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Aqui, apresentamos um protocolo para a detecção e quantificação de baixas moléculas abundantes em soluções complexas usando molecular imprinting em combinação com um biossensor de capacitância.
A capacidade de detectar e quantificar biomoléculas em soluções complexas sempre foi muito procurada dentro da ciência natural; sendo usado para a detecção de biomarcadores, contaminantes e outras moléculas de interesse. Uma técnica comumente utilizada para este fim é a enzima-lig da imunoabsorção ensaio (ELISA), onde muitas vezes um anticorpo é direcionado a uma molécula-alvo específico, e um segundo anticorpo marcado é utilizado para a detecção do anticorpo primário, permitindo a quantificação absoluta da biomolécula sob estudo. No entanto, o uso de anticorpos como elementos de reconhecimento limita a robustez do método; como faz a necessidade do uso de moléculas rotuladas. Para superar essas limitações, impressão molecular foi implementado, criação de sites de reconhecimento artificial complementar à molécula de modelo e obsoleting a necessidade do uso de anticorpos para ligação inicial. Além disso, para maior sensibilidade, o anticorpo secundário marcado pode ser substituído por biosensores depender a capacitância para a quantificação da molécula alvo. Neste protocolo, descrevemos um método para rapidamente e sem rótulo detectar e dosar baixo-abundantes biomoléculas (proteínas e vírus) em amostras complexas, com uma sensibilidade que é significativamente melhor do que os sistemas de deteção comumente usados, tais como o ELISA. Isto é tudo mediado por impressão molecular em combinação com um biossensor de capacitância.
A quantificação das biomoléculas é usada em muitos campos diferentes de pesquisa dentro da ciência, empregando métodos como o radioimunoensaio (RIA) ou ELISA1. Alguns desses métodos requerem um rotulado reagente como um radioisótopo ou uma enzima chamada anticorpo/antigénio, o que os torna trabalhosa e demorada com procedimentos complexos2. Além disso, a robustez, seletividade e sensibilidade desses métodos não são suficientes para todas as análises; em particular não são suficientes quando quantidades attogram precisam ser analisado, ao invés de pictograma quantidades3. Para este efeito, biosensores ganharam considerável interesse4,5, em especial em combinação com impressão molecular para uma maior robustez.
Impressão molecular baseia-se na criação de cavidades, polimerização de monômeros funcionais em torno do modelo6, criação de sites de reconhecimento artificial que lembram perfeitamente o modelo7. Esta técnica tem sido usada para diversas aplicações, incluindo sistemas de entrega de droga e separação analítica, mas também como elementos biorecognition em biosensores8,9,10. No entanto, existem ainda algumas dificuldades na concepção de polímeros molecularmente impressos (MIPs) para modelos macromoleculares como proteínas e células de11,12. Devido a isto, muitos pesquisadores concentraram-se na impressão a proteína modelo diretamente sobre um substrato, criando assim uma superfície que será reconhecida pela proteína alvo12. Esta técnica de revestimento de superfície usada para empregar cavidades de reconhecimento por grandes moléculas e montagens, incluindo proteínas é chamada microcontact impressão13,14. O procedimento geral do método depende da polimerização entre duas superfícies - um selo de modelo e um suporte de polímero - sobre a qual o modelo é adsorvido em uma superfície de15,16e trouxe em contato com o superfície tratada com monômero. Por esta maneira, uma película fina de polímero é formada com o apoio através de UV-polimerização. Finalmente, o modelo é removido, deixando para trás a cavidades específicas do modelo na superfície do eletrodo impresso. Este método tem algumas vantagens, incluindo uma perda reduzida atividade da molécula imprimida, quantidades muito pequenas, bem como exigindo de moléculas modelo para a impressão processam16,17. Assim, estas superfícies cost-effective, estáveis, sensíveis e seletivas podem ser criados nas superfícies de sensor, visando a qualquer modelo de escolha do usuário.
