Yazarlar enstrüman ayarları sitometrede akışı ile yaptığı yardım için kan Sistemler Araştırma Enstitüsü&#39;nden Dale Hirschkorn teşekkür etmek istiyorum. NIH tarafından desteklenen bu çalışma HL095470 ve U01 HL072268 ve DoD sözleşmeleri W81XWH-10-1-0023 ve W81XWH-2-0028 verir.

Not: Aşağıdaki protokoller, insan refahı için tüm kurumsal, ulusal ve uluslararası kurallara uygun olarak yapılmıştır. Bütün insan konu örnekleri kurumsal inceleme kurulu (KİK) -onaylı protokol kapsamında ve konuların bilgilendirilmiş rızası ile test edildi. 1. YÖNTEM A: Bireysel Algılama Yöntemi AGH Kan Örneği / İzolasyon 1.1) İşleme <ol><li> Aşağıdaki 2 adımlı diferansiyel santrifüj protokolü kullanılarak ACD-Solüsyon A ya da diğer halinde, uygun bir antikoagülan ve proses (30 dakika içinde max), 1.5 ml ihtiva eden iki adet 10 ml&#39;lik cam tüplere verici / hastadan alınan kan alımı. NOT: Bu protokol, çekilen kan Birleştirilen ~ 17 ml den yaklaşık 10 ml trombosit bakımından yoksul plazma (PPP), bir yol açacaktır. Daha fazla veya daha az, PPP gerekirse, toplanan kan tüplerin sayısı uygun şekilde ayarlanabilir. </li><li> Oda sıcaklığında 10 dakika boyunca 1500 x g&#39;de santrifüj örnekleribuffy coat ve kırmızı hücrelerin plazma ayırmak için. Buffy coat ve kırmızı hücreleri içeren alt katmanları rahatsız etmemek için dikkatli olmak, 1.5 ml santrifüj tüplerine plazma süpernatant 1.2 ml hacimde aktarın. </li><li> Trombosit ve büyük hücre parçalarını almak için oda sıcaklığında 10 dakika boyunca 13,000 x g&#39;de dönerler. Dikkatle pelet bozulmasını önleyen ve yeni bir tüpe PPP eklemek için 200 ul geride bırakarak PPP aktarın. </li><li> Bu noktada, daha sonra analiz için iki yıla kadar (bir genel bakış için 1A bakınız Şekil) -80 ° C de analiz veya yeni bir 1.5 ml&#39;lik santrifüj tüplerine 1.0 mi alikotlar içinde transfer ve mağaza hemen PPP kullanın. </li><li> Saflaştınldı AGH bir ultra santrifüj tüpüne fonksiyonel deneylerde, transferi PPP 6 mi için gerekli ve 0.2 um filtreden fosfat tamponlu tuzlu su içinde 28 ml (PBS) ekleyin ise. Bir sallanan kepçeli rotor ile donatılmış bir ultrasantrifüj kullanarak, oda sıcaklığında 100,000 x g&#39;de 60 dakika süre ile spin. Aspire süpernatant ve tekrar süspansiyon EV pel1.5 ml medyada bildirin. NOT: En yüksek tekrarlanabilirlik için, kan örnekleri vericiden itibaren sürekli sürede işleme alınmalıdır. EV izolasyon yönteminin herhangi bir varyasyon ölçüde tespit AGH sayısını ve türünü etkileyebilir. </li></ol> 1.2) Analiz için Örnekleri Hazırlama NOT: Bu noktadan itibaren, adım 3 panellerde 14 belirteçleri için 12 numune analiz için yüksek verimlilik protokolü açıklar. Ancak, antikorların ve diğer kombinasyonları burada kullanılabilir; Protokol ilgilenilenlerdir için önerilen belirteçler ile ikame diğer EV popülasyonları çalışma için adapte edilebilir. <ol><li> 37 ° C&#39;de ve çözülme (-80 ° C &#39;de depolandığı takdirde) dondurucu 12 örnek çıkarın. </li><li> Pipet içeriği yukarı ve aşağı birkaç kez karıştırın. Her bir örnekten 320 ul çıkarın ve 96 gözlü bir levhanın üst üste ekleyin. NOT: Bir genişlik ayarlanabilir çok iyi pipetlemeyin bu ve eşek boyunca birçok diğer adımlar için son derece yararlı olanay, bir kerede birden fazla örnekleri analiz özellikle. </li></ol> 1.3) Boyama EV Örnekleri <ol><li> Boyamadan önce, olumlu sinyaller neden olabilir, agrega kaldırmak için tüm antikorları (Abs) filtre. <ol><li> Ab karışımın tümü filtreden geçtikten Kombine antikorlar 2 dakika boyunca oda sıcaklığında sabit bir açı tek hızlı santrifüj (~ 750 xg) ile ayrı bir 0.22 um santrifüj filtre tüpleri ve santrifüj içine 3 panellerin her kullanılacak kadar veya ve herhangi bir antikorun sıvı filtre yüzeyi üzerinde kalır. Mağaza Ab iki hafta buzdolabında kokteyller ama tekrar filtre kullanmadan önce her zaman. </li></ol></li><li> Iyi aralıksız 2&#39;de her süzüldü antikor karışımının uygun miktarda (ör Her Ab 2 ul ile boyanır masasında örnekler, bu yüzden, süzüldü antikor kokteyli 12 ul&#39;lik toplam 2 satır için her bir oyuğa ilave edilir). Önerilen plaka haritanın bir anahat için 1B Bakınız Şekil. Bu ek tekrarlayınDaha fazla paneller çalıştırmak eğer altındaki satırlara s (burada, iyi 4 satır için Panel III kokteyli 3 ve 11 ul / satır 8 ul / kuyu Panel II kokteyl ekleyin; özel paneli bilgileri için malzemeler Listesi&#39;ne bakınız). </li><li> Çok kanallı pipet kullanarak, yukarı ve aşağı satır 1 PPP örnekleri karıştırın ve 2. karıştırın yukarı ve aşağı satır kuyulara satır 1 kuyulardan 100 ul aktarın. 30 dakika boyunca 4 ° C &#39;de satır 3 ve 4 inkübasyona sıra 1 den 100 ul transfer değiştirme uçları ve tekrar. </li></ol> 1.4) Yıkama OG Örnekleri <ol><li> Biyolojik güvenlik kabini 96-kuyu 4 ° C plaka ve transferi çıkarın. / Oyuk satır 6-8 PBS 220 ul, bir çok kanallı pipet kullanarak (/ durulama lekeli PPP içeren kuyu yıkanması için kullanılmak üzere). </li><li> Antikorların 3 panel, 12 x 3 = 36 filtre tüpleri ile, 12 numuneler için genişlik ayarlı çok kanallı pipet (kullanarak ön-etiketli santrifüj filtre tüpleri iyi her içeriğini aktarmak olacak) gerekli. Aynı ipuçları kullanarak, yıkama satırlardan PBS 200 ul kaldırmak ve PPP sadece çıkarıldığı gelen kuyulara ekleyin. </li><li> Kuyu durulayın ve PPP önce ilave edildiği için aynı filtreler durulama çözüm aktarmak için aşağı yukarı karıştırın ve. Santrifüj filtre yakın üstleri. Değişim ipuçları. </li><li> Tüm lekeli PPP örnekleri santrifüj filtre kendi durulama çözümleri ile birlikte devredilmiştir kadar kalan lekeli örnekleri ile bu işlemi tekrarlayın. </li><li> Oda sıcaklığında 3 dakika boyunca 850 xg&#39;de sabit rotor santrifüj ve spin santrifüj filtre aktarın. NOT: Hiçbir sıvı filtre üstleri kalır emin olun. Santrifüj işleminden sonra, filtre, görünür sıvı tabaka üstünde kalan &quot;kuru&quot; olarak görünmelidir. Olası iken, bazı PPP örnekleri etkin bir filtre aracılığıyla taşımak için daha uzun bir santrifüj süresi gerekebilir. </li><li> Santrifüj filtre tüpleri çıkarın ve biyolojik güvenlik kabini dönmek.Çok kanallı bir pipet kullanılarak, PBS, 300 ul filtre tepelerini yeniden süspanse edin. Yeniden süspanse içerikler derhal FCM analizi için tüpler etiketli önceden transfer. NOT: Bu örnek-örnek varyasyon önlemek için numuneler arasında tutarlı pipet piston çöküntü kuvvet ve sayısını tutmak çok önemlidir. Bu ideal yukarı ve belirli bir hacme aşağı pipetlemeyin için programlanmış bir elektronik pipet kullanılarak yapılmalıdır (örn, 280 ul), her numune için zaman (örneğin, 8 kez) bir tam sayısı. </li></ol> 1.5) Sitometresi Kur <ol><li> FCM yazılımını açın. Kurulumu deneme (üreticinin talimatlarına) enstrüman kurulum boncuklar kullanarak günlük alet kalibrasyon ve kurulumu gerçekleştirmek için önce. </li><li> EV örnekleri birden fazla antikor ile boyandı ve olan varsa birden fluorochromes aşağıdaki gibi tazminat değerlerini hesaplamak, bir kerede ölçülecek gibidir: <ol><li> Ön tazminat boncuk 2 damla ekleyin-etiketli borular (her bir florokrom-eşlenik antikor için 1 tüp) ve antikorun önerilen miktarını ekleyin. Lekesiz kompanzasyon kontrolü olarak kullanmak için başka bir tüp negatif tazminat boncuk 2 damla ekleyin. </li><li> 30 dakika boyunca 4 ° C&#39;de inkübe edin PBS içinde 400 ul PBS ve tekrar süspansiyon ile yıkayın. </li><li> Cihaz ile birlikte yazılım sitometrede akışını kullanarak, her tazminat tüpü çalıştırmak ve 5-on günlük bir ölçekte yaklaşık 10 4 her zirveye yerleştirmek için floresan gerilimler ayarlayın. Floresan tepe diğer tüm kanallara kıyasla kendi floresan kanalda yüksek (parlak) olduğundan emin olun ve gerekirse tekrar floresan parametrelerin gerilimleri ayarlayın. Her biri ayrı ayrı boyanmış abone ol tüp çalıştırın ve tüp başına en az 5.000 olayları yakalamak. </li><li> Sonra seçin &quot;Deney&quot; sekmesini seçin &quot;Telafisi,&quot; daha sonra tüm örnekler için tazminat değerlerini uygulamak için &quot;Hesapla Telafisi&quot; seçeneğini seçin. </li></ol></li><li&gt; Ölçek log ve her biri için sitometresindeki (FSC = 200 ve SSC = 200) tarafından izin verilen en düşük eşik seçmek için ileri dağılım (FSC) ve yan dağılım (SSC) gerilim parametrelerini ayarlayın. </li><li> 0.22 mikron filtreli PBS bir tüp çalışırken, (yani, sadece olay hızı 5 olayları / sn aşan hangi gerilim eşiğinin altında) arka plan gürültüsü çoğunluğunu dışlamak en yüksek değerlere FSC &amp; SSC gerilimleri ayarlayın. </li><li> Gerekirse, PBS içinde seyreltilmiş 1.0 um boncuklar, - Daha sonra, 0.2 mikron ihtiva eden bir tüp çalıştırın. FCS SSC vs arsa, um 0.2 ila 1.0 olayları yakalamak için boncuk nüfus etrafında bir kapı çizin. Alternatif olarak, bir SSC-H histogramda, 1.0 mikron boncuk daha küçük tüm olayları kapsar bir kapı çizin. </li><li> &quot;Lo&quot; (yaklaşık 8-12 ul / dk) sitometresinin akış hızını ayarlayın. Boncuk tüp kullanarak (ya da boncuk bilinen bir konsantrasyonu içeren diğer tüp) arifesinde kadar sitometresindeki akış hızı kadranını ayarlayınnt oranı yaklaşık 200 olay / sn ulaşır. Aynı akış hızında tüm numune tüpleri okuyun ve bu akım hızları koşular arasında tutarlı kalmasını sağlamak için gelecek deneylerde aynı boncuk konsantrasyonunu kullanın. </li><li> PBS içinde seyreltilmiş gökkuşağı floresan parçacıkların bir tüp çalıştırın. 5.000 olayları Edinme. FSC, SSC, ve her renk kanalı için ortalama yoğunluk değerleri kaydedin. Bu floresan yoğunlukları deneyler arasında tutarlı kalmasını sağlamak için gelecek deneylerde gerilimleri ayarlamak için bu değerleri kullanın. </li></ol> 1.6) Örnek Okuma <ol><li> &quot;Lo&quot; (yaklaşık 8-12 ul / dk) sitometresinin akış hızını ayarlayın ve tam olarak 1 veya 2 dakika boyunca her örnek çalıştırın. </li><li> Ilk okuma sonra, NP-40 aşağı her numune, pipet yukarı ve% 10 20 ul ekleyin ve tespit pozitif olayların çıkarma izin zaman aynı miktarda (1 ya da 2 dk) için yeniden okumak eşit bir zaman dilimi içinde lize örnek. NOT: Bu son derece impNumuneler pipet yerine bir vorteks ile karıştırılabilir ki ortant. Bizim tecrübelerimize göre, vorteksleme EV-taklit olumlu olaylara yol açan, bazı antikorların kendine gelmesine neden olabilir. </li><li> Bir kez tüm örnekler verme ayrı bir dosya içine tüm dosyaları .fcs FCM analizi yazılımı kullanılarak ileri analiz için kullanılacak, okundu. </li></ol> 1.7) Veri Analizi <ol><li> FCM analiz yazılımı açın. Yeni bir deneme dosyası içine .fcs tüm dosyaları içe. </li><li> Boncuklar sadece tüp açın. SSC-A arsa vs FSC-A&#39;da, etrafında 0.2 mikron ile 1.0 mikron arasında büyüklükte tüm boncuklar bir kapı çizin. Bu EV kapısıdır. Sürükle tüm numunelerin eklemek için. </li><li> Negatif kontrol olarak lize örnekleri kullanarak, kullanılan Her florasan kanalına eşiğe kenarında kapıları çizin. Her gelen olmayan lize numunenin EV kapısı içine floresan kapıları sürükleyin. NOT: Bu noktada da ikili floresan iki parametre araziler incelemek yararlı olacaktır. Roket şekilleri içindebelirteçler alakasız hücre tipleri üzerinde ikamet bilinmektedir özellikle çift pozitif kadran toplama veya diğer kabarcık taklit olaylardan eserin göstergesi olabilir (Şekil 8). </li><li> Her bir floresan markör için, sigara lize numunede olay sayısı ile ilgili lize numunede olay sayısını çıkarılır. İsteğe bağlı olarak,% pozitif değerleri almak için olmayan lize EV kapısının içindeki EVs toplam sayısına göre bu sayı bölün. </li></ol> 2. YÖNTEM B: Boncuk Yöntemi AGH Kan Örneği / İzolasyon 2.1) İşleme <ol><li> (Bölüm 1.1) Yöntem A&#39;da tarif edilen kan işleme yöntemine bakınız. </li></ol> 2.2) Analiz için Örnekleri Hazırlama <ol><li> İstenirse, eksozom ve microvesicles içine PPP veya ultrasantifrüjlenmiş AGH damıtmak. 0.22 mikron santrifüj filtreler PPP veya ultrasantifrüjlenmiş AGH 250 ul ekleyin ve 750 x sabit rotor santrifüj ve spin aktarmakoda sıcaklığında 2 dakika boyunca örn. NOT: Hiçbir sıvı filtre üstleri kalır emin olun. Santrifüj işleminden sonra, filtre, görünür sıvı tabaka üstünde kalan &quot;kuru&quot; olarak görünmelidir. Olası iken, bazı örnekler sıvı etkili bir filtre üzerinden hareket etmek için biraz daha uzun santrifüj süresi gerekebilir. </li><li> 2 ml kaplanmamış 6 mikron polistiren boncuklar (örneğin, negatif ABC boncuk) RPMI medya ile 2x ve tekrar süspansiyon yıkayın. Her bir FACS tüpü 6,000 boncuk ekleyin. Negatif kontrol tüpüne, boncuk tek başına RPMI medya 400 ul ekleyin. Diğer tüm tüpler için, PPP veya ultrasantifrüjlenmiş AGH (veya fraksiyonları) 200 ul ve RPMI medya 200 ul ekleyin. </li><li> Ortam ile 400 ul bütün tüpler son hacim ayarlama ve bir çalkalayıcı üzerinde 4 ° C&#39;de gece boyunca inkübe edilir. </li><li> Ertesi sabah, ortam, 2 ml ile boncuk yıkayın. Süpernatant aspire. </li><li> 4 ve 3 saat boyunca ortam (400 ul) içinde% 5 sığır serum albumin (BSA) ile bloke# 176, bir çalkalayıcı üzerinde ° C. </li><li> Ortam, 2 ml ile boncuk yıkayın. Ortam 100 ul aspire ve tekrar süspansiyon pelet. </li></ol> 2.3) Boyama EV Örnekleri <ol><li> Tüm antikorları Filtre. Yöntem A&#39;da kullanılan aynı antikor panelleri kullanarak ya da eğer arzu edilirse, sürece kendi fluorokromun birbirleriyle uyumlu olarak antikorlar, farklı bir kombinasyon yaratmak. </li><li> Kombine Tüm antikorlar, bir 0.22 um filtre santrifüj tüpüne tek bir panelde kullanılır. 2 dakika boyunca ya da Ab karışımın tümü kadar sabit açılı tek hızlı santrifüj kullanılarak santrifüj filtreden geçirilir ve hiçbir antikor sıvı filtre yüzeyi üzerinde kalır. </li><li> Tüm tüplere süzüldü antikor kokteylinin uygun hacimde ilave edin ve 4 ° C&#39;de 30 dakika inkübe edilir. </li><li> Sitometrede akış medya 400 ul medya, tekrar süspansiyon 2 ml boncuk yıkayın ve hemen çalıştırın (ya da aynı gün içinde). </li></ol> 2.4) Kurulum ve Numune Okuma Sitometrenin<ol><li> FCM yazılımını açın. Kurulumu deneme (üreticinin talimatlarına) enstrüman kurulum boncuklar kullanarak günlük alet kalibrasyon ve kurulumu gerçekleştirmek için önce. </li><li> EV örnekleri birden fazla antikor ile boyandı ve olan varsa birden fluorochromes aşağıdaki gibi tazminat değerlerini hesaplamak, bir kerede ölçülecek gibidir: <ol><li> Tüpler etiketlenmiş önceden tazminat boncuk 2 damla (her florokrom-eşlenik antikor için 1 tüp) ekleyin ve antikorun önerilen miktarını ekleyin. Lekesiz kompanzasyon kontrolü olarak kullanmak için başka bir tüp negatif tazminat boncuk 2 damla ekleyin. 30 dakika boyunca 4 ° C&#39;de inkübe edin PBS içinde 400 ul PBS ve tekrar süspansiyon ile yıkayın. </li><li> FCM yazılımı kullanarak, her tazminat tüpü çalıştırmak ve 5-on günlük bir ölçekte yaklaşık 10 4 her zirveye yerleştirmek için floresan gerilimler ayarlayın. Floresan tepe diğer tüm kanallara kıyasla kendi floresan kanalda (parlak) yüksek olduğundan emin olun veGerekirse tekrar floresan parametrelerin gerilimleri ayarlayın. Her biri ayrı ayrı boyanmış abone ol tüp çalıştırın ve tüp başına en az 5.000 olayları yakalamak. </li><li> Sekmesini seçin &quot;Deney,&quot; sonra &quot;Tazminat,&quot; sonra &quot;Hesapla Tazminat&quot; tüm örnekler için tazminat değerlerini uygulamak için. </li></ol></li><li> Ölçek log ve her biri için sitometresindeki (FSC = 200 ve SSC = 200) tarafından izin verilen en düşük eşik seçmek için FSC ve SSC gerilim parametrelerini değiştirin. </li><li> Tekli boncuk nüfus Run örnekleri, kapı ve bu kapıdan 2.000 olayları kazanır. Export .fcs dosyaları. </li><li> Dosyaları .fcs analiz FCM analiz yazılımı kullanın. Tekli boncuklar üzerinde Kapısı. Her florokrom için geometrik ortalama floresan yoğunluğu (MFI) hesaplayın ve negatif kontrol MFI ile karşılaştırın. </li></ol>

