HTX实验室提供对结构化管道的全自动蛋白质的在线访问,这些管道可用于解决新结构,并进行更大规模的片段和豆类筛选。通过CrystalDirect技术在CRIM软件上实现自动晶体采集和CRI冷却的结合,科学家可以通过互联网控制整个晶体学过程。首先在 Web 浏览器中打开并登录到 Crystal 图形信息管理系统,然后单击"示例"菜单以在"示例管理工具"中打开与项目的界面。
单击"新建样品",然后在"样品"窗口中输入请求的信息,然后单击"保存并提出请求"。在请求面板中,选择结晶方案、孵育温度、要使用的结晶筛选以及实验所需的日期,这些日期应与样品装运所需的时间相符。使用注释字段提供有关 HDX 实验室操作员需要了解的重要示例的指示。
提交后,结晶请求将由高通量结晶实验室团队进行验证。有关安排实验的确认将通过电子邮件发送。样品到达设施后。
实验室人员将设置实验,通过电子邮件发送设置确认,并将结晶托盘转移到自动成像仪。CRIMS将提供对所有实验参数的访问,并实时跟踪新的成像会话。当新图像可用时,将自动发送电子邮件通知。
要查看结晶板中的图像,请打开"板菜单"并导航到样品。单击视图以查看上次成像会话,或单击展开符号以选择其他成像会话并检查丢弃历史记录。筛选所选项目的示例。
单击特定项目框。搜索函数也可用于大多数表列。要评估和评分结晶实验的结果,请选择板视图界面,并在结晶板的不同壁中导航。
选择图像类型,然后选择图像质量或记录分数。视图界面还提供了用于结晶实验的所有实验参数,包括结晶溶液的组成。要根据初始筛选确定的主要命中条件设计水晶优化屏幕,请打开"细化菜单",然后选择"屏幕"子菜单。
选择最适合实验设计的板类型、库存溶液或梯度配置。可以要求CRIMS输出与配方设计师机器人formactrix直接兼容的文件,以自动将屏幕移液到板中或输出可打印的文档,但体积用于手动操作。一旦确定了适合X射线衍射实验的晶体,请导航到板视图界面,并使用预先存储的分数选择与正确结晶滴相对应的图像。
单击晶体采集,记录晶体直接采集机机器人的自动晶体采集计划。CRIMS会自动记录收获的晶体的位置并将其存储到脊柱或单元圆盘中。接下来,我们的设施将从成像仪中取出带有收获计划的板,并将其转移到CrystalDirect机器人。
晶体收获完成后,将含有样品的圆盘放入CX 100杜瓦瓶中或转移到您选择的同步加速器中。要检查冷冻冷却的样品,请打开晶体管理器菜单并选择收获的晶体。收获过程的图像,包括带有收获晶体的引脚的图像将在那里提供。
要创建用于 X 射线衍射分析的样品货件,请打开货件菜单,然后单击创建货件以选择感兴趣的同步加速器和行李编号。还可以输入支持数据收集的注释以及用于在全自动光束线上收集数据的预定义参数。HDX 实验室还提供全自动大规模片段筛选。
CRIMS资源用于基于全球分阶段软件Pipeline Pipe Dream的自动化数据处理和命中识别,可以快速评估单个项目中数百到数千个数据集的结果并确定其优先级。CRIMS与同步加速器信息管理系统进行通信,并检索有关实际衍射实验的信息。打开晶体管理器菜单并选择晶体衍射数据,以查看摘要信息和同步加速器初始数据处理的结果。
在这种代表性分析中,如所示,使用自动晶体学管道进行不同蛋白质的结构鉴定。如前所述,由于晶体筛选优化和衍射测量的快速连续,在很短的时间内鉴定出来自致病细菌的蛋白酶的三种不同确认状态。该管道最近还应用于片段的鉴定,两者与布鲁氏锥虫的几个抗性细胞位点的活性结合。
焦磷酸法呢基合酶是引起人类非洲锥虫病的寄生虫的关键酶。该过程最大限度地减少了晶体生长和测量之间的延迟,从而加快了进展。它还将科学家从复杂的操作中解放出来,如晶体处理和光束线操作渲染晶体学,非专家更容易获得。
这种方法有助于促进转化研究,然后加快药物发现的过程。有助于开发针对更多靶标的更好,更安全的药物。