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Summary

Le protocole présente la transcription in vitro (IVT) d’ARNm chimiquement modifié, la préparation de liposomes cationiques et l’analyse fonctionnelle des transfections d’ARNm activées par les liposomes dans des cellules de mammifères.

Abstract

Au cours des dernières années, l’ARN messager chimiquement modifié (ARNm) est apparu comme une puissante molécule d’acide nucléique pour le développement d’un large éventail d’applications thérapeutiques, y compris une nouvelle classe de vaccins, des thérapies de remplacement des protéines et des thérapies immunitaires. Parmi les vecteurs d’administration, les nanoparticules lipidiques se sont avérées plus sûres et plus efficaces pour délivrer des molécules d’ARN (par exemple, siRNA, miARN, mRNA) et quelques produits sont déjà utilisés en clinique. Pour démontrer l’administration d’ARNm médiée par des nanoparticules lipidiques, nous présentons un protocole optimisé pour la synthèse d’ARNm eGFP fonctionnels modifiés par me1Ψ-UTP, la préparation de liposomes cationiques, la formation de complexes électrostatiques d’ARNm avec des liposomes cationiques et l’évaluation de l’efficacité de la transfection dans les cellules de mammifères. Les résultats démontrent que ces modifications améliorent efficacement la stabilité de l’ARNm lorsqu’il est administré avec des liposomes cationiques et augmentent l’efficacité et la stabilité de la traduction de l’ARNm eGFP dans les cellules de mammifères. Ce protocole peut être utilisé pour synthétiser l’ARNm souhaité et le transfecter avec des liposomes cationiques pour l’expression des gènes cibles dans les cellules de mammifères.

Introduction

En tant que molécule thérapeutique, l’ARNm offre plusieurs avantages en raison de sa nature non intégrative et de sa capacité à transfecter des cellules non mitotiques par rapport à l’ADN plasmidique (ADNp)1. Bien que l’administration d’ARNm ait été démontrée au début des années 1990, les applications thérapeutiques étaient limitées en raison de son manque de stabilité, de son manque d’activation immunitaire et de sa faible efficacité translationnelle2. Des modifications chimiques récemment identifiées, telles que la pseudouridine 5'-triphosphate (Ψ-UTP) et la méthyl pseudouridine 5'-tri....

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Protocol

1. Production d’ARNm modifié par me1 Ψ-UTP

  1. Préparation de matrice d’ADN de transcription in vitro (IVT)
    REMARQUE : Pour la préparation d’un modèle d’ADN IVT (promoteur T7 - cadre de lecture ouvert (ORF) du gène), concevez un ensemble d’amorces spécifiques au gène pour le gène d’intérêt. Ajouter la séquence du promoteur T7 (5'-NNNNNNNTAATACGACTCACTATAGGGNNNNNN-3') avant l’amorce directe spécifique au gène.
    1. Préparez le mélange réactionnel PCR comme décrit dans le tableau 1.
      REMARQUE : Exécutez au moins quatre réactions PCR pour augmenter la concentration et la qualité de la matrice d’ADN IVT.....

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Results

Nous avons optimisé le protocole pour les expériences de production d’ARNm modifiés, de préparation de liposomes et de transfection d’ARNm avec des liposomes cationiques dans plusieurs cellules de mammifères (Figure 1). Pour synthétiser l’ARNm, la matrice eGFP IVT optimisée par le codon de mammifère a été amplifiée à partir du vecteur d’expression de mammifère mEGFP-N1 et purifiée par la méthode d’extraction organique/précipitation .......

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Discussion

Les applications thérapeutiques des ARNm non modifiés ont été limitées en raison de leur demi-vie plus courte et de leur capacité à activer les réponses immunitaires innées intracellulaires, ce qui entraîne à son tour une faible expression des protéines dans les cellules transfectées11. Katalin et al. ont démontré qu’un ARN contenant des nucléosides modifiés tels que m5C, m6A, ΨU et me1Ψ-UTP pouvait empêcher l’activation de TLR

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Disclosures

Aucune divulgation

Acknowledgements

Le MS remercie le Département de biotechnologie de l’Inde pour son soutien financier (BT/PR25841/GET/119/162/2017), le Dr Alok Srivastava, Chef du CSCR de Vellore, pour son soutien et le Dr Sandhya, des plateformes du CSCR pour l’imagerie et les expériences FACS. Nous remercions R. Harikrishna Reddy et Rajkumar Banerjee, Division de Biologie Appliquée, CSIR-Institut Indien de Technologie Chimique Uppal Road, Tarnaka, Hyderabad, 500 007, TS, Inde, pour leur aide dans l’analyse des données physico-chimiques des liposomes. Vigneshwaran V, et Joshua A, CSCR pour leur aide dans la réalisation de vidéos.

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
AgaroseLonza50004
Bath sonicatorDNMANM IndustriesUSC-100
Cationic lipidSynthesized in the lab
ChlorofromMP biomedicals67-66-3"Caution"
CholesterolHimediaGRM335
DEPC waterSRL BioLit66886
DMEMLonza12-604F
DNA LadderGeneDireXDM010-R50C
DOPETCID4251
EDTA sodium saltMP biomedicals194822
EthanolHaymanF204325"Caution"
Fetal bovine serumGibco10270
Flow cytometryBDFACS Celesta
Fluroscence MicroscopeLeicaMI6000B
Gel documentation systemCell BiosciencesFlurochem E
Glacial acetic acidFisher Scientific85801"Caution"
mEGFP-N1, Mammalian expression vectorAddgene54767
N1-Methylpseudo-UTPJena BioscienceNU-890
Phenol:chloroform:isoamyl alchol (25:24:1), pH 8.0SRL BioLit136112-00-0"Caution"
Phosphate Buffer Saline (PBS), pH 7.4CellCloneCC3041
Probe sonicatorSonics Vibra CellsVCX130
RNA ladderNEBN0362S
RNase inhibitorThermo ScientificN8080119
SafeView dyeabmG108
Sodium acetateSigmaS7545
ThermocyclerApplied biosystems4375786
ThermomixerEppendrof22331
Tris bufferSRL BioLit71033
TrypsinGibco25200056

References

  1. Sahin, U., Kariko, K., Tureci, O. mRNA-based therapeutics--developing a new class of drugs. Nature Reviews Drug Discovery. 13 (10), 759-780 (2014).
  2. Schlake, T., Thess, A., Fotin-Mleczek, M., Kallen, K. J. Developing mRNA-vaccine technologies. RNA Biology. 9 (11), 1319-1330 (2012....

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