Yazarlar, yardım için Pekin Ulusal Biyolojik Bilimler Enstitüsü&#39;nü kabul etmek istiyorlar. Bu çalışma Pekin Belediye Tabiat Bilimleri Vakfı (No. Z17110200040000) tarafından desteklenmiştir.

Bu protokolde kullanılan tüm prosedürler, Pekin Ulusal Biyolojik Bilimler Enstitüsünün Laboratuar Hayvanlarının Bakımı ve Kullanımı için Yönergelerdeki önerilere uygun olarak gerçekleştirildi. 8 haftalık CD-1 erkek fareler, deneyler gerçekleştirilene kadar spesifik bir patojen içermeyen (SPF) tesiste barındırıldı. Ameliyatlar tamamen anestezi uygulanmış fareler kullanılarak gerçekleştirildi (diğer bir deyişle çimdikleme tepkileri olmadan). Ameliyattan sonra fareler yeterli miktarda yiyecek ve tatlı su ile sıcak, nemli bir odada tutuldu. Fareler, intraperitoneal enjeksiyon yoluyla verilen bir anestetik doz aşımı kullanılarak öldürüldü. 1. Fare PNX Cerrahisi <ol><li> İntraperitoneal (IP) enjeksiyon yoluyla farelere sodyum fenobarbital (120 mg / kg vücut ağırlığı) ve buprenorfin (0.1 mg / kg vücut ağırlığı) ile tamamen uyartın. Fareler artık parmak ucu ile tepki göstermediğinde ameliyat yapın. </li><li> Farelerin sol toraksındaki saçları kimyasal madde ile çıkarınilatory tedavisi (~ 3 x 3 cm 2 alan). </li><li> Her fareyi, ventral tarafı operatöre bakacak şekilde entübasyon platformuna sabitleyin ( Şekil 1A ). </li><li> Farenin dilini çekin ve ses tellerini, kateterleri 18 ( Şekil 1A ) yönlendirmek için bir çentik içeren küçük bir hayvan laringoskopu ile aydınlatın. </li><li> Solunum sırasında ses tellerinin hareketlerini gözleyerek ses tellerini ayırt edin. Anterior açı 19 ile trakea 20 G intravenöz entübasyon kanülünü yavaşça yerleştirin. </li><li> Fareleri sağ yanal yatık konuma getirin ve kanülü mekanik bir ventilatöre bağlayın ( örn., Basınç kontrollü , Malzeme Tablosuna bakın). Fare göğsünün solunum hareketlerini gözleyerek kanülün trakeaya sokulduğunu kontrol edin ( Şekil 1B ). </li><li> İnspirasyon basıncını ayarlayınVentilatörü 12 cm H 2 O&#39;ye ayarlayın ve solunum hızını dakikada 120 nefes alma değerine ayarlayın ( Şekil 1B ). </li><li> Cerrahi bölgedeki cildi betadin ve% 70 etanol ile arındırın. </li><li> 5. interkostal boşluktaki boşluğa Noyes Bahar Makas (kesici kenar: 14 mm, uç çapı: 0.275 mm) ile cilt ve kasları keserek 2-3 cm posterolateral torakotomi insizyonu yapın ( Şekil 2B , C ). Torakotomi prosedürü için kullanılan cerrahi aletler kullanımdan önce sterilize edilir. </li><li> Sol akciğerin ortaya çıkması için 5. interkostal boşluğa 1.5 cm&#39;lik bir kesi yapın ( Şekil 2D , E ). Ameliyat sırasında kanamayı durdurmak için yüksek sıcaklıkta bir koterizer kullanın. </li><li> Sol akciğer lobunun üçte birini künt uçlu forseps ile göğüsten kaldırın ( Şekil 2F ) ve daha sonra solun tamamını dışarı çekmek için bir pamuk çubuğu kullanınAkciğer ( Şekil 2G ). </li><li> Sol akciğer lobunun pulmoner arter ve bronşunu belirleyin ( Şekil 2G ). </li><li> Bronşu ve damarları ipek cerrahi dikişle hilumda sıkıca bağlayın ve ligasyondan 3-4 mm uzakta sol akciğer lobunu kesin ( Şekil 2H , I ). NOT: (toraks boşluğunda yani hava veya gaz) pnömotoraks neden olabilir sol hilusta, üzerinde dikiş knot kesmeye özen gösterin. </li><li> 1 dikiş ile göğüs duvarını kapatın ve kas tabakasını ve cilt tabakasını sırayla 5-6 kesilmiş sütürleri kullanarak dikin. Her dikiş arasında 3-4 mm boşluk bırakın ( Şekil 2M , 2N ). NOT: Cerrahi dikiş iğnesini kalpten uzak tutun; İstenmeyen kardiyak ponksiyon ölümle sonuçlanır. </li><li> Cerrahi alanı povidon iyotla dezenfekte edin. </li><li> AfteCerrahi işlem, fareyi 38 ° C&#39;lik bir termal yastığa yerleştirin ve spontan solunum hareketleri başlayana kadar fareyi vantilatörün içine bağlayın ( Şekil 2O ). </li></ol> 2. Protez İmplantasyonu <ol><li> PNX prosedürünün adımları 1.1 - 1.13&#39;ü gerçekleştirin (farenin sol akciğer lobu çıkarıldığı noktaya kadar). </li><li> Künt forseps kullanarak silikon protezin (müşterinin yaptığı, 12 mm uzunluğunda, 3 mm kalınlığında, 7 mm genişliğinde, 0.2 g, elipsoid şeklinde) kelepçeleyin ( Şekil 2J ). Silikon protezi yerleştirmeden önce sterilize edin. </li><li> Göğüs boşluğunu ortaya çıkarmak için kaburgayı bir elinizle forsepsle tutun ve daha sonra başka bir elle boş protezi sol boş torak boşluğuna yerleştirin. NOT: Ekleme açısı protezin ön yüzü ile göğüs arası yüzeyi arasında yaklaşık 45 derecedir ( Şekil 2K ,L). Protezi yerleştirirken çok nazik olun. Aşırı kuvvet plevral rüptüre neden olur. </li><li> Protezin sol boş torak boşluğunu kapladığından emin olmak için künt forsepsle protezin yönünü ayarlayın. </li><li> Fare PNX prosedürünün 1.14 - 1.16 adımlarını uygulayın. </li></ol> 3. ILV ölçümü <ol><li> Tek kullanımlık bir serolojik pipetten (10 mL), bir iğne adaptörü olan 40 cm uzunluğunda bir esnek borudan, bir akış hızı kontrol valfinden ve 18 G&#39;lik bir iğneden çıkarılmış bir pistondan oluşan özel bir cihaz hazırlayın (&quot;şişme tüpü&quot;). Montajdan sonra, pipeti bantla bir tahtaya sabitleyin ( Şekil 3A ). Pipet üstü ile deney tezgahı arasındaki mesafe en az 30 cm olmalıdır. </li><li> Elle çalkalanarak, 55 ° C&#39;lik bir su banyosunda 500 gr önceden ısıtılan 1x fosfat tamponlu salin (PBS) içinde 20 g PFA&#39;nın eritilmesi ile taze% 4 paraformaldehit (PFA) fiksasyon çözeltisi hazırlayınSolüsyon berrak olana kadar her 10 dakikada bir temizleyin. Oda sıcaklığına soğuttuktan sonra, solüsyonu 0.45 um&#39;lik bir filtreyle süzün. DİKKAT: PFA kullanırken uygun