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Method Article
Ici, nous présentons un implant unique, imprimable en 3D, pour les rats, nommé TD Drive, capable d’enregistrements symétriques et bilatéraux de fils-électrodes, actuellement dans jusqu’à dix zones cérébrales distribuées simultanément.
Des interactions complexes entre plusieurs zones du cerveau sous-tendent la plupart des fonctions attribuées au cerveau. Le processus d’apprentissage, ainsi que la formation et la consolidation des souvenirs, sont deux exemples qui dépendent fortement de la connectivité fonctionnelle à travers le cerveau. De plus, l’étude des similitudes et/ou des différences hémisphériques va de pair avec ces interactions multi-zones. Les études électrophysiologiques qui tentent d’élucider davantage ces processus complexes dépendent donc de l’enregistrement de l’activité cérébrale à plusieurs endroits simultanément et souvent de manière bilatérale. Voici un implant imprimable en 3D pour rats, nommé TD Drive, capable d’enregistrer symétriquement et bilatéralement des électrodes-fils, actuellement dans jusqu’à dix zones cérébrales distribuées simultanément. La conception open-source a été créée en utilisant des principes de conception paramétriques, permettant aux utilisateurs potentiels d’adapter facilement la conception du variateur à leurs besoins en ajustant simplement des paramètres de haut niveau, tels que les coordonnées antéro-postérieures et médiolatérales des emplacements des électrodes d’enregistrement. La conception de l’implant a été validée chez n = 20 rats Lister Hooded qui ont effectué différentes tâches. L’implant était compatible avec les enregistrements de sommeil attachés et les enregistrements en plein champ (exploration d’objets) ainsi qu’avec l’enregistrement sans fil dans un grand labyrinthe à l’aide de deux systèmes d’enregistrement commerciaux différents et de scènes. Ainsi, la conception et l’assemblage adaptables d’un nouvel implant électrophysiologique sont présentés, facilitant une préparation et une implantation rapides.
La nature multi-zones des interactions cérébrales pendant l’éveil et le sommeil rend difficile l’étude exhaustive des processus physiologiques en cours. Alors que des approches telles que l’IRM fonctionnelle (IRMf) et l’échographie fonctionnelle (fUS) permettent d’échantillonner l’activité cérébrale à partir de cerveaux entiers 1,2, elles exploitent le couplage neurovasculaire pour déduire l’activité cérébrale de l’activité hémodynamique, limitant ainsi leur résolution temporelle2. De plus, l’IRMf exige que le sujet de recherche soit placé dans un scanner IRM, interdisant les expériences avec des animaux se déplaçant librement. L’imagerie optique de la dynamique calcique avec l’imagerie monophotonique ou multiphotonique permet d’enregistrer simultanément des centaines de neurones spécifiques au type de cellule3. Cependant, les microscopes montés sur la tête tels que le Miniscope3, qui permettent un comportement en mouvement libre, sont généralement limités à l’imagerie des zones corticales superficielles dans les cerveaux intacts4. Bien que le diamètre de leur champ de vision sur le cortex puisse être de l’ordre de 1 mm, l’encombrement de ces microscopes montés sur la tête peut rendre difficile le ciblage de plusieurs zones, en particulier adjacentes. Par conséquent, pour capturer avec précision la dynamique cérébrale multi-zones pendant l’éveil et le sommeil, l’électrophysiologie extracellulaire, enregistrée avec des électrodes implantées dans les zones cérébrales d’intérêt, est l’une des méthodes de choix en raison de sa haute résolution temporelle et de sa précision spatiale5. De plus, il permet de caractériser la dynamique du sommeil chez l’animal de manière compatible avec les analyses obtenues à partir de l’EEG humain, augmentant ainsi la valeur translationnelle de cette méthode6.
Classiquement, les études enregistrant l’activité cérébrale avec des électrodes extracellulaires ont utilisé des électrodes individuelles ou des faisceaux d’électrodes, tels que les tétrodes7. Des sondes de pointe telles que la sonde Neuropixels8 permettent de cibler plusieurs zones simultanément, étant donné qu’elles sont alignées sur un axe qui permet d’implanter la sonde le long de cet axe sans nuire à l’animal. Cependant, l’enregistrement simultané précis de plusieurs zones spatialement séparées reste difficile, les méthodes existantes étant soit coûteuses, soit chronophages.
