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I protocolli qui riportati illustrano tre modi alternativi per valutare le prestazioni delle zanzare geneticamente modificate destinate al controllo dei vettori in studi in piccole gabbie contenute in laboratorio. Ogni protocollo è adattato alla modifica specifica che il ceppo di zanzara porta (gene drive o non gene drive) e ai tipi di parametri misurati.
Il controllo dei patogeni trasmessi dalle zanzare utilizzando vettori geneticamente modificati è stato proposto come uno strumento promettente per integrare le strategie di controllo convenzionali. I sistemi di guida genica homing basati su CRISPR hanno reso le tecnologie transgeniche più accessibili all'interno della comunità scientifica. La valutazione delle prestazioni delle zanzare transgeniche e i confronti con le controparti wild-type in piccoli studi in gabbie di laboratorio forniscono dati preziosi per la progettazione di successivi esperimenti in gabbia sul campo e valutazioni sperimentali per perfezionare le strategie per la prevenzione delle malattie. Qui, presentiamo tre diversi protocolli utilizzati in laboratorio per valutare la diffusione transgenica nei vettori di malaria delle zanzare anofeline. Questi includono rilasci inundativi (nessun sistema di gene-drive) e studi di generazione sovrapposti e non sovrapposti di gene-drive. Le tre prove variano in una serie di parametri e possono essere adattate alle impostazioni sperimentali desiderate. Inoltre, gli studi insetticidi in piccole gabbie fanno parte della progressiva transizione degli insetti ingegnerizzati dal laboratorio ai rilasci in campo aperto. Pertanto, i protocolli qui descritti rappresentano strumenti inestimabili per fornire valori empirici che alla fine aiuteranno l'implementazione sul campo di nuove tecnologie per l'eliminazione della malaria.
Si stanno perseguendo strategie basate su zanzare geneticamente modificate per controllare la trasmissione di agenti patogeni trasmessi da vettori come quelli che causano la malaria1. Questi includono tecnologie 1) volte a ridurre il numero e la densità delle zanzare Anopheles (soppressione della popolazione), o 2) volte a compromettere la capacità dei vettori di trasmettere parassiti responsabili di malattie umane (modifica della popolazione, sostituzione o alterazione) in cui ceppi di vettori sono progettati per esprimere geni effettori che impediscono la trasmissione di agenti patogeni. Questi approcci genetici sono stati rafforzati dall'avvento dei gene drive basati su CRISPR / Cas9, con prove di concetto nelle zanzare che trasmettono parassiti di un'efficace diffusione dei tratti del carico utile e delle molecole effettrici antiparassitarie nelle popolazioni in gabbia.
Le piccole prove in gabbia di laboratorio rappresentano un primo passo per valutare le caratteristiche dei ceppi transgenici come parte di un approccio graduale al loro ulteriore sviluppo verso applicazioni sul campo2. Considerazioni specifiche sui risultati includono l'ereditabilità del DNA introdotto in un ambiente competitivo, la penetranza e l'espressività del fenotipo e la stabilità. Le caratteristiche di progettazione sperimentale rilevanti includono le dimensioni delle gabbie, le densità delle zanzare, il numero di repliche, le generazioni sovrapposte o non sovrapposte, le popolazioni target strutturate per età, i rilasci singoli o multipli di ceppi ingegnerizzati, i rilasci solo maschili, solo femminili o misti, i rapporti di rilascio, le fonti di farina di sangue (animali artificiali o vivi) e le procedure di screening.
Descriviamo qui i protocolli utilizzati per valutare i ceppi di zanzare anofeline per le emissioni inondate (nessun sistema di gene-drive) e quelli che trasportano sistemi autonomi di gene-drive mediati da endonucleasi Cas9 e RNA guida (gRNA). Le applicazioni di questi protocolli appaiono in Pham et al. (2019) 2, Carballar-Lejarazú et al. (2020) 3, e Adolfi et al. (2020) 4.
Gli studi di rilascio inundativo valutano il tasso di diffusione di un transgene progettato sotto eredità mendeliana a seguito di rilasci multipli di un gran numero di zanzare transgeniche in una popolazione selvatica. Senza l'attaccamento del transgene a un sistema di azionamento, i dati degli studi di rilascio inundativo forniscono informazioni sull'idoneità e la dinamica del transgene di interesse in una popolazione stabilizzata.
