为下游应用获取足够数量的膜蛋白仍然是一个重大的技术挑战。该协议能够纯化几种膜传输蛋白的均匀性。该技术的一个关键优点是,糖精酶是膜蛋白的一个时间和具有成本效益的真核表达系统,允许优化许多关键的实验变量。
首先接种三个转化酵母菌群,在50毫升的完整补充选择性培养基没有组蛋白。辅以酵母氮碱基和2%葡萄糖过夜孵育,每分钟190次旋转,30摄氏度。第二天删除区域性。
使用分光光度计确定 600 纳米或 OD 600 的光学密度。并接种四个两升烧瓶,其中含有500毫升培养培养,以0.01的OD 600。然后以每分钟190次旋转的速度在30摄氏度下摇动培养物,30小时,让细胞消耗所有葡萄糖并生长到高密度。
为了诱导玻酸盐运输者表达,加入125毫升的5个x酵母肽介质,辅以10%的半乳糖在每分钟190旋转在30摄氏度16小时。然后通过离心收获酵母细胞,并在100毫升冷水中重新加入颗粒。在漩涡中旋转以重新暂停酵母颗粒,并串行转移溶液,以做到这一点,所有瓶子含有颗粒。
为了收获酵母膜,首先,向重新暂停的细胞中加入11.25毫升的摩尔三叶草、0.45毫升的0.5摩尔EDTA和2.25毫升的100毫升PMSF。将水加入225毫升的最终体积,并将细胞转移到450毫升金属珠子跳动罐中。用冷 0.5 毫米玻璃珠顶掉剩余体积,用转子组装珠珠腔。
将腔室浸入冰浴中,执行六次一分钟的脉冲,由两分钟的休息时间分开,以防止酸盐过热。最后一次脉冲后,从塑料一次性瓶顶过滤器中取出过滤膜,将其拧入玻璃瓶中,在吸尘时将珠室的内容倒入组件上。然后用两个 x 珠洗缓冲液冲洗,加入腔室旋转,然后添加到珠子中。
用 225 毫升的洗涤缓冲液冲洗珠珠腔,然后用珠子内装物清洗珠子。通过离心收集离酸液,将上经剂转化为聚碳酸酯瓶,用于超离心,用于收集膜。在超离心结束时,丢弃上流水液,用膜颗粒称重瓶子,然后再将膜重新吸收在大约 35 毫升的膜再吸收缓冲液中。
将悬浮液添加到玻璃 Douncer 中,然后 Dounce 将均质异质的膜均匀化到 50 毫升锥形管中,以进行负 80 摄氏度的存储。称重空离心瓶以确定收获膜的质量。对于蛋白质溶解和纯化,每克膜上加入搅拌棒和150毫克DDM,将解冻膜重新暂停至15毫升膜再吸收缓冲液的最终体积,每克膜辅以1毫升PMSF和20毫升。
将膜溶液加入烧杯,在冰浴中搅拌一小时。然后离心,使非溶解材料颗粒。在4摄氏度的冷室中,通过5微米注射器过滤器过滤上清液,并使用每分钟1毫升的流速的吸热泵将样品装载到1毫升固定镍亲和力柱上,然后用10列洗涤缓冲液清洗柱,稀释洗脱缓冲液中的蛋白质。
收集十毫升分之一的埃卢酸盐。在 4 至 20% Tris-Glycine SDS 页面凝胶上运行收集的凝胶分数,以及溶解的解液和在室温下洗涤馏分,在 4 摄氏度的台式离心机中将收集的未收集馏分将浓度拉至 500 微升或更少的体积。通过0.2微米旋转柱过滤器过滤浓缩蛋白质,将滤液注入S-200缓冲液中平衡的尺寸排除柱上。
在秒四至 20%Tris-Glycine SDS 页面凝胶上运行峰值分数后,染色凝胶并收集纯峰值分数,以在 4 摄氏度的 50 公斤道尔顿截止集中器中浓度。然后测量蛋白质样品在280纳米波长的吸光度,以确定浓度,然后无限期地将样品储存在负80摄氏度。要进行谷胱甘肽交叉链接测定,首先,在S-200缓冲液的三微升中加入每毫升0.5毫克解冻蛋白,以5微升S200缓冲液。
加入一升20%硫酸钠和1.5%谷胱甘肽的微升,完成负控制反应。加入一微升水和一微升1.5%谷胱甘肽,完成实验样品。在室温下30分钟后,用5微升的3x SDS页面凝胶加载模具终止反应,含有过量的Tris缓冲液,以淬火谷氨酸,并加载所有15微升溶液到4至20%的Tris-Glycine SDS页面凝胶上。
然后,在染色前以 200 伏特运行凝胶 30 分钟,以确定暗色交叉链接的范围,如以变性单体两倍大小的带来证明。在缓慢的轨道摇床上摇动,将凝胶染色添加到凝胶中,使凝胶染色。这里,镍亲和色谱中未分离分数的典型凝胶显示三种部分纯化蛋白质,其中酸盐分数没有显示与玻酸盐运输器对应的重要带,因为对于表达不过度的蛋白质,其比例不强。
每个凝胶中的ad毫摩尔洗涤道显示,尽管其相对较高的发射体旧浓度较高,但十种组蛋白的损耗最小。虽然与玻酸盐运输机对应的带子在逃避的分数中很容易明显。在S200柱注射之前,蛋白质对于许多下游应用的纯化不足,每个样品中的额外波段所示。
然而,在它们注入大小排除柱后,可以观察到高纯度的未观测分数。交联表明,纯化的同质运输器可以很容易地在溶液中组装,并结合程度取决于彼此附近的莱辛残留物的数量。要么在摄氏四度的房间的冰上,要么在熟食盒里。
按照这个程序,膜蛋白可以进一步定性的生物物理,生化或结构方法,包括X射线晶体学或低温电子显微镜。通过使一定量的均质蛋白得到纯化,这些技术被用来确定阿拉比多普西沙利纳一个运输器的晶体结构。