Method Article
여기, 선물이 커패시턴스 바이오 센서와 함께에서 각 인 분자를 사용 하 여 복잡 한 솔루션에서 검색 및 낮은 풍부한 분자의 정량화에 대 한 프로토콜.
감지 하 여 복잡 한 솔루션에 쓰이므로 quantitate 능력 항상 자연 과학; 내에서 매우 인기 있다 생체, 오염 물질, 그리고 관심의 다른 분자의 탐지를 위해 사용 되 고. 이 목적을 위해 일반적으로 사용 되는 기술 되는 효소 연결 된 Immunosorbent 분석 결과 (ELISA), 어디 자주 한 항 체는 특정 대상 분자 향해 이동 하 고 기본 항 체의 검출에 사용 되는 두 번째 레이블이 항 체, 수은 연구 biomolecule의 절대 정량화입니다. 그러나, 인식 요소 항 체의 사용 제한 방법;의 견고성 사용 하 여 필요 마찬가지로 분자 분류. 이러한 한계를 극복 하기 위해 분자 각 인 구현 되었습니다, 인공 인식 사이트 템플릿 분자를 보완 만들고 obsoleting 초기 바인딩에 대 한 항 체를 사용 하 여의 필요성. 또한, 더 높은 감도 위한 보조 분류 항 체 바이오 센서는 대상 분자의 정량화에 대 한 커패시턴스에 의존 하 여 교체할 수 있습니다. 이 프로토콜에서 우리 감지 하 여 신속 하 고 레이블 없는 감도 크게는 ELISA 등 일반적으로 사용된 탐지 시스템 보다 더 복잡 한 샘플에 낮은 풍부한 생체 (단백질과 바이러스)을 quantitate 메서드를 설명 합니다. 이 모든 커패시턴스 바이오 센서와 함께에서 분자 각 인에 의해 중재 됩니다.
생체의 정량화는 과학, 방사 면역 검정 법 (RIA) 또는 ELISA1같은 방법을 채용 시간 많은 다른 연구 분야에 사용 됩니다. 이러한 방법 중 일부는 레이블이 필요 방사성 또는 효소 시 약 분류 항 체/항 원, 노동 집약 및 복잡 한 절차2시간이 걸리는 게. 또한, 이러한 방법의 감도, 선택도, 견고성 충분 하지 않습니다 모든 분석; 특히 그들은 충분 하지 않습니다 attogram 수량 그림 수량3보다 분석할 필요가 있을 때. 이 위해 바이오 센서 얻고 있다 상당한 관심4,5, 특히 증가 된 견고성에 대 한 분자 각 인와 함께.
분자 각 인 polymerizing 템플릿6, 인공 인식 있는 사이트를 만드는 템플릿을7을 완벽 하 게 닮은 주위 기능 단위체에 의해 구멍을 만드는 방법에 의존 합니다. 이 기술은 바이오 센서8,,910biorecognition 요소 뿐만 아니라 여러 응용 프로그램, 약물 전달 시스템 등 분석 분리 사용 되었습니다. 그러나, 여전히 분자로 각 인된 고분자 (MIPs) 단백질 및 세포11,12같은 고분자 서식 파일의 디자인에 몇 가지 문제가 있습니다. 이 때문에, 많은 연구 자들은 따라서 대상 단백질12에 의해 인식 될 것 이다 표면 만드는 템플릿 단백질을 기판에 직접 각 인에 집중 했다. 큰 분자와 단백질을 포함 하는 어셈블리에 대 한 인식의 구멍을 고용에 대 한 사용이 표면 코팅 기술 microcontact13,14각 인 이라고 합니다. 두 표면 사이-서식 파일 스탬프와 고분자 지원-는 템플릿이 한 표면15,16, 흡착 및 접촉으로 가져 중 합에 따라 방법의 일반적인 절차는 단량체 처리 표면입니다. 이 방법으로 얇은 폴리머 필름 UV 중 합을 통해 지원에 형성 된다. 마지막으로, 서식 파일 제거 됩니다, 템플릿 찍힌된 전극의 표면에 특정 구멍 뒤에 남겨두고. 이 메서드는 일부 장점 찍힌된 분자의 감소 활동의 손실을 포함 한, 뿐만 아니라 필요한 매우 작은 양의 템플릿 분자는 각 인에 대 한 처리16,17. 따라서, 사용자의 선택의 어떤 템플릿을 대상으로 하는 센서 표면에 이러한 비용, 안정, 민감한, 그리고 선택적 서피스를 만들 수 있습니다.