<ol>
	<li>Andaloussi, S., M&#228;ger, I., Breakefield, X. O., Wood, M. J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+vesicles:+biology+and+emerging+therapeutic+opportunities.">Extracellular vesicles: biology and emerging therapeutic opportunities.</a> Nature Reviews Drug Discovery. 12 (5), 347-357 (2013).</li><li>Sugawara, A., Nollet, K. E., Yajima, K., Saito, S., Ohto, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preventing+platelet-derived+microparticle+formation--and+possible+side+effects-with+prestorage+leukofiltration+of+whole+blood.">Preventing platelet-derived microparticle formation--and possible side effects-with prestorage leukofiltration of whole blood.</a> Archives of Pathology &amp; Laboratory Medicine. 134 (5), 771-775 (2010).</li><li>Th&#233;ry, C., Ostrowski, M., Segura, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Membrane+vesicles+as+conveyors+of+immune+responses.">Membrane vesicles as conveyors of immune responses.</a> Nature Reviews Immunology. 9 (8), 581-593 (2009).</li><li>Mause, S. F., Weber, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microparticles+Protagonists+of+a+Novel+Communication+Network+for+Intercellular+Information+Exchange.">Microparticles Protagonists of a Novel Communication Network for Intercellular Information Exchange.</a> Circulation Research. 107 (9), 1047-1057 (2010).</li><li>Bouvy, C., Gheldof, D., Chatelain, C., Mullier, F., Dogne, J. -. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contributing+role+of+extracellular+vesicles+on+vascular+endothelium+haemostatic+balance+in+cancer.">Contributing role of extracellular vesicles on vascular endothelium haemostatic balance in cancer.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 3, (2014).</li><li>Hood, J. L., San, R. S., Wickline, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exosomes+Released+by+Melanoma+Cells+Prepare+Sentinel+Lymph+Nodes+for+Tumor+Metastasis.">Exosomes Released by Melanoma Cells Prepare Sentinel Lymph Nodes for Tumor Metastasis.</a> Cancer Research. 71 (11), 3792-3801 (2011).</li><li>Gatti, S., Bruno, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microvesicles+derived+from+human+adult+mesenchymal+stem+cells+protect+against+ischaemia-reperfusion-induced+acute+and+chronic+kidney+injury.">Microvesicles derived from human adult mesenchymal stem cells protect against ischaemia-reperfusion-induced acute and chronic kidney injury.</a> Nephrology Dialysis Transplantation. 26 (5), 1474-1483 (2011).</li><li>Barteneva, N. S., Fasler-Kan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Circulating+microparticles:+square+the+circle.">Circulating microparticles: square the circle.</a> BMC Cell Biology. 14 (1), 23 (2013).</li><li>Van der Pol, E., B&#246;ing, A. N., Harrison, P., Sturk, A., Nieuwland, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Classification+functions,+and+clinical+relevance+of+extracellular+vesicles.">Classification functions, and clinical relevance of extracellular vesicles.</a> Pharmacological Reviews. 64 (3), 676-705 (2012).</li><li>Raposo, G., Stoorvogel, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+vesicles:+Exosomes,+microvesicles,+and+friends.">Extracellular vesicles: Exosomes, microvesicles, and friends.</a> The Journal of Cell Biology. 200 (4), 373-383 (2013).</li><li>Dinkla, S., Brock, R., Joosten, I., Bosman, G. J. C. G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gateway+to+understanding+microparticles:+standardized+isolation+and+identification+of+plasma+membrane-derived+vesicles.">Gateway to understanding microparticles: standardized isolation and identification of plasma membrane-derived vesicles.</a> Nanomedicine (London, England). 8 (10), (2013).</li><li>Witwer, K. W., Buzas, E. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+of+sample+collection,+isolation+and+analysis+methods+in+extracellular+vesicle+research.">Standardization of sample collection, isolation and analysis methods in extracellular vesicle research.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 2, (2013).</li><li>Shah, M. D., Bergeron, A. L., Dong, J. -. F., L&#243;pez, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flow+cytometric+measurement+of+microparticles:+Pitfalls+and+protocol+modifications.">Flow cytometric measurement of microparticles: Pitfalls and protocol modifications.</a> Platelets. 19 (5), 365-372 (2008).</li><li>Dey-Hazra, E., Hertel, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+circulating+microparticles+by+flow+cytometry:+influence+of+centrifugation,+filtration+of+buffer,+and+freezing.">Detection of circulating microparticles by flow cytometry: influence of centrifugation, filtration of buffer, and freezing.</a> Vascular Health and Risk Management. 6, 1125-1133 (2010).</li><li>Lacroix, R., Judicone, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+of+pre-analytical+variables+in+plasma+microparticle+determination:+results+of+the+International+Society+on+Thrombosis+and+Haemostasis+SSC+Collaborative+workshop.">Standardization of pre-analytical variables in plasma microparticle determination: results of the International Society on Thrombosis and Haemostasis SSC Collaborative workshop.</a> Journal of Thrombosis and Haemostasis. 11 (6), 1190-1193 (2013).</li><li>Mullier, F., Bailly, N., Chatelain, C., Chatelain, B., Dogn&#233;, J. -. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pre-analytical+issues+in+the+measurement+of+circulating+microparticles:+current+recommendations+and+pending+questions.">Pre-analytical issues in the measurement of circulating microparticles: current recommendations and pending questions.</a> Journal of Thrombosis and Haemostasis. 11 (4), 693-696 (2013).</li><li>Peramo, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physical+Characterization+of+Mouse+Deep+Vein+Thrombosis+Derived+Microparticles+by+Differential+Filtration+with+Nanopore+Filters.">Physical Characterization of Mouse Deep Vein Thrombosis Derived Microparticles by Differential Filtration with Nanopore Filters.</a> Membranes. 2 (1), 1-15 (2012).</li><li>Tilley, R. E., Holscher, T., Belani, R., Nieva, J., Mackman, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tissue+Factor+Activity+is+Increased+in+a+Combined+Platelet+and+Microparticle+Sample+from+Cancer+Patients.">Tissue Factor Activity is Increased in a Combined Platelet and Microparticle Sample from Cancer Patients.</a> Thrombosis research. 122 (5), 604-609 (2008).