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우리는 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)을 사용하여 유리 표면을 패시베이션하는 방법을 설명한다. 이 프로토콜은 표면 세정, 표면 기능화 및 PEG 코팅을 다룹니다. 우리는 기존의 방법에 비해 보호의 우수한 품질을 얻을 수있는, 두 차례에 걸쳐 PEG 분자와 표면을 치료하기위한 새로운 전략을 소개합니다.
단일 분자 형광 분광법은 나노 스케일의 생물학적 현상의 넓은 범위를 이해하는 수단이 될 입증되었습니다. 이 기술은 생물 과학에 굴복 할 수있는 중요한 예는 단백질 - 단백질 및 단백질 - 핵산의 상호 작용에 대한 기계적인 통찰력이다. 단백질의 상호 작용은 단일 분자 수준에서 프로빙하는 경우, 단백질 또는 기판들은 종종 장기간 관측 가능 유리 표면에 고정화된다. 이 고정 방식은 원치 않는 표면 유물을 소개하고있다. 따라서,이 불활성 있도록 유리 표면을 패시베이션하기 위해 필수적이다. 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)을 이용한 표면 코팅은 비특이적 유리 표면과 상호 작용하는 단백질을 방지하는 높은 성능을 띈다. 그러나, 폴리머 코팅 절차로 인해 표면이 필요한 표면 처리 및 일련의 엄격한 요건으로 인한 합병증 어렵다프로 시저의 끝에서 모든 형광 분자의 자유 롭다. 여기, 우리는 단계별 지침과 함께 강력한 프로토콜을 제공합니다. 그것은 피라니아 에칭, 아민 그룹과 표면 기능화, 그리고 마지막으로 PEG 코팅 등의 표면 세정을 다룹니다. PEG 층의 높은 밀도를 얻으려면, 우리는 현저 보호의 질을 향상 두 라운드, 이상 PEG 분자와 표면을 치료하는 새로운 전략을 소개합니다. 사람이 높은 품질의 표면 보호를 달성 할 수 있도록 우리는 대표적인 결과뿐만 아니라 각 중요한 단계에 대한 실질적인 조언을 제공합니다.
단일 분자 단백질 연구를 수행 할 때 그 실험이 어떤 표면에 의한 단백질의 고장 또는 변성 1,2에서 무료로되도록 표면 보호의 높은 품질을 달성하기 위해 필수적이다. 예컨대 소 혈청 알부민 등의 계면 활성제로 처리 된 유리 표면은 일반적으로 단일 분자 핵산 연구 3에 사용되지만, 그 보호의 정도는 단백질 연구에 충분히 높지 않다. 중합체 (폴리에틸렌 글리콜, PEG)로 코팅 된 유리 표면은 패시베이션 성능 4-6 우수하다. 이것에 의해, 그것은 단일 분자 형광 연구 7-10에 도입 된 이래 단일 분자 단백질 연구에 보편적으로 사용되고있다. 폴리머 코팅 절차는 여러 표면 처리 7,11,12이 필요합니다. 따라서, 자세한 설명없이 전체 절차를 수행하는 것이 곤란하다. 종종 표면 보호의 정도는 프로토콜 I에 따라 달라집니다의는 다음에. 여기에서 우리는 단일 분자의 단백질 연구의 주요 병목 현상을 제거합니다 단계별 지침과 함께 강력한 프로토콜을 제시한다. 개요를 그림 1을 참조하십시오.
1. 준비 및 청소를 밀어
미세 유체 챔버는 석영 슬라이드와 커버 슬립으로 구성되어 있습니다. 프리즘 형 전반사 형광 (TIRF) 현미경으로 석영 슬라이드의 표면에 묘화된다. 따라서, 철저 H 2 O, 아세톤, KOH 및 피라니아 용액을 사용하여 석영 슬라이드를 청소하는 것이 중요하다. 토륨은 다단계 세정은 단일 분자 형광 측정을 방해 표면에 형광성 유기 분자를 제거이다. 또한 피라냐 에칭 수산기를 생성하여 석영 표면 친수성을 만든다. 자유 수산기 3 단계에서 아미노 실란 화 반응에 필수적이다.
2. 커버 슬립 청소
미세 유체 챔버는 석영 슬라이드와 커버의 립으로 구성되어있다. 프리즘 형 TIRF 현미경이 사용되는 경우, 커버 슬립의 표면은 묘화되지 않는다. 따라서, 단지 H 2 O 및 KOH로 커버 슬립을 청소하기 위해 충분하다. 경우에 커버 슬립이 (객관적 형 TIRF 현미경을 통해 예) 몇 군데해야합니다, 그것은 피라니아 솔루션 (단계 1.7)와 커버 슬립을 치료하는 것이 좋습니다. 커버 슬립면의 PEG 화 고품질 아닌 경우,이 단백질에 대한 싱크로서 작용할 수 있음을 유의단백질 농도의 변화를 야기 ㄹ.