O biosensor pode ser usado para a detecção de proteínas simples e macromoléculas muito maiores, incluindo vírus. Um grupo específico de vírus ganhando interesse recente é o bacteriófago, que é um vírus que infecta bactérias. Detecção rápida e sensível de bacteriófagos é importante durante biotecnológicas e biofarmacêutica processos a fim de determinar as infecções de culturas bacterianas com bacteriófagos18. O ensaio biológico mais comumente usado para a deteção do bacteriófago é a dupla camada agar método19, que é trabalhoso e demorado. Várias tentativas foram feitas para desenvolver novas ferramentas de diagnóstico para vírus (incluindo bacteriófagos) como força atômica (AFM) a microscopia20, interferometria21, eletroquímica22e sensor sistema23, 24. um monte de trabalho tem sido focado em biosensores devido a suas vantagens como sendo capaz de medição em tempo real,15,25, altamente sensível e fácil de operar. Um tipo específico de biosensor baseia-se em mudanças na capacitância. Estes biosensores capacitivos são os sensores eletroquímicos que medem mudanças nas propriedades dielétricas quando um analito interage com um elemento de biorecognition na superfície do sensor, causando uma diminuição da capacitância2,4 . Biosensores capacitivos têm sido utilizados para a detecção de vários analitos como antígenos, anticorpos, proteínas e heavy metal íons6,26,,27,28. Estes tipos de biosensores têm muitas vantagens como inerente rapidez, alta sensibilidade, simplicidade, baixo custo, fácil manipulação e medição em tempo real sem rotulagem29.
O método descrito neste documento destina-se a permitir a detecção e quantificação de baixo-abundantes biomoléculas em amostras altamente complexas, sem a necessidade de usar qualquer rotulagem. Em particular, a técnica é mais útil na faixa de atto-picograma de biomoléculas, onde outros instrumentos comercialmente existentes não conseguem dosar com precisão seu alvo.
1. modificação de lamínulas de vidro (modelo selos)
2. modificação de eletrodos de ouro capacitivos
3. preparação do modelo de impresso capacitivos eletrodos de ouro
4. Caracterização da superfície do eletrodo com microscopia eletrônica (SEM)
5. medições capacitivas em tempo real com modelo impresso capacitivos eletrodos de ouro
Seguindo o protocolo, de acordo com o esquema na Figura 1, um eletrodo de ouro nua será gravado com um modelo, que representa a estrutura de um biomacromolecule. Este eletrodo pode ser aplicado em um biossensor capacitivo (Figura 2), permitindo que o aplicativo estável de um modelo para o eletrodo e a medição de mudanças na capacitância mediante vinculação do modelo.
Uma representação esquemática do biosensor capacitivo é mostrada na Figura 2. A bomba de centris, que é responsável pela injeção contínua de buffer de execução (fosfato 10 mM, pH 7,4) e o buffer de regeneração (25mm glicina-HCl, pH 2.5) durante a regeneração dentro da célula de fluxo, pode ser vista claramente na figura. A célula de fluxo consiste em trabalhar, referência e eletrodos de contador. A válvula de injeção é composta de soluções padrão de proteína/bacteriófago, que estão de passagem o desgaseificador primeiro e então injetado sequencialmente no sistema. Tão logo as soluções atingem o eletrodo de trabalho inserido na célula de fluxo, o resultado é monitorado em tempo real. Os valores de capacitância podem ser registrados, seguindo o sensorgrams na tela do computador.
Figura 3 e Figura 4 mostram as diferenças entre a superfície dos eléctrodos de ouro desencapados e imprimidas. Esta etapa de caracterização é importante para garantir que existem cavidades poliméricas, vistas como rugosidade na superfície do eléctrodo após a programação. Além de SEM, existem também outros métodos de caracterização incluindo AFM, medições de ângulo de contato, etc., que podem ser usados para caracterizar a superfície após a programação de elipsometria. Desta forma, pode ser assegurado que o processo de impressão é bem sucedido e que as cavidades modelo são formadas na superfície. Dentro dessas cavidades, o modelo pode vincular com afinidade e alta especificidade.