kişisel koruyucu ekipmanı (PPE) giyin. </li><li> Anestezik doz aşımı dozunda (% 0.8 fenobarbital sodyum, 1000 U / mL heparin) fareleri kurban edin. </li><li> Her fare bir polistiren diseksiyon plakası üzerinde sabitleyin ve% 70 alkol ile püskürtün. </li><li> Farenin göğsünü dikkatli bir şekilde açın ve akciğer loblarını iyice ortaya çıkarmak için göğüs uçlarını makas kullanarak kesin. </li><li> Trakea maruz bırakmak için aşırı makroyu makas kullanarak çıkarın. Trakeayı özofagustan ayırdığınızdan emin olun. </li><li> Karın aortunu kesin ve sağ kalp sağ ventrikülüne 25-gauge iğne yerleştirin; Bu yerleştirmeden önce iğneyi 20 mL şırınga ile birleştirin. Akciğerler beyaza dönüşene kadar kan hücrelerini çıkarmak için yavaşça kalbe 1x PBS itin. Tipik olarak, pulmoner kan damarlarını temizlemek için 5 - 10 mL PBS gereklidir. </li><li> Doldurun thE% 4&#39;lük yeni PFA ile özel olarak yapılmış enflasyon tüpünü ve enflasyon tüpündeki tüm kabarcıkları çıkartın. </li><li> Enflasyon borusunun 18-mertebeli iğnesini trakea sokun ve sıvı sızıntısını önlemek için trakeaya gemi klipsleri ile bağlayın. </li><li> 25 sm bir sabit, transpülmoner basınç / H2O 2, 20% 4 PFA ile akciğerlerini şişirmek. Akciğerleri oda sıcaklığında 2 saat inkübe ederek tamamen akciğer genişletmesini sağlayın. Bu &quot;ön-düzeltme&quot; adımı, akciğer morfolojisini korumak için kritik önem taşır. <ol><li> Enflasyon borusunu izleyerek ilk% 4 PFA hacminin değerini kaydedin ve nihai hacmi kaydedin. İç akciğer hacmi, ilk% 4 PFA hacminden eksi son 4% PFA hacmine eşittir. </li></ol></li><li> Trakea bağlayın ve makas kullanarak, çevredeki bağ dokularından akciğerleri hafifçe parçalayın (akciğerleri sağlam tutun). Akciğerlere zarar vermemek için çok nazik olun. </li><li> incuAkciğerleri, 4 ° C&#39;de 12 saat boyunca çalkalayıcıda hafifçe çalkalayarak (50 dev / dak)% 4&#39;lük PFA ile dolu 50 ml&#39;lik bir konik tüpe koyun. Doku işleme ve boyama işlemlerine devam edin (bkz. Bölüm 4). </li></ol> 4. Doku Gömme, Kesitleme ve Hematoksilen ve Eozin (H &amp; E) Boyama <ol><li> Düzeltmeden sonra, akciğerlerden kalbi ve aşırı bağ dokularını düzeltmek için Noyes Bahar Makas kullanın. Akciğer loblarını trakeaya bağlayan bronşu keserek bireysel akciğer loblarını nazikçe ayırın. </li><li> Bir yörünge çubuğu çalkalayıcıda (50 dev / dak) akciğer loblarını 50 mL 1x PBS&#39;de (30 dakika / yıkama) 3-4 kez yoğun yıkayın. </li><li> Son yıkamayı takiben, doku 50 mL&#39;lik konik tüplerin dibine (yaklaşık 12 saat) batıncaya kadar akciğer loblarını 4 ° C&#39;de% 30 sükroz çözeltisine (1x PBS) daldırmak suretiyle kriyoproteksiyona uğratın. </li><li> Gömülmeden ve cryosectioning dokularından önce, forseps ile tüplerden akciğer lob örnekleri çıkarın, acces korumakHistolojik analiz için sory lobları, aksesuar lop numunelerinin yüzeyinden kalan sukroz çözeltisini ilave edin ve sonra yaklaşık 30 dakika boyunca optimum kesme ısısı (OCT) bileşiğini içeren bir Petri kabına iyice daldırın. </li><li> Cryomolds kullanarak sıvı azot içerisindeki OCT gömülü aksesuar lob örneklerini dondurun. Lobun en geniş yüzey alanını kalıbın tabanına paralel konuma getirin. </li><li> Histolojik analiz için cryosectioning sırasında her numune için toplam üç 10-μm kalınlığında bölümleri hazırlayın. İlk 1 mm&#39;lik dokuyu atın, 10 mm kalınlığında bir bölüm toplamayın, 0.5 mm doku atın, başka bir bölüm toplamayın, 0.5 mm doku atın ve üçüncü (son) bölümü toplayın. </li><li> H &amp; E boyamayı yapmadan önce bölümleri 1 saat boyunca havayla kurutun. </li><li> H &amp; E boyama yapın <ol><li> Musluk suyundaki 3-4 değişikliklerdeki bölümleri yıkayın ve daha sonra bölümleri taze hematoksilen içinde 2 dakika boyayın; Musluk suyunun altında yıkayın; Fazla hematoksileni çıkarmak için bölümü% 1 HC1-% 70 etanol solüsyonuna iki kez batırın. </li><li> Parçayı taze eozin içinde 3 dakika boyunca boyayın; % 95 etanol içinde iki ardışık 30 s yıkama ve% 100 etanol ile iki 30 s yıkama ile bölümleri kurutun; Ksilen bölümlerini 30 s temizleyin, temizleme adımını bir kez taze ksilen içinde tekrarlayın; Slaytları, cam lamelleri kullanarak montaj ortalığına monte edin. </li></ol></li></ol> 5. MLI ölçümü <ol><li> Parlak alan mikroskopu kullanarak H &amp; E lekeli aksesuar lob bölümlerinin dijital görüntülerini (20X büyütme) elde edin. </li><li> MLI&#39;yi ölçmek için, 3 bölümden oluşan uygun alanlardan (arterler, damarlar, ana hava yolları ve alveolar kanallar olmaksızın) rastgele toplam 15 bindirmeyen görüntü (1000 μm x 1000 μm) seçin. </li><li> 10 adet eşit dağıtılmış dikey çizgi ve 10 adet eşit olarak dağıtılan yatay çizgi ile bir ızgarayı yerleştirin.Cetvel aracını kullanarak seçilen alanlarda gth (1000 μm); Her hat 100 μm aralıklarla ayrılır ( Şekil 4B ). </li><li> Bir kesişmenin değerini iki bitişik alveolar epitelyum arasındaki doğrusal uzunluk olarak tanımlayın. Her bir 1000 μm uzunluk çizgisi boyunca tüm kesişme değerlerini ölçün. </li><li> Her bir ızgara için, 10 yatay 1000 μm uzunluk çizgisi ve 10 dikey 1.000 um uzunluk çizgisi arasındaki tüm kesme noktalarının değerlerini ölçün. NOT: MLI, her aksesuar lob için hazırlanan 3 bölümden analiz edilen toplam 15 ızgaradan kesme uzunluklarının ortalama değeridür. </li></ol> 6. ISA&#39;nın hesaplanması <ol><li> Denklem 1&#39;i kullanarak ISA&#39;yı hesaplayın ( Giriş&#39;e bakın). ILV&#39;nin ölçümü için bölüm 3&#39;e bakınız ve MLI&#39;nin nicelendirilmesi için bölüm 5&#39;e bakınız. </li></ol>