</li><li>Rood, I. M., Deegens, J. K. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+three+methods+for+isolation+of+urinary+microvesicles+to+identify+biomarkers+of+nephrotic+syndrome.">Comparison of three methods for isolation of urinary microvesicles to identify biomarkers of nephrotic syndrome.</a> Kidney international. 78 (8), 810-816 (2010).</li><li>Van der Pol, E., Hoekstra, A. G., Sturk, A., Otto, C., van Leeuwen, T. G., Nieuwland, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optical+and+non-optical+methods+for+detection+and+characterization+of+microparticles+and+exosomes.">Optical and non-optical methods for detection and characterization of microparticles and exosomes.</a> Journal of Thrombosis And Haemostasis: JTH. 8 (12), 2596-2607 (2010).</li><li>Gy&#246;rgy, B., Szab&#243;, T. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Membrane+vesicles,+current+state-of-the-art:+emerging+role+of+extracellular+vesicles.">Membrane vesicles, current state-of-the-art: emerging role of extracellular vesicles.</a> Cellular and Molecular Life Sciences. 68 (16), 2667-2688 (2011).</li><li>Miguet, L., Be&#769;chade, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+Analysis+of+Malignant+B-Cell+Derived+Microparticles+Reveals+CD148+as+a+Potentially+Useful+Antigenic+Biomarker+for+Mantle+Cell+Lymphoma+Diagnosis.">Proteomic Analysis of Malignant B-Cell Derived Microparticles Reveals CD148 as a Potentially Useful Antigenic Biomarker for Mantle Cell Lymphoma Diagnosis.</a> Journal of Proteome Research. 8 (7), 3346-3354 (2009).</li><li>Smalley, D. M., Root, K. E., Cho, H., Ross, M. M., Ley, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+discovery+of+21+proteins+expressed+in+human+plasma-derived+but+not+platelet-derived+microparticles.">Proteomic discovery of 21 proteins expressed in human plasma-derived but not platelet-derived microparticles.</a> Thrombosis and Haemostasis. 97 (1), 67-80 (2007).</li><li>Lacroix, R., Robert, S., Poncelet, P., Dignat-George, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Overcoming+Limitations+of+Microparticle+Measurement+by+Flow+Cytometry.">Overcoming Limitations of Microparticle Measurement by Flow Cytometry.</a> Seminars in Thrombosis and Hemostasis. 36 (08), 807-818 (2010).</li><li>Mobarrez, F., Antovic, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+multicolor+flow+cytometric+assay+for+measurement+of+platelet-derived+microparticles.">A multicolor flow cytometric assay for measurement of platelet-derived microparticles.</a> Thrombosis Research. 125 (3), e110-e116 (2010).</li><li>Van der Pol, E., van Gemert, M. J. C., Sturk, A., Nieuwland, R., van Leeuwen, T. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single+vs.+swarm+detection+of+microparticles+and+exosomes+by+flow+cytometry.">Single vs. swarm detection of microparticles and exosomes by flow cytometry.</a> Journal of Thrombosis And Haemostasis: JTH. 10 (5), 919-930 (2012).</li><li>Gy&#246;rgy, B., Szab&#243;, T. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+Flow+Cytometric+Assessment+Reveals+Distinct+Microvesicle+(Cell-Derived+Microparticle)+Signatures+in+Joint+Diseases.">Improved Flow Cytometric Assessment Reveals Distinct Microvesicle (Cell-Derived Microparticle) Signatures in Joint Diseases.</a> PLoS ONE. 7 (11), e49726 (2012).</li><li>Gy&#246;rgy, B., M&#243;dos, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+isolation+of+cell-derived+microparticles+are+compromised+by+protein+complexes+resulting+from+shared+biophysical+parameters.">Detection and isolation of cell-derived microparticles are compromised by protein complexes resulting from shared biophysical parameters.</a> Blood. 117 (4), e39-e48 (2011).</li><li>Gy&#246;rgy, B., Pasztoi, M., Buzas, E. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Response:+systematic+use+of+Triton+lysis+as+a+control+for+microvesicle+labeling.">Response: systematic use of Triton lysis as a control for microvesicle labeling.</a> Blood. 119 (9), 2175-2176 (2012).</li><li>Trummer, A., De Rop, C., Tiede, A., Ganser, A., Eisert, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isotype+controls+in+phenotyping+and+quantification+of+microparticles:+a+major+source+of+error+and+how+to+evade+it.">Isotype controls in phenotyping and quantification of microparticles: a major source of error and how to evade it.</a> Thrombosis Research. 122 (5), 691-700 (2008).</li><li>Shet, A. S., Aras, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sickle+blood+contains+tissue+factor-positive+microparticles+derived+from+endothelial+cells+and+monocytes.">Sickle blood contains tissue factor-positive microparticles derived from endothelial cells and monocytes.</a> Blood. 102 (7), 2678-2683 (2003).</li><li>Connor, D. E., Exner, T., Ma, D. D. F., Joseph, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+majority+of+circulating+platelet-derived+microparticles+fail+to+bind+annexin+V,+lack+phospholipid-dependent+procoagulant+activity+and+demonstrate+greater+expression+of+glycoprotein+Ib.">The majority of circulating platelet-derived microparticles fail to bind annexin V, lack phospholipid-dependent procoagulant activity and demonstrate greater expression of glycoprotein Ib.</a> Thrombosis and Haemostasis. 103 (5), 1044-1052 (2010).</li><li>Nolte-&#8217;t Hoen, E. N. M., van der Vlist, E. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+and+qualitative+flow+cytometric+analysis+of+nanosized+cell-derived+membrane+vesicles.">Quantitative and qualitative flow cytometric analysis of nanosized cell-derived membrane vesicles.</a> Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, And Medicine. 8 (5), 712-720 (2012).</li><li>Van der Vlist, E. J., Nolte-&#8217;t Hoen, E. N. M., Stoorvogel, W., Arkesteijn, G. J. A., Wauben, M. H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescent+labeling+of+nano-sized+vesicles+released+by+cells+and+subsequent+quantitative+and+qualitative+analysis+by+high-resolution+flow+cytometry.">Fluorescent labeling of nano-sized vesicles released by cells and subsequent quantitative and qualitative analysis by high-resolution flow cytometry.</a> Nature Protocols. 7 (7), 1311-1326 (2012).</li><li>Orozco, A. F., Lewis, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flow+cytometric+analysis+of+circulating+microparticles+in+plasma.">Flow cytometric analysis of circulating microparticles in plasma.</a> Cytometry Part A. 77 A. 77A (6), 502-514 (2010).</li></ol>