바이오 센서는 단일 단백질 및 훨씬 더 큰 biomacromolecules, 바이러스 등의 검출에 대 한 사용할 수 있습니다. 최근 관심을 얻고 바이러스의 특정 그룹은 살 균 소는 박테리아를 감염 시키는 바이러스 이다. 살 균 소의 신속 하 고 중요 한 발견은 바이오 동안 중요 한 세균성 문화 살 균 소18의 감염을 결정 하기 위하여 의약품 프로세스. 살 균 소 검출에 대 한 가장 일반적으로 사용 되 생물 학적 분석 결과 더블 레이어 agar 방법19, 힘들고 시간이 소요. 원자 힘 현미경 (AFM)20, 간섭계21,22, 전기 화학 센서 시스템23, 등 여러 시도 바이러스 (살 균 소 포함)에 대 한 새로운 진단 도구 개발 되었습니다. 24. 일을 많이 하 고 운영 하 게 쉬운, 매우 민감한 실시간 측정15,25의 능력으로 그들의 이점 때문에 바이오 센서에 집중 되었습니다. 특정 유형의 바이오 센서 커패시턴스에서 변화를 기반으로 합니다. 이러한 용량 성 바이오 센서는 변화를 측정 하는 전기 화학 센서 유 전체 속성에는 분석 센서 표면에 biorecognition 요소와 상호 작용 하 때 일으키는 커패시턴스2,4 감소 . 용량 성 바이오 센서는 항 원, 항 체, 단백질, 및 중 금속 이온6,26,,2728같은 다양 한 analytes의 탐지를 위해 이용 되었다. 이러한 종류의 바이오 센서는29라벨 없이 고유의 속도, 높은 감도, 단순, 저렴 한 비용, 쉬운 조작, 그리고 실시간 측정 같은 많은 이점이 있다.
여기에 설명 된 방법은 탐지 및 정량화 어떤 라벨을 사용 하 여 필요 없이 매우 복잡 한 샘플에 낮은 풍부한 생체의 목적 이다. 특히, 기술은 다른 상업적으로 기존 악기를 정확 하 게 그들의 목표를 quantitate 실패 쓰이므로, atto picogram 범위의 가장 유용 하다.
1. 수정 유리 커버의 전표 (템플릿 우표)
2입니다. 용량 성 금 전극의 수정
3. 준비 서식 파일의 각 용량 성 금 전극
4. 전극 표면 스캐닝 전자 현미경 (SEM)의 특성
5. 실시간 용량 측정 서식 파일을 각 용량 성 금 전극
그림 1, 회로도 따라 프로토콜에 따라 맨 골드 전극은 biomacromolecule의 구조를 나타내는 서식 파일 각 인 것 이다. 이 전극은 용량 성 바이오 센서 (그림 2) 커패시턴스는 서식 파일의 바인딩 시에 전극에 서식 파일의 안정적인 응용 프로그램 및 변화의 측정을 허용에 적용할 수 있습니다.
용량 성 바이오 센서의 도식 대표는 그림 2에 표시 됩니다. 흐름 세포로 재생 하는 동안 실행 중인 버퍼 (10 m m 인산 염, pH 7.4), 그리고 재생 버퍼 (25 m m 글리신-HCl, pH 2.5)의 연속 주입에 대 한 책임 centris 펌프는 그림에서 명확 하 게 볼 수 있습니다. 작업, 기준, 및 카운터 전극 흐름 셀에 의하여 이루어져 있다. 분사 밸브는 degasser 먼저 통과 표준 단백질/살 균 소 솔루션의 구성 후 시스템에 순차적으로 주입 하는 고. 최대한 빨리 솔루션 흐름 셀에 삽입 된 작업 전극에 도달, 결과 실시간으로 모니터링 됩니다. 커패시턴스 값은 컴퓨터 화면에는 sensorgrams에 따라 등록할 수 있습니다.
그림 3 및 그림 4 베어와 찍힌 골드 전극의 표면 사이의 차이 묘사. 이 특성화 단계는 각 인 후에 전극의 표면 거칠기로 본 고분자 충 치 확인 해야 합니다. 떨어져 SEM, AFM, 접촉 각 측정를 포함 하 여 다른 특성화 방법 있다 ellipsometry 등, 각 인 후 표면 특성을 사용할 수 있습니다. 이 방법으로 그것 수 지켜질 각 인 과정은 성공 하 고 템플릿 구멍 표면에 형성 된다. 이러한 충 치 내에서 서식 파일은 높은 특이성 및 선호도 바인딩할 수 있습니다.
