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JoVE Journal

Neuroscience

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Isolation of Adult Spinal Cord Nuclei for Massively Parallel Single-nucleus RNA Sequencing

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Single-cell RNA sequencing is a powerful tool for studying transcriptional profiles of cells, particularly in heterogeneous tissue, such as the central nervous system. This protocol provides a method for isolating nuclei for single-nucleus RNA seq

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Here, we present a protocol to rapidly isolate high-quality nuclei from the fresh or frozen tissue for downstream massively parallel RNA sequencing. We include detergent-mechanical and hypotonic-mechanical tissue disruption and cell lysis options, both of which can be used for isolation of nuclei.

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