Quando le popolazioni di zanzare contengono un sistema autonomo di guida genetica, le piccole prove in gabbia sono progettate per valutare le dinamiche della diffusione del transgene desiderato determinando il tasso di aumento del marcatore dominante a seguito di una singola introduzione di maschi transgenici. Gli elementi autonomi del gene-drive trasportano i geni che codificano per la nucleasi Cas9, il gRNA e il marcatore dominante collegati in modo tale da essere attivi nelle generazioni successive.
Le generazioni "sovrapposte" si riferiscono alla presenza simultanea di più generazioni nella stessa gabbia per creare una popolazione continua strutturata per età, mentre per "non sovrapposte" si intendono singole generazioni discrete in ciascuna popolazione in gabbia consecutiva2. Gli esperimenti di gabbia gene-drive possono essere terminati una volta determinata la dinamica iniziale del tasso di guida (conversione) (8-10 generazioni a seconda del costrutto) e, sebbene forniscano informazioni sulla stabilità a breve termine del transgene all'interno della popolazione di zanzare, potrebbero non rivelare cosa succede quando e se le frequenze dei marcatori dominanti raggiungono o sono vicine alla piena introduzione (ogni zanzara che trasporta almeno una copia del sistema di gene-drive).
Dichiarazione di etica animale
Questo studio è stato condotto in stretta conformità con le raccomandazioni contenute nella Guida per la cura e l'uso degli animali da laboratorio del National Institutes of Health. I protocolli sono stati approvati dai comitati istituzionali per la cura e l'uso degli animali dell'Università della California (Animal Welfare Assurance Numbers A3416.01).
1. Studi di rilascio inundativo su zanzare non gene drive (Figura 1)
2. Prove di generazione sovrapposte di zanzare gene-drive (Figura 4)
NOTA: le zanzare che trasportano sistemi di guida genetica richiedono protocolli scritti e rivisti e devono essere approvate da un Comitato istituzionale per la biosicurezza (IBC) o equivalente, e altri ove richiesto. Il contenimento delle zanzare (livello ACL 2+) deve seguire le procedure raccomandate5,6,7. In particolare, gli esperimenti di gene drive dovrebbero impiegare due rigorose strategie di confinamento. Il primo è di solito barriere fisiche (Barrier Strategy) tra gli organismi e l'ambiente. Ciò richiede di avere un insetto sicuro e procedure operative standard (incluso il monitoraggio) per garantire che le zanzare non possano sfuggire. La seconda strategia di confinamento può essere molecolare, ecologica o riproduttiva5.
3. Prove di generazione non sovrapposte di zanzare gene-drive (Figura 5).
Le zanzare anofeline transgeniche generate per sopportare modifiche non gene-drive o autonome del gene-drive sono impostate per le prove in gabbia come descritto nella sezione Protocolli. I risultati rappresentativi mostrati qui descrivono la dinamica fenotipica delle repliche più performanti di ciascuno degli esperimenti di prove in gabbia eseguiti da Pham et al. (2019) 2 per le zanzare Anopheles stephensi . I tre studi (1 - 3, rispettivamente: unità non genica inondata, unità genetica sovrapposta e unità genetica non sovrapposta) variavano in diversi parametri, come la dimensione della gabbia (0,216 m3 vs 0,005 m3), se la popolazione target fosse strutturata per età, fonte di farina di sangue (topi o alimentatore artificiale) e rapporti di rilascio. Come mezzo di rappresentazione, la Figura 6 mostra i dati osservati selezionati dallo stesso rapporto di rilascio (1:1) per tutti e tre i protocolli utilizzati, nel corso di sette generazioni.
Il rilascio non drive 1:1 raggiunge >80% di introduzione transgenica entro 6-7 generazioni. Per gli studi in gabbia transgenica gene-drive, i rilasci 1: 1 in entrambi i protocolli non sovrapposti e sovrapposti raggiungono questo livello entro 3-4 generazioni, convalidando così l'aspettativa che un singolo rilascio di un sistema di gene drive possa essere più efficiente dei rilasci inundativi non drive per l'introduzione di transgeni. La traiettoria più veloce può anche essere confermata dalla pendenza delle linee di tendenza. Entrambi i protocolli di gene-drive, nonostante le diverse configurazioni, presentano angoli e tendenze di pendenza simili. Alla fine dell'osservazione, le gabbie non drive raggiungono circa l'80% degli individui portatori del transgene, mentre le gabbie con individui gene-drive raggiungono l'introduzione completa (o quasi completa). I dati completi e i dettagli di elaborazione sui risultati dei singoli esperimenti utilizzando i protocolli descritti qui possono essere trovati nelle figure 1-3 di Pham et al. (2019) 2, Figure 2-3 di Carballar-Lejarazú et al. (2020) 3 e Figura 3 di Adolfi et al. (2020) 4.