지난 5 읽기의 평균 소프트웨어에 의해 자동으로 계산 된 용량 성 시스템에 표준 솔루션을 주입 후 고 캘리브레이션 그래프의 농도 대 용량 변화를 그려서 가져온는 분석입니다. 등록 된 커패시턴스에서 감소는 서식 파일의 바인딩에서 일어났다. 골드 전극에 바인딩되는 더 분자 표면, 높은 총 커패시턴스에서 감소 용량 측정의 일반적인 원칙에 따라. 그림 5 와 그림 6 그는 분석의 농도 증가 ΔC 증가 예상 대로 표시. (는 시스템은 특정 대상의 검출에 대 한 유용한 농도 범위는) 동적 범위와 감지 (LOD)의 한계는 이러한 그래프를 분석 하 여 평가할 수 있습니다. 그림 6에 따라 살 균 소 각 용량 성 바이오 센서 10의 농도 범위에서 살 균 소 감지할 수1 -105 pfu/mL,이 연구에서 10 pfu/mL의 LOD 값. 그림 5 와 그림 6 도 같은 간격에 보정 곡선을 측정의 필요성 강조 서식 파일 농도에 필요한 가정, 선형 회귀의 농도 ( 에 다를 수 있습니다 이후 그림 5), 또는 다른 슬로프 (그림 6). 또한 주목 해야 한다는 낮은 농도 사용, 시스템 변동 (샘플, 공기 초안, 등탁도), 매우 민감한 이며 따라서, 적어도 실행 되도록 것이 좋습니다 포함 outliers의 가능성을 줄이기 위해 triplicates . 그림 6에서 보듯이 같은 이유로 표준 편차는 매우 희석된 샘플에 대 한 매우 중요 한 수 있습니다.
그림 1 . Microcontact 메서드를 각 인 도식 표현. 유리 커버 전표 (템플릿 우표)의 (A) 준비 (B) 준비 용량 성 금 전극의 UV 중 합, 및 (D)를 통해 금 전극 표면에 서식 파일의 (C) microcontact 각 인 전극 표면에서 서식 파일의 제거 (Ertürk 외., 생명 공학 보고서 2014 (3)에서 재현: 허가 65-72). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 2. 용량 성 바이오 센서의 도식 대표. 이 연구에 사용 된 용량 성 바이오 센서의 일반적인 레이아웃 (Ertürk 외., 생명 공학 보고서 2014 (3)에서 재현: 허가 65-72). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 3. 단백질의 전자 현미경 스캐닝 각 전극 인. (A) 맨 골드 전극의 SEM 이미지 (눈금 막대 = 20 µ m), 그리고 (B)는 단백질 각 용량 성 금 전극 (눈금 막대 = 10 µ m). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 4. 살 균 소의 전자 현미경 스캐닝 각 전극 인. 맨 골드 전극의 SEM 이미지 (눈금 막대 = 20 µ m) (A), 그리고는 살 균 소 각 용량 성 금 전극 다른 배율 (x, 눈금 막대 6600 = 10 µ m) (B), 11, 500 X, 규모 및 바 = 5 µ m) (C); 화살표 표시 준수 살 균 소). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 5. 교정 그래프에 대 한 버퍼 구성의 효과. 최적의 조건에서 단백질 농도 대 커패시턴스에서 변화를 보여주는 캘리브레이션 그래프 (실행 버퍼: 50 mM Tris HCl, pH 7.4; 재생 버퍼: 25mm 글리신-HCl, pH 2.5 포함 50 m m 트윈-20; 유량: 100 µ L/min, 샘플 볼륨: 250 µ L; T: 25 ° C)입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 6. 큰 biomacromolecules에 대 한 대표적인 보정 곡선. 최적의 조건에서 살 균 소 농도 대 커패시턴스에서 변화를 보여 주는 교정 그래프 (실행 버퍼: 10 m m 인산 염, pH 7.4; 재생 버퍼: 25mm 글리신-HCl, pH 2.5 포함 50 m m 트윈-20; 유량: 100 µ L/min, 샘플 볼륨: 250 µ L; T: 25 ° C) 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
이 방법을 실시 하는 경우 프로토콜을 수행 하는 동안 고려 되어야 하는 몇 가지 중요 한 단계가 있다. 하나의 중요 한 단계는 산 성 피 솔루션 청소 단계가 이다. 2.1 단계는 10 분 이상 되지 않아야 합니다. 이러한 값 이전 최적화 되어 이후 단계 1.4 서식 파일 솔루션 0.1 mg/mL을 초과 해서는 안. 최적의 두께 얻기 위해 순환 voltametric 검사 15 사이클을 초과 해서는 안. 3.1.3 단계 1.5 µ L 최적화 된 값입니다. 이 값이 특정 유형의 전극에 대 한 높은 되지 않아야 합니다. UV 경화 시스템 400 W의 파워를 가지는 중 합 10 ~ 15 분의 최대 수행 합니다. APS (초기자) TEMED 후 솔루션에 추가 되 자 마자 다음 단계 즉각적인 중 합 (3.2.5 단계)를 피하기 위해 매우 신속 하 게 수행 되어야 합니다.