Ces dernières années, les méthodes de fabrication additive telles que la stéréolithographie sont devenues largement disponibles. Cela a permis aux chercheurs de développer de nouveaux implants d’électrodes adaptables àleurs exigences expérimentales9, par exemple, un ciblage simplifié et reproductible de plusieurs zones du cerveau. Fréquemment, ces conceptions d’implants sont également partagées avec la communauté universitaire en tant que matériel open source, ce qui permet à d’autres chercheurs de les adapter à leurs propres fins. Le degré d’adaptabilité de certains implants varie à la fois en fonction de la conception de l’implant et de la façon dont il est partagé. La modélisation paramétrique10 est une approche populaire de la conception assistée par ordinateur, dans laquelle différents composants de la conception sont liés par des paramètres interdépendants et un historique de conception défini. La mise en œuvre d’une approche paramétrique pour la conception des implants augmente leur réutilisation et leur adaptabilité10, car la modification des paramètres individuels met automatiquement à jour les conceptions complètes sans qu’il soit nécessaire de remodeler la conception complexe. Une nécessité conséquente est que le design lui-même soit partagé dans un format modifiable qui préserve les relations paramétriques et l’historique du design. Les formats de fichier qui ne représentent que des primitives géométriques, tels que STL ou STEP, rendent irréalisables les modifications paramétriques ultérieures des modèles publiés.
Bien que les hyperdisques de tétrode 11,12,13 permettent d’enregistrer des dizaines de tétrodes, leur assemblage et leur implantation prennent beaucoup de temps, et leur qualité dépend en grande partie des compétences et de l’expérience de chaque chercheur. De plus, ils combinent généralement les tubes guides qui dirigent les électrodes d’enregistrement vers leur emplacement cible en un ou deux faisceaux plus grands, limitant ainsi le nombre et l’étalement des zones pouvant être ciblées efficacement.
D’autres implants14,15 exposent l’ensemble du crâne et permettent de placer librement plusieurs microdisques individuels qui transportent les électrodes d’enregistrement. Bien que le placement de microvariateurs indépendants16 pendant la durée de l’intervention maximise la flexibilité, il augmente le temps de l’opération et peut rendre difficile le ciblage de plusieurs zones adjacentes en raison de l’encombrement des microvariateurs individuels. De plus, bien que les implants soient open source, ils ne sont publiés que sous forme de fichiers STL, ce qui rend la modification difficile.
Un exemple de variateur avec une philosophie paramétrique plus inhérente est le RatHat17. En fournissant un pochoir chirurgical qui couvre toute la surface dorsale du crâne, il permet de cibler avec précision plusieurs cibles cérébrales sans l’utilisation d’un cadre stéréotaxique pendant la chirurgie. Plusieurs variantes d’implants pour canules, optrodes ou tétrodes sont disponibles. Cependant, bien que l’utilisation du disque soit gratuite à des fins académiques, il n’est pas publié en open source, ce qui crée un obstacle pour les chercheurs qui souhaitent évaluer et utiliser l’implant.
Cet article présente le TD Drive (voir Figure 1), un nouvel implant imprimable en 3D pour l’enregistrement d’électrodes extracellulaires chez le rat. Le TD Drive vise à surmonter certains des inconvénients des solutions existantes : il permet de cibler plusieurs zones du cerveau, en miroir sur les deux hémisphères, avec des électrodes indépendantes simultanément. Grâce à sa conception simple, il peut être assemblé en quelques heures à un coût relativement faible par des chercheurs moins expérimentés. Le TD Drive est publié en open-source, dans des formats de fichiers facilement modifiables pour permettre aux chercheurs de l’adapter à leurs besoins spécifiques. L’intégration d’une approche de modélisation 3D paramétrique dès le début du processus de conception du TD Drive permet d’abstraire les paramètres nécessaires à la modification : pour changer les emplacements cibles, les chercheurs peuvent simplement modifier les paramètres représentant leurs coordonnées dorso-ventrales et antéropostérieures, sans avoir besoin de reconcevoir le lecteur eux-mêmes. Les fichiers pour modifier et fabriquer le TD Drive se trouvent à l’adresse https://github.com/3Dneuro/TD_Drive.
