Burada bildirilen araştırma kısmen Ulusal Sağlık Enstitüleri Ulusal Kanser Enstitüsü tarafından ödül no altında desteklendi. R33 CA217702 ve Öğrenci Gelişimini En Üst Düzeye Çıkarma Girişimi (IMSD) programı. İçerik sadece yazarların sorumluluğundadır ve Ulusal Sağlık Enstitülerinin resmi görüşünü temsil etmek zorunda değildir.

İnsan serum örnekleri, IRB onayı altında ve Helsinki Bildirgesi'nde ifade edilen ilkelere göre rıza gösteren gönüllülerden elde edilmiştir. Numuneler analitik laboratuvara transferden önce kodlandı ve kimliksiz bırakıldı.
1. Numune hazırlama
<ol><li>HepG2 hücreli lysates
	<ol>
<li>%10 fetal sığır serumu (FBS) ile desteklenmiş 14 mL EMEM ortamlı 16 T75 şişede şişe başına yaklaşık 10 x 106 HepG2 hücresi tohum ve 2 gün boyunca hücre yetiştirin.</li>
		<li>RIPA tamponu hazırlayın: 50 mL'lik bir tüpte, 1,5 mL 5 M NaCl, 2,5 mL 1 M Tris-HCl (pH = 7), 500 μL NP-40 reaktif ekleyin, ardından di suyu ile son hacmi 50 mL'ye getirin.</li>
		<li>Lizis tamponu hazırlayın: 50 mL'lik bir tüpe 20 mL RIPA tamponu aliquot ve protein ve lipid bozulmasını inhibe etmek için 100x proteaz inhibitör çözeltisinin 200 μL'si ekleyin. 4 °C'de saklayın. NOT: Lizis tamponu TBARS reaktifleri ile uyumludur ve 532 nm'de emiciliği engellemez. Farklı bir lizis tamponu kullanmayı veya lizis arabelleğine ek bileşenler eklemeyi planlıyorsanız, lizis tampon bileşenlerinin TBARS test ile uyumlu olduğunu doğrulamak için ön doğrulama çalışmalarının yapılması gerekir.</li>
		<li>%10 FBS içeren ortamı çıkarın ve hücreleri 5 mL soğuk, steril 1x PBS ile 2x yıkayın.</li>
		<li>Hücreleri içeren T75 şişelerine 1 mL lizis tamponu ekleyin ve tamponun iyi dağıtıldığından emin olmak için oda sıcaklığında (RT) 10 dakika boyunca sürekli girdapla kuluçkaya yatırın.</li>
		<li>Lysates'i uygun şekilde etiketlenmiş 2 mL snap-cap polipropilen tüplere toplayın ve 10 dakika boyunca buz üzerinde kuluçkaya yatırın.</li>
		<li>Hücre kalıntılarını toplamak için RT'de 10 dakika boyunca 5.000 x g'da lilaları döndürün ve süpernatantları tek bir 15 mL tüpe emişli.</li>
		<li>50 °C ve 3 mbar'da bir Speed Vac kullanarak hücre lisat süpernatant dört kat konsantre edin ve her biri 94 μL'lik aliquot'ları 2 mL snap-cap polipropilen tüpler haline getirin. Numuneleri in vitro oksidasyon ve/veya TBARS tahlilinde kullanılana kadar -80 °C'de saklayın. NOT: Hücre lisat süpernatantının konsantre olmasını önlemek için, hücreler ayrıca 3 mL 1x tripsin kullanılarak ayrılabilir, 6 mL ortamla nötralize edilebilir ve 5 mL soğuk PBS ile 2x yıkanabilir. Hücre peletleri daha sonra 250 μL lizis tamponunda yeniden inşa edilebilir ve 1.1.6 ve 1.1.7 adımları gerçekleştirilebilir.</li>
		<li>Asetik asitte 35 mM CuCl2 stok çözeltisi hazırlayın (pH = 4).<ol>
<li>Asetik asit çözeltisi hazırlayın (pH = 4): 100 mL DI suda 1 μL buzul asetik asetik asidi seyreltin (pH yaklaşık 4 olmalıdır, ancak bunu bir pH metre ile onaylayın). pH'ı 4'e ayarlamak için daha fazla su veya asetik asit ekleyin.</li>
			<li>Yaklaşık 0.1936 g bakır II klorür ağırlığı ve 144 mM CuCl2 stoğu yapmak için asetik asit çözeltisinin (pH = 4) 10 mL'sinde çözünür. Bu çözeltiden Aliquot 490 μL ve 35 mM CuCl2 çözeltisi yapmak için 1.510 μL asetik aside (pH = 4) ekleyin.</li>
		</ol>
</li>
		<li>35 mM CuCl2 stok çözeltisinden Aliquot 6 μL ve yaklaşık 2 mM'lik son bir CuCl2 konsantrasyonu yapmak için 94 μL hücre lisat içeren altı örneğe ekleyin. Kontrol olarak kullanmak için 94 μL hücrelysates içeren altı örneğe CuCl2 içermeyen 6 μL asetik asit çözeltisi (pH = 4) ekleyin. Hücre lisatının son hacmi 100 μL olmalıdır, bu da TBARS tahlilinde kullanılacak olandır. NOT: Bakır hidroksit çökeltisini önlemek için 35 mM CuCl2 stok çözeltisinin asetik asitte (pH = 4) yapılması gereklidir.</li>
		<li>Numuneleri 37 °C'deki bir fırında 24 saat boyunca kuluçkaya yatırın ve her numunede 100 μL'lik son bir hacim içeren bir TBARS tahlil işlemi gerçekleştirin.</li>
		<li>HepG2 hücreli elysatlar için TBARS testinin tekrarlanabilirliğini kontrol etmek için ayrı günlerde 1.1.9 ve 1.1.11 2x adımlarını yineleyin.</li>
	</ol></li>
	<li>Düşük yoğunluklu lipoproteinler NOT: Tipik olarak, önceden saflaştırılmış düşük yoğunluklu lipoprotein (LDL) bir miktar EDTA içerir. Burada kullanılan LDL örnekleri %0.01 EDTA içerir. EDTA, LDL'nin in vitro Cu(II) aracılı oksidasyonunu engelleyebilir. Bu nedenle, deneylerden veya analizlerden önce LDL örneklerinden EDTA'yı çıkarmak gerekebilir. Adım 1.2.1–1.2.5 bu işlemi açıklar. DİkKAT: Sodyum hidroksit aşındırıcıdır ve ciltte ve gözlerde tahrişe neden olur. Uygun kişisel koruyucu ekipman kullanın.<ol>
<li>5,51 mg/mL LDL stoktan Aliquot 24 μL (standart olarak BSA kullanılarak modifiye Lowry yöntemiyle belirlenen protein konsantrasyonu) uygun şekilde etiketlenmiş 1 mL snap-cap polipropilen tüplere. Gerektiği kadar aliquot yapın ve oksidasyon ve/veya TBARS testinde kullanılana kadar 4 °C'de saklayın.</li>
		<li>0,15 M NaCl'de 10 mM HEPES tamponu hazırlayın, naoh boncuklarla pH = 7'ye ayarlanmış: 4,39 g NaCl'yi 0,49 L suda çözün, ardından 1,19 g HEPES ekleyin. Bir karıştırma çubuğu ile iyice çözün. pH 7 olana kadar sodyum hidroksit boncukları ekleyin. Su ile 0,5 L'ye seyreltin. Tamponu 4 °C'de saklayın ve 3 ay içinde kullanın.</li>
		<li>Son hacmi 500 μL'ye getirmek için aliquoted LDL örneklerine 0,15 M NaCl (pH = 7) içinde 10 mM HEPES tamponunun 476 μL'sini ekleyin. Seyreltilmiş LDL örneğini 100K moleküler ağırlık kesmeli 0,5 mL santrifüj dönüş filtresi cihazına ekleyin.</li>
		<li>RT'de 10 dakika boyunca 14.000 x g'da dönüş örnekleri, yaklaşık 30 μL'lik son bir retentate hacmi bırakır. Örnekleri 0,15 M NaCl (pH = 7) 10 mM HEPES arabelleğin 480 μL'sinde yeniden inşa edin ve RT'de 10 dakika boyunca 14.000 x g'da tekrar döndürün.</li>
		<li>Filtre cihazını baş aşağı yeni bir 2 mL snap-cap polipropilen tüpüne yerleştirin ve LDL örneğini toplamak için 2 dakika boyunca 1000 x g'da santrifüj (son hacim = yaklaşık 30 μL).</li>
		<li>Aliquot numunesi uygun şekilde etiketlenmiş 1 mL tüpe ve 50 μL'lik son bir hacim elde etmek için her numuneye 20 μL su ekleyin.</li>
		<li>Asetik asitte 200 μM CuCl2 stok çözeltisinin hazırlanması (pH = 4)<ol>
<li>Asetik asit çözeltisi hazırlayın (pH = 4): bkz. adım 1.1.9.1.</li>
			<li>144 mM CuCl2 stok çözeltisi hazırlayın (bkz. adım 1.1.9.2), ardından 144 mM CuCl2 stoğundan aliquot 5.5 μL ve 200 μM çözeltisini yapmak için 4 mL asetik asit (pH = 4) son hacimde çözün.</li>
		</ol>
</li>
		<li>200 μM CuCl2 stok çözeltisinden Aliquot 2.7 μL ve ~10 μM'lik son bir CuCl2 konsantrasyonu elde etmek için 50 μL LDL içeren altı numuneye ekleyin. Kontroller için kullanılacak 50 μL LDL içeren altı numuneye CuCl2 içermeyen bir asetik asit çözeltisinden (pH = 4) 2,7 μL ekleyin.</li>
		<li>LDL örneklerini 37 °C'deki bir fırında 2 saat boyunca kuluçkaya yatırın. 2 saat sonra, 0,15 M NaCl'de (pH = 7) 10 mM HEPES tamponu olan her numune için son hacmi 100 μL'ye getirin. Hemen bir TBARS tahlil gerçekleştirin.</li>
		<li>TBARS testinin yeniden üretilme yeteneğini test etmek için iki farklı günde 1.2.3–1.2.9 2x adımlarını yineleyin.</li>
	</ol></li>
	<li>İnsan serumu
	<ol>
<li>Bir insan serum örneğinden, her biri 94 μL'lik aliquot'ları 2 mL snap-cap polipropilen tüpler haline getirin ve örnekleri -80 °C'de saklayın.</li>
		<li>Asetik asitte (pH = 4) 35 mM CuCl2 stok çözeltisi hazırlayın: bkz.</li>
