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In diesem Artikel

  • Zusammenfassung
  • Zusammenfassung
  • Einleitung
  • Protokoll
  • Ergebnisse
  • Diskussion
  • Offenlegungen
  • Danksagungen
  • Materialien
  • Referenzen
  • Nachdrucke und Genehmigungen

Zusammenfassung

Dieses Papier beschreibt die Anwendung von cryoanalytical Elektronenmikroskopie auf die quantitative Messung der Gesamtkalziumgehalt und die Verteilung auf subzellulärer Auflösung in physiologisch definierte biologische Proben.

Zusammenfassung

In diesem Artikel werden die Werkzeuge, Techniken und Instrumente für quantitative Messungen der intrazellulären Elementgehalt falls unter Verwendung der Technik, die als Elektronenstrahl-Mikroanalyse (ESMA) bekannt sind, beschrieben. Intramitochondrialen Kalzium ist ein besonderer Schwerpunkt wegen der kritischen Rolle, dass die mitochondriale Calciumüberladung spielt bei neurodegenerativen Erkrankungen. Die Methode basiert auf der Analyse der Röntgenstrahlen erzeugt in einem Elektronenmikroskop (EM) durch Wechselwirkung eines Elektronenstrahls mit der Probe berechnet. Um die native Verteilung der diffusionsfähigen Elemente in der Elektronenmikroskopie Proben zu erhalten, erfordert ESMA "Kryofixation" von Gewebe, gefolgt von der Herstellung von ultradünnen Gefrierschnitten. Schockgefrieren von kultivierten Zellen oder organotypischen Kulturen wird durch Eint Einfrieren in flüssigem Ethan oder durch Einfrieren Slam gegen einen kalten Metallblock bzw. durchgeführt. Cryoschnitte nominell 80 nm dick sind trocken mit einem Diamantmesser bei ca. geschnitten. -16076, C, auf Kohlenstoff / PIOLOFORM beschichteten Kupfergitter montiert und cryotransferred in eine Kryo-EM mit Hilfe eines speziellen cryospecimen Halter. Nach der visuellen Mapping-Umfrage und die Lage bei ≤ 160 ° C und niedriger Elektronendosis, sind tiefgefrorenen Gefrierschnitten gefriergetrockneten bei -100 ° C ~ 30 min. Organell Stufenbilder von getrockneten Kryoabschnitte aufgezeichnet sind, auch bei niedrigen Dosis mittels einer Slow-Scan-CCD-Kamera und subzellulären Regionen von Interesse für die Analyse ausgewählt. Röntgenstrahlen von einem stationären, konzentriert, mit hoher Intensität Elektronensonde von ROIs emittiert werden, von einer energiedispersiven Röntgenanalyse (EDX)-Spektrometer, um die zugehörige Elektronik verarbeitet und als Röntgenspektrum präsentiert gesammelt, das heißt, ein Grundstück von Röntgenintensität vs Energie. Zusätzliche Software erleichtert: 1) Identifizierung von elementaren Komponenten durch ihre "charakteristisch" Spitzen Energien und Fingerabdruck, und 2) die quantitative Analyse durch Extraktion der Peakflächen / Hintergrund. Das Papier schließt mit zwei Beispiele, die veranschaulichen typischeEPMA-Anwendungen, in denen eine mitochondriale Calciumanalyse vorgesehen kritischen Einblick in Mechanismen der exzitotoxischen Schädigung und eine andere, die die Grundlage der Ischämie Beständigkeit zeigte.

Einleitung

Calciumionen sind wohl die wichtigsten und vielseitigsten Zellsignalisierungseinheit in der Biologie, spielen eine wesentliche Rolle in der normalen Prozesse so vielfältig wie die synaptische Transmission und Genexpression. Auf der anderen Seite, ist Calcium in Zelltod ebenso wichtig. Insbesondere ist ein Schlüsselfaktor in der neuronalen Verletzungen in der Schlaganfall-Kalzium Deregulierung, Parkinson, Alzheimer und anderen neurodegenerativen Erkrankungen 3,5. Daher ist es von entscheidender Bedeutung, um quantitativ zu verstehen, wie Calcium in den Zellen verteilt und wie diese Veränderungen nach physiologischen oder pathophysiologischen Stimuli. Frei in Lösung oder an ein Substrat gebunden - - und das zelluläre Calciumkonzentrationen über mehrere Größenordnungen als Folge der Stimulation verändern Dieses Ziel wird durch die Tatsache, dass Kalzium wird dynamisch zwischen zwei physikalische Zustände verteilt kompliziert.

