Method Article
여기에서는 아밀로이드 베타 1-40(Aβ 1-40)으로 코팅된 20nm 금 응집체의 준가역적 자체 조립을 설명하는 체계적인 방법을 제시합니다. 펩타이드 간의 나노 크기 의존적 준가역적 네트워킹은 특정 아미노산 또는 Aβ 1-40 단량체의 절편과 상관관계가 있었습니다.
나노 골드 콜로이드 입자 표면에 코팅된Aβ 1-40의 특성화는 표면 플라즈몬 공명(SPR) 분광법 및 투과 전자 현미경(TEM)을 사용하여 수행되었습니다. Aβ 1-40으로 코팅된 20nm 금 입자의 SPR 대역에서 관찰된 pH 의존적 이동은 TEM 이미지에서 관찰된 응집 및 분해의 교대와 상관관계가 있었습니다. ~4의 pH는 풀린 형태를 유도하고 ~10의 pH는 금 표면에서 Aβ 1-40의 접힌 형태를 유도했습니다. 이 가역적 응집 과정은 pH가 pH 4에서 pH 10으로 점차 변화함에 따라 Raman 이미징에 의해 관찰되었습니다. 금 표면에서Aβ 1-40의 pH 의존적 형태 변화를 관찰했으며, pH 4에서 투명한 응집체가 관찰되었습니다. 그러나 pH 4와 pH 10 조건 사이의 표면 강화 라만 분광법(SERS) 스펙트럼에서 매우 미묘한 차이가 관찰되었으며, 가장 두드러진 차이는 250cm-1 및 1750cm-1 영역의 스펙트럼 밀도였습니다. 구체적으로, 가역적 응집체의 모드 분석은 응집체가 티로신과 페닐알라닌의 벤젠 고리 절편을 포함하는 Aβ 1-40의 풀린 형태에 의해 형성되었음을 나타냈습니다. 반대로, 응집체의 분해는 히스티딘, 글루타민, 메티오닌 및 아스파르트산을 포함하는Aβ 1-40의 단백질 접힘의 구조적 변화와 관련이 있었습니다.
아밀로이드 베타 1-40 (Aβ 1-40) 또는 1-42 (Aβ 1-42) 펩타이드의 섬유형성은 알츠하이머병의 원인인 아밀로이드 플라크 형성에 중요한 성분으로 광범위하게 조사되어 왔습니다 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11. 섬유형성의 핵심 메커니즘은 Aβ 1-40 또는Aβ 1-42 펩타이드의 올리고머화하여 신경독성 단백질 응집체를 형성하는 것이며, 단량체가 올리고머 12,13,14를 형성하는 방법의 메커니즘을 이해하기 위해 광범위한 조사가 수행되었습니다. 우리는 나노 금 표면에 응집체를 형성하는 아밀로이드 생성 펩티드를 조사하고 금 표면에서 멀리 떨어진 펩타이드 사이의 네트워킹을 담당하는 요인을 식별하는 접근 방식을 수행했습니다 15,16,17,18,19,20,21,22.
Aβ 1-40은 산성 조건(pH ~4) 하에서 펼쳐진 형태(A)와 염기성 조건(pH ~10) 하에서 접힌 형태(B)를 채택합니다. pH ~10에서 분산된 Aβ 1-40 코팅된 금 콜로이드 입자와 pH~4에서 큰 Aβ 1-40 코팅된 금 콜로이드 응집체를 관찰했습니다(그림 1)23,24. 산성 조건에서 Aβ 1-40의 풀린 형태는 금-나노 입자 표면에서 Aβ 1-40 단량체 사이의 펩타이드 네트워킹을 선호하여 금 콜로이드 응집체를 형성합니다(그림 1의 A 참조). Aβ 1-40 단량체가 염기성 또는 중성 pH Aβ 1-40에서 접힌 형태를 유지할 때 단량체는 응집체로 네트워크화되지 않고 코팅된 금 나노 입자는 개별적으로 분산된 입자로 남아 있습니다(그림 1의 B 참조). 따라서 Aβ 1-40 펩타이드가 네트워크에 대한 구조적 변화를 겪고 응집체를 형성하는 과정을 조사하려면 다양한 pH 조건 25,26,27,28,29,30,31에서 SPR 대역 이동을 측정해야 합니다.