		<li>CuCl2 stok çözeltisinden Aliquot 6 μL ve yaklaşık 2 mM'lik son bir CuCl2 konsantrasyonu yapmak için 94 μL insan serumu içeren altı örneğe ekleyin. Kontrol olarak kullanmak için 94 μL insan serumu içeren altı örneğe CuCl2 içermeyen 6 μL asetik asit çözeltisi (pH = 4) ekleyin.</li>
		<li>İnsan serumu örneklerini 37 °C'de bir fırında 24 saat kuluçkaya yatırın ve TBARS tahlil ile oksidasyon seviyelerini belirleyin (bölüm 4).</li>
		<li>TBARS testinin tekrarlanabilirliğini belirlemek için 1.3.2–1.3.4 2x adımlarını iki ayrı günde yineleyin.</li>
	</ol></li>
</ol>2. Reaktif hazırlama
DİkKAT: Tiobarbitürik asit cilt ve göz tahrişi neden olur ve belki de inhalasyon veya cilt emilimi ile zararlıdır. Asetik asit solunursa iç organlara zarar verebilir. Tüm asit çözeltilerini bir duman kaputunda hazırlayın.
<ol><li>%8,1 sodyum dodecylsulfate (SDS) çözeltisinin hazırlanması<ol>
<li>32,4 g SDS ağırlığı ve bir beherde 350 mL DI suyunda çözün. SDS'yi nazikçe çözmek ve kabarcık yapmaktan kaçınmak için manyetik bir karıştırma çubuğu kullanın. DI suyu ile son hacmi 400 mL'ye getirin ve SDS çözümünü RT'de saklayın. NOT: Burada% 8,1'lik fazla SDS çözeltisi hazırlanır; ancak, 96 numune için% 8.1 SDS çözümünün sadece yaklaşık 20 mL'sına ihtiyaç vardır. Bu çözümü analiz edilen numune sayısına göre hazırlayın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>3,5 M sodyum asetat tamponunun hazırlanması (pH = 4)<ol>
<li>100 mL buzul asetik asetikini bir beherde 350 mL DI suda seyreltin. Hafifçe çözmek için manyetik bir karıştırma çubuğu kullanın.</li>
		<li>Suda sodyum hidroksit boncukları kullanarak 6,5 M NaOH çözeltisi hazırlayın. 13 g NaOH boncuklarını 40 mL DI suda çözün ve DI suyu ile 50 mL'lik son hacme getirin.</li>
		<li>Karıştırma çubuğuyla karıştırırken asetik asit çözeltisine 6,5 M NaOH çözeltisinin yaklaşık 46 mL'lik kısmını yavaşça ekleyin (bu pH'ı 4'e yükseltmelidir, ancak bir pH ölçer kullanarak ölçüm yaparken NaOH çözeltisini yavaşça ekleyerek onaylayın).</li>
		<li>DI su ile son hacmi 500 mL'ye getirin ve RT'de sodyum asetat tamponu depolayın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Tikobarbitürik asidin % 0.8 sulu çözeltisinin hazırlanması (pH = 4'e göre ayarlanır) NOT: Bu adımda, tiyobakroturik asit hazırlanması büyük hacimler için optimize edilmiştir, çünkü çok sayıda numune analiz edilecektir (standartlar dahil olmayan 108 örnek). Analiz için planlanan numune sayısına bağlı olarak bu çözümü hazırlayın.<ol>
<li>Sodyum hidroksit boncukları ve su kullanarak 5 M sodyum hidroksit çözeltisi hazırlayın: 4 g sodyum hidroksit boncuklarını 20 mL su hacminde çözün. Plastik bir kapta saklayın. Bu çözelti her parti için taze olarak hazırlanmalıdır.</li>
		<li>Ağırlık 4 g tiobarbitürik asit ve 450 mL DI suyu ekleyin. Hafifçe çözmek için manyetik bir karıştırma çubuğu kullanın. NOT: Bu çözüm sonunda 500 mL toplam hacme getirilecektir.</li>
		<li>Tiyobakrotik asidi bir karıştırma çubuğuyla çözerken, 5 M NaOH çözeltisinin yaklaşık 3 mL'lik kısmını 100 μL'lik artışlarla ekleyin (yavaşça ve damla gibi). NaOH çözeltisini ekledikten sonra, tiyobakrotürik asit parçacıkları çözülmeye başlayacaktır.</li>
		<li>Tiyobakrolik asit parçacıkları hala tam olarak çözülmemişse, tüm tiyobakürik asit parçacıkları tamamen çözünene kadar 100 μL artışlarla 5 M NaOH çözeltisinin daha fazlasını ekleyin. Bu özel çözelti hacmi için, tiyobakürik asit parçacıklarını tamamen çözmek için 5 M NaOH çözeltisinin toplam 4 mL'si eklenir. NOT: Bu konsantrasyonda, pH neredeyse 4 olmadıkça tiyobakroturik asit tam olarak çözülmez.</li>
		<li>Tüm tiyobakürik asit tamamen çözüldükten sonra NaOH eklemeyi bırakın. pH'ı 4'e aşmaktan kaçının. Son pH, karıştırma tiyorbitürik asit çözeltisinden 1 μL alınarak ve pH kağıdına yerleştirilerek doğrulanabilir.</li>
		<li>DI suyu ile son hacmi 500 mL'ye getirin ve sulu% 0,8 tiobarbitürik asit çözeltisini RT'de saklayın.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. Malondialdehit bis (dimetil asetal) standart numune hazırlama
NOT: Malondialdehit (MDA) kararsızdır ve ticari olarak mevcut değildir. Bununla birlikte, MDA tetrabutylammonium tuzu, MDA bis (dimetil asetal) ve MDA bis (dietil asetal) gibi ticari olarak mevcut olan farklı kimyasal MDA formları vardır. Bu üç kimyasal formdan MDA bis (dimetil asetal) burada kullanılır, çünkü çalışmaların çoğunluğu aynı standardı kullanır21,22. MDA'nın diğer iki kimyasal formunu kullanmayı seçerseniz, uygunluklarının önceden doğrulanması yapılmalıdır.
<ol><li>1 L DI suda 92 μL saf MDA bis (dimetil asetal) seyrelterek 550 μM MDA bis (dimetil asetal) stok çözeltisi hazırlayın. Çözeltiyi 10 dakika boyunca iyice karıştırmak için manyetik bir karıştırma çubuğu kullanın. Çözeltiyi 4 °C'de saklayın ve 1 ay içinde kullanın.</li>
	<li>1274 μL DI suyundaki 550 μM MDA bis (dimetil asetal) stoktan 726 μL seyrelterek 200 μM MDA bis (dimetil asetal) hazırlayın. Bu 200 μM MDA bis (dimetil asetal) çözeltisi her TBARS tahlili gerçekleştirişlerinde taze olarak hazırlanmalıdır.</li>
	<li>Standart eğri hazırlığı: sekiz 2 mL snap-cap polipropilen tüpü alın ve A'dan H'ye kadar harflerle etiketleyin 200 μM stoktan MDA bis (dimetil asetal) ekleyin ve Tablo 1'de açıklandığı gibi suda seyreltin.</li>
	<li>Sekiz cam tüp (13 mm x 100 mm) alın ve A-H olarak etiketleyin, ardından ilgili tüplere 100 μL standart ekleyin. TBARS testinin algılama sınırlarını hesaplamak için boş standart (örnek A) için altı çoğaltma gerçekleştirin. NOT: Protokol burada en fazla 1 saat duraklatılabilir.</li>
</ol>4. TBARS tahlil
NOT: TBARS teste başlandıktan sonra durmaksızın bitirilmelidir.
<ol><li>Analiz edilecek numune sayısı için gerektiği kadar cam tüp alın ve örneklerin isimleriyle etiketleyin. Ardından, her cam tüpe hazırlanan her numuneden (yukarıda açıklandığı gibi) 100 μL ekleyin.</li>
	<li>Her numuneye ve standarda 200 μL% 8,1 SDS ekleyin ve numuneyi karıştırmak için cam tüpü dairesel bir hareketle hafifçe döndürün.</li>
	<li>Her numuneye ve standarda 3,5 M sodyum asetat tamponunun (pH = 4) 1,5 mL'lik kısmını ekleyin.</li>
	<li>Her numuneye ve standarda sulu %0,8 tiobarbitürik asit çözeltisinin (pH = 4) 1,5 mL'sini ekleyin.</li>
	<li>700 μL DI su ekleyerek her numune ve standart için son hacmi 4 mL'ye getirin.</li>
	<li>Her bir cam tüpü sıkıca kaplayıp 1 saat boyunca 95 °C'ye ayarlanmış bir ısıtma bloğunda kuluçkaya yaslanın. Tüplerin üst kısımlarında yoğuşma olmaması için cam tüpleri alüminyum folyo ile örtün.</li>
	<li>Cam tüpleri ısıtma bloğundan çıkarın ve 30 dakika boyunca buz üzerinde kuluçkaya yatırın.</li>
	<li>4 °C'de 10 dakika boyunca 1500 x g'da santrifüj numuneleri ve standartları. Santrifüjlemeden sonra, numuneleri ve standartları içeren cam tüpleri RT'de tutun. NOT: Numunelerin buzda veya 4 °C'de tutulması, numunenin veya standardın tamamının çökeltme yapmasına neden olur.</li>
	<li>Santrifüjlemeden hemen sonra, her tüpten 150 μL süpernatant aliquot ve 96 kuyu plakasının ayrı bir kuyusuna yerleştirin.</li>
	<li>Pipet ucu kullanarak her kuyudan kabarcıkları çıkarın. NOT: Kabarcıkların varlığı tutarsız absorbans okumaları verecek ve yüksek tahlil imprecision yol açacaktır.</li>
	<li>Absorbansları 532 nm'de okuyun. Diğer tüm absorbans okumalarından boş örneklerin ortalama absorbans okumasını çıkarın.</li>
	<li>Her standardın bilinen konsantrasyonuna karşılık 532 nm'de boş çıkarılan absorbans okumalarını çizerek standart bir eğri oluşturun. Doğrusal regresyon kullanarak veri noktalarını sığdırın. Standart eğriden elde edilen doğrusal regresyon çizgisinin denklemini kullanarak bilinmeyen örnek konsantrasyonlarını hesaplayın.</li>
</ol>

