该协议的主要目的是研究遗传和环境因素在心脏发育背景下的相互作用及其对先天性心脏缺陷的贡献。单核RNA-seq和单核共济失调等单核方法正在成为研究心脏发育过程中健康和疾病细胞异质性的关键方法。这些实验的一个限制步骤是所有样品必须同时运行。
在处理所有实验条件时,同时收集足够新鲜的材料可能具有挑战性。尽管近年来在单细胞领域取得了重大进展,但主要困难是处理免费样品。避免这种困难对于确定先天性心脏病缺陷的分子机制非常有益。
该协议描述了从小鼠胚胎获得的冷冻心脏细胞悬液中成功分离高质量细胞核的步骤。我们的协议与下游单核RNA-seq和单核共济失调兼容。我们希望该程序将帮助感兴趣的研究人员,并鼓励他们使用这种强大的方法进行研究。