우리는 여러 가지 크기의 금 나노 입자를 테스트한 결과 20nm 금 콜로이드가 pH의 외부 변화에 대한 반응으로 Aβ 1-40 단량체의 가장 두드러진 가역적 자기 조립 과정을 나타낸다는 것을 발견했습니다(그림 2). 이는 펩타이드 형태의 가역적 변화를 명확하게 나타내는 지표이며, 산성 조건(A)은 풀린 형태를 유도하여 네트워킹을 강화하고 금 콜로이드의 응집으로 이어집니다. 기본 조건 (B)은 단량체 26,27,28,29,30,31의 접힌 형태를 유도하는 것으로 밝혀졌다.
1. aβ 1-40 코팅 금 나노 입자의 제조
2. 반복적인 pH 변화 및 해당 SPR 대역 이동 모니터링
3. Raman 이미징 및 가역적 응집체 조사
금 나노 콜로이드 입자 표면에 Aβ 1-40을 부착하면 용액이 더 산성 (pH 4) 35로 만들어졌을 때 530nm 흡수 최대 주위의 SPR 대역이 ~ 650nm 피크 위치로 크게 적색 편이되었습니다. TEM 이미지와 함께, pH 4에서 관찰된 분광 특징이 금 표면30 위에 흡착된 주변의 펼쳐진 Aβ 1-40 단량체와 그럴듯하게 펼쳐진 형태 및 네트워킹을 가진 금 콜로이드 응집체의 형성과 일치한다는 것을 확인했습니다. 우리는 Aβ 1-40 단량체가 염기성(pH 10) 조건에서 접힌 형태로 역전되어 준가역적 방식으로 응집체가 변형되는 것을 관찰했습니다. 이 준가역적 과정은 더 짧은 파장과 더 긴 파장 사이에서 이동하는 평균 대역 피크(((n))의 교대와 염기(pH = 10)와 산성(pH = 4) 조건 사이의 TEM 이미지에서 분산된 형태와 응집된 형태에서 분명했습니다. Aβ 1-40 단량체의 일부는 용액이 염기성 조건36으로 되돌아간 후에도 풀린 상태로 남아 있는 것이 이전에 관찰되었습니다. 동영상 1은Aβ 1-40 및 20nm 베어 골드 콜로이드의 pH 의존적 색상 변화를 보여줍니다.
이에 비해 20nm 베어 골드 콜로이드의 pH hop 조사가 수행되었습니다(그림 5C 및 D). pH 변화 작업이 진행됨에 따라 SPR 밴드 쇼프트, TEM 이미지 및 백색광 이미지에서 금 콜로이드의 클러스터링 성장을 보여주었습니다. 매우 흥미롭게도, n홀수와 n짝수에 따라 여러 SERS 스펙트럼 라인이 있었습니다. 예를 들어, n의 짝수(pH ~4)에서 Aun(n = 5, 6, 12, 16, 20, 58)37 또는 Au-Cl-리간드(38)와 관련된 모드로 할당된 275cm-1의 선이 집중적으로 관찰되었습니다. 반면에,n개의 짝수에 대해서는, 1008 cm-1 C-N str에서 39 가 관찰되었고, 1291 cm-1 에서 CH2 wag39, CH2 변형40 이 광범위하게 관찰되었다.