<ol>
	<li>Tsikas, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+lipid+peroxidation+by+measuring+malondialdehyde+(MDA)+and+relatives+in+biological+samples:+Analytical+and+biological+challenges.">Assessment of lipid peroxidation by measuring malondialdehyde (MDA) and relatives in biological samples: Analytical and biological challenges.</a> Analytical Biochemistry. 524, 13-30 (2017).</li><li>Ohkawa, H., Ohishi, N., Yagi, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reaction+of+linoleic+acid+hydroperoxide+with+thiobarbituric+acid.">Reaction of linoleic acid hydroperoxide with thiobarbituric acid.</a> Journal of Lipid Research. 19 (8), 1053-1057 (1978).</li><li>Khoubnasabjafari, M., Soleymani, J., Jouyban, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Avoid+Using+Spectrophotometric+Determination+of+Malondialdehyde+as+a+Biomarker+of+Oxidative+Stress.">Avoid Using Spectrophotometric Determination of Malondialdehyde as a Biomarker of Oxidative Stress.</a> Biomarkers in Medicine. 12 (6), 551-554 (2018).</li><li>Morales, M., Munn&#233;-Bosch, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Malondialdehyde:+Facts+and+artifacts.">Malondialdehyde: Facts and artifacts.</a> Plant Physiology. 180 (3), 1246-1250 (2019).</li><li>Devasagayam, T. P. A., Boloor, K. K., Ramasarma, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+estimating+lipid+peroxidation:+An+analysis+of+merits+and+demerits.">Methods for estimating lipid peroxidation: An analysis of merits and demerits.</a> Indian Journal of Biochemistry and Biophysics. 40 (5), 300-308 (2003).</li><li>Dasgupta, A., Klein, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+Measuring+Oxidative+Stress+in+the+Laboratory.">Methods for Measuring Oxidative Stress in the Laboratory.</a> Antioxidants in Food, Vitamins and Supplements. , 19-40 (2014).</li><li>Wade, C. R., van Rij, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plasma+malondialdehyde,+lipid+peroxides,+and+the+thiobarbituric+acid+reaction.">Plasma malondialdehyde, lipid peroxides, and the thiobarbituric acid reaction.</a> Clinical Chemistry. 35 (2), 336-336 (1989).</li><li>Khoubnasabjafari, M., Ansarin, K., Jouyban, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reliability+of+malondialdehyde+as+a+biomarker+of+oxidative+stress+in+psychological+disorders.">Reliability of malondialdehyde as a biomarker of oxidative stress in psychological disorders.</a> BioImpacts. 5 (3), 123-127 (2015).</li><li>Khoubnasabjafari, M., Ansarin, K., Jouyban, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comments+Concerning+"Comparison+of+Airway+and+Systemic+Malondialdehyde+Levels+for+Assessment+of+Oxidative+Stress+in+Cystic+Fibrosis".">Comments Concerning "Comparison of Airway and Systemic Malondialdehyde Levels for Assessment of Oxidative Stress in Cystic Fibrosis".</a> Lung. 193 (5), 867-868 (2015).</li><li>Khoubnasabjafari, M., Ansarin, K., Vaez-Gharamaleki, J., Jouyban, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comments+on+"Salivary+8-hydroxy-2-deoxyguanosine,+malondialdehyde,+vitamin+C,+and+vitamin+E+in+oral+pre-cancer+and+cancer:+diagnostic+value+and+free+radical+mechanism+of+action".">Comments on "Salivary 8-hydroxy-2-deoxyguanosine, malondialdehyde, vitamin C, and vitamin E in oral pre-cancer and cancer: diagnostic value and free radical mechanism of action".</a> Clinical Oral Investigations. 20 (2), 395-396 (2016).</li><li>Khoubnasabjafari, M., Ansarin, K., Jouyban, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comments+on+"An+Investigation+into+the+Serum+Thioredoxin+Superoxide+Dismutase,+Malondialdehyde,+and+Advanced+Oxidation+Protein+Products+in+Patients+with+Breast+Cancer".">Comments on "An Investigation into the Serum Thioredoxin Superoxide Dismutase, Malondialdehyde, and Advanced Oxidation Protein Products in Patients with Breast Cancer".</a> Annals of Surgical Oncology. 24, 573-576 (2017).</li><li>Azizi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+analytical+procedures+on+the+repeatability+of+malondialdehyde+determinations+in+biological+samples.">Effects of analytical procedures on the repeatability of malondialdehyde determinations in biological samples.</a> Pharmaceutical Sciences. 23 (3), 193-197 (2017).</li><li>Azizi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+possible+reason+for+the+low+reproducibility+of+malondialdehyde+determinations+in+biological+samples.">A possible reason for the low reproducibility of malondialdehyde determinations in biological samples.</a> Bioanalysis. 8 (21), 2179-2181 (2016).</li><li>Wasowicz, W., Neve, J., Peretz, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimized+steps+in+fluorometric+determination+of+thiobarbituric+acid-+reactive+substances+in+serum:+Importance+of+extraction+pH+and+influence+of+sample+preservation+and+storage.">Optimized steps in fluorometric determination of thiobarbituric acid- reactive substances in serum: Importance of extraction pH and influence of sample preservation and storage.</a> Clinical Chemistry. 39 (12), 2522-2526 (1993).</li><li>Jentzsch, A. M., Bachmann, H., F&#252;rst, P., Biesalski, H. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+analysis+of+malondialdehyde+in+human+body+fluids.">Improved analysis of malondialdehyde in human body fluids.</a> Free Radical Biology and Medicine. 20 (2), 251-256 (1996).</li><li>Buege, J. A., Aust, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microsomal+lipid+peroxidation.">Microsomal lipid peroxidation.</a> Methods in Enzymology. 52, 302-310 (1978).</li><li>Gutteridge, J. M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Free-Radical+Damage+to+Lipids,+Amino-Acids,+Carbohydrates+and+Nucleic-Acids+Determined+by+Thiobarbituric+Acid+Reactivity.">Free-Radical Damage to Lipids, Amino-Acids, Carbohydrates and Nucleic-Acids Determined by Thiobarbituric Acid Reactivity.</a> International Journal of Biochemistry. 14 (7), 649-653 (1982).</li><li>Khoubnasabjafari, M., Ansarin, K., Jouyban, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Salivary+malondialdehyde+as+an+oxidative+stress+biomarker+in+oral+and+systemic+diseases.">Salivary malondialdehyde as an oxidative stress biomarker in oral and systemic diseases.</a> J Dent Res Dent Clin Dent Prospects. 10 (2), 71-74 (2016).</li><li>Halliwell, B., Whiteman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measuring+reactive+species+and+oxidative+damage+in+vivo+and+in+cell+culture:+How+should+you+do+it+and+what+do+the+results+mean.">Measuring reactive species and oxidative damage in vivo and in cell culture: How should you do it and what do the results mean.</a> British Journal of Pharmacology. 142 (2), 231-255 (2004).</li><li>Lee, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluating+oxidative+stress+in+human+cardiovascular+disease:+methodological+aspects+and+considerations.">Evaluating oxidative stress in human cardiovascular disease: methodological aspects and considerations.</a> Current medicinal chemistry. 