著者らは、ペルチェプレートについては、この抗アレスチン抗体のための機能的アッセイの支援のために眼アブレーション技術、テイラー・バークホルツ、マイケル・レビン、及び淳二Morokumaを完成するためのミッチェル・デオッカンド感謝したいです。この作品は、WSBにウェスタンミシガン大学からSFSAの助成金によってサポートされていました。

1.動物文化と取り扱い注：このプロトコルは、一般的に再生研究のために使用されているSchmidteaメディ 、配列決定されたゲノム16と二倍体プラナリア種、17を使用しています。しかし、このアッセイは、Girardia tigrina及び（市販されている）Girardia dorotocephalaなどの他の種と同等に成功しています。 <ol><li> 超高純度（又は濾過脱イオン）中、0.5g / Lの海の塩から作られた「ワームの水」は、水にワームを維持します。ワームの水を保持するために、滅菌ポリプロピレンまたはガラス容器を使用します。参照してください。 <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55594/Supplementary_File_1.docx" target="_blank">補足ファイル1</a>ワーム水の準備の詳細については、を。 注：石鹸などの容器（または他の消耗品）をきれいに石鹸を使用しないでくださいは、虫に対して毒性です。代わりに70％エタノールで拭いて空気乾燥させ。 &lt;オール&gt; <li>汚染から守るためにプラナリアと協力しながら、手袋を着用してください。 注：ワームは、石鹸、漂白剤、シャンプー、コンディショナー、ハンドローションを含め、環境有害物質や化学物質に非常に敏感です。 </li></ol></li><li>蓋付きポリプロピレン製食品容器の家コロニーは、〜20°C（室温）での空気交換のために、部分的に開いたまま。 （12ウェルプレート用のウェルあたり1つのワーム）ペトリ皿（100mmの皿当たり20のワーム）、または無処理の組織培養プレートのいずれかに保管実験ワーム。ストレスを減らすために、暗闇の中でコロニーと実験の両方を保持します。 注：コロニーはワーム水1リットル当たりがない以上500〜1,000未満のワームを持っている必要があります。気流がこれらの皿に設計されているので、実験のために、所定の位置に完全に蓋を残します。 </li><li>コンテナ全体の食品の滴を配置し、トランスファーピペットからピューレをドロップすることにより、ピューレ、有機牛肉や鶏肉肝臓で週に一度非実験ワームをフィード。食品を消費するワームに2時間を許可しますコンテナをクリーニングする前に、暗い（ステップ1.4を参照）。長期（数ヶ月）のためにC°、短期のために-20℃で保存ピューレ（週）を使用するか、または-80前。 （細菌が咲きやワームに害を及ぼすことができるように）再利用のためピューレを再凍結していません。 注：肝臓は何のホルモンや抗生物質を含まず、好ましくは、以前に凍結してはなりません。遠心凍結前にピューレ（または前送りする）は、空気を除去し、フローティングから食べ物を防止します。食品容器の底に沈むはずです。ピューレの1mLを500-1,000ワームのために十分です。 </li><li>コロニーと実験の両方のための新鮮なワーム水で週に一度交換水。コロニーコンテナもワームを飢え週1回（そのトラップ廃棄物を粘液残留物を除去するために）無漂白紙タオルで拭き、または週二回のワームを供給するためのする必要があります（2時間2日後に再び供給した後）。バイオフィルムを保持するために、コンテナの80％以上を拭かないでください。 </li><li> コンテナ（または手術setu間のワームを移動しますP）トランスファーピペットを使用して。コンテナの表面に付着した無料のワームに、表面からそれを解放するためにワームの背後に/上に水を噴出。ピペットの底インチ（薄い）部分内でワームを維持しようとしながら、ピペットにワームを吸い上げます。 <ol><li>それらを吸引する前に、ワーム少量の水とバックロードピペット。 </li><li>ピペットでタッチして、ソフトボディのワームを引き裂く防ぐために、むしろワーム自体よりも、ワームの周りに水を移動しよう。 </li><li>ワームを転送するか、水を交換しない限り、カバーされた実験の料理をしてください。 </li></ol></li></ol> 2.準備<ol><li> 実験前に少なくとも1週間ワームを送り停止します。 <ol><li> ≥1週間飼育し、長さが少なくとも5〜7ミリメートルですされていないされているワームを選択します。ウォーム水の完全なペトリ皿2/3にワームを転送し、そして皿の下に定規をスライドさせてウォームの長さを確認します。 wを測定オームズ完全に拡張し、移動しながら。 注：その後の免疫蛍光およびin situハイブリダイゼーション分析において 、より大きなワーム（8〜10 mm）を行うと作業が容易であるときに小さく（5~7 mm）の線虫が良く機能するが-特にときに切除するために学びます。 </li><li>ワームは、全体損傷していない、と最近再生されないことを確認してください。 注：再生成ワームは、通常、ワームに比べてはるかに軽い（または全くない）ヘッド中の顔料及び/又はテール領域があります。 </li><li>ワームに対するRNAiまたは薬理学的治療を行った場合は、この時点で行ってください。ワームは、治療（RNAiのためのような）の一部として供給した場合、2.2のステップに続行する前に少なくとも7日間の最後の給餌後に待ちます。 </li></ol></li><li> 作業スペースをきれいにし、70％エタノールで顕微鏡基盤を解剖し、それが完全に乾燥させます。スコープの左側に選択されたワームの皿を置き。スコープの右に、5/16インチのインスリン針1と＃5鉗子のペア、31 Gを配置mLシリンジ、およびクリーンなトランスファーピペット。 <ol><li>楽器は（汚染物質を導入する可能性）ベンチに触れてから保管されていることを確認してください。クリーン鉗子、針、およびピペットを保つために（たとえば、箸置きなど）は、剛性のアイテムを使用してください。また、新鮮な茶（無漂白）ペーパータオルの上に場所の楽器。 注：彼らは右利きの人に関係するとして、これらと後続の命令が書かれています。左利きの人は、左/右の方向を逆にする必要があります。 </li></ol></li><li>次のワークスペースに、リントフリーのティッシュワイプのボックス、新鮮なワームの水の供給源、および（ベンチトップから保護）いくつかの余分な転送ピペットを配置します。調剤を容易にするためにプラスチック製の洗浄瓶に入れワーム水。また、切除された動物を収集するためのスコープの右側に標識された12ウェルプレート（または100 ム・ペトリ皿）を置きます。 </li><li> ワームを固定するためにカスタムメイドペルチェプレートを使用する場合、Tの凹部にペルチェプレートを位置決め彼解剖顕微鏡のベースとペルチェプレートの作用面が十分に冷却されるまで、DC電源に出力を調整（典型的には約5 V）.Alternatively 1/2水と完全に100 ム・ペトリ皿を充填しコールドプレートを作ります少なくとも24時間凍結。