Zwar gibt es mehrere Methoden für die erweiterte Analyse fr verfügbaree intrazellulären Calcium ist die Bestimmung der Gesamtcalciumkonzentrationen in definierten intrazellulären Kompartimenten realistisch auf einem Ansatz, nämlich Elektronenstrahlmikroanalyse (ESMA) begrenzt. EPMA ist eine Technik, die Paare ein Röntgenspektrometer mit einem Transmissionselektronenmikroskop (TEM). Die TEM-Elektronenkanone konzentriert sich eine stationäre, Submikron Elektronensonde auf subzellulärer Region von Interesse und den elementspezifischen Röntgenstrahlen als Folge der Elektronenbeschuss emittiert werden, werden gesammelt und analysiert (siehe Referenzen 7, 4 für technische Detailbewertung). Vorteile der ESMA sind einzelne Organellen-Level-Auflösung und Empfindlichkeit submillimolaren. In der Praxis jedoch, ESMA erfordert spezielle cryotechniques und Instrumente für die Probenvorbereitung und Analyse. Hier werden die Werkzeuge, Techniken und Instrumente für die Messung von intrazellulären Kalzium mittels ESMA entsprechende beschrieben. Intramitochondrialen Kalzium ist besonders interest wegen der entscheidenden Rolle, dass die mitochondriale Calciumüberladung spielt bei neurodegenerativen Erkrankungen.

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Protokoll

Der hier beschriebene Ansatz wurde mit spezifischen Instrumente, Tools und Software entwickelt. Da Labors werden nicht mit der gleichen Versuchsanordnung werden der Ansatz verallgemeinert, wo möglich.

1. Schnelles Einfrieren

Die Analysemethode beschrieben ist absolut abhängig von kryogenen Ansätze: 1) der "Kryofixation" von Zellen oder Geweben in einer Weise, die quantitativ bewahrt die Verteilung der diffundierbaren Gewebekomponenten und chemische Elemente wie sie in lebenden Zellen zum Zeitpunkt des Einfrierens und 2) die Herstellung von ultradünnen Gefrierschnitten geeignet für in einer TEM-Abbildung und Analyse. Diese Techniken werden hier kurz beschrieben, aber notwendigen Angaben, um diese Verfahren in anderen Laboratorien reproduzieren würde den Rahmen dieses Artikels. Interessierte Leser sind, exzellenten Artikeln 9,14 bezeichnet.

Achtung: Dieser Abschnitt beschreibt die Verwendung von liquefied Ethan, die leicht entzündliche und explosions ist, entsprechende Vorkehrungen getroffen werden sollten. Betreiber müssen ebenfalls mit flüssigem Stickstoff vertraut sein (LN 2) Sicherheitsmaßnahmen, einschließlich Schutzmantel, Gläser und cryoresistant Handschuhe. Hinweis: Hier und überall, alle Werkzeuge (Zange, etc.) für die Handhabung gefrorenen Proben müssen in LN 2 vor der Verwendung vorgekühlt werden, um ein versehentliches Auftauen zu vermeiden.

Kultivierte Zellen auf Deckgläsern

  1. Bereiten Sie eine Tauchgefriergerät durch Kondensation von gasförmigen Ethan bei -160 ° C in der LN 2 gekühlten Zentral gut. Bis zur Marke auffüllen und decken die gut mit der Schwenk Alu-Deckel, wenn sie nicht in Gebrauch ist.
  2. Mit Filterpapier Keile, unter geeigneten Bedingungen experimentell zu einem dünnen Wasserfilm tupfen Kunststoff-Deckgläser von kultivierten Zellen. Tupfen Sie von der Kante um zu vermeiden, berühren das Gewebe, das Ideal Restfilm, durch Versuch und Irrtum bestimmt wird, ist so dünn wie möglich, aber nicht so thim zu verdampfen und trocknen der Gewebeoberfläche.
  3. Halten Sie das Deckglas durch die Kante mit Spannzangen, schnell in flüssigem Ethan eintauchen, entweder manuell oder mit Hilfe der Schwerkraft betriebene Kolben.
  4. Legen Sie die gefrorenen Deckglas in einem nahe gelegenen Styropor-Schale mit LN 2, groß genug, um die gewünschte Anzahl von Deckgläsern in langfristige Lagerbehälter zu manipulieren. Aluminium-Schraubverschluss Dosen, die nicht unter LN 2 ergreifen, werden empfohlen.

