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Aquí, presentamos un protocolo para la detección y cuantificación de moléculas abundantes bajas en soluciones complejas usando molecular imprinting en combinación con un biosensor de capacitancia.
La capacidad para detectar y cuantificar biomoléculas en soluciones complejas siempre ha sido codiciada dentro de la ciencia natural; se utiliza para la detección de biomarcadores, contaminantes y otras moléculas de interés. Una técnica comúnmente utilizada para este propósito es la enzima-ligado del inmunosorbente ensayo (ELISA), donde a menudo un anticuerpo está dirigido hacia una molécula objetivo específico, y un segundo anticuerpo marcado se utiliza para la detección del anticuerpo primario, permitiendo la cuantificación absoluta de la biomolécula bajo estudio. Sin embargo, el uso de anticuerpos como elementos de reconocimiento limita la robustez del método; como la necesidad de la utilización de moléculas marcadas. Para superar estas limitaciones, se ha implementado impresión molecular, creación de sitios de reconocimiento artificial complementaria a la molécula de la plantilla y obsoleting la necesidad del uso de anticuerpos para el enlace inicial. Además, para mayor sensibilidad, el anticuerpo secundario marcado puede reemplazarse por biosensores confiando en la capacidad para la cuantificación de la molécula objetivo. En este protocolo, se describe un método para rápidamente y sin etiqueta de detectar y cuantificar biomoléculas baja abundante (virus y proteínas) en muestras complejas, con una sensibilidad que es significativamente mejor que los sistemas de detección utilizados como el ELISA. Todo esto es mediado por impresión molecular en combinación con un biosensor de capacitancia.
La cuantificación de biomoléculas se utiliza en muchos campos de investigación dentro de la ciencia, empleando métodos como el radioinmunoanálisis (RIA) o ELISA1. Algunos de estos métodos requieren un etiquetado reactivo como un radioisótopo o enzima marcado antígeno anticuerpo, que hace que requieren mucho trabajo y tiempo con procedimientos complejos2. Además, la robustez, la selectividad y la sensibilidad de estos métodos no son suficientes para todos los análisis; en particular no son suficientes cuando nanogramo cantidades necesitan ser analizados, en lugar de pictograma cantidades3. Para ello, biosensores han ganado considerable interés4,5, en particular en combinación con impresión molecular para una mayor robustez.
Impresión molecular se basa en la creación de cavidades polimerizando monómeros funcionales alrededor de la plantilla6, creación de sitios de reconocimiento artificial que recuerdan perfectamente a la plantilla7. Esta técnica se ha utilizado para varias aplicaciones, incluyendo sistemas de entrega de fármacos y la separación analítica, sino también como elementos de bioreconocimiento en biosensores8,9,10. Sin embargo, todavía hay algunas dificultades en el diseño de polímeros molecularmente impresos (MIPs) para las plantillas de macromoléculas como proteínas y células de11,12. Debido a esto, muchos investigadores se han centrado en impresión la proteína de la plantilla directamente sobre un substrato, creando así una superficie que será reconocida por la proteína blanco del12. Esta técnica de recubrimiento utilizada para emplear las cavidades reconocimiento asambleas incluyendo proteínas y grandes moléculas se llama capas impresión13,14. El procedimiento general del método depende de la polimerización entre dos superficies - un sello de plantilla y un soporte de polímero - que la plantilla es adsorbida sobre una superficie de15,16y en contacto con el superficie tratada con monómero. De esta forma, se forma una película delgada de polímero sobre el soporte mediante polimerización UV. Finalmente, se retira la plantilla, dejando cavidades específicas de plantilla en la superficie del electrodo impreso. Este método tiene algunas ventajas como una pérdida de la actividad reducida de la molécula del impresa, así como que requiere cantidades muy pequeñas de moléculas de plantilla para la impresión de procesan16,17. Así, se pueden crear estas superficies rentables, estables, sensibles y selectivas en la superficie del sensor, dirigidos a cualquier plantilla de elección del usuario.