Figure 1 : Vue d’ensemble du TD Drive. (A) Rendu d’un TD Drive avec un capuchon de protection. (B) Rendu avec les parties intérieures illustrées. Le TD Drive dispose (a) de plusieurs emplacements d’enregistrement réglables de manière paramétrique pour les fils d’électrodes fixes et mobiles, d’un EIB avec (b) d’un connecteur Omnetics haute densité compatible avec les systèmes d’acquisition de données filaires et sans fil courants, et (c) d’un mappage de canaux intuitif optimisé pour les enregistrements avec les systèmes Intan/Open Ephys (voir Figure supplémentaire 1) et (d) un capuchon pour protéger l’implant lors des enregistrements attachés et lorsqu’aucun étage n’est connecté. (C) Un pochoir de guidage au bas du TD Drive facilite le placement des canules de guidage et sert de vérification redondante de l’emplacement des implants pendant la chirurgie. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
La conception de l’implant a été testée en n = 4, validée en n = 8 et confirmée chez n = 8 rats Lister Hooded qui ont effectué différentes tâches. Les 4 premiers animaux ont été utilisés pour développer l’entraînement et ajuster les paramètres. Ensuite, un pilote complet a été mené avec 8 animaux (voir les résultats). Une deuxième cohorte de 8 animaux a été analysée et incluse dans l’analyse de survie de l’implant. L’implant était compatible avec les enregistrements de sommeil attachés et les enregistrements en plein champ (Object Exploration) ainsi qu’avec l’enregistrement sans fil dans un grand labyrinthe (HexMaze 9 m x 5 m) à l’aide de deux systèmes d’enregistrement commerciaux différents et de headstages. Les deux cohortes de 8 ont été enregistrées avec deux systèmes d’acquisition différents - connecté pour les enregistrements de sommeil plus longs et sans fil pour les enregistrements d’exploration de grands labyrinthes. Nous pouvons conclure que ce simple entraînement par fil permet de mener des expériences de longue haleine avec des cohortes plus importantes par des chercheurs moins expérimentés pour permettre l’analyse des phases de sommeil ainsi que l’analyse de l’oscillation dans plusieurs zones du cerveau. Cela contraste avec la plupart des implants d’électrophysiologie à ce jour, qui, en raison de la difficulté et de l’intensité du temps, permettent des cohortes d’animaux plus petites et nécessitent généralement des expérimentateurs très expérimentés. Cependant, avec ce moteur, aucune activité neuronale individuelle ne peut être enregistrée ; ainsi, l’utilisation est limitée à l’étude du potentiel de champ local (LFP) et de l’activité de sommation.
La présente étude a été approuvée par le Comité central néerlandais Dierproeven (CCD) et menée conformément à la loi sur les expériences sur les animaux (codes de protocole : 2020-0020-006 et 2020-0020-010). Des rats mâles Lister à capuchon de 9 à 12 semaines à l’arrivée ont été utilisés. Les réactifs et l’équipement utilisés dans le protocole sont répertoriés dans la table des matériaux. Reportez-vous à la figure supplémentaire 1 et à la figure supplémentaire 2 pour connaître les étapes du processus de construction du disque.
1. Ajustement et création de modèles 3D et de données de carte d’interface d’électrode (EIB)
2. Impression des modèles 3D et fabrication de la BEI
REMARQUE : Pour la présente étude, une imprimante 3D disponible dans le commerce a été utilisée pour produire les pièces (voir le tableau des matériaux). Lors de l’utilisation d’imprimantes différentes ou de l’externalisation de la production, il peut être nécessaire d’utiliser des résines différentes et comparables pour la production des pièces.
3. Post-traitement du corps imprimé en 3D
REMARQUE : Le capuchon et les navettes ne devraient pas nécessiter de post-traitement. Selon la qualité des impressions 3D, il peut être nécessaire de les poncer légèrement ou d’éliminer les traces de support restantes. Lors du ponçage et du perçage, veillez à ne pas casser les parois du corps d’entraînement. Si nécessaire, nettoyez les pièces post-traitées avec de l’isopropanol et, un chiffon doux et/ou de l’air comprimé.
Figure 2 : Rendu du TD Drive. (A,B) TD Drive (A) sans et (B) avec un capuchon de protection sur un modèle de crâne de rat. (C) Tubes guides en polyimide correctement insérés dans chacun des six sites d’enregistrement. (D) Un ensemble de navette isolé et complet comprenant la vis de guidage, la navette imprimée en 3D et l’insert en laiton soudé. (E) Carrosserie du moteur TD avec deux navettes insérées. Marqués en rouge : (a) trous de fraisage pour la navette, (b) guide de navette, (c) socles centraux du corps d’entraînement, (d) pochoir de guide. (F,G) Les emplacements importants en haut (F) et en bas (G) du corps du disque qui peuvent nécessiter un post-traitement après l’impression 3D sont indiqués par une flèche rouge chacun. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
4. Assemblages de navettes
5. Assemblage du variateur
6. Préparation de la housse de protection
7. Préparation des fils-électrodes
8. Préparation du fil de terre et des fils EEG
9. Chargement des faisceaux de fils dans le lecteur
10. Chirurgie d’implant de lecteur
REMARQUE : Cette étape décrit brièvement les procédures chirurgicales pour l’implantation du TD Drive. Un protocole d’implantation plus complet, y compris une description des outils, ainsi que les doses et les concentrations de médicaments, se trouve dans le dossier supplémentaire 1.