蓋を捨て、解剖範囲のベースの上に100mmの皿の底に置き、次いで氷（図1A）の表面に直接逆さまに60 ム・ペトリ皿の蓋を置きます。 <ol><li>水が100 mmディッシュ中で凍結した後、氷の「火山」は、プレートの中央に表示されます。この問題が発生した場合、表面から任意の凹凸を取り除くために、氷のフラットをこすりするカミソリの刃を使用します。 注：手術中に氷がアブレーションがはるかに困難に、溶けてしまいます。事前にいくつかの氷の皿を準備し、そして、すぐに60ミリメートル皿のふたが浮い始まりとしてアッセイ中のものを溶融するため、冷凍ものを交換してください。 </li></ol></li><li> 作ります手術表面。プラスチックパラフィンフィルム5cmのX 10cmの片に切断（4 cm 2であればシャーレコールドプレートを使用）、固定装置の中心に置きます。リントフリーのティッシュを折っ平方およそ2cm角にワイプやフィルムの上に置きます。白い濾紙1.5-2センチ2の部分をカットし、ワイプの上に置きます。図1B-1Eを参照してください。 <ol><li>折りたたまれたホールド手袋をはめた指で所定の位置に拭き、軽くそれが折り畳まれたままであることを保証するためにワイプ減衰させるためにワームの水を使用しています。フラットワイプロールホールピペットの側面を使用してください。 注：冷たい温度が動くからワームを維持するのに役立ちます。作業する「乾燥」も固定化するのに役立ちます。組織は、（致死である）ワームは完全に乾燥させることなく、手術中に湿ったワームを保ち、濾紙を通して水を吸い上げるように作用するワイプ。 </li></ol></li></ol> 3.外科切除<ol><li> 上に置くために、転送ピペットを使用してください濾紙上に電子ワームの背側アップ。上の光源の電源を入れ、光がワームに焦点を当てているように、グースネックを指示。目がはっきり見えるように（全体のワームは、ビュー内にある必要はありません）解剖スコープの焦点と倍率を調整します。 5X倍率は良い出発点です。ヘッドは、（顕微鏡の正面に向かって）研究者に向かって指摘されるように、右に、角度付き30-40度をパラフィンフィルムを回転させてウォームを方向付けます。 <ol><li>過剰ワームの動きを防ぐために、明るい光の使用は避けてください。プラナリアは、負の走光性を表示し、明るい光を回避しようとします。 </li><li>ワームは（咽頭可視開口を有する）上向き腹側に位置する場合、緩やか（目可視で）ワームの背側を再配置する鉗子の鈍い面を使用。動物を再配置する際に軟組織を通じて引き裂くの可能性を最小限にするために鉗子の鋭い先端を動物に近づいて避けてください。 </li><li&gt;目の焦点が合って明確になるように顕微鏡の焦点を調整します。また、目や周囲の頭部組織の両方が視野にあることを確認してください。 </li></ol></li><li> それは（親指と人差し指の間）のペンであるかのように右手で新鮮な針/注射器を保持します。ペルチェプレート（またはペトリ皿コールドプレート）に対する左手の親指を支える、シリンジの底部が載るれるに支点（図2A）のように左手の親指を使用します。顕微鏡を通して見て、針のベベルが表示されていることを確認してください。 注：針は非常に鋭いです。それらを取り扱う際は注意してください。ラテックスまたはニトリル手袋を身に着けていることは、いくつかの保護を提供することができます。 <ol><li>手順を通して針/シリンジ安定を保持し、握手を避けるために左手の親指を使用してください。 </li><li>手術の表面安定を保持するのを助けるために左手の親指と（手術表面上の人差し指で）左の人差し指で約40°の角度をなします。 </li></ol></li><li> とともに（スプーンのように）上向き針のベベルは、眼（図2B）に直角に針を配置します。穏やかに右から左にすくい、眼の眼杯（白、無着色領域）を覆う組織の薄い層を貫通する針の先端を使用します。非常にゆっくりと底に穴をあけたり、光学カップの境界を破壊しないように注意しながら、光学カップ内に配置された任意の着色された組織を除去します。 <ol><li>ワームは手続き中の任意の時点で&gt; 1-2分間ろ紙にされている場合は、ワームを再水和するためにワームの水の一滴を追加します。 注：脱水は怪我をリッピングするワームの感受性を増加します。 </li></ol></li><li>繰り返し黒色着色組織（色素細胞）の全てまでステップ3.3、ならびに光学カップ（光受容細胞の樹状突起）の白色組織の全てが除去されます。丁寧に拭くティッシュで拭いて針の端部に付着し、切除した組織を削除します。二重の目ABLAた場合ンは、所望この時点で第2の眼を切除されています。 注：けがを避けるために、針はきれいなティッシュで針をつかんで洗浄することができ、その後、親指と人差し指から拭き取るを通じて針を引っ張るためにもう一方の手を使って、親指と人差し指で開催されたワイプ。あるいは、針は、ワイプウェットティッシュの表面上に拭い、清潔のために調べることができます。 </li><li> 完了したら、新鮮なワームの水を含有する標識された皿にワームを移動する移送ピペットを使用。グループのデータを分析した場合、単一の100ム・ペトリに20のワームまで置きます。時間をかけて同じ個体で再生を追跡する場合は、12ウェルプレートの各ウェルに1つのワームを置きます。すべてのワームが転送されると、皿/ウェルから全てのワーム水を除去し、より新鮮ウォーム水で置換することによりワームをすすぎます。 <ol><li>フィルタからワームを除去するために、ウォーム少量の水を有するピペットをバックロードし、ワームに水を放出します。これは、トンを持ち上げる必要がありますろ紙オフ彼ワームは、すぐに転送用のピペット内に吸引されます。 </li></ol></li><li>光から保護〜20°C（室温）での実験をインキュベートし、再生プロセスに従ってください。 注：ワームは、一定の温度を維持するために温度制御インキュベーター内に保存することができるが、これは厳密には必要ではありません。ほとんどの部屋の温度が再生成するワームの能力には影響しません5℃の、によってのみ異なります。 </li><li>所望される場合、および/またはin situハイブリダイゼーション （ 図3-4を参照）、免疫組織化学のためにワームを固定する遺伝子発現の解析。異なる固定方法は、プラナリア、免疫組織化学18、19、20及びin situハイブリダイゼーション 21、22、23のプロトコルに存在します。 </li><li>実験が締結され、sacrifiCEは皿からワーム水を除去し、70％エタノールで置き換えることにより、ワームを生きます。灰色がかっを溶解し、オンにするワームをチェックし、3-5分間ワームをインキュベートします。 </li><li>一度殺し通常の廃棄物の流れにおける非処理ワームを置きます。環境、特に非在来種へのライブワームを導入することは避けてください。 </li></ol>

