כדי לקבל תרחיף חד-תאי ממוח תא העצב המבודד, הניחו את המוח בכוס מקוררת מראש של 15 מיליליטר Dounce homogenizer המכילה כמות מתאימה של תמיסת מלח מאוזנת של הנקס, או חיץ HBSS. השתמש במזיק Dounce הרופף כדי לנתק בעדינות ובאיטיות את רקמת המוח עם כ -100 עד 120 פעימות על קרח. סנן את תרחיף רקמת המוח שנוצר דרך מסננת תאים של 70 מיקרון בצינור צנטריפוגה של 50 מיליליטר.
שטפו את צינור Dounce עם חמישה מיליליטר HBSS והמשיכו בסינון כדי למקסם את איסוף התאים. צנטריפוגה את תרחיף הרקמה המסונן ב 550 גרם במשך שש דקות בארבע מעלות צלזיוס. הסר את הסופרנאטנט באמצעות שואב ואקום, והשהה מחדש את חיך התא בתמיסת שיפוע צפיפות איזוטונית של 30%.
מעבירים את מתלה התא לצינור צנטריפוגה של 15 מיליליטר. הוסף כמות מתאימה של תמיסת שיפוע צפיפות של 30%, והפוך בעדינות את הצינור כדי להבטיח ערבוב יסודי. מיד צנטריפוגה את הצינור ב 845 גרם עם האצה ובלם להגדיר ברמה שלוש במשך 20 דקות בארבע מעלות צלזיוס.
לאחר שתסיים, הסר בעדינות את הצינור מהצנטריפוגה מבלי לרעוד, ושאפו בזהירות את שכבת המיאלין העליונה באמצעות קצה מיליליטר המחובר לוואקום. לאחר מכן שאפו את הסופרנטנט, השאירו מאחור מיליליטר אחד עד שניים, והשעו מחדש את חיך התא עם מינימום של 10 מיליליטר HBSS קר. צנטריפוגה ב 550 גרם במשך שש דקות בארבע מעלות צלזיוס.
שטפו פעם נוספת עם מינימום של שבעה מיליליטר HBSS קר, וצנטריפוגה שוב. לאחר הסרת כמה שיותר מהסופרנאטנט, יש להשהות מחדש את התאים ב-100 עד 200 מיקרוליטר של מאגר ציטומטריית זרימה לצורך ניתוח ציטומטריית זרימה.