患者胶质母细胞瘤切除中细胞微环境的定量免疫组织化学

摘要

该方案被开发用于使用显色免疫组织化学和ImageJ定量鉴定成胶质细胞瘤患者切除中的肿瘤微环境成分。

摘要

随着对肿瘤微环境的兴趣越来越大，我们着手开发一种方法，专门确定患者胶质母细胞瘤，最致命和最具侵袭性脑癌患者样本中的微环境成分。不仅定量方法有利于准确描述患病组织，而且还可能有助于更精确的预后，诊断和组织工程系统和替代品的发展。在胶质母细胞瘤中，胶质细胞，如小神经胶质细胞和星形胶质细胞，与病理学家分级的不良预后独立相关。然而，这些细胞和其他神经胶质细胞成分的状态在定量上尚未得到很好的描述。由于标记这些胶质细胞的大过程，这可能是困难的。此外，大多数组织学分析集中在整体组织样本或仅在大部分肿瘤内，而不是基于区域的划分量化在高度异质的组织。在这里，我们描述了一种用于鉴定和定量分析来自成胶质细胞瘤患者的肿瘤切除肿瘤体积和相邻区域内的神经胶质细胞群体的方法。我们使用显色免疫组织化学来鉴定患者肿瘤切除术和ImageJ中的胶质细胞群，以分析每个胶质细胞群体的染色百分比。通过这些技术，我们能够更好地描述胶质瘤肿瘤微环境区域的神经胶质细胞。

引言

成胶质细胞瘤（GBM），最常见的恶性脑肿瘤，从初级肿瘤主体，其特征在于高度扩散侵入周围健康脑实质^1,2。此漫入侵使得肿瘤尤其难以完全切除，并且保持治疗后入侵癌细胞是不可避免的复发^2，3，4中的最常见的原因。以前，我们发现抑制弥漫性胶质瘤细胞侵袭是治疗有益的⁵ ，但是对于有助于GBM入侵的复杂机制知之甚少。肿瘤微环境中，或组织中癌症周围，已牵涉于肿瘤的进展在多种癌症^6,7。胶质母细胞瘤肿瘤微环境，关节炎，相对低于特征，是独特复杂的，由多种胶质细胞组成，如星形胶质细胞，小神经胶质细胞和少突胶质细胞，以及细胞外基质，可溶性因子和生物物理因素。在实验上，星形胶质细胞和小胶质细胞已被证明能增加神经胶质瘤进展和侵袭^{8，9，10，}但所有的神经胶质细胞中的天然人脑微环境中的组合物是未知的。

我们以前显示微环境成分可以通过定量分析胶质母细胞瘤微环境的细胞成分并将我们的分析纳入比例风险模型来预测患者存活¹¹ 。在这里，我们描述了定量分析方法，用于鉴定胶质母细胞瘤患者肿瘤切除肿瘤体积和相邻区域内胶质细胞的数量秒。我们使用显色免疫组织化学来鉴定胶质细胞群和ImageJ，以分析每个胶质细胞群体的染色百分比。评估百分比覆盖率创建一个简单的测量来确定细胞的形态学差异，特别是那些受癌细胞相互作用影响的细胞。以前的定量组织病理学染色的研究使用标准染色，如苏木精和曙红¹²或Masson的三色染色体¹³ ，其不利用基于抗体的免疫组织化学染色的特异性。我们的方法被开发直接量化胶质母细胞瘤患者肿瘤切除术中的胶质细胞群，我们旨在阐明复杂胶质母细胞瘤微环境。

研究方案

该方案鉴定了福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样品中的细胞组分，如同样的临床患者样本。石蜡包埋允许细胞和组织形态的最佳维持以及具有更好的切片寿命。用于该分析的样品通过弗吉尼亚大学生物原理和组织研究设施进行访问。根据2010年至2013年在弗吉尼亚大学完成肿瘤切除术的胶质母细胞瘤（星形细胞瘤，WHO IV级）的确定性诊断，由神经病理学家选择患者样本，并在该分析之前被去除¹¹ 。

FFPE样品脱蜡和再水化

注意:该协议的这一部分是针对FFPE样本的。而石蜡包埋的样品由于保留细胞和t而可能对这一分析更有用问题形态，这个分析也可以用冻结部分完成。如果使用冷冻切片，该部分可以省略，直接进行显色免疫组织化学。

1. 进行以下洗涤5分钟:二甲苯，二甲苯，100％乙醇，100％乙醇，95％乙醇，95％乙醇，70％乙醇，去离子水，去离子水

2.抗原检索

注意:该方案的这一部分是破坏FFPE样品福尔马林固定期间形成的亚甲基桥所必需的，并暴露抗原位点以进行结合。

1. 稀释Tris型高pH抗原揭示溶液，制造商推荐在蒸馏水中。
2. 使用微波进行热介导的抗原检索。其他形式的热介导回收（如压力锅，蔬菜蒸笼或沸水）也足够了。
   1. 将稀释后的未曝光溶液加入非密封微波炉中船只。将幻灯片放入血管。将幻灯片放入微波炉。
   2. 在大功率下煮20分钟。监测液体的蒸发量，并根据需要用蒸馏水补充。
3. 使样品在室温下在溶液中冷却1小时。

