Method Article
ここで報告されたプロトコルは、実験室に含まれる小さなケージ試験でベクター制御に向かう遺伝子組み換え蚊の性能を評価する3つの代替方法を示しています。各プロトコルは、蚊株クマ(遺伝子駆動または非遺伝子ドライブ)および測定されたパラメータの種類の特定の改変に合わせて調整されます。
遺伝子組み換えベクターを用いた蚊媒介病原体の制御は、従来の制御戦略を補完する有望なツールとして提案されている。CRISPRベースのホーミング遺伝子駆動システムは、トランスジェニック技術を科学界内でよりアクセスしやすくしました。トランスジェニック蚊の性能の評価と小さな実験室ケージ試験における野生型の比較は、その後のフィールドケージ実験の設計と、疾病予防戦略の改善のための実験評価のための貴重なデータを提供します。ここでは、マラリアのアノフェリン蚊ベクターにおけるトランスジーン拡散を評価するために、実験室の設定で使用される3つの異なるプロトコルを提示する。これには、不浸透性放出(遺伝子駆動システムなし)、遺伝子駆動重複および非重複生成試験が含まれます。3つの試験は、いくつかのパラメータで異なり、所望の実験設定に適応することができる。さらに、小さなケージの昆虫研究は、実験室から開場離れへの操作された昆虫の進行的な移行の一部です。したがって、ここで説明するプロトコルは、最終的にマラリア撲滅のための新しい技術の分野実装を支援する経験的価値を提供するための貴重なツールを表しています。
遺伝子組み換え蚊に基づく戦略は、マラリアを引き起こすようなベクター媒介病原体の伝染を制御するために追求されている。これには、 アノフェレス 蚊の数と密度を減少させることを目的とした技術1)(集団抑制)、または2)ヒト疾患(集団改変、置換、または改変)を担う寄生虫を媒介するベクターの能力を損なうことを目的とした技術が含まれる。これらの遺伝的アプローチは、CRISPR/Cas9ベースの遺伝子ドライブの出現によって強化されており、寄生虫透過蚊の概念実証はペイロード形質の効果的な広がりと、ケージ集団における抗寄生エフェクター分子である。
小さい実験室のケージ試験は、フィールドアプリケーションに向けた彼らのさらなる発展への段階的なアプローチの一部としてトランスジェニック株の特性を評価するための第一歩を表す2。具体的な結果の考慮事項には、競合環境で導入されたDNAの遺伝性、表現型の浸透性と表現力、安定性などがあります。関連する実験設計機能には、ケージの大きさ、蚊密度、複製の数、重複または重複しない世代、年齢構造の標的集団、工学的株の単一または複数の放出、男性のみ、女性専用または男女混合放出、放出比、血液供給源(人工または生きた動物)、スクリーニング手順が含まれる。
ここでは、アノフェリン蚊の菌株を評価するために使用されるプロトコル(遺伝子駆動システムなし)と、Cas9エンドヌクレアーゼとガイドRNA(gRNA)によって媒介される自律的な遺伝子駆動システムを運ぶプロトコルについて説明します。これらのプロトコルのアプリケーションは、Phamらに現 れます。 (2019)2、カルバラル・レハラス ら (2020)3、およびアドルフィ ら。 (2020)4.
膨大な放出試験は、多数のトランスジェニック蚊を野生集団に複数放出した後、メンデリア遺伝の下で設計されたトランスジーンの拡散率を評価する。ドライブシステムへのトランスジーンの付着がなければ、不安定なリリース試験からのデータは、安定化集団における関心のあるトランスジーンの適合性と動的性に関する情報を提供する。
蚊集団に自律的な遺伝子駆動システムが含まれている場合、小さなケージ試験は、トランスジェニックな男性の単一の導入に続く支配的なマーカー増加率を決定することによって、所望のトランスジーンの広がりのダイナミクスを評価するように設計されています。自律型遺伝子駆動要素は、Cas9ヌクレアーゼ、gRNAおよび支配的マーカーをコードする遺伝子を、その後の世代で活性であるようにリンクするように結合する遺伝子を運ぶ。
「重複」世代は、同じケージ内に複数の世代が同時に存在して年齢構造の連続集団を作成することを指し、「重複しない」は連続したケージ集団の単一の離散世代を指す2。遺伝子駆動ケージ実験は、ドライブの初期ダイナミクス(変換)速度を決定すると終了することができ(構成体に応じて8〜10世代)、蚊集団内のトランスジーンの短期的な安定性に関する情報を提供する一方で、支配的なマーカー周波数が完全な導入に達するか、または完全な導入に近い場合に何が起こるかを明らかにしない可能性があります(すべての蚊は遺伝子駆動システムの少なくとも1つのコピーを運ぶ)。
動物倫理に関する声明
この研究は、国立衛生研究所の実験動物のケアと使用ガイドの推奨事項に厳密に従って行われました。プロトコルは、カリフォルニア大学の施設動物のケアと使用委員会によって承認されました (動物福祉保証番号 A3416.01).
