מעבדת HTX מציעה גישה מקוונת לחלבון אוטומטי לחלוטין לצינורות מובנים שניתן ליישם כדי לפתור מבנים חדשים, ולבצע סינון שברים ולגאני בקנה מידה גדול יותר. באמצעות השילוב של טכנולוגיית CrystalDirect לקצירת קריסטלים אוטומטית וקירור CRI בתוכנת CRIM, שם מדענים יכולים לשלוט בכל תהליך הקריסטלוגרפיה דרך האינטרנט. התחל על-ידי פתיחה וכניסה למערכת ניהול המידע הגרפי של Crystal בדפדפן אינטרנט ולחץ על תפריט דוגמאות כדי לפתוח ממשק עם הפרוייקט בכלי ניהול לדוגמה.
לחץ על דוגמה חדשה ובחלון לדוגמה, הזן את המידע המבוקש ולחץ על שמור ובקש. בלוח הבקשות, בחר את פרוטוקול ההתגבשות, את טמפרטורת הדגירה, את מסכי ההתגבשות שישמשו ואת התאריך הרצוי לניסויים שאמורים להיות תואמים לזמן הנדרש למשלוח הדגימה. השתמש בשדות ההערות כדי לספק אינדיקציות לגבי הדגימות החשובות למפעילי מעבדת HDX לדעת.
לאחר ההגשה, בקשת ההתגבשות תאומת על ידי צוות מעבדת התגבשות התפוקה הגבוהה. אישור על תזמון הניסוי יישלח בדוא"ל. עם הגעת הדגימה למתקן.
אנשי המעבדה יקימו את הניסוי, ישלחו אישור על ההתקנה בדוא"ל ויעבירו את מגשי ההתגבשות לדימויים האוטומטיים. CRIMS יספק גישה לכל הפרמטרים הניסיוניים ויעקוב אחר מפגשי הדמיה חדשים בזמן אמת. כאשר תמונות חדשות יהיו זמינות, התראות בדואר אלקטרוני יישלחו באופן אוטומטי.
כדי לראות את התמונות מלוחות ההתגבשות, פתח את תפריט הצלחות ונווט אל המדגם. לחץ על תצוגה כדי לראות את הפעלת ההדמיה האחרונה או לחץ על סימן ההרחבה כדי לבחור הפעלת הדמיה אחרת ולבדוק את היסטוריית השחרור. כדי לסנן דוגמאות עבור פרוייקט נבחר.
לחץ על תיבת הפרוייקט הספציפית. פונקציות חיפוש זמינות גם עבור רוב עמודות הטבלה. כדי להעריך ולהבקיע את תוצאות ניסויי ההתגבשות, בחר את ממשק תצוגת הלוח ונווט בין הקירות השונים של לוחות ההתגבשות.
בחרו את סוג התמונה ובחרו את איכות התמונה או רשמו את הציונים. ממשק התצוגה מספק גם את כל הפרמטרים הניסיוניים המשמשים לניסויי ההתגבשות, כולל הרכב פתרון ההתגבשות. לעיצוב מסכי מיטוב קריסטל בהתבסס על תנאי הפגיעה העיקריים שזוהו באמצעות ההקרנה הראשונית, פתחו את תפריט עידון ובחרו בתפריט המשנה 'מסכים'.
בחר את סוג הלוח, פתרונות מלאי או תצורות הדרגתיות המתאימות ביותר לעיצוב הניסיוני. ניתן לבקש מ-CRIMS להפיק פלט של קובץ התואם ישירות לפורמולה הרובוטית formulator כדי להזרים באופן אוטומטי את המסכים לצלחת או להפיק פלט של מסמך הניתן להדפסה אך את אמצעי האחסון לפעולה ידנית. לאחר שהקריסטל מתאים לניסויי עקיפה של קרני רנטגן זוהו, נווטו לממשק תצוגת הצלחת והשתמשו בציונים המאוחסנים מראש כדי לבחור את התמונה המתאימה לירידה הנכונה של התגבשות.
לחץ על קצירת קריסטל כדי להקליט תוכנית אוטומטית לקצירת קריסטל מרובוט הקוצר הישיר של הקריסטל. CRIMS יתעד באופן אוטומטי ולאחסן את המיקום של הגבישים שנקטפו לתוך עמוד השדרה או דיסקיות יחידה. לאחר מכן, מפעילים שהמתקן שלנו יסיר את הצלחות עם תוכניות הקציר מהדימויים ויעביר אותם לרובוט CrystalDirect.
לאחר השלמת קצירת הגבישים, הדיסקיות המכילות את הדגימות ממוקמות לתוך CX 100 Dewar או מועברות לסנכרטרון על פי בחירתך. כדי לבדוק את הדגימות מקוררות ההקפאה, פתחו את תפריט קריסטל מנג'ר ובחרו קריסטלים שנקטפו. התמונות של תהליך הקציר, כולל התמונות של הסיכות עם הגבישים שנקטפו יהיו זמינים שם.
כדי ליצור משלוחים לדוגמה עבור ניתוח עקיפה של קרני רנטגן, פתח את תפריט המשלוחים ולחץ על צור משלוח כדי לבחור את סינכרוטרון של עניין ואת מספר התיק. ניתן גם להזין הערות התומכות באיסוף הנתונים וכן פרמטרים מוגדרים מראש לאיסוף נתונים בקווי קרן אוטומטיים לחלוטין. מעבדת HDX מספקת גם גישה להקרנת שברים בקנה מידה גדול אוטומטית לחלוטין.
משאבי CRIMS לעיבוד נתונים אוטומטי ולזיהוי כניסות המבוססים על תוכנת ההשתתפות הגלובלית Pipe Dream, מאפשרים להעריך ולתעדף במהירות תוצאות על פני מאות עד אלפי ערכות נתונים בפרויקט אחד. CRIMS מתקשרת עם מערכות ניהול המידע של סינכרוטרון ומאחזרת מידע על ניסויי עקיפה בפועל. פתח את תפריט קריסטל מנהל ובחר נתוני עקיפה מקריסטל כדי להציג מידע סיכום ואת התוצאות של עיבוד הנתונים הראשוני בסינכרוטרון.
בניתוח מייצג זה, צינורות הקריסטלוגרפיה האוטומטיים שימשו כפי שהודגמו, לזיהוי מבני של חלבונים שונים. כפי שנצפו, שלושה מצבי אישור שונים של פרוטאז מחיידק פתוגניים זוהו תוך זמן קצר מאוד, הודות לרצף המהיר של אופטימיזציה של סינון קריסטל ומדידות עקיפה. צינור זה הוחל לאחרונה גם על זיהוי של שברים, מחייב הן פעיל במספר אתרים אלסטריים של טריפנוסומה ברוסי.
פרנסיל פירופוספט סינתאז אנזים מפתח של הטפיל הגורם טריפנוזומיה אפריקאית אנושית. תהליך זה ממזער את העיכוב בין צמיחת הגביש למדידה, מאיץ את ההתקדמות. זה גם משחרר מדענים מפעולות מורכבות כמו טיפול בגבישים ותפעול קו קרן עיבוד קריסטלוגרפיה, נגיש יותר ללא מומחים.
גישה זו יכולה לתרום לטיפוח מחקר תרגום ולאחר מכן להאיץ את תהליך גילוי הסמים. תרומה לפיתוח תרופות טובות ובטוחות יותר נגד מספר גדול יותר של מטרות.
