Author Spotlight: זרימת עבודה גנומית חסכונית לקידום הדברת כלבת בסביבות מוגבלות במשאבים

Please note that all translations are AI generated. Click here for the English version.

2.8K Views

•

02:47 min

•

August 18th, 2023

DOI :

10.3791/65414-v

August 18th, 2023

•

Criselda Bautista¹^,², Gurdeep Jaswant¹^,³^,⁴^,⁵, Hollie French¹^,⁶, Kathryn Campbell¹, Rowan Durrant¹, Robert Gifford¹^,⁶, Grace S. N. Kia⁷^,⁸, Brian Ogoti³^,⁹, Katie Hampson¹, Kirstyn Brunker¹^,⁶

¹School of Biodiversity, One Health & Veterinary Medicine, University of Glasgow, ²Research Institute for Tropical Medicine, ³University of Nairobi, Institute of Tropical and Infectious Diseases, ⁴Tanzania Industrial Research Development Organization, ⁵Ifakara Health Institute, ⁶MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research, ⁷Department of Veterinary Public health, Ahmadu Bello University, ⁸African Centre of Excellence for Neglected Tropical Diseases and Forensic Biotechnology, Ahmadu Bello University, ⁹University of Nairobi, Kenya and Center for Epidemiological Modelling and Analysis, University of Nairobi

Transcript

המחקר שלנו משתמש בגנומיקה מתקדמת כדי לשפר את המעקב אחר פתוגנים במדינות בעלות הכנסה נמוכה ובינונית. וזה עוזר לנו להעצים חוקרים מקומיים לענות על חמש שאלות גדולות, מי, מה, איפה, למה ומתי. וזה יכול לספק פתרונות מעשיים בשטח.

אנו משתמשים בטכנולוגיית ננו-נקבוביות כדי לבזר את הריצוף. קלות השימוש, הניידות והעלויות הזולות יותר ביחס לפלטפורמות אחרות הופכות אותו לאידיאלי עבור הגדרות דלות משאבים. והיכולת לרצף במהירות במקור הדגימה פירושה שאנו יכולים לבצע מעקב בממשק בין החי לסביבה האנושית.

אנו מתמודדים עם אתגרים בהשגת גנומים שלמים מדגימות באיכות משתנה. לעתים קרובות, הגשות מאזורים מרוחקים יועברו בתנאי אחסון גרועים. כמו כן, יש לנו מומחיות מוגבלת בכלים ביואינפורמטיים שיהיו שימושיים בפענוח נתונים.

אז הכלים האלה יהיו כמו MADDOG ו-Drug-V GLUE. זה יכול לשמש לפרש נתונים באופן אוניברסלי כדי לעזור ליזום שליטה. אנחנו מנסים להדגים איך הם מייעלים את הפרוטוקול לרצפים מהירים או לרצפים גנומיים שלמים של כלבת ולראות איך אפשר להתאים אותו ולהשתמש בו במדינות בעלות הכנסה נמוכה לריצוף כלבת כדי לענות על שאלות שונות על איך היא באמת מסתובבת, מה מסתובב ומתי היא מסתובבת?

ומידע זה נחוץ לאסטרטגיות חיסול כלבת. מעקב גנומי ויראלי נגיש כעת יותר. עם זאת, ההנחיות לניתוח נתונים ופרשנות עבור מאמצי בקרה מקומיים מוגבלות יותר.

הפרוטוקול שלנו מציע צינור מקצה לקצה, המעצים מדענים מקומיים עם יכולות מעקב בקו החזית. זמינות רבה יותר של גנומים נגיפיים ושיטות לפענוח נתונים אלה מאפשרת לחוקרים לתרגם תובנות אפידמיולוגיות למידע מעשי עבור משרדי ממשלה או תוכניות בקרת מחלות ולהנחות את תהליך קבלת ההחלטות.

Explore More Videos

LMICs

PCR

MADDOG

From the series

גישה גנומית מבוססת ננופור להדברת כלבת במדינות בעלות הכנסה נמוכה