<ol>
	<li>Liu, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MAPK-Mediated+YAP+Activation+Controls+Mechanical-Tension-Induced+Pulmonary+Alveolar+Regeneration.">MAPK-Mediated YAP Activation Controls Mechanical-Tension-Induced Pulmonary Alveolar Regeneration.</a> Cell Rep. 16 (7), 1810-1819 (2016).</li><li>Thurlbeck, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Internal+surface+area+and+other+measurements+in+emphysema.">Internal surface area and other measurements in emphysema.</a> Thorax. 22 (6), 483-496 (1967).</li><li>Knudsen, L., Weibel, E. R., Gundersen, H. J. G., Weinstein, F. V., Ochs, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+air+space+size+characteristics+by+intercept+(chord)+measurement:+an+accurate+and+efficient+stereological+approach.">Assessment of air space size characteristics by intercept (chord) measurement: an accurate and efficient stereological approach.</a> J Appl Physiol. 108 (2), 412-421 (2010).</li><li>Weibel, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Morphometry of the Human Lung. , (1963).</li><li>Duguid, J. B., Young, A., Cauna, D., Lambert, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+internal+surface+area+of+the+lung+in+emphysema.">The internal surface area of the lung in emphysema.</a> J Pathol Bacteriol. 88, 405-421 (1964).</li><li>Branchfield, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pulmonary+neuroendocrine+cells+function+as+airway+sensors+to+control+lung+immune+response.">Pulmonary neuroendocrine cells function as airway sensors to control lung immune response.</a> Science. 351 (6274), 707-710 (2016).</li><li>Ding, B. -. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endothelial-derived+angiocrine+signals+induce+and+sustain+regenerative+lung+alveolarization.">Endothelial-derived angiocrine signals induce and sustain regenerative lung alveolarization.</a> Cell. 147 (3), 539-553 (2011).</li><li>Dunnill, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+methods+in+the+study+of+pulmonary+pathology.">Quantitative methods in the study of pulmonary pathology.</a> Thorax. 17 (4), 320-328 (1962).</li><li>Weibel, E. R., Gomez, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Architecture+of+the+human+lung.+Use+of+quantitative+methods+establishes+fundamental+relations+between+size+and+number+of+lung+structures.">Architecture of the human lung. Use of quantitative methods establishes fundamental relations between size and number of lung structures.</a> Science. 137 (3530), 577-585 (1962).</li><li>Thurlbeck, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+internal+surface+area+of+nonemphysematous+lungs.">The internal surface area of nonemphysematous lungs.</a> Am Rev Respir Dis. 95 (5), 765-773 (1967).</li><li>Butler, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evidence+for+adult+lung+growth+in+humans.">Evidence for adult lung growth in humans.</a> N Engl J Med. 367 (16), 244-247 (2012).</li><li>Hsia, C. C. W., Herazo, L. F., Fryder-Doffey, F., Weibel, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Compensatory+lung+growth+occurs+in+adult+dogs+after+right+pneumonectomy.">Compensatory lung growth occurs in adult dogs after right pneumonectomy.</a> J Clin Invest. 94 (1), 405-412 (1994).</li><li>Thurlbeck, S. W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pneumonectomy+in+Rats+at+Various+Ages.">Pneumonectomy in Rats at Various Ages.</a> Am Rev Respir Dis. 120 (5), 1125-1136 (1979).</li><li>Cagle, P. T., Langston, C., Thurlbeck, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Effect+of+Age+on+Postpneumonectomy+Growth+in+Rabbits.">The Effect of Age on Postpneumonectomy Growth in Rabbits.</a> Pediatr Pulmonol. 5 (2), 92-95 (1988).</li><li>Langston, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alveolar+multiplication+in+the+contralateral+lung+after+unilateral+pneumonectomy+in+the+rabbit.">Alveolar multiplication in the contralateral lung after unilateral pneumonectomy in the rabbit.</a> Am Rev Respir Dis. 115 (1), 7-13 (1977).</li><li>Cohn, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Factors+Affecting+The+Postnatal+Growth+of+The+Lung.">Factors Affecting The Postnatal Growth of The Lung.</a> Anatomical Record. 75 (2), 195-205 (1939).</li><li>Hsia, C. C., Wu, E. Y., Wagner, E., Weibel, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preventing+mediastinal+shift+after+pneumonectomy+impairs+regenerative+alveolar+tissue+growth.">Preventing mediastinal shift after pneumonectomy impairs regenerative alveolar tissue growth.</a> Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 281 (5), L1279-L1287 (2001).</li><li>Das, S., MacDonald, K., Chang, H. -. Y. S., Mitzner, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simple+method+of+mouse+lung+intubation.">A simple method of mouse lung intubation.</a> J Vis Exp. (73), e50318 (2013).</li><li>Liu, S., Cimprich, J., Varisco, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mouse+pneumonectomy+model+of+compensatory+lung+growth.">Mouse pneumonectomy model of compensatory lung growth.</a> J Vis Exp. (94), (2014).</li><li>Silva, M. F. R., Zin, W. A., Saldiva, P. H. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Airspace+configuration+at+different+transpulmonary+pressures+in+normal+and+paraquat-induced+lung+injury+in+rats.">Airspace configuration at different transpulmonary pressures in normal and paraquat-induced lung injury in rats.</a> Am J Respir Crit Care Med. 158 (4), 1230-1234 (1998).</li><li>Yilmaz, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Noninvasive+quantification+of+heterogeneous+lung+growth+following+extensive+lung+resection+by+high-resolution+computed+tomography.">Noninvasive quantification of heterogeneous lung growth following extensive lung resection by high-resolution computed tomography.</a> J Appl Physiol. 107 (5), 1569-1578 (2009).</li><li>Voswinckel, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterisation+of+post-pneumonectomy+lung+growth+in+adult+mice.">Characterisation of post-pneumonectomy lung growth in adult mice.</a> Eur Respir J. 24 (4), 524-532 (2004).</li><li>Ravikumar, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regional+Lung+Growth+and+Repair+Regional+lung+growth+following+pneumonectomy+assessed+by+computed+tomography.">Regional Lung Growth and Repair Regional lung growth following pneumonectomy assessed by computed tomography.</a> J Appl Physiol. 97, 1567-1574 (2004).</li><li>Gibney, B. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+murine+post-pneumonectomy+lung+regeneration+by+18FDG+PET+imaging.">Detection of murine post-pneumonectomy lung regeneration by 18FDG PET imaging.</a> EJNMMI Res. 2 (1), (2012).</li><li>Mu&#241;oz-Barrutia, A., Ceresa, M., Artaechevarria, X., Montuenga, L. M., Ortiz-De-Solorzano, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantification+of+lung+damage+in+an+elastase-induced+mouse+model+of+emphysema.">Quantification of lung damage in an elastase-induced mouse model of emphysema.</a> Int J Biomed Imaging. 2012, (2012).</li></ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Bu protokolde, fare sol akciğer PNX ve protez yerleştirildikten sonra pulmoner parametrelerin ölçümü hakkında ayrıntılı açıklamalar sağlarız. ISA, şimdi birçok pulmoner hastalıkta solunum fonksiyonlarının değerlendirilmesi ve yaralanmanın yol açtığı alveol rejenerasyonunda önemli bir metrik olarak düşünülmektedir. Bununla birlikte, pulmoner araştırma topluluğu ISA&#39;nın yararlı bir metriği olarak yararlı olduğu konusunda anlaşmaya rağmen, günümüze kadar ISA hesaplamak için k...