1. 非遺伝子駆動蚊に対する不含放出試験(図1)
2. 遺伝子駆動蚊の重なり発生試験(図4)
注:遺伝子駆動システムを運ぶ蚊は、書面とレビューされたプロトコルを必要とし、必要に応じて機関バイオセーフティ委員会(IBC)または同等の、および他の人によって承認されるべきです。蚊の封じ込め(ACL 2+レベル)は推奨される手順5,6,7に従うべきである。具体的には、遺伝子駆動実験は、2つの厳格な閉じ込め戦略を採用する必要があります。1つ目は、生物と環境の間の物理的な障壁(バリア戦略)です。これには、蚊が逃げられないことを保証するための安全な昆虫と標準的な操作手順(監視を含む)が必要です。第2の閉じ込め戦略は、分子、生態学的または生殖5であり得る。
3. 遺伝子駆動蚊の非重ね合わせ発生試験(図5)。
非遺伝子駆動または自律的な遺伝子駆動の改変を負担するために生成されたトランスジェニックアノフェリン蚊は、プロトコルセクションに記載されているようにケージ試験のために設定されています。ここで示す代表的な結果は、Phamらの実験の各々の最もパフォーマンスの高い複製の表現型のダイナミクスを描写する。 (2019)アノフェレス・ステファンシ蚊のための2。3つの試験(1~3:それぞれ、不浸透な非遺伝子ドライブ、重複する遺伝子駆動および重複する遺伝子駆動)は、ケージの大きさ(0.216 m3対0.005 m3)、対象集団が年齢構造であったかどうか、血液の供給源(マウスまたは人工フィーダー)および放出比などの異なるパラメータで変化した。図6は、7世代の間に使用される3つのプロトコルすべてについて、同じリリース比(1:1)から選択された観測データを表示します。
1:1の非ドライブリリースは、6-7世代以内に>80%の導入導入に達します。遺伝子駆動トランスジェニックケージ試験では、非重複性および重複するプロトコルの両方の1:1リリースが3〜4世代以内でこのレベルに達し、遺伝子駆動システムの単一リリースがトランスジーン導入のための非駆動インダフェティブリリースよりも効率的であるという期待を検証する。より速い軌道は、近似曲線の傾きによっても確認できます。両方の遺伝子駆動プロトコルは、異なるセットアップにもかかわらず、同様の角度と傾斜傾向を提示します。観察の終わりに、非ドライブケージはトランスジーンを持つ個人の約80%を達成し、遺伝子駆動個体を持つケージは完全な(またはほぼ完全な)導入に達する。ここで説明するプロトコルを用いた個々の実験結果に関する完全なデータおよび処理の詳細は、Phamらの図1〜3に記載されている 。 (2019)2、カルバラ・レハラスー らの 図2-3(2020)ア ドルフィ ら の3および図3(2020)4.
