We thank John Olsen (Wisconsin Department of Natural Resources), Tom Cooley, Daniel O'Brien and Steve Schmitt (Michigan Department of Natural Resources) and Dr. Daniel Walsh (USGS National Wildlife Health Center) for assistance with tissue acquisition. We also thank the Wisconsin State Laboratory of Hygiene for diagnostic testing services, and Dr. Tonie Rocke and her staff (USGS National Wildlife Health Center) for use of equipment. Any use of trade, product, or firm names is for descriptive purposes only and does not imply endorsement by the U.S. Government.

travaux animale menée à la National Wildlife Health Center USGS a été réalisée en conformité avec l&#39;Office de lignes directrices NIH Laboratoire bien-être animal et sous protection des animaux et le comité de l&#39;utilisation protocole # EP080716. Tissus d&#39;animaux de chasseurs-récoltés étaient des cadeaux du Wisconsin ou du Michigan ministères des Ressources naturelles. 1. Solution Préparation REMARQUE: Les solutions énumérées ci-dessous sont nécessaires pour la préparation du substrat de dosage de CER dans la section 2 ci-dessous. Préparer chacune de ces solutions de concentration des solutions d&#39;achat d&#39;actions plus élevés; concentrations recommandées pour les solutions d&#39;achat d&#39;actions seront indiqués entre parenthèses après chaque nom chimique respective énumérés. Préparer toutes les solutions fraîches lors de la préparation du substrat et conserver à 4 ° C jusqu&#39;à utilisation. <ol><li> Pour tampon de lyse, préparer une solution de la suivante dans Tris 10 mM, pH 7,5 (Tris 1 M, pH 7,5 solution stock recommandé): 100 mm schlorure de odium (NaCl, 1 M solution mère), l&#39;acide éthylènediaminetétraacétique 10 mM (EDTA, 500 mM EDTA, pH 8,0 solution mère), 0,5% de NP-40 (solution à 10% d&#39;actions), 0,5% de désoxycholate (DOC, 10% solution stock ). </li><li> Pour mémoire tampon de conversion, préparer une solution de dodécylsulfate de sodium à 0,05% (SDS, solution à 10% d&#39;actions) et 0,5% de Triton X-100 (10% de solution de stock) dans une solution saline tamponnée phosphate (PBS, 10, pH 7,4 solution mère). </li><li> Pour les solutions chaotropiques, préparer deux solutions 3 M de chlorhydrate de guanidine (GdnHCl, 8 M stock) en 1x PBS (solution 10x de stock). Ajuster le pH de l&#39;une des solutions à 3,5 ± 0,05 avec de l&#39;acide chlorhydrique concentré (HCl). Vérifier que le pH de la deuxième solution se maintient à un pH de 7,4 ± 0,05 et ajuster en utilisant du HCl concentré ou d&#39;hydroxyde de sodium (NaOH), si nécessaire. </li></ol> 2. Préparer Paires CER Assay Substrate <ol><li> Obtenir le tissu cérébral sain, non-TSE-infecté à partir d&#39;espèces d&#39;intérêt et de préparer un volume poids par 10%(P / v) dans du tampon d&#39;homogénat de lyse en utilisant l&#39;une des méthodes suivantes: Dounce, broyeur à billes, ou homogénéisation mortier et un pilon. Affiner plus loin homogénats résultant en les soumettant à seringue-aiguille et l&#39;homogénéisation à l&#39;aide d&#39;aiguilles de calibre croissant jusqu&#39;à ce que le substrat peut être aspiré et expulsé avec facilité par une aiguille G 27 de la seringue. <ol><li> Pour les substrats préparés à partir de rongeurs et autres petits mammifères, homogénéiser cerveau (s) ensemble; pour les substrats préparés à partir de grands mammifères, utiliser obex (tronc cérébral) tissus pour préparer homogénats. Lors de la sélection de la quantité d&#39;homogénat de cerveau, la préparation ne dépassant pas 50% de la capacité de la centrifugeuse utilisée pour la précipitation des protéines à l&#39;étape 2.6. </li><li> Si la qualité du tissu cérébral acquis est discutable, évaluer les niveaux PrP C par SDS-PAGE 16 et 17 immunoblot avant substrat préparation. </li></ol></li><li> Divisez homogénat de cerveau en deux volumes égaux dans des tubes coniques distincts étiquetés plastique. Ajouter GdnHCl (3 M dans une solution PBS) à pH 3,5, soit 7,4 ou de chaque tube dans un rapport 1: 1 en volume d&#39;homogénat de cerveau. </li><li> Vérifiez les valeurs de pH des deux solutions. Ajuster le pH du substrat pH 3,5 à pH 0,05 ± utilisant du HCl concentré. Se assurer que le pH de l&#39;autre substrat reste à un pH de 7,4 ± 0,05 et ajuster le pH si nécessaire avec de l&#39;HCl ou de NaOH selon les besoins. Évitez dépassement des valeurs de pH par addition judicieuse d&#39;acide ou de base. </li><li> Tournez