Akciğerin temel işlevi, kan damarları ile atmosfer arasındaki oksijen ve karbon dioksit değişimidir. Bronkopulmoner displazi (BPD), kronik obstrüktif akciğer hastalığı (COPD) ve akut solunum yolu enfeksiyonları gibi akciğer hastalıkları, ISA 2 azalmasına neden olur. Akciğer hastalığını araştıran araştırmacılar, MLI, ILV, gaz değişim birimi sayısı, ISA ve akciğer dokusu uyumluluğu 2 , 3 dahil olmak üzere akciğerlerdeki morfolojik değişiklikleri değerlendirmek için çeşitli niceliksel yöntemler geliştirmiştir. Weibel ve ark.nın öncü çalışmaları 4 ve Duguid ve ark. 5 , ISA&#39;nın insan akciğerlerindeki akciğer gaz değişim kapasitesinin doğrudan bir ölçümü olarak kullanılabileceğini ve amfizemin ciddiyetini belirlemek için bir kriter olarak kullanılabileceğini birlikte ortaya koymuştur. Son beş yılda yayınlanan bir dizi çalışma, akciğer morfolojik parametrelerini ( örn. </eM&gt; ISA ve MLI) 6 gelişme sırasında ve yaralanma PNX 1 , 7 kurtarma sırasında farelerin akciğerlerinde morfolojik ve fonksiyonel değişiklikleri değerlendirmek için. ISA, Denklem 8 , 9 kullanılarak hesaplanır: <img alt="Denklem" src="/files/ftp_upload/56114/56114eq1.jpg" /> , Burada ILV, iç akciğer hacmi ve MLI, pulmoner periferik hava sahası büyüklüğünü 10 gösteren aracı bir parametredir. PNX, bir veya daha fazla akciğer lobunun cerrahi olarak çıkarılması, insanlar 11 , fareler 1 , köpekler 12 , sıçanlar 13 ve tavşanlar 14 , 15 dahil olmak üzere birçok türe ait alveol rejenerasyonunu uyardığı yaygın olarak bildirilmiştir. SaplamaOn dört gün sonra fareler, akciğer y sonrası PNX önceden var olan alveoller genişlemesi ve alveollere de novo oluşumu hem ISA, ilv restorasyonu ve kalan akciğer dokularında 1 alveol sayısını katkı göstermiştir. Biz ve diğerleri, PNX&#39;yi takiben boş göğüs boşluğuna sünger, balmumu veya özel şekil verilmiş bir protez gibi materyallerin sokulduğunu ( örn. , Protez implantasyonu) alveol rejenerasyonunu engellediğini gösterdik. Artık mekanik kuvvetin alveol rejenerasyonunu başlatmak için en önemli faktörlerden biri olarak işlev gördüğü tam olarak bilinmektedir 1 , 16 , 17 . Bu tür çalışmalar, alveol rejenerasyonunu kantitatif olarak değerlendirmek için bir kriter olarak PNX ile tedavi edilen ve Protez implante edilen akciğerlerden alınan ISA değerlerinin etkinliğini vurgulamıştır. Gözlemci önyargılarının ölçülen vayı önemli derecede etkilediği bilinmektedirAkciğer morfolojik parametreleri ( örn. , MIL ve ILV). ISA hesaplamasında kullanılan iki parametre olan hem ILV hem de MLI&#39;yi belirlemede bu önyargıdan kurtulmak için standart protokoller kullanılabilir. Burada, bu akciğer parametrelerini ölçmek için oldukça ayrıntılı ve standartlaştırılmış protokoller sunuyoruz. Daha da önemlisi, ISA&#39;yı doğru bir şekilde ölçebilme özelliği, yaralanmaya bağlı alveolar rejenerasyon modellerinde akciğer fonksiyonlarının güvenilirliğini ve tekrarlanabilirliğini artırmayı ve çoklu pulmoner hastalıklarda mekanik keşifleri kolaylaştırmayı taahhüt eder.