백색광 이미징에서 관찰된 명확한 pH 의존성 및 가역적 응집 형태와 대조적으로, n개의홀수와 n개의 짝수 사이의 SERS 스펙트럼의 스펙트럼 특징에는 상대적으로 미묘한 차이가 있었습니다. 첫 번째 근사치로, 250cm-1과 1750cm-1 사이의 영역에서의 스펙트럼 라인 밀도는 n짝수보다 n 홀수에 대해 더 높았습니다. n홀수에 대한 지문 영역, 1250 cm-1 및 1750 cm-1 (아미드 I, II 및 III 대역)의 스펙트럼 라인은 덜 해상도 된 스펙트럼 특징을 보여 주었으며, 이는 스펙트럼 밀도의 확대 또는 증가를 의미합니다. 그림 6에서 그림 5B(그림 6B)에 제공된 등고선 맵은 761cm-1(빨간색) 및 1395cm-1(파란색)의 SERS 신호로 구성되어 각각 n개의 홀수 및 n개의 짝수(그림 6C)에서 강조를 나타냅니다. n개의홀수 및 n개의 짝수에 대한 대표적인 SERS 스펙트럼으로, n=7(빨간색) 및 n=4(파란색)의 SERS 스펙트럼이 상단에 표시되어 있습니다(그림 6A). Aβ 1-40 코팅 20nm 금에 대한 SPR 대역 이동에 대한 대응을 보여주기 위해 그림 3의 대역 이동 플롯이 측면에 표시됩니다(그림 6D).
관찰된 SERS 스펙트럼의 전체 할당에 대한 예비 데이터가 있지만, 여기서는 몇 가지 주목할 만한 라만 이동 특징에 주목합니다. n홀수에서 강화 된 스펙트럼 라인 및 (그럴듯한 할당)은 주로 1000cm-1 미만의 영역에서 발생합니다 : 394 cm-1 (Trp) 41,42,43, 761 cm-1 (His, Ala) 39,44,45,46,47, 875 cm-1 (인돌 NH 변위, Met의 C-C 스트레칭) 39, 974 cm-1 (Glu, C-COO- Asp의 스트레칭, 구연산염과 관련된 모드) 39,48,49. n에서 강화 된 라만 이동은 지문 영역 (Amide I, II 및 III)에서 중요한 분광 기능을 보여주었습니다 : 1166 cm-1 (Tyr의 N-H + 변형) 39,41, 1227 cm-1 (Ala-Pro-Gly, Amide III) 39,50,51, 1395 cm-1 (COO- 대칭 스트레칭 또는 CH2- CH3- Glu의 가위) 39 , 48, 1585 cm-1 (Phe의 고리 CC 스트레칭, 카르복실레이트 -Au의 비대칭 스트레칭, 구연산염의 COO- 스트레칭, 벤젠 링의 변형) 39,41,45,46,47,49,52, 1592 cm-1 (Phe, Tyr, C = C 스트레칭, Phe의 고리 CC 스트레칭, 벤젠 링 스트레칭 및 COO- Phe 및 Tyr에서 스트레칭, OH) 39,41,48,50,51 및 1628 cm-1 (분자간 β-시트 구조53, C=O 및 병렬 β-시트 유형 구조에서 유래한 단백질 백본의 결합된 CN/NH 진동 모드에 고유한 아미드 I 서브 피크, 응집된 Aβ 54의 축적, 무작위 코일, β-턴, β 머리핀48. n,홀수 또는 n,짝수에 대해 나타나는 시퀀스는 그림 7에 나와 있습니다. 전반적으로,Aβ 1-40의 가역적 응집 또는 풀린 형태에 해당하는 n에 대해서도 벤젠 고리를 포함하는 Phe/Tyr, COO-의 대칭 연신, Glu의 CH2-CH 3- 가위화 모드, Tyr의 -NH+ 변형이 펩타이드의 구조적 변화에 유의하게 관여했습니다. 펩타이드가 n 홀수에서 두드러진 모드에 해당하는 접힌 형태를 채택했을 때 관찰된 응집체를 분해하는 동안 Glu, Asp, Met, His 및 Ala가 관여하는 것으로 나타났습니다.