solutions sur un mélangeur à tambour-end à la température ambiante (RT) pendant 5 heures. </li><li> Précipiter la protéine en ajoutant quatre volumes de méthanol à la solution de substrat dans chaque tube conique, vortex pour bien mélanger et incuber à 20 ° C pendant 16-18 h. </li><li> Les échantillons de sédiments par centrifugation à 13 000 g pendant 30 min à 4 ° C. Décanter avec soin et jeter le surnageant et laisser se évaporer le methanol à partir des pastilles. Utilisation des applicateurs en coton-tige pour aider à l&#39;absorption du methanol est attachée à l&#39;intérieur du tube. Ne pas permettre à plus de pellets-dry methanol et une fois ne est plus visible, passer à l&#39;étape suivante. </li><li> Pastilles de protéines remettre en suspension dans un tampon de conversion. Utilisation d&#39;une quantité de tampon de conversion égal à la quantité de matériau de départ d&#39;homogénat cérébral distribué dans chaque tube à l&#39;étape 2.2. NOTE: Il est essentiel que le tampon de conversion utilisé pour remettre en suspension les granulés de protéines à la fois un pH de 3,5 et de préparations de substrat 7,4-traités est la solution définie à l&#39;étape 1.2 ci-dessus (qui contient de faibles niveaux de détergents et un pH physiologique). </li><li> Brièvement soniquées solutions de substrat dans un sonicateur à cuphorn (10 sec à ~ 30% puissance maximale), portion dans 0,5 à 1,0 ml par étiquetés 1,5 ml microtubes. Effectuer un immunoblot de contrôle de qualité (étape 2.9) sur une partie aliquote de chaque substrat. Stocker d&#39;autres aliquotes à -80 ° C jusqu&#39;au moment d&#39;effectuer dosage de CER (section 4). </li><li> Effectuer un contrôle de qualité sur les paires de substrat de CER avant de les utiliser (figure 2). Ces étapes se assurer que les substrats de CER seront provide des résultats optimaux dans les études de conversion. <ol><li> Assurer des quantités comparables de PrP C dans les deux substrats. Comparer les niveaux de PrP en 10-25 ul de chaque substrat par 16 SDS-PAGE et immunotransfert 17. Si les niveaux de protéine dans le pH 7,4 et 3,5 substrats sont dans ~ 10% de l&#39;autre, les paires de substrat sont appropriés pour une utilisation dans des études de CER. REMARQUE: Les immunoblots PrP ne devraient pas montrer des preuves de la dégradation importante PrP C. L&#39;immunoréactivité PrP devrait être essentiellement&gt; 20 kDa. Bandes moins de cette masse moléculaire peuvent être produits de dégradation. Modèles baguage devraient être à peu près équivalente entre les paires de substrat. </li><li> Comme la PrP C dans les deux substrats devrait être PK sensibles, traiter 10-25 ul de chaque substrat avec PK à une concentration finale de 100 pg / ml et digérer des échantillons à 1000 rpm à 37 ° C pendant 1 heure dans le thermo-agitateur. Évaluer tout signal PrP reste par SDS-PAGE 16 et 17 immunotransfert.Substrats avec PrP res ne sont pas appropriés pour une utilisation dans les études de CER. </li></ol></li></ol> 3. Préparer agent de l&#39;EST Seeds <ol><li> Obtenir tissu cérébral TSE-infectés par des espèces d&#39;intérêt et de préparer un 10% (p / v) dans homogénat 1x PBS pH 7,4 en utilisant les méthodes énumérées à l&#39;étape 2.1 ci-dessus. NOTE: Semences pourraient également être produits à partir d&#39;autres tissus TSE-infectés en dehors du système nerveux central, cependant, l&#39;efficacité de la conversion de substrats dérivé du cerveau par des graines provenant de tissus périphériques TSE-infectées n&#39;a pas encore été évalué expérimentalement dans la littérature publiée. </li><li> Aliquote homogénat (s) en 100 résultant - 300 volumes ul dans 0,5 ml microtubes et conserver à -80 ° C jusqu&#39;au moment d&#39;effectuer le test de CER. </li></ol> 4. CER Assay NOTE: Le test de CER implique plus d&#39;une quantité relativement faible de PrP TSE (fourni dans la «semence») d&#39;une espècedans un excès relatif de PrP C (fourni dans le cerveau non infecté &quot;substrat&quot;) d&#39;une autre espèce qui a été partiellement dénaturées soit à pH 3,5 ou 7,4. Après une période d&#39;incubation secouant étendu, la conversion du modèle mécanique de PrP C par PrP EST dans chaque réaction est évaluée par le signal densitométrique de la PrP res restant après digestion avec PK et la détection de immunoblot. La comparaison des niveaux de PrPres dans les substrats précédemment dénaturés à un pH de 3,5 par rapport