Schockgefrieren von kultivierten Hirnschnitten

  1. Unter einem Binokular, ansehen und Orient ein organotypischen Hippocampus-Scheibe, ungestört und immer noch auf die Kultur Membraneinsatz befestigt. Zeigen Markierungszeichen auf der Membran in der Nähe der Kante der Scheibe mit einem schwarzen Sharpie-Typ-Stift und Foto.
  2. Noch unter dem Mikroskop, schneiden Sie ca.. 5 x 5 mm Membran Quadrate mit einzelnen Scheiben auf den Plätzen zentriert. Berühren Sie nicht die Scheibe oder Biegen der MembranE.
  3. Montieren Sie einen Membran-gestützte Scheibe, durch eine im Durchmesser ¼ Agar-Pad gepolstert, auf einem kundenspezifischen Aluminiumscheibe, um einen cryoultramicrotome (siehe unten) passen. Schnell frieren die Scheibe durch pneumatisch treibt es gegen eine LN2-gekühlten Saphirblock mittels eines maßgeschneiderten "slam Einfrieren"-Gerät.
  4. Bewegen Sie den Speicher für kultivierten Zellen beschrieben.

2. Kryoschneiden

Vorab: Erfolgreich produzieren Trockenschnitt-Bänder von Ultradünnschnitten, während einfach und logisch, erfordert Übung, Geduld und erheblichen Praxis.

  1. Backen Sie einen cryoultramicrotome mit einem cryoattachment und kühl bis -135 ° C ausgestattet
  2. Schneiden gefroren in ca. Deckgläser. 3 x 3 mm Quadrate mit einem scharfen, vorgekühlt Skalpell. Einbetten Stücke mit Kulturen nach oben in einer viskosen Flüssigkeit "cryoglue" (1:6 Gemisch aus Ethanol und 2-Propanol 11) auf Standard-3mm Durchmesser aus Aluminium entwickelt, um die Pins Mikrotom Probe Futter passen. Vermeiden undicht cryoglue auf Kulturfläche. Festigen cryoglue durch Absenken der Temperatur auf Kryoboxen -160 ° C ≤
    • Für tiefgefrorene Hirnschnitten, sicher direkt befestigen Scheiben zu einem maßgeschneiderten Spannfutter Probe mittels einer Schraube Kragen.
  3. Trim ausgewählten Bereichen der gefrorenen Proben - zB Zellreichen Gebieten des Deckglases Stück oder den Bereichen von Scheiben - zu einer ca.. 250 x 250 um Block Gesicht und ~ 100 um Tiefe mit einem Diamantschneidwerkzeug.
  4. Dry-Cut-Bänder von Dünnschnitten bei ca.. -160 ° C mit einer 35 ° Diamant cryoknife, im wesentlichen wie in referencs 4, 9 beschrieben. Schnittgeschwindigkeit und Messer Freiwinkel werden empirisch bestimmt, ein guter Ausgangspunkt ist 0,4 bis 0,6 mm / sec bei 9 °. Die Nenndicke, dh Probe voraus, von hydrierten Schnitte iist typischerweise 80 nm, obwohl Abschnitte tatsächlich 1,5-2.0x dicker, hauptsächlich aufgrund der Kompression. Für eine einwandfreie Schnitte, ist ein Antistatikvorrichtung notwendig. Setzen Sie den ionisierenden Spitze der Geräte 0,5-1 cm von der Messerkante und stellen Ausgangsleistung, bis eine zufriedenstellende Bänder von Abschnitten hergestellt werden.
  5. Bereiten Wimpern Sonden durch Kleben (mit Epoxy) Wimpern Applikator Holz-Sticks. Mit einer solchen Sonde, Abholung und Transfer Abschnitte aus dem Messerrücken auf glow-entladen, Kohlenstoff-beschichteten Trägerfolien PIOLOFORM über 100-Mesh-Klappkupfergitter gegossen und auf einem Halb gefaltet Indiumfolie Umschlag auf einem Regal hinter ruhenden Arbeits das Messer. Falten Sie die obere Hälfte des Rasters und Umschlag, drücken Sie mit einem Kaltpresswerkzeug.
  6. Übergitter eingewickelt in einem geeigneten Gitterbox und Speicher in einem Aluminium kann, wie in Schritt 1.4 beschrieben.