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M., Ross, E., Sanchez Alvarado, ., A, <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SmedGD:+the+Schmidtea+mediterranea+genome+database.">SmedGD: the Schmidtea mediterranea genome database.</a> Nucleic Acids Res. 36, D599-D606 (2008).</li><li>Beane, W. S., Tseng, A. S., Morokuma, J., Lemire, J. M., Levin, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Inhibition+of+planar+cell+polarity+extends+neural+growth+during+regeneration,+homeostasis,+and+development.">Inhibition of planar cell polarity extends neural growth during regeneration, homeostasis, and development.</a> Stem Cells Dev. 21 (12), 2085-2094 (2012).</li><li>Forsthoefel, D. J., Waters, F. A., Newmark, P. 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G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+monoclonal+antibodies+to+study+tissue+regeneration+in+planarians.">Novel monoclonal antibodies to study tissue regeneration in planarians.</a> BMC Dev Biol. 15, 2 (2015).</li><li>Cardona, A., Fernandez, J., Solana, J., Romero, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+in+situ+hybridization+protocol+for+planarian+embryos:+monitoring+myosin+heavy+chain+gene+expression.">An in situ hybridization protocol for planarian embryos: monitoring myosin heavy chain gene expression.</a> Dev Genes Evol. 215 (9), 482-488 (2005).</li><li>King, R. S., Newmark, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+hybridization+protocol+for+enhanced+detection+of+gene+expression+in+the+planarian+Schmidtea+mediterranea.">In situ hybridization protocol for enhanced detection of gene expression in the planarian Schmidtea mediterranea.</a> BMC Dev Biol. 13, 8 (2013).</li><li>Pearson, B. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Formaldehyde-based+whole-mount+in+situ+hybridization+method+for+planarians.">Formaldehyde-based whole-mount in situ hybridization method for planarians.</a> Dev Dyn. 238 (2), 443-450 (2009).</li></ol>

著者は、開示することは何もありません。

この眼アブレーション技術は、脳組織を除くと眼組織に主に切除を制限することによって（例えば、ホールパンチなど）現行の方法を改善します。練習では、この技術は、経験の浅いが、良心的な学部の学生にmicrosurgeriesに経験した技術者から、ほとんどの人によって行うことができます。なお、この技術は、前免疫組織化学によって、または眼のマーカー<...

