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Method Article
Hier beschreiben wir die Methodik zur Ausschaltung eines Gens, das für das Immunsystem von Interesse ist, unter Verwendung von Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/CRISPR-associated endonuclease (Cas9)-basierten Technologien und die Bewertung dieser Mäuse in einem Cluster von Differenzierungs-40 (CD40) agonistischen Antikörper-induzierten Colitis-Modellen.
Das Immunsystem hat die Aufgabe, den Menschen gegen fremde Eindringlinge wie Bakterien und Viren zu verteidigen. Störungen des Immunsystems können jedoch zu Autoimmunität, Entzündungskrankheiten und Krebs führen. Die chronisch entzündlichen Darmerkrankungen (CED) – Morbus Crohn (CD) und Colitis ulcerosa (UC) – sind chronische Erkrankungen, die durch schubförmige Darmentzündungen gekennzeichnet sind. Obwohl IBD in westlichen Ländern am weitesten verbreitet ist (1 von 1.000), steigen die Inzidenzraten weltweit. Durch Assoziationsstudien haben Forscher Hunderte von Genen mit der Pathologie der CED in Verbindung gebracht. Die aufwendige Pathologie hinter der CED und die hohe Anzahl potenzieller Gene stellen jedoch eine große Herausforderung dar, um die besten therapeutischen Ziele zu finden. Darüber hinaus führen die Werkzeuge, die zur funktionellen Charakterisierung jeder genetischen Assoziation erforderlich sind, viele geschwindigkeitsbegrenzende Faktoren ein, wie z. B. die Erzeugung genetisch veränderter Mäuse für jedes Gen. Um das therapeutische Potenzial von Zielgenen zu untersuchen, wurde ein Modellsystem entwickelt, das auf Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)/CRISPR-associated endonuclease (Cas9) basierenden Technologien und einen Cluster von Differenzierungs-40 (CD40) agonistischen Antikörpern verwendet. Die vorliegende Studie zeigt, dass die CRISPR/Cas9-vermittelte Editierung im Immunsystem genutzt werden kann, um den Einfluss von Genen in vivo zu untersuchen. Beschränkt auf das hämatopoetische Kompartiment wird bei diesem Ansatz das resultierende rekonstituierte Immunsystem zuverlässig bearbeitet. CRISPR/Cas9-editierte Mäuse werden schneller erzeugt und sind weitaus kostengünstiger als herkömmliche gentechnisch veränderte Mäuse. Darüber hinaus hat die CRISPR/Cas9-Editierung von Mäusen erhebliche wissenschaftliche Vorteile im Vergleich zur Erzeugung und Zucht genetisch veränderter Mäuse, wie z. B. die Möglichkeit, Ziele zu bewerten, die embryonal letal sind. Unter Verwendung von CD40 als Modellziel im CD40-agonistischen Antikörper-induzierten Colitis-Modell zeigt diese Studie die Machbarkeit dieses Ansatzes.
Autoimmunerkrankungen beziehen sich auf Erkrankungen, bei denen das Immunsystem eines Patienten seine eigenen Zellen und Organe angreift, was zu chronischen Entzündungen und Gewebeschäden führt. Bisher wurden fast 100 verschiedene Arten von Autoimmunerkrankungen beschrieben, von denen 3-5 % der menschlichen Bevölkerung betroffensind 1. Viele der Autoimmunerkrankungen, einschließlich systemischem Lupus erythematodes und CED, haben keine wirksamen Behandlungen und stellen einen erheblichen ungedeckten medizinischen Bedarf dar. CED, von der derzeit allein in den USA rund 1,5 Millionen Menschen betroffen sind, ist eine verheerende Krankheit, die durch eine fortschreitende, anhaltende und schubförmige Darmentzündung gekennzeichnet ist, für die es keine Heilung gibt. Die Entschlüsselung der zugrunde liegenden Pathogenese und Pathophysiologie ist erforderlich, um die neuartigen Behandlungs- und Präventionsstrategien zu entwickeln, die CED-Patienten benötigen 2,3.