19 (16), 2504-2520 (2012).</li><li>Morel, D. W., Hessler, J. R., Chisolm, G. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Low+density+lipoprotein+cytotoxicity+induced+by+free+radical+peroxidation+of+lipid.">Low density lipoprotein cytotoxicity induced by free radical peroxidation of lipid.</a> Journal of Lipid Research. 24 (8), 1070-1076 (1983).</li><li>Guzm&#225;n-Chozas, M., Vicario-Romero, I. M., Guill&#233;n-Sans, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=2-thiobarbituric+acid+test+for+lipid+oxidation+in+food:+Synthesis+and+spectroscopic+study+of+2-thiobarbituric+acid-malonaldehyde+adduct.">2-thiobarbituric acid test for lipid oxidation in food: Synthesis and spectroscopic study of 2-thiobarbituric acid-malonaldehyde adduct.</a> Journal of the American Oil Chemists Society. 75 (12), 1711-1715 (1998).</li><li>Shibata, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+a+lipid+peroxidation+product+as+a+potential+trigger+of+the+p53+pathway.">Identification of a lipid peroxidation product as a potential trigger of the p53 pathway.</a> Journal of Biological Chemistry. 28 (2), 1196-1204 (2006).</li><li>Skoog, D. A., West, D. M., Holler, F. J., Crouch, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sampling,+standardization,+and+calibration.">Sampling, standardization, and calibration.</a> Fundamentals of Analytical Chemistry. 9th ed. , 153-196 (2014).</li><li>Skoog, D. A., Holler, F. J., Crouch, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Introduction.">Introduction.</a> Principles of Instrumental Analysis. 6th ed. , 1-24 (2007).</li><li>Seibig, S., Van Eldik, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetics+of+[FeII(edta)]+Oxidation+by+Molecular+Oxygen+Revisited.+New+Evidence+for+a+Multistep+Mechanism.">Kinetics of [FeII(edta)] Oxidation by Molecular Oxygen Revisited. New Evidence for a Multistep Mechanism.</a> Inorganic Chemistry. 36 (18), 4115-4120 (1997).</li><li>Jeffs, J. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Delta-S-Cys-Albumin:+A+Lab+Test+that+Quantifies+Cumulative+Exposure+of+Archived+Human+Blood+Plasma+and+Serum+Samples+to+Thawed+Conditions.">Delta-S-Cys-Albumin: A Lab Test that Quantifies Cumulative Exposure of Archived Human Blood Plasma and Serum Samples to Thawed Conditions.</a> Molecular &amp; Cellular Proteomics. 18 (10), 2121-2137 (2019).</li><li>Yagi, K., Armstrong, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simple+Assay+for+the+Level+of+Total+Lipid+Peroxides+in+Serum+or+Plasma.">Simple Assay for the Level of Total Lipid Peroxides in Serum or Plasma.</a> Free Radical and Antioxidant Protocols. Methods in Molecular Biology. , 101-106 (1998).</li><li>Bernheim, F., Bernheim, M. L. C., Wilbur, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+reaction+between+thiobarbituric+acid+and+the+oxidation+products+of+certain+lipides.">The reaction between thiobarbituric acid and the oxidation products of certain lipides.</a> Journal of Biological Chemistry. 174 (1), 257-264 (1948).</li><li>Wilbur, K. M., Bernheim, F., Shapiro, O. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+thiobarbituric+acid+reagent+as+a+test+for+the+oxidation+of+unsaturated+fatty+acids+by+various+agents.">The thiobarbituric acid reagent as a test for the oxidation of unsaturated fatty acids by various agents.</a> Archives of Biochemistry. 24 (2), 305-313 (1949).</li><li>Kwon, T. W., Watts, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+malonaldehyde+by+ultraviolet+spectrophotometry.">Determination of malonaldehyde by ultraviolet spectrophotometry.</a> Journal of Food Science. 28 (6), 627-630 (1963).</li><li>Esterbauer, H., Schaur, F. J., Zollner, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemistry+and+biochemistry+of+4-hydroxynonenal,+malonaldehyde+and+related+aldehydes.">Chemistry and biochemistry of 4-hydroxynonenal, malonaldehyde and related aldehydes.</a> Free Radical Biology &amp; Medicine. 11 (1), 81-128 (1991).</li><li>Dalle-Donne, I., Rossi, R., Colombo, R., Giustarini, D., Milzani, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomarkers+of+oxidative+damage+in+human+disease.">Biomarkers of oxidative damage in human disease.</a> Clinical Chemistry. 52 (4), 601-623 (2006).</li><li>Jentzsch, A. M., Bachmann, H., F&#252;rst, P., Biesalski, H. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+analysis+of+malondialdehyde+in+human+body+fluids.">Improved analysis of malondialdehyde in human body fluids.</a> Free Radical Biology and Medicine. 20 (2), 251-256 (1996).</li><li>Jo, C., Ahn, D. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorometric+Analysis+of+2-Thiobarbituric+Acid+Reactive+Substances+in+Turkey.">Fluorometric Analysis of 2-Thiobarbituric Acid Reactive Substances in Turkey.</a> Poultry Science. 77 (3), 475-480 (1998).</li><li>Tsikas, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development,+validation+and+biomedical+applications+of+stable-isotope+dilution+GC-MS+and+GC-MS/MS+techniques+for+circulating+malondialdehyde+(MDA)+after+pentafluorobenzyl+bromide+derivatization:+MDA+as+a+biomarker+of+oxidative+stress+and+its+relation+to+15(S)-8-iso-prostaglandin+F2&#945;+and+nitric+oxide+(NO).">Development, validation and biomedical applications of stable-isotope dilution GC-MS and GC-MS/MS techniques for circulating malondialdehyde (MDA) after pentafluorobenzyl bromide derivatization: MDA as a biomarker of oxidative stress and its relation to 15(S)-8-iso-prostaglandin F2&#945; and nitric oxide (NO).</a> Journal of Chromatography. B, Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences. 1019, 95-111 (2016).</li><li>Barden, A. E., Mas, E., Croft, K. D., Phillips, M., Mori, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Minimizing+artifactual+elevation+of+lipid+peroxidation+products+(F+2-isoprostanes)+in+plasma+during+collection+and+storage.">Minimizing artifactual elevation of lipid peroxidation products (F 2-isoprostanes) in plasma during collection and storage.</a> Analytical Biochemistry. 449 (1), 129-131 (2014).</li><li>Jeffs, J. W., Ferdosi, S., Yassine, H. N., Borges, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ex+vivo+instability+of+glycated+albumin:+A+role+for+autoxidative+glycation.">Ex vivo instability of glycated albumin: A role for autoxidative glycation.</a> Archives of Biochemistry and Biophysics. 629, 36-42 (2017).</li><li>Lee, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Malondialdehyde+in+Stored+Plasma.">Malondialdehyde in Stored Plasma.</a> Biochemical and Biophysical Research Communications. 95 (4), 1663-1672 (1980).</li><li>Tsikas, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simultaneous+GC-MS/MS+measurement+of+malondialdehyde+and+4-hydroxy-2-nonenal+in+human+plasma:+Effects+of+long-term+L-arginine+administration.">Simultaneous GC-MS/MS measurement of malondialdehyde and 4-hydroxy-2-nonenal in human plasma: Effects of long-term L-arginine administration.</a> Analytical Biochemistry. 524, 31-44 (2017).</li></ol>