Yazarlar ifşa etmek çıkar çatışması var.

İzolasyon, tedavi ve EVs analizi için iki farklı protokol tek bir algılama veya boncuk esaslı yaklaşım kullanılarak sunulmuştur. Kullanmak için en uygun yöntemi seçerek her zaman kolay değildir ve faiz bireysel alt popülasyonlar yanı sıra test edilen numunenin bir anlayış gerektirir. En uygun yöntemi tercih Bundan başka, satın alma için kullanılan sitometresinde duyarlılığı göz önünde bulundurulmalıdır. Çoğu zaman doğrusu yöntemlerin bir kombinasyonu, tek başına herhangi bir yöntem...

Hücre dışı veziküller (EVS) hücre-hücre iletişimine yüksek ilgili olan ve biyolojik süreçler çok çeşitli düzenlemeye yardımcı vücut sıvılarında bulunan küçük, zar-türevi veziküllerdir. Akış sitometrik (FCM) ile AGH analizi nedeniyle küçük boyutu ve ilgi belirteçleri için pozitif ayrık nüfus eksikliği bildiği zor olmuştur. Oldukça son on yılda geliştirilmiş EV analiz yöntemleri, hala devam eden bir çalışma vardır. Ne yazık ki, orada hiç kimse-boyut-uyan tüm protokol ve kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Birkaç farklı işleme AGH için teknikler ve bireysel algılama veya boncuk-tabanlı bir yaklaşım kullanarak AGH analiz için iki protokol burada sundu. rasyonel f yaygın ticari preparatlarda bulunan antikor agregatları bertaraf yardımcı olacaktır Burada tarif edilen yöntemler, artan bir sinyal-gürültü oranı ve ayar kapılarıeşiğe tespitini en aza indirir ashion. İkinci protokol yakalamak ve küçük AGH ve eksozomlar tespit etmek için bir boncuk tabanlı bir yaklaşım kullanır iken ilk protokol, klinik örneklerin yüksek hacimli analiz etmek için özellikle uygundur bireysel algılama yöntemi kullanır. Ayrıca mikro şekilde bilinmektedir EVs, hücre-hücre iletişimine katılan ve biyolojik süreçler 1 çok çeşitli düzenlemeye yardımcı olan vücut sıvılarında bulunan küçük, zar-türevi veziküllerdir. 4 - Çeşitli yüzey belirteçleri ve / veya biyolojik maddenin doğrudan aktarımı ifadesi sayesinde, AGH aktive veya hücreler arası iletişimin 2 rol bastırmak ya oynamak için alıcı hücrelerin fonksiyonunu değiştirmek edebiliyoruz. Diğer tümör Metasta teşvik gelen, geniş bir şartlar aralığında katkıda gösterilmiştir ve Klinik, trombosit türevli EVs kuvvetli pıhtılaşmaya karşı etkinliğe 5 sahip olduğu bilinmektedirHastalığın 7 karşı korumaya sis 6. AGH boyutu ve kuşak 8 mekanizmaya bağlı olarak, bu tür bir eksozom ve microvesicles (MVs) gibi hücre-türevi veziküllerin küçük kategoriye ayrılabilir. MVs 100 1,000 kadar büyük ise hücre kökenli kese alt popülasyonlarının isimlendirme devam eden tartışmanın 8,9 bir konu olmaya devam ediyor, ancak, eksozomlar genellikle, küçük plazma zarı ile endosome füzyon elde edilen 40 ila 100 nm parçacıklar açıklanmıştır nm partiküller, plazma zarının 10 dökülme ile temsil edilmektedir. Burada, genel terim &quot;EV bize&quot; hücreleri tarafından salınan hücre dışı biyolojik veziküllerinin her türlü ifade etmek için kullanılacaktır. Bütün kandan EV&#39;lerin izolasyonu çok aşamalı bir işlemdir ve bir çok farklı işlem değişkenlerinin, depolama sıcaklığı ve süresi 11,12, antikoagülan / koruyucu 13 kullanılır ve de dahil olmak üzere, EV içeriği etkilediği gösterilmiştirsantrifüj yöntemi 14 kullanılır. Bu değişkenlerin standardizasyonu için bir ihtiyaç Tromboz ve Hemostaz Bilimsel ve uygun Standardizasyon Komitesi (ISTH SSC), kan işleme ve EV izolasyon prosedürleri 15,16 Uluslararası Derneği tarafından önerilerine yol açtı, ancak optimum protokolü araştırmacılar arasında fikir birliği hiçbir vardır etti 12 kullanmak için. En sıkı kontrollü ön-analitik değişkenler doğru ve tekrarlanabilir veriler için çok önemli olduğunu, ancak, kabul ediyorum. AGH analiz etmek için, araştırmacılar 20,21 ve 22,23 lekeleme batı saçılma transmisyon elektron mikroskobu 17, taramalı elektron mikroskobu 18,19, atomik kuvvet mikroskobu, dinamik ışık da dahil olmak üzere, çeşitli yöntemler kullanmışlardır. FCM birçok araştırmacı 9,24 için seçim yöntemi iken - nedeniyle yüksek verim yetenekleri 26, FCM kullanarak EVs analizi olmuştur32 - nedeniyle boyutu ve ayrık olumlu nüfus 27 eksikliği oldukça zordur. Hücrelerin analizi ile karşılaştırıldığında, gerekli parçacık başına antijenlerin az sayıda nedeniyle yayılan 1) daha az floresans AGH sonuçların küçük boyutu ve post-leke yıkama 2) sınırlı fizibilite, arka plan floresan azaltmak için. Araştırmacılar arasında ortak zorluklar immunglobulin agrega 27,28 ve antikorların 29 kendini toplama kaynaklanan sinyalleri içerir. Ayrıca, uzun işlem süreleri ve mevcut protokollerin 33,34 birçok kişi tarafından kullanılan uzun yıkama / izolasyon prosedürleri onlara yüksek hacimli uygulamalar için idealdir daha az hale numunelerin az sayıda analiz etmek çok günlük zaman taahhütlerini gerektirir. Bazı araştırmacılar doğru bac değerlendirmek için böyle bir floresan eksi bir (FMO) ve izotiplerle yararsız olarak geleneksel olarak kullanılan FCM negatif kontroller render, tamamen bir yıkama adımı bırakmakkground floresan 30. Antikor agrega ve diğer non-kesecikler, bağlanmamış antikor giderilmesinde zorluk ve farkedilebilir olumlu nüfus eksikliğinden kaynaklanan sinyaller: Bizim protokolleri AGH uygun FCM analizi engelleyebilir üç ortak sorunları çözmek. Burada tarif edilen teknikler, genel olarak ticari preparatlarda bulunan antikor toplulukları ortadan sinyal-gürültü oranını artırmak ve eşiğe tespitini en aza indirir rasyonel bir şekilde kapı ayarlama yardımcı olacaktır. İki farklı algılama yöntemleri burada sunulmuştur: İkinci protokol yakalamak ve küçük AGH ve eksozomlar tespit etmek için bir boncuk-tabanlı bir yaklaşım kullanır iken ilk protokol, klinik örneklerin yüksek hacimli analiz etmek için özellikle uygundur bireysel algılama yöntemi kullanır.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" >
	<tbody>
		<tr >
			<td >LSR II benchtop flow cytometer</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td ></td>
			<td >3-laser (20 mW Coherent Sapphire 488 nm blue, 25 mW Coherent Vioflame 405 nm violet, and 17 mW JDS Uniphase HeNe 633nm red)</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >FACS Diva software&#160;</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td ></td>
			<td >PC version 6.0</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >FlowJo software&#160;</td>
			<td >Treestar US</td>
			<td ></td>
			<td >Mac version 9.6.1 or PC version 7.6.5</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Sphero Rainbow fluorescent particles</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >556298</td>
			<td >used to adjust all channel voltages to maintain fluorescence intensity consistency&#160;</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Ultra Rainbow fluorescent particles&#160;</td>
			<td >Spherotech</td>
			<td >URFP-10-5</td>
			<td >used in addition to Megamix-Plus SSC beads to ensure EV gating consistency from batch to batch</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Megmix-Plus SSC beads</td>
			<td >Biocytex</td>
			<td >7803</td>
			<td >used to adjust FSC and SSC&#160; voltages to maintain&#160; consistency&#160; between runs. Can also used to monitor flow rate and ajust flow rate dial in order to ensure that same flow rate is used in all runs</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >AbC Anti-Mouse Bead Kit</td>
			<td >Life Technologies</td>
			<td >A-10344</td>
			<td >used for compensation controls &#38; negative AbC beads used for beads-based method</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Nonidet P-40 Alternative (NP-40) (CAS 9016-45-9)</td>
			<td >Santa Cruz&#160;</td>
			<td >sc-281108</td>
			<td >used in the individual detection method only to lyse samples after initial reading for use as negative controls. Stock may be diluted to 1:10 in PBS and stored in fridge for up to 1 month.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >BD TruCOUNT Tubes</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >340334</td>
			<td >used whenver absolute EV concentrations are needed</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Ultrafree-MC, GV 0.22 &#181;m Centrifugal Filter Units</td>
			<td >Millipore&#160;</td>
			<td >UFC30GVNB</td>
			<td >used to post-stain wash Evs and/or fractionate EVs based on size</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Vacutainer glass whole blood tubes ACD-A</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >364606</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Facs tubes 12x75 polystrene</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >352058</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >50mL Reservoirs individually wrapped&#160;</td>
			<td >Phenix</td>
			<td >RR-50-1s</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Green-Pak pipet tips - 10&#181;L</td>
			<td >Rainin</td>
			<td >GP-L10S</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Green-Pak pipet tips -200&#181;L&#160;</td>
			<td >Rainin</td>
			<td >GP-L250S</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Green -Pak pipet tips - 1000&#181;L&#160;</td>
			<td >Rainin</td>
			<td >GP-L1000S</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Stable Stack L300 tips presterilized</td>
			<td >Rainin</td>
			<td >SS-L300S</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Pipet-Lite&#160;XLS 8 Channel LTS&#160;Adjustable&#160;Spacer&#160;</td>
			<td >Rainin</td>
			<td >LA8-300XLS</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >96 well tissue culture plates</td>
			<td >E&#38;K Scientific</td>
			<td >EK-20180</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >RPMI 1640 Media (without Hepes)</td>
			<td >UCSF Cell Culture Facility</td>
			<td >CCFAE001</td>
			<td >media used for bead-based detection method</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Dulbeccos PBS D-PBS, CaMg-free, 0.2&#181;m filtered</td>
			<td >UCSF Cell Culture Facility</td>
			<td >CCFAL003</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Ultracentrifuge Tube, Thinwall, Ultra-Clear</td>
			<td >BECKMAN COULTER INC</td>
			<td >344058</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >PANEL I</td>
			<td ></td>
			<td ></td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD3 PerCP-Cy5.5</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >344808</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD14 APC-Cy7</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >301820</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD16 V450</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >560474</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD28 FITC</td>
			<td >biolegend</td>
			<td >302906</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD152 APC</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >555855</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD19 A700</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >302226</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >PANEL II</td>
			<td ></td>
			<td ></td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD41a PerCP-Cy5.5</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >340930</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD62L APC</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >304810</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD108 PE&#160;</td>
			<td >BD Biosciences</td>
			<td >552830</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD235a FITC</td>
			<td >biolegend</td>
			<td >349104</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >PANEL III</td>
			<td ></td>
			<td ></td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD11b PE-Cy7</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >301322</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD62p APC</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >304910</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD66b PE&#160;</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >305106</td>
			<td >2 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD15 FITC</td>
			<td >exalpha</td>
			<td >X1496M</td>
			<td >5 &#181;l</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD9 PE</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >555372</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >CD63 APC</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >353008</td>
			<td ></td>
		</tr>
		<tr >
			<td >APC-Cy7 Ms IgG2a, &#954;</td>
			<td >Biolegend</td>
			<td >400230</td>
			<td ></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