El biosensor se puede utilizar para la detección de proteínas solo y biomacromoléculas mucho más grandes, incluyendo virus. Un grupo específico de virus ganando interés reciente es el bacteriófago, que es un virus que infecta bacterias. Detección rápida y sensible de los bacteriófagos es importante durante biotecnológica y biofarmacéutica procesos para determinar las infecciones de los cultivos bacterianos con bacteriófagos18. El ensayo biológico más utilizado para la detección de bacteriófagos es el método de agar de doble capa de19, que es laborioso y consume tiempo. Se hicieron varios intentos para desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico para virus (incluidos los bacteriófagos) como fuerza atómica (AFM) la microscopia20, interferometría21, electroquímica22sensor sistema23, 24. mucho trabajo se ha centrado en biosensores debido a sus ventajas como ser fáciles de operar, muy sensible y capaz de medición en tiempo real15,25. Un tipo específico de biosensor se basa en cambios en la capacitancia. Estos biosensores capacitivos son los sensores electroquímicos que medir los cambios en las propiedades del dieléctricas cuando un analito se interactúa con un elemento de biorreconocimiento sobre la superficie del sensor, causando una disminución en la capacitancia2,4 . Capacitivas biosensores se han utilizado para la detección de varios analitos como antígenos, anticuerpos, proteínas, metales pesados iones6,26,27,28. Estos tipos de biosensores tienen muchas ventajas como la rapidez inherente, alta sensibilidad, simplicidad, bajo costo, fácil manipulación y medición en tiempo real sin etiquetado29.
El método descrito en este documento está dirigido a permitir la detección y cuantificación de biomoléculas baja abundante en muestras muy complejas, sin la necesidad de utilizar ningún etiquetado. En particular, la técnica es más útil en el rango del picogramo atto de biomoléculas, donde otros instrumentos comercialmente existentes fallan cuantificar con precisión su objetivo.
1. modificación de la cubierta de cristal desliza (plantilla de estampillas)
2. modificación de electrodos de oro capacitivos
3. elaboración de plantilla impresa capacitivos electrodos de oro
4. Caracterización de la superficie del electrodo con microscopía electrónica de barrido (SEM)
5. en tiempo real medidas capacitivas con plantilla imprimen capacitivos electrodos de oro
Siguiendo el protocolo, según el esquema en la figura 1, un electrodo de oro desnudo a ser impreso con una plantilla, que representa la estructura de un biomacromolecule. Este electrodo se puede aplicar en un biosensor capacitivo (figura 2), permitiendo la aplicación estable de una plantilla sobre el electrodo y la medición de los cambios en capacitancia sobre la Unión de la plantilla.
Una representación esquemática del biosensor capacitiva se muestra en la figura 2. La bomba de centris, que se encarga de inyección continua del corriente tampón (fosfato 10 mM, pH 7,4) y el búfer de regeneración (glicina-HCl 25 mM, pH 2.5) durante la regeneración en la célula de flujo, puede verse claramente en la figura. La célula de flujo consiste en trabajo, referencia y electrodos de contador. La válvula de inyección se compone de soluciones estándar de la proteína/del bacteriófago, que pasan por el desgaseador primero y luego se inyectan secuencialmente en el sistema. En cuanto a las soluciones de alcanzan el electrodo de trabajo insertado en la celda de flujo, el resultado es monitoreado en tiempo real. Los valores de capacitancia pueden ser registrados siguiendo el sensorgrams en la pantalla del ordenador.
Figura 3 y figura 4 representan las diferencias entre la superficie de electrodos de oro desnudos e impresos. Este paso de caracterización es importante garantizar que existen cavidades poliméricas, vistas como rugosidad en la superficie del electrodo después de impresión. Aparte de SEM, también hay otros métodos de caracterización como AFM, mediciones del ángulo de contacto, Elipsometría, etc., que pueden utilizarse para caracterizar la superficie después de la impresión. De esta forma, se puede asegurar que el proceso de impresión es acertado y que las cavidades de la plantilla se forman en la superficie. Dentro de estas cavidades, puede enlazar la plantilla con afinidad y especificidad alta.