Yazarların açıklayacak rakip finansal çıkarları veya diğer çıkar çatışmaları yoktur.

Sınırlamalarına rağmen1,3,4,7,8,9,10,12,13,14,15,19 ve laboratuvarlar arasında karşılaştırmaya uygunluk eksikliği, TBARS tahlil en </sup...

Lipid peroksidasyonu, reaktif oksijen türleri ve reaktif azot türleri gibi serbest radikallerin lipitlerdeki karbon-karbon çift bağlarına saldırdığı, bir hidrojenin karbondan soyutlanması ve bir oksijen molekülünün yerleştirilmesini içeren bir süreçtir. Bu işlem, birincil ürünler olarak lipid peroksil radikalleri ve hidroperoksitlerin yanı sıra malondialdehit (MDA) ve baskın ikincil ürünler olarak 4-hidroksinononal dahil olmak üzere karmaşık ürünlerin bir karışımına yol açar1.
MDA, tiaobarbitürik asit (TBA) ile olan facile reaksiyonu nedeniyle lipid peroksidasyonunun bir göstergesi olarak biyomedikal araştırmalarda yaygın olarak kullanılmaktadır. Reaksiyon, 532 nm'de görünür spektrumda emilen ve kırmızı-pembe bir renk2 üreten bir konjuge olan MDA-TBA2 oluşumuna yol açar. MDA'nın yanı sıra lipid peroksidasyonundan elde edilen diğer moleküller de TBA ile reaksiyona alabilir ve 532 nm'de ışığı emerek ölçülen genel emilim sinyaline katkıda bulunabilir. Benzer şekilde, MDA diğer ana biyomolekül sınıflarının çoğuyla reaksiyona girerek TBA3,4 ile reaksiyona erişilebilirliğini potansiyel olarak sınırlayabilir. Bu nedenle, bu geleneksel test sadece "tiyobakroturik asit reaktif maddeleri" veya TBARS5'i ölçmek için kabul edilir.
Doğru uygulandığında ve yorumlandığında, TBARS tahlili genellikle biyolojik bir örnekteki genel oksidatif stres seviyelerinin iyi bir göstergesi olarak kabul edilir6. Ne yazık ki, Khoubnasabjafari ve diğerleri tarafından belgelenen TBARS tahlilleri genellikle şüpheli sonuçları kolaylaştıracak şekilde yürütülür ve yorumlanır3,4,7,8,9,10,11. Bunun nedenleri öncelikle örnekle ilgili ön analitik değişkenlere ve tahlil sonuçlarında önemli değişiklikler olmadan test protokolünde görünüşte küçük varyasyonları yasaklayan test sağlamlığı eksikliğine dayanır1,7,12,13.
Biyospepsimen elleçleme ve depolama ile ilgili preanalitik değişkenler (örneğin, geçici olarak -20 °C'de tutulan kan plazması)14,15 TBARS tahlil sonuçları üzerinde büyük bir etkiye sahip olabilir16,17; öyle ki, TBARS test sonuçları, açık detaylandırıcı analitik doğrulama verileri tarafından garanti edilmediği sürece farklı laboratuvarlarda karşılaştırılmamalıdır. Bu öneri, batı lekelerinin yaygın olarak nasıl kullanıldığına ve yorumlandırıldığına benzer. Bant yoğunluklarının karşılaştırılması leke içi ve belki de laboratuvar içi çalışmalar için geçerlidir, ancak laboratuvarlar arasındaki bant yoğunluklarının karşılaştırılması genellikle geçersiz bir uygulama olarak kabul edilir.
Bazı araştırmacılar, TBARS testi tarafından ölçülen MDA'nın kabul edilebilir bir biyobelirteç3,9,10,18,19'un gerektirdiği analitik veya klinik kriterleri karşılamadığını öne sürmektedir. Nitekim, tahlil 50 yıl önce geliştirilmeseydi, muhtemelen bugünkü yaygın kullanım ve zımni kabul edilebilirliği kazanamayacaktı. Oksidatif stresin belirlenmesinde kullanılan daha fazla analitik hassasiyet, özgüllük ve sağlamlığa sahip başka tahliller olmasına rağmen, 532 nm'deki absorbansa dayanan TBARS tahlilleri, lipid peroksidasyon20'nin belirlenmesi ve böylece oksidatif stresin değerlendirilmesi için açık ara en sık kullanılan tahlillerden biri olarak kalmaktadır.
TBARS tahlilleri sadece, talimatların kullanılan reaktiflerin çoğu konsantrasyonu hakkında ayrıntılı bilgi sağlamadığı pahalı bir kit (400 ABD dolarının üzerinde) olarak bulunabilir. Ayrıca, sağlanan reaktifler yalnızca bir deneme için kullanılabilir, çünkü kit başına yalnızca bir kolorimetrik standart eğri yapılabilir. Bu, farklı zaman noktalarında birkaç örnek içinde oksidasyon seviyelerini belirlemeyi amaçlayan araştırmacılar için sorunlu olabilir, çünkü aynı standart eğri birden çok kez kullanılamaz. Bu nedenle, birden fazla deney için birden fazla kit satın alınması gerekir. Şu anda, pahalı bir kit satın alınmadığı sürece, TBARS testini nasıl gerçekleştireceklerine dair ayrıntılı bir protokol yoktur. Geçmişte bazı araştırmacılar bir TBARS tahlilinin nasıl gerçekleştirildiğini belirsiz bir şekilde tanımlamıştır21,22, ancak TBARS tahlilinin pahalı bir kit olmadan nasıl yürütüleceklerine dair tam ayrıntılı bir protokol veya kapsamlı bir video literatürde mevcut değildir.
Burada, TBARS testlerinin basit, tekrarlanabilir ve ucuz bir şekilde nasıl gerçekleştirilacağı hakkında ayrıntılı, analitik olarak doğrulanmış bir amaç için metodoloji rapor ediyoruz. Cu(II) iyonları ile tedavi üzerine insan serumu, HepG2 lisates ve düşük yoğunluklu lipoproteinlerin lipid peroksidasyonundaki değişiklikler TBARS testi için açıklayıcı uygulamalar olarak gösterilmiştir. Sonuçlar, bu TBARS tahlilinin günlük olarak tutarlı ve tekrarlanabilir olduğunu göstermektedir.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>1x Sterile PBS pH 7.4 1 L</td>
			<td>VWR, PA</td>
			<td>101642--262</td>
			<td>cell lysis reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL self-standing centrifuge tube</td>
			<td>Corning, NY</td>
			<td>CLS430897</td>
			<td>General material</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96 well plate, Non-Treated, clear, with lid, Non-sterile</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific, MA</td>
			<td>280895</td>
			<td>To measure absorbance</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Amicon Ultra-0.5 100 kD centrifugal spin filter device</td>
			<td>Fisher Scientific, NH</td>
			<td>UFC510024</td>
			<td>LDL purification</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Caps for glass tubes</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific, MA</td>
			<td>14-930-15D</td>
			<td>for TBARS assay</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Copper II Chloride</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>222011-250G</td>
			<td>to induce oxidation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Culture tubes, Disposable, with Screw-Cap Finish, Borosilicate Glass (13 x 100 mm)</td>
			<td>VWR, PA</td>
			<td>53283-800</td>
			<td>for TBARS assay</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eagle&#39;s Minimum Essential Medium (EMEM)</td>
			<td>ATCC, VA</td>
			<td>HB-8065</td>
			<td>HepG2 cell media</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eppendorf Safe-Lock Tubes, 1.5 mL</td>
			<td>eppendorf, NY</td>
			<td>22363204</td>
			<td>General material</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eppendorf Safe-Lock Tubes, 2.0 mL</td>
			<td>Genesee Sceitific, CA</td>
			<td>22363352</td>
			<td>General material</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum US Source</td>
			<td>Omega Scientific, CA</td>
			<td>FB-11</td>
			<td>for cell culture</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glacial Acetic Acid</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>27225-1L-R</td>
			<td>TBARS Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Halt Protease Inhibitor Cocktail (100x)</td>
			<td>Thermo Scientific, MA</td>
			<td>87786</td>
			<td>cell lysis reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HEPES</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>H3375-250G</td>
			<td>LDL solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HepG2 Cells</td>
			<td>ATCC, VA</td>
			<td>HB-8065</td>
			<td>Biological matrix prototype</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrocloric acid (HCl)</td>
			<td>Fisher Scientific, NH</td>
			<td>A144-212</td>
			<td>cell lysis reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Legend Micro 17 Centrifuge</td>
			<td>Thermo Scientific, MA</td>
			<td>75002431</td>
			<td>General material</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low Density Lipoprotein, Human Plasma</td>
			<td>Athens Research &#38; Technology, GA</td>
			<td>12-16-120412</td>
			<td>Biological matrix prototype</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Magnetic Stir Bars, Octagon 6-Assortment</td>
			<td>VWR, PA</td>
			<td>58948-025</td>
			<td>General material</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Malondialdehyde bis (dimethyl acetal)</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>8207560250</td>
			<td>TBARS Standard</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multiskan Go Microplate Spectrophotometer</td>
			<td>Fisher Scientific, NH</td>
			<td>51119200</td>
			<td>To measure absorbance</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NP-40</td>
			<td>EMD Millipore Corp, MA</td>
			<td>492016-100ML</td>
			<td>cell lysis reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>S7653-1KG</td>
			<td>cell lysis reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium dodecyl sulfate (SDS)</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>436143-100G</td>
			<td>TBARS Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium hydroxide</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>367176-2.5KG</td>
			<td>TBARS Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SpeedVac Concentrator</td>
			<td>Thermo Scientific, MA</td>
			<td>SC250EXP</td>
			<td>For concentrating cell lysates</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T-75 Flask, Tissue Culture Treated, 250 mL, w/filter cap</td>
			<td>USA Scientific, FL</td>
			<td>658175</td>
			<td>cell culture</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thiobarbituric Acid</td>
			<td>SIGMA, MO</td>
			<td>T5500-100G</td>
			<td>TBARS Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TRIS base</td>
			<td>Fluka, GA</td>
			<td>93362</td>
			<td>cell lysis reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trypsin (1x)</td>
			<td>VWR, PA</td>
			<td>16777-166</td>
			<td>To detach HepG2 cells</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