à 7,4 donne une mesure de la barrière des espèces. Une vue d&#39;ensemble expérimental de cette procédure de test est fourni à la figure 1. <ol><li> Décongeler lentement non infectées paires de substrat de CER (dosage nécessite des volumes égaux de substrats préalablement dénaturé à la fois à 3,5 pH et 7,4) et des solutions de semences TSE-infectés en les plaçant sur le dessus d&#39;un lit de glace (environ 1 heure de temps de dégel). </li><li> Une fois complètement décongelé, aspirer puis expulser chaque solution de substrat à travers une27 G aiguille de la seringue à plusieurs reprises pour re-homogénéiser. Brièvement soniquer chaque solution de semences TSE-infectées pendant 10 secondes à ~ 30% de la puissance maximale. Gardez toutes les solutions sur la glace lors de la préparation des réactions de conversion. </li><li> Label 5 tubes individuels faibles contraignantes, à paroi mince PCR par agent de l&#39;EST à l&#39;essai. </li><li> Préparer les réactions de conversion dans ces tubes en ajoutant 5 ul de solution de semences infectés par l&#39;EST 10% à 95 ul de (a) substrat CER préparés à pH 7,4 et (b) de substrat CER préparé à pH 3,5. <ol><li> Pour chaque échantillon expérimental, préparer réactions parallèles en paires de substrat CER préalablement dénaturé à la fois à pH 3,5 et 7,4. </li><li> Optimiser ratios de TSE semences d&#39;agent pour substrat de cerveau infecté par la détermination empirique. Semences communes: ratios de substrat employé de maintenir un volume de réaction total de 100 pi et pi comprennent 1:99, 2:98 et 5:95 ul ul. Pour la plupart des applications, la graine 5:95 ul: rapport de volume de substrat est approprié et ce qui est est présenté dans eest le protocole. </li></ol></li><li> Préparer trois échantillons de contrôle par agent de l&#39;EST à l&#39;essai comme suit: (a) ajouter 5 pi de solution de semences TSE-infecté 10% à tampon de conversion de 95 pi de contrôle pour entrée PrPres; ajouter un tampon de conversion de 5 ul à 95 ul de substrat préparé en (b) pH 3,5 et (c) à pH 7,4 en tant que témoins pour la conversion non-basé sur un modèle non spécifique. </li><li> Vortex brièvement chaque échantillon dans son tube de PCR fermé de mélanger les semences et le substrat ainsi. Suivi par une impulsion momentanée d&#39;une faible vitesse de paillasse mini-centrifugeuse pour éliminer tout le volume du mélange réactionnel piégé dans le couvercle de tube de PCR. </li><li> Charger les échantillons dans des tubes PCR individuellement marqués dans une paillasse thermo-agitateur équipé d&#39;accepter tubes PCR. Secouez échantillons à 1000 rpm à 37 ° C pendant 24 heures. </li><li> Suite à agitation, ajouter Sarkosyl à une concentration finale de 2% (p / v) et PK à une concentration finale de 100 ug / ml. Échantillons Digest à 1000 rpm à 37 ° C pendant 1 heure dans le thermo-agitateur. NOTE: Ajout de sarkosyl à des échantillons d&#39;aides post-conversion en PK digestion de PrP C. Signaux faux positifs dans des échantillons non ensemencés (étape 4.5) sont pratiquement éliminés par addition de sarkosyl. </li><li> Ajouter du tampon d&#39;échantillon SDS-PAGE, les échantillons de chaleur à 95 ° C pendant 5 minutes et résoudre PrP res restants dans chaque échantillon par SDS-PAGE suivie d&#39;un immunotransfert 16 17. REMARQUE: Après addition de tampon d&#39;échantillon et le chauffage, les échantillons peuvent être traités immédiatement ou les échantillons peuvent être stockés à -20 ° C ou -80 ° C avant l&#39;immunotransfert. Toutes les données présentées ici ont été générés en utilisant du gel et des systèmes d&#39;échange Novex NuPAGE. Des échantillons individuels de l&#39;essai de RGC ont été traitées avec un tampon d&#39;échantillon et l&#39;agent réducteur selon les instructions du fabricant. Les échantillons ont été ensuite chauffés à 95 ° C pendant 5 min et 30 ul de chaque échantillon ont été chargés dans un 12% de Bis-Tris gels préfabriqués. </li><li> Calculer le rapport de rendement de conversion (CER) comme une mesurede barrière des espèces. Mesurer les niveaux de PrPres par densitométrie 17 et divisent la densité totale de l&#39;échantillon pH 7,4 par celle du pH 3,5 échantillon. Multiplier par 100 pour produire un pourcentage. </li><li> Compiler les données de répétitions expérimentales indépendantes pour générer une moyenne ± écart-type CER pour une espèce avec un agent de l&#39;EST donné. </li></ol>