Über 230 verschiedene IBD-Loci wurden durch genomweite Assoziationsanalysen (GWAS)4 identifiziert. Obwohl diese Assoziationen neue Gene aufgeklärt haben, die potenziell wichtige Akteure in den Schlüsselmechanismen und -wegen der CED sind, wurden nur wenige Gene aus diesen Loci untersucht. Einige Gene sind an bestimmten Signalwegen beteiligt. Zum Beispiel wurde der Mikroben-Sensing-Weg mit dem Nukleotid-bindenden Oligomerisierungsdomänen-haltigen Protein 2 (NOD2) in Verbindung gebracht; Der Autophagie-Signalweg wurde mit der Autophagie-bezogenen 16 wie 1 (ATG16L1), der immunitätsbezogenen GTPase-Familie M (IRGM) und dem Caspase-Rekrutierungsdomänen-Familienmitglied 9 (CARD9) in Verbindung gebracht; und der entzündungsfördernde Signalweg wurde mit Interleukin (IL)-23-gesteuerten T-Zell-Antworten in Verbindung gebracht4. Verschiedene in vivo Mausmodelle wurden verwendet, um Gene, die durch GWASidentifiziert wurden, funktionell zu charakterisieren 5,6.
Eines der Schlüsselmodelle zur Untersuchung der IBD-Pathogenese 7,8 ist das CD40-Modell der Kolitis, das nach der Injektion eines CD40-agonistischen Antikörpers in immundefiziente (T- und B-Zell-) Mäuse eine angeborene Immun-Darmentzündung induziert. Es ist unklar, ob die Krankheit bei vollständig immunkompetenten Wildtyp-Mäusen (WT) induziert werden kann, um den Beitrag der angeborenen Immunität zur Entwicklung von IBD zu untersuchen, hauptsächlich in Makrophagen und dendritischen Zellen9. Neben Tiermodellen werden auch genspezifische Werkzeuge für die funktionelle Charakterisierung eines Gens benötigt, darunter chemische Verbindungen und Biologika. Noch wichtiger ist, dass genetisch veränderte Tiere für die Aufdeckung der Funktion eines bestimmten Gens unerlässlich sind. Die Strategien, die typischerweise zur Herstellung genetisch veränderter Mäuse - die Injektion und Zucht von Embryonen - verwendet werden, dauern jedoch oft über ein Jahr und verursachen erhebliche finanzielle Kosten. Dieser geschwindigkeitsbegrenzende Prozess stellt eine große Herausforderung dar, um die Funktionen der von GWAS identifizierten IBD-verwandten Gene aufzuklären.
Das hier vorgestellte Protokoll stellt eine praktikable Alternative zur Zucht gentechnisch veränderter Mäuse dar. Zunächst werden, wie in Abbildung 1 gezeigt, Abstammungs-negative, Stammzellantigen1-positive Rezeptor-Tyrosinkinase-Kit-positive (Lineage-Sca1+c-Kit+ oder LSK) Zellen aus dem Knochenmark von Cas9-Knockin (KI)-Mäusen isoliert, die ein spezifisches Allel (CD45.2) tragen, um die Verfolgung von Immunzellen der Spender zu ermöglichen. Als nächstes werden diese Zellen Lentiviren ausgesetzt, die unterschiedliche Guide-RNAs (gRNAs) und einen fluoreszierenden Marker, das violett-angeregte grün fluoreszierende Protein (VexGFP), tragen, um die Verfolgung von transduzierten Zellen zu ermöglichen. Zwei Tage später werden VexGFP+-Zellen sortiert und in letal bestrahlte Ly5.1 Pep Boy-Empfängermäuse injiziert, bei denen es sich um C57Bl/6-Mäuse handelt, die das CD45.1-Allel tragen, um die Verfolgung der Immunzellen des Empfängers zu ermöglichen. Zwölf Wochen später ist das Immunsystem vollständig rekonstituiert, und die Mäuse können in In-vivo-Modelle aufgenommen werden.
Neben dem Vorteil von Kosteneinsparungen und einer schnelleren Zeit bis zur Erzeugung im Vergleich zur Erzeugung und Zucht genetisch veränderter Tiere ist diese Methode ideal für Ziele, die embryonal letal sind, da sie speziell auf das hämatopoetische Kompartiment abzielt. Darüber hinaus bietet dieses System für Ziele, für die keine Werkzeuge wie ein Antikörper zur Verfügung stehen, einen praktikablen Ansatz. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass zur Bewältigung der bisher beschriebenen Herausforderungen eine in vivo CRISPR/Cas9-basierte Genom-Editing-Plattform entwickelt wurde, um schnell genetisch veränderte Tiermodelle zu generieren 10,11,12,13,14. Diese Studie zeigt, dass Darmentzündungen bei WT C57Bl/6 Mäusen durch einen CD40 agonistischen Antikörper induziert werden können. CD40 ist ein Schlüsselregulator der Krankheit in diesem Modell und wurde daher als Modellziel verwendet, um den CRISPR/Cas9-basierten Knockout und den Verlust der Genfunktion zu validieren.
