Tek Çekirdek Dizilimi için Donmuş Memeli Dokularından Tek Çekirdeklerin İzolasyonu için Basit, Hızlı ve Kısmen Otomatik Bir Protokol

Bu araştırma, potansiyel tedavilerin etkinliğini ve güvenliğini araştırmak için tek çekirdekli RNA dizilimi kullanan ilaç keşif çalışmalarını desteklemeye odaklanmaktadır. Bu nedenle, çeşitli organlardan alınan taze donmuş doku örnekleri için standartlaştırılmış çekirdek ekstraksiyon protokolleri geliştiriyoruz. Amacımız, biyolojik olmayan değişkenliği azaltarak tutarlı ve güvenilir sonuçlar elde etmek için çekirdek ekstraksiyonunu otomatikleştirmek ve standartlaştırmaktı.

Avantajı, robotik bir ayrıştırıcı kullanımı yoluyla kısmi otomasyon ve farklı türlerden çeşitli doku örneklerine uygulanabilen basit ve kısa iş akışıdır. Standartlaştırılmış protokollere sahip olmak, ilaç biyodağılımı ile ilgili soruları yanıtlamamıza ve gözlemleyebileceğimiz herhangi bir güvenlik sinyalinin altında yatan mekanizmaları keşfetmemize yardımcı olabilir. Gelecekte, protokolümüzün ATAC-seq veya multiomik gibi diğer aşağı akış uygulamaları için uygulanabilirliğini test edeceğiz.

Ayrıca, tek çekirdeklerde viral olarak eksprese edilen transgenleri tespit etmek için protokoller oluşturmaya çalışacağız.