangi gerilim eşiğinin altında) arka plan gürültüsü çoğunluğunu dışlamak en yüksek değerlere FSC &amp; SSC gerilimleri ayarlayın. </li><li> Gerekirse, PBS içinde seyreltilmiş 1.0 um boncuklar, - Daha sonra, 0.2 mikron ihtiva eden bir tüp çalıştırın. FCS SSC vs arsa, um 0.2 ila 1.0 olayları yakalamak için boncuk nüfus etrafında bir kapı çizin. Alternatif olarak, bir SSC-H histogramda, 1.0 mikron boncuk daha küçük tüm olayları kapsar bir kapı çizin. </li><li> &quot;Lo&quot; (yaklaşık 8-12 ul / dk) sitometresinin akış hızını ayarlayın. Boncuk tüp kullanarak (ya da boncuk bilinen bir konsantrasyonu içeren diğer tüp) arifesinde kadar sitometresindeki akış hızı kadranını ayarlayınnt oranı yaklaşık 200 olay / sn ulaşır. Aynı akış hızında tüm numune tüpleri okuyun ve bu akım hızları koşular arasında tutarlı kalmasını sağlamak için gelecek deneylerde aynı boncuk konsantrasyonunu kullanın. </li><li> PBS içinde seyreltilmiş gökkuşağı floresan parçacıkların bir tüp çalıştırın. 5.000 olayları Edinme. FSC, SSC, ve her renk kanalı için ortalama yoğunluk değerleri kaydedin. Bu floresan yoğunlukları deneyler arasında tutarlı kalmasını sağlamak için gelecek deneylerde gerilimleri ayarlamak için bu değerleri kullanın. </li></ol> 1.6) Örnek Okuma <ol><li> &quot;Lo&quot; (yaklaşık 8-12 ul / dk) sitometresinin akış hızını ayarlayın ve tam olarak 1 veya 2 dakika boyunca her örnek çalıştırın. </li><li> Ilk okuma sonra, NP-40 aşağı her numune, pipet yukarı ve% 10 20 ul ekleyin ve tespit pozitif olayların çıkarma izin zaman aynı miktarda (1 ya da 2 dk) için yeniden okumak eşit bir zaman dilimi içinde lize örnek. NOT: Bu son derece impNumuneler pipet yerine bir vorteks ile karıştırılabilir ki ortant. Bizim tecrübelerimize göre, vorteksleme EV-taklit olumlu olaylara yol açan, bazı antikorların kendine gelmesine neden olabilir. </li><li> Bir kez tüm örnekler verme ayrı bir dosya içine tüm dosyaları .fcs FCM analizi yazılımı kullanılarak ileri analiz için kullanılacak, okundu. </li></ol> 1.7) Veri Analizi <ol><li> FCM analiz yazılımı açın. Yeni bir deneme dosyası içine .fcs tüm dosyaları içe. </li><li> Boncuklar sadece tüp açın. SSC-A arsa vs FSC-A&#39;da, etrafında 0.2 mikron ile 1.0 mikron arasında büyüklükte tüm boncuklar bir kapı çizin. Bu EV kapısıdır. Sürükle tüm numunelerin eklemek için. </li><li> Negatif kontrol olarak lize örnekleri kullanarak, kullanılan Her florasan kanalına eşiğe kenarında kapıları çizin. Her gelen olmayan lize numunenin EV kapısı içine floresan kapıları sürükleyin. NOT: Bu noktada da ikili floresan iki parametre araziler incelemek yararlı olacaktır. Roket şekilleri içindebelirteçler alakasız hücre tipleri üzerinde ikamet bilinmektedir özellikle çift pozitif kadran toplama veya diğer kabarcık taklit olaylardan eserin göstergesi olabilir (Şekil 8). </li><li> Her bir floresan markör için, sigara lize numunede olay sayısı ile ilgili lize numunede olay sayısını çıkarılır. İsteğe bağlı olarak,% pozitif değerleri almak için olmayan lize EV kapısının içindeki EVs toplam sayısına göre bu sayı bölün. </li></ol> 2. YÖNTEM B: Boncuk Yöntemi AGH Kan Örneği / İzolasyon 2.1) İşleme <ol><li> (Bölüm 1.1) Yöntem A&#39;da tarif edilen kan işleme yöntemine bakınız. </li></ol> 2.2) Analiz için Örnekleri Hazırlama <ol><li> İstenirse, eksozom ve microvesicles içine PPP veya ultrasantifrüjlenmiş AGH damıtmak. 0.22 mikron santrifüj filtreler PPP veya ultrasantifrüjlenmiş AGH 250 ul ekleyin ve 750 x sabit rotor santrifüj ve spin aktarmakoda sıcaklığında 2 dakika boyunca örn. NOT: Hiçbir sıvı filtre üstleri kalır emin olun. Santrifüj işleminden sonra, filtre, görünür sıvı tabaka üstünde kalan &quot;kuru&quot; olarak görünmelidir. Olası iken, bazı örnekler sıvı etkili bir filtre üzerinden hareket etmek için biraz daha uzun santrifüj süresi gerekebilir. </li><li> 2 ml kaplanmamış 6 mikron polistiren boncuklar (örneğin, negatif ABC boncuk) RPMI medya ile 2x ve tekrar süspansiyon yıkayın. Her bir FACS tüpü 6,000 boncuk ekleyin. Negatif kontrol tüpüne, boncuk tek başına RPMI medya 400 ul ekleyin. Diğer tüm tüpler için, PPP veya ultrasantifrüjlenmiş AGH (veya fraksiyonları) 200 ul ve RPMI medya 200 ul ekleyin. </li><li> Ortam ile 400 ul bütün tüpler son hacim ayarlama ve bir çalkalayıcı üzerinde 4 ° C&#39;de gece boyunca inkübe edilir. </li><li> Ertesi sabah, ortam, 2 ml ile boncuk yıkayın. Süpernatant aspire. </li><li> 4 ve 3 saat boyunca ortam (400 ul) içinde% 5 sığır serum albumin (BSA) ile bloke# 176, bir çalkalayıcı üzerinde ° C. </li><li> Ortam, 2 ml ile boncuk yıkayın. Ortam 100 ul aspire ve tekrar süspansiyon pelet. </li></ol> 2.3) Boyama EV Örnekleri <ol><li> Tüm antikorları Filtre. Yöntem A&#39;da kullanılan aynı antikor panelleri kullanarak ya da eğer arzu edilirse, sürece kendi fluorokromun birbirleriyle uyumlu olarak antikorlar, farklı bir kombinasyon yaratmak. </li><li> Kombine Tüm antikorlar, bir 0.22 um filtre santrifüj tüpüne tek bir panelde kullanılır. 2 dakika boyunca ya da Ab karışımın tümü kadar sabit açılı tek hızlı santrifüj kullanılarak santrifüj filtreden geçirilir ve hiçbir antikor sıvı filtre yüzeyi üzerinde kalır. </li><li> Tüm tüplere süzüldü antikor kokteylinin uygun hacimde ilave edin ve 4 ° C&#39;de 30 dakika inkübe edilir. </li><li> Sitometrede akış medya 400 ul medya, tekrar süspansiyon 2 ml boncuk yıkayın ve hemen çalıştırın (ya da aynı gün içinde). </li></ol> 2.4) Kurulum ve Numune Okuma Sitometrenin<ol><li> FCM yazılımını açın. Kurulumu deneme (üreticinin talimatlarına) enstrüman kurulum boncuklar kullanarak günlük alet kalibrasyon ve kurulumu gerçekleştirmek için önce. </li><li> EV örnekleri birden fazla antikor ile boyandı ve olan varsa birden fluorochromes aşağıdaki gibi tazminat değerlerini hesaplamak, bir kerede ölçülecek gibidir: <ol><li> Tüpler etiketlenmiş önceden tazminat boncuk 2 damla (her florokrom-eşlenik antikor için 1 tüp) ekleyin ve antikorun önerilen miktarını ekleyin. Lekesiz kompanzasyon kontrolü olarak kullanmak için başka bir tüp negatif tazminat boncuk 2 damla ekleyin. 30 dakika boyunca 4 ° C&#39;de inkübe edin PBS içinde 400 ul PBS ve tekrar süspansiyon ile yıkayın. </li><li> FCM yazılımı kullanarak, her tazminat tüpü çalıştırmak ve 5-on günlük bir ölçekte yaklaşık 10 4 her zirveye yerleştirmek için floresan gerilimler ayarlayın. Floresan tepe diğer tüm kanallara kıyasla kendi floresan kanalda (parlak) yüksek olduğundan emin olun veGerekirse tekrar floresan parametrelerin gerilimleri ayarlayın. Her biri ayrı ayrı boyanmış abone ol tüp çalıştırın ve tüp başına en az 5.000 olayları yakalamak. </li><li> Sekmesini seçin &quot;Deney,&quot; sonra &quot;Tazminat,&quot; sonra &quot;Hesapla Tazminat&quot; tüm örnekler için tazminat değerlerini uygulamak için. </li></ol></li><li> Ölçek log ve her biri için sitometresindeki (FSC = 200 ve SSC = 200) tarafından izin verilen en düşük eşik seçmek için FSC ve SSC gerilim parametrelerini değiştirin. </li><li> Tekli boncuk nüfus Run örnekleri, kapı ve bu kapıdan 2.000 olayları kazanır. Export .fcs dosyaları. </li><li> Dosyaları .fcs analiz FCM analiz yazılımı kullanın. Tekli boncuklar üzerinde Kapısı. Her florokrom için geometrik ortalama floresan yoğunluğu (MFI) hesaplayın ve negatif kontrol MFI ile karşılaştırın. </li></ol>