Después de la inyección de las soluciones estándar en el sistema capacitivo, un promedio de las cinco últimas lecturas fue calculado automáticamente por el software, y se obtuvieron las gráficas de calibración trazando el cambio en capacitancia vs la concentración de la analito. La disminución de la capacitancia registrada surgió de la Unión de la plantilla. El más moléculas que se unen al electrodo de oro superficial, cuanto mayor sea la reducción de la capacidad total, según el principio general de medición capacitiva. Figura 5 y figura 6 muestran que con el aumento de concentración del analito, la ΔC aumenta como se esperaba. El rango dinámico (entre los cuales es el intervalo de concentraciones donde el sistema es útil para la detección de un objetivo específico) y el límite de detección (LOD) pueden ser evaluados mediante el análisis de estos gráficos. Según la figura 6, el biosensor capacitiva bacteriófago impreso puede detectar bacteriófagos en el rango de concentración de 101 - 105 pfu/mL, con un valor LOD de 10 pfu/mL en este estudio. Figura 5 y figura 6 también destaca la necesidad de medir la curva de calibración en el mismo intervalo requerido para la concentración de la plantilla se supone, puesto que la linealidad de la regresión puede variar con las concentraciones ( Figura 5), o tienen diferentes pendientes (figura 6). También hay que señalar que debido a las bajas concentraciones utilizado, el sistema es muy sensible a las fluctuaciones (turbidez en la muestra, guinda, etc.), y por lo tanto, se recomienda realizar por lo menos triplicado para reducir la posibilidad de incluir valores atípicos . Por la misma razón, la desviación estándar puede ser bastante significativa para las muestras muy diluidas, como se ve en la figura 6.
Figura 1 . Representación esquemática de las capas de impresión método. (A) preparación de los cubreobjetos de vidrio (estampillas de plantilla), (B) preparación de los electrodos capacitivos de oro, impresión de capas (C) de la plantilla sobre la superficie del electrodo de oro mediante polimerización UV y (D) retiro de plantilla de la superficie del electrodo (reproducido de Ertürk et al., biotecnología informes 2014 (3): 65-72 con permiso). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2. Representación esquemática del biosensor capacitivo. La disposición general del biosensor capacitivo utilizado en este estudio (reproducido de Ertürk et al., biotecnología informes 2014 (3): 65-72 con permiso). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 3. Microscopía electrónica de la proteína impresos electrodos. Imágenes de SEM de (A) un electrodo desnudo de oro (barra de escala = 20 μm), y (B) una proteína impreso Electrodo capacitivo de oro (barra de escala = 10 μm). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 4. Microscopía electrónica del bacteriófago impresos electrodos. Imágenes de SEM de un electrodo desnudo de oro (barra de escala = 20 μm) (A), y grabada de un bacteriófago Electrodo capacitivo de oro en diferentes aumentos (6600 x, barra de escala = 10 μm) (B) y 11, 500 X, escala de la barra = 5 μm) (C); las flechas denotan bacteriófagos adheridos). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 5. Efecto de la composición del tampón para gráficos de calibración. Curva de calibración que muestra el cambio en capacitancia vs concentración de proteína en condiciones óptimas (almacenador intermediario de funcionamiento: 50 mM Tris-HCl, pH 7,4; Búfer de regeneración: 25 mM glicina-HCl, pH 2.5 incluyendo 50 mM Tween-20; Caudal: 100 μl/min, volumen de muestra: 250 μl; T: 25 ° C). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 6. Curva de calibración representativos para grandes biomacromoléculas. Curva de calibración que muestra el cambio en capacitancia vs concentración de bacteriófago en óptimas condiciones (almacenador intermediario de funcionamiento: 10 mM fosfato, pH 7,4; Búfer de regeneración: 25 mM glicina-HCl, pH 2.5 incluyendo 50 mM Tween-20; Caudal: 100 μl/min, volumen de muestra: 250 μl; T: 25 ° C) por favor haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Cuando este método se lleva a cabo, hay algunos pasos críticos que deben ser considerados siguiendo el protocolo. Un paso crítico es el paso de limpieza con solución ácida de piraña. Paso 2.1 debe no ser más de 10 minutos. La solución de la plantilla de paso 1.4 no debe exceder 0,1 mg/mL, ya que estos valores se han optimizado previamente. Análisis cíclico voltametric no deben exceder 15 ciclos para obtener el grueso óptimo. Paso 3.1.3, 1,5 μl es un valor optimizado. Este valor no debe ser mayor para este tipo de electrodo. Si el sistema de curado de UV tiene una potencia de 400 W, la polimerización debe realizarse por un máximo de 10-15 minutos. Tan pronto como el APS (iniciador) se agrega a la solución después de TEMED, el paso posterior se debe realizar muy rápidamente para evitar la polimerización inmediata (paso 3.2.5).