<table width="881">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="width:411px;height:21px;">Low cost cautery kit</td>
			<td style="width:167px;">Fine Science Tools</td>
			<td style="width:136px;">18010-00</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Noyes scissors</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>15012-12</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Standard pattern forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11000-12</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Castroviejo Micro Needle Holders</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>12060-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Vessel clips</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>18374-44</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">I. V. Cannula-20 gauge</td>
			<td>Jinhuan Medical Product Co., LTD.</td>
			<td>29P0601</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Surgical suture</td>
			<td>Jinhuan Medical Product Co., LTD.</td>
			<td>F602</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Mouse intubation platform</td>
			<td>Penn-Century, Inc</td>
			<td>Model MIP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Small Animal Laryngoscope</td>
			<td>Penn-Century, Inc</td>
			<td>Model LS-2-M</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">TOPO Small Animal Ventilator</td>
			<td>Kent Scientific</td>
			<td>RSP1006-05L</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thermal pad</td>
			<td>Stuart equipment</td>
			<td>SBH130D</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Pentobarbital sodium salt</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P3761</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Heparin sodium salt</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>H3393</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hematoxylin Solution</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>GHS132</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Eosin Y solution, alcoholic</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>HT110116</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">10 ml Pipette</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>170356</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Paraformaldehyde</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P6148</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">O.C.T Compound</td>
			<td>Tissue-Tek</td>
			<td>4583</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">cryosection machine</td>
			<td>Leica</td>
			<td>CM1950</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Disposable Base Molds</td>
			<td>Fisher HealthCare</td>
			<td>22-363-553</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">18 gauge needle</td>
			<td>Becton Dickinson</td>
			<td>305199</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Povidone iodine</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>19-027132</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">70% ethanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP82011</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Infusion sets for single use</td>
			<td>Weigao</td>
			<td>SFDA 2012 3661704</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Phosphate buffered saline</td>
			<td>Gibco</td>
			<td align="right">10010023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tapes</td>
			<td>3M Scotch</td>
			<td style="width:136px;">8915</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Cotton pad</td>
			<td>Vinda</td>
			<td>Dr.P</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Silicone prosthesis</td>
			<td>Custom made</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Brightfield microscope</td>
			<td>Olympus</td>
			<td>VS120</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ruler tool</td>
			<td>Adobe Photoshop</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a standardized method for measuring internal lung surface area via mouse pneumonectomy and prosthesis implantation

Pulmonary morphology, physiology, and respiratory functions change in both physiological and pathological conditions. Internal lung surface area (ISA), representing the gas-exchange capacity of the lung, is a critical criterion to assess respiratory function. However, observer bias can significantly influence measured values for lung morphological parameters. The protocol that we describe here minimizes variations during measurements of two morphological parameters used for ISA calculation: internal lung volume (ILV) and mean linear intercept (MLI). Using ISA as a morphometric and functional parameter to determine the outcome of alveolar regeneration in both pneumonectomy (PNX) and prosthesis implantation mouse models, we found that the increased ISA following PNX treatment was significantly blocked by implantation of a prosthesis into the thoracic cavity1. The ability to accurately quantify ISA is not only expected to improve the reliability and reproducibility of lung function studies in injured-induced alveolar regeneration models, but also to promote mechanistic discoveries of multiple pulmonary diseases.

<html> Burada, PNX ile işleme tabi tutulan bir grup ve bir protez implantasyonu (Protez yerleştirilmiş) grubu ile bir deney gerçekleştirdik. Bu gruplamalar, araştırma grubumuzdan daha önce yayınlanmış bir çalışmada kullanılan gruplamalarla aynıdır 14 . Fare PNX ve protez yerleştirme prosedürleri Şekil 2&#39;de gösterilmektedir. Ameliyatlar ve kantifikasy...

Watch this Scientific Journal Video about A Standardized Method for Measuring Internal Lung Surface Area via Mouse Pneumonectomy and Prosthesis Implantation at JoVE.com

A Standardized Method for Measuring Internal Lung Surface Area via Mouse Pneumonectomy and Prosthesis Implantation

Akciğer hastalıklarında ve yaralanmaya bağlı alveol rejenerasyonunda akciğer morfolojisi ve fizyolojisini değerlendirmek için iç akciğer yüzey alanı (ISA) kritik bir kriterdir. Burada hem akciğer pnömonektomisinde hem de protez implantasyon fare modellerinde ISA için önyargı önlemeyi en aza indirecek standart bir yöntem açıklanmaktadır.