슬라이드 및 Coverslips는 3. 아미노 실란 화
아미노 실란 화 화학 통해 석영 슬라이드 및 아민 그룹과 커버 슬립의 표면을 기능화. 메탄올 아미노 실란 화 반응을위한 촉매로서, 용매 및 아세트산으로 사용된다.
폴리머 (첫 라운드)를 사용하여 4. 표면 패시베이션
NHS-에스테르, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)를 컨쥬 게이트에 의해 석영 슬라이드 및 커버 슬립의 아민 코팅 된 표면을 패시. 이 반응물을 하룻밤 동안 pH를 8.5에서 PEG 용액의 포화 농도로 수행된다.
5. 장기 저장
-20 º C에서 PEG 화의 슬라이드와 N 2의 coverslips 저장
폴리머 (두 번째 라운드)를 사용하여 6. 표면 패시베이션
PEG 층의 밀도를 확인하고 또한 표면에 남아있는 아민 그룹을 해소하기 위해 PEG 화의 추가 라운드. 짧은 NHS-에스테르 PEG 분자 (333 다)의 사용은 기존의 PEG 층으로 침투하는 효과가있다. 그것은 레크 리 에이션이다오른쪽으로 슬라이드를 사용하기 전에 PEG 화의 두 번째 라운드를 할 권고했다.
7. 미세 유체 챔버를 조립
PEG 화 석영 슬라이드 쌍의 커버 슬립을 이용하여 미세 유체 챔버를 조립. 양면 접착 테이프를 스페이서로 사용됩니다. 챔버는 그래서, 에폭시 접착제로 밀봉하고lutions는 석영 슬라이드에있는 구멍을 통해 소개합니다.
8. 재활용을 밀어
석영 슬라이드를 재활용합니다. 중고 슬라이드를 커버 슬립과 양면 접착 테이프를 복용하여 재활용됩니다.
미세 유체 챔버 조립 후 (7.1 단계 - 7.6) 및 7.7 단계를 수행하기 전에, 그것은 PEG 화 표면의 품질 관리를 수행하는 것이 좋습니다.
표면 패시베이션 성공적 완료 되었다면, 10 미만이 비특이적 1-10 nM의 형광 표지 된 단백질은 챔버 내로 (왼쪽 그림 3a, 다)을 첨가 할 때 관찰 이미징 영역 (x 25mm 25mm) 당 단백질을 흡착있다.
세척이나 반응 절차 중에 제대로 수행되지 않은 경우, 비특이적의 수는 현저하게 증가 단백질을 흡착하고, CCD 화면이 형광 신호에 의하여 포화 될 수있다. 피라니아 에칭 건너 예를 들어, 관찰 비특이적 흡착의 100 배 더 많은 양이 (그림 3a, 중간 왼쪽)와 비교. 두 번째 PEG 화 단계가 생략되면, 약 3 시간이 있었다SA 비특이적 흡착 관찰의 더 많은 양의 (그림 3B). 만료 된 화학 물질 (예 APTES 수개월 동안 실온에서 보관) (데이터는 도시되지 않음)를 사용하는 경우 PEG 화의 낮은 정도를 관찰된다. 상당한 시간이 그것 PEG 화 된 이후로 경과하면 표면의 품질도 아래로 떨어진다 (도 3a, 오른쪽과 왼쪽과 비교).
우리의 최선의 지식, 그것은 PEG 화의 두 라운드는 단일 분자 연구에 도입 된 것은 이번이 처음이다. PEG 화의 두 라운드는 PEG 층 형성 (그림 3b)의 최고 품질을 보장합니다. 이중 PEG 화의 뛰어난 자연은 눈에 띄게 (영화 1B와 영화 1A 비교) 영화에 표시됩니다. 이 영화에서, 용액에서 형광 분자의 배경 신호가 두 번 PEG 첨가 였을 때 훨씬 약한 것으로 관찰된다 단백질이 이중 페 길화 층에 의해 더욱 효율적으로 격퇴하고 있음을 나타냅니다하는 데 사용됩니다. 이 두 단계의 프로세스가 강력하게 권장합니다 비록 실험이 최적 보호를 허용하는 경우, 두 번째 PEG 화 단계는 건너 뛸 수 있습니다.
