Inizia pipettando circa 400 microlitri di dissezione e mezzo di imaging in ciascun pozzetto di un piatto di dissezione a tre pozzetti. Lavorando al microscopio a dissezione, lavare le larve sperimentali in dissezione e mezzo di imaging per rimuovere i residui di cibo. Mentre continui a lavorare al microscopio a dissezione, tieni le larve per i ganci della bocca usando una serie di pinzette.
Con un'altra serie di pinzette, tagliare con cura circa 1/3 della larva dal lato posteriore. Successivamente, mentre si tiene la larva per i ganci della bocca usando una serie di pinzette, utilizzare l'altra serie di pinzette per spazzolare delicatamente la cuticola verso i ganci della bocca. Contemporaneamente, spingere verso l'interno con le pinzette che tengono i ganci della bocca fino a quando l'intera larva non viene capovolta.
Capovolgere la larva per esporre il sistema nervoso centrale e altri tessuti mantenendo la loro connessione con la cuticola. Localizzare il sistema nervoso centrale, o SNC, per evitare la rimozione accidentale. Rimuovere delicatamente i tessuti non del SNC usando una pinzetta, mantenendo solo il SNC e il cervello attaccati alla cuticola.
Per liberare il cervello dalla cuticola recidendo le connessioni assonali, usando le forbici da microdissezione, tagliare delicatamente sotto i lobi cerebrali. Quindi, tagliare le connessioni sotto il cordone nervoso ventrale. Sezionare le larve in lotti per mantenere il tempo di dissezione inferiore a 20 minuti.
Trasferire il cervello sezionato in un pozzo contenente il mezzo di dissezione e imaging. Per immagini che durano più di tre ore, integrare il mezzo con corpi grassi.