Fare Pnömonektomi ve Protez İmplantasyonu ile İç Akciğer Yüzey Alanının Ölçümü için Standart Bir Yöntem

Pulmonary morphology, physiology, and respiratory functions change in both physiological and pathological conditions. Internal lung surface area (ISA), ...

a-standardized-method-for-measuring-internal-lung-surface-area-via

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

13.1K Görüntüleme.  Peking University.  Akciğer hastalıklarında ve yaralanmaya bağlı alveol rejenerasyonunda akciğer morfolojisi ve fizyolojisini değerlendirmek için iç akciğer yüzey alanı (ISA) kritik bir kriterdir. Burada hem akciğer pnömonektomisinde hem de protez implantasyon fare modellerinde ISA için önyargı önlemeyi en aza indirecek standart bir yöntem açıklanmaktadır. 

Video: A Standardized Method for Measuring Internal Lung Surface Area via Mouse Pneumonectomy and Prosthesis Implantation

Microbead Implantation in the Zebrafish Embryo

The zebrafish has emerged as a valuable genetic model system for the study of developmental biology and disease. Zebrafish share a high degree of genomic conservation, as well as similarities in cellular, molecular, and physiological processes, with other vertebrates including humans. During early ontogeny, zebrafish embryos are optically transparent, allowing researchers to visualize the dynamics of organogenesis using a simple stereomicroscope. Microbead implantation is a method that enables tissue manipulation through the alteration of factors in local environments. This allows researchers to assay the effects of any number of signaling molecules of interest, such as secreted peptides, at specific spatial and temporal points within the developing embryo. Here, we detail a protocol for how to manipulate and implant beads during early zebrafish development.

The zebrafish is an excellent model system for genetic and developmental studies. Bead implantation is a valuable tissue manipulation technique that can be used to interrogate developmental mechanisms by introducing alterations in local cellular environments. This protocol describes how to perform microbead implantation in the zebrafish embryo.

Zebra balığı Embriyo microbead İmplantasyonu

The zebrafish has emerged as a valuable genetic model system for the study of developmental biology and disease. Zebrafish share a high degree of genomic ...

Gelişim Biyolojisi

Method of Studying Palatal Fusion using Static Organ Culture

Cleft lip and palate are among the most common of all birth defects. The secondary palate forms from mesenchymal shelves covered with epithelium that adheres to form the midline epithelial seam (MES). The theories suggest that MES cells follow an epithelial to mesenchymal transition (EMT), apoptosis and migration, making a fused palate 1. Complete disintegration of the MES is the final essential phase of palatal confluence with surrounding mesenchymal cells. We provide a method for palate organ culture. The developed in vitro protocol allows the study of the biological and molecular processes during fusion. The applications of this technique are numerous, including evaluating responses to exogenous chemical agents, effects of regulatory and growth factors and specific proteins. Palatal organ culture has a number of advantages including manipulation at different stages of development that is not possible using in vivo studies.

Studies of palate development are motivated by the incidence of cleft palate, a birth defect that imposes a tremendous health burden and can leave lasting disfigurement. We demonstrate here a technique to culture palatal shelves that can be used to study different signaling pathways involved in palatal development and fusion.

Statik Organ Kültürü kullanarak Palatal Fusion incelenmesi yöntemi

Cleft lip and palate are among the most common of all birth defects. The secondary palate forms from mesenchymal shelves covered with epithelium that ...

Production and Administration of Therapeutic Mesenchymal Stem/Stromal Cell (MSC) Spheroids Primed in 3-D Cultures Under Xeno-free Conditions

Mesenchymal stem/stromal cells (MSCs) hold great promise in bioengineering and regenerative medicine. MSCs can be isolated from multiple adult tissues via their strong adherence to tissue culture plastic and then further expanded in vitro, most commonly using fetal bovine serum (FBS). Since FBS can cause MSCs to become immunogenic, its presence in MSC cultures limits both clinical and experimental applications of the cells. Therefore, studies employing chemically defined xeno-free (XF) media for MSC cultures are extremely valuable. Many beneficial effects of MSCs have been attributed to their ability to regulate inflammation and immunity, mainly through secretion of immunomodulatory factors such as tumor necrosis factor-stimulated gene 6 (TSG6) and prostaglandin E2 (PGE2). However, MSCs require activation to produce these factors and since the effect of MSCs is often transient, great interest has emerged to discover ways of pre-activating the cells prior to their use, thus eliminating the lag time for activation in vivo. Here we present protocols to efficiently activate or prime MSCs in three-dimensional (3D) cultures under chemically defined XF conditions and to administer these pre-activated MSCs in vivo. Specifically, we first describe methods to generate spherical MSC micro-tissues or &#39;spheroids&#39; in hanging drops using XF medium and demonstrate how the spheres and conditioned medium (CM) can be harvested for various applications. Second, we describe gene expression screens and in vitro functional assays to rapidly assess the level of MSC activation in spheroids, emphasizing the anti-inflammatory and anti-cancer potential of the cells. Third, we describe a novel method to inject intact MSC spheroids into the mouse peritoneal cavity for in vivo efficacy testing. Overall, the protocols herein overcome major challenges of obtaining pre-activated MSCs under chemically defined XF conditions and provide a flexible system to administer MSC spheroids for therapies.

Production and Administration of Therapeutic Mesenchymal Stem/Stromal Cell MSC Spheroids Primed in 3-D Cultures Under Xeno-free Conditions

The therapeutic potential of mesenchymal stem/stromal cells (MSCs) is well-documented, however the best method of preparing the cells for patients remains controversial. Herein, we communicate protocols to efficiently generate and administer therapeutic spherical aggregates or 'spheroids' of MSCs primed under xeno-free conditions for experimental and clinical applications.

Xeno-ücretsiz Koşullarda 3-D Kültürler Üretim ve Tedavi Mezenkimal Kök Yönetim / Stromal Cell (MSC) küremsi Astarlı

Mesenchymal stem/stromal cells (MSCs) hold great promise in bioengineering and regenerative medicine. MSCs can be isolated from multiple adult tissues via ...