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The authors have nothing to disclose.

Pour la réussite de ce protocole, l&#39;attention devrait être accordée aux niveaux PrP C dans le tissu cérébral infecté utilisé pour la préparation du substrat (étape 2.1.2) et la semence au substrat ratio pour les réactions de conversion (étape 4.4.2). Dans notre expérience, le cerveau peuvent être extraites pour une utilisation comme substrat de CER après un post-mortem de longue période, aussi longtemps que la PrP C est présent par immunoblot (Figure 4). En fait...

Encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST, maladies à prions) sont un groupe de maladies neurodégénératives fatales avec des périodes d&#39;incubation prolongées qui touchent une variété d&#39;animaux et les humains. L&#39;agent étiologique présumé des EST est constitué d&#39;un isomère mal repliée de la protéine prion hôte (PrP), qui est capable d&#39;auto-propagation par conversion du modèle mécanique de la forme cellulaire normale de la PrP (PrPc) en un infectieuse, associée aux maladies forme (PrP EST) qui se accumule dans les tissus du système nerveux central de l&#39;hôte infecté 1. Prions de mammifères infectieuses transmettent généralement de l&#39;hôte à hôte d&#39;une manière spécifique à l&#39;espèce, qui a donné naissance au concept de la «TSE espèces barrière» limitant événements de transmission inter-espèces 2. Les déterminants biologiques de la barrière des espèces de prion ne sont pas bien comprises. similarité de séquence d&#39;acides aminés entre la PrP infectieux des EST et l&#39;hôte PrP C cUne influence fortement si la conversion a lieu 3-5, mais reste insuffisante pour expliquer tous les événements de transmission du prion observés in vivo 6,7. Ainsi, la caractérisation des barrières d&#39;espèces TSE se est largement appuyée sur des études de provocation des animaux: exposer les animaux naïfs d&#39;une espèce donnée aux prions de l&#39;autre et la mesure du temps d&#39;incubation résultant d&#39;apparition de la maladie et le taux d&#39;attaque comme indicateurs de l&#39;efficacité de la transmission. Souris exprimant la PrP C à partir d&#39;espèces hétérologues sont également utilisés pour ce type d&#39;étude 8. Les coûts associés à la production de souris transgéniques et des essais biologiques à prions prolongées, ainsi que des considérations éthiques de l&#39;utilisation des animaux, sont des obstacles à une enquête expérimentale de TSE barrières d&#39;espèces. Évaluation de la barrière d&#39;espèce humaine aux EST se appuie sur des souris modifiées pour exprimer humaine PrP C. Ces souris exigent longues périodes d&#39;incubation de succomber aux EST ou des modifications à T humainsil molécule humaine PrP C pour la maladie rapide apparition 9. La période d&#39;incubation des EST non humain chez ces souris peuvent se étendre au-delà de la durée de vie de souris normale rend l&#39;interprétation des résultats négatifs difficiles. Les primates non humains ont également été utilisés comme procurations pour étudier les barrières d&#39;espèces humaines, mais ces études souffrent avec les mêmes défis que les autres types de l&#39;expérimentation animale et les primates non humains ne peut pas résumer précisément la maladie car elle procède de l&#39;hôte humain. essais biologiques des animaux restent la méthode «étalon-or» pour mesurer la sensibilité d&#39;une espèce à une EST, mais les obstacles, les coûts et l&#39;éthique de ces études d&#39;animaux vivants ont contraint enquête sur des solutions de rechange. Un certain nombre d&#39;essais in vitro, fondées sur l&#39;évaluation de la conversion de l&#39;hôte PrP C à une protéinase K (PK) de l&#39;Etat, résistante (de PrPres) lorsque ensemencée par PrP TSE, ont été développées et utilisées pour étudier TSE spECIES barrières 10-12. Des exemples de tests in vitro comprennent analyses sans cellules conversion, mauvais repliement des protéines amplification cyclique (PMCA), et le taux de rendement de conversion (CER) de dosage 10-14. Bien qu&#39;aucun de ces tests prennent en compte des facteurs périphériques impliqués dans les barrières d&#39;espèces après l&#39;infection naturelle, tout le monde peut être utile pour identifier les hôtes potentiellement sensibles pour les EST. Ici, nous présentons le protocole pour l&#39;essai de CER, dans lequel deux substrats dénaturées PrP C dérivés de homogénats de cerveau normales sont utilisées dans paillasse réactions de conversion du prion (figure 1) 13. PrP C dans le substrat dénaturée à pH 7,4 ne peut être converti en PrPres par PrP EST ensemencées dans la réaction en l&#39;absence d&#39;une barrière de 14 espèces. En revanche, la dénaturation de