<ol>
	<li>Andaloussi, S., M&#228;ger, I., Breakefield, X. O., Wood, M. J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+vesicles:+biology+and+emerging+therapeutic+opportunities.">Extracellular vesicles: biology and emerging therapeutic opportunities.</a> Nature Reviews Drug Discovery. 12 (5), 347-357 (2013).</li><li>Sugawara, A., Nollet, K. E., Yajima, K., Saito, S., Ohto, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preventing+platelet-derived+microparticle+formation--and+possible+side+effects-with+prestorage+leukofiltration+of+whole+blood.">Preventing platelet-derived microparticle formation--and possible side effects-with prestorage leukofiltration of whole blood.</a> Archives of Pathology &amp; Laboratory Medicine. 134 (5), 771-775 (2010).</li><li>Th&#233;ry, C., Ostrowski, M., Segura, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Membrane+vesicles+as+conveyors+of+immune+responses.">Membrane vesicles as conveyors of immune responses.</a> Nature Reviews Immunology. 9 (8), 581-593 (2009).</li><li>Mause, S. F., Weber, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microparticles+Protagonists+of+a+Novel+Communication+Network+for+Intercellular+Information+Exchange.">Microparticles Protagonists of a Novel Communication Network for Intercellular Information Exchange.</a> Circulation Research. 107 (9), 1047-1057 (2010).</li><li>Bouvy, C., Gheldof, D., Chatelain, C., Mullier, F., Dogne, J. -. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contributing+role+of+extracellular+vesicles+on+vascular+endothelium+haemostatic+balance+in+cancer.">Contributing role of extracellular vesicles on vascular endothelium haemostatic balance in cancer.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 3, (2014).</li><li>Hood, J. L., San, R. S., Wickline, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exosomes+Released+by+Melanoma+Cells+Prepare+Sentinel+Lymph+Nodes+for+Tumor+Metastasis.">Exosomes Released by Melanoma Cells Prepare Sentinel Lymph Nodes for Tumor Metastasis.</a> Cancer Research. 71 (11), 3792-3801 (2011).</li><li>Gatti, S., Bruno, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microvesicles+derived+from+human+adult+mesenchymal+stem+cells+protect+against+ischaemia-reperfusion-induced+acute+and+chronic+kidney+injury.">Microvesicles derived from human adult mesenchymal stem cells protect against ischaemia-reperfusion-induced acute and chronic kidney injury.</a> Nephrology Dialysis Transplantation. 26 (5), 1474-1483 (2011).</li><li>Barteneva, N. S., Fasler-Kan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circulating+microparticles:+square+the+circle.">Circulating microparticles: square the circle.</a> BMC Cell Biology. 14 (1), 23 (2013).</li><li>Van der Pol, E., B&#246;ing, A. N., Harrison, P., Sturk, A., Nieuwland, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Classification+functions,+and+clinical+relevance+of+extracellular+vesicles.">Classification functions, and clinical relevance of extracellular vesicles.</a> Pharmacological Reviews. 64 (3), 676-705 (2012).</li><li>Raposo, G., Stoorvogel, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+vesicles:+Exosomes,+microvesicles,+and+friends.">Extracellular vesicles: Exosomes, microvesicles, and friends.</a> The Journal of Cell Biology. 200 (4), 373-383 (2013).</li><li>Dinkla, S., Brock, R., Joosten, I., Bosman, G. J. C. G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gateway+to+understanding+microparticles:+standardized+isolation+and+identification+of+plasma+membrane-derived+vesicles.">Gateway to understanding microparticles: standardized isolation and identification of plasma membrane-derived vesicles.</a> Nanomedicine (London, England). 8 (10), (2013).</li><li>Witwer, K. W., Buzas, E. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+of+sample+collection,+isolation+and+analysis+methods+in+extracellular+vesicle+research.">Standardization of sample collection, isolation and analysis methods in extracellular vesicle research.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 2, (2013).</li><li>Shah, M. D., Bergeron, A. L., Dong, J. -. F., L&#243;pez, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flow+cytometric+measurement+of+microparticles:+Pitfalls+and+protocol+modifications.">Flow cytometric measurement of microparticles: Pitfalls and protocol modifications.</a> Platelets. 19 (5), 365-372 (2008).</li><li>Dey-Hazra, E., Hertel, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+circulating+microparticles+by+flow+cytometry:+influence+of+centrifugation,+filtration+of+buffer,+and+freezing.">Detection of circulating microparticles by flow cytometry: influence of centrifugation, filtration of buffer, and freezing.</a> Vascular Health and Risk Management. 6, 1125-1133 (2010).</li><li>Lacroix, R., Judicone, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+of+pre-analytical+variables+in+plasma+microparticle+determination:+results+of+the+International+Society+on+Thrombosis+and+Haemostasis+SSC+Collaborative+workshop.">Standardization of pre-analytical variables in plasma microparticle determination: results of the International Society on Thrombosis and Haemostasis SSC Collaborative workshop.</a> Journal of Thrombosis and Haemostasis. 11 (6), 1190-1193 (2013).</li><li>Mullier, F., Bailly, N., Chatelain, C., Chatelain, B., Dogn&#233;, J. -. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pre-analytical+issues+in+the+measurement+of+circulating+microparticles:+current+recommendations+and+pending+questions.">Pre-analytical issues in the measurement of circulating microparticles: current recommendations and pending questions.</a> Journal of Thrombosis and Haemostasis. 11 (4), 693-696 (2013).</li><li>Peramo, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physical+Characterization+of+Mouse+Deep+Vein+Thrombosis+Derived+Microparticles+by+Differential+Filtration+with+Nanopore+Filters.">Physical Characterization of Mouse Deep Vein Thrombosis Derived Microparticles by Differential Filtration with Nanopore Filters.</a> Membranes. 2 (1), 1-15 (2012).</li><li>Tilley, R. E., Holscher, T., Belani, R., Nieva, J., Mackman, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tissue+Factor+Activity+is+Increased+in+a+Combined+Platelet+and+Microparticle+Sample+from+Cancer+Patients.">Tissue Factor Activity is Increased in a Combined Platelet and Microparticle Sample from Cancer Patients.</a> Thrombosis research. 122 (5), 604-609 (2008).