3. Schockgefrierungsobjekthalter von Proben in die Elektronen-Mikroskop

Das Kerninstrument für die ESMAin diesem Labor ist eine analytische Elektronenmikroskop bei 120 kV betrieben und für Kryomikroskopie ausgestattet, das heißt, mit einem sauberen Vakuum, Probe-Gebiet anticontaminator, einer 2k x 2k hochempfindlichen Digitalkamera und Schockgefrierungsobjekthalter Probenhalter entworfen. Überprüfen Sie vorher, Mikroskop Ausrichtung und Betriebsbedingungen in beiden Low-und High-Vergrößerung Modi und bestätigen eine zufriedenstellende Spalte Vakuum, idealerweise ≤ 10 -7 Torr. Tune up wie nötig.

  1. Bestätigen Sie, dass die Vakuum-Isolierung der Dewar-Komponente des cryoholder ist zufriedenstellend. Pumpe nach Bedarf.
  2. Kühlen Sie die cryoholder auf die Minimaltemperatur, mindestens -160 ° C, während im Hochvakuum innerhalb der Mikroskoptisch, nehmen Sie das Kabel, das den Halter, seine Steuereinheit. Kippen Sie die Goniometer 45 ° im Uhrzeigersinn, bevor Sie den Inhaber, LN 2 minimieren Verschütten auf Betreiber und Mikroskop Oberflächen.
  3. Bereiten Sie die Tisch cryoworkstation durch Abkühlen des integralen isolierend-Schale auf 160 ° C ≤
  4. Transfer (quickly!) die gekühlte cryoholder von Mikroskop, um Cryo Workstation. Einfahren des Inhabers Frostschirm.
  5. Rufen Sie unter LN 2 ein Raster-Sandwich von der Lagerung und Platz auf dem Arbeitstisch des cryoworkstation. Ein Haltering für des Inhabers Probe gut ist auch auf den Tisch gelegt.
  6. Öffnen Sie die Indium-Umschlag und bewegen Sie den beiliegenden Klappgitter auf die Probe auch der cryoholder. Sichern Sie das Gitter mit Haltering mit dem Schraubenschlüssel Werkzeug ein und schließen Sie den Frostschutz.
  7. Schnelles Entfernen der cryoholder vom cryoworkstation legen und in der Luftschleuse des Mikroskops und gehen durch die Pumpsequenz so schnell wie möglich. Beim Einsetzen, sollte minimale Unterbrechung der Säule Vakuum sein.
  8. Zurück Goniometer auf 0 ° Neigung. Schließen Sie neue Energie tanken und das Kontrollkästchen und bestätigen, dass die Probentemperatur ≤ 150 ° C
  9. Füllen Sie den Dewar derProbenhalter und ermöglichen Vakuum-und Temperatur vollständig erholen.

4. Visual Survey der § §

  1. Fahren Sie den Frostschirm des Inhabers zur Probe aussetzen und schalten Sie den Elektronenstrahl.
  2. Visuelle Bewertung der Probe bei geringer Vergrößerung, in der Regel 250X und geringer Beleuchtung. Wie in Abbildung 1 dargestellt ist, sollte Abschnitte dünn und glatt, nicht gefaltet oder überlappenden, flach und gut auf die Trägerfolie angebracht sein, und in der Regel nicht durch Gitterstäbe verdeckt.
  3. Optional fotografieren ausgewählten Abschnitten. (HINWEIS: Minimieren Belichtung, da tiefgefrorenen Abschnitte sind sehr anfällig für Strahl-induzierten Schäden.) Verwenden Sie die automatisierte digitale Goniometertisch, um die Koordinaten der ausgewählten Abschnitte zu speichern.

5. Die Gefriertrocknung der § §

  1. Gefrier trockenen Abschnitte durch die Erhöhung Halter Temperatur auf ca.. -100 ° C ~ 30 min.
  2. Rückkühlung Halter bis -160 ° C oder darunter.
  3. Vor der Bildgebung, schalten Sie cryoholder Steuereinheit und physisch trennen Controller-Kabel für Bild Drift durch Temperaturwechsel und / oder Vibration Abholung zu vermeiden.