그림 1: pH 의존적 흡광도 및 형태. Aβ 1-40 코팅된 금 나노 입자(20nm)에 대한 pH 4(A) 및 pH 10(B)의 흡수 스펙트럼과 해당 TEM 이미지, 응집/분산 입자 스케치 및 바이알 내 용액 사진이 표시됩니다. A는 산성 조건에서 Aβ 1-40 단량체의 풀린 형태이고 B는 염기성 조건에서 접힌 형태입니다. 각 형태 및 응집/분산 형태에서 Aβ 1-40 단량체의 다이어그램이 TEM 이미지 옆에 표시되어 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2: 나노 크기에 따른 자체 조립 가역성. 테스트된 모든 크기의 금 콜로이드 입자에 대한 작동 번호 n의 함수로 SPR 대역 의 평균 피크 위치의 이동. 그림 1 에 표시된 응집체의 대략적인 pH 값과 해당 단계도 제공됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3: 각 작업 번호에서의 TEM/백색광 이미지.
작업 번호 n의 함수로 Aβ 1-40 코팅 20nm 금(닫힌 원) 및 20nm 금 콜로이드(열린 원)에 대해 함께 표시되었으며 Aβ 1-40 코팅 20nm 금(A 및 B) 및 20nm 금 콜로이드(C 및 D)를 참조하십시오. 검은색 글꼴은 pH 7, 파란색 글꼴은 pH 4, 빨간색 글꼴은 pH 10을 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 4: 대표적인 백색광 및 라만 이미지. (A) n = 2 및 (B) n = 3에 대한 백색광 이미지, 라만 이미지 및 SERS 스펙트럼; i) 넓은 시야의 백색광 이미지, ii) 라만 이미지가 수집된 영역에서의 백색광 이미지(i)에서 빨간색 사각형으로 표시됨), iii) 두 성분이 결합된 라만 이미지, iv) 성분 1 및 그 v) SERS 스펙트럼 iv), vi) 성분 2의 라만 이미지, 및 vii) VI)의 SERS 스펙트럼). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 5: n개의홀수, n개의짝수 및 n모두에 대한 SERS 스펙트럼의 등고선 맵.(A) 250cm-1 및 1750cm-1 영역에서Aβ 1-40 코팅된 20nm 금에 대한 n의 함수로 표시되는 SERS 스펙트럼의 3차원 맵과 상단의 (B)에 표시된 등고선 맵. (C) 250cm-1 및 1750cm-1 영역에서 SERS 스펙트럼의 3차원 지도는 20nm 금에 대한 n의 함수로 상단에 (D)에 표시된 등고선 맵과 함께 제공됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 6: SERS 스펙트럼의 등고선 맵. n(1-10)의 함수로 나타낸 SERS 스펙트럼의 등고선 맵. (A) 1395cm-1(파란색) 및 761cm-1(빨간색)에서의 흡광도. (B-D) 하단 패널은 SERS 스펙트럼을 보여주고 오른쪽 패널은 각 n에서 SERS 신호의 신호 강도 변화 진폭을 보여줍니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 7: Aβ1-40의 주목할 만한 서열. n홀수 (접힌 형태의 형성에 해당)에서 상당한 관여를 갖도록 할당된 서열은 아래쪽 빨간색 화살표로 표시되고, n짝수 (펼쳐진 형태의 형성에 해당)에서 상당한 관여를 갖도록 할당된 시퀀스는 파란색 화살표로 표시됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
동영상 1: Aβ1-40 및 20nm 베어 골드 콜로이드의 pH 의존적 색상 변화. 이 비디오를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
펩타이드 형태 연구에서 중요한 고려 사항은 검체를 부적절하게 보관하면 변질될 수 있으므로 검체 유지 관리입니다. 펩타이드 샘플은 동결 건조된 형태로 접수되었으며 -80°C에서 보관된 경우에도 증류된 탈이온수로 재수화되면 변성되기 시작했습니다. 금 콜로이드의 순도는 품질 관리 분석에 의해 검증되었습니다. 콜로이드의 안정성을 유지하기 위해 얼지 않고 4°C에서 보관했습니다. 금 콜로이드 용액은 염 완충 용액이 금 콜로이드를 불안정하게 만들기 때문에 각 실험에 대해 신선하게 준비되었습니다. HCl 및 NaOH 용액은 각 실험에 대해 신선하게 준비되었습니다.