</li><li>Rood, I. M., Deegens, J. K. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+three+methods+for+isolation+of+urinary+microvesicles+to+identify+biomarkers+of+nephrotic+syndrome.">Comparison of three methods for isolation of urinary microvesicles to identify biomarkers of nephrotic syndrome.</a> Kidney international. 78 (8), 810-816 (2010).</li><li>Van der Pol, E., Hoekstra, A. G., Sturk, A., Otto, C., van Leeuwen, T. G., Nieuwland, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optical+and+non-optical+methods+for+detection+and+characterization+of+microparticles+and+exosomes.">Optical and non-optical methods for detection and characterization of microparticles and exosomes.</a> Journal of Thrombosis And Haemostasis: JTH. 8 (12), 2596-2607 (2010).</li><li>Gy&#246;rgy, B., Szab&#243;, T. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Membrane+vesicles,+current+state-of-the-art:+emerging+role+of+extracellular+vesicles.">Membrane vesicles, current state-of-the-art: emerging role of extracellular vesicles.</a> Cellular and Molecular Life Sciences. 68 (16), 2667-2688 (2011).</li><li>Miguet, L., Be&#769;chade, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+Analysis+of+Malignant+B-Cell+Derived+Microparticles+Reveals+CD148+as+a+Potentially+Useful+Antigenic+Biomarker+for+Mantle+Cell+Lymphoma+Diagnosis.">Proteomic Analysis of Malignant B-Cell Derived Microparticles Reveals CD148 as a Potentially Useful Antigenic Biomarker for Mantle Cell Lymphoma Diagnosis.</a> Journal of Proteome Research. 8 (7), 3346-3354 (2009).</li><li>Smalley, D. M., Root, K. E., Cho, H., Ross, M. M., Ley, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+discovery+of+21+proteins+expressed+in+human+plasma-derived+but+not+platelet-derived+microparticles.">Proteomic discovery of 21 proteins expressed in human plasma-derived but not platelet-derived microparticles.</a> Thrombosis and Haemostasis. 97 (1), 67-80 (2007).</li><li>Lacroix, R., Robert, S., Poncelet, P., Dignat-George, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Overcoming+Limitations+of+Microparticle+Measurement+by+Flow+Cytometry.">Overcoming Limitations of Microparticle Measurement by Flow Cytometry.</a> Seminars in Thrombosis and Hemostasis. 36 (08), 807-818 (2010).</li><li>Mobarrez, F., Antovic, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+multicolor+flow+cytometric+assay+for+measurement+of+platelet-derived+microparticles.">A multicolor flow cytometric assay for measurement of platelet-derived microparticles.</a> Thrombosis Research. 125 (3), e110-e116 (2010).</li><li>Van der Pol, E., van Gemert, M. J. C., Sturk, A., Nieuwland, R., van Leeuwen, T. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single+vs.+swarm+detection+of+microparticles+and+exosomes+by+flow+cytometry.">Single vs. swarm detection of microparticles and exosomes by flow cytometry.</a> Journal of Thrombosis And Haemostasis: JTH. 10 (5), 919-930 (2012).</li><li>Gy&#246;rgy, B., Szab&#243;, T. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+Flow+Cytometric+Assessment+Reveals+Distinct+Microvesicle+(Cell-Derived+Microparticle)+Signatures+in+Joint+Diseases.">Improved Flow Cytometric Assessment Reveals Distinct Microvesicle (Cell-Derived Microparticle) Signatures in Joint Diseases.</a> PLoS ONE. 7 (11), e49726 (2012).</li><li>Gy&#246;rgy, B., M&#243;dos, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+isolation+of+cell-derived+microparticles+are+compromised+by+protein+complexes+resulting+from+shared+biophysical+parameters.">Detection and isolation of cell-derived microparticles are compromised by protein complexes resulting from shared biophysical parameters.</a> Blood. 117 (4), e39-e48 (2011).</li><li>Gy&#246;rgy, B., Pasztoi, M., Buzas, E. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Response:+systematic+use+of+Triton+lysis+as+a+control+for+microvesicle+labeling.">Response: systematic use of Triton lysis as a control for microvesicle labeling.</a> Blood. 119 (9), 2175-2176 (2012).</li><li>Trummer, A., De Rop, C., Tiede, A., Ganser, A., Eisert, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isotype+controls+in+phenotyping+and+quantification+of+microparticles:+a+major+source+of+error+and+how+to+evade+it.">Isotype controls in phenotyping and quantification of microparticles: a major source of error and how to evade it.</a> Thrombosis Research. 122 (5), 691-700 (2008).</li><li>Shet, A. S., Aras, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sickle+blood+contains+tissue+factor-positive+microparticles+derived+from+endothelial+cells+and+monocytes.">Sickle blood contains tissue factor-positive microparticles derived from endothelial cells and monocytes.</a> Blood. 102 (7), 2678-2683 (2003).</li><li>Connor, D. E., Exner, T., Ma, D. D. F., Joseph, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+majority+of+circulating+platelet-derived+microparticles+fail+to+bind+annexin+V,+lack+phospholipid-dependent+procoagulant+activity+and+demonstrate+greater+expression+of+glycoprotein+Ib.">The majority of circulating platelet-derived microparticles fail to bind annexin V, lack phospholipid-dependent procoagulant activity and demonstrate greater expression of glycoprotein Ib.</a> Thrombosis and Haemostasis. 103 (5), 1044-1052 (2010).</li><li>Nolte-&#8217;t Hoen, E. N. M., van der Vlist, E. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+and+qualitative+flow+cytometric+analysis+of+nanosized+cell-derived+membrane+vesicles.">Quantitative and qualitative flow cytometric analysis of nanosized cell-derived membrane vesicles.</a> Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, And Medicine. 8 (5), 712-720 (2012).</li><li>Van der Vlist, E. J., Nolte-&#8217;t Hoen, E. N. M., Stoorvogel, W., Arkesteijn, G. J. A., Wauben, M. H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescent+labeling+of+nano-sized+vesicles+released+by+cells+and+subsequent+quantitative+and+qualitative+analysis+by+high-resolution+flow+cytometry.">Fluorescent labeling of nano-sized vesicles released by cells and subsequent quantitative and qualitative analysis by high-resolution flow cytometry.</a> Nature Protocols. 7 (7), 1311-1326 (2012).</li><li>Orozco, A. F., Lewis, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flow+cytometric+analysis+of+circulating+microparticles+in+plasma.">Flow cytometric analysis of circulating microparticles in plasma.</a> Cytometry Part A. 77 A. 77A (6), 502-514 (2010).</li></ol>