プラナリアは、成体幹細胞媒介再生を研究するための強力なモデル生物です。これらの非寄生淡水扁形動物は、その中枢神経系および脳1を含む任意およびすべての不足している組織を、再生する能力を有しています。 （ インサイチュハイブリダイゼーション 、免疫組織化学、RNA干渉（RNAi）、およびトランスクリプトでは 、このような配列決定ゲノムなど）にまでさかのぼる過去10〜15年間プラナリア分野において1700年代2、技術の進歩などの検討は、この歴史的なモデル生物を更新しました。具体的には、プラナリアは最近、目の研究の3のための新たなモデルとして人気を得ています。 プラナリアは2つだけの組織タイプ、感光体の神経細胞と色素細胞との原型の目を持っています。これは、その目の幹細胞集団の特性を有効にし、同じ遺伝子の多くは、脊椎動物の眼ドを規制することを示しましたvelopmentはプラナリア4,5に保存されています。光学カップは視交叉を介して脳を背側に位置する感光体ニューロン及び半月黒色素細胞の白、無着色の樹状突起で構成され、目の神経支配されています。再生プロセス6を解明するためのモデルであることに加えて、プラナリア眼は光に対して視覚的機構7、行動反応の進化を研究に適している8、及び行動9の神経学的基礎（プラナリアは、負の走光性を表示します）。 断頭4、10以下のヘッド再生の一部として、ちょうど眼組織11の切除に続いて、12：プラナリアにおける眼の再生は、主に二つの主要な文脈で検討されています</SUP&gt;。それは単純明快であるとして、目の再生のほとんどのプラナリアの研究では、断頭メソッドを使用しています。いくつかの研究はまた、単に目（部分断頭）15の後ろに切断術を行っているがこれまでで最も一般的なプラナリア眼の切除方法は、細かいガラス毛細管13、14とパンチ穴を経由してきました。しかし、これらの方法の全ては、潜在的に結果の解釈を複雑に、（例えば、脳、腸、およびnephridiaなど）だけで、目以外の多くの組織の喪失を伴います。ここに提示眼アブレーションプロトコルは、眼に対してより特異的であるデータが得られた（具体的には脳を除く）眼組織への切除を制限します。また、給紙を開始するために7~14日かかる断頭ワームとは異なり、眼アブレーションワームperformeする（RNAiは食物を介して送達される）RNAi実験を可能にする、切除12の24時間以内に送ります同時にdは。 目のアブレーションが正常に断頭よりも実行することは技術的に難しいですが、目の切除を含む現在の研究では、その手順の詳細な手順を含めていません。このビデオの記事の目標は、一貫して基本的な脳組織を乱すし、できるだけ少ない他の組織を除去することなく、プラナリアの光学カップを削除するために、研究者を有効にすることです。この方法は、単一及び二重の両方の目の切除のために使用され、研究の広い範囲に適用可能であることができます。最も再生アッセイのような、眼の切除は、薬理学的および遺伝的（のRNAi）スクリーニング、ならびに行動研究の両方との組合せに適しています。ここでは、プラナリアコロニー、および眼のアブレーション技術自体を維持し、ワームの取り扱い方法について説明します。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Instant Ocean sea salts</td>
			<td>Spectrum Brands&#160;</td>
			<td>SS15-10</td>
			<td>&#34;10 Gallon&#34; box&#160; (net weight 3 lbs)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kimwipes EX-L lint-free tissue wipe</td>
			<td>Kimberly-Clark</td>
			<td>34155</td>
			<td>4.5 x 8.5 in&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Whatman #2 filter paper</td>
			<td>Sigma&#160;</td>
			<td>WHA1002125</td>
			<td>Circles, 125 mm diameter, white</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Easy Touch Insulin syringe (with needle)</td>
			<td>Pet Health Market</td>
			<td>17175-04</td>
			<td>&#160;U-100 1 cc syringe, 31-gauge 5/16 in needle</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>100 mm Petri dish</td>
			<td>VWR</td>
			<td>25384-342</td>
			<td>100 x 15 mm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>60 mm Petri dish</td>
			<td>VWR</td>
			<td>25384-092</td>
			<td>60 x 15 mm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dumont #5&#160; forceps&#160;</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11254-20</td>
			<td>Inox, straight tip , 11 cm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Transfer pipettes&#160;</td>
			<td>Samco Scientific&#160;</td>
			<td>225</td>
			<td>Graduated, large bulb, 7.5 mL, non sterile</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Parafilm M paraffin film</td>
			<td>Brand&#160;</td>
			<td>701606</td>
			<td>&#160;4 in x 125 ft roll</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>12-well untreated tissue culture plate</td>
			<td>VWR</td>
			<td>15705-059</td>
			<td>Untreated, flat bottom, sterile, Falcon brand</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic food containers (for colony)&#160;</td>
			<td>Ziploc</td>
			<td>Large rectangle</td>
			<td>2.25 qt (2.12 L), 10&#34; x 6 -3/4 &#34; x 3 -3/16&#34;&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Planaria (Girardia tigrina)</td>
			<td>Carolina Biological</td>
			<td>132954</td>
			<td>Sold as &#34;Brown&#34; Planaria; most often they are G. tigrina (aka Dugesia tigrina), but sometimes are G. dorotocephala (aka Dugesia dorotocephala); either will work.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Planaria (Schmidtea mediterranea)</td>
			<td>n/a</td>
			<td>n/a</td>
			<td>S. mediterranea are not commercially available. At this time animals are only obtainable from laboratories that use them and have extra animals.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Brown paper towels&#160;</td>
			<td>Grainger</td>
			<td>2U229</td>
			<td>9-3/16 x 9-3/8&#34; 1-Ply Multifold Paper Towel, UNBLEACHED</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wash bottle (for worm water), optional</td>
			<td>VWR</td>
			<td>16650-275</td>
			<td>Wash Bottles, Low-Density Polyethylene, Wide Mouth, 500 mL</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anti-synapsin antibody, optional</td>
			<td>Developmental Studies Hybridoma Bank</td>
			<td>3C11</td>
			<td>Supernatant</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anti-arrestin antibody, optional</td>
			<td>n/a</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Not commercially available. Kind gift from Michael Levin, Tufts University</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nalgene Lowboy carboy with spigot (for storing worm water), optional</td>
			<td>Nalge Nunc International Corporation</td>
			<td>2324-0015</td>
			<td>15 L,&#160; polypropylene, low profile makes it easier to fill plastic colony containers&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Custom Peltier plate, optional</td>
			<td>Williams Machine, Foxboro, MA&#160;</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Design specifics courtesy of Junji Morokuma, Tufts University:&#160; Peltier plate is constructed of a standard thermoelectric heat pump (for example, All Electronics Corp Catalog # PJT-1, 30 mm2).&#160; The square heat pump is covered with a thin mirrored surface, then placed inside a 30 mm2 square hole in a circular plexiglass form (~50 mm in diameter). This form is of similar thickness to the heat pump, and fits flush into a well tooled in the center of a round heat sink (~115 mm in diameter). The form/heat pump is&#160; &#34;anchored&#34; to the sink with silicone base heat sink compound. The leads are threaded through holes drilled through both the form and the the heat sink. The bottom half of the heat sink is tooled into a &#34;foot&#34; that fits into the opening of your microscope&#39;s base plate.&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DC power source (for Peltier plate), optional</td>
			<td>B &#38; K Precision</td>
			<td>1665</td>
			<td>Regulated Low Voltage DC Power Supply, 1-18 volts (DC), 1-10 amps.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Other common supplies</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gloves</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Razor blade&#160;</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Scissors</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dissecting scope with gooseneck lighting</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chopstick rests, optional</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

