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In questo articolo

  • Riepilogo
  • Abstract
  • Introduzione
  • Protocollo
  • Risultati
  • Discussione
  • Divulgazioni
  • Riconoscimenti
  • Materiali
  • Riferimenti
  • Ristampe e Autorizzazioni

Riepilogo

Un sistema di ricombinazione λ-rosso-mediato è stato utilizzato per creare un mutante di delezione di un piccolo microfono di RNA non codificante.

Abstract

Un piccolo RNA non codificante (sRNA) è un nuovo fattore per regolare l'espressione genica a livello post-trascrizionale. Una sorta di sRNA MicC, noto in Escherichia coli e Salmonella Typhimurium, potrebbe reprimere l'espressione delle proteine della membrana esterna. Per studiare ulteriormente la funzione di regolazione della micC in Salmonella Enteritidis, abbiamo clonato il gene micC nel ceppo 50336 di Salmonella Enteritidis, e poi abbiamo costruito il mutante 50336Δ micC con il sistema di ricombinazione λ Red based e il mutante 50336Δ micC/p micC completato che trasporta il plasmide ricombinante pBR322 che esprime micC. I risultati della qRT-PCR hanno dimostrato che la trascrizione di ompD nel micC 50336Δ era 1,3 volte superiore a quella del ceppo wild type, mentre la trascrizione di ompA e ompC nel micC 50336Δ era 2,2 volte superiore e 3 volte superiore a quella del ceppo wild type. Questi indicano che micC reprime l'espressione di ompA e ompC. Nel seguente studio, la patogenicità di 50336ΔmicC è stata rilevata sia infettando topi Balb / c di 6 settimane che polli di 1 giorno. Il risultato ha mostrato che la LD50 del ceppo wild type 50336, i mutanti 50336Δ micC e 50336Δ micC/pmicC per topi Balb/c di 6 settimane erano rispettivamente 12,59 CFU, 5,01 CFU e 19,95 CFU. I ceppi LD 50 per polli di 1 giorno erano rispettivamente 1,13 x 109 CFU, 1,55 x 10 8 CFU e2,54 x 10 8 CFU. Ha indicato che la delezione del micC ha aumentato la virulenza di S. Enteritidis nei topi e nei polli regolando l'espressione delle proteine della membrana esterna.

Introduzione

I piccoli RNA non codificanti (sRNA) sono lunghi 40-400 nucleotidi, che generalmente non codificano proteine ma potrebbero essere trascritti indipendentemente nei cromosomi batterici 1,2,3. La maggior parte degli sRNA sono codificati nelle regioni intergeniche (IGR) tra regioni codificanti geni e interagiscono con gli mRNA bersaglio attraverso azioni di accoppiamento di basi e regolano l'espressione dei geni bersaglio a livello post-trascrizionale 4,5. Svolgono importanti ruoli di regolazione nel metabolismo delle sos....

Protocollo

Tutti gli esperimenti sono stati condotti in conformità con la Guida per la cura e l'uso degli animali da laboratorio del Consiglio Nazionale delle Ricerche. Il comitato per la cura e l'uso degli animali dell'Università di Yangzhou ha approvato tutti gli esperimenti e le procedure applicate sugli animali (SYXK2016-0020).

1. Ceppi batterici, plasmidi e condizioni di coltura

  1. Utilizzare i batteri e i plasmidi elencati nella Tabella 1.
  2. Batteri di coltura in brodo LB o su piastre di agar LB a 37 °C, in presenza di 50 μg/mL di ampicillina (Amp) quando appropriato.
  3. I ceppi di coltura contenenti plasmi....

Risultati

Costruzione del mutante 50336Δ micC e del ceppo complementare 50336Δ micC /pmicC
Il risultato del clone del gene micC ha indicato che questo gene era composto da 109 bp che mostravano un'identità del 100% con quella di S. Typhimurium. Sulla base dei dati di sequenza, il mutante di delezione 50336ΔmicC e il mutante complementare 50336Δ.......

Discussione

S. Enteritidis è un importante patogeno intracellulare facoltativo che può infettare i giovani polli e produce sintomi da enterite a infezione sistemica e morte17,18. Inoltre, S. Enteritidis provoca infezioni latenti nei polli adulti e i portatori cronici contaminano i prodotti avicoli, causando infezioni di origine alimentare nell'uomo19. Il meccanismo patogenetico di S. Enteritidis rimane da sondare ulteriormente........

Divulgazioni

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Riconoscimenti

Questo studio è stato sostenuto da sovvenzioni della Chinese National Science Foundation (Nos. 31972651 e 31101826), Jiangsu High Education Science Foundation (No.14KJB230002), State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology (No.SKLVBF201509), Nature Science Foundation Grant of Yangzhou (No.YZ2014019), un progetto finanziato dal Priority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education Institutions (PAPD).

....

Materiali

NameCompanyCatalog NumberComments
dextroseSangon BiotechA610219for broth preparation
DNA purification kitTIANGENDP214for DNA purification
Ex TaqTaKaRaRR01APCR
KH2PO4Sinopharm Chemical Reagent10017608for broth preparation
K2HPO4Sinopharm Chemical Reagent20032116for broth preparation
L-ArabinoseSangon BiotechA610071λ-Red recombination
Mini Plasmid KitTIANGENDP106plasmid extraction
NaClSinopharm Chemical Reagent10019308for broth preparation
(NH4)2SO4Sinopharm Chemical Reagent10002917for broth preparation
PrimeScriptRRT reagent Kit with gDNA Eraser TaKaRaRR047qRT-PCR
SYBRR Premix Ex Taq IITaKaRaRR820qRT-PCR
T4 DNA LigaseNEBM0202Ligation
TRIzol Invitrogen15596018RNA isolation
TryptoneOxoidLP0042for broth preparation
Yeast extractOxoidLP0021for broth preparation
centrifugeEppendorf5418centrifugation
Electrophoresis apparatusBio-Rad164-5050Electrophoresis
 Electroporation SystemBio-Rad165-2100for bacterial transformation
SpectrophotometerBioTekEpochAbsorbance detection
Real-Time PCR systemApplied Biosystems7500 systemqRT-PCR

Riferimenti

  1. Jørgensen, M. G., Pettersen, J. S., Kallipolitis, B. H. sRNA-mediated control in bacteria: An increasing diversity of regulatory mechanisms. Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms. 1863 (5), 194504 (2020).
  2. Wagner, E. G. H., Romby, P.

Ristampe e Autorizzazioni

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