Uno de los pasos más importantes es la eliminación de la estampilla de la plantilla de la superficie después de la polimerización UV. Si este paso no se realiza correctamente, existe el riesgo de que la película polimérica en la superficie del electrodo puede ser eliminado con el sello. Por lo tanto, se recomienda sumergir el electrodo y el sello de la proteína en la parte superior en una solución de agua después de la polimerización, a continuación, retire el sello muy lentamente y con cuidado la superficie (paso 3.1.6).
Basado en la plantilla utilizada, modificaciones en el tipo y la proporción de monómeros utilizados (monómero funcional y vinculante) pueden evaluarse en términos de generar mayor sensibilidad. Esto debe determinarse empíricamente. Además, la afinidad de unión de la molécula de la plantilla generalmente implica varias interacciones diferentes simultáneamente. Por lo tanto, esto puede llevar a problemas durante los pasos de regeneración. Si la plantilla dependiente no se suelta de la superficie correctamente, esto puede influir en la reutilización del electrodo para su posterior análisis. Estas afinidades multipuntos también pueden resultar del enlace a través de las interacciones más débiles. En tales sistemas, fijación no específica puede tener lugar, que puede influir negativamente en la selectividad del sistema16. Estas son comunes y generales, limitaciones del método.
Aparte de estas limitaciones específicas, hay muchas ventajas importantes del método discutido sobre los métodos existentes. Mientras que la medición fluorométrica, RIAs y ELISA es muy sensibles, requieren el uso de material marcado (plantilla o detector), mientras que el biosensor es totalmente etiqueta libre. Estos métodos también son más costosos y lentos. Un biosensor permite síntesis rápida y paralela de MIPs en diversas composiciones en el mismo tiempo16. Ya que sólo unos pocos microlitros de solución de monómero se requiere para la preparación, el método es conveniente cuando se utiliza monómeros limitadas caros o no. Electrodos de MIP más, solos pueden utilizarse para aproximadamente 80 análisis sin una disminución significativa en el rendimiento, que es significativamente mayor que otros de los métodos existentes30. Los métodos existentes también sufren, en diversos grados, de baja sensibilidad y selectividad, mientras que el método descrito permite la detección y cuantificación de moléculas en el rango de pM con alta selectividad.
Debido a la rentabilidad, la facilidad de operación del instrumento y la detección sensible en tiempo real en un corto tiempo en comparación con los métodos existentes, los biosensores son muy prometedor punto de sistemas de detección de cuidado bajo condiciones de campo; por ejemplo, para monitoreo del medio ambiente y para aplicaciones en los países en desarrollo. En muchas aplicaciones en el diagnóstico de la enfermedad, la detección en tiempo real, sensible, selectiva y rápida de un biomarcador en una mezcla compleja como suero es necesario15,25. Aquí, biosensores son superiores a los métodos existentes, en particular, debido a su robustez y sensibilidad. Específicamente para la detección de agentes infecciosos, bacteriófagos son considerados recientemente como elemento de biorreconocimiento alternativos para biosensores debido a su anfitrión bacterias especificidad33,34,35. Reemplazo de anticuerpos con bacteriófagos es muy prometedor para reducir el costo y aumentar la estabilidad aún más36. Este sistema permitirá también la detección y cuantificación de fagos específicos en el medio ambiente y de muestras clínicas. Debido a la prevalencia de bacteriófagos y su capacidad de transducir las bacterias con genes de resistencia a los antibióticos37,38, este método puede ser valioso estudiar la propagación de bacterias resistentes.