가장 중요 한 단계 중 하나는 자외선 중 합 후 템플릿 스탬프 표면에서의 제거 이다. 전극의 표면에 고분자 필름 수 있는 위험이 있다이 단계를 제대로 수행 되지 않습니다 경우 스탬프와 제거. 따라서, 중 합, 후 전극 및 물 해결책에서 위에 단백질 스탬프를 담가 다음 (단계 3.1.6) 표면에서 아주 천천히 그리고 신중 하 게 스탬프를 제거 하는 것이 좋습니다.
사용 하는 서식 파일을 기반으로, 수정 유형 및 단위체 사용 (기능 단위체와 cross-linker)의 비율에 생성 하는 높은 감도 점에서 평가 될 수 있습니다. 이 실험적으로 결정 되어야 합니다. 또한, 일반적으로 서식 파일 분자에의 선호도 바인딩을 포함 동시에 여러 다른 상호 작용을 한다. 따라서,이 문제 재생 단계 동안 발생할 수 있습니다. 바인딩된 서식 파일 표면에서 제대로 해제 되지 않습니다, 경우 추가 분석을 위해 전극의 재사용 영향을 미칠 수 있습니다이. 이러한 멀티 선호도 또한 약한 상호 작용을 통해 바인딩에서 발생할 수 있습니다. 이러한 시스템에서 일반적인 바인딩 시스템16의 선택도 부정적인 영향을 미칠 수 있는 장소를 걸릴 수 있습니다. 이러한 방법의 일반적인, 그리고 일반, 제한이 있습니다.
이러한 특정 제한 외에도 기존 방법에 비해 논의 방법의 많은 중요 한 이점이 있다. 리아스식, ELISAs, 및 fluorometric 측정은 매우 민감합니다, 그들은 레이블된 자료 (서식 파일 또는 검출기)의 사용은 바이오 센서는 완전히 레이블 없는 필요 합니다. 이 메서드는 또한 더 비싼 및 시간이 걸리는. 바이오 센서 접근 동일한 시간16에 다른 작곡에 MIPs의 급속 하 고, 병렬 합성 수 있습니다. 단지 약간 microliters 단위체 솔루션의 준비를 위한 필요 때문에, 비싼 또는 기타 제한 된 단위체를 사용 하는 경우 메서드를 사용 하면 편리 하다. 또한, 단일 성능 측정 전극30다른 기존의 방법 보다 훨씬 높은 성능에 큰 감소 없이 약 80 분석에 대 한 사용할 수 있습니다. 기존의 방법 또한 고통, 낮은 감도 선택도의 다양 한 각도에서 설명한 메서드를 사용 하면 검출 및 정량화 오후 범위에 분자의 높은 선택도를.
비용 효율성, 악기, 그리고 기존의 방법에 비해 짧은 시간에 민감한 실시간 감지 작동의 용이성 때문에 바이오 센서는 매우 유망한 포인트의 케어 탐지 시스템 필드 조건; 예를 들어, 환경 모니터링 및 응용 프로그램 개발 도상국. 질병의 진단에서 많은 응용 프로그램에서의 혈 청 등 복잡 한 혼합물에서 바이오 마커 실시간, 민감한, 선택, 및 급속 한 탐지 필요한15,25입니다. 여기, 바이오 센서의 견고성 및 감도 기존의 방법, 특히, 보다 우량 하다. 전염 성 요원의 탐지를 위해 특히 살 균 소는 최근 그들의 호스트 박테리아 특이성33,,3435인 바이오 센서에 대 한 대체 biorecognition 요소로 간주 됩니다. 살 균 소와 항 체의 교체 비용을 절감 하 고 안정성 더욱36증가 매우 유망 하다. 이러한 시스템은 또한 검색 및 환경에 및 임상 견본에서 특정 페이지의 정량화에 허용 됩니다. 살 균 소, 그리고 그들의 능력을 박테리아와 항생제 저항 유전자37,38transduce의 보급으로 인해 그러한 방법 내성 박테리아의 확산을 공부 하 고 유용할 수 있습니다.