techniques for the analysis of extracellular vesicles using flow cytometry

Hücre dışı veziküller (EVS) hücre-hücre iletişimine yüksek ilgili olan ve biyolojik süreçler çok çeşitli düzenlemeye yardımcı vücut sıvılarında bulunan küçük, zar-türevi veziküllerdir. Akış sitometrik (FCM) ile AGH analizi nedeniyle küçük boyutu ve ilgi belirteçleri için pozitif ayrık nüfus eksikliği bildiği zor olmuştur. Oldukça son on yılda geliştirilmiş EV analiz yöntemleri, hala devam eden bir çalışma vardır. Ne yazık ki, orada hiç kimse-boyut-uyan tüm protokol ve kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Birkaç farklı işleme AGH için teknikler ve bireysel algılama veya boncuk-tabanlı bir yaklaşım kullanarak AGH analiz için iki protokol burada sundu. rasyonel f yaygın ticari preparatlarda bulunan antikor agregatları bertaraf yardımcı olacaktır Burada tarif edilen yöntemler, artan bir sinyal-gürültü oranı ve ayar kapılarıeşiğe tespitini en aza indirir ashion. İkinci protokol yakalamak ve küçük AGH ve eksozomlar tespit etmek için bir boncuk tabanlı bir yaklaşım kullanır iken ilk protokol, klinik örneklerin yüksek hacimli analiz etmek için özellikle uygundur bireysel algılama yöntemi kullanır.

<html> Şekil 1, izolasyon ve boncuk esaslı yöntemi veya tek tek tespit metodu kullanarak EV&#39;lerin tespiti için genel işlem şemasını açıklar. FCM büyük AGH analiz için iyi çalışır ama çoğu sitometrelerinde bireysel eksozom gibi parçacıkları kadar küçük tespit yeteneğine sahip değildir kullanarak EVs Bireysel algılama. Bir tane bazlı yaklaşım, Tablo 1 &#39;de belirtildiği gibi küçük EVs, ancak, bu yöntem kullanılarak ilişkili dezavantajları vardı...

Watch this Scientific Journal Video about Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry at JoVE.com

Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry

Pek çok farklı yöntem akış sitometrik (FCM) ile hücre dışı veziküller (EVS) ölçülmesi için vardır. Kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Ölçüm EVs için iki protokoller bireysel algılama veya boncuk esaslı yaklaşım kullanılarak sunulmuştur.

Akım Sitometri Kullanımı Ekstrasellüler Veziküller Analizi Teknikleri

Extracellular Vesicles (EVs) are small, membrane-derived vesicles found in bodily fluids that are highly involved in cell-cell communication and help ...

techniques-for-analysis-extracellular-vesicles-using-flow

Research

JoVE Journal

Biology

23.0K Görüntüleme.  Blood Systems Research Institute.  Pek çok farklı yöntem akış sitometrik (FCM) ile hücre dışı veziküller (EVS) ölçülmesi için vardır. Kullanmak için en uygun yöntemi belirlerken çeşitli yönleri dikkate alınmalıdır. Ölçüm EVs için iki protokoller bireysel algılama veya boncuk esaslı yaklaşım kullanılarak sunulmuştur. 

Video: Techniques for the Analysis of Extracellular Vesicles Using Flow Cytometry

Flow Cytometry Purification of Mouse Meiotic Cells

The heterogeneous nature of cell types in the testis and the absence of meiotic cell culture models have been significant hurdles to the study of the unique differentiation programs that are manifest during meiosis. Two principal methods have been developed to purify, to varying degrees, various meiotic fractions from both adult and immature animals: elutriation or Staput (sedimentation) using BSA and/or percoll gradients. Both of these methods rely on cell size and density to separate meiotic cells1-5. Overall, except for few cell populations6, these protocols fail to yield sufficient purity of the numerous meiotic cell populations that are necessary for detailed molecular analyses. Moreover, with such methods usually one type of meiotic cells can be purified at a given time, which adds an extra level of complexity regarding the reproducibility and homogeneity when comparing meiotic cell samples.
Here, we describe a refined method that allows one to easily visualize, identify, and purify meiotic cells, from germ cells to round spermatids, using FACS combined with Hoechst 33342 staining7,8. This method provides an overall snapshot of the entire meiotic process and allows one to highly purify viable cells from most stage of meiosis. These purified cells can then be analyzed in detail for molecular changes that accompany progression through meiosis, for example changes in gene expression9,10and the dynamics of nucleosome occupancy at hotspots of meiotic recombination11.