그림 1. 표면 처리의 도식 () 현미경 슬라이드 아세톤, KOH 및 피라 솔루션을 청소한다. 그것은 NHS-에스테르 PEG와 APTES와 PEG 화와 함께 작용한다. 필요한 경우, (b)는 커버 슬립 피라니아 용액 KOH뿐만 아니라 청소된다. 그것은 NHS-에스테르 PEG와 APTES와 PEG 화와 함께 작용한다.
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그림 2. 미세 유체 챔버 () 단일 채널 실. 현미경 슬라이드를 뚫고 두 개의 구멍이있다. 그것은 양면 접착 테이프의 두 조각을 사용하여 커버 슬립으로 조립된다. (b) 3 채널 챔버. 현미경 슬라이드 드릴 여섯 구멍이 있습니다. 이것은 양면 접착 테이프의 네 개의 슬라이스를 이용하여 커버 슬립으로 조립된다.
그림 3 : 용액에서 염료 표지 단백질로 촬영 CCD 이미지. (a) CCD 이미지는 용액에 10 nM의 Cy3가-으로 labeld 담당자와 60X 대물 렌즈를 이용하여 프리즘 형 전반사 형광 현미경에 의해 촬영 하였다. (왼쪽) 표면은이 문서의 프로토콜에 따라 제조 하였다. (중간) 표면 prepa했다이 문서의 프로토콜 다음과 같은 빨강,하지만 피라 에칭은 건너 뛰었습니다. (오른쪽) 표면은이 문서의 프로토콜에 따라 제조 및 질소 하에서 -20 º C에서의 3 개월 동안 보관 하였다. (B) 용액에 10 nM의 Cy3에 -으로 labeld 담당자로 촬영 CCD 이미지. (왼쪽) 표면은이 문서의 프로토콜에 따라 제조 하였다. (오른쪽) 표면은이 문서의 프로토콜에 따라 제조되었지만, PEG 화의 두 번째 라운드는 건너 뛰었습니다. 스케일 바 = 5 μm의.
영화 1 : 용액에서 염료 표지 단백질로 촬영 CCD 영화. CCD 영화는 용액에 10 nM의 Cy3에 -으로 labeld 담당자와 60X 대물 렌즈를 사용하는 프리즘 형 전반사 형광 현미경으로 촬영했다. 시간 해상도는 100 밀리 초이다. (A) 표면은이 문서의 프로토콜에 따라 제조 하였다. (b)의 표면은이 문서의 프로토콜에 따라 제조되었지만, PEGyl의 두 번째 라운드ATION은 건너 뛰었습니다. 여기를 클릭하여 영화 1A를보고하기 위해 여기를 클릭 영화 1B를 볼 수 있습니다.
이 프로토콜 내에서 중요한 단계
이 아미노 실란 화 반응 전에, 표면 친수성을 만들기 위해 필수적이다. 이것은 유리 / 석영 표면에 자유 히드 록 실기를 생성 피라니아 식각을 통해 달성되었다. 그것은 점차적으로 내려가는 표면의 친수성시기 장시간 H 2 O 또는 공기 중 하나에 노출 피라냐 에칭 표면을 계속하지 않을 것을 권장한다.
NHS-에스테르 PEG 분자는 반응성이다. 그것은 -20 º C에서 분주을 질소에서 보관하는 것이 좋습니다 실온에서 APTES 화학의 수명이 짧다. 이것은 매달 새 것으로 교체하도록 의뢰한다.
이 프로토콜의 수정
어떤 실용적인 이유로 피라니아 에칭을 사용할 수없는 경우, 장시간 KOH를 사용하여 에칭 (예를 들어 Overnight), 이는 또한 수산기가 노출 된 것입니다. 이 대안의 함정 슬라이드 심한 상처로 인해 약간의 재순환 후 사용할 수 없게되는 것입니다.
그것은 종종 형광 유기 재료 7을 제거하는 효과가 프로판 토치를 사용하여 유리 / 석영 표면을 구울 실시됩니다. 이 피라니아 에칭에 대한 중복 때문에이 절차는이 프로토콜에 포함되지 않았습니다. 이 절차가 잠재적으로 수산기의 산화로 이어질 것입니다 있습니다. 표면이 KOH 또는 피라니아 용액을 사용하여 에칭하면 따라서이 절차를 수행 할 수 없습니다.
7 미만의 pH를 가진 버퍼가 단일 분자 이미징에 사용되는 경우, PEG의 형태는 보호의 정도를 감소시킨다 "브러쉬"내지 "버섯"에서 변경한다. 7.0보다 낮은 pH를 사용할 때 따라서는, 더 디 숙신 이미 딜 타르 타 <를 사용하여 표면을 패시베이션하기 위해 권장SUP> 7.