la PrP C dans l&#39;autre substrat à pH 3,5 permet d&#39;être converti en une incubation de PrP suivantavec PrP EST provenant de toute espèce et sert de contrôle pour la conversion. Le rapport de conversion de la PrPc en PrPres à pH 7,4 substrat par rapport à celui du substrat pH 3,5 donne une mesure de la barrière des espèces. Nous avons trouvé que le dosage de CER prédit connu barrières d&#39;espèces de souris de laboratoire à divers EST et ont utilisé le test dans les efforts pour prédire la barrière des espèces de nombreuses espèces de mammifères, y compris le mouflon d&#39;Amérique, à la maladie du dépérissement chronique (MDC) et autres EST 14, 15. Les enquêteurs se intéressent à un outil permettant le dépistage rapide des EST barrières d&#39;espèces ou de l&#39;évaluation de la conversion de PrP C de-PrP trouveront cette méthodologie utile.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="944">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:205px;">Company</td>
			<td style="width:157px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:287px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">12% Bis-Tris SDS-PAGE gels</td>
			<td style="width:205px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:157px;">NP0342</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">0.5 mm zirconium oxide beads</td>
			<td style="width:205px;">Next Advance</td>
			<td style="width:157px;">ZROB05&#160;</td>
			<td style="width:287px;">Other varieties of beads are also effective</td>
		</tr>
		<tr height="66">
			<td height="66" style="height:66px;width:296px;">Antibodies</td>
			<td style="width:205px;">various suppliers</td>
			<td style="width:157px;"></td>
			<td style="width:287px;">Select appropriate primary and secondary antibodies for immunoblot detection of PrPres from species of interest</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Bead homogenizer</td>
			<td style="width:205px;">Next Advance</td>
			<td style="width:157px;">BBY24M</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Centrifuge&#160;</td>
			<td style="width:205px;">Beckman Coulter</td>
			<td style="width:157px;">369434</td>
			<td style="width:287px;">High speed with temperature control</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Conical tubes</td>
			<td style="width:205px;">any brand</td>
			<td style="width:157px;"></td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Cotton-tipped applicator</td>
			<td style="width:205px;">Uline</td>
			<td style="width:157px;">S-18991</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Cuphorn sonicator</td>
			<td style="width:205px;">Heat Systems-Ultrasonics</td>
			<td style="width:157px;">W-380</td>
			<td style="width:287px;">Heat Systems-Ultrasonics, Inc. is now Qsonica, LLC</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:296px;">Densitometry software program</td>
			<td style="width:205px;">UVP</td>
			<td style="width:157px;">Vision Works LS Image Acquisition and Analysis software</td>
			<td style="width:287px;">Other programs, such as NIH ImageJ, will also work</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Dounce homogenizer</td>
			<td style="width:205px;">Kimble Chase</td>
			<td style="width:157px;">885300</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">End-over-end mixer</td>
			<td style="width:205px;">Labnet International</td>
			<td style="width:157px;">H5600</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ethylenediaminetetra acetic acid</td>
			<td style="width:205px;">Boston Bioproducts</td>
			<td style="width:157px;">P-770</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: eye irritation</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Guanidine hydrochloride, 8M</td>
			<td style="width:205px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">24115</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: acute toxicity, skin irritation, eye irritation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Heating block</td>
			<td style="width:205px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">11-718</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hydrochloric acid</td>
			<td style="width:205px;">Sigma-Aldrich&#160;</td>
			<td style="width:157px;">435570</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: strong acid</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;">Lithium dodecyl sulfate sample buffer, 4X</td>
			<td style="width:205px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:157px;">NP0008</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: skin &#38; respiratory irritation, serious eye damage, flammable solid</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">Methanol</td>