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Alle Tierversuche, die nach diesem Protokoll durchgeführt werden, müssen vom jeweiligen Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) genehmigt werden. Alle hier beschriebenen Verfahren wurden von der AbbVie IACUC genehmigt.
1. Erzeugung der benötigten Lentiviren und Beschaffung von Spender- und Empfängertieren
HINWEIS: Die Materialtabelle enthält Angaben zur Quelle und Bestellnummer für alle Tiere, Instrumente und Reagenzien, die in diesem Protokoll verwendet werden.
2. Knochenmarkentnahme und Vorbereitung für die Zellsortierung
3. Zellsortierung zur Isolierung von LSK-Zellen für die Transduktion
4. LSK-Transduktion und -Kultur zur Erzeugung von Kontroll- und Knockout-Zellen
5. Bestrahlung von Tieren zur Vorbereitung der Transplantation von Spenderstammzellen
6. Zellvorbereitung und Injektion in bestrahlte Empfängertiere
7. CD40-agonistisches Antikörper-induziertes Kolitis-Modell in Wildtyp-Mäusen
HINWEIS: Wiegen und beurteilen Sie die Tiere täglich. Bieten Sie bei Bedarf unterstützende Pflege an: 1,0 ml subkutane Natriumchloridlösung bei 10 % Gewichtsverlust oder wenn sie dehydriert sind. Die Positivkontrolle für dieses Modell ist Anti-p40, das zweimal pro Woche intraperitoneal mit 25 mg/kg verabreicht wird, beginnend am Tag -1.
HINWEIS: In dieser Studie umfassten die Versuchsgruppen die naive Kontrolle, die Fahrzeugkontrolle (Negativkontrolle) und die Anti-p40-Kontrollgruppe (positiv). Zusammen kontrollieren diese Gruppen das normale Verhalten des CD40-agonistischen Antikörper-induzierten Colitis-Modells. Vektor-, SgNone- und SgRNA-Gruppen: Die Vektorkontrollen für den gängigen lentiviralen Vektor, SgNone ist eine verschlüsselte Non-Targeting-Guide-Kontrolle, und die SgRNA-Gruppen sind die "Behandlungs"-Gruppen, die eine verminderte Expression der Ziel-gRNA aufweisen.
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Nach dem oben beschriebenen Verfahren wurden Mäuse erzeugt, die CD40-gerichtete gRNA exprimierten. In Woche 2 wurden B-Zellen, CD11b+-Makrophagen und CD11c+-dendritische Zellen (DCs) transplantiert (Abbildung 2). T-Zellen brauchten jedoch, wie auf der Grundlage früherer Literatur18 erwartet, länger, um vollständig zu transplantieren, und benötigten 12 Wochen nach der Transplantation, um ~90% zu er...
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Die hier gezeigten Ergebnisse stellen eine neuartige CRISPR/Cas9-basierte Genom-Editing-Plattform vor, die in der Lage ist, die Genfunktion in diesem CD40-agonistischen Antikörper-induzierten Kolitis-Modell zu untersuchen. Die Zellsortierung bereicherte den Pool genetisch veränderter LSK-Zellen, was zu einer Reduzierung der CD40-Expression bei den rekonstituierten Tieren um über 90 % führte - in nur 4 Monaten. Darüber hinaus hatte die verminderte Expression von CD40 im Immunsystem e...
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Das Design, die Durchführung der Studie und die finanzielle Unterstützung für diese Forschung wurden von AbbVie zur Verfügung gestellt. AbbVie beteiligte sich an der Interpretation der Daten, der Überprüfung und der Genehmigung der Veröffentlichung. Die Autoren erklären, dass kein Interessenkonflikt besteht.
Vielen Dank an Ruoqi Peng, Donna McCarthy, Jamie Erikson, Liz O'Connor, Robert Dunstan, Susan Westmoreland und Tariq Ghayur für ihre Bemühungen zur Unterstützung dieser Arbeit. Vielen Dank an führende Pharmakologie-Experten wie Rajesh Kamath und andere für ihre Führungsrolle bei der Etablierung des CD40-agonistischen Antikörper-induzierten Kolitis-Modells bei WT C57Bl/6-Mäusen. Darüber hinaus möchten wir uns bei allen Mitarbeitern des AbbVie Bioresearch Center und des Cambridge Research Center in der Abteilung für vergleichende Medizin Ost bedanken, die In-vivo-Experimente unterstützen.
