Screening della modificazione degli istoni mediante cromatografia liquida, spettrometria di mobilità ionica intrappolata e spettrometria di massa a tempo di volo

Viene proposto un metodo che utilizza un protocollo di estrazione degli istoni con un'efficienza del 95%. Insieme a LC-TIMS-ToF MS/MS, in breve tempo, è possibile ottenere uno screening per quei PTM presenti nell'istone. E soprattutto, la possibilità di separare gli isomeri.

La separazione dei peptidi isomerici, sebbene possibile utilizzando la sola spettrometria di massa tandem, è spesso difficile. Incorporando TIMS, introduciamo un'ulteriore dimensione di separazione, semplificando molte identificazioni di isomeri posizionali. Inoltre, la tecnologia passiva aumenta la sensibilità di questi esperimenti, migliorando ulteriormente la nostra capacità di analizzare le variazioni epigenetiche.

Con l'aumento della capacità di identificare le posizioni PTM, arriva la capacità di determinare ulteriormente la correlazione tra vari fattori ambientali o biologici e i loro effetti sull'epigenoma. I metodi che migliorano e facilitano l'analisi degli istoni possono essere applicati a diverse aree di ricerca, tra cui la chimica medica e ambientale. La dinamica della conferma delle proteine in stati nativi o danneggiati sarà stabilita dall'implementazione di TIMS MS/MS con HDX.

Attraverso LC-TIMS-ToF MS/MS e Nano LC-TIMS-ToF MS/MS, verranno tracciate le differenze di PTM esistenti in vari campioni biologici.