Depois de injectar das soluções-padrão do sistema capacitivo, uma média das cinco últimas leituras foi calculada automaticamente pelo software, e os gráficos de calibração foram obtidos plotando a mudança na capacitância vs. a concentração do analito. A diminuição da capacidade registrada surgiu a ligação do modelo. As mais moléculas que se ligam ao eléctrodo de ouro de superfície, maior a redução da capacidade total, de acordo com o princípio geral de medição capacitiva. Figura 5 e Figura 6 mostram que com o aumento da concentração do analito, a ΔC aumenta conforme o esperado. A gama dinâmica (entre os quais é o intervalo de concentração onde o sistema é útil para a detecção de um alvo específico) e o limite de detecção (LOD) podem ser avaliadas através da análise desses gráficos. De acordo com a Figura 6, o biosensor capacitivo do bacteriófago imprimido pode detectar bacteriófagos na faixa de concentração de 101 - 105 pfu/mL, com um valor LOD de pfu/mL 10 neste estudo. Tanto a Figura 5 e Figura 6 também destacar a necessidade de medir a curva de calibração no mesmo intervalo necessário para a concentração de modelo deve, desde que a linearidade da regressão pode variar mais as concentrações ( Figura 5), ou ter inclinações diferentes (Figura 6). Também note que devido as baixas concentrações utilizadas, o sistema é bastante sensível às flutuações (turbidez da amostra, projecto de ar, etc.), e portanto, é recomendável executar pelo menos triplica para reduzir o potencial de outliers, incluindo . Pela mesma razão, o desvio-padrão pode ser bastante significativo para amostras altamente diluídas, como visto na Figura 6.
Figura 1 . Representação esquemática do método de impressão microcontact. (A) preparação de lamínulas de vidro (selos de modelo), (B) preparação dos eléctrodos de ouro capacitivos, (C) microcontact impressão do modelo para a superfície do eletrodo de ouro através de UV-polimerização e (D) remoção do modelo da superfície do eletrodo (reproduzido do Ertürk et al, biotecnologia relatórios 2014 (3): 65-72, com permissão). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 2. Representação esquemática do biosensor capacitiva. O layout geral do biosensor capacitivo utilizado neste estudo (reproduzido do Ertürk et al, biotecnologia relatórios 2014 (3): 65-72, com permissão). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 3. Microscopia eletrônica de varredura de proteína impresso eletrodos. Imagens SEM do (A), um eletrodo de ouro desencapado (barra de escala = 20 µm), e (B), uma proteína impresso eletrodo capacitivo de ouro (barra de escala = 10 µm). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 4. Microscopia eletrônica de varredura do bacteriófago impresso eletrodos. Imagens SEM de um eletrodo de ouro desencapado (barra de escala = 20 µm) (A), e um bacteriófago impresso capacitivo eletrodo de ouro em diferentes ampliações (6600 x, barra de escala = 10 µm) (B) e 11, 500 X, escala bar = 5 µm) (C); as setas denotam aderidos bacteriófagos). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 5. Efeito de composição do tampão para gráficos de calibração. Gráfico de calibração mostrando a mudança na capacitância vs uma concentração de proteína em óptimas condições (executando Buffer: 50 mM Tris-HCl, pH 7,4; Buffer de regeneração: 25mm glicina-HCl, pH 2.5 incluindo 50mm Tween-20; Taxa de fluxo: 100 µ l/min, volume de amostra: 250 µ l; T: 25 ° C). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 6. Curva de calibração representante para grandes macromoléculas. Gráfico de calibração que mostra a mudança na capacitância vs concentração do bacteriófago em óptimas condições (executando Buffer: fosfato 10 mM, pH 7,4; Buffer de regeneração: 25mm glicina-HCl, pH 2.5 incluindo 50mm Tween-20; Taxa de fluxo: 100 µ l/min, volume de amostra: 250 µ l; T: 25 ° C) clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Quando este método é realizado, existem algumas etapas essenciais que devem ser consideradas ao seguir o protocolo. Um passo crítico é a etapa de limpeza com solução ácida de piranha. Passo 2.1 não deve ser mais de 10 min. A solução de modelo para a etapa 1.4 não deve exceder 0,1 mg/mL, desde que estes valores foram previamente otimizados. Exames titulimétricos cíclica não devem exceder 15 ciclos a fim de obter a espessura ideal. Para etapa 3.1.3, 1,5 µ l é um valor otimizado. Este valor não deve ser mais elevado para este tipo específico de eletrodo. Se o sistema de cura UV tem uma potência de 400 W, a polimerização deve ser executada por um período máximo de 10-15 min. Tão logo o APS (iniciador) é adicionado à solução após TEMED, a etapa subsequente deve ser executada muito rapidamente para evitar a polimerização imediata (passo 3.2.5).
