Nadir Primer Hücrelerde Hedeflenen Metabolomikler

Laboratuvarımın temel amacı, hematolojik malignitelerden kaçınmak için yaşlanmada sağlıklı bir hematopoietik kök hücre çekmeyi sürdürmektir ve bunu diyet müdahaleleri yaparak yapıyoruz. Bu nedenle, özellikle, diyetten elde edilen metabolitlerin kök salgısını nasıl düzenlediğini ve ayrıca hücre içi metabolitlerin kök hücre kaderini nasıl düzenlediğini anlamakla ilgileniyoruz. Hematopoetik kök hücreler çok nadir görülen bir popülasyondur, yani deneylerimizi gerçekleştirmek için yeterli malzemeye sahip olmadığımız için her zaman zorlukla karşı karşıyayız.

Ama şimdi tek hücreli yöntemlerin kurulmasıyla ve ayrıca düşük girdili yöntemlerle, bu kök hücrelerin nasıl düzenlendiğine dair yeni bir bilgi edindik. Hematopoetik kök hücreler çok nadir görülen bir popülasyondur ve üstelik çok küçüktürler. Şimdi, geliştirdiğimiz yöntemlerle, örneğin, kütle spesifikasyonuna dayalı düşük girdili metabolomiklerle, artık çok az sayıda hücreyi, yüzlerce metaboliti tespit edebiliyoruz, bu artık kök hücre regülasyonu için belirli metabolitlerin rolünün ne olduğunu anlamamızı sağladı.

Geçmişte, nadir primer hücrelerin metabolomik analizi, birçok fare ve gün boyu çalışma ve numune hazırlama gerektiriyordu. Yeni protokolümüzle daha az fareye ve daha az zamana ihtiyacımız var. Ek olarak, manuel adımların sayısını azalttık, böylece tüm protokol daha sağlam hale geldi.

Gelecek için, ek analiz ve nadir birincil hücreler sağlamak için düşük girdi protokolümüzü uyarlamayı planladık. Örneğin, hedeflenmemiş metabolomikler ve lipidomikler.