Таргетная метаболомика на редких первичных клетках

Основной целью моей лаборатории является поддержание здорового уровня гемопоэтических стволовых клеток при старении, чтобы избежать гематологических злокачественных новообразований, и мы делаем это, выполняя диетические вмешательства. Поэтому, в частности, нам интересно понять, как метаболиты пищевого происхождения регулируют стволовость, а также внутриклеточные метаболиты, как они регулируют судьбу стволовых клеток. Гемопоэтические стволовые клетки – очень редкая популяция, а это означает, что мы всегда сталкиваемся с проблемой, что у нас недостаточно материала для проведения наших экспериментов.

Но теперь, с внедрением методов одиночных клеток, а также с методами с низким уровнем входных данных, мы достигли новых знаний о том, как эти стволовые клетки регулируются. Гемопоэтические стволовые клетки – очень редкая популяция, и, кроме того, они очень маленькие. Теперь, с помощью методов, которые мы разработали, таких, например, метаболомика с низким входом, основанная на масс-спекте, мы теперь можем обнаруживать при очень малом количестве клеток сотни метаболитов, это позволило нам понять, какова роль определенных метаболитов в регуляции стволовых клеток.

В прошлом метаболомный анализ редких первичных клеток требовал большого количества мышей и нескольких дней работы и подготовки образцов. Благодаря нашему новому протоколу нам нужно меньше мышей и меньше времени. Кроме того, мы сократили количество ручных шагов, поэтому весь протокол стал более надежным.

В будущем мы планируем адаптировать наш протокол с низким входом, чтобы обеспечить дополнительный анализ и редкие первичные клетки. Например, нетаргетная метаболомика и липидомика.