Los autores no tienen nada que revelar.
María Baumgarten (IQ plataforma de biotecnología, infección de medicina, Universidad de Lund) es reconocido por realizar y brindar análisis de micrografías. Este trabajo fue apoyado por subvenciones de investigación sueco el Consejo Formas (2017-00100) como parte de la tercera articulación programación iniciativa europea llamada resistencia antimicrobiana (JPIAMR) "Dinámica de transmisión". Los fundadores no tenían ningún papel en el diseño del estudio, interpretación, escritura, preparación del manuscrito, la decisión de presentar o toma de decisiones para publicar el trabajo.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Glass Cover slips | ThermoFisher | 102222 | protein stamp |
HCl | Sigma-Aldrich | H1758-500ML | cleaning |
NaOH | Sigma-Aldrich | 72068-100ML | cleaning |
Ultrasonic cleaner | Branson Ultrasonic | BRANSONIC M1800- E | cleaning |
3-amino-propyl-triethoxysilane (APTES) | Sigma-Aldrich | A3648-100ML | modification |
EtOH | Sigma-Aldrich | 1009836010 | rinsing/cleaning |
glutaraldehyde | Sigma-Aldrich | G5882-100ML | cross-linker |
acetone | Sigma-Aldrich | 34850-1L-M | cleaning |
H2SO4 | Sigma-Aldrich | 339741-100ML | piranha solution |
H2O2 | Sigma-Aldrich | H1009-500ML | piranha solution |
tyramine | Sigma-Aldrich | T90344-5G | modification |
CompactStat | Ivium Technologies | CompactStat.h: 30mA@10V/3MHz | potentiostat |
Platinum Counter Electrode Kit | Equilabrium | AFCTR5 | potentiostat |
Reference Electrode | Equilabrium | RREF0021 | potentiostat |
acryloyl chloride | EMD Millipore | 8.00826.0100 | modification |
triethylamine | EMD Millipore | 8.08352.0100 | modification |
toluene | Sigma-Aldrich | 244511-100ML | modification |
N-hydroxymethyl acrylamide | Sigma-Aldrich | 245801-100G | functional monomer |
poly ethylene glycol-400-dimethacrylate | Sigma-Aldrich | 409510-250ML | cross-linker |
2-Hydroxy-4′-(2-hydroxyethoxy)-2-methylpropiophenone | Sigma-Aldrich | 410896-50G | functional monomer |
UV polymerizator | Dymax | Dymax 5000ECE | UV-polymerization |
forceps | Sigma-Aldrich | Z168777-1EA | consumable |
1-dodecanethiol | Sigma-Aldrich | 471364-100ML | blocking agent |
acrylamide | Sigma-Aldrich | A3553-100G | functional monomer |
N-hydroxymethylacrylamide | Sigma-Aldrich | 245801-100G | functional monomer |
N-isopropylacrylamide | Sigma-Aldrich | 415324-50G | functional monomer |
methylenebisacrylamide | Sigma-Aldrich | 146072-500G | cross-linking monomer |
N,N,N',N'-tetrametyhlethyldiamine (TEMED) | Sigma-Aldrich | T9281-25ML | catalyst |
ammonium persulphate | Sigma-Aldrich | A3678-25G | initiator |
Capacitive biosensor | CapSenze | Equipment | |
Glycine | Merck | 1042011000 | regeneration buffer |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P9416-50ML | regeneration buffer |
Trizma base | Sigma-Aldrich | 93352-1KG | running buffer |
Na2HPO4 • 2H2O | Calbiochem | 567547-1KG | running buffer |
NaH2PO4 • 2H2O | Calbiochem | 567549-1KG | running buffer |
DELPHI correlative light and electron microscope | Phenom-World | equipment | |
Capacitive gold electrodes | CapSenze Biosystems | consumables | |
2,2'-azobis(2-methypropionitrile) | Sigma-Aldrich | 441090-25G | photo-initiator |
CapSenze Smart Software | CapSenze Biosystems | software program |
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