전망
이 작품은 높은 품질의 표면 보호를 달성하기위한 강력한 프로토콜을 제공하고 있습니다. 이 프로토콜은 단백질 14뿐만 아니라 세포 추출물 내 단백질 복합체에 참여하고 15 면역 침전물하는 단일 분자 형광 연구에 도움이 될 것입니다. 그것은 널리 힘 분광 및 토크 분광법 (16)과 같은 다른 단일 분자 기술에 사용됩니다. 또한 표면 (17)에 흡착 세포를 예방하는데 유용 할 것이다.
이 작품에서 제공하는 프로토콜은 여러 단계의 절차에 요구하고있다. 지질 PEG 8, 폴리 라이신 PEG 9를 사용하여 표면 보호는 대체 방법으로 사용할 수 있습니다. 이후, 그들은 쉽게 구현할 수있는 화학 반응을 필요로하지 않습니다. 그러나, 보호의 정도는 화학 modif 통해 달성만큼 높지 않다표면의 주시죠.
우리는 공개 아무것도 없어.
SDC, ACH, 그리고 CJ는 유럽 연구위원회를 통해 보조금 (ERC - 엑츄 - 2012-309509)를 시작으로 지원했다. J.-MN은 한국 연구 재단 (NRF) (2011-0018198)에 의해 지원되었다; 한국의 NRF 통해 파이오니어 연구 센터 프로그램 (2012-009586)는 과학, ICT 장관, 그리고 미래의 계획 (MSIP)에 의해 투자. 이 작품은 또한 글로벌 프론티어 프로젝트 (H-GUARD_2013-M3A6B2078947) 등 한국의 MSIP에 의해 투자 바이오 나노 건강 감시 센터에 의해 지원되었다. YKL 및 J.-HH는 서울, 한국의 서울 과학 원정대 프로그램에 의해 지원되었다. 레이블 담당자 단백질 박사 수아 MYONG에서 관대 한 선물이었다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1. Slide preparation and cleaning | |||
Acetone | Sigma | 32201 | 1 L |
Coverslips | VWR | 631-0136 631-0144 631-0147 | 24 x 32 mm2, 22 x 40 mm2, 24 x 50 mm2 (No.1½, Rectangular) |
Diamond drill bits | MTN-Giethoorn, The Netherlands | LA-0564-00DB | 3/4 mm |
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
Glass staining dishes | Fisher Scientific | 300101 | |
H2O2 | Boom | 6233905 | 1 L, hydrogen peroxide 30%. Opened bottles should be stored at 4 °C. |
H2SO4 | Boom | 80900627.9010 | Sulfuric acid 95-98% |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
Quartz slides | Finkenbeiner | 1” x 3”, 1 mm thick | |
2. Coverslip cleaning | |||
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
3. Amino-silanization of slides and coverslips | |||
Acetic acid | Sigma | 320099-500ML | Acetic acid, glacial |
APTES | Sigma-Aldrich | 281778-100ML | 3-aminopropyl trimethoxysilane. Store at the room temperature under N2. Replace once in a month. |
Flask (200 ml) | VWR | Flask (200 ml) | Pyrex flask. Have one flask dedicated for aminosilanization. |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
4. Surface passivation using polymer (the first round) | |||
Biotin-mPEG | Laysan Bio | Biotin-PEG-SVA-5000-100mg | Biotin-PEG-SVA, MW 5,000 Da. Store aliquots of 1-2 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. |
mPEG | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000-1g | mPEG-succinimidyl valerate (SVA), MW 5,000 Da. Store aliquots of 80 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
5. Surface passivation (the second round) | |||
DMSO | Sigma-Aldrich | D8418-100ML | Dimethyl sulfoxide BioReagent, for molecular biology, ≥99.9% |
DST | Pierce | 20589 | Disuccinimidyl tartarate |
MS4-PEG | Pierce | 22341 | Short NHS-ester PEG, MW 333 Da. Dissolve 100 mg MS4-PEG in 1.1 ml DMSO. Store 20 µl aliquots at -20 °C. |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
6. Assembling a microfluidic chamber | |||
Double sticky tape | Scotch | 10 mm wide | |
Epoxy | Thorlabs | G14250 | Devcon 5 minute epoxy |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888-1 KG | Sodium chloride |
Neutravidin | Pierce | 31000 | ImmunoPure NeutrAvidin Biotin-Binding protein. Stock in 5 mg/ml in H2O at 4 °C. |
Streptavidin | Invitrogen | S-888 | Stock 5 mg/ml in H2O or T50 at 4 °C. |
Trizma base | Sigma-Aldrich | T1503-1 KG | Tris |
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