surgical ablation assay for studying eye regeneration in planarians

成体幹細胞と再生機構の研究では、プラナリア扁形動物は、in vivoモデル系の主食です。これは彼らの豊富な多能性幹細胞集団と、ほとんどの動物のために壊滅的だろう怪我した後、すべての細胞や組織の種類を再生する能力に大きな部分的に起因します。最近、プラナリアは、目の再生のためのモデルとして人気を得ています。 （2つの組織タイプから成る：色素細胞及び光受容体）全体の目を再生する能力は、視覚系の再生を制御する機構の切開を可能にします。眼アブレーションは、再生だけで眼の組織に大きく制限されていることが最も重要なものの眼特異的経路およびメカニズムを調べるため（例えば断頭又は穴パンチのような）他の技術を超えるいくつかの利点を有します。このビデオの記事の目的は、確実に脳を乱すまたは組織を囲むことなく、プラナリアの光学カップを削除する方法を実証することです。ワームや確立コロニーのメンテナンスの取り扱いも記載されています。この技術は、外科的にコールドプレート上に固定化されたプラナリアの眼杯をかき出すために31 G 5/16インチのインスリン針を使用します。この方法は、アプリケーションの広い範囲を可能にする、目が1〜2週間以内に再生すると、単一及び二重の両方の目の切除を包含する。特に、このアブレーション技術は、容易に再生機構とその進化、目の幹細胞およびそれらの維持、及びphototaxic行動反応とその神経基盤のより良い理解のために、薬理学的および遺伝的（RNA干渉）スクリーンと組み合わせることができます。

最初の1-2時間後に手術のために、動物は、無傷のワーム（彼らはまだ移動するが）に比べて減少運動を示すことができます。所望であれば、ワーム（例えば、RNAiの供給のための）手術の24時間以内に食べるようになります。時間をかけて同じ個体では、目の再生を以下の場合は、手術前（未使用）にし、1時間後アブレーション（HPA）の両方で各ワームの写真を撮るよ...

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Surgical Ablation Assay for Studying Eye Regeneration in Planarians

このプロトコルは、一貫して、周囲の組織を乱すことなく、プラナリア目（光学カップ）を切除する方法を示しています。インスリン注射針と注射器を使用して、一方または両方の目のどちらかは、目の再生、視覚的な再生の進化、および光誘起行動の神経基盤を調節するメカニズムの調査を容易にするために、アブレーションさせることができます。

プラナリアで瞳の再生を研究するための外科切除アッセイ

In the study of adult stem cells and regenerative mechanisms, planarian flatworms are a staple in vivo model system. This is due in large part to their ...

surgical-ablation-assay-for-studying-eye-regeneration-in-planarians

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

10.9K ビュー.  Western Michigan University. このプロトコルは、一貫して、周囲の組織を乱すことなく、プラナリア目（光学カップ）を切除する方法を示しています。インスリン注射針と注射器を使用して、一方または両方の目のどちらかは、目の再生、視覚的な再生の進化、および光誘起行動の神経基盤を調節するメカニズムの調査を容易にするために、アブレーションさせることができます。 

ビデオ: Surgical Ablation Assay for Studying Eye Regeneration in Planarians

Hepatocyte-specific Ablation in Zebrafish to Study Biliary-driven Liver Regeneration

The liver has a great capacity to regenerate. Hepatocytes, the parenchymal cells of the liver, can regenerate in one of two ways: hepatocyte- or biliary-driven liver regeneration. In hepatocyte-driven liver regeneration, regenerating hepatocytes are derived from preexisting hepatocytes, whereas, in biliary-driven regeneration, regenerating hepatocytes are derived from biliary epithelial cells (BECs). For hepatocyte-driven liver regeneration, there are excellent rodent models that have significantly contributed to the current understanding of liver regeneration. However, no such rodent model exists for biliary-driven liver regeneration. We recently reported on a zebrafish liver injury model in which BECs extensively give rise to hepatocytes upon severe hepatocyte loss. In this model, hepatocytes are specifically ablated by a pharmacogenetic means. Here we present in detail the methods to ablate hepatocytes and to analyze the BEC-driven liver regeneration process. This hepatocyte-specific ablation model can be further used to discover the underlying molecular and cellular mechanisms of biliary-driven liver regeneration. Moreover, these methods can be applied to chemical screens to identify small molecules that augment or suppress liver regeneration.

To help assess the molecular mechanisms underlying zebrafish biliary-driven liver regeneration, we established a liver injury model in which the nitroreductase-expressing hepatocytes are genetically ablated upon metronidazole treatment. In this protocol, we describe how to adeptly manipulate, monitor and analyze hepatocyte ablation and biliary-driven liver regeneration.