evaluation of oxidative stress in biological samples using the thiobarbituric acid reactive substances assay

Sınırlı analitik özgüllüğüne ve sağlamlığına rağmen, tiyobakroturik asit reaktif maddeleri (TBARS) tahlili, biyolojik sıvılarda lipid peroksidasyonunun jenerik ölçümü olarak yaygın olarak kullanılmıştır. Genellikle, numunenin düzgün bir şekilde ele alınması ve depolanmış olması koşuluyla, biyolojik bir numune içindeki oksidatif stres seviyelerinin iyi bir göstergesi olarak kabul edilir. Test, lipid peroksidasyon ürünlerinin, özellikle malondialdehitin (MDA), TBARS adı verilen MDA-TBA2 adducts oluşumuna yol açan tiyorbitürik asit (TBA) ile reaksiyonunu içerir. TBARS, spektrofotometrik olarak 532 nm'de ölçülebilen kırmızı-pembe bir renk verir. TBARS tahlili asidik koşullar altında (pH = 4) ve 95 °C'de gerçekleştirilir. Saf MDA kararsızdır, ancak bu koşullar, bu yöntemde analitik standart olarak kullanılan MDA bis'ten (dimetil asetal) MDA'nın serbest bırakılmasına izin verir. TBARS tahlil, yaklaşık 2 saat içinde tamamlanabilen basit bir yöntemdir. Test reaktiflerinin hazırlanması burada ayrıntılı olarak açıklanmıştır. Bütçe bilincine sahip araştırmacılar, bu reaktifleri yalnızca tek bir standart eğrinin inşasına izin veren pahalı bir TBARS test kiti satın almak yerine düşük maliyetle birden fazla deney için kullanabilirler (ve bu nedenle yalnızca bir deney için kullanılabilir). Bu TBARS testinin uygulanabilirliği insan serumunda, düşük yoğunluklu lipoproteinlerde ve hücre lysates'lerinde gösterilmiştir. Test tutarlı ve tekrarlanabilir ve 1.1 μM algılama sınırlarına ulaşılabilir. Spektrofotometrik TBARS testinin kullanımı ve yorumlanması için öneriler sunulmaktadır.

Asidik koşullar altında (pH = 4) ve 95 °C'de malondialdehit (MDA) bis (dimetil asetal) MDA23 verir. MDA ve yakından ilişkili kimyasal konjenerler, kırmızı-pembe bir renk veren ve 532 nm'de emilme φmax'a sahip olan tiyobakrbitürik asit reaktif maddeler (TBARS) adı verilen bileşikler üretmek için iki tiyorbitürik asit (TBA) molekülü ile reaksiyona sahiptir (Şekil 1, Şekil 2). Standart olarak MDA bis (dimetil as...

Watch this Scientific Journal Video about Evaluation of Oxidative Stress in Biological Samples Using the Thiobarbituric Acid Reactive Substances Assay at JoVE.com

Evaluation of Oxidative Stress in Biological Samples Using the Thiobarbituric Acid Reactive Substances Assay

Tiyorbitürik asit reaktif madde tahlilinin amacı, 532 nm'de görünür dalga boyu spektrofotometrisi kullanarak, öncelikle malondialdehit olmak üzere lipid peroksidasyon ürünlerinin üretimini ölçerek biyolojik numunelerdeki oksidatif stresi değerlendirmektir. Burada açıklanan yöntem insan serumu, hücre lysates ve düşük yoğunluklu lipoproteinlere uygulanabilir.

Tiobarbitürik Asit Reaktif Maddeler Tahlil kullanılarak Biyolojik Örneklerde Oksidatif Stresin Değerlendirilmesi

Despite its limited analytical specificity and ruggedness, the thiobarbituric acid reactive substances (TBARS) assay has been widely used as a generic ...

evaluation-oxidative-stress-biological-samples-using-thiobarbituric

Research

JoVE Journal

Chemistry

27.2K Görüntüleme.  Arizona State University. Tiyorbitürik asit reaktif madde tahlilinin amacı, 532 nm'de görünür dalga boyu spektrofotometrisi kullanarak, öncelikle malondialdehit olmak üzere lipid peroksidasyon ürünlerinin üretimini ölçerek biyolojik numunelerdeki oksidatif stresi değerlendirmektir. Burada açıklanan yöntem insan serumu, hücre lysates ve düşük yoğunluklu lipoproteinlere uygulanabilir.