			<td style="width:205px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">A454-4</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: acute toxicity, flammable liquid</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Microcentrifuge tubes</td>
			<td style="width:205px;">any brand</td>
			<td style="width:157px;"></td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Mini-centrifuge</td>
			<td style="width:205px;">Labnet International</td>
			<td style="width:157px;">C1301</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;">N-lauroyl-sarcosine (sarkosyl)</td>
			<td style="width:205px;">Sigma-Aldrich&#160;</td>
			<td style="width:157px;">L-5125</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: acute toxicity, skin irritation, eye damage</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Nonidet P-40</td>
			<td style="width:205px;">Amresco</td>
			<td style="width:157px;">M158</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: skin irritation, eye damage</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:296px;">SDS-PAGE gel system</td>
			<td style="width:205px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:157px;">NuPAGE electrophoresis system</td>
			<td style="width:287px;">Other SDS-PAGE systems will also work</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">PCR tubes (low-binding)</td>
			<td style="width:205px;">Axygen</td>
			<td style="width:157px;">PCR-02-L-C</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Pestle homogenizer</td>
			<td style="width:205px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">03-392-106</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">pH meter</td>
			<td style="width:205px;">Sentron</td>
			<td style="width:157px;">SI600</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Polyvinyldifluoride membrane</td>
			<td style="width:205px;">Millipore</td>
			<td style="width:157px;">IPVH00010</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Proteinase K</td>
			<td style="width:205px;">Promega</td>
			<td style="width:157px;">V3021</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: skin &#38; eye irritation, respiratory sensitisation, organ toxicity</td>
		</tr>
		<tr height="23">
			<td height="23" style="height:23px;width:296px;">Reducing agent for SDS-PAGE samples, 10X</td>
			<td style="width:205px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:157px;">NP0009</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Sodium Chloride</td>
			<td style="width:205px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">7647-14-5</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Sodium deoxycholate</td>
			<td style="width:205px;">Sigma-Aldrich&#160;</td>
			<td style="width:157px;">D6750</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: acute toxicity</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Sodium dodecyl sulfate</td>
			<td style="width:205px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">28364</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: acute toxicity, skin irritation, eye damage, flammable solid</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Sodium hydroxide</td>
			<td style="width:205px;">Sigma-Aldrich&#160;</td>
			<td style="width:157px;">S5881</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemica; strong base</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Syringe</td>
			<td style="width:205px;">BD Biosciences</td>
			<td style="width:157px;">various</td>
			<td style="width:287px;">Use syringe size appropriate to volumes of substrate to be homogenized</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Syringe needles</td>
			<td style="width:205px;">BD Biosciences</td>
			<td style="width:157px;">various</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Thermoshaker (PCR tube shaker)</td>
			<td style="width:205px;">Hangzhou All Sheng Instruments</td>
			<td style="width:157px;">MS-100</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Tris base</td>
			<td style="width:205px;">Bio Basic&#160;</td>
			<td style="width:157px;">77-86-1</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: skin, eye, respiratory irritation</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:296px;">Triton X-100</td>
			<td style="width:205px;">Integra Chemical Company</td>
			<td style="width:157px;">T756.30.30</td>
			<td style="width:287px;">Hazardous chemical: acute toxicity, eye irritation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:296px;">Vortexer</td>
			<td style="width:205px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:157px;">12-812</td>
			<td style="width:287px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

