ריצוף גנום שלם לאפיון מהיר של נגיף הכלבת בטכנולוגיית ננופור

המחקר שלנו משתמש בגנומיקה מתקדמת כדי לשפר את המעקב אחר פתוגנים במדינות בעלות הכנסה נמוכה ובינונית. וזה עוזר לנו להעצים חוקרים מקומיים לענות על חמש שאלות גדולות, מי, מה, איפה, למה ומתי. וזה יכול לספק פתרונות מעשיים בשטח.

אנו משתמשים בטכנולוגיית ננו-נקבוביות כדי לבזר את הריצוף. קלות השימוש, הניידות והעלויות הזולות יותר ביחס לפלטפורמות אחרות הופכות אותו לאידיאלי עבור הגדרות דלות משאבים. והיכולת לרצף במהירות במקור הדגימה פירושה שאנו יכולים לבצע מעקב בממשק בין החי לסביבה האנושית.

אנו מתמודדים עם אתגרים בהשגת גנומים שלמים מדגימות באיכות משתנה. לעתים קרובות, הגשות מאזורים מרוחקים יועברו בתנאי אחסון גרועים. כמו כן, יש לנו מומחיות מוגבלת בכלים ביואינפורמטיים שיהיו שימושיים בפענוח נתונים.

אז הכלים האלה יהיו כמו MADDOG ו-Drug-V GLUE. זה יכול לשמש לפרש נתונים באופן אוניברסלי כדי לעזור ליזום שליטה. אנחנו מנסים להדגים איך הם מייעלים את הפרוטוקול לרצפים מהירים או לרצפים גנומיים שלמים של כלבת ולראות איך אפשר להתאים אותו ולהשתמש בו במדינות בעלות הכנסה נמוכה לריצוף כלבת כדי לענות על שאלות שונות על איך היא באמת מסתובבת, מה מסתובב ומתי היא מסתובבת?

ומידע זה נחוץ לאסטרטגיות חיסול כלבת. מעקב גנומי ויראלי נגיש כעת יותר. עם זאת, ההנחיות לניתוח נתונים ופרשנות עבור מאמצי בקרה מקומיים מוגבלות יותר.

הפרוטוקול שלנו מציע צינור מקצה לקצה, המעצים מדענים מקומיים עם יכולות מעקב בקו החזית. זמינות רבה יותר של גנומים נגיפיים ושיטות לפענוח נתונים אלה מאפשרת לחוקרים לתרגם תובנות אפידמיולוגיות למידע מעשי עבור משרדי ממשלה או תוכניות בקרת מחלות ולהנחות את תהליך קבלת ההחלטות.