저자는 공개 없다.
마리아 Baumgarten (IQ 바이오 플랫폼, 감염 의학, 룬 드 대학) 스캐닝 전자 현미경을 제공 하 고 수행에 대 한 인정 이다. 이 이는 이니셔티브의 일환으로는 유럽 제 3 공동 프로그래밍에 항균 성 저항 (JPIAMR) 전화 "전송 역학." 스웨덴 연구 위원회 Formas (2017-00100)에서 교부 금에 의해 지원 되었다 Funders 연구 설계, 해석, 쓰기, 작품을 게시 하는 원고, 제출, 또는 의사 결정의 준비에 전혀 역할을 했다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Glass Cover slips | ThermoFisher | 102222 | protein stamp |
HCl | Sigma-Aldrich | H1758-500ML | cleaning |
NaOH | Sigma-Aldrich | 72068-100ML | cleaning |
Ultrasonic cleaner | Branson Ultrasonic | BRANSONIC M1800- E | cleaning |
3-amino-propyl-triethoxysilane (APTES) | Sigma-Aldrich | A3648-100ML | modification |
EtOH | Sigma-Aldrich | 1009836010 | rinsing/cleaning |
glutaraldehyde | Sigma-Aldrich | G5882-100ML | cross-linker |
acetone | Sigma-Aldrich | 34850-1L-M | cleaning |
H2SO4 | Sigma-Aldrich | 339741-100ML | piranha solution |
H2O2 | Sigma-Aldrich | H1009-500ML | piranha solution |
tyramine | Sigma-Aldrich | T90344-5G | modification |
CompactStat | Ivium Technologies | CompactStat.h: 30mA@10V/3MHz | potentiostat |
Platinum Counter Electrode Kit | Equilabrium | AFCTR5 | potentiostat |
Reference Electrode | Equilabrium | RREF0021 | potentiostat |
acryloyl chloride | EMD Millipore | 8.00826.0100 | modification |
triethylamine | EMD Millipore | 8.08352.0100 | modification |
toluene | Sigma-Aldrich | 244511-100ML | modification |
N-hydroxymethyl acrylamide | Sigma-Aldrich | 245801-100G | functional monomer |
poly ethylene glycol-400-dimethacrylate | Sigma-Aldrich | 409510-250ML | cross-linker |
2-Hydroxy-4′-(2-hydroxyethoxy)-2-methylpropiophenone | Sigma-Aldrich | 410896-50G | functional monomer |
UV polymerizator | Dymax | Dymax 5000ECE | UV-polymerization |
forceps | Sigma-Aldrich | Z168777-1EA | consumable |
1-dodecanethiol | Sigma-Aldrich | 471364-100ML | blocking agent |
acrylamide | Sigma-Aldrich | A3553-100G | functional monomer |
N-hydroxymethylacrylamide | Sigma-Aldrich | 245801-100G | functional monomer |
N-isopropylacrylamide | Sigma-Aldrich | 415324-50G | functional monomer |
methylenebisacrylamide | Sigma-Aldrich | 146072-500G | cross-linking monomer |
N,N,N',N'-tetrametyhlethyldiamine (TEMED) | Sigma-Aldrich | T9281-25ML | catalyst |
ammonium persulphate | Sigma-Aldrich | A3678-25G | initiator |
Capacitive biosensor | CapSenze | Equipment | |
Glycine | Merck | 1042011000 | regeneration buffer |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P9416-50ML | regeneration buffer |
Trizma base | Sigma-Aldrich | 93352-1KG | running buffer |
Na2HPO4 • 2H2O | Calbiochem | 567547-1KG | running buffer |
NaH2PO4 • 2H2O | Calbiochem | 567549-1KG | running buffer |
DELPHI correlative light and electron microscope | Phenom-World | equipment | |
Capacitive gold electrodes | CapSenze Biosystems | consumables | |
2,2'-azobis(2-methypropionitrile) | Sigma-Aldrich | 441090-25G | photo-initiator |
CapSenze Smart Software | CapSenze Biosystems | software program |
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