pH를 4에서 10 사이로 변경하면서 섬세한 기기로 용액의 pH를 수동으로 판독하고 기록해야 하는 기술적 문제로 인해 보고된 결과의 정밀도가 제한됩니다. 따라서, SERS 신호의 강도에서 일관된 결과를 관찰하지 못했다. 이로 인해 등고선 플롯에 사용된 진폭에 오류가 발생했을 가능성이 있습니다. n짝수 또는 n홀수와 관련된 모드를 확인하기 위한 향후 연구는 단일 티로신 또는 아스파라긴 잔기와 같은 단백질의 구조적 변화에 관여하는 것으로 보고된Aβ 1-40 서열의 아미노산을 대체하기 위한 돌연변이를 도입할 수 있습니다.
"Aβ1-40 단량체와 금 표면 사이의 상호 작용은 쌍극자 상호 작용으로 간주되며, 수소 결합 수준은 H. Schmidbauer et al.55의 연구에서 가설을 세웠습니다. 별도의 연구에서는 산성 조건에서Aβ 1-40 의 양에 따라 SERS 분광법을 조사하여 나노 크기 의존성 흡착 형성(56)을 추출했다. 20nm 금의 경우, 히스티딘 (His)의 C = C 또는 -C-N 결합이 흡착을 시작하는 것으로 추측되었다. 그러나 80nm 금의 경우 페닐알라닌(Phe) 또는 티로신(Tyr)의 벤젠 고리 호흡 모드가 흡착을 시작하기 위해 금 표면에 도달했습니다. 중성 또는 염기성 조건(pH ~10)에서 금 표면에 Aβ1-40 을 흡착하는 과정은 수성 상태에서 침전물이 형성되지 않았기 때문에Aβ 1-40 코팅된 금 콜로이드를 친수성으로 유지하기 위해 고려되었습니다. 그러나, 침전물은 pH 4에서 관찰되었으며, 이는 응집체가 소수성임을 암시합니다.
TEM 이미지와 백색광 이미지는 응집의 증거를 간접적으로만 보여줍니다. 우리는 가역적 응집체에서 관찰된 형태를 2차 구조와 연관시키기 위해 원이색성(CD) 분광법을 수행하려고 시도했습니다. 그러나 산란 기준선으로 인해 재현 가능한 CD 신호를 얻을 수 없었습니다. 따라서 대신 라만 분광법을 사용하여 pH ~4에서 응집(Aβ1-40의 풀림 형태)이 발생하거나 pH ~10에서 분리(Aβ1-40의 풀림 형태)가 발생할 때 향상된 모드에 더 중점을 두었습니다. 따라서 이 작업에서 2차 구조를 식별하기 위한 최선의 추측은 2차 구조와 관련된 노드를 모니터링하는 것으로 제한되었습니다. 이것은 1628cm-1, 특히 pH 4 조건에서 β 시트를 관찰 한 결과에서 입증되었습니다.
이 연구는 20nm 직경의 금 콜로이드에 대한 펩타이드 형태의 변화만 관찰하고 n에서 최대 10개까지만 조사했습니다. Aβ 1-40 펩타이드의 형태 및 응집 특성은56으로 흡착하는 입자의 크기에 따라 변경될 수 있습니다. 그러므로, 단위체 사이 네트워킹에 기초를 두는 펩티드의 재산을 이해하기 위하여 더 많은 일이 필요합니다 및 흡착 표면의 육체적인 특성에 의해 영향을 받는 그들. 우리가 테스트한 조건에서는 20nm 직경의 금 콜로이드만이 응집 형태의 가역성을 나타냈으며, 콜로이드 직경이 이 특성의 가역성에 어떤 영향을 미치는지에 대한 메커니즘은 알려져 있지 않습니다. n을 최대 20까지 늘리면 응집 형태학의 가역성의 모드 의존적 정도에 대한 더 많은 통찰력을 제공할 수 있습니다. 금 콜로이드의 크기가 아밀로이드 베타 펩타이드 응집에 어떤 영향을 미치는지에 대한 이러한 연구는 알츠하이머병 병리학의 분자 메커니즘에 대한 중요한 통찰력을 제공할 것입니다.