Video: Evaluation of Oxidative Stress in Biological Samples Using the Thiobarbituric Acid Reactive Substances Assay

Untargeted Metabolomics from Biological Sources Using Ultraperformance Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry (UPLC-HRMS)

Here we present a workflow to analyze the metabolic profiles for biological samples of interest including; cells, serum, or tissue. The sample is first separated into polar and non-polar fractions by a liquid-liquid phase extraction, and partially purified to facilitate downstream analysis. Both aqueous (polar metabolites) and organic (non-polar metabolites) phases of the initial extraction are processed to survey a broad range of metabolites. Metabolites are separated by different liquid chromatography methods based upon their partition properties. In this method, we present microflow ultra-performance (UP)LC methods, but the protocol is scalable to higher flows and lower pressures. Introduction into the mass spectrometer can be through either general or compound optimized source conditions. Detection of a broad range of ions is carried out in full scan mode in both positive and negative mode over a broad m/z range using high resolution on a recently calibrated instrument. Label-free differential analysis is carried out on bioinformatics platforms. Applications of this approach include metabolic pathway screening, biomarker discovery, and drug development.

Untargeted Metabolomics from Biological Sources Using Ultraperformance Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry UPLC-HRMS

Untargeted metabolomics provides a hypothesis generating snapshot of a metabolic profile. This protocol will demonstrate the extraction and analysis of metabolites from cells, serum, or tissue. A range of metabolites are surveyed using liquid-liquid phase extraction, microflow ultraperformance liquid chromatography/high-resolution mass spectrometry (UPLC-HRMS) coupled to differential analysis software.

Ultra Performanslı Sıvı Kromatografi-Yüksek Çözünürlüklü Kütle Spektrometre (UPLC-HRMS) kullanarak Biyolojik Kaynaklar gelen hedefsiz Metabolomik

Here we present a workflow to analyze the metabolic profiles for biological samples of interest including; cells, serum, or tissue. The sample is first ...

Kimya

Anticancer Metal Complexes: Synthesis and Cytotoxicity Evaluation by the MTT Assay

Titanium (IV) and vanadium (V) complexes are highly potent anticancer agents. A challenge in their synthesis refers to their hydrolytic instability; therefore their preparation should be conducted under an inert atmosphere. Evaluation of the anticancer activity of these complexes can be achieved by the MTT assay.
The MTT assay is a colorimetric viability assay based on enzymatic reduction of the MTT molecule to formazan when it is exposed to viable cells. The outcome of the reduction is a color change of the MTT molecule. Absorbance measurements relative to a control determine the percentage of remaining viable cancer cells following their treatment with varying concentrations of a tested compound, which is translated to the compound anticancer activity and its IC50 values. The MTT assay is widely common in cytotoxicity studies due to its accuracy, rapidity, and relative simplicity.
Herein we present a detailed protocol for the synthesis of air sensitive metal based drugs and cell viability measurements, including preparation of the cell plates, incubation of the compounds with the cells, viability measurements using the MTT assay, and determination of IC50 values.

A method for synthesis of air-sensitive titanium and vanadium anticancer agents is described, along with the evaluation of their cytotoxic activity towards human cancer cell line by the MTT Assay.

MTT deneyi ile sentez ve Sitotoksisite Değerlendirilmesi: Anticancer Metal Kompleksleri

Titanium (IV) and vanadium (V) complexes are highly potent anticancer agents. A challenge in their synthesis refers to their hydrolytic instability; ...

Supercritical Nitrogen Processing for the Purification of Reactive Porous Materials

Supercritical fluid extraction and drying methods are well established in numerous applications for the synthesis and processing of porous materials. Herein, nitrogen is presented as a novel supercritical drying fluid for specialized applications such as in the processing of reactive porous materials, where carbon dioxide and other fluids are not appropriate due to their higher chemical reactivity. Nitrogen exhibits similar physical properties in the near-critical region of its phase diagram as compared to carbon dioxide: a widely tunable density up to ~1 g ml-1, modest critical pressure (3.4 MPa), and small molecular diameter of ~3.6 &#197;. The key to achieving a high solvation power of nitrogen is to apply a processing temperature in the range of 80-150 K, where the density of nitrogen is an order of magnitude higher than at similar pressures near ambient temperature. The detailed solvation properties of nitrogen, and especially its selectivity, across a wide range of common target species of extraction still require further investigation. Herein we describe a protocol for the supercritical nitrogen processing of porous magnesium borohydride.

Nitrogen is an effective supercritical fluid for extraction or drying processes due to its small molecular size, high density in the near-liquid supercritical regime, and chemical inertness. We present a supercritical nitrogen drying protocol for the purification treatment of reactive, porous materials.

Reaktif Gözenekli Malzemelerin Saflaştırılması Süperkritik Azot İşleme

Supercritical fluid extraction and drying methods are well established in numerous applications for the synthesis and processing of porous materials. ...

Using Polystyrene-block-poly(acrylic acid)-coated Metal Nanoparticles as Monomers for Their Homo- and Co-polymerization

We present a template-free method for &#8220;polymerizing&#8221; nanoparticles into long chains without side branches. A variety of nanoparticles are encapsulated in polystyrene-block-poly(acrylic acid) (PSPAA) shells and then used as monomers for their self-assembly. Spherical PSPAA micelles upon acid treatment are known to assemble into cylindrical micelles. Exploiting this tendency, the core-shell nanoparticles are induced to aggregate, coalesce, and then transform into long chains. When more than one type of nanoparticles are used, random and block &#8220;copolymers&#8221; of nanoparticles can be obtained. Detailed procedures are reported for the PSPAA encapsulation of nanoparticles, homo- and co-polymerization of the core-shell nanoparticles, separation and purification of the resulting nanoparticle chains. Transformations of single-line chains into double- and triple-line chains are also presented. The synergy between the polymer shell and the embedded nanoparticles leads to an unusual chain-growth polymerization mode, giving long nanoparticle chains that are distinct from the products of the traditional step-growth aggregation process.

Using Polystyrene-block-polyacrylic acid-coated Metal Nanoparticles as Monomers for Their Homo- and Co-polymerization

We report protocols for &#8220;polymerizing&#8221; various types of polymer-encapsulated metal nanoparticles into long chains of &#8220;homo-&#8220; and &#8220;co-polymers&#8221;.

Polistiren kullanma<em&gt; Bloğu</em&gt; -poli (Akrilik asit) Bunların homo- ve ko-polimerizasyon için monomer olarak metal Nanopartiküller -kaplı

We present a template-free method for &#8220;polymerizing&#8221; nanoparticles into long chains without side branches. A variety of nanoparticles are ...

Photochemical Oxidative Growth of Iridium Oxide Nanoparticles on CdSe@CdS Nanorods

We demonstrate a procedure for the photochemical oxidative growth of iridium oxide catalysts on the surface of seeded cadmium selenide-cadmium sulfide (CdSe@CdS) nanorod photocatalysts. Seeded rods are grown using a colloidal hot-injection method and then moved to an aqueous medium by ligand exchange. CdSe@CdS nanorods, an iridium precursor and other salts are mixed and illuminated. The deposition process is initiated by absorption of photons by the semiconductor particle, which results with formation of charge carriers that are used to promote redox reactions. To insure photochemical oxidative growth we used an electron scavenger. The photogenerated holes oxidize the iridium precursor, apparently in a mediated oxidative pathway. This results in the growth of high quality crystalline iridium oxide particles, ranging from 0.5 nm to about 3 nm, along the surface of the rod. Iridium oxide grown on CdSe@CdS heterostructures was studied by a variety of characterization methods, in order to evaluate its characteristics and quality. We explored means for control over particle size, crystallinity, deposition location on the CdS rod, and composition. Illumination time and excitation wavelength were found to be key parameters for such control. The influence of different growth conditions and the characterization of these heterostructures are described alongside a detailed description of their synthesis. Of significance is the fact that the addition of iridium oxide afforded the rods astounding photochemical stability under prolonged illumination in pure water (alleviating the requirement for hole scavengers).