胆道主導の肝臓の再生を研究するためにゼブラフィッシュにおける肝細胞特異的アブレーション

The liver has a great capacity to regenerate. Hepatocytes, the parenchymal cells of the liver, can regenerate in one of two ways: hepatocyte- or ...

発生生物学

Isolation of Mouse Endometrial Epithelial and Stromal Cells for In Vitro Decidualization

Decidualization is a progesterone-dependent differentiation process of endometrial stromal cells and is a prerequisite for successful embryo implantation. Although many efforts have been made to reveal the underlying mechanisms of decidualization, the exact signaling between the epithelial cells that are in contact with the embryo and the underlying stromal cells remains poorly understood. Therefore, studying decidualization in a way that takes both the epithelial and stromal cells into account could improve our knowledge about the molecular details of decidualization. For this purpose, in vivo models of artificial decidualization are physiologically the most relevant; however, manipulation of intercellular communication is limited. Currently, in vitro cultures of endometrial stromal cells are being used to investigate the modulation of decidualization by several signaling molecules. Conventionally, human or mouse endometrial stromal cells are used. However, the availability of human samples is very often limited. Furthermore, the use of murine tissues is accompanied with variety in the method of culturing. This study presents a validated and standardized method to obtain pure Endometrial Epithelial Cell (EEC) and Stromal Cell (ESC) cultures using adult intact mice treated with estrogen for three consecutive days. The protocol is optimized to improve the yield, viability, and purity of the cells and was further extended in order to study decidualization in a coculture of EEC and ESC. This model may be suitable to exploit the importance of both cell types in decidualization and to evaluate the contribution of significant signaling molecules secreted by EEC or ESC during the intercellular communication.

Isolation of Mouse Endometrial Epithelial and Stromal Cells for In Vitro Decidualization

This study presents a standardized and validated method for the isolation and culture of primary mouse endometrial stromal and epithelial cells, which can be used in a coculture system to study in vitro decidualization.

マウス子宮内膜上皮と間質細胞の単離のために<em&gt;インビトロ</em&gt;脱落膜化

Decidualization is a progesterone-dependent differentiation process of endometrial stromal cells and is a prerequisite for successful embryo implantation. ...

Precise Cellular Ablation Approach for Modeling Acute Kidney Injury in Developing Zebrafish

Acute Kidney Injury (AKI) is a common medical condition with a high mortality rate. With the repair abilities of the kidney, it is possible to restore adequate kidney function after supportive treatment. However, a better understanding of how nephron cell death and repair occur on the cellular level is required to minimize cell death and to enhance the regenerative process. The zebrafish pronephros is a good model system to accomplish this goal because it contains anatomical segments that are similar to the mammalian nephron. Previously, the most common model used to study kidney injury in fish was the pharmacological gentamicin model. However, this model does not allow for precise spatiotemporal control of injury, and hence it is difficult to study cellular and molecular processes involved in kidney repair. To overcome this limitation, this work presents a method through which, in contrast to the gentamicin approach, a specific Green Fuorescent Protein (GFP)-expressing nephron segment can be photoablated using a violet laser light (405 nm). This novel model of AKI provides many advantages that other methods of epithelial injury lack. Its main advantages are the ability to &#34;dial&#34; the level of injury and the precise spatiotemporal control in the robust in vivo animal model. This new method has the potential to significantly advance the level of understanding of kidney injury and repair mechanisms.

This work presents a new in vivo model of segmental kidney injury using kidney GFP transgenic zebrafish. The model allows for the induction of the targeted ablation of kidney epithelial cells to show the cellular mechanisms of nephron injury and repair.

ゼブラフィッシュの発生における急性腎障害のモデル化のための正確な細胞除去法

Acute Kidney Injury (AKI) is a common medical condition with a high mortality rate. With the repair abilities of the kidney, it is possible to restore ...

Partial Lobular Hepatectomy: A Surgical Model for Morphologic Liver Regeneration

Morphological organ regeneration following acute tissue loss is common among lower vertebrates, but is rarely observed in mammalian postnatal life. Adult liver regeneration after 70% partial hepatectomy results in hepatocyte hypertrophy with some replication in remaining lobes with restoration of metabolic activity, but with permanent loss of the injured lobe&#39;s morphology and architecture. Here, we detail a new surgical method in the neonate that leaves a physiologic environment conducive to regeneration. This model involves amputation of the left lobe apex and a subsequent conservative management regimen, and lacks the necessity for ligation of major liver vessels or chemical injury, leaving a physiologic environment where regeneration may occur. We extend this protocol to amputations on juvenile (P7-14) mice, during which the injured liver transitions from organ regeneration to compensatory growth by hypertrophy. The presented, brief 30 min protocol provides a framework to study the mechanisms of regeneration, its age-associated decline in mammals, and the characterization of putative hepatic stem or progenitors.

Here, we present a new method for partial resection of the left hepatic lobe in neonatal (day 0) mice. This new protocol is suitable for studying acute liver injury and injury response in the neonatal setting.

肺葉切除: 形態学的肝再生手術モデル

Morphological organ regeneration following acute tissue loss is common among lower vertebrates, but is rarely observed in mammalian postnatal life. Adult ...