Yazarlar ifşa etmek çıkar çatışması var.

İzolasyon, tedavi ve EVs analizi için iki farklı protokol tek bir algılama veya boncuk esaslı yaklaşım kullanılarak sunulmuştur. Kullanmak için en uygun yöntemi seçerek her zaman kolay değildir ve faiz bireysel alt popülasyonlar yanı sıra test edilen numunenin bir anlayış gerektirir. En uygun yöntemi tercih Bundan başka, satın alma için kullanılan sitometresinde duyarlılığı göz önünde bulundurulmalıdır. Çoğu zaman doğrusu yöntemlerin bir kombinasyonu, tek başına herhangi bir yöntem...

Hücre dışı veziküller (EVS) hücre-hücre iletişimine yüksek ilgili olan ve biyolojik süreçler çok çeşitli düzenlemeye yardımcı vücut sıvılarında bulunan küçük, zar-türevi veziküllerdir. Akış sitometrik (FCM) ile AGH analizi nedeniyle küçük boyutu ve ilgi belirteçleri için pozitif ayrık nüfus eksikliği bildiği zor olmuştur. Oldukça son on yılda geliştirilmiş EV analiz yöntemleri, hala devam eden bir çalışma vardır. Ne yazık ki, orada hiç kimse-boyut-uyan tüm protokol ve kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Birkaç farklı işleme AGH için teknikler ve bireysel algılama veya boncuk-tabanlı bir yaklaşım kullanarak AGH analiz için iki protokol burada sundu. rasyonel f yaygın ticari preparatlarda bulunan antikor agregatları bertaraf yardımcı olacaktır Burada tarif edilen yöntemler, artan bir sinyal-gürültü oranı ve ayar kapılarıeşiğe tespitini en aza indirir ashion. İkinci protokol yakalamak ve küçük AGH ve eksozomlar tespit etmek için bir boncuk tabanlı bir yaklaşım kullanır iken ilk protokol, klinik örneklerin yüksek hacimli analiz etmek için özellikle uygundur bireysel algılama yöntemi kullanır. Ayrıca mikro şekilde bilinmektedir EVs, hücre-hücre iletişimine katılan ve biyolojik süreçler 1 çok çeşitli düzenlemeye yardımcı olan vücut sıvılarında bulunan küçük, zar-türevi veziküllerdir. 4 - Çeşitli yüzey belirteçleri ve / veya biyolojik maddenin doğrudan aktarımı ifadesi sayesinde, AGH aktive veya hücreler arası iletişimin 2 rol bastırmak ya oynamak için alıcı hücrelerin fonksiyonunu değiştirmek edebiliyoruz. Diğer tümör Metasta teşvik gelen, geniş bir şartlar aralığında katkıda gösterilmiştir ve Klinik, trombosit türevli EVs kuvvetli pıhtılaşmaya karşı etkinliğe 5 sahip olduğu bilinmektedirHastalığın 7 karşı korumaya sis 6. AGH boyutu ve kuşak 8 mekanizmaya bağlı olarak, bu tür bir eksozom ve microvesicles (MVs) gibi hücre-türevi veziküllerin küçük kategoriye ayrılabilir. MVs 100 1,000 kadar büyük ise hücre kökenli kese alt popülasyonlarının isimlendirme devam eden tartışmanın 8,9 bir konu olmaya devam ediyor, ancak, eksozomlar genellikle, küçük plazma zarı ile endosome füzyon elde edilen 40 ila 100 nm parçacıklar açıklanmıştır nm partiküller, plazma zarının 10 dökülme ile temsil edilmektedir. Burada, genel terim &quot;EV bize&quot; hücreleri tarafından salınan hücre dışı biyolojik veziküllerinin her türlü ifade etmek için kullanılacaktır. Bütün kandan EV&#39;lerin izolasyonu çok aşamalı bir işlemdir ve bir çok farklı işlem değişkenlerinin, depolama sıcaklığı ve süresi 11,12, antikoagülan / koruyucu 13 kullanılır ve de dahil olmak üzere, EV içeriği etkilediği gösterilmiştirsantrifüj yöntemi 14 kullanılır. Bu değişkenlerin standardizasyonu için bir ihtiyaç Tromboz ve Hemostaz Bilimsel ve uygun Standardizasyon Komitesi (ISTH SSC), kan işleme ve EV izolasyon prosedürleri 15,16 Uluslararası Derneği tarafından önerilerine yol açtı, ancak optimum protokolü araştırmacılar arasında fikir birliği hiçbir vardır etti 12 kullanmak için. En sıkı kontrollü ön-analitik değişkenler doğru ve tekrarlanabilir veriler için çok önemli olduğunu, ancak, kabul ediyorum. AGH analiz etmek için, araştırmacılar 20,21 ve 22,23 lekeleme batı saçılma transmisyon elektron mikroskobu 17, taramalı elektron mikroskobu 18,19, atomik kuvvet mikroskobu, dinamik ışık da dahil olmak üzere, çeşitli yöntemler kullanmışlardır. FCM birçok araştırmacı 9,24 için seçim yöntemi iken - nedeniyle yüksek verim yetenekleri 26, FCM kullanarak EVs analizi olmuştur32 - nedeniyle boyutu ve ayrık olumlu nüfus 27 eksikliği oldukça zordur. Hücrelerin analizi ile karşılaştırıldığında, gerekli parçacık başına antijenlerin az sayıda nedeniyle yayılan 1) daha az floresans AGH sonuçların küçük boyutu ve post-leke yıkama 2) sınırlı fizibilite, arka plan floresan azaltmak için. Araştırmacılar arasında ortak zorluklar immunglobulin agrega 27,28 ve antikorların 29 kendini toplama kaynaklanan sinyalleri içerir. Ayrıca, uzun işlem süreleri ve mevcut protokollerin 33,34 birçok kişi tarafından kullanılan uzun yıkama / izolasyon prosedürleri onlara yüksek hacimli uygulamalar için idealdir daha az hale numunelerin az sayıda analiz etmek çok günlük zaman taahhütlerini gerektirir. Bazı araştırmacılar doğru bac değerlendirmek için böyle bir floresan eksi bir (FMO) ve izotiplerle yararsız olarak geleneksel olarak kullanılan FCM negatif kontroller render, tamamen bir yıkama adımı bırakmakkground floresan 30. Antikor agrega ve diğer non-kesecikler, bağlanmamış antikor giderilmesinde zorluk ve farkedilebilir olumlu nüfus eksikliğinden kaynaklanan sinyaller: Bizim protokolleri AGH uygun FCM analizi engelleyebilir üç ortak sorunları çözmek. Burada tarif edilen teknikler, genel olarak ticari preparatlarda bulunan antikor toplulukları ortadan sinyal-gürültü oranını artırmak ve eşiğe tespitini en aza indirir rasyonel bir şekilde kapı ayarlama yardımcı olacaktır. İki farklı algılama yöntemleri burada sunulmuştur: İkinci protokol yakalamak ve küçük AGH ve eksozomlar tespit etmek için bir boncuk-tabanlı bir yaklaşım kullanır iken ilk protokol, klinik örneklerin yüksek hacimli analiz etmek için özellikle uygundur bireysel algılama yöntemi kullanır.