Isolation and Enrichment of Liver Progenitor Subsets Identified by a Novel Surface Marker Combination

During chronic liver injuries, progenitor cells expand in a process called ductular reaction, which also entails the appearance of inflammatory cellular infiltrate and epithelial cell activation. The progenitor cell population during such inflammatory reactions has mostly been investigated using single surface markers, either by histological analysis or by flow cytometry-based techniques. However, novel surface markers identified various functionally distinct subsets within the liver progenitor/stem cell compartment. The method presented here describes the isolation and detailed flow cytometry analysis of progenitor subsets using novel surface marker combinations. Moreover, it demonstrates how the various progenitor cell subsets can be isolated with high purity using automated magnetic and FACS sorting-based methods. Importantly, novel and simplified enzymatic dissociation of the liver allows for the isolation of these rare cell populations with a high viability that is superior in comparison to other existing methods. This is especially relevant for further studying progenitor cells in vitro or for isolating high-quality RNA to analyze the gene expression profile.

Liver injuries are accompanied by progenitor cell expansion that represents a heterogeneous cell population. Novel classification of this cellular compartment allows for the distinguishing of multiple subsets. The method described here illustrates the flow cytometry analysis and high purity isolation of various subsets that can be used for further assays.

İzolasyon ve Roman Yüzey Etiket Kombinasyon ile tanımlanır Karaciğer progenitör Alt Grupları zenginleştirilmesi

During chronic liver injuries, progenitor cells expand in a process called ductular reaction, which also entails the appearance of inflammatory cellular ...

Assessing Cardiomyocyte Subtypes Following Transcription Factor-mediated Reprogramming of Mouse Embryonic Fibroblasts

Direct reprogramming of one cell type into another has recently emerged as a powerful paradigm for regenerative medicine, disease modeling, and lineage specification. In particular, the conversion of fibroblasts into induced cardiomyocyte-like myocytes (iCLMs) by Gata4, Hand2, Mef2c, and Tbx5 (GHMT) represents an important avenue for generating de novo cardiac myocytes in vitro and in vivo. Recent evidence suggests that GHMT generates a greater diversity of cardiac subtypes than previously appreciated, thus underscoring the need for a systematic approach to conducting additional studies. Before direct reprogramming can be used as a therapeutic strategy, however, the mechanistic underpinnings of lineage conversion must be understood in detail to generate specific cardiac subtypes. Here we present a detailed protocol for generating iCLMs by GHMT-mediated reprogramming of mouse embryonic fibroblasts (MEFs). 
We outline methods for MEF isolation, retroviral production, and MEF infection to accomplish efficient reprogramming. To determine the subtype identity of reprogrammed cells, we detail a step-by-step approach for performing immunocytochemistry on iCLMs using a defined set of compatible antibodies. Methods for confocal microscopy, identification, and quantification of iCLMs and individual atrial (iAM), ventricular (iVM), and pacemaker (iPM) subtypes are also presented. Finally, we discuss representative results of prototypical direct reprogramming experiments and highlight important technical aspects of our protocol to ensure efficient lineage conversion. Taken together, our optimized protocol should provide a stepwise approach for investigators to conduct meaningful cardiac reprogramming experiments that require identification of individual CM subtypes.

This manuscript describes a step-by-step protocol for the generation and quantification of diverse reprogrammed cardiac subtypes using a retrovirus-mediated delivery of Gata4, Hand2, Mef2c, and Tbx5.

Fare embriyonik fibroblastlar transkripsiyon faktör aracılı yeniden programlanması sonra kardiyomiyosit alt tiplerini değerlendirilmesi

Direct reprogramming of one cell type into another has recently emerged as a powerful paradigm for regenerative medicine, disease modeling, and lineage ...

A Standardized Approach for Multispecies Purification of Mammalian Male Germ Cells by Mechanical Tissue Dissociation and Flow Cytometry

Fluorescence-activated cell sorting (FACS) has been one of the methods of choice to isolate enriched populations of mammalian testicular germ cells. Currently, it allows the discrimination of up to 9 murine germ cell populations with high yield and purity. This high-resolution in discrimination and purification is possible due to unique changes in chromatin structure and quantity throughout spermatogenesis. These patterns can be captured by flow cytometry of male germ cells stained with fluorescent DNA-binding dyes such as Hoechst-33342 (Hoechst). Herein is a detailed description of a recently developed protocol to isolate mammalian testicular germ cells. Briefly, single cell suspensions are generated from testicular tissue by mechanical dissociation, double stained with Hoechst and propidium iodide (PI) and processed by flow cytometry. A serial gating strategy, including the selection of live cells (PI negative) with different DNA content (Hoechst intensity), is used during FACS sorting to discriminate up to 5 germ cell types. These include, with corresponding average purities (determined by microscopy evaluation): spermatogonia (66%), primary (71%) and secondary (85%) spermatocytes, and spermatids (90%), further separated into round (93%) and elongating (87%) subpopulations. Execution of the entire workflow is straightforward, allows the isolation of 4 cell types simultaneously with the appropriate FACS machine, and can be performed in less than 2 h. As reduced processing time is crucial to preserve the physiology of ex vivo cells, this method is ideal for downstream high-throughput studies of male germ cell biology. Moreover, a standardized protocol for multispecies purification of mammalian germ cells eliminates methodological sources of variables and allows a single set of reagents to be used for different animal models.

This work describes the standardization of a method to obtain purified germ cell populations from testicular tissue of different mammalian species. It is a straightforward protocol that combines mechanical testis dissociation, staining with Hoechst-33342 and propidium iodide, and FACS sorting, with wide applications in comparative studies of male reproductive biology.

Memeli Erkek Germ Hücrelerinin Çok Denekli Saflaştırılmasında Standart Bir Yaklaşım, Mekanik Doku Ayrılma ve Akış Sitometrisi ile

Fluorescence-activated cell sorting (FACS) has been one of the methods of choice to isolate enriched populations of mammalian testicular germ cells. ...

