Estamos desenvolvendo sistemas imunológicos ópticos e algoritmos computacionais para registrar e analisar a neuroatividade de todo o cérebro com alta resolução espacial e temporal. O peixe de laboratório é um animal modelo ideal para pesquisa. Graças a cada transparência óptica e à disponibilidade de diversas ferramentas genéticas A qualidade óptica da imagem pode ser degradada devido à aberração introduzida pelo gel de Agarose usado para a montagem da amostra, e os peixes podem se mover durante a gravação causando artefatos de movimento nas imagens ou impedindo a extração do sinal de precisão das imagens.
Protocolos disponíveis publicamente fornecem apenas uma breve visão geral do procedimento experimental, vivendo partes substanciais dos detalhes, como solidificação de agarose, técnicas de montagem precisas e posicionamento simples. Portanto, um protocolo eficaz e reprodutível é necessário para a aquisição de dados de imagem de alta qualidade. Com o mínimo de ruído e movimento.
Nosso protocolo fornece um procedimento experimental otimizado e reprodutível. Este protocolo permite imagens in vivo de todo o cérebro por um período prolongado e visualizações dos dados de imagem adquiridos. O fluxo de trabalho se concentrou em imagens de todo o cérebro, mas pode ser facilmente aplicado a imagens de outros órgãos de muitos de nossos peixes-zebra.
Nosso objetivo é desvendar os princípios subjacentes da computação neural. Para isso, continuaremos a trabalhar em um pipeline que envolve imagens em larga escala da atividade e estrutura neural, e análise computacional de tais para mapeamento cerebral sistemático.