11. Relance de la BEI
En utilisant les instructions fournies dans le protocole, le TD Drive pourrait être construit facilement par plusieurs expérimentateurs. Après le développement de l’entraînement (n = 4), un pilote complet a été mené avec huit animaux. Un lot supplémentaire de huit animaux a été implanté et une collecte de données expérimentales a été effectuée. Comme l’analyse des données sur ces animaux n’a pas été effectuée, ceux-ci ont été inclus dans l’analyse de survie...
Cet article présente un implant adaptable pour les enregistrements bilatéraux symétriques multi-électrodes de fil pour les rats se déplaçant librement.
La possibilité d’ajuster facilement l’implant en modifiant des paramètres prédéfinis a été l’une des motivations pour la création du TD Drive. Tout en visant à maximiser la flexibilité pour changer les paramètres, les contraintes inhérentes aux relations entre eux imposent nécessairement...
TS et PvH sont des employés de 3Dneuro, Nimègue, Pays-Bas. 3Dneuro a co-développé et produit le TD Drive.
Les auteurs tiennent à remercier Angela Gomez Fonseca pour l’inspiration qui a permis de développer le moteur et tous les étudiants qui ont mené des expériences pilotes avec les animaux, Milan Bogers, Floor van Ravenswoud et Eva Severijnen. Ces travaux ont été soutenus par le Conseil néerlandais de la recherche (NWO ; Programme croisé 17619 « INTENSE »).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.5 mm drill bit | McMaster | 2951A38 | |
1.27 mm pitch interconnected SIP/DIP socket (Mill-Max) | Mouser Electronic | 575-003101 | For essembling and connection of EEG & GND screws |
5 minute epoxy | Bison | Commercially available | regular off-the-shelf epoxy |
cyanoacrylate glue | Loctite | Super Glue-3 | |
EEG wire | Science Products GmbH | 7SS-2T | |
Electrode wire | Science Products GmbH | NC7620F | |
Ethanol | LC | For standard pre-operative sterilization procedure of drive | |
Fine forceps (5) | FST | 91150-20 | For wire bundle preperation and handling |
Form 3B | Formlabs | 3D printer used to 3D print the self-printed parts of the TD drive | |
Gold pins (small) | Neuralynx, Inc. | 9885 | Attachment of electorde wires to EIB board |
Ground wire | Science Products GmbH | SS-3T/A | |
High-density connector | LabMaker GmbH/Omnetics | A79026-001 | |
Lister Hodded rats | Charles River Laboratories | Crl:LIS | we used male rats, 9-12 weeks of age at arrival |
M1 brass insert | AliExpress | Commercially available | https://aliexpress.com/item/33047616164.html |
M1 tap | McMaster | 2504A33 | |
M1x16 screw | Bossard | 1096613 | |
M1x3 stainless steel screws | Screws and More | 84213_14985 | |
M2.5x5 polyimide screws | Screws and more | 7985PA25S_50 | |
mineral oil | McMaster | 1244K14 | |
Nail polish | Etos | Commercially available | For color coding EEG and GND wires |
painter's tape | Gamma | Commercially available | For wire bundle preperation |
Pin vise | McMaster | 8455A16 | |
plotting paper | Canson | Commercially available | For wire bundle preperation |
polyimide tubes | Amazon / Small Parts | TWPT-0159-30-50 | AWG, 0.0159" ID, 0.0219" OD, 0.0030" Wall, 30" Length |
RHD 32-channel headstage with accelerometer | Intan Technologies, LLC | C3324 | For tethered recordings in the sleepbox |
RHD 3-ft (0.9 m) standard SPI cables | Intan Technologies, LLC | C3203 | From commutator to headstage |
RHD 6-ft (1.8 m) standard SPI cables | Intan Technologies, LLC | C3206 | From OpenEphys box to commutator |
Slip Ring with Flange | Adafruit | 1196 | Commutator: 22 mm diameter, 12 wires |
Solder flux | Griffon S-39 50 ml | Commercially available | For soldering EEG & GND screws |
soldering paste | Amazon | B08CBZ5HC5 | |
stainless steel M2 nut | McMaster | 93935A305 | |
Tethered recording setup | OpenEphys | Acquasition Board | |
Wireless recording logger | SpikeGadgets | miniLogger 32 | For wireless recordings in the task |
Wireless recording setup | SpikeGadgets | Main Control Unit (MCU) incl. breakout board and RF transceiver | For wireless recordings in the task |
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