図 1.非ドライブの非無人リリーストライアル回路図。 9つの0.216 m3 ケージは、それぞれに追加された60の野生型セカンドインスター(男女混合)幼虫で設定されています。第3週から、メスは毎週血粉を提供され、卵は収集され、孵化する。第8週まで、60頭の幼虫が無作為に選択され、毎週それぞれのケージに戻され、ケージ内に年齢構造の集団を作り出す(初期段階)。9週目から、9つのケージは、トランスジェニック:野生型の男性の放出比(実験段階)に従ってランダムに三重に割り当てられます。ケージA(コントロール)は、トランスジェニックな子犬を加え込みない。メスは毎週献血され、卵は採取され、孵化し、子犬に飼育される。30人の雄と30匹の雌の野生型の子犬がケージに戻されます。ケージ1:1には、さらに30個のトランスジェニック雄の子犬が加えられます。ケージ1:0.1には、追加の300トランスジェニックオスの子犬が追加されています。9ケージのそれぞれから300の幼虫が無作為に選択され、蛍光マーカーについてスクリーニングされる。この手順は、トランス遺伝子固定(数世代後のトランスジェニック野生型蚊の安定化比)まで毎週繰り返された。ファム ら から適応(2019)2. この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図 2.ケージ集団の血液供給。 (A) 麻酔付きマウスまたは (B) ヘモテック血液フィーダーは、それぞれ0.216 m3 ケージまたは小さな0.005 m3 ケージ上の雌の蚊に血液を供給するために提供される。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図 3.非駆動、重複する遺伝子駆動および非重なり合う遺伝子駆動ケージ試験に対するフェノタイプのスクリーニング。 トランスジェニックまたは野生型の表現型の幼虫、子犬および成人の蛍光画像。この例では、 An. stephensi 個体は、3xP3 プロモーターによって駆動される DsRed マーカー (DsRed+ または DsRed-) を 3 つのステージで見ることができ、成人は性別 (♀または♂) についてスクリーニングされました。中腸の食品ボーラスに関連する野生型幼虫の背景蛍光に注意してください。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図 4.重複する遺伝子駆動ケージ試験概略図。 6つの0.216 m3 ケージは、その遺伝子駆動に従って三重に設定されています:野生型男性の放出比。120匹の野生型雄と120匹の野生型メスが各ケージに加えられた。1:1遺伝子駆動男性放出比を有するケージには、さらに120人のトランスジェニック男性が加えた。1:10の男性の放出比率を有するケージには、さらに12人のトランスジェニック男性が加えた。トランスジーンの完全な導入まで、3週間ごとに、成人女性は血液を与え、卵は収集され、孵化する。合計240頭の幼虫を無作為に選択し、それぞれのケージに戻した。300(300)の幼虫を無作為に選択し、支配的なマーカーをスクリーニングする。彼らは後に目の色とセックスのための子犬と大人としてスクリーニングされます。元のケージには、他のトランスジェニックな男性は加えありません。ファム ら から適応(2019)2. この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図 5.重複しない遺伝子駆動ケージ試験模式図。 9つの小さな0.005 m3 ケージは、その遺伝子ドライブに従って三重に設定されています:野生型男性の放出比。1:1の男性の放出率を持つケージには、100匹の野生型メス、50匹の野生型男性、50人の遺伝子駆動の雄が加えられる。1:3の男性の放出比を持つケージは、100野生型のメス、75の野生型の男性、および25の遺伝子駆動の男性を追加しました。ケージ1:10雄の放出比は、100の野生型メス、90の野生型の男性、および9つの遺伝子駆動の男性を加えた。メスには血液ミールが提供され、卵は採取され、孵化します。1:1と1:3のケージでは、200頭の幼虫がランダムに選択され、次の世代のために両親とは別の新しいケージを取り込むために使用されます。さらに500頭の幼虫が無作為に選択され、支配的なマーカー遺伝子のスクリーニングを受けると、子犬に飼育される。500人の子犬は、その後、大人に飼育され、セックスによって得点されます。残りのすべての幼虫はマーカーのためにスクリーニングされる。1:10ケージでは、すべての幼虫は、既存のトランスジーン周波数を反映した世代1〜12および200の幼虫で採点され、新しいケージを取り込むために使用されます。13 世代から、これらのケージは 1:1 と 1:3 ケージと同じように設定されます。ファム ら から適応(2019)2 とカルバラ・レハラス ら (2020)3. この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図 6.異なる集団置換ケージ試験に対するトランスジーン固定動力学の予測。 Phamらが行う各ケージ試験実験について、最もパフォーマンスの高い反復の予測型ダイナミクス を表す。 (2019)2、7世代以上監視。実験のセットアップはプロトコルで説明されています。予測は、1:1 リリース モデル (3 つの異なるケージトライアル プロトコルのそれぞれについて、反復複製を 3 重化) に関する 9 つの実験すべてのデータに基づいています。X軸は初期導入後の世代数で、Y軸はDsRedマーカー表現型(DsRed+)を経時に示す幼虫の割合です。破線は、データの線形近似曲線を表します。DsRed+ 表現型は、変更されたアリールのコピーを少なくとも1つ持つことから生じる。したがって、結果は、遺伝子駆動系において迅速化されたトランスジーンの広がりを反映し、観察終了時に(近い)完全な導入に達する。反復と実験に関する完全な詳細データの間の変動については、Phamらを参照してください 。 (2019)2, カルバラル・レハラズ・Rら (2020)3 およびアドルフィ Aら (2020)4.Pham TBらから適応した画像 (2019) マラリアベクター蚊の実験的集団改変, アノフェレス・ステファンシ. PLOSジェネト 15(12):e1008440。ドイ:10.1371/journal.pgen.1008440、アドルフィAら(2020)マラリア蚊 アノフェレス・ステファシにおける効率的な集団改変遺伝子駆動救助システム。 ナット・コミューン 11(1): 5553.ドイ:10.1038/s41467-020-19426-0およびカルバラ・レハラズRら(2020)マラリアベクター蚊の集団改変のための次世代遺伝子ドライブ、 アノフェレスガンビア。 プロク・ナットル・アカド・サイ・アメリカ 117(37):22805-22814.ドイ: 10.1073/pnas.2010214117.この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