6. Imaging von Zellen und Organellen

Strukturbilder von gefriergetrockneten Abschnitte werden bei ca. erhalten. -160 ° C als low-dose, Zero-Loss-Bilder mit einem 2k x 2k Slow-Scan CCD-Kamera durch entsprechende Software gesteuert digital aufgezeichnet.

  1. Aktivieren Sie die EM in hallo-mag-Modus.
  2. Wählen und Bild bei ~ 2000 X (als TIFF-Dateien, siehe Abbildung 2) markierten Zellen und subzellulärer Bereiche von Interesse in hochwertigen Abschnitte, deren Standorte waren zuvor aufgezeichnet und gespeichert. (Anmerkung: Die getrockneten Abschnitte sind jetzt wesentlich weniger empfindlich und weniger anfällig für Beschädigungen Elektronenstrahl.
  3. Bewerten Sie Bilder, um Regionen von Interesse (ROI) für die Röntgenanalyse auswählen. Dieser Schritt kann wahlweise off-line durchgeführt werden, in welchem ​​Fall die EM gedreht werden kannaus, und die Probe auf Raumtemperatur erwärmen.

7. Akquisition von Röntgenspektren

Röntgenspektren mit einem aufgezeichnet werden mehrere kommerzielle oder kundenspezifische Röntgenanalysesysteme minimal aus einer energiedispersiven Röntgenanalyse (EDX)-Detektor, zugehörigen Impulsprozessor-Elektronik und kompatibel Erfassung und Anzeige-Software. (Der in dieser Übung verwendete System ist in Tabelle 1 beschrieben.)

  1. Konfigurieren des EM für die Röntgenaufnahmen durch Einsetzen des EDX-Detektor in der Kolonne (falls erforderlich), Abziehen der Objektivöffnung und Einführen und Zentrieren keine Streustrahlung Öffnungen. Einstellen der cryoholder der niedrigsten Temperatur, bei der Frost Verunreinigung der Probe vermieden wird, sondern zumindest unterhalb -100 ° C
  2. Neigen Sie den Halter 20 ° in Richtung des Detektors.
  3. Unter Weitfeldabbildungsbedingungen und unter Annahme einer beabsichtigt, die Matrix aus einer analysieren individual Mitochondrien, wählen Sie ein Mitochondrium für die Analyse, verschieben Sie sie in der Mitte des Feldes und den Schwerpunkt.
  4. Zum Spot-Modus (bei ​​einigen Mikroskopen nur konvergieren den Strahl mit zweiten Kondensator Fokus) und erhöhen die Strahlstrom auf ca.. 3 nA (wie mit einem Faraday-Cup oder ähnlichen gemessen) in einer 100 nm Ort.
  5. Starten Sie das Spektrum Erfassungssoftware und beginnen 100 sec Akquisitionen, die Live-Zeit auf dem Monitor betrachtet werden können. Sparen aufgenommene Spektrum (Abb. 2). Der Industriestandard EMSA-Format bevorzugt.
  6. Fahren Sie den EM und übertragen Sie die Multiple-Spektren-Datei (en) zu einem (offline) Analyse-Workstation.

8. Analyse der Röntgenspektren

Qualitative Analyse

Eine EDX-Spektrum (Abbildung 2, Einschub) ist im Wesentlichen eine xy-Darstellung der Röntgenintensität vs Energie. Spectra enthalten qualitative und quantitative Informationen über die elementare Zusammensetzung von ter analysiert, Lautstärke, dass der "charakteristischen" Energie einer Spitzen identifiziert das Element, die zu diesem Gipfel, während die Intensität spiegelt die Menge dieses Elements. Die charakteristischen Peaks reiten auf einem sich langsam verändernden Hintergrund, der "Kontinuum". (Die Legende zu Abbildung 2 weiter diskutiert hervorstechenden Details der EDX-Spektren.) Die Energie der Spitzen Verteiler für das gesamte Periodensystem werden durch die bekannten elektronischen Struktur von Elementen, wodurch alle EDX Software Links zu einer Datenbank, die automatisch identifiziert Komponenten definiert ein Analyt. In einem physiologischen Kontext, Elemente von allgemeinem Interesse, die gut auf EDX-Analyse sind, umfassen Na (K α bei 1,04 keV), P (2,01 keV), K (3,31 keV) und Ca (3,69 keV).