<table><tbody><tr><td>LSR II benchtop flow cytometer</td><td>BD Biosciences</td><td></td><td>3-laser (20 mW Coherent Sapphire 488 nm blue, 25 mW Coherent Vioflame 405 nm violet, and 17 mW JDS Uniphase HeNe 633 nm red)</td></tr><tr><td>FACS Diva software&amp;nbsp;</td><td>BD Biosciences</td><td></td><td>PC version 6.0</td></tr><tr><td>FlowJo software&amp;nbsp;</td><td>Treestar US</td><td></td><td>Mac version 9.6.1 or PC version 7.6.5</td></tr><tr><td>Sphero Rainbow fluorescent particles</td><td>BD Biosciences</td><td>556298</td><td>used to adjust all channel voltages to maintain fluorescence intensity consistency&amp;nbsp;</td></tr><tr><td>Ultra Rainbow fluorescent particles&amp;nbsp;</td><td>Spherotech</td><td>URFP-10-5</td><td>used in addition to Megamix-Plus SSC beads to ensure EV gating consistency from batch to batch</td></tr><tr><td>Megmix-Plus SSC beads</td><td>Biocytex</td><td>7803</td><td>used to adjust FSC and SSC&amp;nbsp; voltages to maintain&amp;nbsp; consistency&amp;nbsp; between runs. Can also used to monitor flow rate and ajust flow rate dial in order to ensure that same flow rate is used in all runs</td></tr><tr><td>AbC Anti-Mouse Bead Kit</td><td>Life Technologies</td><td>A-10344</td><td>used for compensation controls &amp;amp; negative AbC beads used for beads-based method</td></tr><tr><td>Nonidet P-40 Alternative (NP-40) (CAS 9016-45-9)</td><td>Santa Cruz&amp;nbsp;</td><td>sc-281108</td><td>used in the individual detection method only to lyse samples after initial reading for use as negative controls. Stock may be diluted to 1:10 in PBS and stored in fridge for up to 1 month.</td></tr><tr><td>BD TruCOUNT Tubes</td><td>BD Biosciences</td><td>340334</td><td>used whenver absolute EV concentrations are needed</td></tr><tr><td>Ultrafree-MC, GV 0.22 &amp;micro;m Centrifugal Filter Units</td><td>Millipore&amp;nbsp;</td><td>UFC30GVNB</td><td>used to post-stain wash Evs and/or fractionate EVs based on size</td></tr><tr><td>Vacutainer glass whole blood tubes ACD-A</td><td>BD Biosciences</td><td>364606</td><td></td></tr><tr><td>Facs tubes 12x75 polystrene</td><td>BD Biosciences</td><td>352058</td><td></td></tr><tr><td>50 ml Reservoirs individually wrapped&amp;nbsp;</td><td>Phenix</td><td>RR-50-1s</td><td></td></tr><tr><td>Green-Pak pipet tips - 10 &amp;micro;l</td><td>Rainin</td><td>GP-L10S</td><td></td></tr><tr><td>Green-Pak pipet tips -200 &amp;micro;l&amp;nbsp;</td><td>Rainin</td><td>GP-L250S</td><td></td></tr><tr><td>Green -Pak pipet tips - 1,000 &amp;micro;l&amp;nbsp;</td><td>Rainin</td><td>GP-L1000S</td><td></td></tr><tr><td>Stable Stack L300 tips presterilized</td><td>Rainin</td><td>SS-L300S</td><td></td></tr><tr><td>Pipet-Lite&amp;nbsp;XLS 8 Channel LTS&amp;nbsp;Adjustable&amp;nbsp;Spacer&amp;nbsp;</td><td>Rainin</td><td>LA8-300XLS</td><td></td></tr><tr><td>96 well tissue culture plates</td><td>E&amp;amp;K Scientific</td><td>EK-20180</td><td></td></tr><tr><td>RPMI 1640 Media (without Hepes)</td><td>UCSF Cell Culture Facility</td><td>CCFAE001</td><td>media used for bead-based detection method</td></tr><tr><td>Dulbeccos PBS D-PBS, CaMg-free, 0.2 &amp;micro;m filtered</td><td>UCSF Cell Culture Facility</td><td>CCFAL003</td><td></td></tr><tr><td>Ultracentrifuge Tube, Thinwall, Ultra-Clear</td><td>BECKMAN COULTER INC</td><td>344058</td><td></td></tr><tr><td>PANEL I</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>CD3 PerCP-Cy5.5</td><td>Biolegend</td><td>344808</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD14 APC-Cy7</td><td>Biolegend</td><td>301820</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD16 V450</td><td>BD Biosciences</td><td>560474</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD28 FITC</td><td>biolegend</td><td>302906</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD152 APC</td><td>BD Biosciences</td><td>555855</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD19 A700</td><td>Biolegend</td><td>302226</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>PANEL II</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>CD41a PerCP-Cy5.5</td><td>BD Biosciences</td><td>340930</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD62L APC</td><td>Biolegend</td><td>304810</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD108 PE&amp;nbsp;</td><td>BD Biosciences</td><td>552830</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD235a FITC</td><td>biolegend</td><td>349104</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>PANEL III</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>CD11b PE-Cy7</td><td>Biolegend</td><td>301322</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD62p APC</td><td>Biolegend</td><td>304910</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD66b PE&amp;nbsp;</td><td>Biolegend</td><td>305106</td><td>2 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD15 FITC</td><td>exalpha</td><td>X1496M</td><td>5 &amp;micro;l</td></tr><tr><td>CD9 PE</td><td>Biolegend</td><td>555372</td><td></td></tr><tr><td>CD63 APC</td><td>Biolegend</td><td>353008</td><td></td></tr><tr><td>APC-Cy7 Ms IgG2a, &amp;kappa;</td><td>Biolegend</td><td>400230</td><td></td></tr></tbody></table>