Um dos passos mais importantes é a remoção do carimbo modelo da superfície após a polimerização UV. Se esta etapa não é realizada corretamente, há um risco de que o filme polimérico na superfície do eléctrodo pode ser removido com o carimbo. Portanto, é recomendável para mergulhar o eléctrodo e o carimbo de proteína no topo de uma solução de água após a polimerização e, em seguida, retire o selo muito lentamente e com cuidado a superfície (etapa 3.1.6).
Baseado no modelo utilizado, modificações no tipo e proporção de monômeros usados (monómero funcional e cross-linker) poderão ser avaliadas em termos de geração de maior sensibilidade. Isso deve ser determinado empiricamente. Além disso, a ligação de afinidade da molécula modelo geralmente envolve várias interações diferentes simultaneamente. Portanto, isso pode levar a problemas durante as etapas de regeneração. Se o modelo vinculado não é liberado da superfície corretamente, isso pode influenciar a capacidade de reutilização do eletrodo para posterior análise. Essas afinidades multipontos também podem resultar de ligação através de interações fracas. Em tais sistemas, inespecificas podem ter lugar, que pode influenciar negativamente o a seletividade do sistema16. Estas são comuns e gerais, limitações do método.
Além dessas limitações específicas, existem muitas vantagens significativas do método discutido sobre os métodos existentes. Enquanto RIAs, Elisa e medições fluorométrica são muito sensíveis, eles exigem o uso de material rotulado (modelo ou detector), enquanto o biosensor é completamente rótulo livre. Esses métodos também são mais caros e demorados. Uma abordagem de biosensor permite a síntese rápida, paralelo de MIPs em composições diferentes, o mesmo tempo16. Uma vez que apenas alguns microlitros de solução de monômero é necessária para a preparação, o método é conveniente quando usando caros ou não limitado de monômeros. Além disso, o único eletrodos MIP podem ser usados para aproximadamente 80 análises sem uma diminuição significativa no desempenho, que é significativamente maior do que outros de métodos existentes30. Os métodos existentes também sofrem, em graus variáveis, de baixa sensibilidade e seletividade, enquanto o método descrito permite para detecção e quantificação de moléculas na faixa de pM com alta seletividade.
Devido a relação custo-eficácia, a facilidade de operação do instrumento e a detecção sensível em tempo real em um curto período de tempo em comparação com os métodos existentes, os biosensores são muito promissor ponto-de sistemas de deteção de cuidados sob condições de campo; por exemplo, para monitoramento ambiental e para aplicações em países em desenvolvimento. Em muitas aplicações no diagnóstico da doença, detecção em tempo real, sensível, seletiva e rápida de um biomarcador em uma mistura complexa como o soro é necessário15,25. Aqui, biosensores são superiores aos métodos existentes, em particular, devido à sua sensibilidade e robustez. Especificamente para a detecção de agentes infecciosos, bacteriófagos são recentemente considerados como elemento de biorecognition alternativos para biossensores devido à sua especificidade anfitrião de bactérias33,34,35. Substituição de anticorpos com bacteriófagos é muito promissor, a fim de reduzir o custo e aumentar a estabilidade ainda mais36. Esse sistema também permitirá a detecção e quantificação do fago específico no ambiente e de amostras clínicas. Devido a prevalência de bacteriófagos e sua capacidade de transduce bactérias com genes de resistência aos antibióticos37,38, tal método pode ser valioso para estudar a propagação de bactérias resistentes.