  1. Profitieren Sie von der verfügbaren Software-Datenbank und Spitzenpassenden Routinen, um wichtige Elemente in den Spektren zu identifizieren. In einer biologischen Probe zu erwarten Peaks für Na, Mg, P, S, Cl, K und Ca zu finden. (ACHTUNG:Die letzten beiden Elemente überlappen!)

Quantitative Analyse

Die quantitative Analyse der EDX-Spektren aus der Extraktion der integrierten Fläche der Peaks identifiziert und Konvertieren dieses Wertes in einer Konzentration. Für biologische Analyse ist die etablierten Ansatz der Hall Peak / Kontinuum Verfahren 4,7,10, die Nutzen aus der Tatsache, dass die Intensität des Kontinuums (oben und in Abbildung 2 definiert) ist proportional zu der Trockenmasse des analysierten Volumen nimmt . Somit ist das Verhältnis der Peakfläche / Kontinuum Bereich, verglichen mit dem gleichen Verhältnis in Spektren von Standards bekannter Zusammensetzung, gibt die Konzentration in der Ziel Zellkompartiment. Beachten Sie, dass dieser Ansatz Konzentrationen in Einheiten von Mol pro Gewicht, in der Regel als mmol / kg Trockengewicht ausgedrückt. Diese Einheit ist ungewöhnlich und für die Interpretation erfordern zusätzliche Umwandlung in zB mmol / L Nassgewicht oder mmol / mg Protein, wie beschrieben elsewhere 4,10.

  1. Extrahieren Peakflächen (und Fehlerschätzungen) biologischer Elemente zwischen Z = 10-20 (0,5-4,0 keV), dh Na, Mg, P, S, Cl, K, Ca und unter Verwendung einer der Routinen in den Fitting-Analyse-Software gebaut (siehe Tabelle 1, insbesondere Fußnote 4). Dieses Labor verwendet Simplex-oder Mehr kleinsten Quadrate. Beachten Sie, dass diese Montage erfordert eine sorgfältige Aufmerksamkeit auf die Lösung der Überlappung zwischen K-und Ca-Gipfel (siehe Abbildung 2).
  2. Integrieren Sie das Kontinuum zwischen 1,45-1,61 keV. Alternative störungsfreien Bereiche können verwendet werden.
  3. Berechnen Peak / Kontinuum Verhältnisse und dann Konzentrationen im Vergleich zu Standards. Propagieren Fehler während der gesamten Analyse.
  4. Verwenden Sie Standard-Statistik-Software und Formeln, um Durchschnittswerte, die biologische Variabilität widerspiegeln schätzen.

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Ergebnisse

Gehirnzellen zu erhalten in der Regel exzitotoxische Verletzungen als Folge des pathologischen Neurotransmitter-Freisetzung, die unter ischämischen Bedingungen auftritt. ESMA war entscheidend für die Entdeckung, wie die Fähigkeit der neuronalen Mitochondrien, riesige Mengen an Kalzium zu maskieren zugrunde liegt, den Mechanismus der Verletzung. Die elektronenmikroskopische Aufnahme in Fig. 3 veranschaulicht das Aussehen von Mitochondrien in gefriergetrockneter Gefrierschnitten von kultivierten hippoc...

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Diskussion

Die hier vorgestellte Elektronenmikroskop-basierten Analysemethode ermöglicht die Detektion, Identifizierung und Quantifizierung von mehreren Elementen von biologischem Interesse, einschließlich Na, K, P, insbesondere Ca. Diese Analysen können bei subzellulärer geführt werden, dh, intra-Organellen, die Auflösung aufgrund der Fähigkeit, zu lokalisieren und zu identifizieren Strukturen von Interesse in Bildern hoher Qualität von Gefrierschnitten aus rasch eingefroren Proben vorbereitet. Beachten Sie, dass...

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Offenlegungen

Die Autoren berichten, keine Interessenkonflikte.

Danksagungen

Wir möchten Frau Christine A. Winters für hervorragende technische Unterstützung danken. Diese Arbeit wurde durch das Grundneuroscience Programm der NINDS Interne Research Program, NIH (Z01 NS002610) unterstützt.