techniques for the analysis of extracellular vesicles using flow cytometry

Hücre dışı veziküller (EVS) hücre-hücre iletişimine yüksek ilgili olan ve biyolojik süreçler çok çeşitli düzenlemeye yardımcı vücut sıvılarında bulunan küçük, zar-türevi veziküllerdir. Akış sitometrik (FCM) ile AGH analizi nedeniyle küçük boyutu ve ilgi belirteçleri için pozitif ayrık nüfus eksikliği bildiği zor olmuştur. Oldukça son on yılda geliştirilmiş EV analiz yöntemleri, hala devam eden bir çalışma vardır. Ne yazık ki, orada hiç kimse-boyut-uyan tüm protokol ve kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Birkaç farklı işleme AGH için teknikler ve bireysel algılama veya boncuk-tabanlı bir yaklaşım kullanarak AGH analiz için iki protokol burada sundu. rasyonel f yaygın ticari preparatlarda bulunan antikor agregatları bertaraf yardımcı olacaktır Burada tarif edilen yöntemler, artan bir sinyal-gürültü oranı ve ayar kapılarıeşiğe tespitini en aza indirir ashion. İkinci protokol yakalamak ve küçük AGH ve eksozomlar tespit etmek için bir boncuk tabanlı bir yaklaşım kullanır iken ilk protokol, klinik örneklerin yüksek hacimli analiz etmek için özellikle uygundur bireysel algılama yöntemi kullanır.

<html> Şekil 1, izolasyon ve boncuk esaslı yöntemi veya tek tek tespit metodu kullanarak EV&#39;lerin tespiti için genel işlem şemasını açıklar. FCM büyük AGH analiz için iyi çalışır ama çoğu sitometrelerinde bireysel eksozom gibi parçacıkları kadar küçük tespit yeteneğine sahip değildir kullanarak EVs Bireysel algılama. Bir tane bazlı yaklaşım, Tablo 1 &#39;de belirtildiği gibi küçük EVs, ancak, bu yöntem kullanılarak ilişkili dezavantajları vardı...

Watch this Scientific Journal Video about Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry at JoVE.com

Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry

Pek çok farklı yöntem akış sitometrik (FCM) ile hücre dışı veziküller (EVS) ölçülmesi için vardır. Kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Ölçüm EVs için iki protokoller bireysel algılama veya boncuk esaslı yaklaşım kullanılarak sunulmuştur.

Akım Sitometri Kullanımı Ekstrasellüler Veziküller Analizi Teknikleri

Extracellular Vesicles (EVs) are small, membrane-derived vesicles found in bodily fluids that are highly involved in cell-cell communication and help ...

techniques-for-analysis-extracellular-vesicles-using-flow

Research

JoVE Journal

Biology

23.1K Görüntüleme.  Blood Systems Research Institute.  Pek çok farklı yöntem akış sitometrik (FCM) ile hücre dışı veziküller (EVS) ölçülmesi için vardır. Kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Ölçüm EVs için iki protokoller bireysel algılama veya boncuk esaslı yaklaşım kullanılarak sunulmuştur. 

Video: Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry

Rapid Fluorescence-based Characterization of Single Extracellular Vesicles in Human Blood with Nanoparticle-tracking Analysis

Extracellular vesicles (EVs), including exosomes, are specialized membranous nano-sized vesicles found in bodily fluids that are constitutively released from many cell types and play a pivotal role in regulating cell-cell communication and a diverse range of biological processes. Many different methods for the characterization of EVs have been described. However, most of these methods have the disadvantage that the preparation and characterization of the samples are very time-consuming, or it is extremely difficult to analyze specific markers of interest due to their small size and due to the lack of discrete populations. While methods for analysis of EVs have been considerably improved over the last decade, there is still no standardized method for characterization of single EVs. Here, we demonstrate a semi-automated method for characterization of single EVs by fluorescence-based nanoparticle-tracking analysis. The protocol that is presented addresses the common problem of many researchers in this field and provides the complete workflow for rapid isolation of EVs and characterization with PKH67, a general cell membrane linker, as well as with specific surface markers such as CD63, CD9, vimentin, and lysosomal-associated membrane protein 1 (LAMP-1). The presented results show a high level of reproducibility, as confirmed by other methods, such as Western blotting. In the conducted experiments, we exclusively used EVs isolated from human serum samples, but this method is also suitable for plasma or other body fluids and can be adjusted for characterization of EVs from cell culture supernatants. Irrespective of the future progress of research on EV biology, the protocol that is presented here provides a rapid and reliable method for rapid characterization of single EVs with specific markers.

In this protocol, we describe the complete workflow for rapid isolation of extracellular vesicles from human whole blood and characterization of specific markers by fluorescence-based nanoparticle-tracking analysis. The presented results show a high level of reproducibility and can be adjusted to cell culture supernatants.

İnsan kanı nanopartikül izleme analizi ile tek hücre dışı veziküller floresans tabanlı hızlı karakterizasyonu

Extracellular vesicles (EVs), including exosomes, are specialized membranous nano-sized vesicles found in bodily fluids that are constitutively released ...