A protocol for the photochemical oxidative growth of small crystalline iridium oxide nanoparticles on the surface of CdSe@CdS seeded rod nanoparticles is presented.

CdSe @ CdS nanorods üzerinde İridyum Oksit Nanopartiküller Fotokimyasal Oksidatif Büyüme

We demonstrate a procedure for the photochemical oxidative growth of iridium oxide catalysts on the surface of seeded cadmium selenide-cadmium sulfide ...

The MPLEx Protocol for Multi-omic Analyses of Soil Samples

Mass spectrometry (MS)-based integrated metaproteomic, metabolomic, and lipidomic (multi-omic) studies are transforming our ability to understand and characterize microbial communities in environmental and biological systems. These measurements are even enabling enhanced analyses of complex soil microbial communities, which are the most complex microbial systems known to date. Multi-omic analyses, however, do have sample preparation challenges, since separate extractions are typically needed for each omic study, thereby greatly amplifying the preparation time and amount of sample required. To address this limitation, a 3-in-1 method for the simultaneous extraction of metabolites, proteins, and lipids (MPLEx) from the same soil sample was created by adapting a solvent-based approach. This MPLEx protocol has proven to be both simple and robust for many sample types, even when utilized for limited quantities of complex soil samples. The MPLEx method also greatly enabled the rapid multi-omic measurements needed to gain a better understanding of the members of each microbial community, while evaluating the changes taking place upon biological and environmental perturbations.

A protocol is presented for simultaneously extracting metabolites, proteins, and lipids from a single soil sample, allowing reduced sample preparation times and enabling multi-omic mass spectrometry analyses of samples with limited quantities.

Toprak örnekleri Multi-omic analizleri için karmaşık iletişim kuralı

Mass spectrometry (MS)-based integrated metaproteomic, metabolomic, and lipidomic (multi-omic) studies are transforming our ability to understand and ...

Separation of Aldehydes and Reactive Ketones from Mixtures Using a Bisulfite Extraction Protocol

The purification of organic compounds is an essential component of routine synthetic operations. The ability to remove contaminants into an aqueous layer by generating a charged structure provides an opportunity to use extraction as a simple purification technique. By combining the use of a miscible organic solvent with saturated sodium bisulfite, aldehydes and reactive ketones can be successfully transformed into charged bisulfite adducts that can then be separated from other organic components of a mixture by the introduction of an immiscible organic layer. Here, we describe a simple protocol for the removal of aldehydes, including sterically-hindered neopentyl aldehydes and some ketones, from chemical mixtures. Ketones can be separated if they are sterically unhindered cyclic or methyl ketones. For aliphatic aldehydes and ketones, dimethylformamide is used as the miscible solvent to improve removal rates. The bisulfite addition reaction can be reversed by basification of the aqueous layer, allowing for the re-isolation of the reactive carbonyl component of a mixture.

Here, we present a protocol to remove aldehydes and reactive ketones from mixtures by a liquid-liquid extraction protocol directly with saturated sodium bisulfite in a miscible solvent. This combined protocol is rapid and facile to perform. The aldehyde or ketone can be re-isolated by the basification of the aqueous layer.

Aldehitler ve ketonlar reaktif ayrılması Bisülfit ayıklama protokolü kullanılarak karışımları

The purification of organic compounds is an essential component of routine synthetic operations. The ability to remove contaminants into an aqueous layer ...

Reactive Inkjet Printing and Propulsion Analysis of Silk-based Self-propelled Micro-stirrers

In this study, a protocol for using reactive inkjet printing to fabricate enzymatically propelled silk swimmers with well-defined shapes is reported. The resulting devices are an example of self-propelled objects capable of generating motion without external actuation and have potential applications in medicine and environmental sciences for a variety of purposes ranging from micro-stirring, targeted therapeutic delivery, to water remediation (e.g., cleaning oil spills). This method employs reactive inkjet printing to generate well-defined small-scale solid silk structures by converting water soluble regenerated silk fibroin (silk I) to insoluble silk fibroin (silk II). These structures are also selectively doped in specific regions with the enzyme catalase in order to produce motion via bubble generation and detachment. The number of layers printed determines the three-dimensional (3D) structure of the device, and so here the effect of this parameter on the propulsive trajectories is reported. The results demonstrate the ability to tune the motion by varying the dimensions of the printed structures.

This protocol demonstrates the ability to utilize reactive inkjet printing to print self-motile biocompatible and environmentally friendly micro-stirrers for use in biomedical and environmental applications.

Ipek bazlı kendinden tahrikli mikro karıştırıcılar reaktif Inkjet Baskı ve Itme Analizi

In this study, a protocol for using reactive inkjet printing to fabricate enzymatically propelled silk swimmers with well-defined shapes is reported. The ...

Synthesis and Bioconjugation of Thiol-Reactive Reagents for the Creation of Site-Selectively Modified Immunoconjugates

Maleimide-bearing bifunctional probes have been employed for decades for the site-selective modification of thiols in biomolecules, especially antibodies. Yet maleimide-based conjugates display limited stability in vivo because the succinimidyl thioether linkage can undergo a retro-Michael reaction. This, of course, can lead to the release of the radioactive payload or its exchange with thiol-bearing biomolecules in circulation. Both of these processes can produce elevated activity concentrations in healthy organs as well as decreased activity concentrations in target tissues, resulting in reduced imaging contrast and lower therapeutic ratios. In 2018, we reported the creation of a modular, stable, and easily accessible phenyloxadiazolyl methyl sulfone reagent &#8212; dubbed &#8216;PODS&#8217; &#8212; as a platform for thiol-based bioconjugations. We have clearly demonstrated that PODS-based site-selective bioconjugations reproducibly and robustly create homogenous, well-defined, highly immunoreactive, and highly stable radioimmunoconjugates. Furthermore, preclinical experiments in murine models of colorectal cancer have shown that these site-selectively labeled radioimmunoconjugates exhibit far superior in vivo performance compared to radiolabeled antibodies synthesized via maleimide-based conjugations. In this protocol, we will describe the four-step synthesis of PODS, the creation of a bifunctional PODS-bearing variant of the ubiquitous chelator DOTA (PODS-DOTA), and the conjugation of PODS-DOTA to the HER2-targeting antibody trastuzumab.

In this protocol, we will describe the synthesis of PODS, a phenyoxadiazolyl methyl sulfone-based reagent for the site-selective attachment of cargos to the thiols of biomolecules, particularly antibodies. In addition, we will describe the synthesis and characterization of a PODS-bearing bifunctional chelator and its conjugation to a model antibody.

Sentez ve Site seçici olarak oluşturulması için Thiol reaktif reaktif Bioconjugation Immunoconjugates modifiye

Maleimide-bearing bifunctional probes have been employed for decades for the site-selective modification of thiols in biomolecules, especially antibodies. ...

Biological Samples Preparation for Speciation at Cryogenic Temperature using High-Resolution  X-Ray Absorption Spectroscopy

The study of elements with X-ray absorption spectroscopy (XAS) is of particular interest when studying the role of metals in biological systems. Sample preparation is a key and often complex procedure, particularly for biological samples. Although X-ray speciation techniques are widely used, no detailed protocol has been yet disseminated for users of the technique. Further, chemical state modification is of concern, and cryo-based techniques are recommended to analyze the biological samples in their near-native hydrated state to provide the maximum preservation of chemical integrity of the cells or tissues. Here, we propose a cellular preparation protocol based on cryo-preserved samples. It is demonstrated in a high energy resolution fluorescence detected X-ray absorption spectroscopy study of selenium in cancer cells and a study of iron in phytoplankton. This protocol can be used with other biological samples and other X-ray techniques that can be damaged by irradiation.

This protocol presents a detailed procedure to prepare biological cryosamples for synchrotron-based X-ray absorption spectroscopy experiments. We describe all the steps required to optimize sample preparation and cryopreservation with examples of the protocol with cancer and phytoplankton cells. This method provides a universal standard of sample cryo-preparation.

Yüksek Çözünürlüklü X-Işını Absorpsiyon Spektroskopisi Kullanılarak Kriyojenik Sıcaklıkta Türleşme için Biyolojik Numunelerin Hazırlanması

The study of elements with X-ray absorption spectroscopy (XAS) is of particular interest when studying the role of metals in biological systems. Sample ...