Quantification des phénotypes oculaires de Drosophila melanogaster : une approche computationnelle intégrant ilastik et Flynotyper

Nous nous intéressons au développement de modèles de maladies telles que la SLA, la DFT et la protéinopathie multisystémique afin de comprendre leurs pathologies moléculaires. L’un des modèles que nous utilisons est le système oculaire de la drosophile. La régularité et la symétrie de l’œil peuvent être utilisées pour évaluer l’effet de l’introduction de mutations et de changements d’expression génique.

Notre protocole comble une lacune dans les moyens de quantifier les phénotypes de l’œil rugueux, en particulier, l’écart créé par le classement manuel. Le classement manuel est basé sur la fusion, la perte d’ommatidies et l’organisation des poils. Cependant, cela peut conduire à des préjugés.

Par conséquent, la combinaison d’ilastik et de Flynotyper crée une méthode plus robuste pour classer les phénotypes oculaires anormaux. Notre protocole peut être avantageux pour le classement manuel en raison de sa robustesse. Même les membres du laboratoire non formés peuvent effectuer une quantification réussie, tandis qu’un chercheur plus formé est probablement nécessaire pour le classement manuel afin d’éviter les différences de score à score entre deux chercheurs différents.

Par conséquent, ce protocole peut économiser du temps et des ressources. Nos résultats font avancer la recherche car ce protocole permet une quantification plus précise des phénotypes de l’œil rugueux, en particulier les faibles altérations de la morphologie de l’œil, En raison du biais lors du classement manuel, la combinaison d’ilastik et de Flynotyper conduira à un score plus précis, et donc, entraînera des résultats publiés plus précis.