Figura 1. Schema di prova di rilascio inundativo non unità. Nove gabbie da 0,216 m3 sono allestite con 60 larve di seconda stella (sesso misto) di tipo selvatico aggiunte a ciascuna. A partire dalla settimana 3, alle femmine viene fornita una farina di sangue settimanale e le uova vengono raccolte e schiuse. Fino alla settimana 8, 60 larve vengono selezionate a caso e restituite settimanalmente alle rispettive gabbie per creare una popolazione strutturata per età nelle gabbie (fase iniziale). A partire dalla settimana 9, le nove gabbie sono assegnate in modo casuale in triplice copia in base ai loro rapporti di rilascio maschile transgenico:wild-type (fase sperimentale). Le gabbie A (Controllo) non hanno pupe transgeniche aggiunte. Alle femmine viene fornita una farina di sangue settimanale e le uova vengono raccolte, schiuse e allevate a pupe. 30 pupe di tipo selvatico maschio e 30 femmine vengono aggiunte di nuovo alle loro gabbie. Le gabbie 1:1 hanno aggiunto altre 30 pupe maschili transgeniche. Le gabbie 1:0.1 hanno aggiunto altre 300 pupe maschili transgeniche. 300 larve di ciascuna delle 9 gabbie vengono selezionate in modo casuale e sottoposte a screening per il marcatore fluorescente. Questa procedura è stata ripetuta settimanalmente fino alla fissazione transgenica (rapporto stabilizzato di zanzare transgeniche-wildtype dopo alcune generazioni). Adattato da Pham et al. (2019) 2. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2. Alimentazione del sangue delle popolazioni in gabbia. (A) I topi anestetizzati o (B) gli alimentatori di sangue Hemotek sono offerti per l'alimentazione del sangue delle zanzare femmine sulle gabbie da 0,216 m3 o dalle piccole gabbie da 0,005 m3 , rispettivamente. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 3. Fenotipi di screening per studi su gabbie di gene-drive non-drive, sovrapposizione e gene-drive non sovrapposti. Immagini fluorescenti di una larva, pupa e adulto di fenotipi transgenici o wild-type. In questo esempio, gli individui di An. stephensi sono stati sottoposti a screening per il marcatore DsRed guidato dal promotore 3xP3 negli occhi (DsRed+ o DsRed-), visibile in tutte e tre le fasi, e gli adulti sono stati sottoposti a screening per il sesso ( ♀ o ♂ ). Si noti la fluorescenza di fondo nelle larve di tipo selvatico associate al bolo alimentare nel midgut. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 4. Schema di prova della gabbia di guida genica sovrapposta. Sei gabbie da 0,216 m3 sono disposte in triplice copia in base ai loro rapporti di rilascio gene-drive:wild-type maschile. 120 maschi selvatici e 120 femmine selvatiche sono stati aggiunti a ciascuna gabbia. Le gabbie con un rapporto di rilascio maschile gene-drive 1: 1 hanno avuto un ulteriore 120 maschi transgenici aggiunti. Le gabbie con un rapporto di rilascio maschile di 1:10 hanno avuto altri 12 maschi transgenici aggiunti. Fino alla piena introduzione del transgene, ogni 3 settimane, le femmine adulte vengono fornite di farina di sangue e le uova vengono raccolte e schiuse. Un totale di 240 larve sono state selezionate in modo casuale e restituite alle rispettive gabbie. Trecento (300) larve vengono selezionate in modo casuale e sottoposte a screening per il marcatore dominante. In seguito vengono proiettati come pupe e adulti per il colore degli occhi e il sesso. Nessun maschio transgenico aggiuntivo viene aggiunto alle gabbie originali. Adattato da Pham et al. (2019) 2. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 5. Schema di prova in gabbia gene-drive non sovrapposta. Nove piccole gabbie da 0,005 m3 sono disposte in triplice copia in base ai loro rapporti di rilascio gene-drive:wild-type maschile. Le gabbie con un rapporto di rilascio maschile 1: 1 hanno 100 femmine selvatiche, 50 maschi selvatici e 50 maschi gene-drive aggiunti. Le gabbie con un rapporto di rilascio maschile 1: 3 hanno 100 femmine selvatiche, 75 maschi selvatici e 25 maschi gene-drive aggiunti. Le gabbie 1:10 rapporto di rilascio maschile hanno 100 femmine selvatiche, 90 maschi selvatici e 9 maschi gene-drive aggiunti. Alle femmine viene fornito un pasto di sangue e uova raccolte e schiuse. Per le gabbie 1:1 e 1:3, 200 larve vengono selezionate a caso e utilizzate per popolare nuove gabbie, separate da quelle dei loro genitori, per la generazione successiva. Altre 500 larve vengono selezionate in modo casuale e allevate a pupe, quando vengono sottoposte a screening per il gene marcatore dominante. Le 500 pupe vengono poi allevate agli adulti e valutate per sesso. Tutte le larve rimanenti vengono sottoposte a screening per il marcatore. Per le gabbie 1:10, tutte le larve sono segnate nelle generazioni 1-12 e 200 larve che riflettono la frequenza transgenica esistente vengono utilizzate per popolare nuove gabbie. A partire dalla generazione 13, queste gabbie sono allestite in modo identico alle gabbie 1:1 e 1:3. Adattato da Pham et al. (2019) 2 e Carballar-Lejarazú et al. (2020) 3. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 6. Dinamiche di fissazione transgenica previste per i diversi studi di sostituzione della popolazione in gabbia. Rappresentazione della dinamica fenotipica attesa delle repliche più performanti per ciascuno degli esperimenti di prove in gabbia eseguiti da Pham et al. (2019) 2, monitorato per oltre 7 generazioni. Le impostazioni degli esperimenti sono descritte nei Protocolli. Le previsioni si basano sui dati di tutti e 9 gli esperimenti sui modelli di rilascio 1:1 (triplicati replicati per ciascuno dei tre diversi protocolli di prova in gabbia). L'asse X è il numero di generazione dopo l'introduzione iniziale e l'asse Y è la proporzione di larve che mostrano il fenotipo marcatore DsRed (DsRed+) nel tempo. Le linee tratteggiate rappresentano linee di tendenza lineari dei dati. Il fenotipo DsRed+ deriva dall'avere almeno una copia dell'allele modificato. Quindi i risultati riflettono la diffusione del transgene, accelerato nel sistema di gene drive, raggiungendo (quasi) la piena introduzione alla fine dell'osservazione. Per la variabilità tra le repliche e i dati dettagliati completi sugli esperimenti, fare riferimento a Pham et al. (2019) 2, Carballar-Lejarazú R et al. (2020)3 e Adolfi A et al. (2020)4. Immagini adattate da Pham TB et al. (2019) Modifica sperimentale della popolazione della zanzara vettore della malaria, Anopheles stephensi. PLOS Genet 15(12): e1008440. doi: 10.1371/journal.pgen.1008440, Adolfi A et al. (2020) Efficiente sistema di salvataggio gene-drive di modifica della popolazione nella zanzara della malaria Anopheles stephensi. Nat Commun 11(1): 5553. doi: 10.1038/s41467-020-19426-0 e Carballar-Lejarazú R et al. (2020) Guida genica di nuova generazione per la modifica della popolazione della zanzara vettore della malaria, Anopheles gambiae. Proc Natl Acad Sci USA 117(37):22805-22814. DOI: 10.1073/pnas.2010214117. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
File supplementare: La costruzione della gabbia della colonia di 0,005 m3. Fare clic qui per scaricare questo file.
Le zanzare geneticamente modificate che hanno capacità di bloccare gli agenti patogeni o portano geni di sterilità costituiscono nuovi strumenti per controllare le malattie trasmesse da vettori. Data la molteplicità dei parametri che compongono questi approcci alternativi, un passo critico nella loro ricerca consiste in valutazioni sperimentali confinate in laboratorio che consentono una previsione rapida e sicura dei potenziali risultati di un rilascio di transgeni sintetici a fini di controllo1.
