Nous développons des systèmes immunitaires optiques et des algorithmes informatiques pour enregistrer et analyser la neuroactivité de l’ensemble du cerveau avec une résolution spatiale et temporelle élevée. Le poisson de laboratoire est un animal modèle idéal pour la recherche. Grâce à chaque transparence optique et à la disponibilité de divers outils génétiques, la qualité de l’image optique peut être dégradée en raison de l’aberration introduite par le gel d’agarose utilisé pour le montage des échantillons, et les poissons peuvent se déplacer pendant l’enregistrement, provoquant des artefacts de mouvement dans les images ou empêchant l’extraction du signal de précision des images.

Les protocoles accessibles au public ne fournissent qu’un bref aperçu de la procédure expérimentale, des parties substantielles vivantes des détails, tels que les techniques de montage précis de solidification de l’agarose et le positionnement simple. Par conséquent, un protocole efficace et reproductible est nécessaire pour acquérir des données d’image de haute qualité. Avec un minimum de bruit et de mouvement.

Notre protocole fournit une procédure expérimentale optimisée et reproductible. Ce protocole permet l’imagerie in vivo du cerveau entier sur une période prolongée et la visualisation des données d’imagerie acquises. Le flux de travail s’est concentré sur l’imagerie du cerveau entier, mais il peut être facilement appliqué à l’imagerie d’autres organes de beaucoup de nos poissons zèbres.

Notre objectif est de démêler les principes sous-jacents du calcul neuronal. Pour cela, nous continuerons à travailler sur un pipeline qui implique l’imagerie à grande échelle de l’activité et de la structure neuronales et l’analyse informatique de celle-ci pour la cartographie systématique du cerveau.