我们的研究使用先进的基因组学来加强低收入和中等收入国家的病原体监测。这有助于我们授权当地研究人员回答五个大问题,即谁、什么、在哪里、为什么和何时。这可以为实地的实际解决方案提供信息。
我们使用纳米孔技术来分散测序。与其他平台相比,它的易用性、便携性和更便宜的成本使其成为低资源设置的理想选择。在样本源快速测序的能力意味着我们可以在动物-人类环境界面进行监测。
我们面临着从不同质量的样本中获取全基因组的挑战。通常,来自偏远地区的提交材料将在恶劣的储存条件下运输。而且,我们在生物信息学工具方面的专业知识有限,这些工具对解释数据很有用。
所以这些工具就像 MADDOG 和 drug-V GLUE。这可用于以通用方式解释数据,以帮助启动控制。我们正试图展示他们如何针对狂犬病的快速序列或整个基因组序列优化方案,并了解如何在低收入国家进行狂犬病测序,以回答关于狂犬病到底是如何传播的、什么是传播的以及何时传播的不同问题?
这些信息对于狂犬病消除策略是必要的。病毒基因组监测现在更容易获得。然而,对地方控制工作的数据分析和解释的指导更为有限。
我们的协议提供了一个端到端的管道,使当地科学家具有一线监测能力。病毒基因组和解释这些数据的方法的可用性更高,使研究人员能够将流行病学见解转化为政府部门或疾病控制计划的可操作信息,并指导决策过程。