An efficient method to obtain highly purified viable meiotic fractions from mouse testis is described, which combines a refined cell dissociation protocol with fluorescent activated cell sorting (FACS). This method takes advantage of differences in the DNA content and nuclear density of discrete meiotic fractions.

Fare Mayotik Hücreler Sitometrisi Arıtma

The heterogeneous nature of cell types in the testis and the absence of meiotic cell culture models have been significant hurdles to the study of the ...

Biyoloji

Optimized Staining and Proliferation Modeling Methods for Cell Division Monitoring using Cell Tracking Dyes

Fluorescent cell tracking dyes, in combination with flow and image cytometry, are powerful tools with which to study the interactions and fates of different cell types in vitro and in vivo.1-5 Although there are literally thousands of publications using such dyes, some of the most commonly encountered cell tracking applications include monitoring of:
<ol>
	<li>stem and progenitor cell quiescence, proliferation and/or differentiation6-8</li>
	<li>antigen-driven membrane transfer9 and/or precursor cell proliferation3,4,10-18 and</li>
	<li>immune regulatory and effector cell function1,18-21.</li>
</ol>
Commercially available cell tracking dyes vary widely in their chemistries and fluorescence properties but the great majority fall into one of two classes based on their mechanism of cell labeling. "Membrane dyes", typified by PKH26, are highly lipophilic dyes that partition stably but non-covalently into cell membranes1,2,11. "Protein dyes", typified by CFSE, are amino-reactive dyes that form stable covalent bonds with cell proteins4,16,18. Each class has its own advantages and limitations. The key to their successful use, particularly in multicolor studies where multiple dyes are used to track different cell types, is therefore to understand the critical issues enabling optimal use of each class2-4,16,18,24.
The protocols included here highlight three common causes of poor or variable results when using cell-tracking dyes. These are:
<ol>
	<li>Failure to achieve bright, uniform, reproducible labeling. This is a necessary starting point for any cell tracking study but requires attention to different variables when using membrane dyes than when using protein dyes or equilibrium binding reagents such as antibodies.</li>
	<li>Suboptimal fluorochrome combinations and/or failure to include critical compensation controls. Tracking dye fluorescence is typically 102 - 103 times brighter than antibody fluorescence. It is therefore essential to verify that the presence of tracking dye does not compromise the ability to detect other probes being used.</li>
	<li>Failure to obtain a good fit with peak modeling software. Such software allows quantitative comparison of proliferative responses across different populations or stimuli based on precursor frequency or other metrics. Obtaining a good fit, however, requires exclusion of dead/dying cells that can distort dye dilution profiles and matching of the assumptions underlying the model with characteristics of the observed dye dilution profile.</li>
</ol>
Examples given here illustrate how these variables can affect results when using membrane and/or protein dyes to monitor cell proliferation.

Successful use of cell tracking dyes to monitor immune cell function and proliferation involves several critical steps. We describe methods for: 1) obtaining bright, uniform, reproducible label-ing with membrane dyes; 2) selecting fluorochromes and data acquisition conditions; and 3) choosing a model to quantify cell proliferation based on dye dilution.

Cep Takip Boyalar kullanarak Hücre Bölünmesi İzleme için optimize Boyama ve Çoğalma Modelleme Yöntemleri

Fluorescent cell tracking dyes, in combination with flow and image cytometry, are powerful tools with which to study the interactions and fates of ...

Temporal Tracking of Cell Cycle Progression Using Flow Cytometry without the Need for Synchronization

This protocol describes a method to permit the tracking of cells through the cell cycle without requiring the cells to be synchronized. Achieving cell synchronization can be difficult for many cell systems. Standard practice is to block cell cycle progression at a specific stage and then release the accumulated cells producing a wave of cells progressing through the cycle in unison. However, some cell types find this block toxic resulting in abnormal cell cycling, or even mass death. Bromodeoxyuridine (BrdU) uptake can be used to track the cell cycle stage of individual cells. Cells incorporate this synthetic thymidine analog, while synthesizing new DNA during S phase. By providing BrdU for a brief period it is possible to mark a pool of cells that were in S phase while the BrdU was present. These cells can then be tracked through the remainder of the cell cycle and into the next round of replication, permitting the duration of the cell cycle phases to be determined without the need to induce a potentially toxic cell cycle block. It is also possible to determine and correlate the expression of both internal and external proteins during subsequent stages of the cell cycle. These can be used to further refine the assignment of cell cycle stage or assess effects on other cellular functions such as checkpoint activation or cell death.

This protocol describes the use of bromodeoxyuridine (BrdU) uptake to permit the temporal tracking of cells that were in S phase at a specific point in time. Addition of DNA dyes and antibody labeling facilitates detailed analysis of the fate of the S phase cells at later times.

Senkronizasyon Need for olmadan Akım Sitometri Kullanımı Hücre Döngüsü ilerleme zamansal İzleme

This protocol describes a method to permit the tracking of cells through the cell cycle without requiring the cells to be synchronized. Achieving cell ...

Analysis of Cell Suspensions Isolated from Solid Tissues by Spectral Flow Cytometry

Flow cytometry has been used for the past 40 years to define and analyze the phenotype of lymphoid and other hematopoietic cells. Initially restricted to the analysis of a few fluorochromes, currently there are dozens of different fluorescent dyes, and up to 14-18 different dyes can be combined at a time. However, several limitations still impair the analytical capabilities. Because of the multiplicity of fluorescent probes, data analysis has become increasingly complex due to the need of large, multi-parametric compensation matrices. Moreover, mutant mouse models carrying fluorescent proteins to detect and trace specific cell types in different tissues have become available, so the analysis (by flow cytometry) of auto-fluorescent cell suspensions obtained from solid organs is required. Spectral flow cytometry, which distinguishes the shapes of emission spectra along a wide range of continuous wavelengths, addresses some of these problems. The data is analyzed with an algorithm that replaces compensation matrices and treats auto-fluorescence as an independent parameter. Thus, spectral flow cytometry should be capable of discriminating fluorochromes with similar emission peaks and can provide a multi-parametric analysis without compensation requirements.
This protocol describes the spectral flow cytometry analysis, allowing for a 21-parameter (19 fluorescent probes) characterization and the management of an auto-fluorescent signal, providing high resolution in minor population detection. The results presented here show that spectral flow cytometry presents advantages in the analysis of cell populations from tissues difficult to characterize in conventional flow cytometry, such as the heart and the intestine. Spectral flow cytometry thus demonstrates the multi-parametric analytical capacity of high-performing conventional flow cytometry without the requirement for compensation and enables auto-fluorescence management.

This article describes spectral cytometry, a new approach in flow cytometry that uses the shapes of emission spectra to distinguish fluorochromes. An algorithm replaces compensations and can treat auto-fluorescence as an independent parameter. This new approach allows for the proper analysis of cells isolated from solid organs.

Spektral Sitometrisi ile Katı Dokular İzole Hücre Cezalar Analizi

Flow cytometry has been used for the past 40 years to define and analyze the phenotype of lymphoid and other hematopoietic cells. Initially restricted to ...

Flow Cytometric Analysis of Extracellular Vesicles from Cell-conditioned Media

Flow cytometry (FC) is the method of choice for semi-quantitative measurement of cell-surface antigen markers. Recently, this technique has been used for phenotypic analyses of extracellular vesicles (EV) including exosomes (Exo) in the peripheral blood and other body fluids. The small size of EV mandates the use of dedicated instruments having a detection threshold around 50-100 nm. Alternatively, EV can be bound to latex microbeads that can be detected by FC. Microbeads, conjugated with antibodies that recognize EV-associated markers/Cluster of Differentiation CD63, CD9, and CD81 can be used for EV capture. Exo isolated from CM can be analyzed with or without pre-enrichment by ultracentrifugation. This approach is suitable for EV analyses using conventional FC instruments. Our results demonstrate a linear correlation between Mean Fluorescence Intensity (MFI) values and EV concentration. Disrupting EV through sonication dramatically decreased MFI, indicating that the method does not detect membrane debris. We report an accurate and reliable method for the analysis of EV surface antigens, which can be easily implemented in any laboratory.