補足ファイル:0.005 m3コロニーケージの建設。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
病原体遮断能力またはクマの滅菌遺伝子を有する遺伝子組み換え蚊は、ベクター媒介性疾患を制御するための新しいツールを構成する。これらの代替アプローチを構成するパラメータの多重度を考えると、彼らの研究における重要なステップは、制御目的のための合成トランスジーン放出の潜在的な結果の迅速かつ安全な予測を可能にする実験室での限定的な実験的評価からなる1。
ケージ集団におけるトランスジーンダイナミクスのモニタリングは数ヶ月間延長される可能性があるため、プロトコルの中心的な側面の1つは、複製(蚊の飼育、ケージサイズ、年齢構造の集団、固定放出比、安定した血液食事源、低侵襲スクリーニング手順を含む)間の実験設計の一貫性である。
男性専用の放出は、オスの蚊が病原体を伝播したり、人間に餌を与えることもないので、野生の集団に遺伝性の特徴を安全に導入することができるので、理想的であると考えられています。実験室のケージ実験では、男性の交配の競争力が低下し、トランスジーン統合に関連する他のフィットネス負荷を伴うトランスジェニック株を検出することが可能である。しかし、大型cages10で行われたような直接的かつ特異的な実験は、より自然な蚊密度における雄の競争力と女性の胎児性を適切に分析するために行うことができる2。さらに、ケージ試験からの経験データを使用して、耐性アリール形成を含むケージ集団力学のモデルをパラメータ化し、提案された技術の有効性および可能な調整に関する有用な情報を提供することができる。
ここで説明するプロトコルは、必要に応じて他の実験計画に簡単に適応でき、通常の防虫インフラや条件に関する要件は最小限に抑えられます。さらに、市販のケージや顕微鏡を除いて、材料のほとんどは安価であり、低コストの複数の反復と試験の反復を可能にします。特に、これはまた、段階的な試験経路で前進する最もパフォーマンスの高い候補を優先し、最適以下のパフォーマンスを示すもののテストを中断するために、小さなケージ試験で複数のトランスジェニック株を事前にスクリーニングすることを可能にする。
最後に、遺伝子組み換え生物の使用に関する懸念は、蚊媒介性疾患の予防のための遺伝的戦略の開発、評価、応用のためのフレームワークの精緻化を動機づける5,8,9。ここで定義したプロトコルの関連性と実行は、これらのガイドラインと一致しています。
著者は開示を持っていません。
私たちは、ドルシラ・スティリンジャー、キオナ・パーカー、パリッシュ・パウエル、マデリーン・トトリの蚊の夫に感謝しています。資金は、カリフォルニア大学アーバインマラリアイニシアチブによって提供されました.AAJはカリフォルニア大学アーバイン校のドナルド・ブレン教授です。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Artificial feeders | Hemotek | SP6W1-3 | Starter pack – 6 feeders with 3ml reservoirs |
Cage, commercial | BioQuip | 1450D | Collapsible Cage, 24 X 24 X 24" - 0.216 m3 (60 cm3) |
Cage tub (popcorn) | Amazon.com | VP170-0006 | 0.005 m3 (170 fl oz) |
Dissecting microscope with fluorescence light and filters | Leica | M165FC | |
Glue sticks | Michaels | 88646598807 | Gluesticks 40 pk, 0.4X4” |
Hot glue gun | Woodwards Ace | 2382513 | Stanley, 40 watt, GR20 |
Nylon screen (netting) | Joann.com | 1102912 | Tulle 108" Wide x 50 Yds - ~35.6 cm2 (14 in2) |
Oviposition cups | Fisher | 259126 | Beaker PP grad 50 mL |
Razor cutting tool | Office Depot | 487899 | Box cutters |
Scissors | Office Depot | 978561 | Scotch Precision Ultra Edge Titanium Non-Stick Scissors, 8" |
Stapler | Office Depot | 908194 | Swingline Commercial Desk Stapler |
Surgical sleeve (stockinette) | VWR | 56612-664 | ~48 cm (19”) cut from bolt ~15 cm (6”) X ~23 m (25y) |
Zip ties | Home Depot | 295715 | Pk of 100, 14” cable ties - 35.6 cm (14 in) |
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