Biyokimya

Optimization of Flow Cytometric Sorting Parameters for High-Throughput Isolation and Purification of Small Extracellular Vesicles

Small extracellular vesicles (sEV) can be released from all cell types and carry protein, DNA, and RNA. Signaling molecules serve as indicators of the physiological and pathological state of a cell. However, there is no standard method for sEV isolation, which prevents downstream biomarker identification and drug intervention studies. In this article, we provide a detailed protocol for the isolation and purification of 50-200 nm sEV by a flow cell sorter. For this, a 50 &#181;m nozzle and 80 psi sheath fluid pressure were selected to obtain a good sorting rate and stable side stream. Standard sized polystyrene microspheres were used to locate populations of 100, 200, and 300 nm particles. With additional optimization of the voltage, gain, and forward scatter (FSC) triggering threshold, the sEV signal could be separated from the background noise. These optimizations provide a panel of critical sort settings that enables one to obtain a representative population of sEV using FSC vs. side scatter (SSC) only. The flow cytometry-based isolation method not only allows for high-throughput analysis but also allows for synchronous classification or proteome analysis of sEV based on the biomarker expression, opening numerous downstream research applications.

This protocol provides a rapid and size-specific isolation method for small extracellular vesicles by optimizing the size of the air spray nozzle, sheath fluid pressure, sample flow pressure, voltage, gain, and triggering threshold parameters.

Yüksek verimli izolasyon ve küçük hücre dışı veziküllerin saflaştırılması için akış sitometrik sıralama parametrelerinin optimizasyonu

Small extracellular vesicles (sEV) can be released from all cell types and carry protein, DNA, and RNA. Signaling molecules serve as indicators of the ...

Flow Virometry to Analyze Antigenic Spectra of Virions and Extracellular Vesicles

Cells release small extracellular vesicles (EVs) into the surrounding media. Upon virus infection cells also release virions that have the same size of some of the EVs. Both virions and EVs carry proteins of the cells that generated them and are antigenically heterogeneous. In spite of their diversity, both viruses and EVs were characterized predominantly by bulk analysis. Here, we describe an original nanotechnology-based high throughput method that allows the characterization of antigens on individual small particles using regular flow cytometers. Viruses or extracellular vesicles were immunocaptured with 15 nm magnetic nanoparticles (MNPs) coupled to antibodies recognizing one of the surface antigens. The captured virions or vesicles were incubated with fluorescent antibodies against other surface antigens. The resultant complexes were separated on magnetic columns from unbound antibodies and analyzed with conventional flow cytometers triggered on fluorescence. This method has wide applications and can be used to characterize the antigenic composition of any viral- and non-viral small particles generated by cells in vivo and in vitro. Here, we provide examples of the usage of this method to evaluate the distribution of host cell markers on individual HIV-1 particles, to study the maturation of individual Dengue virions (DENV), and to investigate extracellular vesicles released into the bloodstream.

Viruses or extracellular vesicles were immunocaptured with 15 nm magnetic nanoparticles coupled to antibodies recognizing surface antigens. The captured virions or vesicles were labeled with fluorescent antibodies against other surface antigens. The resultant complexes were separated in high magnetic field and analyzed with conventional flow cytometers triggered on fluorescence.

Virionlar antijenik Spectra ve ekstrasellüler veziküllerin Analiz Virometry Akış

Cells release small extracellular vesicles (EVs) into the surrounding media. Upon virus infection cells also release virions that have the same size of ...

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Flow Cytometric Analysis of Extracellular Vesicles from Cell-conditioned Media

Flow cytometry (FC) is the method of choice for semi-quantitative measurement of cell-surface antigen markers. Recently, this technique has been used for phenotypic analyses of extracellular vesicles (EV) including exosomes (Exo) in the peripheral blood and other body fluids. The small size of EV mandates the use of dedicated instruments having a detection threshold around 50-100 nm. Alternatively, EV can be bound to latex microbeads that can be detected by FC. Microbeads, conjugated with antibodies that recognize EV-associated markers/Cluster of Differentiation CD63, CD9, and CD81 can be used for EV capture. Exo isolated from CM can be analyzed with or without pre-enrichment by ultracentrifugation. This approach is suitable for EV analyses using conventional FC instruments. Our results demonstrate a linear correlation between Mean Fluorescence Intensity (MFI) values and EV concentration. Disrupting EV through sonication dramatically decreased MFI, indicating that the method does not detect membrane debris. We report an accurate and reliable method for the analysis of EV surface antigens, which can be easily implemented in any laboratory.

The protocol describes a reproducible method designed for use with cell culture supernatants to detect surface epitopes on small extracellular vesicles (EV). It utilizes specific EV immunoprecipitation using beads coupled with antibodies that recognize surface antigen CD9, CD63, and CD81. The method is optimized for downstream flow cytometry analysis.

Hücre şartına ortamdan hücre dışı veziküller sitometrik analizinde akışı

Flow cytometry (FC) is the method of choice for semi-quantitative measurement of cell-surface antigen markers. Recently, this technique has been used for ...

Biyoloji

Size Determination and Phenotypic Analysis of Urinary Extracellular Vesicles using Flow Cytometry

Extracellular vesicles, EVs, are a heterogeneous complex of lipidic membranes, secreted by any cell type, in any fluid such as urine. EVs can be of different sizes ranging from 40-100 nm in diameter such as in exosomes to 100-1000 nm in microvesicles. They can also contain different molecules that can be used as biomarkers for the prognosis and diagnosis of many diseases. Many techniques have been developed to characterize these vesicles. One of these is flow cytometry. However, there are no existing reports to show how to quantify the concentration of EVs and differentiate them by size, along with biomarker detection. This work aims to describe a procedure for the isolation, quantification, and phenotypification of urinary extracellular vesicles, uEVs, using a conventional cytometer for the analysis without any modification to its configuration. The method&#39;s limitations include staining a maximum of four different biomarkers per sample. The method is also limited by the amount of EVs available in the sample. Despite these limitations, with this protocol and its subsequent analysis, we can obtain more information on the enrichment of EVs markers and the abundance of these vesicles present in urine samples, in diseases involving kidney and brain damage.

This protocol describes a method for the isolation of urinary extracellular vesicles, uEVs, from healthy human donors and their phenotypic characterization by the size and surface marker expression using flow cytometry.

Extracellular vesicles, EVs, are a heterogeneous complex of lipidic membranes, secreted by any cell type, in any fluid such as urine. EVs can be of ...