assessing transmissible spongiform encephalopathy species barriers with an in vitro prion protein conversion assay

Studies to understanding interspecies transmission of transmissible spongiform encephalopathies (TSEs, prion diseases) are challenging in that they typically rely upon lengthy and costly in vivo animal challenge studies. A number of in vitro assays have been developed to aid in measuring prion species barriers, thereby reducing animal use and providing quicker results than animal bioassays. Here, we present the protocol for a rapid in vitro prion conversion assay called the conversion efficiency ratio (CER) assay. In this assay cellular prion protein (PrPC) from an uninfected host brain is denatured at both pH 7.4 and 3.5 to produce two substrates. When the pH 7.4 substrate is incubated with TSE agent, the amount of PrPC that converts to a proteinase K (PK)-resistant state is modulated by the original host&#8217;s species barrier to the TSE agent. In contrast, PrPC in the pH 3.5 substrate is misfolded by any TSE agent. By comparing the amount of PK-resistant prion protein in the two substrates, an assessment of the host&#8217;s species barrier can be made. We show that the CER assay correctly predicts known prion species barriers of laboratory mice and, as an example, show some preliminary results suggesting that bobcats (Lynx rufus) may be susceptible to white-tailed deer (Odocoileus virginianus) chronic wasting disease agent.

L&#39;utilisation réussie de l&#39;essai de CER dépend en grande partie la qualité de la paire de substrats utilisés dans les réactions de conversion. Pour cette raison, les procédures pour préparer paires de substrat CER suivant, un immunoblot de contrôle de la qualité doit être effectuée (Figure 2). Pour les deux substrats, un dosage de 10 à 25 ul par immunotransfert. PrP C doit être facilement détectable dans chaque substrat et les niveaux de PrP C doit être appro...

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Assessing Transmissible Spongiform Encephalopathy Species Barriers with an In Vitro Prion Protein Conversion Assay

Measuring the barrier to the interspecies transmission of prion diseases is challenging and typically involves animal challenges or biochemical assays. Here, we present an in vitro prion protein conversion assay with the ability to predict species barriers.

Évaluation de l&#39;encéphalopathie spongiforme transmissible barrières d&#39;espèces avec une<em&gt; In Vitro</em&gt; Test Prion de conversion des protéines

Studies to understanding interspecies transmission of transmissible spongiform encephalopathies (TSEs, prion diseases) are challenging in that they ...

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Research

JoVE Journal

Medicine

Assessing Transmissible Spongiform Encephalopathy Species Barriers with an In Vitro Prion Protein Conversion Assay

7.7K vues.  USGS National Wildlife Health Center. Measuring the barrier to the interspecies transmission of prion diseases is challenging and typically involves animal challenges or biochemical assays. Here, we present an in vitro prion protein conversion assay with the ability to predict species barriers.