Os autores não têm nada para divulgar.
Maria Baumgarten (plataforma de biotecnologia IQ, infecção de medicina, Universidade de Lund) é reconhecido pela execução e fornecer varredura micrografias de elétron. Este trabalho foi apoiado por subsídios de pesquisa Sueco The Conselho Formas (2017-00100) como parte da terceira comum programação iniciativa europeia na chamada de resistência antimicrobiana (JPIAMR) "Dinâmica de transmissão." Os financiadores não tinham qualquer papel no projeto de estudo, interpretação, escrita, preparação do manuscrito, decisão de submeter ou a decisão de publicar o trabalho.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Glass Cover slips | ThermoFisher | 102222 | protein stamp |
HCl | Sigma-Aldrich | H1758-500ML | cleaning |
NaOH | Sigma-Aldrich | 72068-100ML | cleaning |
Ultrasonic cleaner | Branson Ultrasonic | BRANSONIC M1800- E | cleaning |
3-amino-propyl-triethoxysilane (APTES) | Sigma-Aldrich | A3648-100ML | modification |
EtOH | Sigma-Aldrich | 1009836010 | rinsing/cleaning |
glutaraldehyde | Sigma-Aldrich | G5882-100ML | cross-linker |
acetone | Sigma-Aldrich | 34850-1L-M | cleaning |
H2SO4 | Sigma-Aldrich | 339741-100ML | piranha solution |
H2O2 | Sigma-Aldrich | H1009-500ML | piranha solution |
tyramine | Sigma-Aldrich | T90344-5G | modification |
CompactStat | Ivium Technologies | CompactStat.h: 30mA@10V/3MHz | potentiostat |
Platinum Counter Electrode Kit | Equilabrium | AFCTR5 | potentiostat |
Reference Electrode | Equilabrium | RREF0021 | potentiostat |
acryloyl chloride | EMD Millipore | 8.00826.0100 | modification |
triethylamine | EMD Millipore | 8.08352.0100 | modification |
toluene | Sigma-Aldrich | 244511-100ML | modification |
N-hydroxymethyl acrylamide | Sigma-Aldrich | 245801-100G | functional monomer |
poly ethylene glycol-400-dimethacrylate | Sigma-Aldrich | 409510-250ML | cross-linker |
2-Hydroxy-4′-(2-hydroxyethoxy)-2-methylpropiophenone | Sigma-Aldrich | 410896-50G | functional monomer |
UV polymerizator | Dymax | Dymax 5000ECE | UV-polymerization |
forceps | Sigma-Aldrich | Z168777-1EA | consumable |
1-dodecanethiol | Sigma-Aldrich | 471364-100ML | blocking agent |
acrylamide | Sigma-Aldrich | A3553-100G | functional monomer |
N-hydroxymethylacrylamide | Sigma-Aldrich | 245801-100G | functional monomer |
N-isopropylacrylamide | Sigma-Aldrich | 415324-50G | functional monomer |
methylenebisacrylamide | Sigma-Aldrich | 146072-500G | cross-linking monomer |
N,N,N',N'-tetrametyhlethyldiamine (TEMED) | Sigma-Aldrich | T9281-25ML | catalyst |
ammonium persulphate | Sigma-Aldrich | A3678-25G | initiator |
Capacitive biosensor | CapSenze | Equipment | |
Glycine | Merck | 1042011000 | regeneration buffer |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P9416-50ML | regeneration buffer |
Trizma base | Sigma-Aldrich | 93352-1KG | running buffer |
Na2HPO4 • 2H2O | Calbiochem | 567547-1KG | running buffer |
NaH2PO4 • 2H2O | Calbiochem | 567549-1KG | running buffer |
DELPHI correlative light and electron microscope | Phenom-World | equipment | |
Capacitive gold electrodes | CapSenze Biosystems | consumables | |
2,2'-azobis(2-methypropionitrile) | Sigma-Aldrich | 441090-25G | photo-initiator |
CapSenze Smart Software | CapSenze Biosystems | software program |
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