A Method for Characterizing Embryogenesis in Arabidopsis

Given the highly predictable nature of their development, Arabidopsis embryos have been used as a model for studies of morphogenesis in plants. However, early stage plant embryos are small and contain few cells, making them difficult to observe and analyze. A method is described here for characterizing pattern formation in plant embryos under a microscope using the model organism Arabidopsis. Following the clearance of fresh ovules using Hoyer's solution, the cell number in and morphology of embryos could be observed, and their developmental stage could be determined by differential interference contrast microscopy using a 100X oil immersion lens. In addition, the expression of specific marker proteins tagged with Green Fluorescent Protein (GFP) was monitored to annotate cell identity specification during embryo patterning by confocal laser scanning microscopy. Thus, this method can be used to observe pattern formation in wild-type plant embryos at the cellular and molecular levels, and to characterize the role of specific genes in embryo patterning by comparing pattern formation in embryos from wild-type plants and embryo-lethal mutants. Therefore, the method can be used to characterize embryogenesis in Arabidopsis.

A Method for Characterizing Embryogenesis in Arabidopsis

This protocol outlines a method for observing embryogenesis in Arabidopsis via ovule clearance followed by the inspection of embryo pattern formation under a microscope.

Embriyogenez Arabidopsis olarak karakterize bir yöntem

Given the highly predictable nature of their development, Arabidopsis embryos have been used as a model for studies of morphogenesis in plants. However, ...

A Novel Use of Three-dimensional High-frequency Ultrasonography for Early Pregnancy Characterization in the Mouse

High-frequency ultrasonography (HFUS) is a common method to non-invasively monitor the real-time development of the human fetus in utero. The mouse is routinely used as an in vivo model to study embryo implantation and pregnancy progression. Unfortunately, such murine studies require pregnancy interruption to enable follow-up phenotypic analysis. To address this issue, we used three-dimensional (3-D) reconstruction of HFUS imaging data for early detection and characterization of murine embryo implantation sites and their individual developmental progression in utero. Combining HFUS imaging with 3-D reconstruction and modeling, we were able to accurately quantify embryo implantation site number as well as monitor developmental progression in pregnant C57BL6J/129S mice from 5.5 days post coitus (d.p.c.) through to 9.5 d.p.c. with the use of a transducer. Measurements included: number, location, and volume of implantation sites as well as inter-implantation site spacing; embryo viability was assessed by cardiac activity monitoring. In the immediate post-implantation period (5.5 to 8.5 d.p.c.), 3-D reconstruction of the gravid uterus in both mesh and solid overlay format enabled visual representation of the developing pregnancies within each uterine horn. As genetically engineered mice continue to be used to characterize female reproductive phenotypes derived from uterine dysfunction, this method offers a new approach to detect, quantify, and characterize early implantation events in vivo. This novel use of 3-D HFUS imaging demonstrates the ability to successfully detect, visualize, and characterize embryo-implantation sites during early murine pregnancy in a non-invasive manner. The technology offers a significant improvement over current methods, which rely on the interruption of pregnancies for gross tissue and histopathologic characterization. Here we use a video and text format to describe how to successfully perform ultrasounds of early murine pregnancy to generate reliable and reproducible data with reconstruction of the uterine form in mesh and solid 3-D images.

Mice are widely used to study gestational biology. However, pregnancy termination is required for such studies which precludes longitudinal investigations and necessitates the use of large numbers of animals. Therefore, we describe a non-invasive technique of high-frequency ultrasonography for early detection and monitoring of post-implantation events in the pregnant mouse.

Üç boyutlu yüksek frekanslı Ultrasonografi romanı kullanımı için fare erken gebelik karakterizasyonu

High-frequency ultrasonography (HFUS) is a common method to non-invasively monitor the real-time development of the human fetus in utero. The mouse is ...

Application of Chronic Stimulation to Study Contractile Activity-induced Rat Skeletal Muscle Phenotypic Adaptations

Skeletal muscle is a highly adaptable tissue, as its biochemical and physiological properties are greatly altered in response to chronic exercise. To investigate the underlying mechanisms that bring about various muscle adaptations, a number of exercise protocols such as treadmill, wheel running, and swimming exercise have been used in the animal studies. However, these exercise models require a long period of time to achieve muscle adaptations, which may be also regulated by humoral or neurological factors, thus limiting their applications in studying the muscle-specific contraction-induced adaptations. Indirect low frequency stimulation (10 Hz) to induce chronic contractile activity (CCA) has been used as an alternative model for exercise training, as it can successfully lead to muscle mitochondrial adaptations within 7 days, independent of systemic factors. This paper details the surgical techniques required to apply the treatment of CCA to the skeletal muscle of rats, for widespread application in future studies.

This protocol describes the use of the chronic contractile activity model of exercise to observe stimulation-induced skeletal muscle adaptations in the rat hindlimb.

Contractile fare faaliyet kaynaklı kas iskelet fenotipik uyarlamalar çalışmaya kronik stimulasyon uygulanması

Skeletal muscle is a highly adaptable tissue, as its biochemical and physiological properties are greatly altered in response to chronic exercise. To ...

Partial Lobular Hepatectomy: A Surgical Model for Morphologic Liver Regeneration

Morphological organ regeneration following acute tissue loss is common among lower vertebrates, but is rarely observed in mammalian postnatal life. Adult liver regeneration after 70% partial hepatectomy results in hepatocyte hypertrophy with some replication in remaining lobes with restoration of metabolic activity, but with permanent loss of the injured lobe&#39;s morphology and architecture. Here, we detail a new surgical method in the neonate that leaves a physiologic environment conducive to regeneration. This model involves amputation of the left lobe apex and a subsequent conservative management regimen, and lacks the necessity for ligation of major liver vessels or chemical injury, leaving a physiologic environment where regeneration may occur. We extend this protocol to amputations on juvenile (P7-14) mice, during which the injured liver transitions from organ regeneration to compensatory growth by hypertrophy. The presented, brief 30 min protocol provides a framework to study the mechanisms of regeneration, its age-associated decline in mammals, and the characterization of putative hepatic stem or progenitors.

Here, we present a new method for partial resection of the left hepatic lobe in neonatal (day 0) mice. This new protocol is suitable for studying acute liver injury and injury response in the neonatal setting.

Kısmi Lobular Hepatectomy: Morfolojik karaciğer rejenerasyonu için cerrahi bir Model

Morphological organ regeneration following acute tissue loss is common among lower vertebrates, but is rarely observed in mammalian postnatal life. Adult ...