3.显色免疫组织化学

1. 用疏水笔勾画组织样本，以尽量减少覆盖样品所需的试剂体积。
   注意:确保保持组织样本的水分，不要让它们变干，因为这会影响染色效果。
2. 吸管足够的透化溶液（Tris缓冲盐水（TBS）+ 0.01％Triton-X）以覆盖组织样品（通常约100-200μL）。
3. 取出并丢弃溶液并重复步骤3.2。
4. 在室温下用封闭溶液（2.5％马血清+透化溶液）孵育样品。
5. 在4℃孵育样品过夜，用一级抗体稀释在阻塞解决方案。
   注意:此处使用的所有初级抗体均以1:200稀释，但最佳稀释度可用制造商推荐的连续稀释度确定。此协议中使用的抗体的详细信息先前已发布¹¹ 。
6. 使用与一抗体宿主动物相对应的辣根过氧化物酶聚合物试剂检测一抗，按照制造商方案。
7. 吸取足够的透化溶液以覆盖组织样品并孵育5分钟。
8. 删除并丢弃解决方案并重复步骤3.7。
9. 在1×TBS中的0.3％H ₂ O ₂中孵育15分钟。
10. 用过氧化物酶二氨基联苯胺（DAB）底物开发样品2-10分钟，直到达到所需的染色强度。
11. 复制样品以鉴定细胞核，如用苏木精，按照制造商协议。
12. 用100％脱水样品乙醇和二甲苯。
13. 使用安装介质永久安装样品。

4.利益区域识别

1. 图像幻灯片在明场显微镜下能够进行高分辨率图像。
   注意:使用成像细胞组分至少20x分辨率。
2. 将相机移动到整个组织样本的特定感兴趣区域。
3. 将图像保存为TIFF文件进行定量。

图像分析

1. 在ImageJ中打开图像以量化百分比覆盖率。
2. 使用阈值颜色插件从苏木精染色的核中去除紫色。
3. 将图像转换为8位。
4. 添加阈值，不带深色背景。
5. 使用17个预加载的ImageJ阈值滤波器（ 即 MaxEntropy）中的一个处理图像，因此只有DAB染色部分被包括在阈值中。
   注意:选择最小化的最佳预加载阈值过滤器包括背景染色。这可以取决于抗体的染色质量和特异性。对每个患者样本中的所有技术重复使用相同的阈值。
6. 应用阈值。
7. 测量阈值图像的百分比面积。
8. 每个样本中多个区域的平均面积百分比覆盖率。

结果

对于这一分析，我们的肿瘤切除术中的两个兴趣区域 - 主要肿瘤体积和相邻区域，主要由具有扩散性侵袭性癌细胞的健康组织组成（ 图1A ， 1B ） - 通过合成神经病理学家在苏木精和伊红染色患者样本。在每个患者样品中，通过显色免疫组织化学鉴定了星形胶质细胞（ 图1C ），小胶质细胞（ 图1D

讨论

我们在这里提出的方法是一种定量的方法来分析使用传统的显色免疫组织化学染色的组织学样品。此类分析的现行方法包括相似的染色方案，随后由独立病理学家进行分级。该方法是可靠的，但是对于许多应用，需要更精确地了解细胞构成，例如更好地理解与肿瘤相关的异质性和用于体外研究的肿瘤的准确重现。

该方案证明了用于定量分析脑肿瘤微环境内胶质细胞群体的直?...

材料

Name	Company	Catalog Number	Comments
Xylene	Fisher Chemical	X3P
Ethanol
High pH antigen unmasking solution	Vector Labs	H-3301
TBS
Triton-X	Amresco	9002-93-1
Horse serum
Anti-ALDH1L1	abcam	ab56777
Anti-Iba1	abcam	ab5076
Anti-Oligodendrocyte Specific Protein1	abcam	ab53041
ImmPRESS anti-goat	Vector Labs	MP-7405
ImmPRESS Universal (anti-mouse/rabbit)	Vector Labs	MP-7500
Hydrogen peroxide	Sigma Aldrich	216763
ImmPACT DAB substrate	Vector Labs	SK-4105
Hematoxylin counterstain	ThermoScientific	72404
Histochoice Mounting Media	Amresco	H157-475
Aperio Scanscope	Leica Biosystems
Image Scanscope	Leica Biosystems
Super HT PAP Pen	Research Products International	195506