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Materialien

NameCompanyCatalog NumberComments
REAGENTS/MATERIALS
Thermanox plastic coverslipsThermo Fischer Scientific72280
Culture insertsBD Falcon353090For 6-well plates
CryopinsLeica Microsystems16701952Grooved
Wood applicatorsEM Sciences72300
Folding EM gridsTed Pella4GC100/100100 mesh
Indium foilAlfa Aesar139820.25 mm thick
EQUIPMENT
Plunge freezing deviceLeica MicrosystemsKF-80
Slam freezing deviceLifeCellCF-100
UltramicrotomeLeica MicrosystemsUC6
Cryoattachment for microtomeLeica MicrosystemsFC6
Diamond cryotrimming toolDiatomeCryotrim 45
Diamond cryoknifeDiatomeCryo 35
Antistatic deviceDiatomeHauf Static Line
Cryo electron microscopeCarl Zeiss MicroscopyEM912 Omega
EM cryo specimen holderGatanCT3500
Slow-scan CCD camera, 2k x 2kTroendle (TRS)Sharpeye
Image acquisition softwareOlympus SISiTEM suite
ED x-ray detectorOxford InstrumentsLinksystem Pentafet
Pulse ProcessorOxford InstrumentsXP-3
PCI backplane card4pi SystemsSpectral Engine II
Desktop computerAppleAny OS9-compatible model
X-ray analysis softwareNISTDTSA, DTSA II
Spreadsheet softwareMicrosoftExcel
  1. The CF100 is no longer sold commercially, although the machine is available at many academic facilities, and complete machines or parts can be found on-line.
  2. A video tutorial for the CT3500 cryotransfer holder is available at http://www.gatan.com/files/Movies/CT3500_Cryo_transfer_holder.mp4.
  3. The SEII is obsolete; the Universal Spectral Engine Is a later, PC-compatible product with comparable functionality. 4pi has ceased manufacturing and sales but still provides technical customer support. Used systems are often found online.
  4. The original DTSA is now obsolete. NIST offers in the public domain an updated successor, DTSA II 12 (http://www.nist.gov/mml/mmsd/software.cfm)

Referenzen

  1. Aronova, M. A., Kim, Y. C., Pivovarova, N. B., Andrews, S. B., Leapman, R. D. Quantitative EFTEM mapping of near physiological calcium concentrations in biological specimens. Ultramicroscopy. 109, 201-212 (2009).
  2. Aronova, M. A., Leapman, R. D. Elemental mapping by electron energy loss spectroscopy in biology. Methods Mol. Biol. 950, 209-226 (2013).
  3. Bezprozvanny, I. Calcium signaling and neurodegenerative diseases. Trends Mol. Med. 15, 89-100 (2009).
  4. Fernandez-Segura, E., Warley, A. Electron probe X-ray microanalysis for the study of cell physiology. Methods Cell Biol. 88, 19-43 (2008).
  5. Gibson, G. E., Starkov, A., Blass, J. P., Ratan, R. R., Beal, M. F. Cause and consequence: Mitochondrial dysfunction initiates and propagates neuronal dysfunction, neuronal death and behavioral abnormalities in age-associated neurodegenerative diseases. Biochim. Biophys. Acta. 1802, 122-134 (2010).
  6. Leapman, R. D. Novel techniques in electron microscopy. Curr. Opin. Neurobiol. 14, 591-598 (2004).
  7. LeFurgey, A., Bond, M., Ingram, P. Frontiers in electron probe microanalysis: application to cell physiology. Ultramicroscopy. 24, 185-219 (1988).
  8. Newbury, D. E. The new X-ray mapping: X-ray spectrum imaging above 100 kHz output count rate with the silicon drift detector. Microsc. Microanal. 12, 26-35 (2006).
  9. Pierson, J., Vos, M., McIntosh, J. R., Peters, P. J. Perspectives on electron cryotomography of vitreous cryo-sections. J. Electron Microsc. 60, S93-S100 (2011).
  10. Pivovarova, N. B., Hongpaisan, J., Andrews, S. B., Friel, D. D. Depolarization-induced mitochondrial Ca accumulation in sympathetic neurons: spatial and temporal characteristics. J. Neurosci. 19, 6372-6384 (1999).
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  13. Stanika, R. I., Winters, C. A., Pivovarova, N. B., Andrews, S. B. Differential NMDA receptor-dependent calcium loading and mitochondrial dysfunction in CA1 vs. CA3 hippocampal neurons. Neurobiol. Dis. 37, 403-411 (2010).
  14. Zhang, P., et al. Direct visualization of receptor arrays in frozen-hydrated sections and plunge-frozen specimens of E. coli engineered to overproduce the hemotaxis receptor Tsr. J. Microsc. 216, 76-83 (2004).

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