Wir danken dem Zhang-Labor vom Broad Institute und dem McGovern Institute of Brain Research am Massachusetts Institute of Technology für die Bereitstellung von CRISPR-Reagenzien [Multiplex-Genom-Engineering mit CRISPR/Cas-Systemen. Cong, L, Ran, FA, Cox, D, Lin S, Barretto, R, Habib N, Hsu PD, Wu X, Jiang W, Marraffini LA, Zhang F Wissenschaft. 2013 Jan 3].
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
6-well tissue culture plates | Corning/Costar | #3506 | |
TransIT-LT1 | Mirus Bio | MIR 2300/5/6 | |
MACS Buffer (autoMACS Running Buffer) | Miltenyi Biotec | 130-091-221 | |
0.45 µm filter unit | Millipore | #SLHV013SL | |
0.6 mL microcentrifuge Tube | Axygen | MCT-060-C-S | |
1.5 mL Eppendorf Tube | Axygen | MCT-150-C-S | |
15mL Conical | VWR | 21008-918 | |
23 G Needle | VWR | #305145 | |
24 Well Non-TC Plates | Falcon | #351147 | |
24-Well TC Plates | Falcon | #353047 | |
50 mL Conical tube | VWR | 21008-951 | |
5 mL Syringe | BD Biosciences | #309647 | |
70 µm Filter | Miltenyi | #130-098-462 | |
96-Well Flat Bottom Plates | Corning | #3599 | |
96-Well U-Bottom Plates | Corning/Costar | #3365 | |
Anesthesia Machine | VetEquip - COMPAC5 | #901812 | |
Anti-CD40 Agonist monoclonal antibody | BioXcell | BE-0016 | |
Anti-p40 monoclonal antibody | BioXcell | BE-0051 | |
B220 PE Antibody | BioLegend | #103208 | |
Bovine serum albumin | Sigma Aldrich | A7906-100G | |
Cas9 Knock-in Mice | Jackson Labs | #026179 | C57Bl/6 background |
CD117+ Beads | Miltenyi | #130-091-224 | |
CD11b PE Antibody | BioLegend | #101208 | |
CD3 PE Antibody | BD Biosciences | #553240 | |
Centrifuge | Beckman Coulter | Allegra 6KR Centrifuge | |
Countertop Centrifuge | Eppendorf | Centrifuge 5424 | |
DPBS | ThermoFisher | #14190136 | |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium | Mediatech | #10-013-CV | |
Ethylenediamine tetraacetic acid (EDTA) | Invitrogen | AM9260G | |
Endoscope | Karl Storz | N/A | Custom Coloview Tower |
Flow cytometer | BD Biosciences | FACS Aria II | |
Fms-related tyrosine kinase 3 ligand (Flt-L) | PeproTech | #250-31L | |
Gr-1 PE Antibody | BD Biosciences | #553128 | |
Hank's balanced salt solution (HBSS) | ThermoFisher | #14170120 | |
Heat-Inactivated Fetal Bovine Serum | HyClone | #SH30071.03 | |
IL-7 | PeproTech | #217-17 | |
Incubator | Binder | #9040-0116 | |
Isoflurane | HenrySchein | #6679401710 | |
LS Column | Miltenyi | #130-042-041 | |
Ly5.1 Pepboy Mice | Jackson Labs | #002014 | C57Bl/6 background |
mouse stem cell factor (mSCF) | PeproTech | #250-03 | |
Sodium chloride (NaCl) | Hospira | #00409488850 | |
OPTI-MEM serum-free media | Invitrogen | #31985-070 | |
Penicillin-streptomycin (PenStrep) | ThermoFisher | #15140-122 | |
Plate Shaker | ThermoFisher | #88880023 | |
pLentiPuro | Addgene | #52963 | |
Polybrene (10 µg/µL) | Sigma Aldrich | #TR-1003-G | |
Red Blood Cell Lysis Buffer | eBioscience | #00-4333 | |
Retronectin | Takarbio | #T100B | |
Sca-1 APC Antibody | BioLegend | #108112 | |
StemSpan | StemCell Technologies | #09600 | |
Ter119 PE Antibody | eBioscience | #12-5921 | |
Thrombopoietin (TPO) | PeproTech | #315-14 | |
X-ray Irradiator | Precision X-Ray | X-Rad 320 |
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