Single Extracellular Vesicle Transmembrane Protein Characterization by Nano-Flow Cytometry

Single particle characterization has become increasingly relevant for research into extracellular vesicles, progressing from bulk analysis techniques and first-generation particle analysis to comprehensive multi-parameter measurements such as nano-flow cytometry (nFCM). nFCM is a form of flow cytometry that utilizes instrumentation specifically designed for nano-particle analysis, allowing for thousands of EVs to be characterized per minute both with and without the use of staining techniques. High resolution side scatter (SS) detection allows for size and concentration to be determined for all biological particles larger than 45 nm, while simultaneous fluorescence (FL) detection identifies the presence of labeled markers and targets of interest. Labeled subpopulations can then be described in quantitative units of particles/mL or as a percentage of the total particles identified by side scatter.
Here, EVs derived from conditioned cell culture media (CCM) are labeled with both a lipid dye, to identify particles with a membrane, and antibodies specific for CD9, CD63, and CD81 as common EV markers. Measurements of comparison material, a concentration standard and a size standard of silica nanospheres, as well as labeled sample material are analyzed in a 1-minute analysis. The software is then used to measure the concentration and size distribution profile of all particles, independent of labeling, before determining the particles that are positive for each of the labels.
Simultaneous SS and FL detection can be utilized flexibly with many different EV sources and labeling targets, both external and internal, describing EV samples in a comprehensive and quantitative manner.

The latest generation of EV characterization tools are capable of single EV analysis across multiple parameters simultaneously. Nano-flow cytometry measures all biological particles larger than 45 nm without labeling and identifies specific characteristics of subpopulations by a variety of fluorescent labeling techniques.

Nano-Flow Sitometri ile Tek Hücre Dışı Vezikül Transmembran Protein Karakterizasyonu

Single particle characterization has become increasingly relevant for research into extracellular vesicles, progressing from bulk analysis techniques and ...

Isolation and Analysis of Traceable and Functionalized Extracellular Vesicles from the Plasma and Solid Tissues

Circulating and tissue-resident extracellular vesicles (EVs) represent promising targets as novel theranostic biomarkers, and they emerge as important players in the maintenance of organismal homeostasis and the progression of a wide spectrum of diseases. While the current research focuses on the characterization of endogenous exosomes with the endosomal origin, microvesicles blebbing from the plasma membrane have gained increasing attention in health and sickness, which are featured by an abundance of surface molecules recapitulating the membrane signature of parent cells. Here, a reproducible procedure is presented based on differential centrifugation for extracting and characterizing EVs from the plasma and solid tissues, such as the bone. The protocol further describes subsequent profiling of surface antigens and protein cargos of EVs, which are thus traceable for their derivations and identified with components related to potential function. This method will be useful for correlative, functional, and mechanistic analysis of EVs in biological, physiological, and pathological studies.

The present protocol describes a method to extract extracellular vesicles from the peripheral blood and solid tissues with subsequent profiling of surface antigens and protein cargos.

Plazma ve Solid Dokulardan İzlenebilir ve İşlevselleştirilmiş Hücre Dışı Veziküllerin İzlenmesi ve Analizi

Circulating and tissue-resident extracellular vesicles (EVs) represent promising targets as novel theranostic biomarkers, and they emerge as important ...

Dışa Aktarma Mekanizmalarını Anlamak için Bir Akış Sitometrisi Protokolü

Tracking miRNA Release into Extracellular Vesicles using Flow Cytometry

Extracellular vesicles (EVs) are important mediators of cellular communication that are secreted by a variety of different cells. These EVs shuttle bioactive molecules, including proteins, lipids, and nucleic acids (DNA, mRNAs, microRNAs, and other noncoding RNAs), from one cell to another, leading to phenotypic consequences in the recipient cells. Of all the various EV cargo, microRNAs (miRNAs) have garnered a great deal of attention for their role in shaping the microenvironment and in educating recipient cells because of their clear dysregulation and abundance in EVs. Additional data indicates that many miRNAs are actively loaded into EVs. Despite this clear evidence, research on the dynamics of export and mechanisms of miRNA sorting is limited. Here, we provide a protocol using flow cytometry analysis of EV-miRNA that can be used to understand the dynamics of EV-miRNA loading and identify the machinery involved in miRNA export. In this protocol, miRNAs predetermined to be enriched in EVs and depleted from donor cells are conjugated to a fluorophore and transfected into the donor cells. The fluorescently tagged miRNAs are then verified for loading into EVs and depletion from cells using qRT-PCR. As both a transfection control and a tool for gating the transfected population of cells, a fluorescently labeled cellular RNA (cell-retained and EV-depleted) is included. Cells transfected with both the EV-miRNA and cell-retained-miRNA are evaluated for fluorescent signals over the course of 72 h. The fluorescence signal intensity specific for the EV-miRNAs diminishes rapidly compared to the cell-retained miRNA. Using this straightforward protocol, one could now assess the dynamics of miRNA loading and identify various factors responsible for loading miRNAs into EVs.

Yazar Spotlight: Kanser İlerlemesinde Hücre Dışı Veziküllere MikroRNA Yükleme Mekanizmalarının Araştırılması 

Here, we describe a straightforward protocol that enables in vitro assessment of the abundance of fluorescently labeled microRNAs to study the dynamics of microRNA packaging and export into extracellular vesicles (EVs).

Akış Sitometrisi Kullanarak Hücre Dışı Veziküllere miRNA Salınımının İzlenmesi

Extracellular vesicles (EVs) are important mediators of cellular communication that are secreted by a variety of different cells. These EVs shuttle ...

Akım Sitometri Kullanımı Ekstrasellüler Veziküller Analizi Teknikleri

Özet

Daha Fazla Video Keşfet

Bu videodaki bölümler

İnsan kanı nanopartikül izleme analizi ile tek hücre dışı veziküller floresans tabanlı hızlı karakterizasyonu

Yüksek verimli izolasyon ve küçük hücre dışı veziküllerin saflaştırılması için akış sitometrik sıralama parametrelerinin optimizasyonu

Virionlar antijenik Spectra ve ekstrasellüler veziküllerin Analiz Virometry Akış

Hücre şartına ortamdan hücre dışı veziküller sitometrik analizinde akışı

Size Determination and Phenotypic Analysis of Urinary Extracellular Vesicles using Flow Cytometry

Nano-Flow Sitometri ile Tek Hücre Dışı Vezikül Transmembran Protein Karakterizasyonu

Plazma ve Solid Dokulardan İzlenebilir ve İşlevselleştirilmiş Hücre Dışı Veziküllerin İzlenmesi ve Analizi

Akış Sitometrisi Kullanarak Hücre Dışı Veziküllere miRNA Salınımının İzlenmesi

Akış Sitometrisi Kullanarak Hücre Dışı Veziküllere miRNA Salınımının İzlenmesi

Akış Sitometrisi Kullanarak Hücre Dışı Veziküllere miRNA Salınımının İzlenmesi