The protocol describes a reproducible method designed for use with cell culture supernatants to detect surface epitopes on small extracellular vesicles (EV). It utilizes specific EV immunoprecipitation using beads coupled with antibodies that recognize surface antigen CD9, CD63, and CD81. The method is optimized for downstream flow cytometry analysis.

Hücre şartına ortamdan hücre dışı veziküller sitometrik analizinde akışı

Flow cytometry (FC) is the method of choice for semi-quantitative measurement of cell-surface antigen markers. Recently, this technique has been used for ...

Purification and Analysis of Caenorhabditis elegans Extracellular Vesicles

The secretion of small membrane-bound vesicles into the external environment is a fundamental physiological process of all cells. These extracellular vesicles (EVs) function outside the cell to regulate global physiological processes by transferring proteins, nucleic acids, metabolites, and lipids between tissues. EVs reflect the physiological state of their cells of origin. EVs are implicated to have fundamental roles in virtually every aspect of human health. Thus, EV protein and genetic cargos are being increasingly analyzed for biomarkers of health and disease. However, the EV field still lacks a tractable invertebrate model system that permits the study of EV cargo composition. C. elegans is well suited for EV research because it actively secretes EVs outside of its body into its external environment, permitting facile isolation. This article provides all the necessary information for generating, purifying, and quantifying these environmentally secreted C. elegans EVs including how to work quantitatively with very large populations of age-synchronized worms, purifying EVs, and a flow cytometry protocol that directly measures the number of intact EVs in the purified sample. Thus, the large library of genetic reagents available for C. elegans research can be tapped into for investigating the impacts of genetic pathways and physiological processes on EV cargo composition.

Purification and Analysis of Caenorhabditis elegans Extracellular Vesicles

This article presents methods for generating, purifying, and quantifying Caenorhabditis elegans extracellular vesicles.

Arınma ve Caenorhabditis elegans Ekstrasellüler Veziküllerin Analizi

The secretion of small membrane-bound vesicles into the external environment is a fundamental physiological process of all cells. These extracellular ...

Nanoparticle Tracking Analysis for the Quantification and Size Determination of Extracellular Vesicles

The physiological and pathophysiological roles of extracellular vesicles (EVs) have become increasingly recognized, making the EV field a quickly evolving area of research. There are many different methods for EV isolation, each with distinct advantages and disadvantages that affect the downstream yield and purity of EVs. Thus, characterizing the EV prep isolated from a given source by a chosen method is important for interpretation of downstream results and comparison of results across laboratories. Various methods exist for determining the size and quantity of EVs, which can be altered by disease states or in response to external conditions. Nanoparticle tracking analysis (NTA) is one of the prominent technologies used for high-throughput analysis of individual EVs. Here, we present a detailed protocol for quantification and size determination of EVs isolated from mouse perigonadal adipose tissue and human plasma using a breakthrough technology for NTA representing major advances in the field. The results demonstrate that this method can deliver reproducible and valid total particle concentration and size distribution data for EVs isolated from different sources using different methods, as confirmed by transmission electron microscopy. The adaptation of this instrument for NTA will address the need for standardization in NTA methods to increase rigor and reproducibility in EV research.

We demonstrate how to use a novel nanoparticle tracking analysis instrument to estimate the size distribution and total particle concentration of extracellular vesicles isolated from mouse perigonadal adipose tissue and human plasma.

Hücre Dışı Veziklinlerin Nicelleştirilmesi ve Boyut Tayini için Nanopartikül Takip Analizi

The physiological and pathophysiological roles of extracellular vesicles (EVs) have become increasingly recognized, making the EV field a quickly evolving ...

Single Extracellular Vesicle Transmembrane Protein Characterization by Nano-Flow Cytometry

Single particle characterization has become increasingly relevant for research into extracellular vesicles, progressing from bulk analysis techniques and first-generation particle analysis to comprehensive multi-parameter measurements such as nano-flow cytometry (nFCM). nFCM is a form of flow cytometry that utilizes instrumentation specifically designed for nano-particle analysis, allowing for thousands of EVs to be characterized per minute both with and without the use of staining techniques. High resolution side scatter (SS) detection allows for size and concentration to be determined for all biological particles larger than 45 nm, while simultaneous fluorescence (FL) detection identifies the presence of labeled markers and targets of interest. Labeled subpopulations can then be described in quantitative units of particles/mL or as a percentage of the total particles identified by side scatter.
Here, EVs derived from conditioned cell culture media (CCM) are labeled with both a lipid dye, to identify particles with a membrane, and antibodies specific for CD9, CD63, and CD81 as common EV markers. Measurements of comparison material, a concentration standard and a size standard of silica nanospheres, as well as labeled sample material are analyzed in a 1-minute analysis. The software is then used to measure the concentration and size distribution profile of all particles, independent of labeling, before determining the particles that are positive for each of the labels.
Simultaneous SS and FL detection can be utilized flexibly with many different EV sources and labeling targets, both external and internal, describing EV samples in a comprehensive and quantitative manner.

The latest generation of EV characterization tools are capable of single EV analysis across multiple parameters simultaneously. Nano-flow cytometry measures all biological particles larger than 45 nm without labeling and identifies specific characteristics of subpopulations by a variety of fluorescent labeling techniques.

Nano-Flow Sitometri ile Tek Hücre Dışı Vezikül Transmembran Protein Karakterizasyonu

Single particle characterization has become increasingly relevant for research into extracellular vesicles, progressing from bulk analysis techniques and ...

Isolation and Analysis of Traceable and Functionalized Extracellular Vesicles from the Plasma and Solid Tissues

Circulating and tissue-resident extracellular vesicles (EVs) represent promising targets as novel theranostic biomarkers, and they emerge as important players in the maintenance of organismal homeostasis and the progression of a wide spectrum of diseases. While the current research focuses on the characterization of endogenous exosomes with the endosomal origin, microvesicles blebbing from the plasma membrane have gained increasing attention in health and sickness, which are featured by an abundance of surface molecules recapitulating the membrane signature of parent cells. Here, a reproducible procedure is presented based on differential centrifugation for extracting and characterizing EVs from the plasma and solid tissues, such as the bone. The protocol further describes subsequent profiling of surface antigens and protein cargos of EVs, which are thus traceable for their derivations and identified with components related to potential function. This method will be useful for correlative, functional, and mechanistic analysis of EVs in biological, physiological, and pathological studies.

The present protocol describes a method to extract extracellular vesicles from the peripheral blood and solid tissues with subsequent profiling of surface antigens and protein cargos.

Plazma ve Solid Dokulardan İzlenebilir ve İşlevselleştirilmiş Hücre Dışı Veziküllerin İzlenmesi ve Analizi

Circulating and tissue-resident extracellular vesicles (EVs) represent promising targets as novel theranostic biomarkers, and they emerge as important ...

Görüntüleme Akış Sitometrisi Kullanılarak Mikrobiyal Otoagregasyonun Kantitatif Analizi

Imaging Flow Cytometry to Study Microbial Autoaggregation

Beneficial and probiotic bacteria play essential roles in their hosts, providing various health benefits, including immunity to infectious diseases. The Lactobacillaceae family consists of Gram-positive bacteria with confirmed probiotic properties. This study utilizes Lactobacillaceae species as a model to demonstrate the effectiveness of single-cell high throughput analysis in studying cellular aggregation. The focus is on analyzing the response of these beneficial species to simple carbohydrates from the diet.
The study showcases how Imaging Flow Cytometry (IFC) can overcome the fundamental differences in the assembly of probiotic bacteria in the presence and absence of carbohydrates. IFC combines the power and speed of conventional flow cytometry with the spatial resolution of microscopy, enabling high-rate complex morphometric measurements in a phenotypically defined manner across a library of beneficial bacterial strains and conditions. This protocol provides insights into the autoaggregation of Lactobacillaceae species and sheds light on their response to dietary carbohydrates, contributing to understanding the mechanisms behind the beneficial effects of these probiotic bacteria.

Yazar Spotlight: Görüntüleme Akış Sitometrisi Kullanarak Mikrobiyal Otoagregasyonda Araştırmaları Geliştirme

This protocol describes a quantitative approach to measure microbial autoaggregation using imaging flow cytometry.

Mikrobiyal otoagregasyonu incelemek için görüntüleme akışı sitometrisi

Beneficial and probiotic bacteria play essential roles in their hosts, providing various health benefits, including immunity to infectious diseases. The ...