Methods for the Study of Regeneration in Stentor

Cells need to be able to regenerate their parts to recover from external perturbations. The unicellular ciliate Stentor coeruleus is an excellent model organism to study wound healing and subsequent cell regeneration. The Stentor genome became available recently, along with modern molecular biology methods, such as RNAi. These tools make it possible to study single-cell regeneration at the molecular level. The first section of the protocol covers establishing Stentor cell cultures from single cells or cell fragments, along with general guidelines for maintaining Stentor cultures. Culturing Stentor in large quantities allows for the use of valuable tools like biochemistry, sequencing, and mass spectrometry. Subsequent sections of the protocol cover different approaches to inducing regeneration in Stentor. Manually cutting cells with a glass needle allows studying the regeneration of large cell parts, while treating cells with either sucrose or urea allows studying the regeneration of specific structures located at the anterior end of the cell. A method for imaging individual regenerating cells is provided, along with a rubric for staging and analyzing the dynamics of regeneration. The entire process of regeneration is divided in three stages. By visualizing the dynamics of the progression of a population of cells through the stages, the heterogeneity in regeneration timing is demonstrated.

Methods for the Study of Regeneration in Stentor

The giant ciliate, Stentor coeruleus, is an excellent system to study regeneration and wound healing. We present procedures for establishing Stentor cell cultures from single cells or cell fragments, inducing regeneration by cutting cells, chemically inducing the regeneration of membranellar band and oral apparatus, imaging, and analysis of cell regeneration.

ラッパムシの再生の研究のための方法

Cells need to be able to regenerate their parts to recover from external perturbations. The unicellular ciliate Stentor coeruleus is an excellent model ...

A Simplified and Efficient Method to Isolate Primary Human Keratinocytes from Adult Skin Tissue

Primary human keratinocytes isolated from fresh skin tissues and their expansion in vitro have been widely used for laboratory research and for clinical applications. The conventional isolation method of human keratinocytes involves a two-step sequential enzymatic digestion procedure, which has been proven to be inefficient in generating primary cells from adult tissues due to the low cell recovery rate and reduced cell viability. We recently reported an advanced method to isolate human primary epidermal progenitor cells from skin tissues that utilizes the Rho kinase inhibitor Y-27632 in the medium. Compared with the traditional protocol, this new method is simpler, easier, and less time-consuming, and increases epithelial stem cell yield and enhances their stem cell characteristics. Moreover, the new methodology does not require the separation of the epidermis from the dermis, and, therefore, is suitable for isolating cells from different types of adult tissues. This new isolation method overcomes the major shortcomings of conventional methods and is more suitable for producing large numbers of epidermal cells with high potency both for laboratory and for clinical applications. Here, we describe the new method in detail.

Here we present a protocol to efficiently isolate primary human keratinocytes from adult skin tissues. This method simplifies the conventional procedure by using the ROCK Inhibitor Y-27632 in the inoculation medium to spontaneously separate epidermal cells from dermal cells.

大人の皮膚組織から人間ケラチノ サイト主を特定する簡易で効率的な方法

Primary human keratinocytes isolated from fresh skin tissues and their expansion in vitro have been widely used for laboratory research and for clinical ...

An Enhanced Green Fluorescence Protein-based Assay for Studying Neurite Outgrowth in Primary Neurons

Neurite outgrowth is a fundamental event in the formation of the neural circuits during nervous system development. Severe neurite damage and synaptic dysfunction occur in various neurodegenerative diseases and age-related degeneration. Investigation of the mechanisms that regulate neurite outgrowth would not only shed valuable light on brain developmental processes but also on such neurological disorders. Due to the low transfection efficiency, it is currently challenging to study the effect of a specific protein on neurite outgrowth in primary mammalian neurons. Here, we describe a simple method for the investigation of neurite outgrowth by the co-transfection of primary rat cortical neurons with EGFP and a protein of interest (POI). This method allows the identification of POI transfected neurons through the EGFP signal, and thus the effect of the POI on neurite outgrowth can be determined precisely. This EGFP-based assay provides a convenient approach for the investigation of pathways regulating neurite outgrowth.

In this report, we describe a simple protocol for studying neurite outgrowth in embryonic rat cortical neurons by co-transfecting with EGFP and the protein of interest.

原発性ニューロンにおける神経質の増殖を研究するための強化された緑色蛍光タンパク質ベースのアッセイ

Neurite outgrowth is a fundamental event in the formation of the neural circuits during nervous system development. Severe neurite damage and synaptic ...

Confocal Microscope-Based Laser Ablation and Regeneration Assay in Zebrafish Interneuromast Cells

Hair cells are mechanosensory cells that mediate the sense of hearing. These cells do not regenerate after damage in humans, but they are naturally replenished in non-mammalian vertebrates such as zebrafish. The zebrafish lateral line system is a useful model for characterizing sensory hair cell regeneration. The lateral line is comprised of hair cell-containing organs called neuromasts, which are linked together by a string of interneuromast cells (INMCs). INMCs act as progenitor cells that give rise to new neuromasts during development. INMCs can repair gaps in the lateral line system created by&#160;cell death. A method is described here for selective INMC ablation using a conventional laser-scanning confocal microscope and transgenic fish that express green fluorescent protein in INMCs. Time-lapse microscopy is then used to monitor INMC regeneration and determine the rate of gap closure. This represents an accessible protocol for cell ablation that does not require specialized equipment, such as a high-powered pulsed ultraviolet laser. The ablation protocol may serve broader interests, as it could be useful for the ablation of additional cell types, employing a tool set that is already available to many users. This technique will further enable the characterization of INMC regeneration under different conditions and from different genetic backgrounds, which will advance the understanding of sensory progenitor cell regeneration.

Laser ablation is a widely applicable technology for studying regeneration in biological systems. The presented protocol describes use of a standard laser-scanning confocal microscope for laser ablation and subsequent time-lapse imaging of regenerating interneuromast cells in the zebrafish lateral line.

ゼブラフィッシュインターニューロマスト細胞における共焦点顕微鏡ベースレーザーアブレーションと再生アッセイ

Hair cells are mechanosensory cells that mediate the sense of hearing. These cells do not regenerate after damage in humans, but they are naturally ...