저자는 이 작품과 관련하여 공개할 이해 상충이 없음을 선언합니다.
K.Y.는 NSF-MRI Grant #2117780의 지원을 받습니다. Geneseo 재단은 이 프로젝트의 초기 단계를 지원했습니다. A. I.는 SUNY Geneseo 화학과 동문 여름 연구 장학금('19 Rhodes Award 및 '20 Lipkowitz Award)과 Dreyfus Foundation 학부 여름 연구 장학금의 지원에 감사드립니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Amyloid beta peptide 1-40 (Aβ1–40 peptide) | r-Peptide (Bogart, GA, USA) | A-1156-2 | |
CCD digital camera | AMT | XR-40 4-megapixel CCD | |
Distilled deionized water from Milli-Q- water system | Millipore Sigma (Burlington, MA, USA) | Milli-Q IQ 7000 | |
Freezer -86 oC | Thermo Scientific | Revco Chilly Willy RLE Series Unit ID 187004 Build Number 40.04 | |
Gold Colloid (10 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15703-20 | |
Gold Colloid (100 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15711-22 | |
Gold Colloid (15 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15704-20 | |
Gold Colloid (20 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15705-20 | |
Gold Colloid (30 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15706-21 | |
Gold Colloid (40 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15707-21 | |
Gold Colloid (50 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15708-21 | |
Gold Colloid (60 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15709-22 | |
Gold Colloid (80 nm) | Ted Pella, Inc. (Redding, California, USA) | 15710-22 | |
Highest Grade V1AFM Mica Discs 10 mm | Ted Pella Inc. | #50 | |
Hydrochloric Acid Standard Solution, 1.0 N | Fluka | Lot# SHBB4705V 318949-2L | |
Macro quartz quvette Light Path 10 mm | Fire Fly Science | Type1-MC-Path10mm | |
Micro pH electrode | HORIBA | Model 9618S (MFG No. 9Y8E0050) | |
Peak Fit Program | Origin (Northampton, MA, USA) | OriginPro2018b (64-bit) b9.5.5.409 (Academic) | |
pH 4.00 Buffer solution | VWR | Cat No. 34170-127 | |
pH 7.00 Buffer Solution | Fisher Chemical | SB107-4 Lot 191041 | |
pH meter | HORIBA | Model F-72G (MFG No. B27M0017) | |
Pipet Tips Maxi Tips 1–5 mL | Fisher | 02-707-467 | |
Pipet Tips 10 mL | Fisher | 02-717-135 | |
Pipet Tips 1000 mL | Fisher | 02-717-156 | |
Pipet Tips 1–200 mL | Fisher | 02-717-143 | |
Pipetter Fisher Brand Elite 0.5–5 mL | Fisher | QU05317 | |
Pipetter Fisher Brand Elite 100–1000 mL | Fisher | QU01672 | |
Pipetter Fisher Brand Elite 10–100 mL | Fisher | MU10985 | |
Pipetter Fisher Brand Elite 1–10 mL | Fisher | MU08178 | |
Sodium Hydroxide Solution 1.0 M | Fluka | Lot#05096BPV 319511-2L | |
TEM | FEI Co | Morgagni model 268 | |
TempAssure PCR Tubes, Flat Caps, Natural | USA Scientific | polypropylene. 0.2 mL individual thin-wall tubes with attached frosted flat caps | |
UV-Vis-NIR Spectrophotometer | Varian | CARY 5000 UV1106M074 | |
WI Tec alpha300R Confocal Raman Microscope | WITec-Oxford Instrument | XMB3000-3001 |
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