Poiché il monitoraggio delle dinamiche transgeniche nelle popolazioni in gabbia può estendersi per diversi mesi, uno degli aspetti centrali dei protocolli è la coerenza nella progettazione sperimentale tra le repliche (tra cui l'allevamento delle zanzare, le dimensioni della gabbia, le popolazioni strutturate per età, i rapporti di rilascio fissi, le fonti stabili di farina di sangue e le procedure di screening minimamente invasive).
I rilasci solo maschili sono considerati ideali perché le zanzare maschio non trasmettono agenti patogeni né si nutrono di esseri umani, quindi possono tranquillamente introdurre caratteristiche ereditabili nelle popolazioni selvatiche. Negli esperimenti in gabbia di laboratorio, è possibile rilevare ceppi transgenici con ridotta competitività dell'accoppiamento maschile e altri carichi di fitness associati all'integrazione transgenica. Tuttavia, esperimenti diretti e specifici, come quelli condotti in gabbie di grandi dimensioni10, possono essere condotti per analizzare correttamente la competitività maschile, così come la fecondità femminile in densità di zanzare più naturali2. Inoltre, i dati empirici delle prove in gabbia possono essere utilizzati per parametrizzare modelli di dinamica della popolazione in gabbia, compresa la formazione di alleli resistenti, e fornire informazioni utili sull'efficacia e sui possibili aggiustamenti nella tecnologia proposta.
I protocolli qui descritti possono essere facilmente adattati ad altri progetti sperimentali come richiesto, con requisiti minimi per quanto riguarda le infrastrutture e le condizioni regolari degli insetti. Inoltre, ad eccezione delle gabbie commerciali e dei microscopi, la maggior parte dei materiali sono economici e consentono repliche multiple e iterazioni a basso costo delle prove. In particolare, ciò consente anche di pre-selezionare più ceppi transgenici in studi su piccole gabbie al fine di dare la priorità ai candidati con le migliori prestazioni da spostare in avanti nel percorso di test graduale e di sospendere i test su quelli che mostrano prestazioni non ottimali.
Infine, la preoccupazione per l'uso di organismi geneticamente modificati motiva l'elaborazione di quadri per lo sviluppo, la valutazione e l'applicazione di strategie genetiche per la prevenzione delle malattie trasmesse dalle zanzare5,8,9. La rilevanza e l'esecuzione dei protocolli qui definiti sono coerenti con queste linee guida.
Gli autori non hanno divulgazioni.
Siamo grati a Drusilla Stillinger, Kiona Parker, Parrish Powell e Madeline Nottoli per l'allevamento delle zanzare. Il finanziamento è stato fornito dalla University of California Irvine Malaria Initiative. AAJ è donald bren professor presso l'Università della California, Irvine.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Artificial feeders | Hemotek | SP6W1-3 | Starter pack – 6 feeders with 3ml reservoirs |
Cage, commercial | BioQuip | 1450D | Collapsible Cage, 24 X 24 X 24" - 0.216 m3 (60 cm3) |
Cage tub (popcorn) | Amazon.com | VP170-0006 | 0.005 m3 (170 fl oz) |
Dissecting microscope with fluorescence light and filters | Leica | M165FC | |
Glue sticks | Michaels | 88646598807 | Gluesticks 40 pk, 0.4X4” |
Hot glue gun | Woodwards Ace | 2382513 | Stanley, 40 watt, GR20 |
Nylon screen (netting) | Joann.com | 1102912 | Tulle 108" Wide x 50 Yds - ~35.6 cm2 (14 in2) |
Oviposition cups | Fisher | 259126 | Beaker PP grad 50 mL |
Razor cutting tool | Office Depot | 487899 | Box cutters |
Scissors | Office Depot | 978561 | Scotch Precision Ultra Edge Titanium Non-Stick Scissors, 8" |
Stapler | Office Depot | 908194 | Swingline Commercial Desk Stapler |
Surgical sleeve (stockinette) | VWR | 56612-664 | ~48 cm (19”) cut from bolt ~15 cm (6”) X ~23 m (25y) |
Zip ties | Home Depot | 295715 | Pk of 100, 14” cable ties - 35.6 cm (14 in) |
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