Multiome Sequencing을 위한 신선 및 냉동 고형 종양 검체에서 최적화된 핵 분리

종양 생물학에 대한 지식이 증가하고 세포가 종양 내에서 상호 작용하고 환자 결과에 영향을 미치는 방식의 복잡성을 이해하려는 관심이 높아짐에 따라 종양 미세환경 전반에서 이종 세포 분석의 중요성도 높아졌습니다. 단일 세포 RNA의 획득과 쌍을 이루는 세포 방식으로 동일한 세포에서 공격 염기서열 분석을 가능하게 하는 다중 염기서열 분석은 이러한 목적을 향한 상당한 발전을 제공합니다. 그러나 이러한 실험에서 얻은 데이터의 품질은 실험 조건과 투입된 생물학적 물질의 품질에 크게 의존합니다.

이 프로토콜은 10x Genomics 플랫폼을 사용하여 멀티오메 염기서열 분석을 위해 고형 종양 검체에서 핵을 분리하는 데 안정적이고 최적화된 접근 방식을 제공합니다. 이 프로토콜은 신선 또는 냉동 단세포 현탁액을 사용하여 신뢰할 수 있습니다. 당사는 조직 해리 조건, 단일 세포 현탁액의 동결 보존 및 분리된 핵 평가에 대한 권장 사항을 제공합니다.

이 프로토콜에서는 인간 췌관 선암종 검체를 사용했는데, 이는 우리 실험실의 주요 조직 유형입니다. 췌장암은 탈형성 종양 유형으로, 세포뿐만 아니라 조직도 상대적으로 끈적끈적합니다. 또한, 연구에 사용할 수 있는 췌장 종양 검체도 상대적으로 적은 경향이 있기 때문에 포획된 세포의 양을 최대화하기 위한 노력이 필요합니다.