Metabolômica direcionada em células primárias raras

O principal objetivo do meu laboratório é manter uma extração saudável de células-tronco hematopoéticas no envelhecimento para evitar malignidades hematológicas, e fazemos isso realizando intervenções dietéticas. Então, em particular, estamos interessados em entender como os metabólitos derivados da dieta regulam o tronco e também os metabólitos intracelulares como eles regulam o destino das células-tronco. As células-tronco hematopoéticas são uma população muito rara, o que significa que sempre enfrentamos o desafio de não termos material suficiente para realizar nossos experimentos.

Mas agora, com o estabelecimento de métodos de célula única, e também com métodos de baixa entrada, conseguimos um novo conhecimento sobre como essas células-tronco são reguladas. As células-tronco hematopoéticas são uma população muito rara e, além disso, são muito pequenas. Agora, com os métodos que desenvolvemos como, por exemplo, metabolômica de baixa entrada baseada em especificações de massa, agora podemos detectar com número muito baixo de células, centenas de metabólitos, isso agora nos permitiu entender qual é o papel de certos metabólitos para a regulação de células-tronco.

No passado, a análise metabolômica de células primárias raras exigia muitos camundongos e dias de trabalho e preparação de amostras. Com nosso novo protocolo, precisamos de menos ratos e menos tempo. Além disso, reduzimos o número de passos manuais, para que todo o protocolo se torne mais robusto.

Para o futuro, planejamos adaptar nosso protocolo de baixa entrada para permitir análises adicionais e células primárias raras. Por exemplo, metabolômica e lipidômica não direcionadas.