Development of Organoids from Mouse Pituitary as In Vitro Model to Explore Pituitary Stem Cell Biology

The pituitary is the master endocrine gland regulating key physiological processes, including body growth, metabolism, sexual maturation, reproduction, and stress response. More than a decade ago, stem cells were identified in the pituitary gland. However, despite the application of transgenic in vivo approaches, their phenotype, biology, and role remain unclear. To tackle this enigma, a new and innovative organoid in vitro model is developed to deeply unravel pituitary stem cell biology. Organoids represent 3D cell structures that, under defined culture conditions, self-develop from a tissue's (epithelial) stem cells and recapitulate multiple hallmarks of those stem cells and their tissue. It is shown here that mouse pituitary-derived organoids develop from the gland's stem cells and faithfully recapitulate their in vivo phenotypic and functional characteristics. Among others, they reproduce the activation state of the stem cells as in vivo occurring in response to transgenically inflicted local damage. The organoids are long-term expandable while robustly retaining their stemness phenotype. The new research model is highly valuable to decipher the stem cells' phenotype and behavior during key conditions of pituitary remodeling, ranging from neonatal maturation to aging-associated fading, and from healthy to diseased glands. Here, a detailed protocol is presented to establish mouse pituitary-derived organoids, which provide a powerful tool to dive into the yet enigmatic world of pituitary stem cells.

Development of Organoids from Mouse Pituitary as In Vitro Model to Explore Pituitary Stem Cell Biology

The pituitary gland is the key regulator of the body's endocrine system. This article describes the development of organoids from the mouse pituitary as a novel 3D in vitro model to study the gland's stem cell population of which the biology and function remain poorly understood.

下垂体幹細胞生物学を探るための In Vitro モデルとしてのマウス下垂体からのオルガノイドの開発

The pituitary is the master endocrine gland regulating key physiological processes, including body growth, metabolism, sexual maturation, reproduction, ...

Eye Removal in Living Zebrafish Larvae to Examine Innervation-dependent Growth and Development of the Visual System

Zebrafish exhibit remarkable life-long growth and regenerative abilities. For example, specialized stem cell niches established during embryogenesis support continuous growth of the entire visual system, both in the eye and the brain. Coordinated growth between the retinae and the optic tectum ensures accurate retinotopic mapping as new neurons are added in the eyes and brain. To address whether retinal axons provide crucial information for regulating tectal stem and progenitor cell behaviors such as survival, proliferation, and/or differentiation, it is necessary to be able to compare innervated and denervated tectal lobes within the same animal and across animals. 
Surgical removal of one eye from living larval zebrafish followed by observation of the optic tectum achieves this goal. The accompanying video demonstrates how to anesthetize larvae, electrolytically sharpen tungsten needles, and use them to remove one eye. It next shows how to dissect brains from fixed zebrafish larvae. Finally, the video provides an overview of the protocol for immunohistochemistry and a demonstration of how to mount stained embryos in low-melting-point agarose for microscopy.

The article explains how to surgically remove eyes from living zebrafish larvae as the first step toward investigating how retinal input influences optic tectum growth and development. In addition, the article provides information about larval anesthetization, fixation, and brain dissection, followed by immunohistochemistry and confocal imaging.

生きているゼブラフィッシュ幼虫の眼球除去による神経支配依存性の成長と視覚系の発達を調べる

Zebrafish exhibit remarkable life-long growth and regenerative abilities. For example, specialized stem cell niches established during embryogenesis ...

プラナリアで瞳の再生を研究するための外科切除アッセイ

要約

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この動画の章

胆道主導の肝臓の再生を研究するためにゼブラフィッシュにおける肝細胞特異的アブレーション

マウス子宮内膜上皮と間質細胞の単離のために

ゼブラフィッシュの発生における急性腎障害のモデル化のための正確な細胞除去法

肺葉切除: 形態学的肝再生手術モデル

ラッパムシの再生の研究のための方法

大人の皮膚組織から人間ケラチノサイト主を特定する簡易で効率的な方法

原発性ニューロンにおける神経質の増殖を研究するための強化された緑色蛍光タンパク質ベースのアッセイ

ゼブラフィッシュインターニューロマスト細胞における共焦点顕微鏡ベースレーザーアブレーションと再生アッセイ

下垂体幹細胞生物学を探るための In Vitro モデルとしてのマウス下垂体からのオルガノイドの開発

生きているゼブラフィッシュ幼虫の眼球除去による神経支配依存性の成長と視覚系の発達を調べる

プラナリアで瞳の再生を研究するための外科切除アッセイ

要約

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胆道主導の肝臓の再生を研究するためにゼブラフィッシュにおける肝細胞特異的アブレーション

マウス子宮内膜上皮と間質細胞の単離のために

ゼブラフィッシュの発生における急性腎障害のモデル化のための正確な細胞除去法

肺葉切除: 形態学的肝再生手術モデル

ラッパムシの再生の研究のための方法

大人の皮膚組織から人間ケラチノ サイト主を特定する簡易で効率的な方法

原発性ニューロンにおける神経質の増殖を研究するための強化された緑色蛍光タンパク質ベースのアッセイ

ゼブラフィッシュインターニューロマスト細胞における共焦点顕微鏡ベースレーザーアブレーションと再生アッセイ

下垂体幹細胞生物学を探るための In Vitro モデルとしてのマウス下垂体からのオルガノイドの開発

生きているゼブラフィッシュ幼虫の眼球除去による神経支配依存性の成長と視覚系の発達を調べる

大人の皮膚組織から人間ケラチノサイト主を特定する簡易で効率的な方法